前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法
【專利摘要】本發(fā)明的課題在于提供前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法,所述方法利用血液中的氨基酸濃度中與前列腺疾病的狀態(tài)相關(guān)的氨基酸濃度,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法,從采集自評(píng)價(jià)對(duì)象的血液測(cè)定與氨基酸的濃度值相關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù),基于測(cè)定出的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)。
【專利說明】前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法
[0001]本申請(qǐng)是申請(qǐng)?zhí)枮?00980124392.X、申請(qǐng)日為2009年6月22日、發(fā)明名稱為“前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法”的中國(guó)專利申請(qǐng)的分案申請(qǐng)。
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0002]本發(fā)明涉及利用血液(血漿)中的氨基酸濃度、對(duì)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病進(jìn)行評(píng)價(jià)的方法。
【背景技術(shù)】
[0003]前列腺癌在與1990年相比的2015年的各臟器分類的癌癥死亡數(shù)的預(yù)期值之比為3.90,在所有的癌癥當(dāng)中最高。因此,為了抑制將來的死亡率增加,必須在早期進(jìn)行高精度的診斷。
[0004]目前,前列腺癌的診斷依靠前列腺特異性抗原(PSA)、直腸檢查、經(jīng)直腸超聲診斷而進(jìn)行。而且,對(duì)于異常病癥,需要通過經(jīng)直腸超聲引導(dǎo)下進(jìn)行前列腺六分區(qū)六點(diǎn)活檢(前立腺6分割6 ^所生検)來確診。
[0005]但是,由于PSA不只在前列腺癌組織中產(chǎn)生,而且在前列腺肥大組織中也產(chǎn)生,所以難以區(qū)分早期前列腺癌和前列腺肥大,活檢陽性預(yù)中率(的中率)低至3?4%。此外,對(duì)于直腸檢查、經(jīng)直腸超聲診斷,靈敏度、活檢陽性預(yù)中率比PSA還低。此外,經(jīng)直腸超聲引導(dǎo)下前列腺六分區(qū)六點(diǎn)活檢能夠確診,但其是侵襲力高的檢查,對(duì)所有疑似前列腺癌的患者實(shí)施是不實(shí)際的。因此,從對(duì)患者的身體負(fù)擔(dān)和費(fèi)用效益等方面考慮,期待用侵襲力和精神痛苦少的方法選擇前列腺癌發(fā)病可能性高的受試者,對(duì)選擇的受試者實(shí)施診斷,將得到確診的患者作為治療的對(duì)象。
[0006]另一發(fā)面,已知血中氨基酸濃度隨癌癥發(fā)病而變化。例如,Cynober (參照非專利文獻(xiàn)I)報(bào)道了,例如谷氨酰胺主要作為氧化能量源、精氨酸作為氮氧化物或聚胺的前體、蛋氨酸通過激活癌細(xì)胞蛋氨酸攝取能力,分別在癌細(xì)胞內(nèi)的消耗量增加。此外,Vissers等(參照非專利文獻(xiàn)2)、Kubota (參照非專利文獻(xiàn)3)、Park(參照非專利文獻(xiàn)4)、Proenza等(參照非專利文獻(xiàn)5)、Cascino (參照非專利文獻(xiàn)6)報(bào)道了癌癥患者的血漿中氨基酸組成與健康人不同。
[0007]另外,專利文獻(xiàn)I和專利文獻(xiàn)2公開了將氨基酸濃度和生物體狀態(tài)關(guān)聯(lián)的方法。另夕卜,專利文獻(xiàn)3公開了用氨基酸濃度來評(píng)價(jià)肺癌狀態(tài)的方法。
[0008]現(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)
[0009]專利文獻(xiàn)
[0010]專利文獻(xiàn)1:國(guó)際公開第2004/052191號(hào)
[0011]專利文獻(xiàn)2:國(guó)際公開第2006/098192號(hào)
[0012]專利文獻(xiàn)3:國(guó)際公開第2008/016111號(hào)
[0013]非專利文獻(xiàn)
[0014]非專利文獻(xiàn) I:Cynober, L.ed., Metabolic and therapeutic aspects of aminoacids in clinical nutrit1n.2nd ed., CRC Press
[0015]非專利文獻(xiàn) 2:Vissers, Y.LJ.,等,Plasma arginine concentrat1n arereduced in cancer patients:evidence for arginine deficiency ? , The AmericanJournal of Clinical Nutrit1n, 2005,81,第 1142-1146 頁(yè)
[0016]非專利文獻(xiàn)3:Kubota, A.,Meguid, Μ.Μ.,and Hitch, D.C.,Amino acid profilescorrelate diagnostically with organ site in three kinds of malignant tumors.,Cancer,1991,69,第 2343-2348 頁(yè)
[0017]非專利文獻(xiàn)4:Park, K.G.,等,Arginine metabolism in benign andmagi inant disease of breast and colon:evidence for possible inhibit1n oftumor-1nfiltrating macropharges., Nutrit1n,1991 7,第 185-188 頁(yè)
[0018]非專利文獻(xiàn)5:Proenza, Α.Μ., J.0liver, A.Palou and P.Roca, Breast and lungcancer are associated with a decrease in blood cell amino acid content.,J NutrB1chem, 2003.14 (3),第 133-8 頁(yè)
[0019]非專利文獻(xiàn)6:Cascino, A., M.Muscaritoli, C.Cangiano, L.Conversano,A.Laviano,S.Ariemma,M.M.Meguid and F.Rossi FanelIi,Plasma amino acid imbalancein patients with lung and breast cancer.,Anticancer Res, 1995.15(2),第507-10頁(yè)
【發(fā)明內(nèi)容】
[0020]發(fā)明要解決的問題
[0021]然而,迄今為止,存在如下的診斷方法和診斷裝置的開發(fā)從時(shí)間和金錢的觀點(diǎn)考慮還未進(jìn)行、且未實(shí)用化的問題,所述診斷方法和診斷裝置是以復(fù)數(shù)種氨基酸為變數(shù),對(duì)前列腺癌、前列腺肥大以及其他前列腺疾病是否發(fā)病進(jìn)行診斷的診斷方法和診斷裝置。另外,即使用專利文獻(xiàn)3公開的肺癌判別用指標(biāo)式(index formula)組來判別前列腺癌、前列腺肥大以及其他前列腺疾病是否發(fā)病,也由于判別對(duì)象不同,存在不能得到足夠的判別能力的問題。
[0022]鑒于上述問題,本發(fā)明的目的在于提供前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法,所述方法利用血液中的氨基酸濃度中與前列腺疾病的狀態(tài)相關(guān)的氨基酸的濃度,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。
[0023]解決問題的手段
[0024]為了解決上述問題,本發(fā)明人等經(jīng)過認(rèn)真研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn),鑒別對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別等有用的氨基酸,同時(shí),包含鑒別出的氨基酸濃度作為變數(shù)的多變量判別式(指標(biāo)式、相關(guān)方程)與前列腺疾病的狀態(tài)顯著相關(guān),從而完成本發(fā)明。具體而言,探求對(duì)于前列腺疾病更特異的指標(biāo)式,結(jié)果可得到比專利文獻(xiàn)1、專利文獻(xiàn)2、專利文獻(xiàn)3等公開的指標(biāo)式更適于評(píng)價(jià)前列腺疾病狀態(tài)的指標(biāo)式,從而完成本發(fā)明。
[0025]即,為了解決上述問題,達(dá)到本發(fā)明的目的,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,包括:測(cè)定步驟,從采集自評(píng)價(jià)對(duì)象的血液測(cè)定與氨基酸的濃度值相關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù);以及濃度值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟,基于在所述測(cè)定步驟中測(cè)定的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的所述濃度值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)。
[0026]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述濃度值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟進(jìn)一步包括:濃度值基準(zhǔn)判別步驟,基于在所述測(cè)定步驟中測(cè)定的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr> Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是所述前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是所述前列腺癌或所述前列腺肥大。
[0027]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述濃度值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟進(jìn)一步包括:判別值算出步驟,基于在所述測(cè)定步驟中測(cè)定的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及以所述氨基酸的濃度作為變數(shù)的預(yù)先設(shè)定的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值;以及判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟,基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)所述前列腺疾病的狀態(tài)。所述多變量判別式含有Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)。
[0028]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟進(jìn)一步包括:判別值基準(zhǔn)判別步驟,基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是所述前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是所述前列腺癌或所述前列腺肥大。
[0029]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)所述分?jǐn)?shù)式之和、或者邏輯回歸(logistic regress1n)式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)(Support VectorMachine)制作的公式、用馬氏距離法(Mahalanobis,generalized distance method)制作的公式、用典型判別分析(canonical discriminant analysis)制作的公式、用決策樹制作的公式的任意一種。
[0030]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述判別值算出步驟基于在所述測(cè)定步驟中測(cè)定的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及含有Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值,所述判別值基準(zhǔn)判別步驟基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或所述非前列腺疾病。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式I的所述分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、Cit、ABA、Val作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式,
[0031]al (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0032]……(數(shù)學(xué)式I)
[0033](數(shù)學(xué)式I中,C1'屯、G1是任意實(shí)數(shù)。)
[0034]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述判別值算出步驟基于在所述測(cè)定步驟中測(cè)定的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn> Cys2中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及含有Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、0rn、Cys2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值,所述判別值基準(zhǔn)判別步驟基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺癌或所述非前列腺癌。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式2的所述分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的所述分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的所述分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、0rn作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp> Orn> Arg作為所述變數(shù)的所述線性判別式、以Tau、Glu、Ala、Cit、Met、Orn作為所述變數(shù)的所述線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、OrruArg作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr> Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0035]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0036]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0037]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0038]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0039]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0040]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0041](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0042]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述判別值算出步驟基于在所述測(cè)定步驟中測(cè)定的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp> Lys的所述濃度值以及含有Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp, Lys作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值,所述判別值基準(zhǔn)判別步驟基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺癌或所述前列腺肥大。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式5的所述分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Ser、Gln、Gly、Cit,Val,Trp作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0043]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0044]……(數(shù)學(xué)式5)
[0045](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0046]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)裝置,具備控制單元和存儲(chǔ)單元,是對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置,其特征在于,所述控制單元具備:判別值算出單元,基于與氨基酸的濃度值有關(guān)的預(yù)先取得的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及以所述氨基酸濃度為變數(shù)的存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)單元的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值;以及判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)單元,基于由所述判別值算出單元算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)所述前列腺疾病的狀態(tài)。所述多變量判別式包含Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp> Orn> Lys>Cys2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)。
[0047]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)單元進(jìn)一步具備:判別值基準(zhǔn)判別單元,基于由所述判別值算出單元算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是所述前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是所述前列腺癌或所述前列腺肥大。
[0048]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述多變量判別式是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)所述分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的式子、用馬氏距離法制作的式子、用典型判別分析制作的式子、用決策樹制作的式子的任意一種。
[0049]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述判別值算出單元基于所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及包含 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、HiS、Trp、LyS、CyS2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值,所述判別值基準(zhǔn)判別單元基于由所述判別值算出單元算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或所述非前列腺疾病。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式I的所述分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、CU、ΑΒΑ、Val作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0050]H1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0051]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0052](數(shù)學(xué)式I中,C1'屯、G1是任意實(shí)數(shù)。)
[0053]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述判別值算出單元基于所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp> Orn> Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及包含 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、HiS、Trp、0rn、CyS2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值,所述判別值基準(zhǔn)判別單元基于由所述判別值算出單元算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺癌或所述非前列腺癌。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式2的所述分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的所述分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的所述分?jǐn)?shù)式、以TaU、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、OrruArg作為所述變數(shù)的所述線性判別式、以TaU、GlU、Ala、Cit、Met、Orn作為所述變數(shù)的所述線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、Orn> Arg作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr> Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0054]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0055]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0056]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0057]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0058]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0059]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0060](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0061]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述判別值算出單元基于所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp> Lys 的所述濃度值以及包含 Thr> Ser> Gly、Cit、Val、His、Trp> Lys作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值,所述判別值基準(zhǔn)判別單元基于由所述判別值算出單元算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺癌或所述非前列腺肥大。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式5的所述分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr> Trp> Lys作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0062]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0063]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0064](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0065]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置中,所述控制單元還具備多變量判別式制作單元,基于存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)單元的前列腺疾病狀態(tài)信息,制作存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)單元的所述多變量判別式,所述前列腺疾病狀態(tài)信息包括所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)和與表示所述前列腺疾病的所述狀態(tài)的指標(biāo)有關(guān)的前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù),所述多變量判別式制作單元進(jìn)一步具備:候選多變量判別式制作單元,基于規(guī)定的公式制作方法,從所述前列腺疾病狀態(tài)信息,制作所述多變量判別式的候選即候選多變量判別式;候選多變量判別式驗(yàn)證單元,基于規(guī)定的驗(yàn)證方法,驗(yàn)證由所述候選多變量判別式制作單元制作的所述候選多變量判別式;變數(shù)選擇單元,基于規(guī)定的變數(shù)選擇方法,從由所述候選多變量判別式驗(yàn)證單元得到的驗(yàn)證結(jié)果,選擇所述候選多變量判別式的變數(shù),由此來選擇在制作所述候選多變量判別式時(shí)所用的所述前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合,根據(jù)反復(fù)執(zhí)行所述候選多變量判別式制作單元、所述候選多變量判別式驗(yàn)證單元以及所述變數(shù)選擇單元而積累的所述驗(yàn)證結(jié)果,從復(fù)數(shù)個(gè)所述候選多變量判別式中,選擇出作為所述多變量判別式采用的所述候選多變量判別式,由此制作所述多變量判別式。
[0066]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法是,用具備控制單元和存儲(chǔ)單元的信息處理裝置實(shí)行的、對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法,其特征在于,在所述控制單元中實(shí)行以下步驟:判別值算出步驟,基于與氨基酸的濃度值有關(guān)的預(yù)先取得的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2中的至少一種所述濃度值以及以所述氨基酸濃度為變量的存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)單元的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值;判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟,基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)所述前列腺疾病的狀態(tài),所述多變量判別式包含 Tau、Thr> Ser> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp> Orn> Lys、Cys2中的至少一種作為所述變數(shù)。
[0067]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟進(jìn)一步包括判別值基準(zhǔn)判別步驟,基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是所述前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是所述前列腺癌或所述前列腺肥大。
[0068]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)所述分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式的任意一種。
[0069]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述判別值算出步驟基于所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及包含 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp, Lys、Cys2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值;所述判別值基準(zhǔn)判別步驟基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺疾病或所述非前列腺疾病。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式I的所述分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、CU、ΑΒΑ、Val作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0070]H1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0071]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0072](數(shù)學(xué)式I中,BpbpC1Upe1是任意實(shí)數(shù)。)
