抗人PDL1抗體及其用途的制作方法

            文檔序號:12453234閱讀:1542來源:國知局
            本申請大體涉及抗體藥物領域,具體而言,本申請提供了抗人PDL1抗體及其醫學和生物學用途。發明背景程序性死亡受體-1(programmeddeath-1,PD-1)是T細胞上的一種跨膜受體,PD-1能夠與配體PDL1(程序性死亡受體配體1)、PDL2相互作用,抑制T細胞增殖。在正常機體中,PD-1作為一種T細胞增殖的負調節分子,對維持機體的免疫耐受有重要作用。在腫瘤和病毒感染時,細胞中PDL1和PDL2的表達上調,與T細胞表面的PD-1受體相互作用,能夠抑制T細胞的活化、增殖及對腫瘤的殺傷,使其功能發生紊亂和枯竭。針對PD-1的單克隆抗體能夠阻斷PD-1與配體的結合,而抗PDL1的單克隆抗體可阻斷PDL1與PD-1、CD80的相互作用,從而恢復T細胞功能,起到殺傷腫瘤細胞的作用。目前美國FDA已經批準使用的抗PD1的單抗藥物包括百時美施貴寶公司(Bristol-MyersSquibb)的Opdivo(納武單抗)和默克公司(Merck)的Keytruda(派姆單抗)。這些抗PD1的單抗在臨床上用于治療黑色素瘤和化療后依然進展的轉移性鱗狀非小細胞肺癌等多種腫瘤。另外還有多個抗PD-1和抗PDL1的抗體進入臨床試驗用于多種腫瘤的治療。但是本領域仍然需要更多適于治療患者的改善的能阻斷PD-1與PDL1結合的抗體。發明概述第一方面,本申請提供了特異性結合人PDL1的抗體,其包含含HCDR1、HCDR2和HCDR3序列的重鏈可變區,其特征在于:所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為RGLGLDV(SEQIDNO:28);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSA(SEQIDNO:29);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSS(SEQIDNO:30);其中HCDR序列根據Chothia定義。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列如SEQIDNO:22、23或24的氨基酸序列所示。第二方面,本申請提供了特異性結合人PDL1的抗體,其包含含LCDR1、LCDR2和LCDR3序列的輕鏈可變區,其特征在于:所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33),其中LCDR序列根據Chothia定義。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的輕鏈可變區序列如SEQIDNO:25的氨基酸序列所示。第三方面,本申請提供了特異性結合人PDL1的抗體,其包含含HCDR1、HCDR2和HCDR3序列的重鏈可變區以及含LCDR1、LCDR2和LCDR3序列的輕鏈可變區,其特征在于:所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSA(SEQIDNO:29),所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSS(SEQIDNO:30),所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為RGLGLDV(SEQIDNO:28),所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33);其中HCDR和LCDR序列根據Chothia定義。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列為SEQIDNO:22,輕鏈可變區序列為SEQIDNO:25。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列為SEQIDNO:23,輕鏈可變區序列為SEQIDNO:25。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列為SEQIDNO:24,輕鏈可變區序列為SEQIDNO:25。