用于處理用于組織病理學的組織樣本的系統和方法

專利名稱：用于處理用于組織病理學的組織樣本的系統和方法
用于處理用于組織病理學的組織樣本的系統和方法本申請要求享有2008年12月30日(未決)提交的未決臨時申請序列號 No. 61/141324的優先權，所述文獻的公開內容在此全文引入作為參考。
背景技術：
當前的患者記錄包含主要涉及患者和醫生身份以及保險和/或保險支付范圍的信息。例如，當患者在掛號處掛號時，初始化醫療提供者的就診記錄。通常，這些記錄存儲在醫院記錄中的健康護理信息系統(HIS)中。該記錄可以示出賬單編碼、保險數據、在患者治療期間使用的服務和材料。當患者需要外科活檢的情況下，必須維持記錄以追蹤活檢組織樣本，外科活檢有時簡單地稱為活檢。當前，患者記錄是紙質圖、粘膠標簽、條形碼和計算機賬單記錄等的匯總，但是該信息將不包含特定的操作指令或者組織樣本自身的特定歷史。逐個樣本地選擇計量和處理參數，或者通過樣本的基礎分類而手動計量，該分類例如，類似組織類型和/或類似組織樣本尺寸。當從患者獲得組織活檢時，獲得追蹤(一個或多個)樣本所需的信息。包括許多不同的步驟，并且這些步驟受錯誤或在組織病理學處理期間的下游過程中有用的信息的損耗影響。當今，將單一追蹤號分配給從患者獲得的活檢組織樣本。該追蹤號可以被手動地記錄，或者可以采取應用于活檢容器和組織制備盒上的標貼或粘膠標貼上的條形碼的形式。 使用活檢容器以將組織轉送至組織病理學分析的實驗室，同時可以使用盒處理組織用于將組織樣本包埋在石蠟中、薄片切片和顯微鏡載片制備。通常隨后用于處理診斷組織樣本的各個步驟或過程的查看，示出了在不同處理步驟期間在保管中發生了多少改變。保管中這些改變中的每個帶來了潛在錯誤的情況。然而， 這些不同處理步驟中的每個還提供了定制下游步驟或過程中的組織特異處理參數的機會。 此外，當前未由用于組織病理學處理中的步驟或過程的機器自動使用特異于組織樣本的信肩、ο通常，通過各種方法在外科手術室中從患者獲取或獲得組織樣本。將樣本放置在活檢容器中，活檢容器中包含緩沖和固定液，以在組織到達組織病理學實驗室之前保持組織健康。更特別地，下列步驟示出了典型的處理1、在外科手術室中，可以將日期、患者ID、主治醫師、樣本類型信息手寫在每個獨立的樣本容器上和手術記錄中。2、將樣本轉送至組織病理學實驗室可以簡單至使用在醫院里建立的遞送路線。在農村地區，樣本可能經過數英里，而從外科手術室傳輸至獨立的病理學實驗室或者甚至可以由商業運輸工具發送樣本。3、樣本容器必須在其上具有足夠的信息，以能夠確定地將該容器與在步驟1中創建的患者手術記錄相鏈接。4、一旦將樣本遞送至病理學實驗室，實驗室人員將患者請求匹配至樣本容器，并且在具有相同信息的記錄本上進行標記和注明日期。
5、在登錄之后，將組織學樣品或樣本信息輸入實驗室記錄計算機數據庫中。數據庫軟件檢查生日和姓名，以核實正確的患者身份。所有情況都具有分配給該病例的唯一入藏登記號。隨著將這些樣本錄入組織病理學系統而按序產生這些號。6、隨后組織學專家將入藏登記號寫在請求書和樣本容器上。相應地標注組織處理
品.ο7、病理學家或他/她的助手，在收取病例時，核實請求書、樣本容器和盒上的入藏登記號的匹配。8、其中具有組織樣本的組織處理盒置于組織處理器中。在處理以從樣本中移除液體之后，將組織樣本包埋在石蠟塊中，將其準備用于在薄片切片機中切割。9、在薄片切片期間，組織樣本和盒錄入置于載玻片上的薄切片中，其中，薄片切片是將包埋在石蠟中的組織切成薄片的步驟。在此時，病例入藏登記號需要被傳遞至由石蠟塊形成的每個獨立載片上。10、每個載片均染色并且蓋片。將完成的載片遞送至病理學家，用于在顯微鏡下進行診斷檢查。11、病理學家接收帶有手術報告、收取(gross in)信息和處理信息的每個病例或 (一個或多個)載片。病理學家形成他/她的診斷，并且完成手術病理學報告。12、存儲載片和石蠟塊，以備需要第二意見或第二次查看。在工業中使用RFID標簽或芯片以追蹤貨物是已知的。當今，一些商業貨運使用 RFID標簽以在貨運期間在各個時間點追蹤包裹，以監視和記錄貨運朝向其終點的位置。已經提出了通過將RFID標簽附著至顯微鏡載片的合適區域，在組織病理學處理的末期使用 RFID標簽。期望提供用于使用機器可讀指示器以更全面地控制組織病理學處理及其各個過程的設備、方法和系統。

發明內容
在第一示意性實施例中，本發明包括一種系統，用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本，其大體上包括組織載體、數據庫、與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器以及電子控制。該組織載體構建成在組織病理學處理的步驟期間承載組織活檢樣本。數據庫存儲與組織活檢樣本相關聯以及與在組織病理學處理期間使用的組織處理過程相關聯的信息。機器可讀指示器包括標識組織活檢樣本的機器可讀參考標記。電子控制操作用于讀取與組織載體物理相關聯的參考標記、使用參考標記訪問數據庫中的信息、并且根據所訪問的信息實施組織處理過程的至少一部分。組織處理設備可以直接包括電子控制，以實施組織處理過程的至少一部分，例如， 使用該組織處理設備執行。備選地，電子控制可以與組織處理設備分離，甚至與其遠離。例如，組織處理設備可以是組織收取設備、組織處理器、組織包埋設備、組織切片設備、組織載片制備設備或者診斷載片讀取設備。可以使用其他類型的組織處理以實施本發明及其備選方案。電子控制可以具有各種功能，諸如更新數據庫中的信息和更新存儲在機器可讀指示器中的信息，此外，通過使用包含在機器可讀指示器上和/或獨立數據庫中的信息的至少一部分而實施或控制組織處理過程的至少一部分。機器可讀指示器可以包括各種形式。例如，指示器可以是RFID標簽或另一電子存儲器設備。備選地，機器可讀指示器可以包括更簡單的形式，諸如機器可讀數字參考碼(DRC)。在該形式中，例如，數字參考碼或DRC可以是簡單的只讀指示器。更具體地，這種只讀指示器可以包括條形碼、蝕刻碼或者機器可讀且與組織載體物理相關聯的其他標記。在另一實施例中，提供了一種系統，用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本，并且大體包括組織載體、與組織載體物理相關聯的機器可讀可寫指示器以及電子控制。 在該實施例中，再次構建組織載體，以在組織病理學處理的至少一個步驟期間承載組織活檢樣本。機器可讀可寫指示器與組織載體物理相關聯，并且存儲標識到活檢組織樣本的參考標記，并且還存儲與組織活檢樣本的至少一個物理屬性相關聯的信息。該物理屬性可以例如是下列之一或多個組織尺寸或體積、組織類型、可疑疾病外形或組織的病理學、或者任何其他物理屬性。電子控制操作用于讀取存儲在機器可讀可寫指示器上的參考標記和信息，并且根據所訪問的信息執行組織處理過程的至少一部分。電子控制還可以操作用于將新信息寫入機器可讀可寫指示器。新信息可以包括更新已經存儲在機器可讀可寫指示器上的信息。存儲在機器可讀可寫指示器上的信息可以與存儲在獨立數據庫中的信息的至少一部分相同。當使用獨立數據庫作為系統除了機器可讀可寫指示器之外的一部分時，可以由電子控制通過電子控制與機器可讀可寫指示器以及數據庫的相互作用而實施組織處理過程。該數據庫可以是遠程計算機系統的一部分，或者可以是電子控制的一部分。在各種其他實施例中，數據庫可以包括在機器可讀指示器的電子器件中。機器可讀可寫指示器上的信息可以備選地至少部分不同于存儲在獨立數據庫中的信息。系統還可以包括組織處理設備，其包括電子控制，并且操作用于執行組織處理過程的至少一部分。可以并入如本文所大體討論的該系統的其他特征。在本發明的另一實施例中，提供了一種用于在組織病理學處理期間包埋組織活檢樣本的系統，并且大體包括如上討論的組織載體，以及數據庫、機器可讀指示器和如上討論的電子控制。該系統還包括包埋設備，其操作用于包埋組織活檢樣本，用于隨后的組織切片。在該實施例中，電子控制訪問數據庫中的信息，并且根據信息而執行由包埋設備進行的包埋過程的至少一部分。例如，可以使用存儲在數據庫中的信息，以指導包埋設備將帶有或不帶有組織載體的組織活檢樣本置于用于接收包埋材料的至少兩個不同模具中的一個內。 這可以包括使用可切割載體，其保持組織活檢樣本，并且置于具有組織樣本的模具中。數據庫可以遠離組織載體，或者可以位于機器可讀指示器自身上。