[0073]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述判別值算出步驟基于所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp> Orn> Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及包含 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe, His、Trp, Orn, Cys2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值;所述判別值基準(zhǔn)判別步驟基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺癌或所述非前列腺癌。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式2的所述分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的所述分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的所述分?jǐn)?shù)式、以TaU、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、OrruArg作為所述變數(shù)的所述線性判別式、以TaU、GlU、Ala、Cit、Met、Orn作為所述變數(shù)的所述線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、Orn> Arg作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr> Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0074]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0075]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0076]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0077]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0078]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0079]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0080](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0081]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述判別值算出步驟基于所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp> Lys 的所述濃度值以及包含 Thr> Ser> Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys作為所述變數(shù)的所述多變量判別式,算出所述判別值;所述判別值基準(zhǔn)判別步驟基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是所述前列腺癌或所述前列腺肥大。此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,所述多變量判別式是數(shù)學(xué)式5的所述分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為所述變數(shù)的所述邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr> Trp、Lys作為所述變數(shù)的所述線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為所述變數(shù)的所述線性判別式。
[0082]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0083]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0084](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0085]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法的特征在于,在上述的前列腺疾病評(píng)價(jià)方法中,進(jìn)一步由所述控制單元實(shí)行多變量判別式制作步驟,所述多變量判別式制作步驟基于存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)單元的前列腺疾病狀態(tài)信息,制作存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)單元的所述多變量判別式,所述前列腺疾病狀態(tài)信息包括所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)和與表示所述前列腺疾病的所述狀態(tài)的指標(biāo)有關(guān)的前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù),所述多變量判別式制作步驟,進(jìn)一步包括:候選多變量判別式制作步驟,基于規(guī)定的公式制作方法,從所述前列腺疾病狀態(tài)信息,制作所述多變量判別式的候選即候選多變量判別式;候選多變量判別式驗(yàn)證步驟,基于規(guī)定的驗(yàn)證方法,驗(yàn)證在所述候選多變量判別式制作步驟中制作的所述候選多變量判別式;變數(shù)選擇步驟,基于規(guī)定的變數(shù)選擇方法,從由所述候選多變量判別式驗(yàn)證步驟得到的驗(yàn)證結(jié)果,選擇所述候選多變量判別式的變數(shù),由此來選擇在制作所述候選多變量判別式時(shí)所用的所述前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合?;诜磸?fù)實(shí)行所述候選多變量判別式制作步驟、所述候選多變量判別式驗(yàn)證步驟和所述變數(shù)選擇步驟而積累的所述驗(yàn)證結(jié)果,從復(fù)數(shù)個(gè)所述候選多變量判別式中,選擇出作為所述多變量判別式采用的所述候選多變量判別式,由此制作所述多變量判別式。
[0086]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)系統(tǒng)是經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)以可通信的方式將具備控制單元和存儲(chǔ)單元且對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置,以及提供與氨基酸的濃度值有關(guān)的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的信息通信終端裝置連接在一起而構(gòu)成的前列腺疾病評(píng)價(jià)系統(tǒng),其特征在于,所述信息通信終端裝置具備:氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送單元,將所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送至所述前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置;評(píng)價(jià)結(jié)果接收單元,接收由所述前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置發(fā)送的與所述前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的評(píng)價(jià)結(jié)果。所述前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的所述控制單元具備:氨基酸濃度數(shù)據(jù)接收單元,接收由所述信息通信終端裝置發(fā)送的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù);判別值算出單元,基于由所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)接收單元接收的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及以所述氨基酸的濃度為變數(shù)的在所述存儲(chǔ)單元存儲(chǔ)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值;判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)單元,基于由所述判別值算出單元算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)所述前列腺疾病的狀態(tài);評(píng)價(jià)結(jié)果發(fā)送單元,將由所述判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)單元得到的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述評(píng)價(jià)結(jié)果發(fā)送至所述信息通信終端裝置。所述多變量判別式包含 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、CU、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp、Orn> Lys、Cys2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)。
[0087]此外,本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)程序是在具備控制單元和存儲(chǔ)單元的信息處理裝置中實(shí)行的對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)的前列腺疾病評(píng)價(jià)程序,其特征在于,在上述控制單元中實(shí)行下述步驟:判別值算出步驟,基于與氨基酸的濃度值有關(guān)的預(yù)先取得的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的所述濃度值以及以所述氨基酸濃度為變數(shù)的在所述存儲(chǔ)單元存儲(chǔ)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值;判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟,基于在所述判別值算出步驟中算出的所述判別值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)所述前列腺疾病的狀態(tài)。所述多變量判別式包括 Tau> Thr> Ser> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp、Orn> Lys、Cys2中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)。
[0088]此外,本發(fā)明涉及的記錄介質(zhì)是計(jì)算機(jī)可讀取的記錄介質(zhì),其特征在于,記錄有上述前列腺疾病評(píng)價(jià)程序。
[0089]發(fā)明效果
[0090]根據(jù)本發(fā)明,從采集自評(píng)價(jià)對(duì)象的血液測(cè)定與氨基酸的濃度值相關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù),基于測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、0rn、Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中至少一種的前列腺疾病的狀態(tài),因此發(fā)揮如下效果:利用血液中的氨基酸濃度中與前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的氨基酸濃度,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。具體而言,發(fā)揮如下效果:能夠以一種檢體且短時(shí)間內(nèi)即可縮小篩選范圍至罹患前列腺疾病的可能性高的受試者,結(jié)果可以減輕給受試者帶來的時(shí)間、身體和金錢上的負(fù)擔(dān)。此外,具體而言,發(fā)揮如下效果:利用多種氨基酸的濃度,可以高精度地評(píng)價(jià)某檢體是否有前列腺疾病發(fā)病,結(jié)果可以實(shí)現(xiàn)檢查的高效化和高精度化。
[0091]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是前列腺癌或前列腺肥大,因此發(fā)揮如下效果:利用血液中的氨基酸濃度中對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別有用的氨基酸濃度,可以高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0092]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及以氨基酸濃度為變數(shù)預(yù)先設(shè)定的包含Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài),因此發(fā)揮如下效果:利用與前列腺疾病的狀態(tài)顯著相關(guān)的由多變量判別式得到的判別值,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。具體而言,發(fā)揮如下效果:能夠以一種檢體且短時(shí)間內(nèi)即可縮小篩選范圍至罹患前列腺疾病的可能性高的受試者,結(jié)果可以減輕給受試者帶來的時(shí)間、身體和金錢上的負(fù)擔(dān)。此外,具體而言,發(fā)揮如下效果:利用復(fù)數(shù)種氨基酸的濃度和以該氨基酸的濃度為變數(shù)的判別式,可以高精度地評(píng)價(jià)某檢體是否有前列腺疾病發(fā)病,結(jié)果可以實(shí)現(xiàn)檢查的高效化和高精度化。
[0093]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是前列腺癌或前列腺肥大,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別有用的多變量判別式得到的判別值,可以高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0094]此外,根據(jù)本發(fā)明,多變量判別式是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式中的任意一種,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0095]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp>Lys、Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,根據(jù)本發(fā)明,多變量判別式是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、CU、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0096]H1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0097]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0098](數(shù)學(xué)式I中,C1'屯、G1是任意實(shí)數(shù)。)
[0099]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe> His、Trp>Orn、Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺癌或非前列腺癌,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,根據(jù)本發(fā)明,多變量判別式是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、0rn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp、Orn, Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn, Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以 Tau、Thr、Ser、Ala、0rn、Arg 作為變數(shù)的線性判別式或以 Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp 作為變數(shù)的線性判別式,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0100]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +c2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0101]……(數(shù)學(xué)式2)
[0102]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0103]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0104]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0105]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0106](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0107]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp、Lys 的濃度值以及包含 Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys 作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺癌或前列腺肥大,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,根據(jù)本發(fā)明,多變量判別式是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr, Trp、Lys作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式,因此發(fā)揮如下效果:利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0108]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0109]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0110](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0111]此外,根據(jù)本發(fā)明,基于包含氨基酸濃度數(shù)據(jù)和與表示前列腺疾病的狀態(tài)的指標(biāo)有關(guān)的前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)的在存儲(chǔ)單元存儲(chǔ)的前列腺疾病狀態(tài)信息,制作在存儲(chǔ)單元存儲(chǔ)的多變量判別式。具體而言,(I)基于規(guī)定的公式制作方法,從前列腺疾病狀態(tài)信息制作候選多變量判別式,(2)基于規(guī)定的驗(yàn)證方法來驗(yàn)證制作的候選多變量判別式,(3)基于規(guī)定的變數(shù)選擇方法,從所述驗(yàn)證結(jié)果選擇候選多變量判別式的變數(shù),由此來選擇在制作候選多變量判別式時(shí)所用的前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合,(4)基于反復(fù)實(shí)行(I)、(2)和(3)而積累的驗(yàn)證結(jié)果,從復(fù)數(shù)個(gè)候選多變量判別式中選擇出作為多變量判別式采用的候選多變量判別式,藉此制作多變量判別式。由此發(fā)揮可制作最適于前列腺疾病的狀態(tài)評(píng)價(jià)的多變量判別式的效果。
[0112]此外,根據(jù)本發(fā)明,發(fā)揮如下效果:通過實(shí)行使計(jì)算機(jī)讀取該記錄介質(zhì)中記錄的前列腺疾病評(píng)價(jià)程序,使計(jì)算機(jī)實(shí)行前列腺疾病評(píng)價(jià)程序,因此可得到與前列腺疾病評(píng)價(jià)程序相同的效果。
[0113]此外,本發(fā)明在評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)時(shí),除了氨基酸的濃度之外,可以進(jìn)一步使用其他代謝物的濃度和基因表達(dá)量、蛋白質(zhì)表達(dá)量、受試者的年齡、性別、是否吸煙、心電圖波形的數(shù)值化結(jié)果等。此外,本發(fā)明在評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)時(shí),作為多變量判別式中的變數(shù),除了氨基酸的濃度之外,可以進(jìn)一步使用其他代謝物的濃度和基因的表達(dá)量、蛋白質(zhì)的表達(dá)量、受試者的年齡、性別、是否吸煙、心電圖波形的數(shù)值化結(jié)果等。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0114]圖1是表示本發(fā)明的基本原理的原理構(gòu)成圖。
[0115]圖2是表示第一實(shí)施方式涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的一例的流程圖。
[0116]圖3是表示本發(fā)明的基本原理的原理構(gòu)成圖。
[0117]圖4是表示本系統(tǒng)的整體構(gòu)成的一例的圖。
[0118]圖5是表示本系統(tǒng)的整體構(gòu)成的另一例的圖。
[0119]圖6是表示本系統(tǒng)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的構(gòu)成的一例的框圖。
[0120]圖7是表示保存在利用者信息文件106a中的信息的一例的圖。
[0121]圖8是表示保存在氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件106b中的信息的一例的圖。
[0122]圖9是表示保存在前列腺疾病狀態(tài)信息文件106c中的信息的一例的圖。
[0123]圖10是表示保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d中的信息的一例的圖。
[0124]圖11是表示保存在候選多變量判別式文件106el中的信息的一例的圖。
[0125]圖12是表示保存在驗(yàn)證結(jié)果文件106e2中的信息的一例的圖。
[0126]圖13是表示保存在選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件106e3中的信息的一例的圖。
[0127]圖14是表示保存在多變量判別式文件106e4中的信息的一例的圖。
[0128]圖15是表示保存在判別值文件106f中的信息的一例的圖。
[0129]圖16是表示保存在評(píng)價(jià)結(jié)果文件106g中的信息的一例的圖。
[0130]圖17是表示多變量判別式制作部102h的構(gòu)成的框圖。
[0131]圖18是表示判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j的構(gòu)成的框圖。
[0132]圖19是表示本系統(tǒng)的客戶端裝置200的構(gòu)成的一例的框圖。
[0133]圖20是表示本系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400的構(gòu)成的一例的框圖。
[0134]圖21是表示由本系統(tǒng)進(jìn)行的前列腺疾病評(píng)價(jià)服務(wù)處理的一例的流程圖。
[0135]圖22是表示通過本系統(tǒng)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100進(jìn)行的多變量判別式制作處理的一例的流程圖。
[0136]圖23是與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖(boxplot)。
[0137]圖24是表示與指標(biāo)式I具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0138]圖25是表示與指標(biāo)式I具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0139]圖26是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0140]圖27是表示與指標(biāo)式2具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0141]圖28是表示與指標(biāo)式2具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0142]圖29是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中各氨基酸變量的ROC曲線下面積的圖。
[0143]圖30是表示與指標(biāo)式3具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0144]圖31是表示與指標(biāo)式3具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0145]圖32是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0146]圖33是與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖。
[0147]圖34是表示與指標(biāo)式4具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0148]圖35是表示與指標(biāo)式4具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0149]圖36是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0150]圖37是表示與指標(biāo)式5具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽的圖。
[0151]圖38是表示與指標(biāo)式5具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽的圖。
[0152]圖39是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0153]圖40是表示與指標(biāo)式6具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0154]圖41是表示與指標(biāo)式6具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0155]圖42是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0156]圖43是與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖。
[0157]圖44是表示與指標(biāo)式7具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0158]圖45是表示與指標(biāo)式7具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0159]圖46是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0160]圖47是表示與指標(biāo)式8具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0161]圖48是表示與指標(biāo)式8具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0162]圖49是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0163]圖50是表示與指標(biāo)式9具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0164]圖51是表示與指標(biāo)式9具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0165]圖52是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0166]圖53是與前列腺癌組和前列腺肥大組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖。
[0167]圖54是表示與指標(biāo)式10具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0168]圖55是表示與指標(biāo)式10具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0169]圖56是表示前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0170]圖57是表示與指標(biāo)式11具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0171]圖58是表示與指標(biāo)式11具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0172]圖59是表示前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0173]圖60是表示與指標(biāo)式12具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0174]圖61是表示與指標(biāo)式12具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0175]圖62是表示前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0176]圖63是與前列腺疾病組和非前列腺疾病組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖。
[0177]圖64是表示與指標(biāo)式13具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0178]圖65是表示與指標(biāo)式13具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0179]圖66是表示前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0180]圖67是表示與指標(biāo)式14具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0181]圖68是表示與指標(biāo)式14具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0182]圖69是表示前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0183]圖70是表示與指標(biāo)式15具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0184]圖71是表示與指標(biāo)式15具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0185]圖72是表示前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別中的各氨基酸變數(shù)的ROC曲線下面積的圖。
[0186]圖73是表示與各指標(biāo)式相關(guān)的各兩組判別中的ROC曲線下面積的圖。
[0187]圖74是與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變量的分布相關(guān)的箱線圖。
[0188]圖75是表示與指標(biāo)式16具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0189]圖76是表示與指標(biāo)式16具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0190]圖77是表示與指標(biāo)式16具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0191]圖78是表示與指標(biāo)式16具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0192]圖79是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的指標(biāo)式16的ROC曲線的圖。