在上述三方面的一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體為全抗體、Fab片段、F(ab’)2片段或ScFv片段。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體為全人源抗體。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體還包含選自IgG1(SEQIDNO:12)、IgG2(SEQIDNO:13)或IgG4(SEQIDNO:14)亞型的重鏈恒定區和/或包含選自κ亞型(SEQIDNO:15)或λ亞型(SEQIDNO:16)的輕鏈恒定區。第四方面,本申請提供了包含前述特異性結合人PDL1的抗體的藥物組合物。第五方面,本申請提供了前述特異性結合人PDL1的抗體在制備用于由PDL1介導的疾病的預防和/或治療的藥物中的用途。在一些實施方案中,由PDL1介導的疾病為癌癥。在一些實施方案中,癌癥包括但不限于:黑色素瘤、非小細胞肺癌、腎癌、乳腺癌、白血病、晚期實體瘤以及其它癌癥。附圖簡要說明圖1為噬菌體展示載體pADSCFV-S的質粒圖譜。圖2為顯示對照抗體(MI4736和MPDL3280A)抑制噬菌體展示的ScFv(S4B11)結合人PDL1-His的圖。圖3為顯示不同的抗PDL1單克隆抗體與重組PDL1-His的結合能力的圖,其中三種抗體分別為IgG4-MI4736、IgG4-MPDL3280A和IgG1-H1B12+L5A10。圖4為顯示不同的抗PDL1單克隆抗體抑制PD1與PDL1的結合的圖,其中三種抗體分別為IgG4-MI4736、IgG4-MPDL3280A和IgG1-H1B12+L5A10。發明詳述本申請的發明人通過構建大容量天然人源噬菌體抗體庫,篩選并優化得到了具有希望性質的抗PDL1單克隆抗體。在本申請的多個方面,提供了新型抗人PDL1的抗體或其抗原結合片段,編碼該抗體或其抗原結合片段的多核苷酸,包含所述多核苷酸的載體,包含所述多核苷酸或載體的宿主細胞,制備和純化該抗體的方法及所述抗體或其抗原結合片段的醫學應用。根據本申請提供的抗體基因序列,可構建全長的抗體分子作為藥物用于臨床上由人PDL1介導的疾病。除非另外指明,本發明的實施將采用本領域常規的分子生物學、微生物學、細胞生物學、生物化學以及免疫學技術。除非另外指明,本申請中所用的術語具有本領域技術人員通常所理解的含義。定義本文使用的術語“抗體”指能夠經由至少一個位于免疫球蛋白分子的可變區中的抗原識別位點特異性結合靶標的免疫球蛋白分子。靶標包括但不限于碳水化合物、多聚核苷酸、脂質、多肽等。本文使用的“抗體”不僅包括完整的(即全長)抗體,而且還包括其抗原結合片段(例如Fab、Fab'、F(ab')2、Fv)、其變異體、包含抗體部分的融合蛋白、人源化抗體、嵌合抗體、雙抗體、線性抗體、單鏈抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)及任何其他包含所需特異性的抗原識別位點的免疫球蛋白分子的修改配置,包括抗體的糖基化變體、抗體的氨基酸序列變體及共價修飾的抗體。通常,完整或全長的抗體包含兩個重鏈和兩個輕鏈。每個重鏈含有重鏈變異區(VH)和第一、第二及第三恒定區(CH1、CH2及CH3)。每個輕鏈含有輕鏈變異區(VL)和恒定區(CL)。全長的抗體可以是任何種類的抗體,例如IgD、IgE、IgG、IgA或IgM(或上述的子類),但抗體不需要屬于任何特定的類別。根據重鏈恒定區的抗體氨基酸序列,可以將免疫球蛋白指定為不同的類別。通常,免疫球蛋白有五種主要的類別:IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,而且這些類別中有幾種可被進一步區分成子類(同型),例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。對應于不同免疫球蛋白類別的重鏈恒定區分別稱為α、δ、ε、γ以及μ。不同類別的免疫球蛋白的子單元結構和三維結構是公知的。本文使用的術語“抗原結合片段”或“抗原結合域”指負責結合抗原的完整抗體分子的一部分或區域。抗原結合域可以包含重鏈變異區(VH)、輕鏈變異區(VL)或上述兩者。VH和VL中的每一個通常含有三個互補決定區CDR1、CDR2及CDR3。