在后一種情況下，可以使用存儲在機器可讀指示器中的信息以指導包埋設備將組織活檢樣本放置在用于接收包埋材料的至少兩個不同模具中的一個內。例如，這可以允許根據組織載體的尺寸使用小模具和大模具。還可以或備選地使用存儲在數據庫中的信息，以指導包埋設備加熱和/或冷卻用于包埋組織活檢樣本的包埋材料。此外，該信息還可以或備選地更直接地存儲在機器可讀指示器中。還可以或備選地使用該信息以例如根據組織類型而從包埋組織活檢樣本的多種類型的材料中選擇一種包埋材料。在另一實施例中，在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統包括組織載體、組織處理器、數據庫、機器可讀指示器和電子控制。組織載體、數據庫、機器可讀指示器和電子控制可以大體上如上所述。組織處理器操作用于使得組織活檢樣本經受一過程，該過程用于允許隨后包埋組織活檢樣本。在常規組織處理器中，這包括使用化學試劑以從組織中移除流體，并且使用石蠟狀物質替換這些流體，由此制備用于完全包埋在石蠟中的組織樣本。其他組織處理器可以例如使用微波技術，用于從組織移除流體。在根據該實施例構建的系統中，電子控制訪問數據庫中的信息，并且根據所訪問的信息而使用組織處理器實施過程的至少一部分。例如，該信息可以根據如下參數而指導組織處理器在處理循環期間使用的化學試劑、處理器的循環時間、處理器的循環溫度等。在另一實施例中，提供一種用于實施組織病理學處理的至少一部分的系統。該系統大體包括構建成承載組織活檢樣本的組織載體、與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器以及數據庫。機器可讀指示器提供了使用組織活檢樣本識別的機器可讀參考標記。數據庫存儲與機器可讀指示器的參考標記相關聯的組織樣本記錄。組織樣本記錄中的信息可用于協助活檢組織樣本的組織病理學處理中至少一個步驟的執行。可以使用組織樣本記錄中的信息以協助執行例如下列步驟中至少一個在包埋樣本之前處理組織活檢樣本，包埋組織活檢樣本、樣本的切片載片制備、對顯微鏡載片上的樣本染色或者制備關于組織活檢樣本的最終病理學報告。在另一實施例中，提供一種用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統，并且其大體包括多個組織載體、操作用于在組織病理學處理期間執行至少一個過程的機器、數據庫、分別與多個組織載體相關聯的多個機器可讀指示器、以及電子控制。在該實施例中，多個組織載體的每一個構建成在組織病理學處理期間承載組織活檢樣本。每個機器可讀指示器包括使用標識與對應組織載體相關聯的組織活檢樣本的機器可讀參考標記。 在使用唯一參考標記訪問數據庫中的信息之后，電子控制基于關于不同參考標記存儲的類似信息而實施過程的至少一部分。可以使用該系統以實施各種過程。例如，可以使用電子控制基于類似信息以防止過程中的至少一個操作在至少一個組織活檢樣本上執行。還可以對電子控制編程以使得基于類似信息過程內至少一個操作在至少一個組織活檢樣本上執行。本發明還預期各種方法。例如，在一個實施例中，一種在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的方法包括讀取與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器，以獲得與載體所承載的組織活檢樣本相關聯的參考標記；訪問數據庫中與從機器可讀指示器獲得的參考標記相關聯的信息；以及使用該信息在組織病理學處理期間執行至少一個過程。在一個備選方案中，組織處理設備可以包括讀取器，并且可以使用讀取器讀取機器可讀指示器。該方法還包括使用組織處理設備執行該過程。該組織處理設備例如可以包括組織收取設備、組織處理器、組織包埋設備、組織切片設備、組織載片制備設備或診斷載片讀取設備或者在組織病理學處理期間使用的任何其他設備。在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的另一方法包括讀取與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器，以獲得與組織載體承載的組織活檢樣本相關聯的信息，并且使用該信息在組織病理學處理期間執行至少一個過程。該方法可以包括使用包括讀取器的組織處理設備，而該讀取器可以用于讀取機器可讀指示器。該方法還可以包括使用組織處理設備執行該過程。該組織處理設備可以是前述任意一項，或者是另一設備。作為說明性示例，本發明的方法可以執行下列步驟中至少一個a)使用該信息以選擇用于將信息記錄在組織活檢樣本上的組織收取過程的參數；b)使用該信息以選擇用于制備組織活檢樣本以用于包埋的組織固著過程的參數；c)使用該信息以選擇用于制備用于切片以及顯微鏡載片制備的組織活檢樣本的組織包埋過程的參數；以及d)使用該信息以選擇用于制備組織活檢樣本的顯微鏡載片的切片過程的參數。
在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的另一方法包括讀取與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器，以獲得與組織載體所承載的組織活檢樣本相關聯的信息，至少部部基于該信息而訪問電子組織樣本記錄，并且在組織病理學處理期間使用所訪問信息控制至少一個過程，而該過程選自下列中的一個或多個組織固著、組織包埋、切片、顯微鏡載片制備、顯微鏡載片染色以及制備病理學報告。本發明的方法可以包括使用用于組織病理學處理的后續過程中的信息更新電子組織樣本記錄中的信息。控制至少一個過程還可以包括基于與不同組織載體和/或不同組織活檢樣本相關聯的類似或相似參數的比較而形成包含性或排除性批決定。包含在機器可讀指示器上的信息或參考標記，諸如DRC，可以包括與組織活檢樣本或組織載體中至少一個相關聯的數字參考碼，而電子組織樣本記錄可以至少部分地存儲在遠離機器可讀指示器的數據庫中。電子組織樣本記錄可以至少部分地包含在存儲于在組織病理學處理自身使用的設備的控制中的數據庫中。例如，在如上所述的組織處理期間使用的任何設備可以包括具有上述數據庫的電子控制。備選地或附加地，電子組織樣本記錄可以至少部分地存儲在機器可讀指示器上。在其他實施例中，機器可讀指示器僅包含數字參考碼，而電子組織樣本記錄的其他信息可以存儲在遠離機器可讀指示器的數據庫中。通過對本公開內容的進一步查看以及尤其是在下文對實施例的描述中提供的附加細節，將認識到本發明的各種附加特征和優點。


圖1是根據本發明的說明性實施例的患者入院過程的示意性圖示。圖2是在患者入院過程之后的活檢獲取過程或步驟的示意性圖示。圖3是在從患者獲取活檢樣本之后使用的收取中心或裝置的透視圖。圖4是在組織樣本收取過程之后使用的組織處理機器或組織處理器的透視圖。圖5是在組織處理過程之后使用的組織包埋中心或機器的透視圖。圖6是在組織包埋過程之后的切片過程期間使用的裝置的透視圖。圖7是備選的自動切片裝置和載片制備中心或設備的示意性正視圖。圖8是載片染色中心或設備的透視圖。圖9是病理學檢查和報告過程的示意圖。
