性結合活性。與結構無關，抗體片段結合由全長抗體識別的相同抗原。例 如，抗AT0H單克隆抗體片段與AT0H的表位結合。抗體的抗原結合功能可W通過全長抗體 的片段執行。在術語抗體的"抗原結合部分"內涵蓋的結合片段的例子包括：（i)Fab片段， 由VL、VH、化和CHl結構域組成的單價片段；（ii)F(油'）2片段，包含在較鏈區通過二硫 橋連接的兩個F油片段的二價片段；（iii)由VH和CHl結構域組成的Fd片段；（iv)由抗體 單臂的化和VH結構域組成的Fv片段，（V)由Vh結構域組成的dAb片段（Ward等人，（1989) 化1:腳6 341:544-546); (Vi)經分離的互補決定區（CDR); (Vii)微型抗體、雙抗體、S抗體、 四抗體和K體(參見例如111等人，Protein化g1997 ; 10:949-57) ; (Viii)駱駝IgG;和 (ix)IgNAR。此外，盡管Fv片段的兩個結構域V神VH由分開的基因編碼，但它們可W使用 重組法通過合成接頭進行連接，所述合成接頭使得它們能夠制備為單條蛋白質鏈，其中\ 和Vh區配對W形成單價分子(稱為單鏈Fv(scFv);參見例如，Bird等人（1988)Science 242:423-426;和Huston等人（1988)Proc.化tl.Acad.Sci.USA85:5879-5883)。此類 單鏈抗體也涵蓋在術語抗體的"抗原結合部分"內。運些抗體片段使用本領域技術人員已 知的常規技術獲得，并且W與完整抗體相同的方式分析片段的效用。
[0035] 此外，考慮抗原結合片段可W涵蓋在抗體模擬物中。如本文使用的，術語"抗體模 擬物"或"模擬物"指運樣的蛋白質，其顯示出與特定抗體相似的結合活性，但為更小的替代 抗體或非抗體蛋白質。此類抗體模擬物可W包含在支架中。術語"支架"指用于改造具有 定制功能和特征的新產物的多膚平臺。
[0036]如本文使用的，術語"抗ATP抗體"指特異性結合與肝素或肝素樣相關的ATP的 表位的抗體。當在體內與ATPH的表位結合時，本文公開的抗ATP抗體增強凝血級聯的一 個或多個方面。
[0037]如本文使用的，術語"抑制結合"和"阻斷結合"（例如(提及ATP底物與ATPH的 結合的抑制/阻斷）可互換使用，并且涵蓋蛋白質與其底物的部分和完全抑制或阻斷兩者， 例如至少約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約95%、約96%、 約97%、約98%、約99%、或約100%的抑制或阻斷。
[003引提及AT0底物與AT0的結合的抑制和/或阻斷，術語抑制和阻斷還包括與不和 抗AT0抗體接觸的AT0相比較，當與抗AT0抗體接觸時，AT0和/或AT0H與生理學底 物的結合親和力中的任何可測量減少，例如ATP與其底物的相互作用至少約10%、約20%、 約 30%、約 40%、約 50%、約 60%、約 70%、約 80%、約 90%、約 95%、約 96%、約 97%、約 98%、約 99%、 或約100%的阻斷。
[0039] 如本文使用的，術語"單克隆抗體"或"單克隆抗體組合物"指單分子組合物的抗 體分子。單克隆抗體組合物展示關于特定表位的單一結合特異性和親和力。相應地，如本 文使用的，術語"人單克隆抗體"指展示單一結合特異性的抗體，其具有衍生自人種系免疫 球蛋白序列的可變區和恒定區。人抗體可W包括不由人種系免疫球蛋白序列編碼的氨基酸 殘基(例如，通過體外隨機或位點特異性誘變或者通過體內體細胞突變引入的突變)。
[0040] 如本文使用的，術語"經分離的抗體"意指基本上不含其他生物學分子，包括具 有不同抗原特異性的抗體的抗體(例如與AT0H結合的經分離的抗體基本上不含結合除 ATPH外的抗原的抗體)。在一些實施方案中，經分離的抗體為按干重計至少約75%、約80%、 約90%、約95%、約97%、約99%、約99. 9%或約100%純的。在一些實施方案中，純度可W通過 諸如柱層析、聚丙締酷胺凝膠電泳或HPLC分析的方法進行測量。然而，與人AT0H的表位、 同種型或變體結合的經分離的抗體可W與例如來自其他物種的其他相關抗原(例如ATPH 物種同系物)具有交叉反應性。此外，經分離的抗體可W基本上不含其他細胞材料和/或化 學品。
