本發明涉及用于核酸染色的新穎的辣椒堿類化合物、其提取方法及其應用。
背景技術:
目前在分子生物學核酸電泳中主要是使用溴化乙啶(ethidiumbromide,eb)作為染色液進行染色。溴化乙啶來自化學合成,是最常用的嵌入性熒光染料。活細胞或固定細胞均能從極稀溶液中攝取eb染料,dna螺旋暫時彎曲允許eb熒光染料嵌入大分子疏水中心的堿基對之間。
已有國內外的生物公司生產大分子量核酸染料用于替代溴化乙錠(eb),但是其市場價格極其昂貴,且采用化學合成,工藝復雜,成本高。
目前市場還沒有植物提取物當作分子生物學核酸染料。
目前市場上已知的各種食用色素都具有較強的染色力,如辣椒紅色素、番茄紅色素、胡蘿卜色素、姜黃素等等,但作為核酸染色劑的用途未見報道。
辣椒(又名:番椒、海椒、辣子、辣角、秦椒等,拉丁文名:capsicumannuuml.),是一種茄科辣椒屬植物,為一年或有限多年生草本植物。果實通常成圓錐形或長圓形,未成熟時呈綠色,成熟后變成鮮紅色、黃色或紫色,以紅色最為常見。辣椒的果實因果皮含有辣椒素而有辣味。辣椒的成分相當復雜,但主要成分是辣椒堿和辣椒色素,以及具有特有香味的揮發物。通過將辣椒素與蛋白質、碳水化合物、脂肪、無機鹽分離開來,獲得一種濃縮物,其中辣椒堿可溶于乙醇、乙醚、苯及堿性水溶液中。辣椒中揮發物用水蒸餾與溶劑萃取收集后,在色質聯用儀中進行分析,證明有醇、羥基化合物,吡嗪環狀碳水化合物、樹脂類等各種成分。
由于辣椒中辣椒堿和辣椒色素混合物中單成分極性非常接近,對分離技術提出很高的要求,因而迄今為止未見報道用于核酸染色的辣椒的單成分化合物。
技術實現要素:
本發明提供一種從辣椒提取的天然產物,其是一種優質天然色素,用于核酸dna的染色。
因此,本發明的一個目的在于提供式i的化合物:
本發明還提供一種制備所述的式i化合物的方法。
本發明所述的制備所述的式i化合物的方法包括以下步驟:
(1)提取:以干燥辣椒粉為原料,以乙醇作為浸取劑,室溫靜止浸取,得到浸取液;
(2)濃縮:在低于80℃的溫度(或優選35-78℃)減壓蒸發除去乙醇,得到濃縮物;
(3)萃取提純:濃縮物溶于水中,過濾,除去濃縮物中的膠狀的樹脂類雜質,棄掉濾餅,用氯仿萃取濾液,然后蒸發除去萃取溶劑,得到較純的提取物辣椒堿混合物;
(4)柱層析分離:采用柱層析法對步驟(3)所得的辣椒堿混合物進行分離,采用的洗脫劑為石油醚和乙酸乙酯的混合溶劑,收集含所述的式i化合物的洗脫液,濃縮后分離得到所述的式i化合物。
在一實施方式中,所述步驟(1)具體為:采用95%乙醇室溫靜止浸取干燥辣椒粉24-48小時,優選24小時,較優選36小時,更優選48小時。在一實施方式中,所述步驟(1)具體為:采用95%乙醇室溫靜止浸取干燥辣椒粉24-48小時。
在一實施方式中,所述步驟(2)中,在35-78℃減壓蒸發乙醇。在一實施方式中,可以先在較低溫度,例如在35℃-45℃,優選35℃(或36℃,37℃,38℃,39℃,40℃,41℃,42℃,43℃,44℃或45℃)減壓蒸發一部分乙醇,然后升溫至60℃-78℃(60℃,61℃,62℃,63℃,64℃,65℃,66℃,67℃,68℃,69℃,70℃,71℃,72℃,73℃,74℃,75℃,76℃,77℃,78℃,或79℃)減壓蒸發殘余乙醇。
在一實施方式中,所述步驟(3)中采用氯仿萃取濾液1-4次,或1-3次。
在一實施方式中,所述步驟(3)中濃縮物與水的重量比例為1:40-100,優選1:50-90,較優選1:50-80,最優選1:50。
