多個開放式阱包括至少100個開放式阱。
41. 如權利要求27所述的組件，其中所述多個開放式阱包括至少1000個開放式阱。
42. 如權利要求27所述的組件，其中所述受抑制液體包含PCR試劑。
43. 如權利要求27所述的組件，其中所述受抑制液體包含擴增的核酸。 44?如權利要求27所述的組件，其中所述芯片具有IOmm至200mm的長度、IOmm至200mm 的寬度以及〇? Imm至10厘米的厚度。
45. 如權利要求27所述的組件，其中所述襯底包括選自由以下組成的組的材料：玻璃、 陶瓷、類金屬、硅、硅酸鹽、氮化硅、二氧化硅、石英、砷化鎵、塑料和有機聚合物材料。
46. 如權利要求27所述的組件，其中所述芯片還包括單獨控制的加熱元件，每個所述 加熱元件可操作地連接至開放式阱。
47. 如權利要求27所述的組件，其中所述至少一個提取固定裝置通過附接部件附接至 所述芯片或保持與所述芯片相鄰，所述附接部件選自由以下組成的組：螺絲、粘合劑、至少 一個夾具和螺栓。
48. -種系統，其包括： a) 芯片，其中所述芯片包括襯底和形成于所述襯底中的多個開放式阱，其中所述多個 開放式阱含有受抑制液體，以及 b) 至少一個提取固定裝置，所述至少一個提取固定裝置被設定尺寸以與所述芯片相鄰 和/或附接至所述芯片以便形成組件，并且其中所述至少一個提取固定裝置進一步被設定 尺寸，以使得當所述受抑制液體存在于所述多個開放式阱中并且被迫離開所述多個開放式 阱以形成釋放液體時，所述釋放液體由所述至少一個提取固定裝置保持或流過所述至少一 個提取固定裝置。
49. 如權利要求48所述的系統，其還包括c)被配置成向所述組件施加力的裝置。
50. 如權利要求49所述的系統，其中所述裝置包括離心機。
51. 如權利要求48所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置包括提取固定裝置基 部，其中所述提取固定裝置基部包括被設定尺寸以收集流體的錐形區段。
52. 如權利要求48所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置包括提取固定裝置基 部，其中所述提取固定裝置基部包括：i)被設定尺寸以保持所述芯片的口袋部件；ii)被設 定尺寸以收集流體的錐形區段；以及iii)被設定尺寸以保持墊圈的墊圈軌道。
53. 如權利要求52所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置還包括：i)被設定尺 寸以附接至所述提取固定裝置基部以便封閉所述芯片的提取固定裝置頂板；ii)被配置成 配合在所述芯片與所述提取固定裝置頂板之間的紙墊圈；以及iii)被配置成允許通過所 述固定裝置頂板分配樣品的樣品杯。
54. 如權利要求52所述的系統，其中從所述多個開放式阱中的至少一個流出的所述液 體由所述至少一個提取固定裝置保持。
55. 如權利要求48所述的系統，其還提供基部保持部件，其中所述基部保持部件被設 定尺寸以保持與所述芯片相鄰的所述至少一個提取固定裝置。
56. 如權利要求55所述的系統，其還包括安裝在所述基部保持部件中的至少一個收集 管，其中從所述多個開放式阱中的至少一個流出的所述液體流過所述至少一個提取固定裝 置進入所述至少一個收集管中。
57. 如權利要求48所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置附接至所述芯片。
58. 如權利要求48所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置包括至少兩個提取固 定裝置。
