用于控制昆蟲侵襲的核苷酸序列及其方法
【技術領域】
[0001] 本發明設及一種用于控制昆蟲侵襲的核巧酸序列及其方法,特別是設及一種利用 RNAi技術降低或關閉盲睹峻體內祀標序列的表達來控制盲睹峻的方法。
【背景技術】
[0002] 農田作物通常是昆蟲攻擊的目標。在過去數十年中,關于開發用于作物中昆蟲侵 襲的更為有效的方法和組合物,已有了一些實質性的進展。化學殺蟲劑對于控制有害生物 侵襲是比較有效的手段。但是,使用化學殺蟲劑同時也有很多缺點。首先化學殺蟲劑是非選 擇性的,人們意欲應用化學殺蟲劑來控制對多種作物和其他植物來說有害的昆蟲,但是由 于其缺乏選擇性,化學殺蟲劑對于非目標的生物也會造成傷害,例如版蝴等。并且,在化學 殺蟲劑應用過的一段時間,通常會使田野貧瘡。化學殺蟲劑持續存在于環境中,通常很慢被 代謝。運種緩慢代謝,使得作物及環境中存在化學殺蟲劑的殘留,它們會積累于食物鏈中, 特別是高等食肉動物的食物鏈中。運些化學殺蟲劑的積累導致對更高端的物種誘導了疾 病,例如人類的癌癥。因此人們強烈需要對環境友善的方法用于控制或根除作物生產中的 昆蟲侵襲,即選擇性的,環境友好的,生物可降解的,并且能很好地用于有害生物抗性管理 體系的方法。
[0003] 在過去的幾十年中,開發用于控制植物蟲害的有效方法已取得了實質性的進展。 化學殺蟲劑雖然對于根除植物害蟲非常有效,但是其對于非祀標昆蟲也會施加作用,同時 化學殺蟲劑持續存在于環境中,不僅對環境造成不可逆的污染,還會導致抗藥性昆蟲的出 現。微生物殺蟲劑,特別是從蘇云金芽抱桿菌(Bacillus thuringiensis,簡稱化)菌株所獲 得的殺蟲劑,作為化學殺蟲劑的替代品,在農業生產中發揮了重要作用,其對包括鱗翅目、 雙翅目、銷翅目和半翅目等昆蟲具有一定的殺蟲活性,但是微生物殺蟲劑對于施藥環境的 要求比較高,如果環境不適合運些微生物的生長,在生產上則需要重復施用,有些甚至重復 施用也不能達到控制害蟲的目的,大大增加了生產成本。通過基因工程將編碼化殺蟲蛋白 的一種或多種基因轉入植物中,可獲得一些害蟲抗性增強的轉基因植物,例如經基因工程 產生C巧毒素的玉米和棉花植物已經廣泛應用于美國的農業生產中,并且為農民提供了傳 統害蟲控制方法的可選方案。但是目前開發的含有Cry毒素的轉基因作物只能用于防治范 圍相對狹窄的害蟲,而尚未有能夠防治刺吸式害蟲的產品。而刺吸式害蟲因其繁殖速度快, 分布區域廣,正在成為已開發的轉基因作物中的最主要害蟲。
[0004] 本領域中已報道了反義方法和組合物,它們被相信能通過單鏈RNA分子(理論上, 能在體內與高度互補的正義鏈RNA分子雜交)的合成施加其作用。反義技術難于在很多系統 中使用,運有Ξ個主要原因。首先,轉化細胞中表達的反義序列不穩定。第二,轉化細胞中表 達的反義序列的不穩定性隨之對將該序列運送到遠離轉基因細胞的宿主、細胞類型或生物 系統造成困難。第Ξ,隨著不穩定性和反義序列的運送遇到的困難對于如下企圖來說也制 造困難,所述企圖是:在編碼該反義序列的重組細胞內部提供能有效調節目標正義核巧酸 序列表達水平的劑量。