在一實施方式中,所述步驟(4)中,以體積比為10:1的石油醚和乙酸乙酯洗脫劑混合物進行洗脫。
在一實施方式中,本發明所述的制備所述的式i化合物的方法包括以下工藝流程:
辣椒→干燥→粉碎→乙醇→浸取→濃縮→氯仿→提純→辣椒堿類化合物。
在一實施方式中,本發明所述的制備所述的式i化合物的方法可以具體如下:
1、原料的準備:選用色紅、味辣、水分低、無霉變的干辣椒加工成辣椒粉。或者選用市售的無霉變的干燥辣椒粉作為原料。
2、提取(或浸取):采用常溫靜止浸取的方法進行提取。選用95%無毒、價廉、易得的食用酒精作為浸取劑,常溫靜止浸取24-48小時。
3、濃縮:將浸取液在35-78℃減壓蒸發除去乙醇,得到濃縮物。具體為:將浸取液送入旋蒸裝置內,減壓蒸發除去乙醇,接收乙醇可循環利用。隨著乙醇的蒸發,浸取液的濃度不斷升高,顏色變深。蒸餾后期,要控制加熱溫度,溫度不能超過80℃,防止焦化。所得濃縮物冷卻至室溫后,是一種濃稠的暗紅色液體。
4、萃取提純:濃縮物溶于水中,為了除去濃縮液中的雜質,過濾,去掉膠狀的樹脂類物質,還需要進一步用氯仿萃取1-3次,合并萃取液,硫酸鎂干燥24小時,再將提純溶液減壓濃縮,得到較純的提取物辣椒堿類混合物。
5、柱層析分離:采用柱層析法分離,使用石油醚:乙酸乙酯體積比為10:1的混合物洗脫,收集各成分溶液,減壓旋蒸得到純的單體化合物,進行結構鑒定,得到本發明所述的式i化合物。
產品性質:用本發明所述方法制得的式i的辣椒堿類化合物在常溫下是一種暗紅色的固體,熔點為215-220℃,易溶于各種有機溶劑和水。
本發明還涉及所述的式i化合物用于核酸染色的用途。
在一實施方式中,所述核酸為脫氧核糖核酸。
本發明還涉及一種核酸染料,其是本發明所述的式i化合物。
本發明還涉及一種試劑盒,其包含作為核酸染料的式i化合物。
本發明所述的式i化合物具有以下有益效果:1、染色力強,染色效果好;2、相比于溴化乙啶,環境友好;3、用量非常非常少,即可獲得良好的染色效果;4、原材料易于獲得,成本更低;5、容易保存,無需避光。
本發明所述的方法原料易得,工藝簡單,成本低。
本發明所述的提取步驟采用的常溫靜止浸取的方法具有設備簡單、操作方便、節省能源等優點,有利于廣泛應用。
附圖說明
圖1為使用本發明實施例1的式i化合物染色的dna電泳圖。
具體實施方式
下面將結合實施例進一步說明本發明的實質內容和有益效果,該實施例僅用于說明本發明,而非對本發明進行限制。
實施例1式i化合物的提取分離與表征
1.儀器與材料
在以下實施例中使用的試劑均為市售常規試劑,除非另有明確指明。柱層析法采用的試劑為化學純。
儀器:旋轉蒸發儀(鞏義市予華儀器有限公司);柱層析用硅膠柱子(北京欣維爾玻璃儀器有限公司);柱層析硅膠(乳山市太陽干燥劑有限公司;硅膠目數為200-300目;核磁共振儀(美國anasazi公司);質譜儀(waters公司);紅外光譜儀(德國布魯克公司);熔點儀(梅特勒-托利多公司)。
2.式i化合物的提取分離
取5公斤干辣椒(市售),粉碎成粉末。投入于10升的玻璃容器中,并加入5升95%乙醇,室溫靜浸24-48小時。過濾,收集乙醇溶液,用旋轉蒸發儀在低于80℃減壓旋蒸,得到45.12克混合物。混合物溶于2256克水中,過濾去掉雜質。用氯仿萃取濾液3次,合并有機相,干燥,濃縮除去溶劑。得到31.3克樣品。
使用200毫升的硅膠柱子,填充100克柱層析硅膠。濃縮得到的樣品31.3克用100ml乙醇溶解后,與50克硅膠混合并旋干,使用石油醚濕法上樣。洗脫劑為石油醚:乙酸乙酯=10:1,使用該洗脫劑洗脫,收集含式i化合物的洗脫液并濃縮。分離得到的式i化合物性狀為暗紅色固體,化合物重量為5.65克。