59. 如權利要求48所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置包括至少九個提取固 定裝置。
60. 如權利要求48所述的系統，其中所述多個開放式阱中的每一個具有在0. 1納升與 500納升之間的容積。
61. 如權利要求48所述的系統，其中所述多個開放式阱中的每一個具有在I. 0納升與 250納升之間的容積。
62. 如權利要求48所述的系統，其中所述多個開放式阱包括至少2個開放式阱。
63. 如權利要求48所述的系統，其中所述多個開放式阱包括至少1000個開放式阱。
64. 如權利要求48所述的系統，其中所述受抑制液體是受表面張力抑制的液體。
65. 如權利要求48所述的系統，其中所述芯片具有IOmm至200mm的長度、IOmm至200mm 的寬度以及〇? Imm至10厘米的厚度。
66. 如權利要求48所述的系統，其中所述襯底包括選自由以下組成的組的材料：玻璃、 陶瓷、類金屬、硅、硅酸鹽、氮化硅、二氧化硅、石英、砷化鎵、塑料和有機聚合物材料。
67. 如權利要求48所述的系統，其中所述芯片還包括單獨控制的加熱元件，每個所述 加熱元件可操作地連接至開放式阱。
68. 如權利要求48所述的系統，其中所述至少一個提取固定裝置通過附接部件附接至 所述芯片或保持與所述芯片相鄰，所述附接部件選自由以下組成的組：螺絲、粘合劑、至少 一個夾具和螺栓。
69. -種制造制品，其包括：提取固定裝置，所述提取固定裝置被設定尺寸以附接至芯 片和/或保持與所述芯片相鄰以便形成組件， 其中所述芯片包括襯底和形成于所述襯底中的多個開放式阱，其中所述多個開放式阱 含有受抑制液體，并且 其中所述提取固定裝置進一步被設定尺寸以使得當所述受抑制液體存在于所述多個 開放式阱中并且被迫離開所述多個開放式阱以成為釋放液體時，所述釋放液體的至少一部 分由所述提取固定裝置保持或流過所述提取固定裝置。
70. 如權利要求69所述的制品，其中所述至少一個提取固定裝置包括提取固定裝置基 部，其中所述提取固定裝置基部包括被設定尺寸以收集流體的錐形區段。
71. 如權利要求69所述的制品，其中所述至少一個提取固定裝置包括提取固定裝置基 部，其中所述提取固定裝置基部包括：i)被設定尺寸以保持所述芯片的口袋部件；ii)被設 定尺寸以收集流體的錐形區段；iii)被設定尺寸以保持墊圈的墊圈軌道。
72. 如權利要求71所述的制品，其中所述至少一個提取固定裝置還包括提取固定裝置 頂板，所述提取固定裝置頂板被設定尺寸以附接至所述提取固定裝置基部以便封閉所述芯 片。
73. 如權利要求71所述的制品，其中從所述多個開放式阱中的至少一個流出的所述液 體由所述至少一個提取固定裝置保持。
74. 如權利要求69所述的制品，其還提供基部保持部件，其中所述基部保持部件被設 定尺寸以保持與所述芯片相鄰的所述至少一個提取固定裝置。
75. 如權利要求74所述的制品，其還包括安裝在所述基部保持部件中的至少一個收集 管，其中從所述多個開放式阱中的至少一個流出的所述液體流過所述至少一個提取固定裝 置進入所述至少一個收集管中。
76. 如權利要求69所述的制品，其中所述至少一個提取固定裝置附接至所述芯片。
77. -種制作組件的方法，其包括： a) 將至少一個提取固定裝置附接至芯片和/或使至少一個提取固定裝置和芯片接觸， 以形成組件， 其中所述芯片包括襯底和形成于所述襯底中的多個開放式阱，其中所述多個開放式阱 含有受抑制液體， 其中所述至少一個提取固定裝置附接至所述芯片和/或與所述芯片相鄰，以使得被迫 離開所述多個開放式阱以成為釋放液體的任何所述受抑制液體由所述至少一個提取固定 裝置保持或流過所述至少一個提取固定裝置，以及 b) 利用密封部件將所述至少一個提取固定裝置密封至所述芯片，以便在所述芯片的至 少一部分與所述至少一個提取固定裝置之間形成水密密封。