抗原結合片段的實例包括但不限于:(1)Fab片段,其可以是具有VL-CL鏈和VH-CH1鏈的單價片段;(2)F(ab’)2片段,其可以是具有兩個Fab片段的二價片段,該兩個Fab片段由鉸鏈區的二硫橋(即Fab的二聚物)連接;(3)具有抗體的單臂的VL和VH域的Fv片段;(4)單鏈Fv(scFv),其可以是由VH域和VL域經短肽連接而組成的單一多肽鏈;以及(5)(scFv)2,其可以包含兩個由肽連接的VH域和兩個VL域,該兩個VL域經由二硫橋與該兩個VH域組合。“特異性結合”指兩個分子之間的非隨機結合反應,例如抗體至抗原表位的結合。詳細描述第一方面,本申請提供了特異性結合人PDL1的抗體,其包含含HCDR1、HCDR2和HCDR3序列的重鏈可變區,其特征在于:所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為RGLGLDV(SEQIDNO:28);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSA(SEQIDNO:29);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSS(SEQIDNO:30);其中HCDR序列根據Chothia定義。Chothia定義是基于結構環區的位置鑒定CDR區邊界的經典規則。參閱例如Kabat,“SequencesofProteinsofImmunologicalInterest”,NationalInstitutesofHealth,Bethesda,Md.(1991);A1-Lazikanietal.,J.Mol.Biol.273:927-948(1997);以及Martinetal.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:9268-9272(1989)。本領域技術人員公知,對于給定抗體的可變區序列,可以通過多種方式分析可變區序列中CDR區序列,例如可以利用在線軟件Abysis確定(http://www.abysis.org/)。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列如SEQIDNO:22、23或24的氨基酸序列所示。第二方面,本申請提供了特異性結合人PDL1的抗體,其包含含LCDR1、LCDR2和LCDR3序列的輕鏈可變區,其特征在于:所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33),其中LCDR定義根據Chothia定義。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的輕鏈可變區序列如SEQIDNO:25的氨基酸序列所示。第三方面,本申請提供了特異性結合人PDL1的抗體,其包含含HCDR1、HCDR2和HCDR3序列的重鏈可變區以及含LCDR1、LCDR2和LCDR3序列的輕鏈可變區,其特征在于:所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSA(SEQIDNO:29),所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為QTFGLSS(SEQIDNO:30),所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33);或者,所述HCDR1序列為GGTFSRH(SEQIDNO:26),所述HCDR2序列為IPILGI(SEQIDNO:27),所述HCDR3序列為RGLGLDV(SEQIDNO:28),所述LCDR1序列為GGDNIGSHSAH(SEQIDNO:31),所述LCDR2序列為DDTNRPS(SEQIDNO:32),所述LCDR3序列為QAWDTAGDHPV(SEQIDNO:33);其中HCDR和LCDR序列根據Chothia定義。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列為SEQIDNO:22,輕鏈可變區序列為SEQIDNO:25。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列為SEQIDNO:23,輕鏈可變區序列為SEQIDNO:25。