3.式i化合物結構表征
式i化合物辣椒堿:暗紅色固體,[α]20d+22.5(c0.2,chcl3);由電噴霧離子質譜信號m/z:639.2059[m+h]+,推算其分子式為c29h26n3o6i;紫外光譜在245nm和302nm有強吸收,說明該化合物具有二氫啡啶環結構特征;紅外光譜在2978cm-1、1376cm-1、1282cm-1、1296cm-1處有吸收峰,提示該化合物含有苯酚羥基、羰基和苯胺基。1h核磁共振譜顯示啡啶環上的六個芳香氫質子信號[δ7.67(1h,d,j=7.54hz),7.13(1h,m),7.11(1h,m),7.12(1h,d,j=7.6hz),6.55(1h,s),6.12(1h,s)]和兩個二氫啡啶環上的特征氫質子信號[δ4.63(1h,dd,j=9.6hz)和4.42(1h,d,j=9.6hz)],以上核磁數據提示該化合物為式i的辣椒堿。從hmbc譜中可以看到h-3′a(δ3.36)/h-5′b(δ2.41)/h-14′(δ1.49)和c-18(δ173.0)具有相關,說明c-16和c-17以亞甲基方式連接,1h和13c核磁共振數據見表1。從上述表征可以確定化合物辣椒堿的化學結構式。
表1式i的辣椒堿的核磁共振數據
實施例2
dna染色實驗
1.試劑及儀器:
tbe緩沖液(tris-硼酸;中科瑞泰(北京)生物技術有限公司);瓊脂糖(北京沃比森科技有限公司);微量移液槍(美國賽默飛公司);凝膠成像儀(美國biorad公司)
2.溶液配制:
2.1取20ml5×tbe緩沖液,加水至200ml,配制成0.5×tbe稀釋緩沖液,待用。
2.2取2毫克實施例1得到的式i辣椒堿,用1毫升水溶解,制成濃度為2mg/ml的水溶液。
3.實驗方法
制備膠液:稱取0.4g瓊脂糖,置于200ml錐形瓶中,加入50ml0.5×tbe稀釋緩沖液,放入微波爐里加熱至瓊脂糖全部熔化,取出搖勻,得到0.8%瓊脂糖凝膠液。加熱過程中要不時搖動,使附于瓶壁上的瓊脂糖顆粒進入溶液。
灌膠:將有機托盤放入制膠模具上,插上1*3mm九齒梳子,注意觀察梳子齒下緣應與膠槽底面保持1mm左右的間隙。向冷卻至50-60℃的瓊脂糖膠液中加入如上配制的本發明辣椒提取物的水溶液5μl,搖勻。將瓊脂糖小心地倒入膠槽內,使膠液形成均勻的膠層。倒膠時的溫度不可太低,為50℃,否則凝固不均勻,速度也不可太快,否則容易出現氣泡。待膠完全凝固后撥出梳子,注意不要損傷梳底部的凝膠。然后向槽內加入0.5×tbe稀釋緩沖液至液面恰好沒過膠板上表面。
加樣:取d2000dnaladder(北京天根生化科技有限公司)和100bpdnaladder(北京天根生化科技有限公司),用微量移液槍在第二、四泳道里分別加入2.5ul和5ul的d2000dnaladder,在第六、八泳道里分別加入2.5ul和5ul的100bpdnaladder。
電泳:加完樣后,合上電泳槽蓋,立即接通電源。控制電壓保持在80v,電流在40ma以上。當溴酚藍條帶移動到距凝膠前沿約2cm時,停止電泳。
染色:膠板在電泳前已經在灌膠步驟用本發明實施例1的式i化合物預染。
觀察和拍照:在波長為254nm的紫外分析儀下觀察染色后的電泳膠板。凝膠顯示出清晰可辨的桔紅色熒光條帶。染色圖片如圖1所示,圖1中從左邊起分別為第二、第四、第六和第八泳道。
圖1表明,本發明實施例1的式i化合物染色用量非常非常少,即可獲得良好的染色效果。
本發明不受上面所顯示和描述的實施例的限制,而是在權利要求的范圍內可以改變。