[0193]圖80是表示與指標(biāo)式17具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0194]圖81是表示與指標(biāo)式17具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0195]圖82是表示與指標(biāo)式17具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0196]圖83是表示與指標(biāo)式17具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0197]圖84是表示前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別中的指標(biāo)式17的ROC曲線的圖。
[0198]圖85是表示基于ROC曲線的AUC提取出的氨基酸的一覽圖。
[0199]圖86是與前列腺癌組和前列腺肥大組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖。
[0200]圖87是表示與指標(biāo)式18具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0201]圖88是表示與指標(biāo)式18具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0202]圖89是表示與指標(biāo)式18具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0203]圖90是表示與指標(biāo)式18具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0204]圖91是表示前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別中的指標(biāo)式18的ROC曲線的圖。
[0205]圖92是表示與指標(biāo)式19具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0206]圖93是表示與指標(biāo)式19具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0207]圖94是表示與指標(biāo)式19具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0208]圖95是表示與指標(biāo)式19具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0209]圖96是表示前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別中指標(biāo)式19的ROC曲線的圖。
[0210]圖97是表示基于ROC曲線的AUC提取出的氨基酸的一覽圖。
[0211]圖98是與前列腺癌組和前列腺肥大組的氨基酸變數(shù)的分布相關(guān)的箱線圖。
[0212]圖99是表示與指標(biāo)式20具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0213]圖100是表示與指標(biāo)式20具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0214]圖101是表示與指標(biāo)式20具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0215]圖102是表示與指標(biāo)式20具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0216]圖103是表示前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別中的指標(biāo)式20的ROC曲線的圖。
[0217]圖104是表示與指標(biāo)式21具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0218]圖105是表示與指標(biāo)式21具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0219]圖106是表示與指標(biāo)式21具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0220]圖107是表示與指標(biāo)式21具有同等的判別性能的指標(biāo)式的一覽圖。
[0221]圖108是表示前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別中的指標(biāo)式21的ROC曲線的圖。
[0222]圖109是表示基于ROC曲線的AUC提取出的氨基酸的一覽圖。符號(hào)說明
[0223]100前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置
[0224]102控制部
[0225]102a要求解釋部
[0226]102b 閱覽處理部
[0227]102c認(rèn)證處理部
[0228]102d電子郵件生成部
[0229]102e網(wǎng)頁(yè)生成部
[0230]102f 接收部
[0231]102g前列腺疾病狀態(tài)信息指定部
[0232]102h多變量判別式制作部
[0233]102hl候選多變量判別式制作部
[0234]102h2候選多變量判別式驗(yàn)證部
[0235]102h3變數(shù)選擇部
[0236]102?判別值算出部
[0237]102j判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部
[0238]102 j I判別值基準(zhǔn)判別部
[0239]102k結(jié)果輸出部
[0240]102m 發(fā)送部
[0241]104通信接口部
[0242]106存儲(chǔ)部
[0243]106a利用者信息文件
[0244]106b氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件
[0245]106c前列腺疾病狀態(tài)信息文件
[0246]106d指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件
[0247]106e多變量判別式相關(guān)信息數(shù)據(jù)庫(kù)
[0248]106el候選多變量判別式文件
[0249]106e2驗(yàn)證結(jié)果文件
[0250]106e3選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件
[0251]106e4多變量判別式文件
[0252]106f判別值文件
[0253]106g評(píng)價(jià)結(jié)果文件
[0254]108輸入輸出接口部
[0255]112輸入裝置
[0256]114輸出裝置
[0257]200客戶端裝置(信息通信終端裝置)
[0258]300網(wǎng)絡(luò)
[0259]400數(shù)據(jù)庫(kù)裝置
【具體實(shí)施方式】
[0260]下面,基于附圖詳細(xì)地說明本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的實(shí)施方式(第一實(shí)施方式)以及本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置、前列腺疾病評(píng)價(jià)方法、前列腺疾病評(píng)價(jià)系統(tǒng)、前列腺疾病評(píng)價(jià)程序和記錄介質(zhì)的實(shí)施方式(第二實(shí)施方式)。此外,本發(fā)明不受本實(shí)施方式的限制。
[0261]第一實(shí)施方式
[0262][1-1.本發(fā)明的概要]
[0263]這里,參照?qǐng)D1對(duì)本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法的概要進(jìn)行說明。圖1是表示本發(fā)明的基本原理的原理構(gòu)成圖。
[0264]首先,本發(fā)明中,從采集自評(píng)價(jià)對(duì)象(例如動(dòng)物或人等個(gè)體)的血液,測(cè)定與氨基酸的濃度值有關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)(步驟S-11)。這里,血中氨基酸濃度的分析如下進(jìn)行。通過將采集的血液樣品采取至經(jīng)肝素處理的試管中,再將采取的血液樣品離心,由此從血液分離血漿。在-70°C下將所有血漿樣品冷凍保存至測(cè)定氨基酸濃度時(shí)。測(cè)定氨基酸濃度時(shí),通過加入磺基水楊酸并將調(diào)節(jié)至濃度為3%來進(jìn)行脫蛋白處理,測(cè)定中使用氨基酸分析儀,所述氨基酸分析儀以采用了柱后茚三酮反應(yīng)的高效液相色譜(HPLC)為原理。此外,氨基酸濃度的單位,可以是例如摩爾濃度或重量濃度、通過將這些濃度加減乘除任意常數(shù)而得到的濃度。
[0265]接著,本發(fā)明中,基于在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thrλ Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、VaK Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys, Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)(步驟S-12)。
[0266]如上所述,根據(jù)本發(fā)明,從采集自評(píng)價(jià)對(duì)象的血液測(cè)定與氨基酸的濃度值相關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù),基于測(cè)定出的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr, Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn> Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)。由此,利用血液中的氨基酸濃度中與前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的氨基酸濃度,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。具體而言,能夠用一種檢體且短時(shí)間內(nèi)即可縮小篩選范圍至罹患前列腺疾病的可能性高的受試者,其結(jié)果可以減輕給受試者帶來的時(shí)間、身體和金錢上的負(fù)擔(dān)。此外,具體而言,利用復(fù)數(shù)種氨基酸的濃度,可以高精度地評(píng)價(jià)某檢體是否有前列腺疾病發(fā)病,其結(jié)果可以實(shí)現(xiàn)檢查的高效化和高精度化。
[0267]這里,在實(shí)行步驟S-12之前,可以從在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)除去缺失值和異常值等數(shù)據(jù)。由此,可以更高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。
[0268]此外,步驟S-12中,基于在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp>Orn、Lys, Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是前列腺癌或非前列腺癌、或者、是否是前列腺癌或前列腺肥大。由此,利用血液中的氨基酸濃度中,對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別有用的氨基酸濃度,可以高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0269]此外,在步驟S-12中,基于在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp>Orn、Lys, Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值以及以氨基酸濃度為變數(shù)的預(yù)先設(shè)定的多變量判別式即包含 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、HiS、Trp、0rn、LyS、CyS2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。由此,利用由與前列腺疾病的狀態(tài)具有顯著相關(guān)性的多變量判別式得到的判別值,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。具體而言,能夠用一種檢體且短時(shí)間內(nèi)即可縮小篩選范圍至罹患前列腺疾病的可能性高的受試者,其結(jié)果可以減輕給受試者帶來的時(shí)間、身體和金錢上的負(fù)擔(dān)。此外,具體而言,利用復(fù)數(shù)種氨基酸的濃度和以該氨基酸的濃度為變數(shù)的判別式,可以高精度地評(píng)價(jià)某檢體是否有前列腺疾病發(fā)病,其結(jié)果可以實(shí)現(xiàn)檢查的高效化和高精度化。
[0270]此外,步驟S-12中,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是前列腺癌或前列腺肥大。具體而言,通過比較判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?,cutoff value),對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是前列腺癌或前列腺肥大。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和與巨前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別有用的多變量判別式得到的判別值,可以高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0271]此外,多變量判別式可以是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)所述分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式中的任意一種。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0272]此外,在步驟S-12中,基于在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys> Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、HiS、Trp、LyS、CyS2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,這時(shí)使用的多變量判別式,可以是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、CU、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0273]B1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0274]……(數(shù)學(xué)式I)
[0275](數(shù)學(xué)式I中,BpbpCpdpe1是任意實(shí)數(shù)。)
[0276]此外,在步驟S-12中,基于在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、Hi s、Trp、Orn、Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺癌或非前列腺癌。由此,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,這時(shí)使用的多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn 作為變數(shù)的邏輯回歸式、以 Tau、Thr> Ala、Trp、Orn、Arg 作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Thr> Ser、Ala、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0277]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0278]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0279]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0280]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0281 ] a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/He) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0282]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0283](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0284]此外,在步驟S-12中,基于在步驟S-1l中測(cè)定的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Thr> Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys 的濃度值以及包含 Thr、Ser、Gly、Cit、Val、HiS、Trp、LyS作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺癌或非前列腺肥大。由此,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,這時(shí)使用的多變量判別式,可以是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr, Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0285]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0286]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0287](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0288]此外,上述的多變量判別式,可用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法、或本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2006/098192號(hào)中記載的方法(下述第二實(shí)施方式中記載的多變量判別式制作處理)制作。只要是用這些方法得到的多變量判別式,不論作為輸入數(shù)據(jù)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中的氨基酸濃度單位,都可以合適地將該多變量判別式用于前列腺疾病狀態(tài)的評(píng)價(jià)。
[0289]這里,多變量判別式是指通常在多變量分析中使用的公式的形式,包含例如分?jǐn)?shù)式、多重回歸式、多重邏輯回歸式、線性判別函數(shù)、馬氏距離、典型判別函數(shù)、支持向量機(jī)、決策樹等。還包含由不同形式的多變量判別式之和表示的公式。多重回歸式、多重邏輯回歸式、典型判別函數(shù)中,各變數(shù)可以附加系數(shù)和常數(shù)項(xiàng),此時(shí)的系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)優(yōu)選為實(shí)數(shù),更優(yōu)選在為了由數(shù)據(jù)進(jìn)行判別而得到的系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)的99%置信區(qū)間的范圍內(nèi)的值,還可進(jìn)一步優(yōu)選在為了由數(shù)據(jù)進(jìn)行判別而得到的系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)的95%置信區(qū)間的范圍內(nèi)的值。此夕卜,各系數(shù)的值及其置信區(qū)間可以是其實(shí)數(shù)倍的值,常數(shù)項(xiàng)的值及其置信區(qū)間可以是對(duì)其加減乘除任意的實(shí)常數(shù)所得的值。
[0290]此外,對(duì)于分?jǐn)?shù)式,該分?jǐn)?shù)式的分子由氨基酸A、B、C.......之和表示,并且該分?jǐn)?shù)式的分母由氨基酸a、b、c.......之和表示。此外,分?jǐn)?shù)式中,還包括上述構(gòu)成的分?jǐn)?shù)式
α、β、Y.......之和(例如α + β之類的)。此外,分?jǐn)?shù)式中也包括分割的分?jǐn)?shù)式(分割分?jǐn)?shù)式)。此外,分子和分母中使用的氨基酸可以分別帶有適當(dāng)?shù)南禂?shù)。此外,分子和分母中使用的氨基酸可以重復(fù)。此外,各分?jǐn)?shù)式可以帶有適當(dāng)?shù)南禂?shù)。此外,各變數(shù)的系數(shù)的值和常數(shù)項(xiàng)的值只要是實(shí)數(shù)即可。分?jǐn)?shù)式中,對(duì)于將分子的變數(shù)和分母的變數(shù)互換的組合,與目標(biāo)變數(shù)相關(guān)的正負(fù)符號(hào)均轉(zhuǎn)換,但它們?nèi)员3窒嚓P(guān)性,因此,在判別性中視為同等,因此,分?jǐn)?shù)式也包含將分子的變數(shù)與分母的變數(shù)互換的組合。
[0291]此外,本發(fā)明在評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)時(shí),除了氨基酸的濃度之外,可以進(jìn)一步使用其他代謝物的濃度和基因表達(dá)量、蛋白質(zhì)表達(dá)量、受試者的年齡、性別、是否吸煙、心電圖波形的數(shù)值化結(jié)果等。此外,本發(fā)明在評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)時(shí),作為多變量判別式中的變數(shù),除了氨基酸的濃度之外,可以進(jìn)一步使用其他代謝物的濃度和基因表達(dá)量、蛋白質(zhì)表達(dá)量、受試者的年齡、性別、是否吸煙、心電圖波形的數(shù)值化結(jié)果等。
[0292][1-2.第一實(shí)施方式涉及的前列腺疾病的狀態(tài)的評(píng)價(jià)方法]
[0293]這里,參照?qǐng)D2對(duì)第一實(shí)施方式涉及的前列腺疾病的狀態(tài)的評(píng)價(jià)方法進(jìn)行說明。圖2是表示第一實(shí)施方式涉及的前列腺疾病的狀態(tài)的評(píng)價(jià)方法的一例的流程圖。
[0294]首先,由采集自動(dòng)物或人等個(gè)體的血液,測(cè)定與氨基酸的濃度值有關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)(步驟SA-11)。此外,氨基酸的濃度值的測(cè)定用上述方法進(jìn)行。
[0295]接著,從在步驟SA-1l中測(cè)定的個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)除去缺失值和異常值等數(shù)據(jù)(步驟SA-12)。
[0296]接著,基于在步驟SA-12中除去了缺失值和異常值等數(shù)據(jù)的個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)、以氨基酸的濃度作為變數(shù)的預(yù)先設(shè)定的多變量判別式(該多變量判別式是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式中的任意一種。),對(duì)于個(gè)體進(jìn)行下述11.?13.表示的判別中的任意一個(gè)(步驟SA-13)。
[0297]11.是否是前列腺疾病或非前列腺疾病的判別
[0298]通過比較氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、0rn、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?,對(duì)于個(gè)體,判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病,或者基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys> Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp、Lys> Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?,對(duì)于個(gè)體,判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病。
[0299]12.是否是前列腺癌或非前列腺癌的判別
[0300]基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、0rn、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺癌或非前列腺癌,或者基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?,對(duì)于個(gè)體,判別是否是前列腺癌或非前列腺癌。
[0301]13.是否是前列腺癌或前列腺肥大的判別
[0302]基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、0rn、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺癌或前列腺肥大,或者基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys 的濃度值以及包含 Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys 作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?,對(duì)于個(gè)體,判別是否是前列腺癌或前列腺肥大。
[0303][1-3.第一實(shí)施方式的總結(jié)以及其他實(shí)施方式]
[0304]如以上的詳細(xì)說明,根據(jù)第一實(shí)施方式涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法,(I)從采集自個(gè)體的血液測(cè)定氨基酸濃度數(shù)據(jù),(2)從測(cè)定出的個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)除去缺失值和異常值等數(shù)據(jù),(3)基于除去了缺失值和異常值后的個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)、或以氨基酸的濃度作為變數(shù)的預(yù)先設(shè)定的多變量判別式,對(duì)于個(gè)體,進(jìn)行上述11.?13.表示的判別中的任意一項(xiàng)。由此,利用血液中的氨基酸濃度中,對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別有用的氨基酸濃度,可以高精度地進(jìn)行這些兩組判別。此外,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0305]此外,在步驟SA-13中,進(jìn)行上述11.表示的判別時(shí),多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met, Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、Cit、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0306]B1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0307]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0308](數(shù)學(xué)式I中,BpbpC1Upe1是任意實(shí)數(shù)。)
[0309]此外,在步驟SA-13中,進(jìn)行上述12.表示的判別時(shí),多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp> Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr, Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0310]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0311]……(數(shù)學(xué)式2)
[0312]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0313]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0314]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0315]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0316](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0317]此外,在步驟SA-13中,進(jìn)行上述13.表示的判別時(shí),多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val.Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gln、Gly、Cit、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0318]a5 (Ser/Gin) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0319]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0320](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0321]此外,上述的多變量判別式,可用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法、或本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2006/098192號(hào)中記載的方法(后述的第二實(shí)施方式中記載的多變量判別式制作處理)制作。只要是用這些方法得到的多變量判別式,不論作為輸入數(shù)據(jù)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中的氨基酸濃度的單位,都可以合適地將該多變量判別式用于前列腺疾病狀態(tài)的評(píng)價(jià)。
[0322]第二實(shí)施方式
[0323][2-1.本發(fā)明的概要]
[0324]這里,參照?qǐng)D3對(duì)本發(fā)明涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置、前列腺疾病評(píng)價(jià)方法、前列腺疾病評(píng)價(jià)系統(tǒng)、前列腺疾病評(píng)價(jià)程序和記錄介質(zhì)的概要進(jìn)行說明。圖3是表示本發(fā)明的基本原理的原理構(gòu)成圖。
[0325]首先,本發(fā)明在控制部,基于與氨基酸的濃度值有關(guān)的預(yù)先取得的評(píng)價(jià)對(duì)象(例如動(dòng)物或人等個(gè)體)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及以氨基酸的濃度作為變數(shù)的存儲(chǔ)于存儲(chǔ)部的多變量判別式即包含Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn> Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值(步驟S-21)。
[0326]接著,本發(fā)明在控制部,基于在步驟S-21中算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)(步驟S-22)。