具體實施例方式本發明的各個實施例大體包括創建、記錄和利用關于活檢或其他組織樣品的信息的設備、系統和方法，該信息可以用于定制用于該特定樣本的組織病理學組織處理參數。在患者登記時初始化數字記錄，在本文中稱為組織樣本記錄或TSR。可以補充或建立數字記錄或TSR，以包含直接涉及組織樣本或者更一般地與樣本相關聯的數據，例如涉及隨著樣本持續通過組織病理學系統而處理組織樣本的數據。將與患者組織樣本相關聯的信息添加至數字記錄或TSR中，例如活檢過程記錄、組織病理學報告和診斷，以及關于組織樣本的、改進對樣本的處理和診斷的數據。當然，本發明的原理將適用于一次處理許多樣本。TSR可以包括伴隨樣本的組織特異處理指令。TSR防止丟失對患者樣本的追蹤，正如當使用多個記錄并且隨后變得失聯時可能發生的。此外，實驗室處理裝備可以使用TSR以對每個組織樣本的特異處理參數進行多變量分析。本發明能夠使得在組織病理學處理的步驟或過程中建立和使用發展性地更智能、全面和有用的記錄。這并不僅包括諸如組織樣本的各個項目的連續追蹤。本發明能夠使得關于每個獨立樣本的信息對于一個或多個自動機器可獲得，所述機器用于通過持續更新關于每個組織樣本的信息(即TSR)的數據庫以及其對于優選處理和診斷結果的需求，而在組織操作、處理和載片制備處理中自動形成決定。此外，本發明允許自動機器在整個組織病理學處理中交流關于各個活檢或者批處理的信息，由此允許各個機器接受來自其他智能機器的工作流程并與其交流。本發明不僅增強了現有組織追蹤系統，還允許以對于下游組織樣本處理唯一有用和不同的方式收集、存儲和使用新信息。對于每個組織樣本存儲在數據記錄或TSR中的新信息，對于計算機控制的組織處理機器而言可獲得。該信息可能涉及與組織樣本相關聯的記錄和處理，并且可以允許新的處理效率和診斷能力，之前用高工作量的手動系統不可能或者非常難以實現這樣的處理效率和診斷能力。可以使用記錄在數字記錄或TSR中的信息以允許針對以下內容定制組織特異處理，例如，組織類型、可疑疾病類型、包埋材料類型等。可以使用諸如通過限定特定載片染色、不同包埋材料、不同組織處理參數等的信息而定制診斷制備。此外，可以將關于診斷報告和病理學實驗室處理的信息存儲或記錄在數據記錄或TSR中，用于報告和歸檔建議。如上所述，在所公開的系統中，數據記錄包括動態組織樣本記錄(TSR)，隨著活檢樣本經過各個過程的同時處理組織樣本，TSR持續更新。在組織病理學處理的多個時點，將更多信息添加至TSR，這將允許在整個處理中的隨后步驟增加效率、能力和精確性。系統或方法的數個部件可以一同工作，以允許在系統的部件之間存儲和歸檔信息。最后，這可以在對組織樣本的診斷報告中達到頂峰。在更基本的形式中，本發明可以包括一系列組織載體，其具有與其物理相關聯的機器可讀指示器。機器可讀指示器可以包括基本技術，諸如條形碼或組織載體上的激光蝕刻、或者更精密的只讀或讀/寫存儲器技術，例如RFID標簽或芯片。機器可讀指示器包括參考標記，其可以簡單至組織載體標識元件。還將本文稱為數字參考碼(DRC)的組織載體標識號存儲在中心數據庫中，并且與用于由特定組織載體承載的樣本的TSR相關聯。隨著使用關于組織樣本的信息持續更新數據庫，TSR成為動態的和可讀/可寫的。當通過在整個處理中使用的機器的控制可訪問TSR時，改善各個樣本制備成為可能。通過使用涉及處理中的在先步驟或過程的信息持續更新TSR，隨著樣本向最終診斷報告行進，TSR成為更有用的下游產物。組織病理學處理的下列部件或步驟可以部分或整體升級，以允許數據存儲使用和從這樣的系統的更新。例如，可以包括下列步驟1、患者入院如果活檢是過程的一部分，初始化患者記錄和TSR。2、手術組織獲取使用例如可疑疾病類型、特定操作過程、用于顯微鏡載片制備的染色需求和用于可疑診斷的其他參數，而更新TSR。3、運送至實驗室的組織在制備中，使用諸如組織樣本的數量、固定液的類型和固定液中(一個或多個)組織樣本的初始浸泡的時間/日期而更新TSR。4、在病理學實驗室定向的組織收取使用例如組織樣本的需求、在收取之前的組織樣本的數字記錄(例如數字照片)、在該步驟識別的特異組織處理需求而更新的TSR。
5、使用溶劑/化學藥品、微波等的組織處理在制備中，使用例如特異組織處理參數、諸如使用的試劑、循環時間和溫度而更新TSR。6、組織包埋在制備中，使用例如用于基底模具選擇尺寸以最小化包埋材料(例如石蠟)的盒類型、石蠟類型和溫度暴露而更新TSR。7、組織切片和載片制備在制備中，使用例如制備用于顯微鏡載片制備和染色的組織切片厚度和切片數量更新TSR。8、組織染色在制備中，使用例如用于特異組織類型或疾病狀態的組織染色而更新的TSR。9、病理學診斷和報告使用例如改進的組織標識和描述方法而更新TSR，所述方法諸如超聲成像、數字記錄的照片或視頻以及數字記錄的口頭描述和這些描述的轉錄。10、組織塊載片和報告歸檔TSR允許更容易、更有效地調取歸檔塊，更容易地發送數字病理學報告至用于第二次意見的職業顧問。一般地，利用設備、系統和方法以讀取/寫入數據并且使得能夠從該數據增強處理存在三個主要的特征1、組織載體一這可以采取任何機械(一個或多個)設備或(一個或多個)支撐的形式，以固定通過收取從初始獲取獲得的(一個或多個)組織樣本，在盒中處理組織并且然后將其置于顯微鏡載片上。組織載體還承載機器可讀指示器，其可以具有相關聯的數字參考碼或DRC。2、組織病理學處理裝備或機器一收取站、組織處理器、自動包埋、切片、顯微鏡載片制備、診斷等。3、組織樣本記錄(TSR)和更新系統一其部分可以存儲在機器可讀指示器和/或處理裝備中，但是完整的TSR理想地存在于可由組織處理裝備訪問的一個或多個數據庫中。通過電子地鏈接上述三個特征，對于每個獲取的組織樣本，可以維持具有增強能力和更完整且精確的記錄的更有效的處理系統。電子或數字TSR可以在從組織獲取至最終病理學診斷記錄和報告的時間內，或者僅在整個組織病理學處理的一個或多個步驟期間， 追蹤組織樣本信息。RFID標簽可以附著至組織載體或者用作為機器可讀指示器。雖然RFID標簽(芯片)由于其讀寫信息的能力而具有吸引力，但是與每個組織樣本相關聯的大部分信息可以遠程地記錄在服務器上的數據庫記錄中。該組織載體僅需要具有參考標記，諸如唯一號或碼，其可以與患者手術記錄相關聯。事實上，在為組織載體實現讀寫能力(諸如具有物理相關聯的RFID標簽的那些)之前，首先初始化本發明的預測性的和增強的處理方面可能是更經濟的。通過使用RFID技術或其他讀/寫存儲器技術，可以實現更完整的利益，正如從本文的說明書中可注意到的。RFID標簽包括各種天線和具有數據存儲能力的射頻收發電路。RFID標簽或設備應當充分地包埋或者與每個組織載體集成，以防止因各個組織處理步驟而退化，其可以包括溶劑、試劑、來自組織處理器的微波輻射、升高和降低的溫度、正或負大氣壓以及基本震動和振動。此外，RFID標簽或其他存儲器設備在用于歸檔目的持續至少10年期間不能損失其存儲。期望使用包埋在玻璃或抗試劑塑料中的RFID標簽或其他存儲器設備。可以建立組織樣本記錄或TSR，以允許處理裝備不僅追蹤各個樣本，還能夠在整個處理中的下游過程或步驟中推薦那些樣本的其他處理增強。一些實驗室將實現在各個階段中的技術。因而，可能需要具有能夠讀取其他類型的機器可讀指示器的系統，諸如在先已經實現在組織病理學處理中的條形碼。可以并入能夠讀取這些其他類型的機器可讀指示器并且將它們記錄在對于每個步驟而持續更新的組織樣本記錄(TSR)中的設備。數字TSR不需要包含所有所需信息。由于大部分醫院系統具有追蹤賬單記錄的數據庫計算機，可以構想的是，系統可以利用可以被添加至這些數據庫的軟件。特定TSR鏈接至在獲取時間從患者獲得的每個組織樣本，并且利用在病理學處理的部分或全部期間的新信息對該特定TSR進行更新。隨著組織樣本經過整個處理，可以將數字更新碼記錄在與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器上(通過機器可讀碼)，或者可以將數字更新碼傳送至遠離組織載體的中心數據庫記錄中的TSR，但是借助于DRC標記到組織載體。這將更新TSR，并且保持該信息對于組織病理學處理中的下一步驟已經準備好和可獲得。在整個處理期間，通過將組織樣本的保管鏈與對于每個患者組織樣本而構建采取 TSR形式的數字數據庫的能力相關聯，而確保簡明的記錄。將組織樣本記錄(TSR)鏈接至數字參考碼(DRC)，數字參考碼例如可以采取二進制碼或十六進制碼或者與組織載體物理相關聯的任何其他類型的機器可讀碼。因而可以使用DRC作為特定標識，其在TSR存儲在遠離組織載體的數據庫中時允許患者組織載體鏈接至TSR。通過機器可讀指示器，DRC與組織載體物理相關聯，并且與數據庫中的TSR相關聯。 例如，實施例可以是條形碼標簽，其包含DRC、激光雕刻光學可讀碼(DRC)或者編程在諸如 RFID設備的數字存儲設備中的碼(DRC)。DRC可以標注為或者與從患者獲得的任何組織樣本相關聯。RFID標簽或其他機器可讀指示器可以并入容器、載片或在組織病理學處理期間用于運輸或保存(一個或多個)組織樣本的任何其他組織載體中或者與其物理相連。DRC是組織載體、和因此的載體內或上的(一個或多個)組織樣本以及TSR之間的鏈接。由于當前的RFID芯片數據存儲限制和成本，可能有利的是限制物理駐留在組織載體的信息量。成本效率對于實現便宜的裝置以將數據與每個組織載體、以及因而每個組織樣本相關聯，是重要的。正如任何數字存儲設備，存儲的信息位數越多，成本越大。因而，可能期望混合系統，其使用位于一些載體上的條形碼或類似簡單機器可讀指示器以及更復雜的機器可讀指示器的組合，所述更復雜的機器諸如在其他處的RFID標簽或其他讀/寫存儲器設備。