0Ji1 反應體系:10Ji1SsoAdvanceSYBRMastermix, 5Ji1cDNA,200nM引物, 剩余體積用無菌水補齊至20Ji1。mcpM基因擴增引物為mcpM-F和mcpM-R(引物序列見表 1)內(nèi)參基因巧OD擴增引物為巧OD-F和巧OD-R;反應程序為:95°C預變性2分鐘,95°C變 性15秒,55 °C延伸1分鐘,40個循環(huán);從75 °C開始讀板,每個循環(huán)增加0. 5 °C制備溶解曲線。 相對表達量的計算方法參照Livak的2 。
[003引 巧)、結果分析:在接種至M9和LB兩種培養(yǎng)基之前是在LB中生長24小時的培養(yǎng) 物,因此選取此培養(yǎng)物為參照。如圖1所示,經(jīng)4小時和8小時培養(yǎng)后,mcpM基因的表達量 在M9培養(yǎng)基中明顯高于在LB培養(yǎng)基中的表達量,尤其是在8小時后,前者約是后者的20 倍。相對于LB,M9是寡營養(yǎng)、低滲透壓培養(yǎng)基,因此推測mcpM基因的表達受到低滲透壓的 誘導,其上游可能存在一個受滲透壓調(diào)節(jié)的啟動子。
[003引表1引物序列表
[003引實施例2:啟動子PmccPDI受滲透壓調(diào)控的鑒定:
[0039] 在實施例1的基礎上,通過如下步驟對啟動子PmeePDI進行鑒定,具體如下:
[0040](1)、大腸桿菌E25基因組DNA制備:取過夜培養(yǎng)的E25培養(yǎng)物100yL離心細菌 沉淀重懸在200yL無菌TE溶液(IOmMTris-HCl,ImM邸TA,pH8. 0),沸水煮lOmin,冷卻 至室溫,充分震蕩IOs后120(K)r/min離屯、2min,上清液即為大腸桿菌E25基因組DNA,置 于-20°C備用;
[0041](2)、PmeePDI啟動子序列的獲得及純化:根據(jù)mCCPDI基因簇序列(登錄號: JQ901381)設計一對引物PmeePDI-F/PmeePDI-R,W上述基因組DNA為模板進行PCR擴增,PCR反 應使用Invitrogen公司的PlatinumPCRSuperMixHi曲Fidelity試劑盒,反應體系和反 應條件按照試劑盒說明書進行。反應結束后對擴增產(chǎn)物使用QIAGEN公司的PCR純化試劑 盒進行,DNA濃度使用Nano化op?2000分光光度計完成。
[0042] (3)、滲透壓調(diào)控蛋白OmpR的表達、純化:OmpR是滲透壓調(diào)控蛋白,通常會結合到 滲透壓調(diào)節(jié)的啟動子序列上。為驗證Pm。。。。;是否受滲透壓調(diào)控,通過常規(guī)的原核表達在體外 獲得了OmpR蛋白,用于下述的凝聚阻滯實驗。
[0043] (4)、凝聚阻滯實驗(EMSA):將純化的啟動子DNA序列與不同濃度OmpR蛋白 (0,75,150,300,600,900ng)分別在結合緩沖液[lOmMTris(pH7.5),100mMKCl,10mM MgC12,ImMDTT,5%glycerol]中室溫解育30分鐘,然后加入電泳緩沖液在5%非變性TBE 膠100伏電泳45分鐘,用邸染色拍照。
[0044]巧)、EMSA結果分析:如圖2 (A)所示,在OmpR存在情況下,啟動子DNA電泳被阻滯, 在靠近點樣孔的出現(xiàn)出現(xiàn)蛋白質(zhì)-核酸復合物,尤其是隨著OmpR蛋白濃度的增加巧OOng), 所有的啟動子DNA電泳被阻滯,蛋白質(zhì)-核酸復合物出現(xiàn)在更大的位置。運說明PmttPDI啟動 子序列存在OmpR結合的位點,是受滲透壓調(diào)控的啟動子。
