專利名稱：：提供藥學信息的在線系統、方法和接口的制作方法
技術領域：
：本發明涉及藥學(pharmaceutical)產品開發，具體地說，涉及方便藥學研究者工作的信息檢索系統、方法和軟件。
背景技術：
：在過去的半個世紀，醫藥工業開發了多種藥品，對成千上萬人的生活質量和健康產生了巨大的影響。該行業的研究人員相互分享見解和資料，經常使用公共和/或專用信息檢索服務，經因特網訪問研究論文、專利和其它重要信息。本發明者認識到與常規在線藥學研究服務有關的一個問題涉及這些服務提供的信息的可訪問性和管理。具體而言，許多服務為定義查詢、查看搜索結果和提供有關功能提供其獨特的用戶接口(interface)。口、查詢語言等等，而且要保持單獨的帳戶、密碼等等。4因此，例如，對搜索專利和科學論文與財務新聞感興趣的用戶通常要使用三個單獨的搜索服務，在三個單獨的接口定義和提交三個單獨的查詢，在三個單獨的結果列表中查看文檔。另外，任何相關結果擴展到三個服務，使用戶要將結果手動收集和組織成集中的方便形式。此外，一個或多個服務可提供用于獲得新的或更新信息的一些自動或半自動進程。但是，更新進程相互是完全獨立和不同的，這使方便和智能地聚合數據的問題變得更復雜。相應地，本發明者認識到需要提供跨不同信息資源執行藥學研究的更佳方式。
發明內容為解決此需要和/或其它需要，除其它之外，本發明者設計了信息檢索系統、方法和軟件，允許用戶定義和選擇性顯示包括多個同時顯示portlet的兩個或更多個藥學研究網頁，這些portlet包含了來自諸如專利、科學和財務數據庫等單獨數據庫的信息。另外，系統允許用戶單獨配置每個portlet以提供更新的信息，并基于治療標準同時定義用于兩個或更多個portlet的輸入或呈現過濾器。示范實施例包括用于以portlet的形式提供多個web服務的在線網站或門戶。每個web服務提供一種不同內容類型，可供醫藥界特定類型知識工作者在每天的工作流中使用。每個portlet向用戶推送當前的、新的或一般性知識(以自定義或標準化格式)，并隨后提供針對各種類型用途的多個研究應用。一種類型的研究功能稱為導引搜索。這是簡單搜索格式的預設搜索，允許一般研究員只通過幾次擊鍵便執行格式正確的查詢。另一個實施例通過各種圖形或圖表搜索工具提供化學式的可視化。一些實施例包括了解特定用戶研究類型和/或從導引搜索概念自動擴展搜索查詢的迭代式或語義服務；擴展內容吸引度、自動建議與當前和過去查詢有關的新內容，通過支持或沖突研究補充過去的搜索結果，以及突5出顯示或標記沖突或補充研究范圍；根據功能實現推送概念；詮釋空間內部組織/實驗室電子筆記本；為藥品行業的各種類型用戶建立安全、匿名或社會性公共合作空間。圖1是對應于本發明一個或多個實施例的在線藥學研究系統100的方框圖。圖2-11是對應于本發明一個或多個實施例，在系統內采用的網頁和/或portlet形式的各種圖形用戶接口復制本。圖12另_對應于本發明一個或多個實施例的操作系統100示范方法流程圖。具體實施例方式包含上述圖形及隨附權利要求書的本文檔描述發明的一個或多個特定實施例。這些實施例不是限制而只是示范和示教本發明，以充分的細節示出和描述以便本領域的技術人員實現或實踐本發明。因此，在適當之處，為避免混淆本發明，描述將忽略本領域技術人員熟知的某些信息。示范信息檢索系統圖1示出示范在線信息檢索系統100，該系統可適用于包含本文所述的功能和/或性能。系統100包括一個或多個數據庫110、一個或多個服務器120和一個或多個訪問裝置130。數據庫110包括一組一個或多個專利數據庫111、一組一個或多個科學文獻數據庫112、一組財務數據庫113、一組化學數據庫114、一組遺傳或生物數據庫115及一組新聞數據庫116和一組其它數據庫117。數據庫110也可包括本文暗示或明確參考的其它類型數據庫和/或數據。數據庫110采取一個或多個電子、磁性或光數據存儲裝置的示范形式，關聯。