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體的重鏈可變區序列為SEQIDNO:24,輕鏈可變區序列為SEQIDNO:25。在上述三方面的一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體為全抗體、Fab片段、F(ab’)2片段或ScFv片段。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體為全人源抗體。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體還包含選自IgG1(SEQIDNO:12)、IgG2(SEQIDNO:13)或IgG4(SEQIDNO:14)亞型的重鏈恒定區和/或包含選自κ亞型(SEQIDNO:15)或λ亞型(SEQIDNO:16)的輕鏈恒定區。在一些實施方案中,特異性結合人PDL1的抗體拮抗至少一種與PDL1或其部分相關的體外或體內生物活性。在一些實施方案中,特異性結合PDL1的抗體能夠特異性結合重組人PDL1胞外區。在一些實施方案中,特異性結合PDL1的抗體能夠特異性抑制PD-1結合重組人PDL1胞外區。本申請還提供了編碼前述抗體或其抗原結合片段的多核苷酸、包含所述多核苷酸的載體以及用所述載體轉染的宿主細胞。第四方面,本申請提供了包含前述特異性結合人PDL1的抗體的藥物組合物。在一些實施方案中,藥物組合物還包含藥學可接受的載體、賦形劑、稀釋劑等。在一些實施方案中,藥物組合物還可包含潤滑劑,如滑石粉、硬脂酸鎂和礦物油;潤濕劑;乳化劑;懸浮劑;防腐劑,如苯甲酸、山梨酸和丙酸鈣;增甜劑和/或調味劑等。在一些實施方案中,可將本申請中的藥物組合物配制為片劑、丸劑、粉劑、錠劑、酏劑、懸液、乳劑、溶液、糖漿、栓劑或膠囊等形式。在一些實施方案中,可以利用任何生理上可接受的給藥方式遞送本申請的藥物組合物,這些給藥方式包括但不限于:口服給藥、腸胃外給藥、經鼻給藥、直腸給藥、腹膜內給藥、血管內注射、皮下給藥、經皮給藥、吸入給藥等。在一些實施方案中,可以通過混合具有所需純度的試劑與視情況的藥學上可接受的載體、賦形劑等,以凍干制劑或水溶液的形式配制用于治療用途的藥物組合物用于存儲。第五方面,本申請提供了前述特異性結合人PDL1的抗體在制備用于由PDL1介導的疾病的預防和/或治療的藥物中的用途。在一些實施方案中,由PDL1介導的疾病為癌癥。在一些實施方案中,癌癥包括但不限于:黑色素瘤、非小細胞肺癌、腎癌、乳腺癌、白血病、晚期實體瘤以及其它癌癥。在一些實施方案中,本申請的抗體的藥理學活性、其在血清中的穩定性及其在小鼠體內的代謝均可在標準測試方法中進行證明。第六方面,本申請還提供編碼本發明抗體或其輕鏈或重鏈的分離的核酸分子以及包含所述核酸分子的載體、包含所述載體的宿主細胞以及產生所述抗體的方法。在一些實施方案中,所述核酸分子可操作地連接到調控序列,調控序列可以被用所述載體轉化過的宿主細胞識別。在一些實施方案中,產生抗體的方法包括培養宿主細胞以便于表達核酸。在一些實施方案中,產生抗體的方法還包括從宿主細胞培養基中回收抗體。此外,本文所述的特異性結合人PDL1的抗體也可用于檢測生物樣品中PDL1的存在。基于抗體的檢測方法在本領域是眾所周知的,并且包括例如ELISA、免疫印跡、放射免疫試驗、免疫熒光、免疫沉淀以及其它相關技術。應當理解,以上詳細描述僅為了使本領域技術人員更清楚地了解本申請的內容,而并非意圖在任何方面加以限制。本領域技術人員能夠對所述實施方案進行各種改動和變化。實施例提供以下實施例僅僅是對本申請的一些實施方案進行舉例說明,沒有任何限制性目的或性質。實施例1:高質量噬菌體展示抗體庫的構建抗體庫技術是制備和篩選人單克隆抗體的一個重要方法,而基于噬菌體展示的抗體庫技術則是目前成熟的抗體庫技術,已經成功地應用于人單抗藥物的制備。本實施例描述利用當今多種基因工程技術構建噬菌體展示抗體庫的策略和方法。1.1制備抗體重鏈和輕鏈可變區基因(VH和VL)。為構建人抗體庫,首先需要獲得人抗體的重鏈可變區(VH)和輕鏈可變區(VL)基因。抗體可變區基因來自正常人外周血淋巴細胞以及全合成。1.1.1天然人抗體可變區基因的制備。采集19個正常志愿者的血液(各50mL),其中所采集的血液由發明人及其同事作為志愿者提供,所有志愿者均已簽署知情同意書。志愿者的納入標準為:1.年齡大于18周歲;2.