[004引做、PmeePDI啟動子序列中OmpR結合位點分析:將PmeePDI啟動子序列與OmpF和OmpC 的啟動子序列進行多重序列比對,結果如圖2度),P"_PDI啟動子序列至少存在3個OmpR結合 位點,含有保守的且必須的核巧酸位點,運進一步證實PmeePDI啟動子是受滲透壓調(diào)控的啟動 子。
[004引實施例3:含有啟動子PmeePDI的重組載體構建:
[0047] 本發(fā)明待表達外源基因W綠色巧光蛋白(GF巧基因為例,采用重疊延伸PCR法將 其連接到啟動子Pm。。。。;下游;構建含有啟動子P和GFP基因的重組表達載體,主要步驟 如下:
[004引 (1)、引物設計:W啟動子PmeePDI序列和GFP基因序列為模板,使用PrimerPremier 5軟件設計兩對引物,分別為PmccPDi-F/PmccPDi-SOE-R和GFP-SOE-F/GFP-R,用于下述的重疊 延伸PCR反應。
[0049] (2)、重疊延伸PCR法:重疊延伸PCR法包含兩輪PCR反應,第一輪PCR使用 PmccPDi-F/PmccPDi-SOE-RW實施例2中大腸桿菌E25基因組DNA為模板進行PCR擴增啟動子 PmccPDi,同時使用GFP-SOE-F/GFP-RW祀GFP-N3質(zhì)粒(帶有GFP基因)為模板進行PCR擴 增GFP基因。第二輪PCRW第一輪PCR擴增的產(chǎn)物為模板,使用P"_pdi-F/GFP-R進行擴增。 PCR反應使用Invitrogen公司的PlatinumPCRSuperMixHi曲Fidelity試劑盒,反應體 系和反應條件按照試劑盒說明書進行。第二輪PCR擴增產(chǎn)物為PmttPDI-GFP融合片段,使用 QIAGEN公司的PCR純化試劑盒進行對擴增產(chǎn)物進行純化,DNA濃度使用Nano化op?2000分 光光度計完成。
[0050](3)、將純化后的PmeePDI-GFP融合片段連接到pCR2. 1載體上(購買自Invitrogen 公司),DNA片段和載體的比例等按照說明書進行;使用熱激法將連接產(chǎn)物轉化至大腸桿菌 TOPlO感受態(tài)中,最后通過菌落PCR篩選陽性克隆。
[0051](4)、重組載體驗證:使用QIAGEN公司的質(zhì)粒制備試劑盒(QIAprepSpinMiniprep Kit)從陽性克隆中提取重組載體pCR2. 1-P"_pdi-GFP,送至上海生物工程公司測序驗證。[005引實施例4:啟動子P 驅動外源基因在大腸桿菌體系中表達的應用:
[0053] 本發(fā)明驅動的外源基因W綠色巧光蛋白(GF巧基因為例,說明啟動子PmttPDI驅動 外源基因在大腸桿菌體系中表達,具體步驟如下:
[0054] (1)、將在實施例3中測序驗證正確的重組載體轉化至大腸桿菌基因工程菌株 TOPlO中,在含有氨節(jié)青霉素的LB中培養(yǎng)過夜,分別W1 :100接種至新鮮的LB和M9兩種 不同滲透壓的培養(yǎng)基,置于37°C搖床20化pm震蕩培養(yǎng)。LB培養(yǎng)基和M9培養(yǎng)基配方與實施 例1中相同。
[00巧](2)、巧光觀察GFP表達:培養(yǎng)8小時后,分別取Iml培養(yǎng)物1200化pm離屯、2min, 細菌沉淀重懸于含0. 5yg/mlDAPI的PBS中室溫避光解育IOmin;然后將細菌懸液轉移至 多聚賴氨酸處理后的載玻片上,使細菌自然吸附到載玻片上,輕輕使用PBS細菌未吸附的 細菌后,蓋玻片封片。
