毛竹轉錄因子nac基因cds序列的應用
【技術領域】
[0001] 本發明涉及基因工程領域,具體地說,涉及毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列的應用。
【背景技術】
[0002] NAC(NAM/ATAF/CUC)轉錄因子家族是植物特有的一類轉錄因子,多數NAC蛋白的N 端具有高度保守的NAC結構域,而在C端則具有多元化的激活域。NAC轉錄因子廣泛參與調控 許多生物學過程,如細胞分裂、細胞次生壁合成、器官邊界、開花和衰老等植物生長發育過 程,以及參與調控植物對高鹽、干旱、低溫等非生物逆境脅迫響應過程。在擬南芥中過量表 達八財0)19、4財(:055、1?)26/^麻0)72和414?1/^麻(:002均能提高其抗旱能力 ;過量表達 ATAF2/ANAC081的植物更容易感染枯萎病菌;過量表達JUB1/ANAC042和VNI2/ANAC083能夠 延遲植物衰老,提高對非生物脅迫的耐受能力。在水稻中過量表達0sNAC5、0sNAC9和 OsNACIO能夠顯著擴大根系的分布范圍,從而提高抗旱能力實現高產;過量表達0sNAC5提高 其抗旱、耐鹽的能力;SNAC1轉入水稻和小麥,能夠提高轉基因植株抵抗多種非生物脅迫的 能力。
[0003]竹子是僅次于木材的第二大森林資源,竹產業是我國林業四大朝陽產業之一,竹 子已經被廣泛應用于建筑、家具、造紙、裝飾材料、食品保健、園林景觀、生態修復等領域,是 最具潛力的綠色資源之一。竹子以其生長速度快,繁殖能力強,一次造林,永續利用,適宜山 地造林的特點,在我國造林宜林地日趨減少的情況下,竹林優勢更為明顯。尤其是目前我國 天然林商業采伐全面禁止的情況下,竹資源的開發利用在保障我國木材安全、生態安全以 及貧困山區農民脫貧致富和新農村建設中具有不可替代的作用。毛竹(Phyllostachys edulis)是我國最為重要的筍、材兩用經濟竹種,現有面積443萬公頃,2014年年產毛竹 13.08億根,為彌補我國木材缺口做出了積極貢獻。以毛竹為材料進行NAC轉錄因子研究,對 于更好地開發利用毛竹基因資源,開展抗逆分子育種具有重要的現實意義。
【發明內容】
[0004] 本發明的目的是提供毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列的應用。
[0005]為了實現本發明目的,本發明提供毛竹轉錄因子NAC基因CDS序列在促進植物側根 生長發育中的應用。
[0006]本發明所述的毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列為:
[0007] i)SEQIDN0:1所示的核苷酸序列;或
[0008]ii)SEQIDNO: 1所示的核苷酸序列經取代、缺失和/或增加一個或多個核苷酸且 表達相同功能蛋白質的核昔酸序列;或
[0009] iii)在嚴格條件下與SEQIDNO: 1所示序列雜交且表達相同功能蛋白質的核苷酸 序列,所述嚴格條件為在含〇. 1 %SDS的0.1XSSPE或含0.1 %SDS的0.1XSSC溶液中,在65°C 下雜交,并用該溶液洗膜;或
[0010] iv)與i)、ii)或iii)的核苷酸序列具有90%以上同源性且表達相同功能蛋白質的 核苷酸序列。
[0011] 前述的應用,其是將毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列構建到植物雙元表達載體上, 轉化植物,從而促進轉基因植株側根生長發育。
[0012] 本發明述及的植物雙元表達載體包括PCAMBIA1301、改造的pCAMBIA1301等;其中, 所述改造的PCAMBIA1301是在載體pCAMBIA1301的多克隆位點引入花椰菜花葉病毒35S啟動 子和胭脂堿合酶終止子。