無HIV、HBV感染;3.血常規檢測正常;4.非孕婦或哺乳期婦女。然后用淋巴細胞分離液(MPBiomedicals公司,Cat#:0850494)分離淋巴細胞,利用Omega公司的總RNA提取試劑盒(Cat#:R6834-01)制備RNA,然后用TransGenBiotech公司的反轉錄試劑盒(Cat#:AT301-03)制備cDNA。最后用下表1所列的引物組進行PCR,分別擴增抗體的重鏈可變區基因(VH)和輕鏈可變區基因(VL,包括Vk和Vl)。利用常規的瓊脂糖凝膠電泳方法純化并回收擴增的PCR產物(VH、VK或Vl),置于-20℃保存備用。表1:擴增天然人抗體重鏈和輕鏈基因所用引物1.1.2全合成人抗體可變區基因的制備。全合成抗體基因制備的基本策略是利用簡并引物在選定的模板抗體基因的CDR中引入設計的突變。為構建全合成人抗體庫,本實施例中選擇了3種人抗體重鏈可變區模板(VH1、VH3和VH5)和兩種人抗體輕鏈可變區模板(VK1和Vl3)構建人全合成抗體庫。設計并委托明琛志遠生物技術公司合成5種抗體可變區基因VH1(SEQIDNO:1),VH3(SEQIDNO:2),VH5(SEQIDNO:3),VK1(SEQIDNO:4)以及Vl3(SEQIDNO:5)。設計并合成表2所列的引物,分別用于在5種可變區基因的CDR1、CDR2和CDR3中引入設計的各種突變。利用常規PCR技術及各組含有設計突變的兼并引物,分別在對應的CDR中引入設計的突變,然后再利用2-3輪重疊延伸PCR構建得到完整的重鏈可變區(VH1、VH3、VH5)和輕鏈可變區(VK1、VL3)基因。瓊脂糖凝膠電泳回收擴增的最終的可變區基因PCR產物,置于-20℃保存備用。表2.擴增全合成人抗體可變區基因所用引物1.2構建單鏈抗體(ScFv)基因為構建單鏈抗體基因(ScFv),在重鏈可變區(VH)和輕鏈可變區(VL)之間添加常用的由15個氨基酸組成的柔性連接肽,該連接肽的序列為GGGGSGGGGSGGGGS,編碼序列為ggtggaggcggttctggcggaggtgggagcggaggcggaggttca。設計的單鏈抗體的結構為VH-連接肽-VL。基于此實施例第一部分的方法,共獲得如下表3所示的多種重鏈和輕鏈可變區基因,即四種不同的重鏈可變區基因和3種輕鏈可變區基因。表3:各種不同重鏈和輕鏈可變區基因。重鏈可變區輕鏈可變區天然抗體基因VHVL(VK+Vl混合)合成抗體基因VH1VK1VH3VL3VH5基于上述單鏈抗體的設計以及目前已經成熟重疊延伸PCR技術,可以很方便的將此表所示的不同重鏈和輕鏈進行組合,共構建獲得12種不同的單鏈抗體基因。利用瓊脂糖凝膠電泳方法純化并回收PCR擴增獲得的12種單鏈抗體基因,置于-20℃保存備用。1.3構建基于阿拉伯糖啟動子的噬菌體展示載體。常用的噬菌體展示載體基于乳糖啟動子(Plac),而乳糖啟動子由于其滲漏表達等特性,影響抗體庫的容量和多樣性。以常用的噬菌體展示載體pCANTAB5E(AmershamBiosciences/GE公司)為基礎,對pCANTAB5E進行了如下改造。利用AflIII和NotI雙酶切,將pCANTAB5E載體上的Plac啟動子及g3蛋白信號肽部分更換為包含AraC基因,阿拉伯糖啟動子(Para)及PelB信號肽(PelBleader)的片段。其中AraC基因和ParaC來自invitrogen公司的pBADhis載體,而PelB前導序列(SEQIDNO:6)為人工合成序列。然后再利用NcoI和NotI雙酶切,將一段約750bp的無關序列(stuffsequence,SEQIDNO:7)克隆在NcoI和NotI位點之間,構建得到最終的新型噬菌體展示載體pADSCFV-S(圖1)。該載體中的NcoI位點和NotI位點,可以方便的用于克隆單鏈抗體(ScFv)基因。1.4人單鏈抗體庫及噬菌體展示抗體庫的制備。利用NcoI和NotI雙酶切的策略,將1.2中制備的12種ScFv分別克隆至載體pADSCFV-S,將連接產物分別電轉TG1電轉感受態,每個子庫約20個電轉,總共約240次電轉。利用稀釋法對每個子庫的庫容量進行推算,隨機從每個子庫中取30-40個克隆進行序列分析,以推算每個子庫的正確率,匯總12個子庫的庫容量及正確率見表4。此12個子庫的總庫容量達到1.0*10E9,平均正確率超過75%。表4:12個子庫的庫容量及正確率。