[0005] RNA干擾或RNAi是用W在細胞或整個生物體環境下W序列特異性方式下調基因表 達的一種方法,其通過特異性祀向選擇和高效mRNA遏制,可W達到定向干設祀基因表達的 目的。雖然利用RNAi技術來進行害蟲防治是本領域的已知的,但是將運種技術用作控制昆 蟲侵襲措施的關鍵因素是選擇最適當的祀基因,即功能缺失導致必需生物過程嚴重破壞 和/或生物體死亡的那些基因。因此,本發明將下調害蟲中的特定祀基因作為一種手段來實 現控制昆蟲侵襲,特別是控制植物的昆蟲侵襲。
【發明內容】
[0006] 本發明的目的是提供一種用于控制昆蟲侵襲的核巧酸序列及其方法,即利用RNAi 技術按下述方式來下調祀標序列的表達:削弱昆蟲存活、生長、繁殖、定殖特定環境和/或侵 襲寄主的能力,W實現控制昆蟲侵襲及由其造成的損害。
[0007] 為實現上述目的,本發明提供了一種分離的多核巧酸序列,包括:
[000引(a)SEQ ID N0:l、2或3所示的多核巧酸序列;或
[0009] (b)在嚴格條件下與(a)限定的多核巧酸序列雜交的多核巧酸序列;或
[0010] (C)與(a)限定的多核巧酸序列具有80% W上同一性的多核巧酸序列;或
[0011] (d)(a)限定的多核巧酸序列的至少17個連續核巧酸的多核巧酸序列,其中半翅目 昆蟲害蟲攝取包含與所述多核巧酸序列互補的至少一條鏈的雙鏈RNA,抑制所述半翅目昆 蟲害蟲的生長;或
[0012] (e)上述(a)、(b)、(c)或(d)限定的多核巧酸序列的互補序列。
[0013] 進一步地,所述多核巧酸序列還包括所述多核巧酸序列的互補序列。
[0014] 更進一步地,所述多核巧酸序列還包括間隔序列。
[0015] 優選地,所述多核巧酸序列為SEQ ID N0:4、5或6。
[0016] 為實現上述目的,本發明還提供了一種表達盒,包含在有效連接的調控序列調控 下的所述多核巧酸序列。
[0017] 為實現上述目的,本發明還提供了一種包含所述多核巧酸序列或所述表達盒的重 組載體。
[0018] 為實現上述目的,本發明還提供了一種所述多核巧酸序列用于干擾半翅目昆蟲害 蟲祀標序列表達或抑制半翅目昆蟲害蟲生長的用途。
[0019] 為實現上述目的,本發明還提供了一種干擾核糖核酸序列,所述干擾核糖核酸序 列在被半翅目昆蟲害蟲攝入后起到下調所述半翅目昆蟲害蟲中至少一種祀標序列表達的 作用,其中所述干擾核糖核酸序列包含至少一個沉默元件,其中所述沉默元件是包含退火 的互補鏈的一個雙鏈RNA區域,其中一條鏈包含與所述祀標序列內的一個祀標片段至少部 分地互補的一個核巧酸序列或由其組成,所述祀標序列包含所述多核巧酸序列。
[0020] 進一步地,所述沉默元件包含與所述祀標序列內的一個祀標片段互補至少部分地 互補的一個至少19個連續核巧酸的序列或由其組成。
[0021] 可選擇地,所述干擾核糖核酸序列包含至少兩個沉默元件,每一個所述沉默元件 包含與所述祀標序列內的一個祀標片段至少部分地互補的一個核巧酸序列或由其組成。
[0022] 進一步地,所述沉默元件各自包含與一個不同的祀標片段互補的一個不同的核巧 酸序列或由其組成。
[0023] 更進一步地,所述不同的祀標片段來源于單一祀標序列或來源于不同的祀標序 列。
[0024] 所述不同的祀標序列來源于相同的半翅目昆蟲害蟲或不同的半翅目昆蟲害蟲。
[0025] 優選地,所述半翅目昆蟲害蟲為盲睹峻。
[0026] 在上述技術方案的基礎上,所述干擾核糖核酸序列還包括間隔序列。
[0027] 具體地,所述干擾核糖核酸序列為SEQ ID NO:4、5或6。