[0041] 如本文使用的，術語"特異性結合"指與預定抗原結合的抗體。顯示出特異性結合 的抗體通常W至少約IO5M1的親和力與抗原結合，并且與該抗原結合的親和力比其對于無 關抗原(例如BSA、酪蛋白）的結合親和力高，例如至少兩倍高。短語"識別抗原的抗體"和 "對于抗原特異性的抗體"在本文中可與術語"與抗原特異性結合的抗體"互換使用。如本 文使用的，術語"最低限度結合"指不與指定抗原結合和/或顯示出與指定抗原的低親和力 的抗體。通常，與抗原具有最低限度結合的抗體W低于約1〇2Mi的親和力與該抗原結合， 并且不W比它與無關抗原結合更高的親和力與預定抗原結合。
[0042] 當在本文中用于抗體例如IgG抗體時，術語"高親和力"指至少約1〇7M1的結合 親和力，在至少一個實施方案中，至少約1〇8Ml,在一些實施方案中，至少約1〇9M1、約1〇1° M1、約1〇11Mi或更大，例如最高達約10"Mi或更大。然而，"高親和力"結合可W對于其他 抗體同種型改變。例如，關于IgM同種型的"高親和力"結合指至少約1〇7Mi的結合親和 力。
[0043] 如本文使用的，術語"同種型"指由重鏈恒定區基因編碼的抗體類別（例如IgM或 IgGl)。
[0044] 如本文使用的，術語"互補決定區"或"CDR"指在抗體分子的重鏈可變區或輕鏈可 變區內的=個高變區之一，其構成與所結合抗原的=維結構互補的N末端抗原結合表面。 從重鏈和輕鏈的N末端開始，運些互補決定區分別指定為"CDR1"、"CDR2"和"CDR3"[Wu TT，K油atEA，BilofskyH，Proc化tlAcadSciUSA. 1975Dec;72 (12) :5107 和Wu TT，K油atEA，JExpMed. 1970Aug1 ;132 (2):211]。CDR設及抗原抗體結合，并且CDR3 包含對于抗原抗體結合特異性的獨特區域。因此，抗原結合位點可W包括六個CDR，包含來 自重鏈和輕鏈V區各自的CDR區。術語"表位"指抗體與之特異性結合或相互作用的區域或 區，在一些實施方案中，所述區域或區指示抗原在其中與抗體處于物理接觸。相反，術語"互 補位"指抗原在其上特異性結合的抗體區域或區。如果相應抗體的結合是相互排斥的，即一 種抗體的結合排除另一種抗體的同時結合，則通過競爭結合表征的表位被說成重疊的。如 果抗原能夠同時容納兩種相應抗體的結合，則表位被說成是分開的(獨特的)。
[0045] 如本文使用的，術語"競爭抗體"指與如本文描述的針對ATeH的抗體結合大約相 同、基本上相同、基本相同或甚至相同表位的抗體。競爭抗體包括具有重疊表位特異性的抗 體。競爭抗體因此能夠與如本文描述的抗體有效競爭結合AT0H。在一些實施方案中，競爭 抗體可W與本文描述的抗體結合相同的表位。換言之，競爭抗體具有與本文描述的抗體相 同的表位特異性。
[0046] 如本文使用的，術語"保守置換"指設及一個或多個氨基酸置換具有相似生物化學 特性的氨基酸的多膚修飾，其不導致多膚的生物學或生物化學功能的喪失。保守氨基酸置 換是其中氨基酸殘基替換為具有相似側鏈的氨基酸殘基的置換。具有相似側鏈的氨基酸殘 基家族已在本領域中得到限定。運些家族包括具有堿性側鏈的氨基酸(例如賴氨酸、精氨 酸、組氨酸)、具有酸性側鏈的氨基酸(例如天冬氨酸、谷氨酸)、具有不帶電荷的極性側鏈的 氨基酸(例如甘氨酸、天冬酷胺、谷氨酷胺、絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半脫氨酸)、具有非極性 側鏈的氨基酸(例如丙氨酸、鄉氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨 酸)、具有P-分支側鏈的氨基酸(例如蘇氨酸、鄉氨酸、異亮氨酸）和芳族側鏈的氨基酸(例 如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、組氨酸)。本公開內容的抗體可W具有一個或多個保守氨基酸 置換，仍保留抗原結合活性。