[0327]如上所述,根據(jù)本發(fā)明,基于與氨基酸的濃度值有關(guān)的預(yù)先取得的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、HiS、Trp、0rn、LyS、CyS2中的至少一種氨基酸的濃度值以及以氨基酸的濃度作為變數(shù)的存儲(chǔ)于存儲(chǔ)部的多變量判別式即包含Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、CU、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys> Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。由此,利用由與前列腺疾病的狀態(tài)具有顯著相關(guān)性的多變量判別式得到的判別值,可以高精度地評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。具體而言,能夠用一種檢體且短時(shí)間內(nèi)即可縮小篩選范圍至罹患前列腺疾病的可能性高的受試者,其結(jié)果可以減輕給受試者帶來的時(shí)間、身體和金錢上的負(fù)擔(dān)。此外,具體而言,利用復(fù)數(shù)種氨基酸的濃度和以該氨基酸的濃度為變數(shù)的判別式,可以高精度地評(píng)價(jià)某檢體是否有前列腺疾病發(fā)病,其結(jié)果可以實(shí)現(xiàn)檢查的高效化和高精度化。
[0328]這里,步驟S-22中,基于在步驟S-21中算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病、是否是前列腺癌或非前列腺癌、或者是否是前列腺癌或前列腺肥大。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別有用的多變量判別式得到的判別值,可以高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0329]此外,多變量判別式可以是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)所述分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式中的任意一種。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別、前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別、前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行這些兩組判別。
[0330]此外,在步驟S-21中,基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、His、Trp、Lys、Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,在步驟S-22中,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,這時(shí)使用的多變量判別式,可以是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn,Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、CU、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0331]H1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0332]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0333](數(shù)學(xué)式I中,BpbpCpdpe1是任意實(shí)數(shù)。)
[0334]此外,在步驟S-21中,基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、Ile、Leu、Phe、His、Trp、0rn、Cys2中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn> Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,在步驟S-22中,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,可以判別是否是前列腺癌或非前列腺癌。由此,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,這時(shí)使用的多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以 Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg 作為變數(shù)的線性判別式或以 Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp 作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0335]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0336]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0337]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0338]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0339]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0340]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0341](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0342]此外,在步驟S-21中,基于氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys的濃度值以及包含Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp、Lys作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,在步驟S-22中,基于算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,判別是否是前列腺癌或前列腺肥大。由此,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,這時(shí)使用的多變量判別式,可以是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Ser、Gln、Gly、Cit、Val、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gln、Gly、Cit、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0343]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0344]……(數(shù)學(xué)式5)
[0345](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0346]此外,上述的多變量判別式,可用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法、或本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2006/098192號(hào)中記載的方法(后述的多變量判別式制作處理)制作。只要是用這些方法得到的多變量判別式,不論作為輸入數(shù)據(jù)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中的氨基酸濃度的單位,都可以合適地將該多變量判別式用于前列腺疾病狀態(tài)的評(píng)價(jià)。
[0347]這里,多變量判別式是指通常在多變量分析中使用的公式的形式,包括例如分?jǐn)?shù)式、多重回歸式、多重邏輯回歸式、線性判別函數(shù)、馬氏距離、典型判別函數(shù)、支持向量機(jī)、決策樹等。另外,還包含由不同形式的多變量判別式之和表示的公式。多重回歸式、多重邏輯回歸式、典型判別函數(shù)中,各變數(shù)可以附加系數(shù)和常數(shù)項(xiàng),此時(shí)的系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)優(yōu)選為實(shí)數(shù),更優(yōu)選在為了由數(shù)據(jù)進(jìn)行判別而得到的系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)的99%置信區(qū)間的范圍內(nèi)的值,還可進(jìn)一步優(yōu)選在為了由數(shù)據(jù)進(jìn)行判別而得到的系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)的95%置信區(qū)間的范圍內(nèi)的值。此外,各系數(shù)的值及其置信區(qū)間可以是其實(shí)數(shù)倍的值,常數(shù)項(xiàng)的值及其置信區(qū)間可以是對(duì)其加減乘除任意的實(shí)常數(shù)所得的值。
[0348]此外,對(duì)于分?jǐn)?shù)式,該分?jǐn)?shù)式的分子由氨基酸A、B、C.......之和表示,并且該分?jǐn)?shù)式的分母由氨基酸a、b、c.......之和表示。此外,分?jǐn)?shù)式中,還包括上述構(gòu)成的分?jǐn)?shù)式
α、β、Y.......之和(例如α+β之類的)。此外,分?jǐn)?shù)式中也包括分割的分?jǐn)?shù)式。此夕卜,分子和分母中使用的氨基酸可以分別帶有適當(dāng)?shù)南禂?shù)。此外,分子和分母中使用的氨基酸可以重復(fù)。此外,各分?jǐn)?shù)式可以帶有適當(dāng)?shù)南禂?shù)。此外,各變數(shù)的系數(shù)的值和常數(shù)項(xiàng)的值只要是實(shí)數(shù)即可。分?jǐn)?shù)式中,對(duì)于將分子的變數(shù)和分母的變數(shù)互換的組合,與目標(biāo)變數(shù)相關(guān)的正負(fù)符號(hào)均轉(zhuǎn)換,但它們?nèi)员3窒嚓P(guān)性,因此,在判別性中視為同等,因此,分?jǐn)?shù)式也包含將分子的變數(shù)與分母的變數(shù)互換的組合。
[0349]此外,本發(fā)明在評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)時(shí),除了氨基酸的濃度之外,可以進(jìn)一步使用其他代謝物的濃度和基因表達(dá)量、蛋白質(zhì)表達(dá)量、受試者的年齡、性別、是否吸煙、心電圖波形的數(shù)值化結(jié)果等。此外,本發(fā)明在評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)時(shí),作為多變量判別式中的變數(shù),除了氨基酸的濃度之外,可以進(jìn)一步使用其他代謝物的濃度和基因表達(dá)量、蛋白質(zhì)表達(dá)量、受試者的年齡、性別、是否吸煙、心電圖波形的數(shù)值化結(jié)果等。
[0350]這里,對(duì)多變量判別式制作處理(工序I?工序4)的概要進(jìn)行詳細(xì)說明。
[0351]首先,本發(fā)明在控制部,基于規(guī)定的公式制作方法,由包含氨基酸濃度數(shù)據(jù)和與表示前列腺疾病狀態(tài)的指標(biāo)有關(guān)的前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)于存儲(chǔ)部的前列腺疾病狀態(tài)信息來制作多變量判別式的候選即候選多變量判別式(例如,y = alXl+a2x2+...+anxn,y:前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù),X1:氨基酸濃度數(shù)據(jù),a1:常數(shù),i = 1、2、...、n)(工序I)。此夕卜,可以預(yù)先從前列腺疾病狀態(tài)信息除去帶有缺失值和異常值等的數(shù)據(jù)。
[0352]此外,工序I中,可以并用復(fù)數(shù)個(gè)不同的公式制作方法(包括與主成分分析或判別分析、支持向量機(jī)、多重回歸分析、邏輯回歸分析、k-means法、聚類分析、決策樹等的多變量分析相關(guān)的方法),由前列腺疾病狀態(tài)信息制作復(fù)數(shù)個(gè)候選多變量判別式組。具體來說,可以利用復(fù)數(shù)種不同的算法,對(duì)于前列腺疾病狀態(tài)信息同時(shí)并行地制作復(fù)數(shù)個(gè)候選多變量判別式組,其中,所述前列腺疾病狀態(tài)信息是由通過分析從許多的健康人和前列腺疾病患者獲取的血液而得到的氨基酸濃度數(shù)據(jù)和前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)構(gòu)成的多變量數(shù)據(jù)。例如,可以利用不同的算法,同時(shí)進(jìn)行判別分析和邏輯回歸分析,制作兩種不同的候選多變量判別式。還可以利用進(jìn)行主成分分析而制作的候選多變量判別式,變換前列腺疾病狀態(tài)信息,對(duì)變換的前列腺疾病狀態(tài)信息進(jìn)行判別分析,從而制作候選多變量判別式。由此,最終可以制作符合診斷條件的適當(dāng)?shù)亩嘧兞颗袆e式。
[0353]這里,使用主成分分析制作的候選多變量判別式是由使全部的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的離散為最大的各氨基酸變數(shù)構(gòu)成的一次式。使用判別分析制作的候選多變量判別式是由使各組內(nèi)離散之和相對(duì)于全部氨基酸濃度數(shù)據(jù)的離散的比值為最小的各氨基酸變數(shù)構(gòu)成的高次式(包括指數(shù)和對(duì)數(shù))。另外,使用支持向量機(jī)制作的候選多變量判別式是由使組間的分界為最大的各氨基酸變數(shù)構(gòu)成的高次式(包括核函數(shù))。使用多重回歸分析制作的候選多變量判別式是由使自全部的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的距離之和為最小的各氨基酸變數(shù)構(gòu)成的高次式。使用邏輯回歸分析制作的候選多變量判別式是由使似然率為最大的各氨基酸變數(shù)構(gòu)成的、項(xiàng)中具有以一次式作為指數(shù)的自然對(duì)數(shù)的分?jǐn)?shù)式。k-means法是探索各氨基酸濃度數(shù)據(jù)的k個(gè)附近(近傍),將鄰近點(diǎn)(近傍點(diǎn))在所屬的組中最多的組定義為該數(shù)據(jù)的所屬組,選擇使輸入的氨基酸濃度數(shù)據(jù)所屬的組與定義的組最一致的氨基酸變數(shù)的方法。聚類分析是對(duì)全部氨基酸濃度數(shù)據(jù)中位于最近距離的點(diǎn)之間進(jìn)行聚類(群化)的方法。決策樹是給氨基酸變數(shù)排序,由序列上位的氨基酸變數(shù)可取得的圖案來預(yù)測(cè)氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組的方法。
[0354]返回多變量判別式制作處理的說明,本發(fā)明是在控制部,根據(jù)規(guī)定的驗(yàn)證方法,驗(yàn)證(相互驗(yàn)證)工序I中制作的候選多變量判別式(工序2)。候選多變量判別式的驗(yàn)證是對(duì)工序I中制作的各候選多變量判別式進(jìn)行。
[0355]工序2中,可以基于自舉(bootstrap)法、堅(jiān)持(holdout)法、留一(leave-one-out)法等中的至少一種方法,驗(yàn)證候選多變量判別式的判別率或靈敏度、特異性、信息量基準(zhǔn)等中的至少一種。由此,可以制作考慮了前列腺疾病狀態(tài)信息或診斷條件的、預(yù)測(cè)性或可靠性高的候選多變量判別式。
[0356]這里,判別率是在全部輸入數(shù)據(jù)中,本發(fā)明所評(píng)價(jià)的前列腺疾病的狀態(tài)正確的比例。靈敏度是在輸入數(shù)據(jù)所記載的前列腺疾病的狀態(tài)為患病的數(shù)據(jù)中,本發(fā)明所評(píng)價(jià)的前列腺疾病的狀態(tài)正確的比例。特異性是在輸入數(shù)據(jù)所記載的前列腺疾病的狀態(tài)為正常的數(shù)據(jù)中,本發(fā)明所評(píng)價(jià)的前列腺疾病的狀態(tài)正確的比例。信息量基準(zhǔn)是將工序I中制作的候選多變量判別式的氨基酸變數(shù)的數(shù)目、和本發(fā)明所評(píng)價(jià)的前列腺疾病的狀態(tài)以及輸入數(shù)據(jù)所記載的前列腺疾病的狀態(tài)的差異數(shù)加在一起所得到的。預(yù)測(cè)性是將反復(fù)進(jìn)行候選多變量判別式的驗(yàn)證而得到的判別率或靈敏度、特異性的平均??煽啃允欠磸?fù)進(jìn)行候選多變量判別式的驗(yàn)證而得到的判別率或靈敏度、特異性的離散。
[0357]返回多變量判別式制作處理的說明,本發(fā)明是在控制部,根據(jù)規(guī)定的變數(shù)選擇方法,從工序2的驗(yàn)證結(jié)果中選擇候選多變量判別式的變數(shù),來選擇在制作候選多變量判別式時(shí)使用的前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合(工序3)。氨基酸變數(shù)的選擇是對(duì)工序I中制作的各候選多變量判別式進(jìn)行。由此可以適當(dāng)選擇候選多變量判別式的氨基酸變數(shù)。使用包含工序3中選擇的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的前列腺疾病狀態(tài)信息,再次實(shí)行工序I。
[0358]工序3中,可以根據(jù)逐步法、最優(yōu)路徑法(best path method)、局部探索法(localsearch method)、遺傳算法中的至少一種,從步驟2的驗(yàn)證結(jié)果中選擇候選多變量判別式的氨基酸變數(shù)。
[0359]這里,最優(yōu)路徑法是將候選多變量判別式中所含的氨基酸變數(shù)一個(gè)個(gè)依次減少,使候選多變量判別式帶來的評(píng)價(jià)指標(biāo)最優(yōu)化,由此選擇氨基酸變數(shù)的方法。
[0360]回到多變量判別式制作處理的說明中,本發(fā)明是在控制部,基于反復(fù)實(shí)行上述的工序1、工序2和工序3而累積的驗(yàn)證結(jié)果,從復(fù)數(shù)個(gè)候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,由此制作多變量判別式(工序4)。候選多變量判別式的選出中,例如有從用相同的公式制作方法制作的候選多變量判別式中選出最佳的多變量判別式的情況,也有從所有的候選多變量判別式中選出最佳的多變量判別式的情況。
[0361]如上述說明,在多變量判別式制作處理中,基于前列腺疾病狀態(tài)信息,通過一系列的流程使與候選多變量判別式的制作、候選多變量判別式的驗(yàn)證和候選多變量判別式的變數(shù)的選擇相關(guān)的處理體系化(系統(tǒng)化)并實(shí)行,由此可以制作最適合評(píng)價(jià)各前列腺疾病的狀態(tài)的多變量判別式。
[0362][2-2.系統(tǒng)構(gòu)成]
[0363]這里,參照?qǐng)D4至圖20,對(duì)第二實(shí)施方式涉及的前列腺疾病評(píng)價(jià)系統(tǒng)(下面有時(shí)記為本系統(tǒng)。)的構(gòu)成進(jìn)行說明。此外,本系統(tǒng)只是一個(gè)例子,本發(fā)明不受其限制。
[0364]首先,參照?qǐng)D4和圖5,對(duì)本系統(tǒng)的整體構(gòu)成進(jìn)行說明。圖4是表示本系統(tǒng)的整體構(gòu)成的一例的圖。此外,圖5是表示本系統(tǒng)的整體構(gòu)成的另一例的圖。本系統(tǒng)如下構(gòu)成:如圖4所示,經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)300以可通信的方式將對(duì)評(píng)價(jià)對(duì)象評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100和提供與氨基酸的濃度值有關(guān)的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的信息通信終端裝置即客戶端裝置200連接。
[0365]此外,本系統(tǒng)還可以如下構(gòu)成:如圖5所示,除了前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100和客戶端裝置200之外,還將保存了在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100中制作多變量判別式時(shí)使用的前列腺疾病狀態(tài)信息和用于評(píng)價(jià)前列腺疾病狀態(tài)的多變量判別式等的數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)300以可通信的方式連接。由此,經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)300,可以從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100至客戶端裝置200和數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400、或者從客戶端裝置200和數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100提供與前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的信息等。這里,與前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的信息是對(duì)于與人的前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的特定項(xiàng)目進(jìn)行測(cè)定所得的值的相關(guān)信息。此外,與前列腺疾病的狀態(tài)有關(guān)的信息,在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100、客戶端裝置200或其他裝置(例如各種測(cè)量裝置等)中生成,主要積累在數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400中。
[0366]接著,參照?qǐng)D6至圖18對(duì)本系統(tǒng)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的構(gòu)成進(jìn)行說明。圖6是表示本系統(tǒng)的前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的構(gòu)成的一例的框圖,僅概念性地表示了該構(gòu)成中與本發(fā)明有關(guān)的部分。
[0367]前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100由如下部分構(gòu)成:綜合地控制該前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置的CPU(中央處理裝置,Central Processing Unit)等的控制部102 ;經(jīng)由路由器等的通信裝置和專用線等的有線或無線的通信線路,將該前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置與網(wǎng)絡(luò)300以可通信的方式連接的通信接口部104 ;保存各種的數(shù)據(jù)庫(kù)、表格、文件等的存儲(chǔ)部106 ;與輸入裝置112和輸出裝置114連接的輸入輸出接口部108,這些各部分可以經(jīng)由任意的通信線路以可通信的方式連接。這里,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100可以與各種的分析裝置(例如氨基酸分析儀等)在同一外殼(housing)中構(gòu)成。前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的分散、綜合的具體形態(tài)并不限于圖示的形態(tài),可以將其全部或部分以對(duì)應(yīng)各種負(fù)荷等的任意單元進(jìn)行功能性或物理性地分散、綜合來構(gòu)成。例如,可以使用CGI (公共網(wǎng)關(guān)接口,Common Gateway Interface)來實(shí)現(xiàn)處理的一部分。
[0368]存儲(chǔ)部106是存儲(chǔ)裝置,可以使用例如RAM、ROM等的存儲(chǔ)裝置、硬盤之類的固定盤裝置、軟盤、光盤等。存儲(chǔ)部106中記錄計(jì)算機(jī)程序,該計(jì)算機(jī)程序與OS(操作系統(tǒng),Operating System)協(xié)作,對(duì)CPU發(fā)出指令,進(jìn)行各種處理。存儲(chǔ)部106如圖所示,保存利用者信息文件106a、氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件106b、前列腺疾病狀態(tài)信息文件106c、指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d、多變量判別式關(guān)聯(lián)信息數(shù)據(jù)庫(kù)106e、判別值文件106f和評(píng)價(jià)結(jié)果文件106g。
[0369]利用者信息文件106a中保存與利用者相關(guān)的利用者信息。圖7是表示保存在利用者信息文件106a中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在利用者信息文件106a中的信息如圖7所示,由用于專門識(shí)別利用者的利用者ID、用于認(rèn)證利用者是否為正當(dāng)?shù)睦谜叩睦谜呙艽a、利用者姓名、用于專門識(shí)別利用者的所屬機(jī)構(gòu)的所屬機(jī)構(gòu)ID、用于專門識(shí)別利用者的所屬機(jī)構(gòu)的部門的部門ID、部門名稱以及利用者的電子郵件地址相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0370]返回圖6,氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件106b中保存關(guān)于氨基酸濃度值的氨基酸濃度數(shù)據(jù)。圖8是表示保存在氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件106b中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件106b中的信息如圖8所示,由用于專門識(shí)別評(píng)價(jià)對(duì)象個(gè)體(樣品)的個(gè)體編號(hào)和氨基酸濃度數(shù)據(jù)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。這里,圖8中,將氨基酸濃度數(shù)據(jù)作為數(shù)值即連續(xù)尺度應(yīng)用,氨基酸濃度數(shù)據(jù)也可以是名義尺度或順序尺度。為名義尺度或順序尺度時(shí),可通過對(duì)各狀態(tài)賦予任意的數(shù)值來進(jìn)行分析。氨基酸濃度數(shù)據(jù)中還可以組合其它的生物體信息(氨基酸以外的其它代謝物的濃度或基因表達(dá)量、蛋白質(zhì)表達(dá)量、被驗(yàn)者的年齡和性別、有無吸煙、心電圖的波形數(shù)值化所得的結(jié)果等)。
[0371]返回圖6,前列腺疾病狀態(tài)信息文件106c中保存制作多變量判別式時(shí)使用的前列腺疾病狀態(tài)信息。圖9是表示保存在前列腺疾病狀態(tài)信息文件106c中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在前列腺疾病狀態(tài)信息文件106c中的信息如圖9所示,由個(gè)體編號(hào)、與表示前列腺疾病狀態(tài)的指標(biāo)(指標(biāo)T1、指標(biāo)T2、指標(biāo)T3......)相關(guān)的如列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)(T)
和氨基酸濃度數(shù)據(jù)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。這里,圖9中,前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)和氨基酸濃度數(shù)據(jù)以數(shù)值(即連續(xù)尺度)的形式應(yīng)用,但前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)和氨基酸濃度數(shù)據(jù)也可以是名義尺度或順序尺度。為名義尺度或順序尺度時(shí),可通過對(duì)各狀態(tài)賦予任意的數(shù)值來進(jìn)行分析。前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)是成為前列腺疾病的狀態(tài)的標(biāo)志物的已知的單一的狀態(tài)指標(biāo),可以使用數(shù)值數(shù)據(jù)。
[0372]返回圖6,指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d中保存在后述的前列腺疾病狀態(tài)信息指定部102g中指定的前列腺疾病狀態(tài)信息。圖10是表示保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d中的信息的一個(gè)例子。保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d中的信息如圖10所示,由個(gè)體編號(hào)、指定的前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)和指定的氨基酸濃度數(shù)據(jù)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0373]返回圖6,多變量判別式關(guān)聯(lián)信息數(shù)據(jù)庫(kù)106e由以下文件構(gòu)成:候選多變量判別式文件106el,保存在后述的候選多變量判別式制作部102hl中制作的候選多變量判別式;驗(yàn)證結(jié)果文件106e2,保存后述的候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2中的驗(yàn)證結(jié)果;選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件106e3,保存包括在后述的變數(shù)選擇部102h3中選擇的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合的前列腺疾病狀態(tài)信息;多變量判別式文件106e4,保存在后述的多變量判別式制作部102h中制作的多變量判別式。
