轉基因植物中vip3A基因的LAMP檢測引物組、試劑盒及檢測方法
【技術領域】
[0001 ]本發明屬于分子生物學技術領域，涉及轉基因植物及其產品的檢測方法，具體涉及一種利用環介導等溫擴增技術(LAMP)快速檢測轉基因植物中vip3A基因的引物組、試劑盒和檢測方法。
【背景技術】
[0002]2014年全球轉基因作物種植面積高達1.815億公頃，比1996年商業化初期增長了100余倍。目前商業化種植的轉基因作物主要有大豆、玉米、棉花、油菜，主要性狀為抗蟲和抗除草劑。來源于蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis，Bt)的抗蟲基因是目前在轉基因植物中應用最廣的抗蟲基因，包括(^71厶13、(^71?、(^7116、(^71(]、(^734厶13、(^735八13、vip3A等，其中vip3A基因已廣泛應用到轉基因玉米新品種研究中，含有vip3A基因的轉基因玉米已獲準進口我國用作加工原料。針對vip3A基因開展快速精準的檢測方法研究，是轉基因生物安全管理相關法律法規順利實施的技術支撐和保障。
[0003]轉基因成分檢測技術主要分為兩大類:一類以外源DNA為檢測對象，如PCR、基因芯片等，另一類以外源基因表達的蛋白質為檢測對象，如ELISA、免疫試紙條等。在上述方法中，目前PCR技術應用最為廣泛，但基于PCR的轉基因檢測方法需要PCR儀、凝膠成像系統等專業儀器設備，且擴增和產物檢測時間較長(約3?4 h)，難以達到現場快速檢測目的，因此，在實際工作中需要一種更加便捷、準確、且適用于現場操作的轉基因檢測新技術。
[0004]LAMP技術是由日本榮研化學株式會社在2000年開發的一種新的基因擴增技術，該技術的基本特點是:①恒溫擴增:整個擴增反應在恒溫條件(60?65°C)進行，不需要特殊儀器設備;②快速尚效:整個擴增和廣物檢測可在1 h內完成;③尚特異性:針對革E1標序列的6個區域設計4條檢測引物，擴增特異性高;④高靈敏度:檢測極限可低至10個拷貝或更低;⑤鑒定簡便:可通過肉眼或濁度儀觀察反應管內的沉淀變化，或在反應管中加入染色劑后通過肉眼觀察顏色變化等方法，對擴增產物進行便捷的檢測。
[0005]LAMP方法具有快速高效、操作簡便、特異性強、靈敏度高等特點，不需要特殊儀器，適合現場快速檢測，在轉基因植物檢測領域具有廣闊的應用前景。目前尚未有利用LAMP方法檢測轉基因植物中vip3A基因的檢測方法和試劑盒。
【發明內容】
[0006]本發明的一個目的在于公開一種轉基因植物中viP3A基因的LAMP檢測引物組。
[0007]本發明的另一個目的在于公開一種轉基因植物中vip3A基因的LAMP檢測試劑盒。
[0008]本發明的另一個目的在于公開一種基于上述引物組和試劑盒檢測轉基因植物中vip3A基因的LAMP檢測方法。
[0009]本發明所采用的技術方案如下:
根據vip3A基因的核苷酸序列，設計vip3A基因的LAMP檢測引物組，其核苷酸序列如SEQID NO: 1?4;確定LAMP檢測方法的技術參數，并對檢測方法的特異性進行驗證。
[0010]轉基因植物中vip3A基因的LAMP檢測引物組，包括外引物F3、外引物B3、內引物FIP、內引物BIP，其核苷酸序列分別如下所示:
外引物F3:AGGAGGACAACCTGGAGC(SEQ ID N0:1)；
外引物B3:TCGTCCTTCAGGTGAATCGA(SEQ ID N0:2)；
內引物FIP:GCACGTACAGGGCCTTGGTGAGGCCAACAACAAGAACGC(SEQ ID N0:3)；
內引物BIP:TCAGCCAGTTCATCGGCGACCCTTCACGGTGTACTGGATC(SEQ ID N0:4)。
