本發明涉及一種催化活性和熱穩定性提高的石莼多糖裂解酶突變體及其應用,屬于基因工程。
背景技術:
1、綠藻是三大藻類之一,相較于紅藻和褐藻,綠藻相關研究及報道較少,這說明綠藻仍未被充分開發和利用。石莼多糖是綠藻細胞壁的主要成分,是一種水溶性多糖,約占總藻干重的8%到29%。石莼多糖的結構主要由硫酸化鼠李糖(rha3s)、葡萄糖醛酸(glca)、艾杜糖醛酸(idoa)和木糖(xyl)組成。由于艾杜糖醛酸和硫酸化鼠李糖的存在使石莼多糖與其他海洋來源的多糖不同,顯示出與哺乳動物糖胺聚糖(如硫酸軟骨素和透明質酸)的相似性,因此石莼多糖及其降解后的石莼寡糖具有抗氧化、抗菌、抗病毒和降血糖等多種作用,其在生物醫藥行業有廣泛的應用價值。另外石莼多糖及寡糖在能源、以及農作物保護方面都有潛在的應用價值,近年來得到越來越多的關注。因此加強對石莼多糖的開發一方面可以生產高附加值產物,帶來新的經濟增長點,同時可以減輕因綠藻的富營養化引起的水質污染。
2、與物理、化學方法相比,生物酶解法提取石莼多糖具有高效綠色,條件溫和,專一性強等優點。石莼多糖裂解酶可以通過β-消除機制將石莼多糖降解為小分子石莼寡糖。在工業生產及應用中,提高反應溫度有利于提高反應速率,降低成本。因此,研發高效及穩定性較高的酶具有重要的意義。
3、目前蛋白質工程是提高酶活及熱穩定性的主要手段。包括隨機進化、半理性設計及理性設計等。隨機進化往往工作量大,存在結果不確定性等劣勢。基于蛋白質的序列及結構的改造方法更具有針對性,通過引入計算模擬等篩選方法,干濕實驗的結合可以更高效的篩選出優勢突變體,降低成本等。
技術實現思路
1、為提高石莼多糖裂解酶的熱穩定性和催化活性,通過對石莼多糖裂解酶的非保守loop區進行改造,利用foldx計算篩選熱點殘基,進行飽和突變獲得熱穩定性和催化活性提升的單點突變體,進一步組合突變,提高酶的催化性能。
2、實現本發明的技術路線概述如下:
3、基于序列和結構比對,選擇石莼多糖裂解酶的非保守loop區殘基,利用foldx計算δδg值變化,確定了熱點區域。在對應于seq?id?no:1的q207、t91位或d81位殘基進行飽和突變。在以獲得的熱穩定性和催化活性提升的n35p的基礎上,獲得雙突變體,其中n35p/q207m突變體相對酶活為野生型的1.51倍,最適溫度提高10℃,在40℃下孵育2h后,野生型酶活幾乎喪失,突變體殘余酶活為76%,約是野生型的10.8倍。
4、本發明的第一個目的是提供一種結合foldx篩選熱點突變殘基的方法,所述的突變體是以氨基酸序列如seq?id?no.1所示的石莼多糖裂解酶為親本,進行飽和突變和組合突變改造,得到催化效率明顯提升的突變體。
5、本發明的第二個目的是構建一種重組表達載體用以表達突變體酶的工程菌株。
6、本發明的第三個目的是上述重組菌株的應用,特別是在生產石莼多糖裂解酶中的應用。進一步地,所述的應用是采用石莼多糖裂解酶突變體降解石莼多糖。
1.一種石莼多糖裂解酶突變體,其特征在于,所述的石莼多糖裂解酶突變體是在氨基酸序列如seq?id?no:1所示的q207,t91位或d81c位中的至少一個位置的氨基酸殘基發生突變,或者上述單點突變體與酶活和熱穩定性提升的n35p組合的雙突變體。
2.權利要求1所述的石莼多糖裂解酶突變體的編碼基因,所述編碼基因的核苷酸序列如seq?id?no:2所示的基因序列。
3.一種攜帶權利要求2所述的基因的表達載體。
4.一種表達權利要求1所述的石莼多糖裂解酶突變體的重組菌。
5.如權利要求4所述宿主細胞,其特征在于,所述的重組菌是大腸桿菌bl21或大腸桿菌jm109。
6.權利要求1所述的石莼多糖裂解酶突變體在醫藥、生物、化工等行業的應用。
7.根據權利要求6所述的應用,其特征在于,所述的應用是采用石莼多糖裂解酶突變體降解石莼多糖為石莼寡糖。