[0374]候選多變量判別式文件106el中保存在后述的候選多變量判別式制作部102hl中制作的候選多變量判別式。圖11是表示保存在候選多變量判別式文件106el中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在候選多變量判別式文件106el中的信息如圖11所示,由順序(rank)和候選多變量判別式(圖 11 中的 FjGly’Leu’Phe,...)或 F2 (Gly,Leu,Phe,...)、F3 (Gly,Leu, Phe,...)等)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0375]返回圖6,驗(yàn)證結(jié)果文件106e2中保存后述的候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2中的驗(yàn)證結(jié)果。圖12是表示保存在驗(yàn)證結(jié)果文件106e2中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在驗(yàn)證結(jié)果文件106e2中的信息如圖12所示,由順序、候選多變量判別式(圖12中的Fk(Gly,Leu, Phe,...)或 Fm (Gly, Leu, Phe,...)、Fl (Gly, Leu, Phe,...)等)和各候選多變量判別式的驗(yàn)證結(jié)果(例如各候選多變量判別式的評(píng)價(jià)值)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0376]返回圖6,選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件106e3中保存前列腺疾病狀態(tài)信息,該前列腺疾病狀態(tài)信息包括與在后述的變數(shù)選擇部102h3中選擇的變數(shù)對(duì)應(yīng)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合。圖13是表示保存在選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件106e3中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件106e3中的信息如圖13所示,由個(gè)體編號(hào)、在后述的如列腺疾病狀態(tài)?目息指定部102g中指定的如列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)和在后述的變數(shù)選擇部102h3中選擇的氨基酸濃度數(shù)據(jù)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0377]返回圖6,多變量判別式文件106e4中保存在后述的多變量判別式制作部102h中制作的多變量判別式。圖14是表示保存在多變量判別式文件106e4中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在多變量判別式文件106e4中的信息如圖14所示,由順序、多變量判別式(圖14 中的 Fp (Phe,...)或 Fp (Gly, Leu, Phe)、Fk(Gly, Leu, Phe,...)等)、與各公式制作方法對(duì)應(yīng)的閥值和各多變量判別式的驗(yàn)證結(jié)果(例如各多變量判別式的評(píng)價(jià)值)相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0378]返回圖6,判別值文件106f中保存在后述的判別值算出部102i中計(jì)算的判別值。圖15是表示保存在判別值文件106f中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在判別值文件106f中的信息如圖15所示,是用于專門識(shí)別評(píng)價(jià)對(duì)象個(gè)體(樣品)的個(gè)體編號(hào)、順序(用于專門識(shí)別多變量判別式的編號(hào))和判別值相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0379]返回圖6,評(píng)價(jià)結(jié)果文件106g中保存在后述的判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102 j中的評(píng)價(jià)結(jié)果(具體的是,在后述的判別值基準(zhǔn)判別部102jl中的判別結(jié)果)。圖16是表示保存在評(píng)價(jià)結(jié)果文件106g中的信息的一個(gè)例子的圖。保存在評(píng)價(jià)結(jié)果文件106g中的信息由用于專門識(shí)別評(píng)價(jià)對(duì)象個(gè)體(樣品)的個(gè)體編號(hào)、預(yù)先取得的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)、由各多變量判別式算出的判別值和與前列腺疾病狀態(tài)有關(guān)的評(píng)價(jià)結(jié)果相互關(guān)聯(lián)地構(gòu)成。
[0380]返回圖6,在存儲(chǔ)部106中,除上述信息之外,作為其它信息,還記錄有用于將網(wǎng)站提供給客戶端裝置200的各種網(wǎng)站數(shù)據(jù)、CGI程序等。網(wǎng)站數(shù)據(jù)有用于表示后述的各種網(wǎng)頁(yè)的數(shù)據(jù)等,這些數(shù)據(jù)以例如用HTML或XML記述的文本文件的形式形成。用于制作網(wǎng)站數(shù)據(jù)的部件用的文件、操作用的文件及其它臨時(shí)性的文件等也存儲(chǔ)于存儲(chǔ)部106中。在存儲(chǔ)部106中,根據(jù)需要可以將用于發(fā)送給客戶端裝置200的聲音以如WAVE形式或AIFF形式的聲音文件保存,或者將靜止圖像或動(dòng)態(tài)圖像以如JPEG形式或MPEG2形式的圖像文件保存。
[0381]通信接口部104連通前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100和網(wǎng)絡(luò)300 (或路由器等通信裝置)之間的通信。即,通信接口部104具有經(jīng)由通信線路與其它終端進(jìn)行數(shù)據(jù)通信的功能。
[0382]輸入輸出接口部108與輸入裝置112和輸出裝置114連接。這里,輸出裝置114除了使用監(jiān)視器(包括家庭用電視)之外,也可以使用擴(kuò)音器或打印機(jī)(以下有時(shí)將輸出裝置114記為監(jiān)視器114)。輸入裝置112除了使用鍵盤或鼠標(biāo)或麥克風(fēng)之外,還可以使用與鼠標(biāo)協(xié)作以實(shí)現(xiàn)指點(diǎn)器(pointing device)功能的監(jiān)視器。
[0383]控制部102具有用于保存OS (操作系統(tǒng))等控制程序、規(guī)定各種處理順序等的程序和所需數(shù)據(jù)等的內(nèi)存,基于這些程序?qū)嵭懈鞣N信息處理。控制部102如圖所示,大致具備要求解釋部102a、閱覽處理部102b、認(rèn)證處理部102c、電子郵件生成部102d、網(wǎng)頁(yè)生成部102e、接收部102f、前列腺疾病狀態(tài)信息指定部102g、多變量判別式制作部102h、判別值算出部1021、判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j、結(jié)果輸出部102k和發(fā)送部102m。控制部102對(duì)于從數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400發(fā)送的前列腺疾病狀態(tài)信息或從客戶端裝置200發(fā)送的氨基酸濃度數(shù)據(jù)進(jìn)行以下數(shù)據(jù)處理:除去有缺失值的數(shù)據(jù)、除去偏離值多的數(shù)據(jù)、除去有缺失值的數(shù)據(jù)多的變數(shù)坐寸ο
[0384]要求解釋部102a是解釋來自客戶端裝置200或數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400的要求內(nèi)容,根據(jù)該解釋結(jié)果,將處理交付給控制部102的各部。閱覽處理部102b接受來自客戶端裝置200的各種畫面的閱覽要求,并進(jìn)行這些畫面的網(wǎng)站數(shù)據(jù)的生成和發(fā)送。認(rèn)證處理部102c接受來自客戶端裝置200或數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400的認(rèn)證要求,并進(jìn)行認(rèn)證判斷。電子郵件生成部102d生成包含各種信息的電子郵件。網(wǎng)頁(yè)生成部102e生成利用者在客戶端裝置200閱覽的網(wǎng)頁(yè)。
[0385]接收部102f經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)300,接收從客戶端裝置200和數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400發(fā)送的信息(具體的是氨基酸濃度數(shù)據(jù)、前列腺疾病狀態(tài)信息、多變量判別式等)。前列腺疾病狀態(tài)信息指定部102g在制作多變量判別式時(shí),指定作為對(duì)象的前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)和氨基酸濃度數(shù)據(jù)。
[0386]多變量判別式制作部102h基于在接收部102f中接收的前列腺疾病狀態(tài)信息和在前列腺疾病狀態(tài)信息指定部102g中指定的前列腺疾病狀態(tài)信息來制作多變量判別式。具體來說,多變量判別式制作部102h是基于從前列腺疾病狀態(tài)信息反復(fù)運(yùn)行候選多變量判別式制作部102hl、候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2和變數(shù)選擇部102h3而累積的驗(yàn)證結(jié)果,從復(fù)數(shù)個(gè)候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,來制作多變量判別式。
[0387]多變量判別式預(yù)先保存在存儲(chǔ)部106的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域時(shí),多變量判別式制作部102h可以通過從存儲(chǔ)部106中選擇所需的多變量判別式來制作多變量判別式。多變量判別式制作部102h通過從預(yù)先保存了多變量判別式的其它的計(jì)算機(jī)裝置(例如數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400)中選擇所需的多變量判別式并下載,可以制作多變量判別式。
[0388]這里,參照?qǐng)D17對(duì)多變量判別式制作部102h的構(gòu)成進(jìn)行說明。圖17是表示多變量判別式制作部102h的構(gòu)成的框圖,該構(gòu)成中只概念性地表示了與本發(fā)明有關(guān)的部分。多變量判別式制作部102h進(jìn)一步具備候選多變量判別式制作部102hl、候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2和變數(shù)選擇部102h3。候選多變量判別式制作部102hl是基于規(guī)定的公式制作方法,從前列腺疾病狀態(tài)信息制作多變量判別式的候選即候選多變量判別式。候選多變量判別式制作部102hl可以并用復(fù)數(shù)種不同的公式制作方法,從前列腺疾病狀態(tài)信息制作復(fù)數(shù)個(gè)候選多變量判別式。候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2基于規(guī)定的驗(yàn)證方法,驗(yàn)證在候選多變量判別式制作部102hl中制作的候選多變量判別式。候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2還可以基于自舉法、保持法、留一法中的至少一種方法,對(duì)于候選多變量判別式的判別率、靈敏度、特異性、信息量基準(zhǔn)中的至少一種進(jìn)行驗(yàn)證。變數(shù)選擇部102h3基于規(guī)定的變數(shù)選擇方法,從候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2的驗(yàn)證結(jié)果中選擇候選多變量判別式的變數(shù),來選擇在制作候選多變量判別式時(shí)使用的前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合。變數(shù)選擇部102h3還可基于逐步法、最優(yōu)路徑法、局部探索法、遺傳算法中的至少一種,從驗(yàn)證結(jié)果中選擇候選多變量判別式的變數(shù)。
[0389]返回圖6,判別值算出部102i,基于在接收部102f接收的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr> Ser> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、HiS、Trp、0rn、LyS、CyS2中的至少一種氨基酸的濃度值以及在多變量判別式制作部102h制作的多變量判別式即包含 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys, Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值。
[0390]這里,多變量判別式可以是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式中的任意一種。
[0391]此外,當(dāng)在判別值基準(zhǔn)判別部102jl判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病時(shí),判別值算出部102i,可基于在接收部102f接收的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及在多變量判別式制作部102h制作的包含Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值。這時(shí)使用的多變量判別式,可以是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以 Tau、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA 作為變數(shù)的邏輯回歸式或以 Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp 作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、Cit、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式。
[0392]H1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0393]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0394](數(shù)學(xué)式I中,BpbpC1Upe1是任意實(shí)數(shù)。)
[0395]此外,當(dāng)在判別值基準(zhǔn)判別部102jl判別是否是前列腺癌或非前列腺癌時(shí),判別值算出部102i,可基于在接收部102f接收的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr> Asn> Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及在多變量判別式制作部102h制作的包含Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值。這時(shí)使用的多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以 Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn 作為變數(shù)的邏輯回歸式、以 Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg 作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp作為變數(shù)的線性判別式。
[0396]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0397]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0398]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0399]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0400]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0401]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0402](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0403]此外,當(dāng)在判別值基準(zhǔn)判別部102jl判別是否是前列腺癌或前列腺肥大時(shí),判別值算出部102i,可基于在接收部102f接收的評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp、Lys的濃度值以及在多變量判別式制作部102h制作的包含Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp、Lys作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值。這時(shí)使用的多變量判別式,可以是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式。
[0404]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0405]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0406](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0407]判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j,基于在判別值算出部102i算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)前列腺疾病的狀態(tài)。判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j進(jìn)一步具備判別值基準(zhǔn)判別部102jl。這里,參照?qǐng)D18對(duì)判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j的構(gòu)成進(jìn)行說明。圖18是表示判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j的構(gòu)成的框圖,僅概念性地表示該構(gòu)成中與本發(fā)明有關(guān)的部分。判別值基準(zhǔn)判別部102jl,基于在判別值算出部102i算出的判別值,對(duì)于評(píng)價(jià)對(duì)象,進(jìn)行“是否是前列腺疾病或非前列腺疾病的判別”、“是否是前列腺癌或非前列腺癌的判別”、“是否是前列腺癌或前列腺肥大的判別”。
[0408]返回圖6,結(jié)果輸出部102k將在控制部102的各處理部的處理結(jié)果(包括在判別值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)部102j的評(píng)價(jià)結(jié)果(具體的是在判別值基準(zhǔn)判別部102jl的判別結(jié)果))等輸出至輸出裝置114。
[0409]發(fā)送部102m對(duì)評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的發(fā)送源的客戶端裝置200發(fā)送評(píng)價(jià)結(jié)果、對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400發(fā)送在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100制作的多變量判別式和評(píng)價(jià)結(jié)果。
[0410]接著,參照?qǐng)D19對(duì)本系統(tǒng)的客戶端裝置200的構(gòu)成進(jìn)行說明。圖19是表示本系統(tǒng)的客戶端裝置200的構(gòu)成的一個(gè)例子的框圖,只概念性地表示該構(gòu)成中與本發(fā)明有關(guān)的部分。
[0411]客戶端裝置200由控制部210、R0M220、HD230、RAM240、輸入裝置250、輸出裝置260、輸入輸出IF270和通信IF280構(gòu)成,這些各部經(jīng)由任意的通信線路以可通信的方式連接。
[0412]控制部210具備網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211、電子郵箱212、接收部213、發(fā)送部214。網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211進(jìn)行解釋網(wǎng)站數(shù)據(jù)、將解釋的網(wǎng)站數(shù)據(jù)顯示在后述的監(jiān)視器261上的瀏覽處理??梢栽诰W(wǎng)頁(yè)瀏覽器211中插入具備進(jìn)行影像流的接收、顯示、反饋等的功能的流式播放器等的各種軟件。電子郵箱212按照規(guī)定的通信協(xié)議(例如,SMTP (簡(jiǎn)單郵件傳輸協(xié)議,Simple Mail Transfer Protocol)或POP3 (郵局協(xié)議的第 3個(gè)版本,Post Office Proteocolvers1n 3)等)進(jìn)行電子郵件的發(fā)送接收。接收部213經(jīng)由通信IF280,接收從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的評(píng)價(jià)結(jié)果等的各種信息。發(fā)送部214經(jīng)由通信IF280,將評(píng)價(jià)對(duì)象的氨基酸濃度數(shù)據(jù)等的各種信息發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100。
[0413]輸入裝置250是鍵盤、鼠標(biāo)或麥克風(fēng)等。后述的監(jiān)視器261也與鼠標(biāo)協(xié)作,實(shí)現(xiàn)指點(diǎn)器功能。輸出裝置260是將經(jīng)由通信IF280接收的信息輸出的輸出裝置,包含監(jiān)視器(包括家庭用電視機(jī))261和打印機(jī)262。除此之外還可以在輸出裝置260中設(shè)置擴(kuò)音器等。輸入輸出IF270與輸入裝置250和輸出裝置260連接。
[0414]通信IF280將客戶端裝置200與網(wǎng)絡(luò)300 (或路由器等的通信裝置)以可通信的方式連接。換言之,客戶端裝置200經(jīng)由調(diào)制解調(diào)器或TA或路由器等的通信裝置以及電話線路,或者經(jīng)由專用線,與網(wǎng)絡(luò)300連接。由此,客戶端裝置200按照規(guī)定的通信協(xié)議與前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100連通(access)。
[0415]這里,通過在根據(jù)需要連接了打印機(jī)、監(jiān)視器、圖像掃描儀等的外圍裝置的信息處理裝置(例如,已知的個(gè)人計(jì)算機(jī)、工作站、家庭用游戲裝置、互聯(lián)網(wǎng)TV、PHS終端、便攜終端、移動(dòng)通信終端、PDA等的信息處理終端等)上安裝可實(shí)現(xiàn)網(wǎng)站數(shù)據(jù)的瀏覽功能和電子郵件功能的軟件(程序、數(shù)據(jù)等),也可以實(shí)現(xiàn)客戶端裝置200。
[0416]客戶端裝置200的控制部210中,通過CPU和由該CPU解釋并運(yùn)行的程序,也可實(shí)現(xiàn)在控制部210中進(jìn)行的處理的全部或任意的一部分。R0M220或HD230中記錄與OS (操作系統(tǒng))協(xié)作而對(duì)CPU發(fā)出指令、用于進(jìn)行各種處理的計(jì)算機(jī)程序。該計(jì)算機(jī)程序通過裝載在RAM240中來運(yùn)行,與CPU協(xié)作而構(gòu)成控制部210。該計(jì)算機(jī)程序可以記錄在經(jīng)由任意的網(wǎng)絡(luò)與客戶端裝置200連接的應(yīng)用程序服務(wù)器中,客戶端裝置200可以根據(jù)需要下載其全部或部分。還可通過布線邏輯等的硬件實(shí)現(xiàn)在控制部210中進(jìn)行的處理的全部或任意的一部分。
[0417]接著,參照?qǐng)D4、圖5對(duì)本系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)300進(jìn)行說明。網(wǎng)絡(luò)300具有以可通信的方式將前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100和客戶端裝置200和數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400相互連接的功能,例如互聯(lián)網(wǎng)、內(nèi)聯(lián)網(wǎng)或LAN(包括有線/無線兩者)等。網(wǎng)絡(luò)300可以是VAN、個(gè)人計(jì)算機(jī)通信網(wǎng)、公眾電話網(wǎng)(包括模擬/數(shù)字兩者)、專用線路網(wǎng)(包括模擬/數(shù)字兩者)、CATV網(wǎng)、便攜線路交換網(wǎng)或便攜網(wǎng)絡(luò)包交換網(wǎng)(包括MT2000方式、GSM方式或roc/roc-p方式等)、無線呼出網(wǎng)、Bluetooth (藍(lán)牙)(注冊(cè)商標(biāo))等的局域無線網(wǎng)、PHS網(wǎng)或衛(wèi)星通信網(wǎng)(包括CS、BS 或 ISDB 等)等。
[0418]接著,參照?qǐng)D20對(duì)本系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400的構(gòu)成進(jìn)行說明。圖20是表示本系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400的構(gòu)成的一個(gè)例子的框圖,只概念性地表示了該構(gòu)成中與本發(fā)明有關(guān)的部分。
[0419]數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400具有保存以下內(nèi)容的功能:在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100或該數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400中制作多變量判別式時(shí)使用的前列腺疾病狀態(tài)信息、在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100中制作的多變量判別式、在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100中的評(píng)價(jià)結(jié)果等。如圖20所示,數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400由綜合控制該數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400的CPU等的控制部402、經(jīng)由路由器等的通信裝置以及專用線等的有線或無線通信線路將該數(shù)據(jù)庫(kù)裝置與網(wǎng)絡(luò)300以可通信的方式連接的通信接口部404、保存各種的數(shù)據(jù)庫(kù)或表格或文件(例如網(wǎng)頁(yè)用文件)等的存儲(chǔ)部406、與輸入裝置412和輸出裝置414連接的輸入輸出接口部408構(gòu)成,這些各部經(jīng)由任意的通信線路以可通信的方式連接。
[0420]存儲(chǔ)部406是存儲(chǔ)裝置,例如可使用RAM、ROM等的存儲(chǔ)裝置、硬盤等的固定盤裝置、軟盤、光盤等。存儲(chǔ)部406中保存各種處理中所使用的各種程序等。通信接口部404連通數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400與網(wǎng)絡(luò)300 (或路由器等的通信裝置)之間的通信。S卩,通信接口部404具有經(jīng)由通信線路與其它終端進(jìn)行數(shù)據(jù)通信的功能。輸入輸出接口部408與輸入裝置412和輸出裝置414連接。這里,輸出裝置414除使用監(jiān)視器(包括家庭用電視機(jī))之外,還可以使用擴(kuò)音器或打印機(jī)(以下,有時(shí)將輸出裝置414記為監(jiān)視器414)。輸入裝置412除鍵盤、鼠標(biāo)或麥克風(fēng)之外,還可以使用與鼠標(biāo)協(xié)作而實(shí)現(xiàn)指點(diǎn)器功能的監(jiān)視器。
[0421]控制部402具有用于保存OS(操作系統(tǒng))等的控制程序、規(guī)定了各種處理順序等的程序、所需數(shù)據(jù)等的內(nèi)存,基于這些程序運(yùn)行各種信息處理??刂撇?02如圖所示,大體具備要求解釋部402a、閱覽處理部402b、認(rèn)證處理部402c、電子郵件生成部402d、網(wǎng)頁(yè)生成部402e和發(fā)送部402f。
[0422]要求解釋部402a解釋來自前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的要求內(nèi)容,根據(jù)該解釋結(jié)果,將處理交付給控制部402的各部。閱覽處理部402b接受來自前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的各種畫面的閱覽要求,進(jìn)行這些畫面的網(wǎng)站數(shù)據(jù)的生成和發(fā)送。認(rèn)證處理部402c接受來自前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的認(rèn)證要求,進(jìn)行認(rèn)證判斷。電子郵件生成部402d生成包含各種信息的電子郵件。網(wǎng)頁(yè)生成部402e生成利用者用客戶端裝置200閱覽的網(wǎng)頁(yè)。發(fā)送部402f將前列腺疾病狀態(tài)信息和多變量判別式等的各種信息發(fā)送給前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100。
[0423][2-3.本系統(tǒng)的處理]
[0424]這里,參照?qǐng)D21對(duì)用如上構(gòu)成的本系統(tǒng)進(jìn)行的前列腺疾病評(píng)價(jià)服務(wù)處理的一個(gè)例子進(jìn)行說明。圖21是表示前列腺疾病評(píng)價(jià)服務(wù)處理的一個(gè)例子的流程圖。
[0425]本處理中使用的氨基酸濃度數(shù)據(jù)是與針對(duì)從個(gè)體預(yù)先采集到的血液進(jìn)行分析而得到的氨基酸的濃度值相關(guān)的數(shù)據(jù)。這里,對(duì)血液中的氨基酸的分析方法進(jìn)行簡(jiǎn)單說明。首先,將采集的血樣取至經(jīng)肝素處理的管中,然后對(duì)該管進(jìn)行離心分離以分離血漿。分離的全部的血漿樣品在_70°C下冷凍保存至氨基酸濃度測(cè)定之前。測(cè)定氨基酸濃度時(shí),在血漿樣品中添加硫代水楊酸調(diào)節(jié)為3%濃度,由此進(jìn)行除蛋白處理。氨基酸濃度的測(cè)定采用氨基酸分析儀,該氨基酸分析儀以使用柱后茚三酮反應(yīng)的高效液相色譜(HPLC)為原理。
[0426]首先,在顯示了網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211的畫面上,利用者經(jīng)由輸入裝置250而指定前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100所提供的網(wǎng)站的地址(URL等)時(shí),客戶端裝置200與前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100連通。具體來說,利用者指示客戶端裝置200的網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211的畫面更新,則網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211通過規(guī)定的通信協(xié)議,將前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100所提供的網(wǎng)站的地址發(fā)送給前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100,由此用基于該地址的路由,向前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送與氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面對(duì)應(yīng)的網(wǎng)頁(yè)的發(fā)送要求。