[0011 ]轉基因植物中vip3A基因的LAMP檢測試劑盒，包括以下組分:
(1)檢測引物溶液:由上述4條引物配制的檢測引物溶液，外引物F3、外引物B3、內引物FIP、內引物BIP的濃度依次為4?6 ymol/L、4?6 ymol/L、32?48 ymol/L、32?48 ymol/L;
(2)具有鏈置換活性的BstDNA聚合酶:濃度為7?9 U/yL；
(3)10X反應緩沖液:200 mmol/L Tris-HCKpH 8.8,100 mmol/L KC1，100 mmol/L(NH4)2S04，40?100 mmol/L MgS〇4，6?14 mol/L甜菜喊；
(4)dNTPs溶液，由濃度分別為10mmol/L的dATP、dCTP、dGTP、dTTP四種脫氧核糖核苷酸溶液等體積混合而成；
(5)顯色劑:1000XSYBRGREEN I熒光染料。
[0012]優選的，所述的檢測引物溶液中含有5ymol/L外引物F3、5 ymol/L外引物B3、40 μmol/L內引物FIP、40 ymol/L內引物BIP。
[0013]優選的，所述的Bst DNA聚合酶的濃度為8 U/yL。
[0014]優選的，所述的10X反應緩沖液中MgS04、甜菜堿的濃度分別為80 mmol/L和8mol/L。
[0015]利用以上所述的試劑盒檢測viP3A基因的方法，包括如下步驟:
(1)提取待測樣品的基因組DNA；
(2)配制待測樣品的LAMP檢測反應體系:在200yL PCR反應管內加入模板DNA 2-5 yL、檢測引物溶液1 yL、Bst DNA聚合酶1 yL、10 X反應緩沖液2.5 yL、dNTPs溶液2~5 yL，用滅菌去離子水或超純水補齊至總體積為25 yL；
(3)在反應管蓋上加1yL的顯色劑，蓋到反應管上；
(4)運行LAMP擴增反應:將反應管放置在恒溫水浴鍋中，65°C孵育60min，80°C孵育5min終止反應；
(5)LAMP擴增結果的鑒定:顛倒反應管，使管蓋上的顯色劑與反應溶液充分混合，若反應管顯現綠色則為陽性，若顯現橙色則為陰性。
[0016]通過實驗證明，本發明提供的viP3A基因的LAMP檢測引物組、試劑盒及檢測方法具有快速高效、操作簡便、特異性強等優點。
【附圖說明】
[0017]圖1是實施例2中進行特異性檢測的結果圖，卜8依次為轉crylie基因玉米IE09S034、轉(^710基因水稻11(3-19、轉(^71?基因玉米1(]1507、轉(^734六13和(^735六13基因玉米59122、轉vip3A基因MIR162、轉dmo基因大豆M0N87708、轉aadl基因玉米DAS40278-9和非轉基因玉米對照。
【具體實施方式】
[0018]下面結合實施例對本發明作進一步的說明。
[0019]實施例1試劑盒及其檢測方法。
[0020]按下列配方制備viP3A基因的LAMP檢測試劑盒，每個試劑盒的規格為100次反應:
(1)檢測引物溶液:合成外引物F3、外引物B3、內引物FIP、內引物BIP，將引物干粉用超純水分別配成濃度為100 ymol/L的母液，然后分別取5 yL外引物F3、5 yL外引物B3、40 yL內引物FIP、40 yL內引物BIP、10 yL超純水，放入一個新的1.5 mL離心管中，充分混勻，配成100 yL的vip3A基因的LAMP檢測引物溶液，其中引物序列分別為:
外引物F3:AGGAGGACAACCTGGAGC(SEQ ID N0:1)；
外引物B3:TCGTCCTTCAGGTGAATCGA(SEQ ID N0:2)；
內引物FIP:GCACGTACAGGGCCTTGGTGAGGCCAACAACAAGAACGC(SEQ ID N0:3)；
內引物BIP:TCAGCCAGTTCATCG