[0047] 對于核酸和多膚，如本文使用的，術語"基本同源性"指示，在至少約80%的核巧酸 或氨基酸中，通常為至少約85%，在一些實施方案中，約90%、約91%、約92%、約93%、約94% 或約95%，在至少一個實施方案中，至少約96%、約97%、約98%、約99%、約99. 1%、約99. 2%、 約99. 3%、約99. 4%或約99. 5%的核巧酸或氨基酸中，當最佳比對且比較時，兩種核酸或兩 種多膚或其指定序列是相同的，伴隨適當的核巧酸或氨基酸插入或缺失。可替代地，當區段 在選擇性雜交條件下與鏈的互補體雜交時，存在關于核酸的基本同源性。還包括的是與本 文所述的特異性核酸序列和氨基酸序列具有基本同源性的核酸序列和多膚序列。兩個序列 之間的同一性百分比是由序列共享的相同位置數目的函數（即同源性％ =相同位置#/位 置總#X100)，考慮到為了兩個序列的最佳比對需要引入的缺口數目和每個缺口的長度。 序列的比較和兩個序列之間的同一性百分比的測定可W使用數學算法來完成，所述數學算 法例如但不限于VectorNTI"(InvitrogenCo;rp.，Carlsbad,CA)的Ali即X?模塊。對于AlignX?，多重比對的缺省參數是：缺口開放罰分：10 ;缺口延伸罰分：〇. 05 ;缺口分開罰分 范圍：8 ;比對延遲的同一性％ :40。
[0048] 兩個序列之間的同一性百分比是由序列共享的相同位置數目的函數（即同源性％ =相同位置#/位置總#X100)，考慮到為了兩個序列的最佳比對需要引入的缺口數目 和每個缺口的長度。序列的比較和兩個序列之間的同一性百分比的測定可W使用數學算 法來完成，所述數學算法例如但不限于VectorNTI "(Invitrogen Co;rp.，Carlsbad, CA) 的AlignX?模塊。對于AlignX?，多重比對的缺省參數是：缺口開放罰分：10;缺口延伸 罰分：0. 05 ;缺口分開罰分范圍：8;比對延遲的同一'性％:40。（進一步的細節在http:// WWW.invitrogen. com/site/us/en/home/LINNEA-Online-Guides/LINNEACommunities/ Vector-NTI-Community/Sequence-曰n曰lysis-and-date-maMgement-software-for- PCs/ AlignX-Module-for-Vector-NTI-Advance. reg. us. html處發現）。
[0049] 用于測定查詢序列（本公開內容的序列）和主題序列之間的總體匹配的另一種方 法，也稱為總體序列比對，可W使用化USTALW計算機程序（Thompson等人，NucleicAcids Research，1994,2 (22) : 4673-4680)進行測定，所述CLUSTALW計算機程序基于Higgins等人，ComputerApplicationsintheBiosciences(CABIOS)，1992,8 (2) : 189-191 的 算法。在序列比對中，查詢和主題序列均為DM序列。所述總體序列比對的結果W同一性 百分比表示。可W在DNA序列的CLUSTALW比對中用于經由配對比對計算同一性百分比的 參數是：矩陣=IUB，k-元組=1，頂部對角線數=5,缺口罰分=3,缺口開放罰分=10， 缺口延伸罰分=0.1。對于多重比對，可W使用下述CLUSTALW參數：缺口開放罰分=10， 缺口延伸參數=0. 05 ;缺口分開罰分范圍=8 ;比對延遲的同一性％ :40。
[0050] 核酸可W存在于全細胞、細胞裂解產物中、或W部分純化或基本上純的形式存在。 當從它在天然環境中通常與之結合的其他細胞組分中純化出來時，核酸是"經分離的"或 "