每個索引包括與對應文檔地址、標識符和其它常規信息相關聯的術語和短語。數據庫內的數據以常規方式索引及按治療類別索引，如癌癥、CV/血液、皮膚病、內分泌/代謝、GI/營養、免疫/炎癥、感染、肌肉骨骼/生長、神經病學/精神醫學、生殖/GU、呼吸、感覺。數據庫110經無線或有線通信網絡耦合或能夠耦合到服務器120，如本地網、寬域網、專用網或虛擬專用網。服務器120,—般代表一個或多個服務器，用于通過相關聯的小應程(Applet)、ActiveX控制、遠程調用對象或其它有關軟件和數據結構，以網頁形式或其它標記語言形式向各種"厚度"的服務客戶提供數據。更具體地說，服務器120包括處理器模塊121、存儲器模塊122、用戶數據庫123、主搜索模塊124、輔助搜索模塊125及用戶接口模塊126。處理器模塊121包括一個或多個本地或分布式處理器、控制器或虛擬機。在示范實施例中，處理器模塊121采取任何方便或所需的形式。存儲器才莫塊122采取一個或多個電子、磁性或光數據存儲裝置的示范形式，存儲用戶數據庫123、搜索才莫塊124、配置才莫塊125及頁面和portlet管理才莫塊126。用戶數據庫123包括用戶有關數據，用于控制、執行和管理賬單到期付費或基于訂閱的數據庫110的訪問。在示范實施例中，用戶數據庫123包括一個或多個首選數據結構，數據結構1231是其代表。數據結構1221包括客戶或用戶標識符部分1231A，在邏輯上與一個或多個頁面和portlet配置首選項(preference)相關聯，如首選項1231B、1231C和1231D。首選項1231B包括用戶主頁名稱和對應的配置或定義。例如，在示范實施例中，用戶可定義一個、兩個或更多個特定的主頁，每頁包括一組可用內容特定portlet的用戶portlet選擇。首選項1231C包括用于一組兩個或更多個內容特定portlet中每個portlet的portlet配置數據。下面更詳細定義的示范portlet配置數據定義了portlet有關參數，如更新頻率。首選項1231D包括其它配置數據，例如，影響或控制portlet放置的數據。搜索模塊124包括機器可讀和/或可執行指令集，以便一個或多個搜索引擎和有關用戶接口組件在必要或需要時接收和處理針對一個或多個數據庫110的查詢，提供主頁和portlet指定內容。在示范實施例中，與搜索模塊124相關聯的一個或多個搜索引擎提供布爾、術語頻率-逆文本頻率(tf-idf)、自然語言搜索性能。配置模塊125包括機器可讀和/或可執行指令集，以便一個或多個圖形用戶接口和其它支持軟件允許用戶配置和重新配置單獨的主頁和/或其構成portlet。頁面和portlet才莫塊126包括用于完全或部分定義諸如一個或多個主頁等基于web用戶接口的機器可讀和/或可執行指令集。在示范實施例中，每個主頁包括兩個或更多個portlet,并且每個portlet通過無線或有線通信網絡向諸如訪問裝置130等訪問裝置提供不同的內容類型和/或搜索接口。訪問裝置130—般代表一個或多個訪問裝置。在示范實施例中，訪問裝置130采取的形式為個人計算機、工作站、個人數字助理、移動電話或能夠為有效用戶接口提供服務器或數據庫的任何其它裝置。具體而言，訪問裝置130包括處理器才莫塊131(—個或多個處理器(或處理電路))131、存儲器132、顯示器133、鍵盤134和圖形指針或選擇器135。處理器才莫塊131包括一個或多個處理器、處理電路或控制器。在示范實施例中，處理器^f莫塊131釆取任何方便或所需的形式。存儲器132耦合到處理器^t塊131。存儲器132存儲用于操作系統136、瀏覽器137和圖形用戶接口(GUI)138的代碼(機器可讀或可執行指令)。在示范實施例中，操作系統136釆取MicrosoftWindows操作系統某個版本的形式，并且瀏覽器137采取MicrosoftInternetExplorer某個版本的形式。