一種生物素化atps的儲存試劑的制作方法
【技術領域】
[0001 ]本發明屬于生物技術領域,具體涉及一種生物素化ATPS的儲存試劑。
【背景技術】
[0002] ATP硫酸化酶(ATP sulfurylase,ATPS,EC 2.7.7.4)是一種可逆催化腺苷酰硫酸 (adenosine-5 ' -phospho sulfate,APS)與焦磷酸鹽(pyrophosphate,PPi)反應生成三磷酸 腺苷(ATP)與硫酸鹽的酶,在生物體硫代謝中發揮重要作用。ATPS廣泛存在于植物、動物及 微生物中,但它在各種生物體當中的生物學作用略有不同。在植物和部分微生物中,是催化 硫酸鹽同化反應第一步的關鍵酶。在ATPS的催化下,硫酸根離子與ATP反應,產生腺嘌呤-5' -磷酸硫酸APS和焦磷酸鹽PPi。而在一些化學自養菌和化能無機營養菌中,ATPS是催化硫 化氫氧化生成無機硫酸鹽最后一步的酶,其作用是催化APS和PPi反應生成ATP和硫酸根離 子,即上述反應的逆反應。ATPS已經從產黃青霉菌、鼠肝、卷心菜等生物體中提取并純化得 到,而且編碼ATPS的基因也已經從原核生物、真核生物、動物和植物中克隆出來并在適當的 宿主中得到表達。不同來源的ATPS結構不同,大腸桿菌來源的ATPS是異源二聚體且需要GTP 激活,酵母、真菌以及植物來源的ATPS是單體或是同源寡聚體。在分子生物學方面,目前已 通過氨基酸修飾等手段研究其結構和功能的關系,加深了對ATPS作用機制的了解。偶連ATP 硫酸化酶可以應用于很多方面,如:PPi定量、RNA測定、DNA測序、DNA聚合酶酶活測定等,其 中ATPS在焦磷酸測序技術發揮重要作用。
[0003] 焦磷酸測序技術(Pyrosequencing)是利用DNA聚合酶(polymerase )、ATPS、焚光素 酶(lucif erase)和三磷酸腺苷雙磷酸酶(apyrase)四種酶催化的同一反應體系中的酶級聯 化學發光反應進行DNA測序的技術,其實質是利用生物發光反應進行序列測定的技術。焦磷 酸測序技術的反應體系由反應底物、待測單鏈、測序引物和上述4種酶構成,反應底物為5'-腺苷酰硫酸(adenosine-5'-phosphosulfat,APS)和焚光素(luciferin)。在每一輪測序反 應中,只加入四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)中的一種,若該dNTP能夠與DNA模板的下一個堿 基配對,則會在DNA聚合酶的催化下,將其摻入到測序引物鏈的3'末端,同時釋放出一分子 的PPi;在ATP硫酸化酶的作用下,生成的PPi可以和APS結合形成等量的ATP;生成的ATP在熒 光素酶的催化下,可以和熒光素結合形成氧化熒光素,同時產生可見光,通過微弱光檢測裝 置及處理軟件可獲得一個特異的檢測峰,峰值的高低則和相匹配的堿基數成正比。如果加 入的dNTP不能和DNA模板的下一個堿基配對,則上述反應不會發生,也就沒有檢測峰。反應 體系中剩余的dNTP和殘留的少量ATP在Apyrase的作用下發生降解。待上一輪反應完成后, 加入另一種dNTP,使上述反應重復進行,根據獲得的峰值圖即可讀取準確的DNA序列信息。 [0004]近年來出現了一種高通量光導纖維皮升級微反應池陣列焦測序技術,該技術一次 可以測定上百萬個樣品,其出現帶來了測序技術的革命,這極大地推動了后基因組計劃的 發展。這種高通量焦磷酸測序技術需要對ATPS進行生物素化修飾,使之便于固定在微球表 面。眾所周知,酶活會直接關系到測序反應的準確度,而酶儲存試劑的優劣又直接影響到酶 活。ATPS作為一種生物活性蛋白,在儲存、運輸和銷售過程中易失活,目前常用的酶儲存試 劑并不能有效保護生物素化ATPS的酶活,也沒有一種專門針對生物素化ATPS的儲存試劑。 因此,開發一種專門針對生物素化ATPS的儲存試劑,保證其在儲存、運輸和銷售過程中的穩 定性,是該酶工業化生產的應用基礎。
【發明內容】
[0005] 本領域技術人員應該理解的是,在不偏離本發明的精神和范圍下可以對本發明技 術方案的細節和形式進行修改或替換,但這些修改和替換均落入本發明的保護范圍內。
[0006] 本發明中涉及的英文符號:
[0007] Tris-HCl指利用三羥甲基氨基甲烷(Tris)和鹽酸配制的緩沖液;EDTA指乙二胺四 乙酸;DTT指二硫蘇糖醇;Tris-Ac指利用三羥甲基氨基甲烷和醋酸配制的緩沖液;BSA指牛 血清白蛋白;PVP指聚乙烯吡咯烷酮。
[0008] 本發明要解決的一個問題是提供一種生物素化ATPS的儲存試劑,該儲存試劑包括 以下組分:Tris-HCl、氯化鈉、EDTA和DTT,溶劑為去離子水。
[0009] 上述儲存試劑中,Tris-HCl的濃度為25~50mM;優選為30~40mM;進一步優選為32 ~36mM〇
[0010] 上述儲存試劑中,Tris-HCl的pH值為7.0~8.0;優選為7.2~7.8;進一步優選為 7.4~7.6〇