[0013] 攜帶有目的片段的表達載體可通過使用Ti質粒、植物病毒載體、直接DNA轉化、微 注射、電穿孔等常規生物技術方法導入植物細胞中(Weissbach,1998,MethodforPlant MolecularBiologyVIII,AcademyPress,NewYork,第411-463頁;Geiserson和Corey, 1998,PlantMolecularBiology,2ndEdition)〇
[0014] 本發明還提供毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列在提高植物對非生物逆境脅迫的耐 受能力中的應用,所述非生物逆境脅迫包括高鹽、干旱等。
[0015] 前述的應用,其是將毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列構建到植物雙元表達載體上, 轉化植物,從而提高轉基因植株對非生物逆境脅迫的耐受能力。
[0016] 本發明所述的植物包括但不限于擬南芥。將毛竹轉錄因子NAC基因CDS序列構建到 改造的載體PCAMBIA1301上,轉化野生型擬南芥,從而提高轉基因擬南芥植株的耐鹽、抗旱 能力。
[0017] 本發明優選采用農桿菌轉化法轉化植物。
[0018]本發明進一步提供毛竹轉錄因子NAC基因⑶S序列在植物抗性育種中的應用,所述 植物包括但不限于禾本科植物,例如竹子等。
[0019] 本發明首次發現毛竹NAC轉錄因子在植物對抗非生物逆境脅迫中的功能,將毛竹 轉錄因子NAC基因CDS序列導入植物(例如擬南芥)中,得到側根明顯增多的轉基因植株,且 轉基因植株的耐鹽、抗旱能力均明顯提高,為植物的抗性育種奠定了基礎。毛竹NAC轉錄因 子基因在竹子等禾本科植物抗性育種中具有廣泛的應用前景,為植物速生育種提供了新的 基因資源。
【附圖說明】
[0020] 圖1為本發明實施例1中基因PeSNAC擴增產物電泳圖;其中,M:DNA分子量標記;1: 擴增產物。
[0021] 圖2為本發明實施例1中毛竹NAC轉錄因子基因結構示意圖。
[0022] 圖3為本發明實施例1中多物種NAC氨基酸序列比較分析;其中,A、B、C、D和Ε為Ν端 NAC保守域中的5個亞結構域。
[0023]圖4為本發明實施例2中正義植物表達載體PeSNACsense的質粒載體圖和酶切檢測 電泳圖;其中,(A):載體圖;(B):酶切檢測電泳圖,M:DNA分子量標記;1:酶切產物。
[0024]圖5為本發明實施例2中反義植物表達載體PeSNACantisense的質粒載體圖;其中, (A):載體圖;(B):酶切檢測電泳圖,M:DNA分子量標記;1:酶切產物。
[0025] 圖6為本發明實施例3中PeSNACsense單克隆菌落PCR電泳結果;其中,M:DNA分子量 標記;1-6 :轉化PeSNACsense的單克隆菌落;7 :PeSNACsense重組表達載體質粒;8: PCAMBIA1301載體質粒。
[0026] 圖7為本發明實施例3中PeSNACantisense單克隆菌落PCR電泳結果;其中,M:DNA分 子量標記;1_6:轉化PeSNACantisense的單克隆菌落;7:PeSNACantisense重組表達載體質 粒;8:pCAMBIA1301載體質粒。
[0027]圖8為本發明實施例4中轉基因擬南芥植株RT-PCR檢測結果;其中,(A):正義PeSNAC基因表達檢測,3-1、3-6、3-8、3-9為不同轉基因植株,11'為野生型植株;(8):反義 PeSNAC基因表達檢測,六-1^-2^-8^-9為不同轉基因植株,11'為野生型植株。
[0028]圖9為本發明實施例5中轉基因擬南芥表型;其中,1:正義PeSNAC基因表達轉基因 植株;2:野生型植株;3:反義PeSNAC基因表達轉基因植株。
