Scml4基因序列及表達改變檢測及其在冠心病預測中的應用
【技術領域】
[0001] 本發明涉及生物技術領域，特別涉及與冠心病易感性相關的SCML4基因上的單核 苷酸多態性（singlenucleotidepolymorphism,SNP)位點，以及用于檢測所述SNP位點的 相應的組合物及試劑盒，尤其涉及所述SNP位點的核酸親和配體在制備用于檢測、篩查或 預測漢族人群冠心病易感性的組合物中的應用。
【背景技術】
[0002] 冠心病，又稱冠狀動脈性心臟病，是由冠狀動脈血管壁粥樣硬化引起的以冠狀動 脈狹窄甚至閉塞為形態學改變的缺血性心臟病。冠心病危害極大，根據世界衛生組織的數 據，在世界范圍內，以冠心病為主的缺血性心臟病是威脅人類健康的頭號殺手。數據顯示： 在2008年，全球大約有多于730萬人死于冠心病（WH0, 2011)。雖然從死亡率上看中國目前 并不是冠心病的重災區，但是，由于人口基礎大，我國的冠心病受累人數是十分驚人的。估 計中國每年超過100萬人死于冠心病。另外，隨著我國經濟水平的發展和人民生活水平的 提高，發明人國家的冠心病發病率還在逐年升高。
[0003] 臨床和流行病學研究證明，冠心病是常見的復雜多基因疾病，引起疾病的原因包 括遺傳因素、環境因素以及兩者的交互作用。冠心病有家族聚集性，研究表明，冠心病的遺 傳度約為40%到60%。因此，冠心病易感基因和易感位點的鑒定將為發現新的冠心病分子 機制、發展新的藥物靶點以及冠心病的早期基因診斷和個性化治療提供新線索。遺傳學上， 尋找多基因疾病的易感基因多利用關聯分析。遺傳關聯分析分為兩個策略：候選基因關聯 分析和全基因組關聯分析（genomewideassociationstudy,GWAS)。得益于人類基因組 計劃和HapMap計劃對人類遺傳圖譜的揭示，從全基因組水平尋找與疾病相關的變異成為 可能。在過去的六年里，全基因組關聯分析發展成為研究復雜多基因疾病遺傳基礎的重要 方法之一，已有超過50個冠心病相關位點通過該方法被發現，其中絕大部分位點是在白種 人的研究中發現。然而，由于遺傳的異質性，這些結果并不能為黃種人，尤其是發明人中國 漢族人群所用。另一方面，已發現的位點中僅有6個是基于中國漢族人群的研究所發現，這 遠不足以解釋中國漢族人群的冠心病遺傳基礎。此外，已有的研究多僅關注了相關位點，而 對于鑒定相關位點所指代的易感基因缺乏有效的方法。
[0004] 鑒于已知用來解釋中國漢族人群的冠心病遺傳基礎的基因及位點的數量較少，為 了提高漢族人群冠心病易感性檢測、篩查或預測的準確度，從而更容易、更直接、更靈敏且 更特異性地檢測、篩查或預測漢族人群冠心病易感性，有必要尋找新的與冠心病易感性相 關的易感基因和SNP位點。
【發明內容】
[0005] 本發明發現了一種新的能夠解釋中國漢族人群的冠心病遺傳基礎的與冠心病易 感性相關的SCML4基因，同時確證了SCML4基因上與冠心病易感性密切相關的SNP位點 rs9486729以及與rs9486729連鎖的SNP位點。本發明具體技術方案如下：
[0006] 第一方面，本發明提供了分離的核酸分子，其代表SCML4基因上的單核苷酸多態 性（SNP)位點rs9486729,DNA序列如SEQIDNO: 1所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因A。
[0007] 第二方面，本發明提供了分離的核酸分子，其代表SCML4基因上與SNP位點 rs9486729連鎖的SNP位點，所述連鎖的SNP位點選自以下任一項：
[0008] (l)rs4945789,其DNA序列如SEQID勵:2所示，其中單核苷酸11為(：的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因G;
[0009] (2)rs872548,其DNA序列如SEQIDN0:3所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因G;
[0010] (3)rs9320237,其DNA序列如SEQID勵:4所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因A;
[0011] (4)rs7773622,其DNA序列如SEQID勵:5所示，其中單核苷酸11為1'的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因C;
[0012] (5)rs6568503,其DNA序列如SEQIDNO:6所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因G;
[0013] (6)rsl878780,其DNA序列如SEQID勵:7所示，其中單核苷酸11為六的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因G;
[0014] (7)rsl2194084,其DNA序列如SEQIDN0:8所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因C;