[0028] 為實現上述目的,本發明還提供了一種控制半翅目昆蟲害蟲侵襲的組合物,包含 至少一種所述干擾核糖核酸序列和至少一種合適的載體、賦形劑或稀釋劑。
[0029] 進一步地,所述組合物包含一種表達或能夠表達所述干擾核糖核酸序列的宿主細 胞。具體地,所述宿主細胞是細菌細胞。
[0030] 更進一步地,所述組合物是固體、液體或凝膠。具體地,所述組合物是殺蟲噴霧劑。
[0031] 可選擇地,所述組合物還包含至少一種殺蟲劑,所述殺蟲劑為化學殺蟲劑、馬鈴馨 塊莖特異蛋白、蘇云金芽抱桿菌殺蟲蛋白、致病桿菌殺蟲蛋白、光桿狀菌殺蟲蛋白、側抱芽 抱桿菌殺蟲蛋白或球形芽抱桿菌殺蟲蛋白。
[0032] 為實現上述目的,本發明還提供了一種所述控制半翅目昆蟲害蟲侵襲的組合物用 于預防和/或控制半翅目昆蟲害蟲侵襲的用途。
[0033] 為實現上述目的,本發明還提供了一種控制半翅目昆蟲害蟲侵襲的方法,包括使 半翅目昆蟲害蟲與有效量的至少一種所述干擾核糖核酸序列接觸。
[0034] 為實現上述目的,本發明還提供了一種產生控制半翅目昆蟲害蟲的植物的方法, 包括將所述多核巧酸序列或所述表達盒或所述重組載體導入植物。
[0035] 為實現上述目的,本發明還提供了一種用于保護植物免受由半翅目昆蟲害蟲引起 的損傷的方法,包括將所述多核巧酸序列或所述表達盒或所述重組載體導入植物,導入后 的植物在被半翅目昆蟲害蟲攝食后起到抑制所述半翅目昆蟲害蟲的生長的作用。
[0036] 在上述技術方案的基礎上,所述植物為大豆、小麥、大麥、玉米、煙草、水稻、油菜、 棉花或向日葵。所述半翅目昆蟲害蟲為盲睹峻。
[0037] 本發明包含對半翅目昆蟲害蟲中一種或多種祀標序列的表達加 W調節或抑制的 方法,所述方法包括:將經穩定的雙鏈RNA(如dsRNA)或其修飾形式(例如,小干擾RNA序列) 的部分或全部引入到無脊椎有害昆蟲體內細胞或細胞外環境中。在昆蟲體內,dsRNA或 siRNA進入到細胞中,對至少一種或多種祀標序列的表達加 W抑制,并且運種抑制產生了減 弱昆蟲存活、生長、繁殖W及侵襲寄主的能力。
[003引本發明提供了一組分離和純化的多核巧酸序列,如SEQ ID N0:1至SEQ ID N0:3所 示。本發明提供穩定化的雙鏈RNA分子,用于抑制半翅目害蟲中從運些序列和片段表達祀標 序列。穩定化的雙鏈RNA包括至少兩個編碼序列,它們相對于至少一個啟動子是有義和反義 方向排列的,其中包含有義鏈和反義鏈的核巧酸序列通過至少約5-1000個核巧酸的間隔序 列連接或相連,其中有義鏈和反義鏈可W是不同的長度,并且其中所述兩個編碼序列中的 至少一個編碼序列與SEQ ID NO: 1至SEQ ID NO: 3所示的任何一個或多個核巧酸序列具有 至少80%的序列同一性,至少90%,至少95%,至少98%,或100%的序列同一性。
[0039]當表達為dsRNA并且提供給害蟲時,該片段可W定義為導致害蟲死亡、攝食抑制、 受阻或停止。該片段可W例如包含SEQ ID NO: 1至SEQ ID NO:3中任何一個或多個序列或其 互補序列的至少約19,21,23,25,40,60,80,100,125或更多個連續核巧酸,或約19-約100個 核巧酸,或更多。特別有用的是包括約19300個與害蟲祀標序列同源的核巧酸的dsRNA序列。 本發明也提供了從任何所述多核巧酸序列表達的RNA,包括dsRNA。可W來自一種或多種祀 害蟲的單個序列構建選擇用于表達基因抑制劑的序列,并且用于表達抑制一種或多種祀害 蟲中的單個基因或基因家族的RNA,或該DNA序列可從多種DNA序列構建為嵌合體。