[0029] 圖10為本發明實施例6中轉基因擬南芥根系表型及側根數量統計;其中,WT:野生 型植株;S-1:正義PeSNAC基因表達轉基因植株;A-2:反義PeSNAC基因表達轉基因植株。
[0030] 圖11為本發明實施例7中NaCl脅迫條件下轉基因擬南芥表型、存活率統計、Fv/Fm的 變化趨勢;其中,WT:野生型植株;S-1:正義PeSNAC基因表達轉基因植株;A-2:反義PeSNAC基 因表達轉基因植株;(A) :NaCl處理7d后的表型;(B) :NaCl處理10d后存活率統計;(C):NaCl 處理過程中Fv/Fm的變化趨勢。
[0031] 圖12為本發明實施例8中干旱脅迫條件下轉基因擬南芥表型、存活率統計、Fv/^的 變化趨勢;其中,WT:野生型植株;s-1:正義PeSNAC基因表達轉基因植株;A-2:反義PeSNAC基 因表達轉基因植株;(A):干旱處理14d后的表型;(B):干旱處理20d后存活率統計;(C):干旱 處理過程中Fv/Fm的變化趨勢。
【具體實施方式】
[0032]以下實施例用于說明本發明,但不用來限制本發明的范圍。若未特別指明,實施例 均按照常規實驗條件,如Sambrook等分子克隆實驗手冊(SambrookJ&RussellDW, Molecularcloning:alaboratorymanual,2001),或按照制造廠商說明書建議的條件。 [0033]實施例1毛竹NAC轉錄因子基因⑶S序列的獲得
[0034] 以毛竹(Phyllostachysedulis)葉片為材料,提取葉片總RNA,并反轉錄成cDNA作 為模板,從毛竹基因組數據庫中搜索,分析找到基因組中預測為編碼轉錄因子NAC的DNA序 列,根據該序列的編碼區設計如下引物:
[0035]上游引物:5' -ATGGTGGAGGCGAGGCTGC-3'
[0036]下游引物:5' -TCAATCGAGTGAGTTCCACATCTGTGA-3'
[0037] 對PCR擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測(圖1 ),切下目的條帶純化回收,將回收 的DNA片段連接到pGEM-Teasy載體上,轉化大腸桿菌(Esherichiacoli)DH5a感受態細胞, 經藍白斑篩選,提取陽性克隆質粒并酶切圖譜分析后,再將單克隆測序,插入片段為867bp, 如SEQIDNo: 1所示。應用Blast在線軟件,將測序的片段與已報道的基因序列進行同源性 比較,發現該插入片段與預測的NAC基因編碼區完全一致,同時與基因組序列比對分析發 現,該編碼區對應的基因組序列含有2個內含子和3個外顯子(圖2)。將該基因命名為PeSNAC (即,毛竹NAC轉錄因子基因⑶S序列)。
[0038]通過Blast軟件在線比較分析,發現該基因編碼的氨基酸序列(SEQIDN〇:2)與其 它單子葉植物的NAC均具有較高的一致性,尤其與同是來自禾本科的水稻(Oryzasativa IndicaGroup)、二糖短柄草(Brachypodiumdistachyon)、谷子(Setariaitalica)、大麥 (Hordeumvulgaresubsp·vulgare)、小麥(Triticumaestium)、節節麥(Aegilops tauschii)和玉米(Zeamays)同源蛋白的一致性都在80 %以上,其中與水稻的NAC (EAZ02065)的一致性最高,達87.0%,N端NAC保守域包含A、B、C、D和E5個亞結構域(圖3)。 由此可見,克隆出的PeSNAC基因為毛竹中的一個全新的NAC轉錄因子基因。
[0039]實施例2攜帶毛竹PeSNAC基因的植物表達載體構建
[0040]以毛竹cDNA為模板,根據SEQIDNo: 1設計引物,植物表達引物兩端分別引入位點Clal和BamHI酶切位點,進行PCR擴增。引物序列如