[0427]接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在要求解釋部102a接受來自客戶端裝置200的發(fā)送,分析該發(fā)送的內(nèi)容,根據(jù)分析結(jié)果將處理轉(zhuǎn)移至控制部102的各部。具體來說,發(fā)送的內(nèi)容是要求發(fā)送與氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面對(duì)應(yīng)的網(wǎng)頁(yè)時(shí),前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100主要是在閱覽處理部102b取得保存在存儲(chǔ)部106的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的、用于顯示該網(wǎng)頁(yè)的網(wǎng)站數(shù)據(jù),將取得的網(wǎng)站數(shù)據(jù)發(fā)送給客戶端裝置200。更具體地說,利用者要求發(fā)送與氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面對(duì)應(yīng)的網(wǎng)頁(yè)時(shí),前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100首先在控制部102要求利用者輸入利用者ID和利用者密碼。輸入利用者ID和密碼后,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在認(rèn)證處理部102c對(duì)輸入的利用者ID和密碼、與保存在利用者信息文件106a中的利用者ID和利用者密碼進(jìn)行認(rèn)證判斷。只在可以認(rèn)證情況下,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在閱覽處理部102b將用于顯示與氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面對(duì)應(yīng)的網(wǎng)頁(yè)的網(wǎng)站數(shù)據(jù)發(fā)送至客戶端裝置200??蛻舳搜b置200的特定是通過從客戶端裝置200與發(fā)送要求同時(shí)發(fā)送的IP地址進(jìn)行。
[0428]接著,客戶端裝置200在接收部213接收從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的網(wǎng)站數(shù)據(jù)(用于顯示與氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面對(duì)應(yīng)的網(wǎng)頁(yè)),在網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211解釋所接收的網(wǎng)站數(shù)據(jù),將氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面顯示在監(jiān)視器261上。
[0429]接著,利用者經(jīng)由輸入裝置250,對(duì)于顯示在監(jiān)視器261上的氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送畫面進(jìn)行個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)等的輸入、選擇,則客戶端裝置200在發(fā)送部214將用于特定輸入信息和選擇事項(xiàng)的標(biāo)識(shí)符發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100,由此將評(píng)價(jià)對(duì)象個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100 (步驟SA-21)。步驟SA-21中的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的發(fā)送可通過FTP等現(xiàn)有的文件傳輸技術(shù)等來實(shí)現(xiàn)。
[0430]接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在要求解釋部102a解釋從客戶端裝置200發(fā)送的標(biāo)識(shí)符,由此解釋客戶端裝置200的要求內(nèi)容,將前列腺疾病的狀態(tài)評(píng)價(jià)用的多變量判別式的發(fā)送要求發(fā)送至數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400。
[0431]接著,數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400在要求解釋部402a解析來自前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的發(fā)送要求,將存儲(chǔ)在存儲(chǔ)部406的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的、包含Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pr0、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、IIe、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸作為所述變數(shù)的多變量判別式(例如被更新為最新的判別式。該多變量判別式是一個(gè)分?jǐn)?shù)式或復(fù)數(shù)個(gè)分?jǐn)?shù)式之和、或邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、用支持向量機(jī)制作的公式、用馬氏距離法制作的公式、用典型判別分析制作的公式、用決策樹制作的公式中的任意一種。)發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100 (步驟SA-22)。
[0432]這里,步驟SA-22中發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的多變量判別式,當(dāng)在后述的步驟SA-26中判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病時(shí),可以是包含Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys、Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式。具體而言,多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pix)、Ala、CU、ABA作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、CU、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式。
[0433]B1 (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0434]......(數(shù)學(xué)式 I)
[0435](數(shù)學(xué)式I中,C1'屯、O1是任意實(shí)數(shù)。)
[0436]此外,步驟SA-22中發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的多變量判別式,當(dāng)在后述的步驟SA-26中判別是否是前列腺癌或非前列腺癌時(shí),可以是包含Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Cys2 中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式。具體而言,多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Glu、CU、ABA、Val、Orn作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ΑΒΑ、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr>Trp作為變數(shù)的線性判別式。
[0437]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0438]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0439]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0440]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0441 ] a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/He) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0442]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0443](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0444]此外,步驟SA-22中發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的多變量判別式,當(dāng)在后述的步驟SA-26中判別是否是前列腺癌或前列腺肥大時(shí),可以是包含Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp、Lys作為變數(shù)的多變量判別式。具體而言,多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以 Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys 作為變數(shù)的邏輯回歸式或以 Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式。
[0445]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0446]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0447](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0448]返回圖21的說明,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在接收部102f接收從客戶端裝置200發(fā)送的個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)和從數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400發(fā)送的多變量判別式,將接收的氨基酸濃度數(shù)據(jù)保存在氨基酸濃度數(shù)據(jù)文件106b的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域,同時(shí)將接收的多變量判別式保存在多變量判別式文件106e4的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SA-23)。
[0449]接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在控制部102從在步驟SA-23接收的個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中除去缺失值和異常值等數(shù)據(jù)(步驟SA-24)。
[0450]接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在判別值算出部102i,基于在步驟SA-24除去了缺失值和異常值等數(shù)據(jù)的個(gè)體氨基酸濃度數(shù)據(jù)以及在步驟SA-23接收的多變量判別式,算出該多變量判別式的值即判別值(步驟SA-25),在判別值基準(zhǔn)判別部102jl通過比較在步驟SA-25算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?,由此對(duì)于個(gè)體進(jìn)行下述21.?23.表示的判別的任意一種,將該判別結(jié)果保存在評(píng)價(jià)結(jié)果文件106g的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SA-26)。
[0451]21.是否是前列腺疾病或非前列腺疾病的判別
[0452]在步驟SA-25中,基于個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp、Lys> Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、His、Trp> Lys>Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,在步驟SA-26中,通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?而對(duì)于個(gè)體判別是否是前列腺疾病或非前列腺疾病。
[0453]22.是否是前列腺癌或非前列腺癌的判別
[0454]在步驟SA-25中,基于個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Tau、Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp、Orn、Cys2 中的至少一種氨基酸的濃度值以及包含 Tau、Thr> Asn、Glu、Pro、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe、His、Trp> Orn>Cys2中的至少一種氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,在步驟SA-26中,通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?而對(duì)于個(gè)體判別是否是前列腺癌或非前列腺癌。
[0455]23.是否是前列腺癌或前列腺肥大的判別
[0456]在步驟SA-25中,基于個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的Thr、Ser、Gly、CU、Val、His、Trp、Lys的濃度值以及包含Thr、Ser、Gly、Cit、Val、His、Trp、Lys作為變數(shù)的多變量判別式,算出判別值,在步驟SA-26中,通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值(截?cái)嘀?而對(duì)于個(gè)體判別是否是前列腺癌或前列腺肥大。
[0457]返回圖21的說明,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在發(fā)送部102m將在步驟SA-26得到的判別結(jié)果發(fā)送至氨基酸濃度數(shù)據(jù)的發(fā)送源的客戶端裝置200和數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400 (步驟SA-27)。具體而言,首先,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在網(wǎng)頁(yè)生成部102e制作用于顯示判別結(jié)果的網(wǎng)頁(yè),將與制作的網(wǎng)頁(yè)對(duì)應(yīng)的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)保存在存儲(chǔ)部106的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域。接著,利用者經(jīng)由輸入裝置250,向客戶端裝置200的網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211輸入規(guī)定的述認(rèn)證后,客戶端裝置200將該網(wǎng)頁(yè)的閱覽要求發(fā)送給前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100。接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在閱覽處理部102b解釋從客戶端裝置200發(fā)送的閱覽要求,從存儲(chǔ)部106的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域讀取與用于顯示判別結(jié)果的網(wǎng)頁(yè)對(duì)應(yīng)的網(wǎng)站數(shù)據(jù)。前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在發(fā)送部102m將讀取的網(wǎng)站數(shù)據(jù)發(fā)送至客戶端裝置200,同時(shí)將該網(wǎng)站數(shù)據(jù)或判別結(jié)果發(fā)送至數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400。
[0458]這里,在步驟SA-27中,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100可以在控制部102用電子郵件將判別結(jié)果通知利用者的客戶端裝置200。具體來說,首先,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在電子郵件生成部102d,基于利用者ID等,按照發(fā)送時(shí)間,參照保存在利用者信息文件106a中的利用者信息,取得利用者的電子郵件地址。接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在電子郵件生成部102d,以獲得的電子郵件地址為發(fā)送地址,生成包含利用者的姓名和判別結(jié)果的電子郵件相關(guān)的數(shù)據(jù)。接著,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100在發(fā)送部102m將生成的該數(shù)據(jù)發(fā)送至利用者的客戶端裝置200。
[0459]步驟SA-27中,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100可通過FTP等已有的文件傳輸技術(shù)等,將判別結(jié)果發(fā)送至利用者的客戶端裝置200。
[0460]返回圖21的說明,數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400在控制部402接收從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的判別結(jié)果或網(wǎng)站數(shù)據(jù),將接收的判別結(jié)果或網(wǎng)站數(shù)據(jù)保存(積累)在存儲(chǔ)部406的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SA-28)。
[0461]客戶端裝置200在接收部213接收從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的網(wǎng)站數(shù)據(jù),在網(wǎng)頁(yè)瀏覽器211中解釋接收的網(wǎng)站數(shù)據(jù),將記錄有個(gè)體的判別結(jié)果的網(wǎng)頁(yè)的畫面顯示在監(jiān)視器261上(步驟SA-29)。判別結(jié)果用電子郵件從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送時(shí),用電子郵箱212的公知的功能,客戶端裝置200可以在任意的時(shí)間接收從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的電子郵件,并將接收的電子郵件顯示在監(jiān)視器261上。
[0462]以上,利用者通過閱覽在監(jiān)視器261上顯示的網(wǎng)頁(yè),可以確認(rèn)關(guān)于前列腺疾病的個(gè)體的判別結(jié)果。利用者可以用打印機(jī)262打印顯示在監(jiān)視器261上的網(wǎng)頁(yè)的顯示內(nèi)容。
[0463]判別結(jié)果用電子郵件從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送時(shí),利用者通過閱覽在監(jiān)視器261上顯示的電子郵件,可以確認(rèn)關(guān)于前列腺疾病的個(gè)體的判別結(jié)果。利用者可以用打印機(jī)262打印顯示在監(jiān)視器261上的電子郵件的顯示內(nèi)容。
[0464]至此,前列腺疾病服務(wù)處理的說明結(jié)束。
[0465][2-4.第二實(shí)施方式的總結(jié)以及其他實(shí)施方式]
[0466]如上所述詳細(xì)說明,根據(jù)前列腺疾病評(píng)價(jià)系統(tǒng),客戶端裝置200將個(gè)體的氨基酸濃度數(shù)據(jù)發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100,數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400接收來自前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的要求并將前列腺疾病的判別用的多變量判別式發(fā)送至前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100。前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100,(I)從客戶端裝置200接收氨基酸濃度數(shù)據(jù),同時(shí)從數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400接收多變量判別式,⑵基于接收的氨基酸濃度數(shù)據(jù)和多變量判別式算出判別值,⑶通過比較算出的判別值和預(yù)先設(shè)定的閾值,對(duì)于個(gè)體進(jìn)行上述21.?23.表示的判別中的任意一種,(4)將該判別結(jié)果發(fā)送至客戶端裝置200和數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400。客戶端裝置200接收并顯示從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的判別結(jié)果,數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400接收并保存從前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100發(fā)送的判別結(jié)果。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。此外,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0467]此外,在步驟SA-26中進(jìn)行上述21.表示的判別時(shí),多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式I的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met, Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Glu、Gly、Cit、ABA、Val作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺疾病和非前列腺疾病的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0468]al (Tau/ABA) +Id1 (Thr/Cit) +C1 (Glu/Ser) +(I1 (Pro/Asn) +G1
[0469]……(數(shù)學(xué)式I)
[0470](數(shù)學(xué)式I中,bpC1'屯、S1是任意實(shí)數(shù)。)
[0471]此外,在步驟SA-26中進(jìn)行上述22.表示的判別時(shí),多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式2的分?jǐn)?shù)式、數(shù)學(xué)式3的分?jǐn)?shù)式或數(shù)學(xué)式4的分?jǐn)?shù)式、以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn作為變數(shù)的邏輯回歸式、以Tau、Thr、Ala、Trp> Orn、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Glu、Ala、CU、Met、Orn作為變數(shù)的線性判別式、以Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg作為變數(shù)的線性判別式或以Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和非前列腺癌的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0472]a2 (Tau/Trp) +b2 (Thr/Ser) +C2 (Glu/Asn) +d2 (Orn/Gln) +e2
[0473]......(數(shù)學(xué)式 2)
[0474]a3 (Tau/Met) +b3 (Ser/Cit) +C3 (Asn/Thr) +d3 (Glu/Pro) +e3
[0475]......(數(shù)學(xué)式 3)
[0476]a4 (Thr/Orn) +b4 (Ser/Ile) +C4 (Asn/Glu) +d4 (Gln/Tau) +e4
[0477]......(數(shù)學(xué)式 4)
[0478](數(shù)學(xué)式2中,a2、b2、c2、d2、e2是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式3中,a3、b3、c3、d3、e3是任意實(shí)數(shù),數(shù)學(xué)式4中,34、134、。4、(14、64是任意實(shí)數(shù)。)
[0479]此外,在步驟SA-26中進(jìn)行上述23.表示的判別時(shí),多變量判別式可以是數(shù)學(xué)式5的分?jǐn)?shù)式、以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的邏輯回歸式或以Ser、Gin、Gly、CU、Val.Trp作為變數(shù)的邏輯回歸式、或者以Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys作為變數(shù)的線性判別式或以Ser、Gln、Gly、Cit、Val、Trp作為變數(shù)的線性判別式。由此,利用由對(duì)前列腺癌和前列腺肥大的兩組判別特別有用的多變量判別式得到的判別值,可以更高精度地進(jìn)行該兩組判別。
[0480]a5 (Ser/Gln) +b5 (Glu/Tau) +C5 (Ala/Asn) +d5 (Val/Thr) +e5
[0481]......(數(shù)學(xué)式 5)
[0482](數(shù)學(xué)式5中,a5、b5、c5、d5、e5是任意實(shí)數(shù)。)
[0483]此外,上述多變量判別式,可按照本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法、或本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2006/098192號(hào)中記載的方法(后述的多變量判別式制作處理)制作。只要是由這些方法得到的多變量判別式,不論作為輸入數(shù)據(jù)的氨基酸濃度數(shù)據(jù)中的氨基酸濃度單位,都可以合適地將該多變量判別式用于前列腺疾病狀態(tài)的評(píng)價(jià)。
[0484]此外,本發(fā)明除了可以實(shí)施上述的第二實(shí)施方式之外,還可以在權(quán)利要求書記載的技術(shù)思想范圍內(nèi)使用多種不同的實(shí)施方式來實(shí)施。在上述的第二實(shí)施方式中說明的各處理中,以自動(dòng)進(jìn)行的形式說明的處理的全部或一部分可以是手動(dòng)進(jìn)行,以手動(dòng)進(jìn)行的形式說明的處理的全部或一部分可以用公知的方法自動(dòng)進(jìn)行。除此之外,除了特別說明的之外,上述文章中或附圖中表示的處理順序、控制順序、具體名稱、各種登錄數(shù)據(jù)以及包括檢索條件等的參數(shù)的信息、畫面例、數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)成均可任意變更。例如關(guān)于前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100,圖示的各構(gòu)成要素是功能概念性的,物理學(xué)上未必是如圖示的構(gòu)成。另外,關(guān)于前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100的各部或各裝置所具備的處理功能(特別是通過控制部102進(jìn)行的各處理功能),可通過CPU (中央處理單元)以及由該CPU解釋并運(yùn)行的程序來實(shí)現(xiàn)其全部或任意的一部分,也可以以接線邏輯的硬件的形式實(shí)現(xiàn)。
[0485]這里,“程序”是通過任意的語言或記述方法記述的數(shù)據(jù)處理方法,不管其源代碼或二進(jìn)制代碼等的形式?!俺绦颉辈⒉幌抻趩我粯?gòu)成,包含多種模塊或以庫(kù)的形式分散構(gòu)成的程序、或與以O(shè)S(操作系統(tǒng))為代表的個(gè)別程序協(xié)作來實(shí)現(xiàn)其功能的程序。程序記錄在記錄介質(zhì)上,根據(jù)需要可以機(jī)械讀取到前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100中。關(guān)于在各裝置中讀取記錄在記錄介質(zhì)上的程序的具體的構(gòu)成或讀取工序或讀取后的安裝工序等,可以采用周知的構(gòu)成或工序。
[0486]“記錄介質(zhì)”包含任意的“可移動(dòng)的物理介質(zhì)”、任意的“固定用的物理介質(zhì)”和“通信介質(zhì)”。“可移動(dòng)的物理介質(zhì)”是軟盤、光磁盤、R0M、EPR0M、EEPR0M、CD_R0M、M0或DVD等?!肮潭ǖ奈锢斫橘|(zhì)”是內(nèi)置于各種計(jì)算機(jī)系統(tǒng)的ROM、RAM或HD等。“通信介質(zhì)”如經(jīng)由LAN或WAN或互聯(lián)網(wǎng)等網(wǎng)絡(luò)發(fā)送程序時(shí)的通信線路或載波,是短期保持程序的介質(zhì)。
[0487]最后,參照?qǐng)D22對(duì)于在前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100中進(jìn)行的多變量判別式制作處理的一個(gè)例子進(jìn)行詳細(xì)說明。圖22是表示多變量判別式制作處理的一個(gè)例子的流程圖。該多變量判別式制作處理可以在管理前列腺疾病狀態(tài)信息的數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400中進(jìn)行。
[0488]本說明中,前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100是將事先從數(shù)據(jù)庫(kù)裝置400取得的前列腺疾病狀態(tài)信息保存在前列腺疾病狀態(tài)信息文件106c的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域。前列腺疾病評(píng)價(jià)裝置100是將事先在前列腺疾病狀態(tài)信息指定部102g中指定的包含前列腺疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)據(jù)和氨基酸濃度數(shù)據(jù)的前列腺疾病狀態(tài)信息保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域。
[0489]首先,多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式制作部102hl中,根據(jù)規(guī)定的公式制作方法,從保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的前列腺疾病狀態(tài)信息制作候選多變量判別式,將制作的候選多變量判別式保存在候選多變量判別式文件106el的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SB-21)。具體來說,首先,多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式制作部102hl中,從多種不同的公式制作方法(包含關(guān)于主成分分析或判別分析、支持向量機(jī)、多重回歸分析、邏輯回歸分析、k-means法、聚類分析、決策樹等的多變量分析的方法)中選擇所需的一種,根據(jù)所選擇的公式制作方法,確定制作的候選多變量判別式的形式(公式的形式)。接著,多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式制作部102hl中,基于前列腺疾病狀態(tài)信息,運(yùn)行與所選擇的公式選擇方法對(duì)應(yīng)的各種(例如平均或分散等)的計(jì)算。接著,多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式制作部102hl中,確定計(jì)算結(jié)果和所確定的候選多變量判別式的參數(shù)。由此,基于所選擇的公式制作方法來制作候選多變量判別式。并用多種不同的公式制作方法并同時(shí)并行(并列)地制作候選多變量判別式時(shí),可以根據(jù)每種所選擇的公式制作方法,將上述處理并行運(yùn)行。另外,并用多種不同的公式制作方法并依次制作候選多變量判別式時(shí),例如可以利用進(jìn)行主成分分析而制作的候選多變量判別式,變換前列腺疾病狀態(tài)信息,對(duì)變換的前列腺疾病狀態(tài)信息進(jìn)行判別分析,由此制作候選多變量判別式。