[0011] 上述儲存試劑中,氯化鈉的濃度為10~35mM;優選為10~30mM;進一步優選為15~ 25mM〇
[0012] 上述儲存試劑中,EDTA的濃度為0.02~0.08mM;優選為0.03~0.07mM;進一步優選 為0.04~0.07mM。
[0013] 上述儲存試劑中,DTT的濃度為0.02~0.08mM;優選為0.04~0.07mM;進一步優選 為0·04~0·06mM。
[0014] 在某些優選的實施方案中,所述的生物素化ATPS的儲存試劑中還包括:蔗糖、山梨 醇和硫代硫酸鈉中的一種或多種。
[0015] 所述的蔗糖的濃度為30~lOOrnM;優選為40~90mM;進一步優選為50~80mM;再一 步優選為60~70mM。
[0016] 所述的山梨醇的濃度為10~20mM;優選為12~18mM;進一步優選為14~16mM。
[0017] 所述的硫代硫酸鈉的濃度為〇 · 4~0 · 8mM;優選為0 · 4~0 · 7mM;進一步優選為0 · 5~ 0.6mM〇
[0018] 本發明要解決的另一個問題是提供上述生物素化ATPS的儲存試劑的使用方法:使 用時,先將生物素化ATPS與甘油按照1: 2的體積比混勻,得到生物素化ATPS的甘油溶液;再 將該生物素化ATPS的甘油溶液與本發明所述的ATPS儲存試劑按照3:1的體積比混合均勻。
[0019] 本發明的有益效果:
[0020] 本發明提供的生物素化ATPS儲存試劑,對生物素化ATPS的活性有保護作用,是的 生物素化ATPS在-80°C、_20°C和4°C下放置1個月,活性幾乎不變;在_80°C、_20°C和4°C下放 置3個月,分別能夠維持>99%、>97%以及>92%的殘余活力;在-80°(3、-20°(3和4°(3下放置6 個月,分別能夠維持>97%、>93%以及>90%的殘余活力;在25°(3、30°(3和35°(3下放置1211,能 夠維持>97 %的殘余活力;在25°C、30°C和35°C下放置24h,能夠維持>95 %的殘余活力;在25 °C、30°C和35°C下放置48h,能夠維持>93 %的殘余活力。本發明提供的生物素化ATPS儲存試 劑在以上各個儲存條件下對ATPS的活性保護均優于常規50%甘油的儲存條件。
[0021] 加入本發明提供的儲存試劑后,生物素化ATPS在凍融1次和3次后,均能夠維持〉 93 %的殘余活力;在凍融5次后,均能夠維持>97 %的殘余活力;在凍融10次后,均能夠維持〉 94 %的殘余活力。而在50 %甘油中,生物素化ATPS在反復凍融10次后,僅剩13.1 %的殘余活 力;不加任何試劑的生物素化ATPS在反復凍融10次后,僅剩5.8 %的殘余活力。
[0022] 綜上所述,本發明提供的儲存試劑能夠延長生物素化ATPS的儲存時間,減少反復 凍融對其活性的影響;并且使得生物素化ATPS可以長期存放于-80°C、_20°C和4°C下,增加 了其儲存溫度的選擇性;還能夠有效降低ATPS上生物素標簽的脫落率。
【具體實施方式】
[0023] 如無特殊說明,本發明涉及的化學或生物試劑均購自Sigma-Aldrich公司;生物發 光檢測儀購自Promega公司,型號為GloMax20/20。
[0024] 實施例1 一種生物素化ATPS的儲存試劑
[0025] 包括以下組分:Tris-HCl 25mM ρΗ7·0、氯化鈉 10mM、EDTA0.02mM和DTT0.02mM,溶 劑為去離子水。
[0026] 實施例2-種生物素化ATPS的儲存試劑
[0027] 包括以下組分:Tris-HCl 30mM ρΗ7·2、氯化鈉 15mM、EDTA0.03mM和DTT0.03mM,溶 劑為去離子水。
[0028]實施例3-種生物素化ATPS的儲存試劑
[0029] 包括以下組分:Tris-HCl 35mM ρΗ7·4、氯化鈉20mM、EDTA0.04mM和DTT0.04mM,溶 劑為去離子水。
[0030] 實施例4 一種生物素化ATPS的儲存試劑
[0031 ]包括以下組分:Tris-HCl 40mM ρΗ7·6、氯化鈉25mM、EDTA0.05mM和DTT0.06mM,溶 劑為去離子水。
[0032]實施例5-種生物素化ATPS的儲存試劑
[0033]包括以下組分:Tris-HC145mM ρΗ7·8、氯化鈉30mM、EDTA0.06mM和DTT0.06mM,溶劑 為去離子水。
[0034]實施例6-種生物素化ATPS的儲存試劑
[0035] 包括以下組分:Tris-HC150mM pH7.8、氯化鈉35mM、EDTA0.07mM和DTT0.07mM,溶劑 為去離子水。
[0036] 實施例7-種生物素化ATPS的儲存試劑
[0037] 包括以下組分:Tris-HC150mM pH8·0、氯化鈉35mM、EDTA0·08mM和DTTO.08mM,溶劑 為去離子水。
[0038] 實施例8-種生物素化ATPS的儲存試劑