操作系統136和瀏覽器137不但接收鍵盤134和選擇器135的輸入，而且支持在顯示器133上的GUI138顯現。在顯現時，GUI138將數據與一個或多個交互式控制特性(或用戶接口元素)關聯呈現。在示范實施例中，每個這些控制特性采取超鏈接或其它瀏覽器兼容命令輸入的形式，并且提供對具有導航或頁面控制區1381和portlet區1382與1383的藥學研究主頁的訪問和控制。(雖然圖l示出區1381、1382和1383同時顯示，但一些實施例在單獨的時間顯示它們。)導航區1381包括頁面選擇特性1381A、portlet控制或過濾特性1381B及頁面配置特性1381C。在示范實施例中，頁面選擇特性1381A允許用戶從預定義的主頁列表中選擇，每個主頁具有兩個或更多個portlet。一個或多個預定義的主頁是基于用戶數據庫123中用戶的配置數據的用戶定義主頁。Portlet控制特性1381B允許用戶同時控制，作為portlet區138的一個方面。例如，在一個實施例中，控制特性基于指定的治療類別過濾內容，如癌癥、CV/血液、皮膚病、內分泌/代謝、GI/營養、免疫/炎癥、感染、肌肉骨骼/生長、神經病學/精神醫學、生殖/GU、呼吸、感覺。過濾選擇特性可使用下拉菜單或單選按鈕或復選框組實現。在選擇治療類別時，彈出框會顯示，指示被過濾的portlet。在一些實施例中，彈出框允許用戶選擇過濾或不過濾哪些合格的portlet。點擊"確定"后，彈出框會關閉，并且主頁會刷新，根據該類別過濾所有適當的portlet。在示范實施例中，最后的治療類別保持選定，因此，如果用戶現在選擇另一專業頁面，則該頁面會根據該最后選定的類別過濾。左邊距中選定類別的按鈕會突出顯示，以提示用戶過濾操作。在一些實施例中，過濾只用于當前主頁或專業頁面，使得選擇另一頁面將不會自動導致使用最后選定過濾器變量的過濾。視portlet內容而定，根據IDdb指示進行的過濾是直接或"隱式"進行。因此，對于包含藥物凈艮告的portlet,使用應用到凈艮告的IDdb指示術語(治療區)。對于包含新聞項(即，IDdb提示)的portlet，示范實施例為鏈接到新聞項的藥物或專利使用IDdb指示。另外，"期刊集(Focusedjournals)"已直接編索引。示范實施例提供了可按治療類別過濾的以下portlet:臨床試驗觀察(ClinicalTrialsWatch)、合作/M&A(Collaborations/M&A)、藥物階段變化(DrugPhaseChanges)、期刊集(FocussedJournals),許可機會(LicensingOpportunities)、新化合物查看器(NewComponudViewer)、新藥物(NewDrugs)。下表示出一纟且六個主頁或專業頁面和定義它們的portlet。專業頁面生物學化學臨床研許可和商CI大眾SPECIALTY(Biolo-(Chemist究業興趣PAGE(橫向)gy)畫ry)(Clinic(Licensing(GenerPORTLET(向-al&國al下)Research)Business)interes■t)新化合物查《《看器(NewCompoundViewer)藥物(Drugs)《《《《《Thomson選《《《《《定特性(ThomsonselectedFeatures)期刊集《(Focusedjournals)合成方法(Synthetic10<table>tableseeoriginaldocumentpage11</column></row><table>專利公才艮(Patentsgazette)《《突發新聞(breakingnews)承《《《《《圖3示出包括三個portlet的示范主頁300的一部分新化合物查看portlet、新順序查看器portlet和特性portlet。一些portlet具有多個部分或多個下拉選項，例如，新藥物portlet具有"新藥物"和"新更新藥物"部分。對于每個部分，適當時只提供術語"未找到結果"。