因而，可能期望一個或多個數據庫作為所有TSR的中心倉庫，這是有成本效率的。此外，可以由醫院或實驗室處的信息技術人員備份和歸檔這些記錄。該系統還可以包括將數據寫在機器可讀指示器上的設備和方法，并且可以由處理裝備在組織處理的連續步驟中使用該數據。例如，如果裝備的一件或多件未電子地鏈接至數據庫，并且不能調取遠程存儲在數據庫中的數據，那么這將是有用的。可以在機器或裝備中使用諸如光讀取器的讀取器，以讀取已經寫到組織載體上的碼。可以直接沿著與載體物理相關聯或連接的RFID芯片而傳遞特定量的信息。可以從遠離載體的一個或多個數據庫中的TSR調取其他信息。DRC將能夠將所有患者組織樣本和診斷工作鏈接至存儲在一個或多個中心數據庫中的TSR。雖然今天的RFID標簽不可用于操作建立TSR所需的所有數據， 可以構想的是在未來，可以將整個TSR存儲在與組織載體相關聯的RFID芯片上。在該情況下，存儲在這種精密機器可讀指示器上的參考標記將包括更詳細的信息和/或與用于對應組織樣本的處理相關聯的指令。還可能分配鏈接至查找表的事件碼。以這種方式，簡單的二進制碼可以與一些TSR相關聯。例如，僅存在三種類型的石蠟，可以用于包埋組織樣本， 因而兩代碼二進制碼將覆蓋所有三個。隨著與組織載體相關聯的機器可讀指示器的存儲水平發展，可以設計一種系統允許更多的存儲。直到諸如RFID技術的讀/寫存儲變得成本更低，將實現更簡單的系統，其取決于遠程數據存儲與以有效方式訪問數字TSR的混合，以使得信息對于小型組織處理機器可獲得。下文示出了在三個不同示例性精密度水平的DRC的遷移路徑。第一水平將是在每個患者的處理期間僅使用單一組織標識DRC。然后，單一組織標識DRC將每個組織處理站鏈接回存儲在健康護理信息系統的(一個或多個)數據庫中的 TSR0這將需要與組織載體物理相關聯的最少量的存儲器，并且對于組織載體無需RFID芯片或其他精密存儲器設備。例如，DRC可以簡單的是唯一條形碼或者其他機器可讀指示器的形式，其被分配給來自特定患者的特定組織樣本或多個樣本，并且以合適的方式施加于組織載體。該系統可以仍然允許將有限的信息存儲在組織載體上，以幫助對該特定組織樣本作出智能處理決定。在下一情況或第二水平中，存儲在少量讀/寫存儲器中的TSR在機器可讀指示器上可獲得。在該情況下，機器可讀指示器可以包括RFID芯片或其他讀/寫存儲器設備。這將允許系統隨著通過組織病理學處理的各個站而更新機器可讀指示器，由此添加對于組織處理的下游定制有用的信息。處理中一個或多個機器可以獨立地讀取對于正被處理的每個樣本的TSR。在該情況下，每個機器對于當前在批中正運行的組織樣本的制定決定處理而言基本上是獨立的。在第三水平中，構建關于組織特異測試和處理參數的信息，以作出全面的動態數字文件(TSR)，允許對于每個樣本對定制處理參數進行排序。在醫院系統中，對于機器可讀指示器而言其可能簡單地具有唯一的號，該唯一的號訪問唯一的數據庫記錄，每當樣本完成一個處理步驟時，就對數據庫記錄進行更新。然后，每個處理機器可以通過參考與組織載體相關聯的DRC而詢問數據庫，以確保每個步驟正確地更新樣本記錄。這是期望的步驟，因為可以追蹤保管中的每個改變至特定機器或用戶，并且隨著組織樣本朝向病理學家用于診斷，而創建TSR的歷史記錄。當也包括的數據以直接編程RFID芯片到組織載體上的情況下， 可以存儲短代碼以指示對于該步驟已經編程組織載體。這也是在整個處理的步驟期間追蹤樣本的方法，并且確認例如樣本已經以正確的順序完成了每個步驟。最精密形式的機器可讀指示器可以攜帶大部分(或者全部)TSR，但是仍然期望將TSR電子地存儲在遠離機器可讀指示器的一個或多個其他數據庫中，至少用于備份和歸檔目的。組織樣本與TSR鏈接的第一位置是在從患者獲取樣本的外科手術室。每個樣本或樣本組置于組織載體中，諸如活檢容器。每個活檢容器具有機器可讀指示器，諸如RFID標簽、條形碼、激光蝕刻碼等，其將包含在患者的住院處理或開始進入實驗室系統期間分配的 DRC。機器可讀指示器還可以包含需要傳遞至病理學實驗室中的下一處理步驟或過程的其他信息。該信息可以包括關于可疑病理學類型的手術醫生的觀察。該信息在與處理樣本相關聯的后期步驟期間可能是重要的，諸如對于特定類型的細胞或疾病的特異載片染色。 這種信息對于病理學家或組織技術專家，或者對于下文將描述的自動收取系統而言是有用的。TSR還將包括執行手術的醫生姓名，以及手術過程所特有的信息，諸如放置在樣本容器中的活檢樣本的數量。如果正如在現有醫院追蹤系統中已經對儀器給定追蹤號，那么可以使用指示用于獲取活檢的儀器的信息而更新TSR。然后，根據組織類型，特定的疾病或組織類型能夠接收特定的組織處理指令。一些罕見的疾病可能需要特定的載片染色。在該情況下，可以從標準運行批中自動精選出組織，并且在獨立的染色裝備上處理。在美國專利No. 5817032中，描述了一種系統，其包括數字視頻收取。收取站將位于病理學實驗室中。這預想為具有數字攝像機系統的區域，樣本將置于數字攝像機系統下。 可以使用立體攝像機系統，從而可能在將樣本置于盒內之前并且在化學/溶劑處理、包埋和切片之前記錄描述樣本的三維圖像。在照片中的尺寸標線將允許系統軟件計算組織樣本的總面積。可以使用超聲成像以確定組織樣本的高度或體積。使用已記錄的這些參數，軟件可以做出關于最適用于包埋組織樣本的盒類型的決定或建議。該收取站還將具有讀取和寫入機器可讀指示器的系統，諸如RFID標簽，或者創建更簡單的機器可讀指示器，諸如施加于組織載體的條形碼標貼或激光蝕刻碼。讀取系統將借助于組織載體上的機器可讀指示器(例如，樣本容器)而讀取例如來自外科手術室的樣本信息和特定處理指令。數字視頻收取取代手動收取系統，由此可以由病理學家在從手術中接收組織之后將組織收取特征描述入聽寫系統中。使用視頻收取，將可以給出的任何口頭描述與視頻數據一同記錄，并且隨后轉換成數字形式，諸如轉換成.wav文件。這些文件可以在TSR中存儲為語音記錄，或者隨后可以使用聽寫軟件轉錄或由轉錄員錄入。無論如何，所有這些記錄可以對醫院外部的檢索可獲得。例如，可以向在遠程位置的轉錄員提供對該天工作的特定 TSR的訪問。由于每個TSR具有唯一的DRC，已寫入的轉錄可以在完成時鏈接回TSR中。該信息將數字地添加至TSR。TSR成為存放關于患者活檢和診斷處理和報告的所有信息的中心位置。如前所述，TSR可以電子地存儲在一個或多個遠程數據庫中，或者位于組織載體自身上，或者使用兩者的組合。在記錄了收取數據之后，病理學家制備組織樣本，并且將它們置于各個組織載體中，例如，采取盒的形式。隨后，盒分別按照對于各個患者而言唯一的數字參考碼(DRC)而序列化。該號或碼還借助于和與盒物理相關聯的機器可讀指示器相關聯的機器可讀碼，而與每個盒相關聯。當病理學家首次遇到來自患者的組織樣本時，收取站將詢問樣本容器以獲得DRC。詢問可以以任何形式，諸如光可讀碼、RF標識或者甚至在計算機鍵盤上的手動輸入。此外，在該收取站的控制面板將允許病理學家添加指令，諸如從選擇菜單或者暗示處理器碼，其關于在處理中將如何處理和進一步切片組織，而相應地對于每個獨立盒更新TSR。 該信息隨后可以允許使用隨后的智能處理和包埋機器，這顯著地減少了所需的人/樣本交互，并且允許機器作出自動處理決定。智能處理可以包含諸如組織類型、組織方向、或者特定疾病或組織類型所需的特殊載片染色的信息。因而，已經指示具有特殊組織處理特征或需求的樣本可以根據這些特征或需求而被精確處理。在組織樣本收取之后，將制備的樣本置于一個或多個獨立組織載體中，諸如活檢盒，并且將盒轉送至組織處理機器中，組織處理機器可以使用諸如溶劑和化學藥品的試劑或微波等，以制備用于包埋和切片的組織。可以在進入處理機器的處理腔之前詢問盒的機器可讀指示器，并且基于樣本厚度或尺寸以及組織類型、根據所需的處理長度、試劑參數、 熱或真空限制等而分類。這是在收取每個樣本時添加至TSR的信息。這還將允許對樣本交叉核查以確保對它們進行正確的處理。例如，在處理機器中以比大活檢樣本更快的循環處
