一種用于輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒的制作方法
【技術領域】
[0001] 本發明涉及一種用于輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒。
【背景技術】
[0002] 食管癌是常見的惡性腫瘤，是全球第六大癌癥死因。食管癌有兩個主要的病理類 型：腺癌（Esophagus Adenocarcinoma, EAC)和鱗癌（ESCC)。世界上不同地區的病理類型不 盡相同。食管癌在西方國家主要以腺癌為主。在我國，90%的食管癌是鱗癌，占據我國癌癥 死因第四位。ESCC具有高度侵襲性，預后不良，更深入的了解它的基因和分子異常機制對于 疾病的早期診斷、治療及改善預后有重要意義。
[0003] 在腫瘤的發生、發展和轉移中，基因的異常表達起了很重要的作用。很多蛋白在 腫瘤細胞中有異常表達，影響了某些關鍵的細胞通路，進而使腫瘤細胞獲得持續生長的能 力。因而在過去幾十年，人們將大多數注意力集中到編碼蛋白的基因上。但編碼蛋白的基 因僅占基因組序列的2%，在基因組中還有大量的非編碼序列，它們轉錄后形成非編碼RNA (non-coding RNA)，如小分子干擾 RNA (small inference RNA，siRNA)、微 RNA(microRNA， miRNA)、PIWI 互作用 RNA (PlWI-interacting RNA，piRNA)以及長鏈非編碼 RNA (long noncoding RNA, IncRNA)等。siRNA和miRNA在最近幾年研究非常火熱，人們逐漸認識到它 們在腫瘤中具有非常重要的調節作用。
[0004] 對于IncRNA而言，我們對其結構、功能以及在腫瘤中的作用所知不多。長鏈非編 碼RNA (IncRNA)是一類長度大于200個核苷酸、不翻譯成蛋白質的RNA。近些年來，科學家 對于IncRNA的研究興趣漸漸增加，最近兩年，pubmed上每年IncRNA的文章數目增長都在 50%左右。人們已發現了一大批IncRNA分子，但對于它們的特點和功能卻所知不多。
[0005] 研究表明，IncRNA可以通過促進轉錄、抑制轉錄、調控mRNA翻譯等多種方式參與 生物過程。IncRNA可以影響很多基因的表達，調控機制多樣復雜，有些IncRNA順式調節其 臨近基因的轉錄，有些則是反式調節，有些則是通過表觀遺傳學方式調節，而另外一些則是 通過直接與RNA聚合酶或者轉錄因子結合的作用方式調節。這些IncRNA可以調節關鍵通 路上的蛋白，從而在腫瘤的發展中起到重要作用。
[0006] 目前，對于包括ESCC在內的大多數實體腫瘤而言，癌癥的臨床分期仍是一個預測 術后病人生存時間的主要依據。但臨床分期預測的并不足夠精確。癌癥在分子和基因層面 有很大異質性，期別相同、接受治療也相同的病人可能有不同的預后。這給醫生在制定治療 方案時帶來了很大的困擾。隨著時代的發展，需要更好的方法來預測患者的預后，為主治醫 生提供盡可能準確的生存信息，從而達到指導治療的目的。
【發明內容】
[0007] 本發明的目的是提供一種用于輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒。
[0008] 本發明提供了一種輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒，包括用于檢測 IncRNAl (ENST00000435885 ? 1)的表達量的物質、用于檢測 lncRNA2 (XL0C_013014)的表 達量的物質和用于檢測lncRNA3 (ENST00000547963 *1)的表達量的物質；所述IncRNAl如 序列表的序列1所示；所述lncRNA2如序列表的序列2所示；所述lncRNA3如序列表的序列 3所示。
[0009] 所述試劑盒還可包括記載有如下模型和評判方法的載體：
【主權項】
1. 一種輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒，包括用于檢測IncRNAl的表達 量的物質、用于檢測lncRNA2的表達量的物質和用于檢測lncRNA3的表達量的物質；所述 IncRNAl如序列表的序列1所示；所述lncRNA2如序列表的序列2所示；所述lncRNA3如序 列表的序列3所示。