下面的才莫型示出用于新化合物查看器的一個示例。此portlet具有兩個部分，并且下面的模型示出未找到任一部分的結果。圖4示出示范合成方法portlet,可用于提示用戶包含感興趣的反應數據的新期刊。期刊列表已預定義，并且這些期刊的所有"最新化學反應(CCR)"記錄已選定。源于任何選定文章的反應步驟圖像將在portlet中從左向右滾動。源于數字的鏈接將引導用戶到"結果摘要頁面"。源于滾動反應的鏈接將引導用戶到完整的報告。通過此portlet鏈接到CCR信息，提供了"化學索引(IndexChemicus)"內的化合物。因此，此portlet將允許用戶不但查看反應數據，而且查看反應中涉及的特定化合物。"化學索引"集成到包括在數據庫110內的T-Pharma化合物庫中。因此，通過"合成方法"portlet查看這些化合物，用戶隨后將能夠經"化學才艮告"(未示出)鏈接到特定化合物有關的其它內容。圖5示出示范"快速結構搜索"portlet,它允許用戶在用戶定義的一段時間內執行只得到化學報告的匹配搜索或子結構搜索。在一些實施例中，允許其它類型的結果。示范搜索是針對"藥學化合物注冊"執行。此portlet的內容不根據業務范圍或治療區而變化。在結構框上任意處雙擊將打開"化學繪圖軟件包"(例如，ISISDraw),或者將允許用戶導入預繪制結構。"活動"鏈接將引導用戶到"作用詞典"。該示范實施例使用的活動術語挑選器與劑型搜索頁中使用的相同。由于完成了IDDB到DDF到PP到DWPIB部分活動手工代碼到IC活動(activity)術語的索引術語映射，因此，單個活動術語允許搜索ThomsonPharma庫的所有組成部分。圖6示出包括兩個區的示范專利公報portlet:"公報頭條"和"新專利"。公報頭條是"最新專利公報"每周出版轉成用于E)db的提示時創建的完整標題列表。這是形成每段標題的階段；打印的"公^;，本身不提供這些標題。新專利是根據"公報"標準(A-E部分)分類的公報每周出版中的所有專利。還提供的是"公報"每周出版中的專利總數。每次CPG專利數據的新出版可用，并且頭條(標題)寫入以形成有關IDdb的提示時，portlet內容會默認刷新。專利^^艮portlet配置選項包括確定更新頻率和重命名門戶。圖7示出包括三個專利前景區的示范"專利前景"portlet700的復制本"引用最多的藥物作用(TopCitedDrugActions)"、熱門治療區(TopTherapyareas)和"熱門專利權所有人(T叩Patentees)，，。引用最多的藥物作用和熱門治療區是使用治療區或作用關鍵字索引樹的頂層創建。如果不止一個索引術語已應用到某個專利，則該專利在索引術語所屬的每個區被統計一次。熱門專利權所有人M于新專利的專利權受讓人。如果某個專利具有多個專利權受讓人，則該單個專利為每個專利權受讓人統計一次。此portlet的內容將不根據專業頁面上的治療區或業務范圍而變化。每次新的索引專利數據(PP/PFA)出版可用時，該portlet內容會默認刷新。圖8示出示范藥物Portlet800。Portlet800包括兩個部分。第一部分將提示用戶新藥物凈艮告。第二部分將提示用戶現有藥物才艮告的重大更新(即，結構添加或階段變化)。該portlet內容將根據用戶選擇的治療區變化。藥物基于使用IDdb作用術語的活動和使用IDdb指示術語的治療區，才艮才居"編輯"分類。源于此portlet內藥物名稱的所有鏈接將引導用戶到相關藥物才艮告。默認情況下，該portlet的第一部分示出按藥物名稱字母順序排序的前三個結果。默認情況下，該portlet的第二部分示出按藥物名稱字母順序排序的前五個結果。多個配置選項可用于portlet900(及其它portlet)。例如，用戶可選擇只收到特定結構、子結構新藥物或類似性的提示。備選，用戶可選擇不按結構限制此portlet的內容。此處所示結構搜索功能將反映在劑型搜索頁面上所示的功能。