[0490]接著,多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2中,根據(jù)規(guī)定的驗(yàn)證方法,對(duì)在步驟SB-21中制作的候選多變量判別式進(jìn)行驗(yàn)證(相互驗(yàn)證),將驗(yàn)證結(jié)果保存在驗(yàn)證結(jié)果文件106e2的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SB-22)。具體來說,多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2中,基于保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的前列腺疾病狀態(tài)信息,制作驗(yàn)證候選多變量判別式時(shí)使用的驗(yàn)證用數(shù)據(jù),基于制作的驗(yàn)證用數(shù)據(jù)來驗(yàn)證候選多變量判別式。在步驟SB-21中并用多種不同的公式制作方法來制作多種候選多變量判別式時(shí),多變量判別式制作部102h是在候選多變量判別式驗(yàn)證部102h2中,對(duì)于每種與各公式制作方法對(duì)應(yīng)的候選多變量判別式,基于規(guī)定的驗(yàn)證方法進(jìn)行驗(yàn)證。這里,在步驟SB-22中,可以基于自舉法或保持法、留一法等中的至少一種方法,對(duì)候選多變量判別式的判別率或靈敏度、特異性、信息量基準(zhǔn)等中的至少一種進(jìn)行驗(yàn)證。由此,可以選擇考慮了前列腺疾病狀態(tài)信息或診斷條件的、預(yù)測(cè)性或可靠性高的候選指標(biāo)式。
[0491]接著,多變量判別式制作部102h是在變數(shù)選擇部102h3中,基于規(guī)定的變數(shù)選擇方法,從在步驟SB-22中的驗(yàn)證結(jié)果選擇候選多變量判別式的變數(shù),由此選擇在制作候選多變量判別式時(shí)使用的前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合,將包含所選擇的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合的前列腺疾病狀態(tài)信息保存在選擇前列腺疾病狀態(tài)信息文件106e3的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SB-23)。在步驟SB-21中,并用多種不同的公式制作方法,制作多種候選多變量判別式,在步驟SB-22中,基于規(guī)定的驗(yàn)證方法,對(duì)于每種與各公式制作方法對(duì)應(yīng)的候選多變量判別式進(jìn)行驗(yàn)證時(shí),在步驟SB-23中,多變量判別式制作部102h是在變數(shù)選擇部102h3中,對(duì)每種與步驟SB-22的驗(yàn)證結(jié)果對(duì)應(yīng)的候選多變量判別式,基于規(guī)定的變數(shù)選擇方法選擇候選多變量判別式的變數(shù)。這里,步驟SB-23中,可以基于逐步法、最優(yōu)路徑法、局部探索法、遺傳算法中的至少一種方法,從驗(yàn)證結(jié)果選擇候選多變量判別式的變數(shù)。最優(yōu)路徑法是將候選多變量判別式中所含的變數(shù)一個(gè)個(gè)依次減少,使候選多變量判別式所賦予的評(píng)價(jià)指標(biāo)最佳化,由此選擇變數(shù)的方法。步驟SB-23中,多變量判別式制作部102h可以是在變數(shù)選擇部102h3中,基于保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的前列腺疾病狀態(tài)信息,選擇氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合。
[0492]接著,多變量判別式制作部102h判定保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的全部的組合是否結(jié)束,判定結(jié)果是“結(jié)束”時(shí)(步驟SB-24:是),進(jìn)入下一步驟(步驟SB-25),判定結(jié)果不是“結(jié)束”時(shí)(步驟SB-24:否),返回步驟SB-21。多變量判別式制作部102h判定預(yù)先設(shè)定的次數(shù)是否結(jié)束,判定結(jié)果是“結(jié)束”時(shí)(步驟SB-24:是),進(jìn)入下一步驟(步驟SB-25),判定結(jié)果不是“結(jié)束”時(shí)(步驟SB-24:否),可以返回步驟SB-21。多變量判別式制作部102h判定在步驟SB-23中選擇的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合與保存在指定前列腺疾病狀態(tài)信息文件106d的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域的前列腺疾病狀態(tài)信息中所含的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合或在上一步驟SB-23中選擇的氨基酸濃度數(shù)據(jù)的組合是否相同,判定結(jié)果是“相同”時(shí)(步驟SB-24:是),進(jìn)入下一步驟(步驟SB-25),判定結(jié)果不是“相同”時(shí)(步驟SB-24:否),可以返回步驟SB-21。驗(yàn)證結(jié)果具體為關(guān)于各候選多變量判別式的評(píng)價(jià)值時(shí),多變量判別式制作部102h可基于該評(píng)價(jià)值和與各公式制作方法對(duì)應(yīng)的規(guī)定的閥值的比較結(jié)果,判定是進(jìn)入步驟SB-25還是返回步驟SB-21。
[0493]接著,多變量判別式制作部102h基于驗(yàn)證結(jié)果,從多種候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,由此確定多變量判別式,將確定的多變量判別式(選出的候選多變量判別式)保存在多變量判別式文件106e4的規(guī)定的存儲(chǔ)區(qū)域(步驟SB-25)。這里,在步驟SB-25中,例如有從用相同的公式制作方法制作的候選多變量判別式中選出最佳的多變量判別式的情況,也有從全部的候選多變量判別式中選出最佳的多變量判別式的情況。
[0494]至此,對(duì)多變量判別式制作處理的說明結(jié)束。
[0495]實(shí)施例1
[0496]利用上述氨基酸分析法,從通過前列腺活檢進(jìn)行前列腺癌的診斷的前列腺癌患者組的血液樣品以及非前列腺癌組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖23(橫軸為非前列腺癌組:1,前列腺癌組:2)所示。以前列腺癌組和非前列腺癌組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0497]與非前列腺癌組相比,前列腺癌組中,Ala、Tau、Cys2、0rn顯著增加,Leu、Trp、Val、Ile顯著減少。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Ala、Tau、Cys2、Orn、Leu、Trp、Val、He具有前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組間的判別能力。
[0498]實(shí)施例2
[0499]使用實(shí)施例1中所用的樣品數(shù)據(jù)。使用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法,對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行深入探索。其結(jié)果,在具有同等性能的復(fù)數(shù)個(gè)指標(biāo)式中得到指標(biāo)式I。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式I具有同等判別性能的多變量判別式。將它們?cè)趫D24、圖25中表示。此夕卜,圖24、圖25中表示的公式中的各系數(shù)的值,可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0500]指標(biāo)式1:
[0501 ] 0.24 (Tau) / (Trp) -0.03 (Thr) / (Ser) -0.002 (Glu) / (Asn) +2.13 (Orn) / (Gln) +0.72
[0502]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式I的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D26)。其結(jié)果,得到0.941±0.012 (95%置信區(qū)間為0.917?0.966)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式I的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率(symptom prevalence)為5%的最合適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.086,而且得到靈敏度96.67%,特異性80.25%,陽性預(yù)中率20.48 %、陰性預(yù)中率99.78 %、正確診斷率81.07 %。從這些結(jié)果判明指標(biāo)式I是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0503]實(shí)施例3
[0504]使用實(shí)施例1中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法(変數(shù)網(wǎng)羅法)),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式2,得到由Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù)Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg的數(shù)字系數(shù)(numeral coefficient)和常數(shù)項(xiàng)依次為0.0519,0.0137,0.0792、_0.1079,0.0795、-0.0201,-8.5123)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式2具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖27、圖28中。此外,圖27、圖28所示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0505]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式2的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D29)。其結(jié)果得到0.950±0.011 (95%置信區(qū)間為0.929?0.971)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式2的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪銮傲邢侔┙M的發(fā)病率為5%的最合適的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?.060,而且得到靈敏度90.00%,特異性89.24%,陽性預(yù)中率30.57%、陰性預(yù)中率99.41%、正確診斷率89.28%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式2是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0506]實(shí)施例4
[0507]使用實(shí)施例1中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式3,得到由Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù)Tau、Ala、ABA、Trp、Orn、Arg 的數(shù)字系數(shù)依次為 5.713e-01、6.033e_02、2.377e_01、-5.546e_01、5.431e_01、-1.042e-OU-3.573e+01)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式3具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖30、圖31中。此外,圖30、圖31中表示的公式中的各系數(shù)的值,可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0508]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式3的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D32)。其結(jié)果得到0.954 ± 0.010 (95%置信區(qū)間為0.934?0.974)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式3的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為5%的最適的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?1.15,而且得到靈敏度93.33%,特異性90.12%、陽性預(yù)中率33.22%,陰性預(yù)中率99.61 %、正確診斷率90.28%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式3是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0509]實(shí)施例5
[0510]利用上述氨基酸分析法,從通過前列腺活檢進(jìn)行前列腺癌的診斷的前列腺癌患者組的血液樣品以及非前列腺癌組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖33(橫軸為非前列腺癌組:1,前列腺癌組:2)所示。以前列腺癌組和非前列腺癌組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0511]與非前列腺癌組相比,前列腺癌組中,了311顯著增加,6111、(:行、484工782、]^1116、Trp顯著減少。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Tau、Glu、CU、ABA、Cys2、Met、lie、Trp具有前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組間的判別能力。
[0512]實(shí)施例6
[0513]使用實(shí)施例5中所用的樣品數(shù)據(jù)。使用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法,對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行深入探索。其結(jié)果,在具有同等性能的復(fù)數(shù)個(gè)指標(biāo)中得到指標(biāo)式4。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式4具有同等判別性能的多變量判別式。將它們表示在圖34、圖35中。此外,圖34、圖35中表示的公式中的各系數(shù)的值,可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0514]指標(biāo)式4:
[0515]0.19 (Tau) / (Met) +0.13 (Ser) / (Cit) +0.25 (Asn) / (Thr) -0.75 (Glu) / (Pro) +0.50
[0516]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式4的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D36)。其結(jié)果得到0.969±0.013 (95%置信區(qū)間為0.943?0.995)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式I的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪銮傲邢侔┙M的發(fā)病率為22%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.264,而且得到靈敏度96.67%,特異性88.68%,陽性預(yù)中率70.66%,陰性預(yù)中率98.95%、正確診斷率90.44%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式4是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0517]實(shí)施例7
[0518]使用實(shí)施例5中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式5,得到由Tau、Glu、CU、ABA、Val、Orn構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù)Tau、Glu、Cit、ABA、Val、Orn 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為 0.0760、-0.1100、-0.4990、-0.3076、0.0418,0.0992,0.8657)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式5具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖37、圖38中。此外,圖37、圖38表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0519]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式5的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D39)。其結(jié)果得到0.988 ± 0.008 (95%置信區(qū)間為0.972?I)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式5的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為22%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.269,而且得到靈敏度93.33%,特異性92.93%、陽性預(yù)中率78.83%、陰性預(yù)中率98.02%、正確診斷率93.02%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式5是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0520]實(shí)施例8
[0521]使用實(shí)施例5中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式6,得到由Tau、Glu、Ala、Cit、Met、Orn構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù)Tau、Glu、Ala、Cit、Met、Orn 的數(shù)字系數(shù)依次為 _3.776e_01、2.843e_01、-2.857e_02、5.645e_01、6.426e_01、-2.102e-01、-5.599e+00)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式6具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖40、圖41中。此外,圖40、圖41中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0522]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式6的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D42)。其結(jié)果得到0.978±0.011 (95%置信區(qū)間為0.957?I)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式6的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為22%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?4.27,而且得到靈敏度93.33%,特異性84.22%、陽性預(yù)中率69.93%、陰性預(yù)中率97.92%、正確診斷率89.70%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式6是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0523]實(shí)施例9
[0524]利用上述氨基酸分析法,從通過前列腺活檢進(jìn)行前列腺癌的診斷的前列腺癌患者組的血液樣品以及非前列腺癌組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖43 (橫軸為非前列腺癌組:1,前列腺癌組:2)所示。以前列腺癌組和非前列腺癌組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0525]與非前列腺癌組相比,前列腺癌組中,了311、6111413工782、0111顯著增加,]^1116、Leu、Phe、Trp顯著減少。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Tau、Glu、Ala、Cys2、Orn、Met、lie、Leu、Phe、Trp具有前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組間的判別能力。
[0526]實(shí)施例10
[0527]使用實(shí)施例9中所用的樣品數(shù)據(jù)。使用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法,對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行深入探索。其結(jié)果,在具有同等性能的復(fù)數(shù)個(gè)指標(biāo)中得到指標(biāo)式7。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式7具有同等判別性能的多變量判別式。將它們表示在圖44、圖45中。此外,圖44、圖45中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0528]指標(biāo)式7:
[0529]-0.34 (Thr) / (Orn) +0.25 (Ser) / (He) -0.03 (Asn) / (Glu) -0.08 (Gln) / (Tau) +2.62
[0530]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式7的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D46)。其結(jié)果得到0.958±0.021 (95%置信區(qū)間為0.916?0.999)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式7的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為37%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.426,而且得到靈敏度93.33%,特異性88.46%,陽性預(yù)中率82.61 %、陰性預(yù)中率95.76 %、正確診斷率90.26 %。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式7是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0531]實(shí)施例11
[0532]使用實(shí)施例9中所的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式8,得到由Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù)Tau、Thr、Ala、Trp、Orn、Arg 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為 0.3610、-0.1862,0.0604、-0.2344、0.4838,-0.1130,-25.0814)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式8具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖47、圖48中。此外,圖47、圖48表示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0533]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式8的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D49)。其結(jié)果得到0.985 ± 0.014 (95%置信區(qū)間為0.957?I)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式8的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪銮傲邢侔┙M的發(fā)病率為37%的最適的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?.355,而且得到靈敏度96.67%,特異性90.24%、陽性預(yù)中率85.34%、陰性預(yù)中率97.88%、正確診斷率92.62%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式8是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0534]實(shí)施例12
[0535]使用實(shí)施例9中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式9,得到由Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù)Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg 的數(shù)字系數(shù)依次為-6.459e-01、l.829e_01、-1.391e_01、-7.718e_02、-6.794e_01、2.498e-01、7.303e+01)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式9具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖50、圖51中。此外,圖50、圖51中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0536]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式9的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D52)。其結(jié)果得到0.981 ± 0.014 (95%置信區(qū)間為0.954?I)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式9的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪銮傲邢侔┙M的發(fā)病率為37%的最適的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?.32,而且得到靈敏度96.67%,特異性88.46%、陽性預(yù)中率83.12%、陰性預(yù)中率97.83%、正確診斷率91.50%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式9是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0537]實(shí)施例13
[0538]利用上述氨基酸分析法,從通過前列腺活檢進(jìn)行前列腺癌的診斷的前列腺癌患者組的血液樣品以及前列腺肥大患者組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺癌組和前列腺肥大組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖53(橫軸為前列腺肥大組:1,前列腺癌組:2)所示。以前列腺癌組和前列腺肥大組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0539]與前列腺肥大組相比,前列腺癌組中,Thr顯著減少。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Thr具有前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組間的判別能力。
[0540]實(shí)施例14
[0541]使用實(shí)施例13中所用的樣品數(shù)據(jù)。使用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法,對(duì)使前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行深入探索。其結(jié)果,在具有同等性能的復(fù)數(shù)個(gè)指標(biāo)中得到指標(biāo)式10。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式10具有同等判別性能的多變量判別式。將它們表示在圖54、圖55中。此外,圖54、圖55中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0542]指標(biāo)式10:
[0543]3.77 (Ser) / (Gln) -0.31 (Glu) / (Tau) +0.07 (Ala) / (Asn) +0.26 (Val) / (Thr) -0.16
[0544]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式10的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D56)。其結(jié)果得到0.780±0.066(95%置信區(qū)間為0.650?0.910)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式10的前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為45%的最適的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?.587,而且得到靈敏度73.33%,特異性73.91 %、陽性預(yù)中率69.70%、陰性預(yù)中率77.21 %、正確診斷率73.65%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式10是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0545]實(shí)施例15
