本發明屬于植物分子育種學領域,具體涉及一種野生亞麻種子總dna提取方法。
背景技術:
目前植物總dna提取方法有ctab法,sds法,高鹽低ph值法等。亞麻總dna提取常用方法為高鹽低ph法,該方法常以莖葉為提取原材料。由于野生亞麻種子發芽率低,人工條件育苗獲得幼莖需要5個月時間,如果提取原料為多年生野生種,那么獲得所需的提取材料會更加困難,提取工作也受時間的限制。因此利用種子提取dna的方法便可以打破這種限制。由于野生亞麻種皮上的果膠質遠大于莖葉,故而提取難度較莖葉大。故本專利在前人研究基礎之上,著重解決利用野生亞麻種子提取總dna,既達到高濃度、高純度、大量提取的目的,又能克服提取時間的限制,滿足分子生物學實驗的需要。
技術實現要素:
本發明目的是提供了一種野生亞麻種子總dna提取方法。
本發明通過以下技術方案實現:
一種野生亞麻種子總dna提取方法,包括如下步驟:
步驟1、用液氮將研缽和杵預冷,取0.25g野生亞麻種子置于研缽中,迅速研磨至粉末狀,之后向研缽中加入65℃的提取緩沖液10ml,在水浴鍋中繼續研磨至充分混勻,得到野生亞麻種子勻漿;
步驟2、將步驟1制得的野生亞麻種子勻漿用尼龍網兜過濾;
步驟3、將步驟2過濾后的濾液用1.5ml離心管分裝,每個離心管內濾液容積為0.6ml,65℃水浴10min,水浴的同時輕輕搖動離心管,水浴后將離心管冷卻至室溫后,以轉速10000r/min,離心10分鐘,離心后取上清液待用;
步驟4、將步驟3得到的上清液加入0.33體積的5mol/l的醋酸鉀溶液,混勻后置于0℃冰浴保持30min,以轉速10000r/min,離心10分鐘,離心后取上清液待用;
步驟5、將步驟4得到的上清液加入0.6倍體積的預冷異丙醇,混勻后的溶液在-20℃條件下靜置2h得到的混合物,利用微提取器吸取懸浮物,使之與管底部果膠質分離,留懸浮物待用;
步驟6、將步驟5得到的沉淀物用無水乙醇洗滌2次后,自然晾干后,加50μl超純水混勻后在-20℃條件下靜置8~10h,得到的溶液中加人300μl超純水稀釋,稀釋后加5μlrna酶,混勻后置于水浴鍋中37℃水浴1h,得到溶液待用;
步驟7、將步驟6得到的溶液加入0.6倍體積的預冷異丙醇,混勻后在-20℃條件下靜置2h,得到的混合物,利用微提取器吸取懸浮物,使之與管底部果膠質分離,留懸浮物待用;
步驟8、將步驟7得到的沉淀物用無水乙醇洗滌2次后,自然晾干后,加25~50μl超純水混勻后,得到野生亞麻種子總dna,置于-80℃保存;
步驟9、將步驟8得到的野生亞麻種子總dna利用瓊脂糖檢測條帶完整性及純度,分光光度計檢測濃度。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟1中所述的提取緩沖液的配方為每1000ml緩沖液中含有100mmol醋酸鈉、50mmol乙二胺四乙酸二鈉、500mmol氯化鈉、2%聚乙烯吡咯烷酮、1.4%十二烷基磺酸鈉。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟2中的尼龍網兜過濾用紗布過濾代替。尼龍網兜過濾可用紗布代替,但會影響產量,如果不要求大量提取,可以用紗布替代。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟3中的水浴鍋中放置浮漂。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟4中醋酸鉀溶液的ph值為4.8。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟5中混勻后的溶液在室溫下靜置8~10h后得到混合物。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟5中的混合物在室溫下以轉速10000r/min,離心10分鐘,得到沉淀物待用。步驟5中的混合物中沒有沉淀出現,則采用離心分離的方法得到沉淀物,用來代替微提取器吸取沉淀。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟7中的混合物在室溫下以轉速10000r/min,離心10分鐘,得到沉淀物待用。步驟7中的混合物中沒有沉淀出現,則采用離心分離的方法得到沉淀物,用來代替微提取器吸取沉淀。
本發明所述的野生亞麻種子總dna提取方法,經液氮研磨之后,再用緩沖液研磨,使dna充分溶于緩沖液中而不被破壞,有益效果是加大了dna的產率。而經過過濾的dna提取緩沖液在提取初期就先去掉一部分果膠質,直接降低了dna的粘稠度。本發明步驟簡單,實驗試劑無毒,提取量大,解決了無法獲得或者獲取莖葉材料困難的難題,打破dna提取在時間上限制,只要有種子且需要dna時,隨時可以提取。
附圖說明
附圖1為具體實施方式一野生亞麻種子總dna提取的電泳檢測對比圖。
具體實施方式
具體實施方式一:
一種野生亞麻種子總dna提取方法,包括如下步驟:
步驟1、用液氮將研缽和杵預冷,取0.25g野生亞麻種子置于研缽中,迅速研磨至粉末狀,之后向研缽中加入65℃的提取緩沖液10ml,在水浴鍋中繼續研磨至充分混勻,得到野生亞麻種子勻漿;
步驟2、將步驟1制得的野生亞麻種子勻漿用尼龍網兜過濾;
步驟3、將步驟2過濾后的濾液用1.5ml離心管分裝,每個離心管內濾液容積為0.6ml,65℃水浴10min,水浴的同時輕輕搖動離心管,水浴后將離心管冷卻至室溫后,以轉速10000r/min,離心10分鐘,離心后取上清液待用;