用戶可選擇將portlet內容限制為在特定治療區內的新藥物。如果用戶想在示范實施例中監視兩個治療區，則用戶可配置兩個單獨的portlet。用戶可選擇限制為不在廣泛藥物作用(broaddrugaction)區中的新藥物。如果用戶要這樣做，則他們可選擇單個高級活動區(作用索引樹的頂部術語)。如果用戶選擇了某個活動區，則用戶將可選擇該特定活動區的特定作用。用戶可選擇任意數量的這些作用，或者可選擇不限于特定作用。用戶可選擇將該portlet限于特定公司或特定組公司的新藥物。用戶可從提供的已提供公司列表中最多選擇10個公司。備選，用戶可選擇不按公司進行限制。用于所有portlet的另一個選項是設置電子郵件提示。圖9示出示范"新化合物查看器Portlet)900。此portlet提示用戶添加到T-Pharma化合物庫的新化合物。新化合物也將作為GIF圖像沿portlet底部滾動。此portlet將以周而復始的每周方式顯示7天數據。該portlet內容從源于化合物名稱的原數據庫源(例如，IDdb/DCR/DDF/"化學索引")鏈接和滾動結構得到，將引導用戶到化學報告。用戶在某個滾動結構上停止時，該結構將停止滾動。如果用戶選擇不將portlet內容限于特定治療區(參見專業頁面的左欄)，則默認情況下，portlet將顯示前三個結果。顯示的優先級為IDdb>PP/PFA>DDF>DCR>"化學索引"。換而言之，如果有所有產品的新化合物，則按字母順序顯示來自IDdb的前三個化合物。如果頁沒有新IDdb化合物，則按字母順序顯示前三個DDF化合物。(注意，按字母順序顯示不同于屏幕抓圖。)根據如上相同標準區分優先順序的前50個結構將以連續環的方式滾動。如果結構數量少于50,則以連續環的方式滾動所有結構。如果沒有結構，則指示"無新化合物"。此portlet的內容可根據用戶選擇的治療區變化。如果用戶選擇了將portlet內容限于特定治療區，則指示索引用于為內容排序。單擊結構(GIF)也將引導用戶到"化學報告"(未示出)。用戶在某個結構上停止時，該結構將停止滾動。結構從右到左滾動。"全部顯示"鏈接引導用戶到新化合物結果的完整列表，即，包含"化學報告"的"列表視圖"屏幕(參見搜索結果規格)。默認情況下，列表根據上述用于portlet的相同標準排序。用戶在"個性化(Personalise)"區中時，用于portlet配置頁面的鏈^:顯示在portlet頂部。用戶可選擇只收到特定結構、子結構新化合物的提示。備選，用戶可選擇不按結構限制此portlet的內容。此處所示結構搜索功能將反映劑型搜索頁面上所示的功能。用戶可選擇將portlet內容限制為在特定治療區內的新化合物。用戶不可選擇超過一個治療區。注意，這是指示樹上的所有頂部術語列表，而不是在主頁上給出的治療區列表。如果用戶想監視兩個治療區，則用戶可配置兩個單獨的portlet。圖10示出示范"許可機會(LicensingOpportunities)"Portlet1000。此portlet提供最新的"許可機會提示(LicensingOpportunitiesAlert)"(通過主題"許可機會"選定)，并帶有經菜單一次一天查看過去"5天"的選項。如果沒有新提示，此門戶顯示消息"此日期無"許可機會，，項目"。如果一天公布不止一個提示，則所有，，提示"顯示在該portlet中。象其它portlet—樣，此門戶可通過"治療區"類別過濾。圖11示出示范期刊集portlet1100，它顯示了關注特定專業的以每兩周為基礎的新公布期刊。在示范實施例中，包括期刊集portlet的專業主頁是"生物"、"化學"、"臨床研究"、"大眾興趣"及任15何用戶定義的主頁。期刊集portlet可配置，以便用戶可選擇在新文章添加到數據庫時他們可收到提示的最多60個期刊。用戶能夠從所有可用期刊(大約3500個)選擇，并且也能夠選擇時間框以監視從2周到8周之間的新添加內容。