16理小活檢。由于可以更快地運行小活檢，如果腔完全填充有小活檢，那么可以以短循環運行該處理。隨后機器可以制定包含性決定以根據類似處理需求而對樣本進行分批，并且將該批樣本一同運行通過組織學處理的一個或多個部分。相反地，如果一個或多個樣本與其余樣本不同，那么機器可以從該批中排除該一個或多個樣本，并且分別地運行(一個或多個) 樣本，或者轉移至另一處理機器。作為進一步示例，乳房組織具有高的脂肪含量，而某些試劑比其余試劑更好地清除脂肪。這種系統可以調整時間和溫度和化學藥品(試劑)組成， 以使得對于裝配成基于每個組織樣本的需求而改變組織處理參數的機器可獲得組織類型特異的處理。全自動機器可以根據處理類型而對盒分類，并且對于該處理樣本類型而將正確的樣本裝載在合適的處理腔內。該系統還允許在特定樣本上運行特定試劑和/或促進劑，以便于穿刺厚組織或出于其他理由。該系統將挑出這些樣本，并且防止它們在標準批中被處理。機器將根據處理腔中樣本的組成而自動調整處理參數。一旦處理了組織樣本，可以將它們引導至自動包埋站或中心內。再一次，可以由自動包埋機器讀取與每個組織載體的機器可讀指示器相關聯的信息。例如，如果組織載體 (例如，盒)包括RFID標簽或條形碼上的DRC，例如，可以調取用于該樣本的數據庫記錄，以由包埋機器和下游機器使用。可以對處理中的上游機器實現相同的步驟。如果組織載體的機器可讀指示器不包含該信息自身，機器簡單地詢問遠程或本地數據庫記錄，查找與該組織載體相關聯的個體DRC，并且調出TSR以獲得對于該樣本的特定包埋需求。在該步驟或過程期間，將逐個盒地命令包埋機器如何包埋特定樣本。TSR中的信息還將控制配備用于特殊類型的活檢的特殊包埋介質。例如，優選對于不同類型的組織選擇不同分子量的石蠟切片。諸如乳房組織的脂肪組織，與肌肉或膽囊組織切割非常不同。因為存在數以百計的不同類型的組織和許多盒與基底模具的尺寸，可能的組合數量可能非常大。自動系統將根據例如存儲在每個機器中的查找表而管理許多可能的排列。具有許多可編程變量的系統，諸如已經訪問增強TSR的那些，將允許組織學技術人員或智能處理機器， 使用正確的處理和包埋信息控制每個機器用于精確的樣本制備，而運行對每個盒或其他組織載體所選的最優處理參數。各種切片機可切組織載體是已知的。可切片組織操作技術將演變成不同類型的組織固定。可以預想的是，這些不同類型的固定將需要不同的組合處理步驟。因而，除了機器可讀指示器上的組織樣本信息，特定組織處理和包埋信息可以源于與盒類型或者正使用的其他組織樣本固定設備相關聯的預編程碼。存儲在TSR中的信息涉及不僅是組織所需的也是所使用的組織固定系統類型所需的特定類型的處理。關于特殊樣本或與其相關聯的信息的可用性應當允許包埋機器基于組織樣本和盒的尺寸和數量而確定配備多少石蠟。當在包埋中心識別樣本類型時，用于進一步自動化和處理控制的其他選擇可能變得可獲得。例如，特殊樣本可能需要真空輔助設備，以將非常小的氣泡從石蠟中抽出，并且在基于TSR中的信息的指令之后，自動啟動該步驟。例如，還可以基于與任何特定盒或者其他固定設備相關聯的包埋材料流動特征，而初始化更長或更短的處理參數。隨著處理繼續進行，隨后將每個包埋盒(或者其他固定設備或組織載體)傳遞至組織切片站，其中將石蠟包埋的組織樣本和硬化的包埋材料(例如石蠟)切割成薄切片，以應用于顯微鏡載片。通過具有切片機可訪問的信息，還可以允許自動組織切片站。該信息可以包括基于特殊盒或組織的可切割性的特定參數。可以編程控制諸如初始刮面切片厚度 (initial facing section thickness)的參數以建立在暴露和切割組織之前需要移除的材料的精確厚度。智能切片機可以讀取與組織載體相關聯的DRC。正如前述所討論的，DRC 鏈接至數據庫中的TSR，數據庫中的TSR隨后可以使用在切片步驟或過程期間使用的相關聯參數而更新切片機。例如，這些參數可以包括用于該特殊類型的組織或盒的正確類型的刀刃和刀刃或卡盤設置。同樣地，理解現有包埋處理的重要性是重要的。在自動包埋中心中，將記錄用于在每個獨立組織載體設備中使用的特殊類型的石蠟。在不同的溫度和利用組織切片刀刃上的不同類型的研磨，來切割不同類型的石蠟具有更好的效果。因而，通過提供用于特殊樣本的石蠟類型的行進記錄(TSR)，自動切片中心可以調整其參數以在特定溫度、刀刃速度和切片厚度而切割組織，或者向用戶指示特定刀刃和/或刀刃設置或其它參數。如果裝配有讀/寫存儲器設備，諸如RFID標簽，讀取器/記錄器將讀取盒上的碼， 以訪問對于特殊樣本的TSR，并且隨著將薄切片轉送至載片上，將對載片給定與相關聯組織載體相同的DRC。這將每個載片相關回到與該樣本相關聯的TSR中的信息，TSR中的信息包括所有其他相關聯的處理信息，以及用于該特殊活檢的患者信息。這樣，具有在TSR中建立的數字參考標記的完整非斷裂鏈，其從(患者掛號時采集)原始患者和腕帶延伸直到由病理學家在顯微鏡診斷進行分析。概言之，當前從活檢樣本取回到診斷載片分析的處理包括許多手動系統，用于記錄必須隨同給定組織樣本的相關聯信息。使用諸如本文所述的系統和方法，可以包括所有患者/賬單信息，以及任何組織病理學信息，以幫助定義樣本所需的特殊處理。在診斷時對于病理學家有用的信息可以使用機器可讀指示器綁定于每個樣本，其中根據與機器可讀指示器相關聯的精密度水平，機器可讀指示器帶有或不帶有對獨立數據庫的參考標記。該系統以其任何形式，允許隨著樣本從取回行進到診斷，而創建和更新單一 TSR。下文中，參考附圖給出了說明性實施例的更詳細描述。圖1示出了患者入院中對TSR的初始化。在入住醫院或其他醫療機構之后，將腕帶10分配給每個患者12。該帶10標識患者12和他的醫生(未示出)。帶10包括條形碼標貼或RFID標簽14，取決于上述討論所需的精密水平，其將唯一參考標記、諸如數字參考碼(DRC)分配給患者12。在該示例中，腕帶10上的RFID標簽14被編程有患者唯一標識 DRC。隨后，可以使用該DRC以將患者記錄或TSR 15與診斷處理的每個部件連接。RFID標簽14可以由醫院雇員16編程，例如，使用具有WiFi或無線能力的計算機20。將意識到，在本文所述的整體處理中發生的任何數據傳輸可以是無線的、硬布線的或其組合。還可以使用因特網和/或更局部化的內聯網用于數據傳輸。在入院時，初始化患者記錄或TSR，其與DRC相關聯，而TSR可以接收患者信息(姓名、地址和社會保險號)、保險信息、過程數據以及醫生和過程詳細信息(例如，醫生參考的測試和有序的手術過程)。這建立了用于最終診斷報告的組織樣本記錄(TSR)。使用無線界面或WiFi，具有硬連線的計算機鍵盤輸入或者掃描設備30和計算機 20，將入院信息或TSR傳輸至計算機數據庫15，其中，可以在活檢樣本處理中的任意點從計算機數據庫15中調取該信息。
圖2示出了例如在外科手術室發生的處理的步驟。在外科手術室，使用機器碼讀取器或掃描儀30經由包括條形碼或RFID標簽14的腕帶10確認患者12的身份。護士或醫務人員32可以將患者手術信息記錄到TSR服務器文件或數據庫15，并且可以確認將執行的過程。在TSR中查找有序的(一個或多個)特殊手術過程。將執行的特殊過程將指示將使用的醫療儀器并且將從患者12調取或獲取多少組織樣本。便攜式讀取器/編程器30可以從外科醫生使用的任何儀器中獲得數據，其可以觸發在整個處理后期的專用操作過程的需求，并且通過與服務器數據庫15中的特定TSR相鏈接，使得該信息對于技師或自動系統或機器可獲得。活檢樣本容器40標注有患者DRC，例如，使用條形碼標貼或RFID標簽42。利用放置在容器40中(容器40包含的)的患者組織類型和應當如何在稍后處理步驟操作組織而更新TSR。每個樣本容器40上的DRC將唯一地標識特殊患者12和手術過程。這將允許追蹤從患者12獲得的所有樣本在置入容器40后盡快開始，甚至在到達病理學實驗室之前。將更新諸如服務器15上的數據庫中的患者TSR，以包含完整的樣本記錄，包括獲取的組織樣本數量和如何獲得樣本。稍后，在最終診斷報告中調入該信息。圖3示出了病理學實驗室收取步驟，包括使用數字收取中心或部件46。活檢容器 40到達病理學實驗室。在病理學實驗室中，通過數字收取中心46處理樣本容器40。容器 40是可以在整個組織病理學處理中使用的許多種組織載體中的一種。其他容器包括在包埋過程期間使用的組織盒、平臺或其它結構，以及用于檢查/分析目的的顯微鏡載片。數字收取中心46通過無線讀取樣本容器40上的DRC而與TSR交互，以從TSR 15調取關于樣本的信息，并且由技師或其它專業人員或者由自動機器而記錄在處理中進一步使用的任何新信肩、ο數字收取中心46包括讀取器，由此將特殊樣本容器40專門地識別至收取中心46。 收取中心46編程機器可讀指示器，諸如RFID標簽50，可讀指示器固定至組織載體，諸如組織樣本M將從一個容器40轉移至其中的盒52。