78. 如權利要求77所述的方法，其中所述密封部件包括O形環。
79. 如權利要求77所述的方法，其中所述密封部件選自由以下組成的組：螺絲、粘合 劑、至少一個夾具和螺栓。
80. -種方法，其包括： a) 提供芯片，其中所述芯片包括襯底和形成于所述襯底中的多個開放式阱，其中所述 多個開放式阱含有受抑制液體，并且其中所述芯片至少部分地由覆蓋所述多個開放式阱的 密封膜覆蓋； b) 將所述密封膜的至少一部分從所述芯片移除以形成開放區域； C)將提取固定裝置附接至所述芯片和/或使得所述提取固定裝置與所述芯片相鄰，以 使得所述開放區域由所述提取固定裝置覆蓋以形成組件，其中所述提取固定裝置附接至所 述芯片和/或與所述芯片相鄰，以使得被迫離開所述多個開放式阱以成為釋放液體的任何 所述受抑制液體由所述提取固定裝置保持或流過所述提取固定裝置；以及 d)利用密封部件將所述至少一個提取固定裝置密封至所述芯片，以便在所述芯片的至 少一部分與所述提取固定裝置之間形成水密密封。
81. 如權利要求80所述的方法，其還包括步驟e):使所述組件經受力以使得所述受抑 制液體的至少一部分從所述多個開放式阱中的至少一個流出以成為釋放液體，所述釋放液 體由所述提取固定裝置保持。
82. -種用于減小納米阱芯片上的擴增子產量的動態范圍的方法，其包括： i) 識別初始納米阱芯片中的至少一個阱，所述至少一個阱在擴增期間從特定靶標產生 相對于所述納米阱芯片中的所有所述阱擴增期間的平均擴增子產量增加或減少的擴增子 產量；以及 ii) 除了至少以下各項之外使用與所述初始納米阱芯片相同設置的測試納米阱芯片來 執行擴增： A) 所述測試納米阱芯片上的另外的阱被用于識別為具有減少的擴增子產量的靶標； B) 發現具有增加的表達的靶標與其它靶標結合以使得在單個阱中發生多重擴增； C) 增大發現具有低擴增子產量的阱中的引物濃度； D) 減小發現具有高擴增子產量的阱中的引物濃度； E) 使抑制劑包含在發現具有高擴增子產量的阱中； F) 切換到發現具有高擴增子產量的阱中的效率較低的引物； G) 如果擴增子產量減少則更改阱中的熱循環溫度和/或時間以增加擴增子產量，或如 果擴增子產量增加則更改阱中的熱循環溫度和/或時間以減少擴增子產量；以及 H) 如果擴增子產量減少則更改阱的深度、寬度和/或容積以增加擴增子產量，或如果 擴增子產量增加則更改阱的深度、寬度和/或容積以減少擴增子產量。
【專利摘要】本發明提供用于從芯片中的開放式阱提取受抑制液體(例如，受表面張力抑制的液體)的方法、系統、組件和制品，其中當所述阱保持倒置時所述受抑制液體不會由于重力而從所述阱中流出。例如，本發明提供可附接至芯片和/或保持與所述芯片相鄰的提取固定裝置，以使得被迫離開所述開放式阱的任何受抑制液體由所述提取固定裝置收集或流過所述提取固定裝置。另外，例如，本發明提供由附接至芯片和/或保持與所述芯片相鄰的提取固定裝置組成的組件、以及使此類組件經受力以使得所述開放式阱中的所述受抑制液體的至少一部分被迫離開并且由所述提取固定裝置收集或流過所述提取固定裝置的方法。
【IPC分類】C12M1/00, B01L3/00
【公開號】CN104884168
【申請號】CN201380058480
【發明人】B·L·格里斯沃爾德, S·A·胡塞恩, R·莫蒂, W·B·唐格, G·康特里, J·鄧恩, P·林
【申請人】瓦弗根公司
【公開日】2015年9月2日
【申請日】2013年11月8日
【公告號】CA2891088A1, EP2916953A2, US20140130885, WO2014074863A2, WO2014074863A3