用戶也可配置此portlet以提供2、4和8周的更新頻率。示范操作方法圖12示出才喿作系統100的一個或多個示范方法的流程圖1200。流程圖1200包括方框1210-1240，它們在示范實施例中以連續順序布置和描述。但是，其它實施例使用多個處理器或處理器類似裝置或組成為兩個或更多個虛擬機或子處理器的單個處理器，并行執行兩個或更多個方框。其它實施例也可變更進程順序，或者提供不同的功能分區以實現類似的結果。另外，其它實施例還將方框實現為兩個或更多個互連的硬件模塊，相關控制和數據信號在模塊之間和通過模塊傳送。因此，示范流程適用于軟件、硬件和固件實現。方框1210需要呈現藥學研究主頁。在示范實施例中，這要求用戶引導諸如裝置130等訪問裝置的瀏覽器到服務器120，然后登錄到系統。成功登錄后，基于web接口的一個或多個部分會從服務器120輸出、存儲在存儲器112中，并由訪問裝置130顯示，如包括兩個或更多個portlet的主頁139。方框1220需要配置一個或多個portlet。在示范實施例中，這要求在一個或多個portlet中更改更新頻率參數或目標公司列表或與數據相關聯的其它索引參數。方框1230需要保存具有剛配置portlet的主頁。在示范實施例中，這要求通過指示在方框1220中所作更改的配置數據，更新用戶信息以i"更^f吏用。方框1240需要過濾在主頁的兩個或更多個portlet中數據。在示范實施例中，這要求用戶選擇與兩個或更多個portlet中數據相關聯的16一個或多個治療參數，如類別，并修改顯示數據以排除不匹配治療參數的數據。在一些實施例中，選擇可用于排除匹配選定參數的數據。結論上述實施例只是為了示出和示教形成和使用本發明的一種或多種方式，而不是限制其廣度或范圍。涵蓋實踐或實現本發明示教所有方式的本發明實際范圍只由一個或多個發布的專利權利要求書及其等效物限定。權利要求1.一種在線藥學研究系統，包括一組兩個或更多個數據庫，包括專利數據庫、科學文獻數據庫及財務信息數據庫；以及服務器，所述服務器經計算機網絡可操作地耦合到所述數據庫及第一和第二客戶訪問裝置，其中所述第一和第二客戶訪問裝置分別與第一和第二用戶相關聯，并且所述服務器配置為向所述第一和第二客戶訪問裝置提供第一和第二主頁，其中每個所述主頁包括至少第一和第二portlet，所述第一portlet配置為接收并呈現來自所述專利、科學文獻和財務信息數據庫之一的信息，以及所述第二portlet配置為接收并呈現來自所述專利、科學文獻和財務數據庫中另一個的信息。2.如權利要求1所述的系統，其中所述服務器與包括用于所述相應第一和第二用戶的第一和第二首選項的用戶數據庫在操作上相關聯，并且所述第一和第二主頁分別根據所述第一和第二首選項配置。3.如權利要求1所述的系統，其中所述服務器配置成為每個所述第一和第二用戶提供多個主頁。4.如權利要求1所述的系統，還包括與所述服務器相關聯的用戶數據庫，其中所述用戶數據庫包括用于所述第一和第二用戶的第一和第二記錄，每個記錄在邏輯上將所述記錄對應的用戶與多個主頁標識符相關聯，并且每個主頁標識符在邏輯上與多個portlet標識符或portlet配置相關聯。5.—種方法，包括呈現具有多個藥學相關的portlet的主頁；從用戶接收識別治療類別的輸入；以及響應于識別的治療類別，〗務改兩個或更多個所述藥學相關portlet的內容。6.如權利要求5所述的方法，其中所述portlet之一包括專利數據，并且所述portlet中的另一個包括財務數據。全文摘要一種在線藥學研究系統包括用于提供用戶可配置主頁的服務器，每個主頁具有用于不同類型藥學數據的一組兩個或更多個portlet。主頁包括治療過濾技術，允許用戶例如基于治療類別過濾兩個或更多個portlet。文檔編號G06F17/30GK101490673SQ200780006624公開日2009年7月22日申請日期2007年1月3日優先權日2005年12月30日發明者I·塔申請人:湯姆森環球資源公司