使用合適的電子控制48，諸如計算機或其他電子處理器，可以實現編程功能。本文所公開的與其他組織學處理裝備相關聯的其他電子控制同樣可以根據所需的能力而包括計算機化控制或電子處理器。立體數字攝影機60 允許3D成像，或者紅外照相機和燈62、微波、超聲或其它類型的成像系統在出現于盒52上或其它組織載體上時記錄組織討的一幅圖像，在切割之前給出組織樣本討的物理記錄。這向TSR 15提供了組織的歸檔圖像，包括樣本數量及其外觀，并且出于后期參考和確認目的而與組織載體52相關聯。這還可以允許計算將制作的(一個或多個)樣本M的體積，其可以用于指定在組織處理機器中所需的處理時間的長度、自動包埋處理期間每個樣本所需的包埋材料的體積和/或整個石蠟體積需求或者其他變量。與運行通過包埋機器的許多盒相關聯的(一個或多個)組織樣本中的每個所需的包埋材料(例如石蠟)的體積的確定， 將提供用于提供至包埋機器的包埋材料的自動存貨控制。如果由病理學家識別組織類型， 并且將其記錄在TSR 15中，可以使用自動查找表以確定組織樣本M的密度。可以使用該信息以及其他輸入或測量參數，以借助于計算機算法將處理碼分配給每個組織樣本M。這將確保例如不向例如前列腺組織的小密度組織分配與密度較小的卻大得多的肝臟相同的處理碼。所以，類似或相同的組織類型能夠更有效地被分批進行處理。例如，類似的組織類型可以使用類似的處理試劑和處理循環時間以及類似類型的石蠟。通過使用所有樣本信息以及用計算機程序代替手動對類似的組織樣本分批，將改善處理效率。在收取期間對每個樣本M拍攝的圖像，還可以在創建最終報告時從服務器上的 TSR 15被調出，以代替對樣本M的書面物理描述或作為其的補充，簡化該處理并且使其更完整。數字收取中心46還可以語音記錄病理學家的傳統物理描述，將信息存儲為.wav 文件，該文件隨后可以由轉錄軟件或者由轉錄員自動轉錄成TSR15。這持續在TSR服務器 15上建立信息的數字記錄，而在處理末期可以獲得該信息以協助形成最終報告。收取中心46還允許病理學家向用于組織處理中心、包埋中心和/或染色中心的盒52上的機器可讀指示器50添加特殊指令，例如在處理后期使用的，以確保最優可視化組織M中感興趣的特殊特征用于診斷。這給了病理學家分別操作每個組織樣本M的機會， 并且確保執行合適的過程以獲得可能的最佳診斷信息。例如，病理學家可以獲得單一樣本 M，將其切成數片，并且在處理中對每個獨立片或樣本施加不同的過程和/或染色，以增強樣本中的不同特征。不需要其他人為互動以區分每個樣本的所需治療，因為對于進一步處理的指令被編程在盒RFID標簽50內，或者從TSR 15調取。收取中心46還可以允許有效地追蹤工作人員。通過要求每個職工在開始工作之前輸入工號，可以基于樣本的產量而監視生產力。可以在存儲于服務器15上的所有TSR上運行子程序，并且可以在組織病理學處理中需要完成一個步驟或過程時進行比較。對于本文所討論的所有過程而言都是這樣的，這些過程包括例如組織切片，其中人為效率是生產力的重要因素。這使得能夠進行工作流程分析和成本比較，用于結帳和審計目的。隨后可以使用預測性模型以管理材料使用和實施程序，以增加工作流程效率，諸如通過對存在減速或瓶頸的整個處理的任何部分的研究。圖4示出了組織處理過程。在收取之后，將盒52隨機插入架70中，以等待處理。 通常將組織處理稱為組織固著或固定。制備組織用于包埋的步驟可以使得石蠟滲透組織。 理想地，隨后將組織樣本(一個或多個)包埋在石蠟塊中，其在其整個橫截面上將具有類似的密度和切割特性，包括含有(一個或多個)樣本的部分。稍后將參考圖5討論組織包埋過程。組織處理機器，有時稱為組織處理器80，可以通過讀取DRC、即條形碼或RFID標簽50 而詢問每個盒52，并且隨后在服務器中訪問用于該組織樣本的TSR 15。可以結合處理器80 使用合適的電子控制84，以有助于讀取、訪問和其他必須處理功能。TSR包含確定用于該特殊樣本的最佳處理循環所需的數據——其由盒尺寸、樣本厚度、所需試劑或溫度、以及在數字收取中心46處或者在進行手術的情況之前添加至TSR 15的其他參數所指定。隨后處理器80可以確定將哪些樣本分批在一起、到各個組82中并且運行何種類型的處理循環。處理器或處理機器80將能夠根據其處理參數而挑選或設置每個盒52進入處理腔。以該方式， 在有效的組中處理盒52，節省處理器試劑和處理時間。此外，對于加急掛號，需要以加速方式處理的組織樣本可以由機器80自動挑選出，并且進行適當地處理。這提供了有效自動的處理，而無需過多的人為干預或管理。組織處理器80可以將關于如何處理每個組織樣本的數據寫入TSR 15。由此確保最終報告包含關于如何在處理中操作特殊樣本的正確信息。在機載計算機的這種系統中， 處理器80還可以保持追蹤處理了多少個盒52和什么類型的盒52。這可能有助于對供應品計數和排序。該系統還允許處理器80基于實際使用而追蹤使用的每個試劑和所推薦的維護。圖5示出了自動包埋中心100及其使用。一旦經處理，每個盒52必須包埋在石蠟中。再次將盒52隨機地插入架100中，以在自動包埋中心100中等待包埋，自動包埋中心 100諸如&ikura的自動TEC包埋中心或如在美國專利公開No. 2005/0226770中所述的包埋中心，該文獻在此引入作為參考。使用合適的電子控制102，包埋中心100可以通過讀取與 RFID標簽50或其他機器可讀指示器相關聯的DRC而詢問每個盒52(并且訪問TSR 15以確定所需的包埋參數，諸如包埋模具的尺寸、所需包埋材料(石蠟參數)、樣本優先權等)。 盒52當前具有物理詢問點，可以讀取物理詢問點以確定所需包埋模具的尺寸。更詳細的處理說明可以經由位于盒52上的TSR 15或RFID芯片50而鏈接至特定樣本，并且自動更新 TSR 15。隨后包埋中心100可以使用組120中的類似處理參數而自動對盒52分批，或者在讀取其RFID標簽50和對應TSR 15之后而對于每個獨立盒52而重新配置處理參數。將盒 52包埋在石蠟或其他包埋材料中。包埋中心100使用建立如何處理每個樣本的信息而更新每個TSR 15。確保該最終報告包含用于在包埋處理期間如何操作特定樣本的正確信息。圖6示出了切片中心130及其使用。切片設備132使用例如電子光學或RF讀取器136而讀取每個獨立盒52上的指示器50，并且將標識信息發送至編程設備138，編程設備138將機器可讀指示器140上的DRC適當地記錄在從盒52接收切片的顯微鏡載片150 上。使用合適的電子控制142，以促進例如讀取器136和設備138之間的信息交換，以及如在整個過程的其他部分中那樣與TSR 15的信息交換。組織切片設備132從盒52創建薄帶切片152，其隨后在水浴器154中漂浮到顯微鏡載片150上。盒52上的RFID標簽或其它指示器50維持包埋在石蠟塊中，從石蠟塊獲得切片。隨后歸檔該塊并且如果對于之后的檢查需要其他切片可以調用(通過塊存儲設施中的電子RFID詢問)該塊。可以將歸檔位置記錄在服務器15上的TSR內。顯微鏡載片150經由RFID標簽140標注有盒/石蠟塊DRC，以確保原始組織樣本TRS 15的可追蹤性。這提供了源自對樣本的原始收取以及例如指定組織樣本所需的染色類型的信息的訪問。在TSR 15中創建根據每個盒/石蠟塊而形成的顯微鏡載片的數量的記錄以便具有可追蹤性。圖7示出了備選自動組織切片和顯微鏡載片制備中心或部件170及其使用。該部件170自動化圖6中所示的處理。使用從盒/石蠟塊上的機器可讀指示器50調取的信息， 載片制備中心170自動化以下處理接收盒/石蠟塊52，將其切片，并且將帶切片152施加至適當標注以相關聯機器可讀指示器140的顯微鏡載片150。使用編程器172而編碼指示器140，例如以具有與對應組織樣本匹配的DRC。正如本文所公開的其他裝置，使用合適的電子控制174(諸如計算機或電子處理器)，以促進信息交換和控制功能的執行。圖8示出了染色中心200及其使用。以隨機順序將顯微鏡載片150插入染色中心 200中。使用通過從每個載片150上的指示器140讀取DRC獲得的信息，并且經由電子控制 202從TSR 15調取數據，染色中心200可以挑選和設置載片150以使用組210中的類似處理參數對其進行分批。這些參數可以包括常規染色序列、定時、優先權等。使用確認已經通過該中心100處理的每個載片150的信息，而更新用于患者的服務器記錄或數據庫15。