步驟4、將步驟3得到的上清液加入0.33體積的5mol/l的醋酸鉀溶液,混勻后置于0℃冰浴保持30min,以轉速10000r/min,離心10分鐘,離心后取上清液待用;
步驟5、將步驟4得到的上清液加入0.6倍體積的預冷異丙醇,混勻后的溶液在-20℃條件下靜置2h得到的混合物,利用微提取器吸取懸浮物,使之與管底部果膠質分離,留懸浮物待用;
步驟6、將步驟5得到的沉淀物用無水乙醇洗滌2次后,自然晾干后,加50μl超純水混勻后在-20℃條件下靜置8h,得到的溶液中加人300μl超純水稀釋,稀釋后加5μlrna酶,混勻后置于水浴鍋中37℃水浴1h,得到溶液待用;
步驟7、將步驟6得到的溶液加入0.6倍體積的預冷異丙醇,混勻后在-20℃條件下靜置2h,得到的混合物,利用微提取器吸取懸浮物,使之與管底部果膠質分離,留懸浮物待用;
步驟8、將步驟7得到的沉淀物用無水乙醇洗滌2次后,自然晾干后,加25μl超純水混勻后,得到野生亞麻種子總dna,置于-80℃保存;
步驟9、將步驟8得到的野生亞麻種子總dna利用瓊脂糖檢測條帶完整性及純度,分光光度計檢測濃度。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟1中所述的提取緩沖液的配方為每1000ml緩沖液中含有100mmol醋酸鈉、50mmol乙二胺四乙酸二鈉、500mmol氯化鈉、2%聚乙烯吡咯烷酮、1.4%十二烷基磺酸鈉。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟3中的水浴鍋中放置浮漂。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟4中醋酸鉀溶液的ph值為4.8。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,附圖1為本實施方式野生亞麻種子總dna提取的電泳檢測對比圖,其中第1泳道為15000bp的dnamarker,第2、3、4泳道為本方法莖葉提取,第5、6、7、8為本方法種子提取,第9、10、11、泳道為3%ctab法。圖1電泳圖是dna提取液經過稀釋5倍之后上樣獲得的。從電泳圖上可以看出種子總dna的提取量最大,條帶清晰無雜質,提取dna長度位于maker之上,提取的dna較完整,rna添加量適合,無污染,達到分子生物學要求,莖葉的提取量較低,條帶比較模糊,未達到分子生物學要求。3%ctab法沒有檢測出條帶。
具體實施方式二:
一種野生亞麻種子總dna提取方法,包括如下步驟:
步驟1、用液氮將研缽和杵預冷,取0.25g野生亞麻種子置于研缽中,迅速研磨至粉末狀,之后向研缽中加入65℃的提取緩沖液10ml,在水浴鍋中繼續研磨至充分混勻,得到野生亞麻種子勻漿;
步驟2、將步驟1制得的野生亞麻種子勻漿用紗布過濾;
步驟3、將步驟2過濾后的濾液用1.5ml離心管分裝,每個離心管內濾液容積為0.6ml,65℃水浴10min,水浴的同時輕輕搖動離心管,水浴后將離心管冷卻至室溫后,以轉速10000r/min,離心10分鐘,離心后取上清液待用;
步驟4、將步驟3得到的上清液加入0.33體積的5mol/l的醋酸鉀溶液,混勻后置于0℃冰浴保持30min,以轉速10000r/min,離心10分鐘,離心后取上清液待用;
步驟5、將步驟4得到的上清液加入0.6倍體積的預冷異丙醇,混勻后的溶液在室溫下靜置2h后得到的混合物,在室溫下以轉速10000r/min,離心10分鐘,得到的沉淀物待用;
步驟6、將步驟5得到的沉淀物用無水乙醇洗滌2次后,自然晾干后,加50μl超純水混勻后在-20℃條件下靜置8h,得到的溶液中加人300μl超純水稀釋,稀釋后加5μlrna酶,混勻后置于水浴鍋中37℃水浴1h,得到溶液待用;
步驟7、將步驟6得到的溶液加入0.6倍體積的預冷異丙醇,混勻后在-20℃條件下靜置2h,得到的混合物,在室溫下以轉速10000r/min,離心10分鐘,得到的沉淀物待用;
步驟8、將步驟7得到的沉淀物用無水乙醇洗滌2次后,自然晾干后,加50μl超純水混勻后,得到野生亞麻種子總dna,置于-80℃保存;
步驟9、將步驟8得到的野生亞麻種子總dna利用瓊脂糖檢測條帶完整性及純度,分光光度計檢測濃度。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟1中所述的提取緩沖液的配方為每1000ml緩沖液中含有100mmol醋酸鈉、50mmol乙二胺四乙酸二鈉、500mmol氯化鈉、2%聚乙烯吡咯烷酮、1.4%十二烷基磺酸鈉。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟3中的水浴鍋中放置浮漂。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,步驟4中醋酸鉀溶液的ph值為4.8。
本實施方式所述的野生亞麻種子總dna提取方法,表1列舉了不同方法提取dna的分光光度計檢測結果。
表1不同方式提取dna分光光度計檢測結果對比表
從表1中明確看出,利用種子提取的dna濃度達到217ng/ul,濃度遠遠大于其他方法,該方法od260/od280為1.808,接近理論值1.80,表明提取的dna沒有蛋白質污染,滿足分子生物學的實驗需要。