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【主權項】
1.HBV基因組中的寡核苷酸組在制備用于測定HBV的基因型的試劑盒中的用途,其中所述寡核苷酸組包括以下基因型的核苷酸:基因型A:T451和T586;基因型B:A321、T324和G408;基因型C:A491和G633;基因型D:T289、A290和T867;基因型E:C705、C706、T837、C840和〇843;基因型?:六628、了837和六838;基因型6:了306、了936和6939;以及基因型!^493、六494、A838、A840、G841和C842。2.權利要求1的用途,所述試劑盒還用于測定從患者生物樣品中提取的HBV是否對LMV、ADV和/或對其它核苷/核苷酸類似物、干擾素或其它抗HBV藥劑或其組合的敏感性下降,并且其中所述寡核苷酸組還包括編碼HBV DNA聚合酶中的以下的突變的核苷酸:rtL801、rtL82M、rtF166L、rtQ215S和rtM204I/V/S +/- rtL180Mo3.權利要求1的用途,所述試劑盒還用于測定從患者生物樣品中提取的HBV是否對LMV、ADV和對其它核苷/核苷酸類似物、干擾素和/或其它抗HBV藥劑或其組合的敏感性下降,并且其中所述寡核苷酸組還包括編碼HBV核心啟動子和/或前核心區中的選自以下的突變的核苷酸:A1752G/T、T1753C、T1754C、C1856T、C1862T、G1898A 和 G1899A。4.權利要求1的用途,所述試劑盒還用于測定HBV對抗體的反應性例如疫苗逃逸、免疫球蛋白療法逃逸或抗HBV血清學檢測逃逸或其組合是否降低的試劑盒中的用途,并且其中所述寡核苷酸組還包括編碼HBV包膜蛋白中的選自以下的突變的核苷酸:sQ101、sL104、sC107、sS/T114、sT115、sT116、sC121、sK/R122、sT123、sC124、sI/T126、sQ129、sG130、sN/T131、sF/Y134、sP135、sS136、sC137、sC138、sC139、sT/S140、sK141、sP142、sN146、sC147、sT148、sP153、sS154、sS155、sA157、sF/L158、sA/G159、sW163、sS167和sA/D168。5.權利要求3的用途,其中所述寡核苷酸組包括編碼所述核心啟動子和/或前核心區中的突變的核苷酸,所述突變包括:A1752G/T、T1753C、T1754C、C1856T、C1862T、G1898A和G1899A。6.權利要求4的用途,其中所述寡核苷酸組包括編碼HBV包膜蛋白中的突變的核苷酸,所述突變包括:80101、81^104、8(:107、85/1'114、81'115、81'116、8(:121、81(/1?122、81'123、8(:124、sI/T126、sQ129、sG130、sN/T131、sF/Y134、sP135、sS136、sC137、sC138、sC139、sT/S140、sK141、sP142、sN146、sC147、sT148、sP153、sS154、sS155、sA157、sF/L158、sA/G159、sW163、sS167和sA/D168。7.權利要求1-6中任一項的用途,其中所述試劑盒同時檢測HBV變異株的多個突變和/或基因型,其中可用肉眼觀察結果。8.權利要求7的用途,其中所述試劑盒包含: a)寡核苷酸陣列,用于分析含有可變序列的靶序列; b)具有足夠大小和間距的斑點的陣列,可供肉眼觀測各個斑點;和 c)含有生物素標記的核苷酸和酶的反應試劑。9.權利要求8的用途,其中所述酶是反轉錄酶或DNA聚合酶。10.權利要求8的用途,其中延伸的每個寡核苷酸可通過由鏈霉抗生物素堿性磷酸酶或辣根過氧化物酶催化的比色反應來檢測。11.權利要求10的用途,其中在比色反應中的底物是BCIP/NBT或4-氯-1-萘酚。12.—種用于檢測HBV變異株的突變和/或基因型的試劑盒,其中所述試劑盒包含具有用于檢測所述HBV變異株的突變和/或基因型的核苷酸序列的載玻片,其中所述核苷酸序列是權利要求1-6中任一項所使用的寡核苷酸組。13.權利要求12的試劑盒,其中所述試劑盒還包含用于覆蓋樣品的蓋玻片。14.權利要求13的試劑盒,其中所述試劑盒還包含反應試劑。15.權利要求14的試劑盒,所述反應試劑包括緩沖劑、dNTP和聚合酶。16.權利要求14的試劑盒,其中所述試劑盒還包含用于肉眼觀測的試劑。17.權利要求16的試劑盒,其中所述用于肉眼觀測的試劑包含鏈霉抗生物素堿性磷酸酶或辣根過氧化物酶和BCIP/NBT或4-氯-1-萘酚。
【專利摘要】本發明提供用于以下方面的診斷試劑盒和材料:1)預測慢性乙型肝炎病毒(HBV)攜帶者對用核苷/核苷酸類似物或其組合治療的長期反應;2)檢測對抗體檢測的反應性降低的HBV變異株;3)檢測在前核心/核心區負面影響肝病進程的HBV變異株;4)鑒定HBV基因型。
【IPC分類】C12Q1/70, C12R1/93, C12Q1/68
【公開號】CN105648110
【申請號】
【發明人】陳繼明, 陳立怡, 黎青龍, 袁孟峰
【申請人】香港大學
【公開日】2016年6月8日
【申請日】2009年4月3日