可操作地連接 的基因的表達的任何序列元件。基因控制元件可通過升高或降低表達水平來起作用，并且 可位于編碼序列之前、之內或之后。基因控制元件可通過調節例如轉錄的起始、延伸或終 止、mRNA剪接、mRNA編輯、mRNA穩定性、細胞內mRNA的定位、翻譯的起始、延伸或終止而在 基因表達的任何階段起作用或在基因表達的任何其它階段起作用。基因控制元件可單獨地 或彼此組合地起作用。
[0053] 同源性：如本文中所用，術語"同源性"是指聚合分子之間，例如核酸分子（例如， DNA分子和/或RNA分子）之間和/或多肽分子之間的總體相關性。在一些實施方案中， 如果聚合分子的序列具有至少 25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、 75 %、80 %、85 %、90 %、95 %或99 %的同一性，則它們被認為是彼此"同源的"。在一些實 施方案中，如果聚合分子的序列具有至少25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、 65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%的相似性，則它們被認為是彼此"同源的"。
[0054] 同一性：如本文中所用，"同一性"是指聚合分子之間，例如核酸分子（例如，DNA 分子和/或RNA分子）之間和/或多肽分子之間的總體相關性。兩個核酸序列的百分比同 一性的計算，例如，可通過為了最佳比較目的而比對兩個序列（例如，可在第一和第二核酸 序列的一個或兩個中引入缺口來進行最佳比對，并且為了比較目的可忽略不相同的序列） 來進行。在某些實施方案中，為了比較目的而比對的序列的長度為參照序列的長度的至少 30%，至少40%，至少50%，至少60%，至少70%，至少80%，至少90%，至少95%或大體上 100%。隨后比較對應核苷酸位置上的核苷酸。當第一序列中的位置被與第二序列中的對 應位置相同的核苷酸占據時，則分子在該位置上是相同的。通過考慮兩個序列的最佳比對 而需要引入的缺口的數目和每個缺口的長度，兩個序列之間的同一性百分比是序列共有的 相同位置的數目的函數。序列的比較和兩個序列之間的同一性百分比的測定可使用數學算 法來實現。例如，例如，兩個核苷酸序列之間的同一,性百分比可使用Meyers和Miller的算 法化48105，1989,4:11-17)，使用？八11120權重殘基表、缺口長度罰分12和缺口罰分4來測 定，所述算法已被整合至ALIGN程序（2.0版）中。或者，可使用GCG軟件包中的GAP程序， 使用NWSgapdna.CMP矩陣來測定兩個核苷酸序列之間的同一,性百分比。各種其它序列比對 程序是可用的，并且可被用來測定序列同一性，例如，Clustal。
[0055] 提高、增加或減少：如本文中所用，術語"提高"、"增加"或"減少"或語法等同物， 指示相對于基線測量，例如在本文中描述的治療開始之前相同個體中的測量或在本文中描 述的治療不存在的情況下對照個體（或多個對照個體）中的測量的值。"對照個體"是患有 與正在治療的個體相同的溶酶體貯積病形式的個體，所述個體與正在治療的個體年齡大致 相同（以確保被治療個體與對照個體的疾病分期是可比較的）。
[0056] 鞘內施用：如本文中所用，術語"鞘內施用"或"鞘內注射"是指至椎管內的注射 (圍繞脊髓的鞘內空間）。可使用各種技術，包括但不限于，通過鉆孔的側腦室注射或池穿 刺或腰椎穿刺等。在一些實施方案中，根據本發明的"鞘內施用"或"鞘內遞送"是指通過腰 部區域或腰部區的IT施用或遞送，即腰IT施用或遞送。如本文中所用，術語"腰部區"或 "腰部區域"指的是第三和第四腰（下背部）椎骨之間的區域，更包含地，脊椎的L2-S1區。
[0057] 分離的：如本文中所用，術語"分離的"是指這樣的物質和/或實體，所述物質和/ 或實體（1)已與當最初產生（無論是在自然界中還是在實驗環境中）時與其結合的組分的 至少一些分離，和/或（2)已通過人的手產生、制備和/或制造。分離的物質和/或實體可 與約 10%、約 20%、約 30%、約 40%、約 50%、約 60%、約 70%、約 80%、約 90%、約 91%、 約92 %、約93 %、約94 %、約95 %、約96 %、約97 %、約98 %、約99 %或更多的與它們最初結 合的其它組分分離。在一些實施方案中，分離物質具有約80%、約85%、約90%、約91%、 約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或高于約99%的純度。 如本文中所用，如果物質基本上不含其它組分的話，則它是"純的"。如本文中所用，分離的 物質和/或實體的百分比純度的計算不應包括賦形劑（例如，緩沖液、溶劑、水等）。