2. 如權利要求1所述的試劑盒，其特征在于：所述試劑盒還包括記載有如下模型和評 判方法的載體：
其中，與4筆依次表示所述IncRNAl的相對表達量、所述lncRNA2的相對表達量和所述 lncRNA3的相對表達量； 某一 IncRNA的相對表達量=待測食管鱗癌患者的腫瘤組織中該IncRNA的表達量-該 待測食管鱗癌患者的癌旁組織中該IncRNA的表達量； 如果dig〈dip，該待測食管鱗癌患者被預測為"低危患者"，預期生存期為60個月以上；如 果dig > dip，該待測食管鱗癌患者被預測為"高危患者"，預期生存期小于60個月。
3. 如權利要求1或2所述的試劑盒，其特征在于：所述用于檢測IncRNAl的表達量的 物質為核苷酸如序列表的序列4所示的探針；所述用于檢測lncRNA2的表達量的物質為核 苷酸如序列表的序列5所示的探針；所述用于檢測lncRNA3的表達量的物質為核苷酸如序 列表的序列6所示的探針。
4. 用于檢測IncRNAl的表達量的物質、用于檢測lncRNA2的表達量的物質和用于檢測 lncRNA3的表達量的物質在制備試劑盒中的應用；所述試劑盒的功能為輔助預測食管鱗癌 患者術后生存時間；所述IncRNAl如序列表的序列1所示；所述lncRNA2如序列表的序列2 所示；所述lncRNA3如序列表的序列3所示。
5. 如權利要求4所述的應用，其特征在于：所述用于檢測IncRNAl的表達量的物質為 核苷酸如序列表的序列4所示的探針；所述用于檢測lncRNA2的表達量的物質為核苷酸如 序列表的序列5所示的探針；所述用于檢測lncRNA3的表達量的物質為核苷酸如序列表的 序列6所示的探針。
6. 用于檢測IncRNAl的表達量的物質、用于檢測lncRNA2的表達量的物質和用于檢測 lncRNA3的表達量的物質和記載有如下模型和評判方法的載體在制備輔助預測食管鱗癌患 者術后生存時間的試劑盒中的應用：
其中，茍筆與依次表示所述IncRNAl的相對表達量、所述lncRNA2的相對表達量和所述 lncRNA3的相對表達量； 某一 IncRNA的相對表達量=待測食管鱗癌患者的腫瘤組織中該IncRNA的表達量-該 待測食管鱗癌患者的癌旁組織中該IncRNA的表達量； 如果dig〈dip，該待測食管鱗癌患者被預測為"低危患者"，預期生存期為60個月以上；如 果dig > dip，該待測食管鱗癌患者被預測為"高危患者"，預期生存期小于60個月； 所述IncRNAl如序列表的序列1所示；所述lncRNA2如序列表的序列2所示；所述 lncRNA3如序列表的序列3所示。
7.如權利要求6所述的應用，其特征在于：所述用于檢測IncRNAl的表達量的物質為 核苷酸如序列表的序列4所示的探針；所述用于檢測lncRNA2的表達量的物質為核苷酸如 序列表的序列5所示的探針；所述用于檢測lncRNA3的表達量的物質為核苷酸如序列表的 序列6所示的探針。
【專利摘要】本發明公開了一種用于輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒。本發明提供了一種輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間的試劑盒，包括用于檢測lncRNA1的表達量的物質、用于檢測lncRNA2的表達量的物質和用于檢測lncRNA3的表達量的物質；所述lncRNA1如序列表的序列1所示；所述lncRNA2如序列表的序列2所示；所述lncRNA3如序列表的序列3所示。本發明中納入了多個ESCC病人，分析lncRNA在癌和癌旁正常組織中的表達特點，發現若干lncRNA在癌組織中的表達譜明顯不同于癌旁正常組織，進一步基于3個lncRNA的相對表達量建立了模型，該模型可用于輔助預測食管鱗癌患者術后生存時間。
【IPC分類】C12Q1-68
【公開號】CN104762368
【申請號】CN201410001307
【發明人】赫捷, 陳潤生, 程京, 李嘉根, 陳照麗
【申請人】中國醫學科學院腫瘤醫院
【公開日】2015年7月8日
【申請日】2014年1月2日