將信息轉送至TSR 15，其將用于結帳目的，例如，包括制備的載片數量以及執行的任何特定過程。染色中心200將載片分類到每個患者的合適的載片盤，用于由病理學家查看。使用(根據已經記錄在患者記錄中的信息)追蹤對每個患者創建的載片150的總數量的能力，分類器可以識別哪個盤已經完成并且已經準備好用于查看，而其他等待所有載片的處理完成。圖9示出了病理學家的查看和最終報告產生。病理學家220在顯微鏡222下查看了載片150。顯微鏡222可以包括電子控制224，或者控制2 可以是獨立部件。在任一情況下，其可以執行與信息交換有關的功能和/或如本文所述的過程的控制功能。使用報告系統，他或她可以調用從患者入院至在外科手術室的樣本調取以及載片制備處理已存儲的所有信息。他可以驗證正確標識和操作樣本。標準化的報告形式230包含信息塊和數字圖像鏈接，其基于記錄在由顯微鏡載片150承載的指示器140上的DRC而自動填充。還可以記錄對載片的顯微鏡分析的數字記錄。可以通過使用麥克風232進行聽寫以及隨后的自動轉錄和/或手動鍵盤輸入而將附加信息和診斷添加至報告和TSR 15。病理學家220例如使用麥克風而描述他/她的分析，其可以記錄作為音頻文件，諸如.wav文件。該文件可以作為音頻文件和/或文本文件而存儲在TSR 15中。麥克風222優選能夠允許病理學家拍攝 (一個或多個)組織樣本的照片圖像，而這些圖像可以組成病理學報告的部分或者TSR 15 的部分。該數字記錄隨后可以電子地傳輸回患者的醫師240處。處理步驟的概述表
過程步驟數字參考碼(DRC): 對于需要報告的每個組織獲取事件的唯一標識碼(例如，號)組織樣本記錄(TSR): 對于每個病例或樣本的位于服務器或數據庫上的累計數據入院建立的具有DRC的唯一患者組織標識(腕帶ID RFID可以包括 DRC)所有入院記錄賬單信息(例如保險) 建立唯一病例碼(在數據庫中建立涉及唯一 DRC的組織樣本記錄)手術(一個或多個)樣本容器的每個均攜帶DRC以標識(一個或TSR由下列更新(一個或多個)容器中的樣本#;活檢樣
權利要求
1.一種用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統，包括組織載體，其構建成在所述組織病理學處理的至少一個步驟期間承載組織活檢樣本； 數據庫，其存儲與所述組織活檢樣本相關聯和與組織處理過程相關聯的信息； 機器可讀指示器，其與所述組織載體物理相關聯，所述機器可讀指示器包括標識所述組織活檢樣本的機器可讀參考標記；以及電子控制，其操作用于讀取所述參考標記、使用所述參考標記訪問所述數據庫中的所述信息、并且根據所訪問的信息而實施所述組織處理過程的至少一部分。
2.根據權利要求1所述的系統，還包括組織處理設備，其包括所述電子控制并且操作用于執行所述組織處理過程的至少一部分。
3.根據權利要求2所述的系統，其中，從包括下列項的組中選擇所述組織處理設備 組織收取設備、組織處理器、組織包埋設備、組織切片設備、組織載片制備設備以及診斷載片讀取設備。
4.根據權利要求1所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新所述數據庫中的所述信息。
5.根據權利要求1所述的系統，其中，所述機器可讀指示器存儲在建立組織活檢樣本的處理參數中使用的信息。
6.根據權利要求5所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新存儲在所述機器可讀指示器上的所述信息。
7.根據權利要求6所述的系統，其中，所述機器可讀指示器還包括RFID標簽。
8.根據權利要求1所述的系統，其中，所述參考標記還包括數字參考碼。
9.根據權利要求1所述的系統，其中，所述機器可讀指示器是只讀指示器。
10.根據權利要求9所述的系統，其中，所述只讀指示器還包括條形碼或所述組織載體上的蝕刻。
11.一種在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統，包括組織載體，其構建成在所述組織病理學處理的步驟期間承載組織活檢樣本； 機器可讀可寫指示器，其與所述組織載體物理相關聯，所述機器可讀可寫指示器存儲標識所述組織活檢樣本的參考標記，并且還存儲與所述組織活檢樣本的至少一個物理屬性相關聯的信息；以及電子控制，其操作用于讀取所述參考標記和存儲在所述機器可讀可寫指示器上的所述信息，并且根據所訪問的信息實施組織處理過程的至少一部分。
12.根據權利要求11所述的系統，其中，所述電子控制還操作用于將新信息寫入所述機器可讀可寫指示器上。
13.根據權利要求12所述的系統，其中，所述新信息包括更新已經存儲在所述機器可讀可寫指示器上的信息。
14.根據權利要求11所述的系統，其中，存儲在所述機器可讀可寫指示器上的信息與存儲在獨立數據庫中的信息的至少一部分相同。
15.根據權利要求11所述的系統，其中，存儲在所述機器可讀可寫指示器上的所述信息至少部分地不同于存儲在所述數據庫中的所述信息。
16.根據權利要求11所述的系統，還包括組織處理設備，其包括所述電子控制并且操作用于執行所述組織處理過程的至少一部分。
17.根據權利要求16所述的系統，其中，從包括下列項的組中選擇所述組織處理設備 組織收取設備、組織處理器、組織包埋設備、組織切片設備、組織載片制備設備以及診斷載片讀取設備。
18.根據權利要求11所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新所述數據庫中的所述信息。
19.根據權利要求11所述的系統，其中，所述機器可讀指示器存儲在建立組織活檢樣本的處理參數中使用的信息。
20.根據權利要求19所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新存儲在所述機器可讀指示器上的所述信息。
21.根據權利要求20所述的系統，其中，所述機器可讀指示器還包括RFID標簽。
22.根據權利要求11所述的系統，其中，所述參考標記還包括數字參考碼。
23.一種用于在組織病理學處理期間包埋組織活檢樣本的系統，包括 組織載體，其構建成在包埋過程期間承載組織活檢樣本；包埋設備，其操作用于包埋所述組織活檢樣本用于后續切片； 數據庫，其存儲與包埋處理相關聯的信息；機器可讀指示器，其與所述組織載體物理相關聯，所述機器可讀指示器包括標識所述組織活檢樣本的機器可讀參考標記；以及電子控制，其操作性地與所述包埋設備耦合，并且能夠讀取所述參考標記和存儲在所述機器可讀指示器上的信息，訪問所述數據庫中的所述信息，并且根據所述信息實施所述包埋過程的至少一部分。
24.根據權利要求23所述的系統，其中，使用存儲在所述數據庫中的所述信息以指導所述包埋設備將所述組織活檢樣本放置在用于接收包埋材料的至少兩個不同模具的一個中。
25.根據權利要求23所述的系統，其中，所述信息存儲在所述機器可讀指示器中，并且用于指導所述包埋設備將所述組織活檢樣本放置在用于接收包埋材料的至少兩個不同模具的一個中。
26.根據權利要求23所述的系統，其中，使用存儲在所述數據庫中的所述信息指導所述包埋設備加熱和/或冷卻用于包埋所述組織活檢樣本的包埋材料。
27.根據權利要求23所述的系統，其中，所述信息存儲在所述機器可讀指示器中，并且用于指導所述包埋設備加熱和/或冷卻用于包埋所述組織活檢樣本的包埋材料。
28.根據權利要求23所述的系統，其中，使用存儲在所述數據庫中的所述信息以選擇用于包埋所述組織活檢樣本的包埋材料。
29.根據權利要求23所述的系統，其中，所述信息存儲在所述機器可讀指示器中，并且用于選擇用于包埋所述組織活檢樣本的包埋材料。
30.根據權利要求23所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新所述數據庫中的所述信息。
31.根據權利要求23所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新存儲在所述機器可讀指示器上的所述信息。
32.根據權利要求23所述的系統，其中，所述機器可讀指示器還包括RFID標簽。
33.根據權利要求23所述的系統，其中，所述參考標記還包括數字參考碼。