[0546]使用實(shí)施例13中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式11,得到由Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù) Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為-0.0634,0.0101,0.0169、0.0569,-0.0934,-0.0224,5.3209)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式11具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖57、圖58中。此外,圖57、圖58表示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0547]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式11的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D59)。其結(jié)果得到0.832±0.059 (95%置信區(qū)間為0.716?0.948)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式11的前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為37%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.552,而且得到靈敏度83.33%,特異性78.26%、陽性預(yù)中率75.82%、陰性預(yù)中率85.16%、正確診斷率80.54%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式11是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0548]實(shí)施例16
[0549]使用實(shí)施例13中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式12,得到由Thr、Ala、Val、Tyr、Trp、Lys構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù)Tau、Thr、Ser、Ala、Orn、Arg 的數(shù)字系數(shù)依次為-5.143e_01、8.710e_02、l.289e_01、4.425e-01、-6.921e_01、-l.912e_01、3.929e+01)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式 12 具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖60、圖61中。此外,圖60、圖61中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0550]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式12的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D62)。其結(jié)果得到0.820±0.061 (95%置信區(qū)間為0.700?0.940)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式12的前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺癌組的發(fā)病率為45%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?1.50,而且得到靈敏度83.33%,特異性73.91 %、陽性預(yù)中率72.33%、陰性預(yù)中率84.42%、正確診斷率78.15%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式12是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0551]實(shí)施例17
[0552]利用上述氨基酸分析法,從利用前列腺活檢進(jìn)行前列腺疾病的診斷的前列腺癌、前列腺肥大這樣的前列腺疾病患者組的血液樣品、以及非前列腺疾病組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺疾病組和非前列腺疾病組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖63(橫軸為非前列腺疾病組:1,前列腺疾病組:2)所示。以前列腺疾病組和非前列腺疾病組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0553]與非前列腺疾病組相比,前列腺疾病組中,Tau、Asn、Gly、Lys顯著增加,Glu、Cit、ABA、Cys2、Met、He顯著減少。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Tau、Asn、Gly、Lys、Glu、Cit、ABA、Cys2、Met、He具有前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組間的判別能力。
[0554]實(shí)施例18
[0555]使用實(shí)施例17中所用的樣品數(shù)據(jù)。使用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2004/052191號(hào)中記載的方法,對(duì)使前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行深入探索。其結(jié)果,在具有同等性能的復(fù)數(shù)個(gè)指標(biāo)中得到指標(biāo)式13。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式13具有同等判別性能的多變量判別式。將它們表示在圖64、圖65中。此外,圖64、圖65中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0556]指標(biāo)式13:
[0557]0.12 (Tau) / (ABA) +0.14 (Thr) / (Cit) -0.38 (Glu) / (Ser) +0.01 (Pro) / (Asn) +0.50
[0558]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式13的前列腺疾病的診斷性能,對(duì)于前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D66)。其結(jié)果得到0.977 + 0.011 (95%置信區(qū)間為0.955?0.998)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式13的前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出前列腺疾病組的發(fā)病率為33%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.268,而且得到靈敏度96.23%,特異性80.19%、陽性預(yù)中率70.52%,陰性預(yù)中率97.73%、正確診斷率85.48%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式13是診斷性能聞的有用的指標(biāo)式。
[0559]實(shí)施例19
[0560]使用實(shí)施例17中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式14,得到由Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù) Tau、Glu、Pro、Ala、CU、ABA 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為 0.0778、-0.0705、-0.0074、0.0209,-0.489 K-0.3098,9.2727)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式14具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖67、圖68中。此外,圖67、圖68表示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0561]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式14的前列腺疾病的診斷性能,對(duì)于前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D69)。其結(jié)果得到0.982±0.009 (95%置信區(qū)間為0.963?1.000)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式14的前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪銮傲邢偌膊〗M的發(fā)病率為37%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.450,而且得到靈敏度90.57%,特異性100.00%、陽性預(yù)中率100.00%、陰性預(yù)中率95.56%、正確診斷率96.89%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式14是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0562]實(shí)施例20
[0563]使用實(shí)施例17中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式15,得到由Tau、Glu、Gly、CU、ABA、Val構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù)Tau、Glu、Gly、Cit、ABA、Val 的數(shù)字系數(shù)依次為-3.158e_01、l.439e_01、-5.537e_02、6.746e_01、6.473e-01、-4.858e_02、2.269e+00)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式15具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖70、圖71中。此外,圖70、圖71中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0564]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式15的前列腺疾病的診斷性能,對(duì)于前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D72)。其結(jié)果得到0.850±0.032 (95%置信區(qū)間為0.788?0.913)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式15的前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪銮傲邢偌膊〗M的發(fā)病率為33%的最適的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?5.34,而且得到靈敏度80.00%,特異性80.62%、陽性預(yù)中率67.03%、陰性預(yù)中率89.11 %、正確診斷率為80.41%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式15是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0565]實(shí)施例21
[0566]使用實(shí)施例1、13、17中所用的樣品數(shù)據(jù)。作為相對(duì)于上述實(shí)施例2、14、18的比較例,使用本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2008/016111號(hào)中記載的指標(biāo)式1、10、11、13,對(duì)前列腺癌組和健康組、前列腺肥大組和前列腺癌組、以及前列腺疾病組和健康組的兩組判別性能進(jìn)行驗(yàn)證。其結(jié)果,如圖73所示,對(duì)于各兩組判別,不管使用哪個(gè)公式,也得不到超過在上述實(shí)施例2、14、18中得到的R0C_AUC的R0C_AUC的值。由此,可確認(rèn)關(guān)于這些判別本發(fā)明中的多變量判別式具有比本 申請(qǐng)人:的國(guó)際申請(qǐng)即國(guó)際公開第2008/016111號(hào)中記載的指標(biāo)式組更高的判別性能。
[0567]實(shí)施例22
[0568]利用上述氨基酸分析法,從利用前列腺活檢進(jìn)行前列腺癌的診斷的前列腺癌患者組的血液樣品以及非前列腺癌組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺癌組和非前列腺癌組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖74(橫軸為非前列腺癌組:1,前列腺癌組:2)所示。以前列腺癌組和非前列腺癌組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0569]與非前列腺癌組相比,前列腺癌組中,Thr、Asn、Ala、His顯著增加,Val、Met、Leu、Trp顯著減少(顯著性差異概率P < 0.05)。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Thr、Asn、Ala、His、Val.Met, Leu、Trp具有前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組間的判別能力。
[0570]實(shí)施例23
[0571]使用實(shí)施例22中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式16,得到由Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù)Asn、Ala、Val、Met、Trp、Arg 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為 0.08585,0.01405,-0.01816,-0.11079、-0.08095、-0.02272,3.18118)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式16具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖75、圖76、圖77、圖78中。此外,圖75、圖76、圖77、圖78表示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0572]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式16的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D79)。其結(jié)果得到0.850±0.031 (95%置信區(qū)間為0.789?0.911)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式16的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出靈敏度和特異性的平均值為最大的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?0.1574,而且得到靈敏度82%,特異性76 %。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式16是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0573]實(shí)施例24
[0574]使用實(shí)施例22中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式17,得到由Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù) Asn、Ala、Val、Met、Tyr、Trp 的數(shù)字系數(shù)依次為 0.07557,0.01311,-0.01544,-0.16644、0.02693、-0.08447,2.48506)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式17具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖80、圖81、圖82、圖83中。此外,圖80、圖81、圖82、圖83中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0575]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式17的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D84)。其結(jié)果得到0.852±0.028 (95%置信區(qū)間為0.797?0.906)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式17的前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出靈敏度和特異性的平均值為最大的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?0.4851,而且得到靈敏度93 %,特異性64 %。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式17是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0576]實(shí)施例25
[0577]使用實(shí)施例22中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用變數(shù)覆蓋法,將進(jìn)行前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組判別的線性判別式全部提取出。此時(shí),使各式中出現(xiàn)的氨基酸變數(shù)的最大值為6,計(jì)算滿足該條件的所有公式的ROC曲線下面積。此時(shí),在ROC曲線下面積為某閾值以上的公式中,測(cè)定各氨基酸出現(xiàn)的頻率,結(jié)果可確認(rèn),當(dāng)將ROC曲線下面積0.7、0.75、0.8分別作為閾值時(shí),Ala、Trp、Val、Met、Leu、Asn、His、Thr、Pro經(jīng)常在被高頻率提取的氨基酸的前十位以內(nèi),判明使用這些氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式具有前列腺癌組和非前列腺癌組的兩組間的判別能力(參照?qǐng)D85)。
[0578]實(shí)施例26
[0579]利用上述氨基酸分析法,從利用前列腺活檢進(jìn)行前列腺癌的診斷的前列腺癌患者組的血液樣品以及前列腺肥大患者組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺癌組和前列腺肥大組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖86 (橫軸為前列腺肥大組:1,前列腺癌組:2)所示。以前列腺癌組和前列腺肥大組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0580]與前列腺肥大組相比,前列腺癌組中,Gly、Trp、Lys顯著減少(顯著性差異概率P< 0.05)。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Gly、Trp、Lys具有前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組間的判別能力。
[0581]實(shí)施例27
[0582]使用實(shí)施例26中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式18,得到由Ser、Gin、Gly、CU、Val、Trp構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù) Ser、Gin、Gly、Cit、Val、Trp 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為 0.05102,0.01259、-0.05243、0.05778,-0.02344,-0.05969,6.78981)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式18具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖87、圖88、圖89、圖90中。此外,圖87、圖88、圖89、圖90表示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0583]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式18的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D91)。其結(jié)果得到0.848±0.041 (95%置信區(qū)間為0.768?0.929)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式18的前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出靈敏度和特異性的平均值為最大的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?.3355,而且得到靈敏度71%,特異性85%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式18是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0584]實(shí)施例28
[0585]使用實(shí)施例26中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式19,得到由Ser、Gin、Gly、Cit、Val、Trp構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù) Ser、Gin、Gly、Cit、Val、Trp 的數(shù)字系數(shù)依次為 0.03070,0.00620、-0.03718、0.05108,-0.0164U-0.03504,5.98134)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式19具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖92、圖93、圖94、圖95中。此外,圖92、圖93、圖94、圖95中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0586]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式19的前列腺癌的診斷性能,對(duì)于前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D96)。其結(jié)果得到0.844±0.042 (95%置信區(qū)間為0.762?0.926)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式19的前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別的截?cái)嘀担蟪鲮`敏度和特異性的平均值為最大的截?cái)嘀怠F浣Y(jié)果截?cái)嘀禐?0.1540,而且得到靈敏度73%,特異性82%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式19是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0587]實(shí)施例29
[0588]使用實(shí)施例26中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用變數(shù)覆蓋法,將進(jìn)行前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組判別的線性判別式全部提取出。此時(shí),使各式中出現(xiàn)的氨基酸變數(shù)的最大值為6,計(jì)算滿足該條件的所有公式的ROC曲線下面積。此時(shí),在ROC曲線下面積為某閾值以上的公式中,測(cè)定各氨基酸出現(xiàn)頻率,結(jié)果可確認(rèn),當(dāng)分別將ROC曲線下面積0.7,0.75,0.8作為閾值時(shí),Gly、Val、Ser、Trp、CU、Lys, His經(jīng)常在被高頻率提取的氨基酸的前十位以內(nèi),判明使用這些氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式具有前列腺癌組和前列腺肥大組的兩組間的判別能力(參照?qǐng)D97)。
[0589]實(shí)施例30
[0590]利用上述氨基酸分析法,從利用前列腺活檢進(jìn)行前列腺疾病的診斷的前列腺癌、前列腺肥大這樣的前列腺疾病患者組的血液樣品、以及非前列腺疾病組的血液樣品,測(cè)定血中氨基酸濃度。與前列腺疾病組和非前列腺疾病組的氨基酸變數(shù)分布有關(guān)的箱線圖如圖98(橫軸為非前列腺疾病組:1,前列腺疾病組:2)所示。以前列腺疾病組和非前列腺疾病組的判別為目的,實(shí)施兩組間的t檢驗(yàn)。
[0591 ] 與非前列腺疾病組相比,前列腺疾病組中,Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、His顯著增加,Cit、Val、Met、Leu、Trp顯著減少。由該結(jié)果判明,氨基酸變數(shù)Thr、Asn、Glu、Pro、Ala、His、CU、Val、Met、Leu、Trp具有前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組間的判別能力。
[0592]實(shí)施例31
[0593]使用實(shí)施例30中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用邏輯分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式20,得到由Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp構(gòu)成的邏輯回歸式(氨基酸變數(shù)Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp 的數(shù)字系數(shù)和常數(shù)項(xiàng)依次為 0.09273,0.02241,0.01196、-0.01415,-0.12983,-0.05678,-0.7474)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式20具有同等判別性能的邏輯回歸式。將它們表示在圖99、圖100、圖101、圖102中。此外,圖99、圖100、圖101、圖102表示的公式中的各系數(shù)值可以是其實(shí)數(shù)倍的值。
[0594]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式20的前列腺疾病的診斷性能,對(duì)于前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D103)。其結(jié)果得到0.822±0.026 (95%置信區(qū)間為0.772?0.872)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式20的前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出靈敏度和特異性的平均值為最大的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?1.239,而且得到靈敏度86%,特異性66%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式20是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0595]實(shí)施例32
[0596]使用實(shí)施例30中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用線性判別分析(根據(jù)ROC最大基準(zhǔn)的變數(shù)覆蓋法),對(duì)使前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別性能最大化的指標(biāo)進(jìn)行探索。其結(jié)果,作為指標(biāo)式21,得到由Asn、Glu、Ala、Val、Met、Trp構(gòu)成的線性判別函數(shù)(氨基酸變數(shù)六811、6111、六1&、¥&1、]^扒1'印的數(shù)字系數(shù)依次為 0.08591,0.01994,0.01194,-0.01250、-0.13483、-0.05252,0.15837)。此外,得到復(fù)數(shù)個(gè)與指標(biāo)式21具有同等判別性能的線性判別函數(shù)。將它們表示在圖104、圖105、圖106、圖107中。此外,圖104、圖105、圖106、圖107中表示的公式中的各系數(shù)的值可以是其實(shí)數(shù)倍的值、或是附加了任意的常數(shù)項(xiàng)的值。
[0597]為了驗(yàn)證利用指標(biāo)式21的前列腺疾病的診斷性能,對(duì)于前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別,利用ROC曲線的曲線下面積進(jìn)行評(píng)價(jià)(參照?qǐng)D108)。其結(jié)果得到0.822±0.026 (95%置信區(qū)間為0.772?0.872)。此外,對(duì)于利用指標(biāo)式21的前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別的截?cái)嘀?,求出靈敏度和特異性的平均值為最大的截?cái)嘀?。其結(jié)果截?cái)嘀禐?0.2271,而且得到靈敏度85%,特異性65%。從這些結(jié)果判明,指標(biāo)式21是診斷性能高的有用的指標(biāo)式。
[0598]實(shí)施例33
[0599]使用實(shí)施例30中所用的樣品數(shù)據(jù)。利用變數(shù)覆蓋法,將進(jìn)行前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組判別的線性判別式全部提取出。此時(shí),使各式中出現(xiàn)的氨基酸變數(shù)的最大值為6,計(jì)算滿足該條件的所有公式的ROC曲線下面積。此時(shí),在ROC曲線下面積為某閾值以上的公式中,測(cè)定各氨基酸出現(xiàn)的頻率,結(jié)果可確認(rèn),當(dāng)將ROC曲線下面積0.7,0.75、0.8分別作為閾值時(shí),Ala、Met、Asn、Trp、Leu、His、Val,Glu、Cit經(jīng)常在被高頻率提取的氨基酸的前十位以內(nèi),判明使用這些氨基酸作為變數(shù)的多變量判別式具有前列腺疾病組和非前列腺疾病組的兩組間的判別能力(參照?qǐng)D109)。
[0600]工業(yè)實(shí)用性
[0601]如上所述,本發(fā)明涉及的前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法,可在工業(yè)上的很多領(lǐng)域、特別是藥品、食品、醫(yī)療等領(lǐng)域廣泛地實(shí)施,特別是在進(jìn)行前列腺疾病的病況預(yù)測(cè)、疾病危險(xiǎn)預(yù)測(cè)等領(lǐng)域中極其有用。
【權(quán)利要求】
1.前列腺疾病的評(píng)價(jià)方法,其特征在于,包括: 獲取步驟,從采集自評(píng)價(jià)對(duì)象的血液獲取與氨基酸的濃度值相關(guān)的氨基酸濃度數(shù)據(jù);以及 濃度值基準(zhǔn)評(píng)價(jià)步驟,基于在所述獲取步驟中獲取的所述評(píng)價(jià)對(duì)象的所述氨基酸濃度數(shù)據(jù)中所含的 Tau、Thr、Ser、Asn、Glu、Pro、Gly、Ala、Cit、ABA、Val、Met、lie、Leu、Phe>His、Trp> Orn> Lys> Cys2中的至少一種氨基酸的所述濃度值,對(duì)于所述評(píng)價(jià)對(duì)象,評(píng)價(jià)包括前列腺癌和前列腺肥大中的至少一種的前列腺疾病的狀態(tài)。
【文檔編號(hào)】G01N33/68GK104330571SQ201410575190
【公開日】2015年2月4日 申請(qǐng)日期:2009年6月22日 優(yōu)先權(quán)日:2008年6月20日
【發(fā)明者】岡本直幸, 三浦猛, 宮城洋平, 今泉明, 山本浩史, 田中孝幸, 村松孝彥, 安東敏彥, 高橋紀(jì)子 申請(qǐng)人:味之素株式會(huì)社