[0058] 培養基：如本文中所用，該術語指包含有素滋養生長細胞的營養物的溶液。通常情 況下，這些溶液提供了細胞進行最低生長和/或存活所需的必需和非必需氨基酸、維生素、 能量來源、脂質和微量元素。該溶液還可包含增強高于最小速率的生長和/或存活的組分， 包括激素和生長因子。在一些實施方案中，將培養基配制為對于細胞存活和增殖是最佳的 pH和鹽濃度。在一些實施方案中，培養基可以是"化學成分確定的培養基"一不含蛋白質、 水解產物或未知組合物的組分的無血清培養基。在一些實施方案中，化學成分確定的培養 基不含動物來源的組分并且培養基中的所有組分具有已知的化學結構。在一些實施方案 中，培養基可以是"基于血清的培養基" 一已補充了動物來源的組分例如但不限于胎牛血 清、馬血清、山羊血清、驢血清和/或其組合的培養基。
[0059] 核酸：如本文中所用，術語"核酸"以其最廣泛的意義是指為寡核苷酸鏈或可被并 入寡核苷酸鏈的化合物和/或物質。在一些實施方案中，核酸是作為寡核苷酸鏈或可通過 磷酸二酯鍵并入寡核苷酸鏈的化合物和/或物質。在一些實施方案中，"核酸"是指個別核 酸殘基（例如，核苷酸和/或核苷）。在一些實施方案中，"核酸"是指包含個別核酸殘基的 寡核苷酸鏈。如本文所使用的，術語"寡核苷酸"和"多核苷酸"可以互換使用。在一些實施 方案中，"核酸"涵蓋RNA以及單鏈和/或雙鏈DNA和/或cDNA。此外，術語"核酸"、"DNA"、 "RNA"和/或類似術語包括核酸類似物，即，具有除磷酸二酯骨架外的類似物。例如，所謂 的"肽核酸"，其在本領域是已知的并且在骨架中具有肽鍵而非磷酸二酯鍵，被認為在本發 明的范圍之內。術語"編碼氨基酸序列的核苷酸序列"包括互為簡并形式和/或編碼相同 氨基酸序列的所有核苷酸序列。編碼蛋白質和/或RNA的核苷酸序列可包括內含子。核 酸可以從天然來源中純化，使用重組表達系統產生并任選地純化，化學合成等。在適當情況 下，例如，在化學合成分子的情況下，核酸可包含核苷類似物，例如具有經化學修飾的堿基 或糖、骨架修飾等的類似物。除非另有說明，否則核酸序列以5'至3'方向顯示。術語"核 酸區段"在本文中用于指作為更長的核酸序列的一部分的核酸序列。在許多實施例中，核 酸區段包含至少3、4、5、6、7、8、9、10或更多個殘基。在一些實施方案中，核酸是或包含天然 核苷（例如，腺苷、胸苷、鳥苷、胞苷、尿苷、脫氧腺苷、脫氧胸苷、脫氧鳥苷和脫氧胞苷）；核 苷類似物（例如，2-氨基腺苷、2-硫代胸苷、肌苷、吡咯并嘧啶、3-甲基腺苷、5-甲基胞苷、 C-5丙炔基-胞苷、C-5丙炔基-尿苷、2-氨基腺苷、C5-溴尿苷、C5-氟尿苷、C5-碘尿苷、 C5-丙炔基-尿苷、C5-丙炔基-胞苷、C5-甲基胞苷、2-氨基腺苷、7-脫氮腺苷、7-脫氮鳥 苷、8-氧代腺苷、8-氧代鳥苷、0(6)-甲基鳥嘌呤和2-硫代胞苷）；化學修飾堿基；生物修 飾的堿基（例如，甲基化堿基）；嵌入堿基；修飾糖（例如，2'-氟代核糖、核糖、2'-脫氧核 糖、阿拉伯糖和己糖）；和/或修飾磷酸基團（例如，硫代磷酸酯和5'-N-亞磷酰胺鍵）。在 一些實施方案中，本發明特別針對"未修飾核酸"，意指未經歷化學修飾以促進或實現遞送 的核酸（例如，多核苷酸和殘基，包括核苷酸和/或核苷）。
[0060] 灌注工藝：如本文中所用，術語"灌注工藝"是指其中在培養過程開始之后將另外 的組分連續地或半連續地提供給培養物的培養細胞的方法。所提供的組分通常包括已在培 養過程中被耗盡的細胞的營養補充劑。通常在連續或半連續的基礎上收獲培養基中的一部 分細胞和/或組分并且任選地對其進行純化。通常情況下，涉及灌注工藝的細胞培養過程 被稱為"灌注培養"。通常情況下，在灌注工藝過程中在新鮮培養基中提供營養補充劑。在 一些實施方案中，新鮮培養基可與細胞培養過程中使用的基本培養基相同或相似。在一些 實施方案中，新鮮的培養基可與基本培養基不同，但包含期望的營養補充劑。在一些實施方 案中，新鮮培養基是化學成分確定的培養基。
[0061] 蛋白質：如本文中所用，術語"蛋白質"是指多肽（即，至少2個通過肽鍵彼此連接 的氨基酸的串）。蛋白質可包括除氨基酸外的部分（例如，可以是糖蛋白、蛋白聚糖等）和 /或可另外地被加工或修飾。本領域普通技術人員將理解，"蛋白質"可以是如由細胞產生 的完整的多肽鏈（具有或不具有信號序列），或可為其特征部分。在一些實施方案中，蛋白 質有時可包括1個以上的多肽鏈，例如，通過一個或多個二硫鍵連接或通過其它方式締合。 在一些實施方案中，多肽可含有L-氨基酸、D-氨基酸或兩者，并且可以包含多種本領域已 知的氨基酸修飾或類似物中的任一種。有用的修飾包括，例如，末端乙酰化、酰胺化、甲基化 等。在一些實施方案中，蛋白質可包含天然氨基酸、非天然氨基酸、合成氨基酸及其組合。術 語"肽"通常用于指具有長度少于約100個氨基酸、少于約50個氨基酸、少于20個氨基酸 或少于10個氨基酸的肽。在一些實施方案中，蛋白質是抗體、抗體片段、其生物活性部分和 /或其特征部分。
[0062] 重組蛋白和重組多肽：如本文中所用，這些術語是指從宿主細胞表達的多肽，所述 宿主細胞已經被基因工程化以表達該多肽。在一些實施方案中，重組蛋白可在來源于動物 的宿主細胞中表達。在一些實施方案中，重組蛋白可在來源于昆蟲的宿主細胞中表達。在一 些實施方案中，重組蛋白可在來源于酵母的宿主細