將構建的12個子庫分別接種于2YTAG液體培養基(A:氨芐青霉素,100μg/mL;G:葡萄糖,2%),37℃,220rpm震蕩培養至對數生長期(OD600=0.8),感染M13輔助噬菌體(M13KO7,NEB公司),感染結束后置換2YTAKA液體培養基(A:氨芐青霉素,100μg/mL;K:卡那霉素,70μg/mL;A:阿拉伯糖,0.001%),28℃,220rpm震蕩培養過夜進行噬菌體擴增,然后利用PEG/Nacl沉淀方法制備純化噬菌體(噬菌體-ScFv),并進行滴度測定。然后參照庫容量的比例將制備的12個子庫的噬菌體-ScFv進行混合,制備噬菌體展示人抗體庫,噬菌體的最終滴度為6*10E12cfu/mL,凍存于-70℃。此噬菌體展示抗體庫可以用于篩選針對各種目的抗原的特異性人抗體。實施例2:重組蛋白的制備為了制備抗PDL1單抗,合成了多種重組蛋白基因,包括人PDL1胞外區(hPDL1,SEQIDNO:8)、人PD1胞外區(hPD1,SEQIDNO:9)以及對照重組抗體。重組抗人PDL1對照抗體MI4736(參見美國專利申請US20130034559A1)的重鏈和輕鏈可變區序列分別為SEQIDNO:17和SEQIDNO:18,重組對照抗體MPDL3280A(參見美國專利US8217149B2)的重鏈和輕鏈可變區序列分別為SEQIDNO:19和SEQIDNO:20。為了方便純化,非抗體類的重組蛋白在C端添加了His標簽(SEQIDNO:10)或者鼠抗體的Fc段(mFc1,SEQIDNO:11)。在重組抗體制備過程中,使用的抗體重鏈恒定區可以是IgG1亞型(SEQIDNO:12)、IgG2亞型(SEQIDNO:13)或IgG4亞型(SEQIDNO:14),輕鏈恒定區可以是κ亞型(SEQIDNO:15)或λ亞型(SEQIDNO:16)。根據Uniprot數據庫的各種目的重組蛋白的氨基酸序列,設計并合成上述重組蛋白的基因(包含His標簽或者mFc編碼基因)。將合成的重組蛋白基因克隆至真核表達載體pcDNA3.1(購自Invitrogen公司),然后利用脂質體(Invitrogen公司的293fectin)將制備的重組蛋白表達質粒轉染Invitrogen公司的HEK293F細胞,在無血清懸浮培養條件下培養3-4天。然后通過離心方式收獲培養上清。His標簽融合表達的重組蛋白利用金屬螯合親和層析柱(GE公司的HisTrapFF)對培養上清中的重組蛋白進行進一步純化。而mFc1融合表達的重組蛋白和重組抗體用ProteinA/G親和層析柱(GE公司的MabselectSURE)進行進一步純化。然后利用脫鹽柱(GE公司的Hitrap脫鹽柱)將重組蛋白保存緩沖液置換為PBS(pH7.2),然后分裝保存于-20℃。實施例3:利用噬菌體展示抗體庫技術篩選和優化抗人PDL1單克隆抗體以制備的重組hPDL1-his(以下簡寫為PDL1-His)為抗原,利用固相篩選策略(參考技術為:噬菌體展示:通用實驗指南/(美)克拉克森(Clackson,T.),(美)洛曼(Lowman,H.B.)編;馬嵐等譯。化學工業出版社,2008.5)篩選展示人單鏈抗體庫的噬菌體,獲得多株序列不同但特異性結合人PDL1的人單鏈抗體(ScFv)。然后利用制備的重組抗人PDL1對照抗體MI4736(重鏈和輕鏈可變區序列分別為SEQIDNO:17和SEQIDNO:18,重鏈恒定區為IgG4亞型,輕鏈恒定區為κ亞型)和MPDL3280A(重鏈和輕鏈可變區序列分別為SEQIDNO:19和SEQIDNO:20,,重鏈恒定區為IgG4亞型,輕鏈恒定區為κ亞型)對篩選得到的陽性克隆進行噬菌體-ELISA抑制實驗。結果顯示,單抗S4B11(氨基酸序列SEQIDNO:21,核酸序列SEQIDNO:34)與PDL1的結合能夠完全或者部分被MI4736或者MPDL3280A所抑制(圖2),表明此株單抗與MI4736或者MPDL3280A的抗原結合表位部分或者完全重疊,因而推測S4B11可能與對照抗體(MI4736和MPDL3280A)的功能類似,即能夠阻斷PDL1與PD1之間的結合。然后,基于公司建立的雙載體噬菌體呈現系統,以單抗S4B11的重鏈(S4B11VH)為基礎,利用輕鏈置換(具體操作可參照本申請人之前提交的中國專利第201510097117.0號中的實施例4.3)對抗體S4B11進行親和力體外成熟研究,并最終篩選到能夠提高單抗S4B11親和力的新輕鏈L5A10(SEQIDNO:25)。