[0040]本發明中所述的植物可W包括一種植物的任何生殖或繁殖材料,還可W包括植物 細胞、植物原生質體、植物組織培養物、植物愈傷組織及在植物或植物的部分中完好的植物 細胞,運些植物部分如胚、花粉、胚珠、種子、葉、花、枝、果實、核、穗、穗軸、外殼、莖、根、根尖 等。
[0041 ] 本發明所述的盲睹峻化ygus)屬于半翅目巧eteroptera)盲睹科(Miridae),是農 業生產上的一類重要害蟲。目前我國常見的種類有綠盲睹Apolygus lucorunKMeyer-Diir)、 中黑盲睹 Adelphocoris sutural is (Jakovlev)三點盲睹 Adelphocoris fasciaticollis (Reuter)、首猜盲睹Adelphocoris lineolatus(Goeze)和牧草盲睹Lygus pratensis 化innaeus)等。W綠盲睹峻危害最嚴重,成蟲W針刺吸附植株汁液為害,喜食植物的花、蕾、 果實等生殖器官。
[0042] 本發明中所述的"控制昆蟲"或"控制害蟲"或"控制昆蟲害蟲"是指能夠導致昆蟲 引起的損害受到限制且作用于昆蟲的任何作用,包括但不限于殺死昆蟲、抑制昆蟲發育、W 昆蟲對植物提供較小損害的方式改變昆蟲的繁殖力或生長、減少昆蟲產生的后代數量、產 生的正常昆蟲更少、產生更易受捕食者攻擊的昆蟲或者阻止昆蟲哨食植物。
[0043] 本發明中所述的"祀標序列"為意圖在昆蟲中下調的任何序列。通過下調祀標序列 來控制昆蟲的侵擾,例如破壞昆蟲中必需的生物過程。因此,優選的祀標序列包括但不限于 在調控攝食、存活、生長、發育、生殖、侵襲W及侵染方面發揮關鍵作用的基因。當該祀標序 列的表達被下調或受抑制時,至少20%的昆蟲被殺死;或阻止/延緩/妨礙/延遲/阻礙了至 少20 %的昆蟲的生長,阻止了至少20 %的昆蟲生殖,阻止了至少20 %的昆蟲通過生命周期 的轉變;或由昆蟲引起的損害和/或昆蟲侵染或侵擾環境、表面和/或植物或作物物種的能 力降低;或至少20%的昆蟲停止從其天然食物資源(如植物和植物產物)中攝食。運些祀標 序列可W在昆蟲細胞的全部或部分中表達。此外,運些祀標序列可W僅在昆蟲的生命周期 的特定階段表達,例如成蟲期或幼蟲期或卵期。
[0044] 在本發明中,術語"害蟲"優選地是引起植物侵襲/侵擾/侵染的昆蟲,且屬于半翅 目,優選為盲睹峻。術語"侵擾"、"侵染"和/或"侵襲"總體上通篇是可W互換使用的。
[0045] 本發明"RNA干擾(RNAi)"是指一些RNA可W高效、特異地阻斷體內特定基因的表 達,促使mRNA降解,誘使細胞表現出特定基因缺失的表型,其也稱為RNA干預或干設。RNA干 擾是高度特異的在mRNA水平上的基因沉默機制。
[0046] 本發明中"核酸"指從5'至3'末端閱讀的脫氧核糖核酸或核糖核酸堿基的單或雙 鏈聚合物。可選地,"核酸"還可含有非天然存在的或被改變的堿基,其允許通過聚合酶的正 確閱讀,不會降低該核酸編碼的多膚的表達。"核巧酸序列"指作為