[005引啟動子PmccPD在低滲透壓啟動GFP基因表達:巧光顯微觀察顯示結果如圖3所示, 攜帶重組質(zhì)粒pCR2.I-PmeePDI-GFP的TOPlO菌株在M9培養(yǎng)基中培養(yǎng)有明顯的綠色巧光,而在 LB培養(yǎng)基中未觀察綠色巧光,運說明在低滲透壓培養(yǎng)基中啟動子PmttPDI發(fā)揮功能,能啟動外 源基因的表達。
[0057] W上所述,僅為本發(fā)明的較佳實施例,并非對本發(fā)明作任何形式上和實質(zhì)上的限 審Ij,凡熟悉本專業(yè)的技術人員,在不脫離本發(fā)明技術方案范圍內(nèi),當可利用W上所掲示的技 術內(nèi)容,而作出的些許更動、修飾與演變的等同變化,均為本發(fā)明的等效實施例;同時,凡依 據(jù)本發(fā)明的實質(zhì)技術對W上實施例所作的任何等同變化的更動、修飾與演變,均仍屬于本 發(fā)明的技術方案的范圍內(nèi)。
【主權項】
1. 一種受滲透壓調(diào)控的啟動子P 其特征在于:所述啟動子P_PDI來源于大腸桿菌 SSuT-25菌株,其DNA序列如SEQ ID NO. 1所示。2. 根據(jù)權利要求1所述的一種受滲透壓調(diào)控的啟動子P_PDI,其特征在于:所述啟動子 PmccPDi在體外能與滲透壓調(diào)節(jié)蛋白OmpR相結合,擁有至少3個潛在的OmpR結合位點。3. -種重組表達載體,其特征在于,所述重組表達載體包含權利要求1或2所述的受滲 透壓調(diào)控的啟動子P_PDI;在重組表達載體中,啟動子P_PDI連接于外源基因序列的上游。4. 根據(jù)權利要求3所述的重組表達載體,其特征在于,所述的外源基因為綠色熒光蛋 白基因或其他待表達外源基因。5. 根據(jù)權利要求3或4所述的重組表達載體,其特征在于:所述重組表達載體為 pCR2. l-Pmc(:pDI-GFP〇6. 權利要求1或2所述的受滲透壓調(diào)控的啟動子P_PDI在驅動外源基因表達中的應用。7. 根據(jù)權利要求6所述的應用,其特征在于:所述外源基因為綠色熒光蛋白基因。8. 根據(jù)權利要求6所述的應用,其特征在于:將包含權利要求1或2所述的受滲透壓 調(diào)控的啟動子P_PDI的重組表達載體PCR2. 1-P _pdi-GFP轉化到大腸桿菌基因工程T0P10菌 株中,在M9培養(yǎng)基中誘導GFP基因的表達,表明低滲透壓誘導條件下啟動子P_ PDI能驅動目 標基因在大腸桿菌體系中的尚效表達。
【專利摘要】本發(fā)明一種受滲透壓調(diào)控的啟動子PmccPDI、其重組表達載體及應用,屬于基因工程領域。所述啟動子PmccPDI序列如SEQ?ID?NO.1所示,來源于大腸桿菌SSuT-25菌株;該啟動子在體外能與滲透壓調(diào)節(jié)蛋白OmpR相結合,擁有至少3個潛在的OmpR結合位點。本發(fā)明還提供了含有該啟動子以及GFP基因的重組表達載體,將該重組表達載體轉化到大腸桿菌基因工程TOP10菌株中,在M9培養(yǎng)基中能誘導GFP基因的表達。本發(fā)明的啟動子具有可以不依賴于IPTG等化學試劑誘導實現(xiàn)外源基因在大腸桿菌表達體系中高效表達,成本低,對表達產(chǎn)物不產(chǎn)影響;有利于表達產(chǎn)物尤其是分泌性表達蛋白的后續(xù)純化和活性分析的優(yōu)點。
【IPC分類】C12N15/113, C12N15/70, C12N1/21, C12R1/19
【公開號】CN105296489
【申請?zhí)枴緾N201510875053
【發(fā)明人】趙哲, 胡超群, 任春華, 江曉, 鄧益琴
【申請人】中國科學院南海海洋研究所
【公開日】2016年2月3日
【申請日】2015年12月2日