[0015] (8)rs6568505,其DNA序列如SEQIDN0:9所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者患 誕心病的風險商于等位基因G;
[0016] (9)rsl2214724,其DNA序列如SEQIDN0:10所示，其中單核苷酸n為C的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因G;
[0017] (10)rsl2214852,其DNA序列如SEQIDN0:11所示，其中單核苷酸n為A的攜帶 者患誕心病的風險商于等位基因C;
[0018] (ll)rsl0457173,其DNA序列如SEQIDN0:12所示，其中單核苷酸n為T的攜帶 者患誕心病的風險商于等位基因A;
[0019] (12)^6568508，其0嫩序列如5￡〇10勵：13所示，其中單核苷酸11為(：的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因T;
[0020] (13)rs7771956,其DNA序列如SEQID勵:14所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因C;
[0021] (14)rs9400150,其DNA序列如SEQIDN0:15所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因T;
[0022] (15)rs4946871，其DNA序列如SEQIDN0:16所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因A;
[0023] (16)rs4946872,其DNA序列如SEQIDNO: 17所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因G;
[0024] (17)rsl2211874,其DNA序列如SEQIDN0:18所示，其中單核苷酸n為G的攜帶 者患誕心病的風險商于等位基因A;
[0025] (18)rs9400152,其DNA序列如SEQID勵：19所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因A;
[0026] (19)rs9480807,其DNA序列如SEQIDN0:20所示，其中單核苷酸n為T的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因G;
[0027] (20)rs6915611，其DNA序列如SEQIDN0:21所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因C;
[0028] (21)rs7767848,其DNA序列如SEQID勵:22所示，其中單核苷酸11為六的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因G;
[0029] (22)rsl0782157,其DNA序列如SEQIDN0:23所示，其中單核苷酸n為G的攜帶 者患誕心病的風險商于等位基因A;
[0030] (23)rs9384663,其DNA序列如SEQID勵:24所示，其中單核苷酸11為1'的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因G;
[0031] (24)rsl7530298,其DNA序列如SEQIDN0:25所示，其中單核苷酸n為C的攜帶 者患誕心病的風險商于等位基因T;
[0032] (25)rs9386677,其DNA序列如SEQID勵:26所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因A;
[0033] (26)rs9398150,其DNA序列如SEQID勵:27所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因A;
[0034] (27)rsl7596103,其DNA序列如SEQIDN0:28所示，其中單核苷酸n為G的攜帶 者患誕心病的風險商于等位基因A;
[0035] (28)rs6931026,其DNA序列如SEQID勵:29所示，其中單核苷酸11為1'的攜帶者 患誕心病的風險商于等位基因C。
[0036] 序列SEQIDNO: 1-29構成新的與冠心病易感性相關的單核苷酸多態性（SNP)。它 們允許靈敏、特異性、有效和簡單的對冠心病易感性的檢測、篩查或預測方法，例如通過采 用廣為流傳且易于使用的技術如PCR或核酸雜交，其具有高適用性和利用率，特別是在世 界的欠發達地區。由于上述SNP是在中國漢族人群中鑒定的，因此認為新的SNP可特別適 用于中國漢族人群冠心病易感性檢測、篩查或預測。<