然后再利用重鏈CDR(HCDR)突變策略對S4B11單抗的HCDR3進行突變并構建了庫容量超過1.0*10E7的突變庫,其中HCDR3突變引入所需的引物名稱和序列見表5。以篩選到的新輕鏈L5A10為基礎,基于公司的雙載體噬菌體展示系統,對HCDR3突變庫進行篩選和單克隆鑒定(具體操作可參照本申請人之前提交的中國專利第201510097117.0號中的實施例5),鑒定出兩個親和力提高的重鏈突變體H1B12(SEQIDNO.22)和H1D12(SEQIDNO.23)。將鑒定的新輕鏈L5A10和S4B11的重鏈或重鏈突變體進行組合,最終獲得三株親和力較親本抗體S4B11提高的抗體突變體(具體信息參見表6)。表5:構建S4B11重鏈HCDR3突變庫所需引物表6:親和力成熟的抗人PDL1的單克隆抗體實施例3:BIacore3000測定抗PDL1單克隆抗體全抗體的親和力氨基偶聯試劑盒和人抗體捕獲試劑盒以及CM5芯片和pH7.4的10×HBS-EP均購自GEhealthcare。根據試劑盒中的說明書,將抗人Fc段的抗體偶聯至芯片CM5的表面上,稀釋抗體蛋白至合適的濃度,保證100-200RU左右的抗體被抗人Fc的抗體捕獲。將PDL1-His設置一系列的濃度梯度(100nM、50nM、25nM、12.5nM、6.25nM、3.125nM、1.5625nM、0nm)流經固定相表面,分別測定單克隆抗體S4B11VH+L5A10、H1B12+L5A10和H1D12+L5A10的親和力,其中各單克隆抗體的重鏈恒定區均為IgG1亞型,輕鏈恒定區均為κ亞型。結果如表7所示。數據顯示:抗體H1B12+L5A10的親和力最高。表7:抗PDL1單克隆抗體親和力常數的測定數值抗體Kon(1/MS)Koff(1/S)KD(mol/L)S4B11VH+L5A103.80E+061.60E-024.21E-09H1B12+L5A104.20E+066.50E-031.55E-09H1D12+L5A104.40E+069.90E-032.25E-09實施例4:不同抗PDL1單克隆抗體結合PDL1的能力分析選取單克隆抗體H1B12+L5A10進行后續測試。利用ELISA方法對抗PDL1單克隆抗體H1B12+L5A10和對照抗體MI4736、MPDL3280A結合PDL1-His的能力進行了分析。包被PDL1-his(1.5μg/mL,100μL/孔,4℃包被過夜),各單克隆抗體的起始濃度為300nM,并分別進行3倍梯度稀釋,每個單抗樣品設置11個稀釋度。利用HRP山羊抗人IgG檢測各個稀釋度的單克隆抗體結合PDL1的能力(圖3)。然后利用GraphpadPrism對數據進行分析并作圖(圖3和表8)。數據顯示,單克隆抗體H1B12+L5A10具有與對照抗體類似的結合PDL1的能力。表8:不同抗PDL1單克隆抗體的EC50IgG4-MI4736IgG4-MPDL3280AIgG1-H1B12+L5A10EC50(nM)0.11440.17390.2457實施例5:抗人PDL1單克隆抗體競爭PDL1結合PD1功能性的抗PDL1單抗應該能在蛋白水平上阻斷PDL1和PD1之間的結合,本實施例分析了3種不同的抗PDL1單抗(H1B12+L5A10和兩種對照抗體MI4736、MPDL3280A)抑制PDL1與PD1的結合的能力。利用重組PD1-Fc包被ELISA板(5μg/mL),然后用含有2.5μg/mL(50nM)PDL1-mFc1的PBST-2%牛奶分別對各種單抗進行系列稀釋。單抗的起始濃度為70nM,前6個點3:4稀釋,后4個點1:1稀釋。利用HRP山羊抗鼠IgG檢測PD1-PDL1的結合信號,然后利用GraphPadPrism6進行數據分析和作圖(圖4和表9)。數據顯示,所有的單抗都能夠有效抑制PD1-PDL1間的結合。表9:不同抗PDL1單克隆抗體抑制PD1-PDL1結合的IC50IgG4-MI4736IgG4-MPDL3280AIgG1-H1B12+L5A10IC50(nM)9.93916.87.285在不偏離本申請公開的實質和范圍的情況下,可對本申請公開的各實施方案進行多種改變和用等同替換。除非上下文中另有說明,否則本公開的實施方案的任何特征、步驟或實施方案都可以與任何其他特征、步驟或實施方案組合使用。當前第1頁1 2 3 
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