34.一種用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統，包括組織載體，其構建成在允許隨后包埋所述組織活檢樣本的過程期間承載組織活檢樣本；組織處理器，其操作用于使所述組織活檢樣本經受允許隨后包埋所述組織活檢樣本的所述過程；數據庫，其存儲與所述過程相關聯的信息；機器可讀指示器，其與所述組織載體物理相關聯，所述機器可讀指示器包括標識所述組織活檢樣本的機器可讀參考標記；以及電子控制，其操作性地與所述組織處理器耦合，并且能夠讀取所述參考標記，使用所述參考標記訪問所述數據庫中的所述信息，并且根據所述信息而實施所述過程的至少一部分。
35.根據權利要求34所述的系統，其中，使用存儲在所述數據庫中的所述信息以關于下列中至少一項指導所述組織處理器在所述過程期間使用的化學試劑、循環時間或者循環溫度。
36.根據權利要求34所述的系統，其中，所述信息存儲在所述機器可讀指示器中，并且使用所述信息關于下列中至少一項指導所述組織處理器在所述過程期間使用的化學試劑、循環時間或者循環溫度。
37.根據權利要求34所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新所述數據庫中的所述信息。
38.根據權利要求37所述的系統，其中，所述數據庫在所述機器可讀指示器上。
39.根據權利要求34所述的系統，其中，所述機器可讀指示器還包括RFID標簽。
40.根據權利要求34所述的系統，其中，所述參考標記還包括數字參考碼。
41.一種用于執行組織病理學處理的至少一部分的系統，包括組織載體，其構建成承載組織活檢樣本；機器可讀指示器，其與所述組織載體物理相關聯，所述指示器提供標識所述組織活檢樣本的機器可讀參考標記；以及數據庫，其存儲與所述機器可讀指示器的所述參考標記相關聯的組織樣本記錄，由此所述組織樣本記錄中的信息能夠用于協助所述活檢組織樣本的所述組織病理學處理中至少一個步驟的執行。
42.根據權利要求41所述的系統，其中，所述組織樣本記錄中的所述信息能夠用于協助下列中至少一項的執行在包埋所述組織活檢樣本之前處理所述組織活檢樣本、包埋所述組織活檢樣本、所述組織活檢樣本的切片載片制備、載片上的所述組織活檢樣本的染色、 或者關于所述組織活檢樣本的最終病理學報告的制備。
43.一種用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統，包括多個組織載體，每個組織載體構建成在所述組織病理學處理期間承載組織活檢樣本；操作用于在所述組織病理學處理期間執行至少一個過程的機器， 數據庫，其存儲與所述過程相關聯的信息；多個所述機器可讀指示器，其分別與所述組織載體物理相關聯，每個機器可讀指示器包括標識與對應的組織載體相關聯的所述組織活檢樣本的唯一機器可讀參考標記；以及電子控制，其操作性地與所述機器耦合，并且能夠讀取所述參考標記、使用所述唯一參考標記訪問所述數據庫中的所述信息，并且基于關于不同參考標記所存儲的類似信息實施所述過程的至少一部分。
44.根據權利要求43所述的系統，其中，所述電子控制基于所述類似信息而排除在所述組織活檢樣本中的至少一個上執行所述過程中的至少一個操作。
45.根據權利要求44所述的系統，其中，所述電子控制包括基于所述類似信息在所述組織活檢樣本中的至少一個上執行所述過程中的至少一個操作。
46.根據權利要求44所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新所述數據庫中的所述信息。
47.根據權利要求44所述的系統，其中，所述電子控制操作用于更新存儲在所述機器可讀指示器上的所述信息。
48.根據權利要求44所述的系統，其中，所述機器可讀指示器還包括RFID標簽。
49.根據權利要求44所述的系統，其中，所述參考標記還包括數字參考碼。
50.一種在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的方法，包括讀取與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器，以獲得與由所述載體承載的組織活檢樣本相關聯的參考標記；訪問與從所述機器可讀指示器獲得的所述參考標記相關聯的數據庫中的信息；以及使用所述信息執行在所述組織病理學處理期間的至少一個過程。
51.根據權利要求50所述的方法，其中，組織處理設備包括讀取器，且使用所述讀取器以讀取所述機器可讀指示器，所述方法還包括使用所述組織處理設備執行所述過程。
52.根據權利要求51所述的方法，其中，從包括下列項的組中選擇所述組織處理設備 組織收取設備、組織處理器、組織包埋設備、組織切片設備、組織載片制備設備以及診斷載片讀取設備。
53.一種在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的方法，包括讀取與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器，以獲得與由所述組織載體承載的所述組織活檢樣本相關聯的信息；以及使用所述信息執行在所述組織病理學處理期間的至少一個過程。
54.根據權利要求53所述的方法，其中，組織處理設備包括讀取器，且使用所述讀取器以讀取所述機器可讀指示器，所述方法還包括使用所述組織處理設備執行所述過程。
55.根據權利要求討所述的方法，其中，從包括下列項的組中選擇所述組織處理設備 組織收取設備、組織處理器、組織包埋設備、組織切片設備、組織載片制備設備以及診斷載片讀取設備。
56.根據權利要求53所述的方法，其中，執行所述過程的步驟還包括下列步驟中的至少一個a)使用所述信息以選擇用于記錄與所述組織活檢樣本相關聯的信息的組織收取過程的參數；b)使用所述信息以選擇用于制備所述組織活檢樣本以用于包埋的組織固定過程的參數；c)使用所述信息以選擇用于制備所述組織活檢樣本以用于切片和顯微鏡載片制備的組織包埋過程的參數；和/或d)使用所述信息以選擇用于制備所述組織樣本的顯微鏡載片的切片過程的參數。
57.一種在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的方法，包括讀取與組織載體物理相關聯的機器可讀指示器，以獲得與由所述組織載體承載的所述組織活檢樣本相關聯的信息；至少部分地基于所述信息訪問電子組織樣本記錄；以及使用所訪問的信息控制在所述組織病理學處理期間的至少一個過程，所述過程選自于包括下列項的組組織固定、組織包埋、切片、顯微鏡載片制備、顯微鏡載片染色和病理學報告制備。
58.根據權利要求57所述的方法還包括利用在所述組織病理學處理的隨后過程中使用的信息更新在所述電子組織樣本記錄中的信息。
59.根據權利要求57所述的方法，其中，控制至少一個過程還包括基于與不同組織載體和/或不同組織活檢樣本相關聯的類似或相似參數的比較而做出關于包含批內和排出批外的決定。
60.根據權利要求57所述的方法，其中，包含在所述機器可讀指示器上的信息包括與所述組織活檢樣本或所述組織載體中至少一個相關聯的數字參考碼，而所述電子組織樣本記錄至少部分地存儲在遠離所述機器可讀指示器的數據庫中。
61.根據權利要求60所述的方法，其中，所述電子組織樣本記錄至少部分地包含在存儲于在所述組織病理學處理中使用的設備的控制中的數據庫中。
62.根據權利要求57所述的方法，其中，所述電子組織樣本記錄至少部分地存儲在所述機器可讀指示器上。
63.根據權利要求57所述的方法，其中，所述機器可讀指示器僅包含數字參考碼，而所述電子組織樣本記錄的其他信息存儲在遠離所述機器可讀指示器的數據庫中。
全文摘要
本發明涉及一種用于在組織病理學處理期間處理組織活檢樣本的系統，包括構建成在組織病理學處理的至少一個步驟期間承載組織活檢樣本(54)的組織載體(40)，存儲與組織活檢樣本相關聯和與組織處理過程相關聯的信息的數據庫，與組織載體(40)物理相關聯的機器可讀指示器(50)，該機器可讀指示器(50)包括標識組織活檢樣本(54)的機器可讀參考標記；以及操作用于讀取參考標記的電子控制(48)，其使用參考標記以訪問數據庫中的信息，并且根據所訪問的信息而實施組織處理過程的至少一部分。
文檔編號G06F3/00GK102334085SQ200980157669
公開日2012年1月25日 申請日期2009年12月28日 優先權日2008年12月30日
發明者W·P·威廉森四世 申請人:比歐帕斯自動化公司