專利名稱::治療、診斷或檢測癌癥的amigo-2抑制劑的制作方法治療、診斷或檢測癌癥的AMIGO-2抑制劑發明領域本發明總體上涉及腫瘤學領域。更具體地說,本發明涉及治療癌癥的方法,治療癌癥的組合和診斷和/或檢測癌癥的方法和組合物。
背景技術:
:癌癥是美國的第二死因。雖然利用"癌癥"描述許多不同類型的癌癥,即乳腺癌、前列腺癌;肺癌、結腸癌、胰腺癌,但各類型癌癥的區別既在于表型水平也在于遺傳學水平。當一種或多種基因的表達因突變而失調并且細胞生長不再受控制上,則發生癌癥特征性的不受調節生長。通常將基因分成兩類,癌基因和腫瘤抑制基因。癌基因是只有在特定條件下其功能為促進細胞生長的基因。當癌基因產生突變,隨后失控,其促進所有條件下的生長。然而,現已發現癌癥要真正成功,該癌癥還必須在腫瘤抑制基因中獲得突變。腫瘤抑制基因的正常功能是終止細胞生長。腫瘤抑制(基因)的例子包括p53、p16、p21和APC,所有這些在正常起作用時可終止細胞不受控地分化和生長。當腫瘤抑制(基因)突變或喪失,則對細胞生長的制動作用也喪失,從而細胞可不受限制地生長。AMIGO-2(也稱為Alivin1和DEGA)是AMIGO(兩性霉素(amphoterin)-誘導基因和ORF)家族的一員(Kuja-Panula等,JCB160:963,2003)。AMIGO家族參與細胞運動性,家族成員具有同嗜性和異嗜性相互作用。AMIGO-2還抑制凋亡,促進神經元存活(Ono等,JNeurosci235887,2003)。AMIGO-2在胃癌中上調(Rabenau等,Oncogene235056,2004),穩定抑制AMIGO-2可抑制腫瘤細胞染色體穩定性、遷移和生長。然而,目前為止,AMIGO-2在癌癥和其它疾病及病癥中的作用尚未完全闡明。因此,需要堅定能調節AMIGO-2的組合物和方法。本發明涉及這些以及其它重要的需要。發明概述在一些方面,本發明提供包含AMIGO-2調節劑和一種或多種藥學上可接受的載體的組合物。在一方面,本發明的特征在于包含AMIG0-2抑制劑和一種或多種藥學上可接受的載體的組合物,其中所述AMIG0-2抑制劑是分離的雙鏈RNA(dsRNA);含有選自SEQEDNO:7-16所構成組的序列中至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;結合選自下組的AMIG02-結構域中表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;小分子;模擬物;可溶性受體;或引誘物。在另一方面,本發明的特征在于特異性結合AMIGO-2多肽表位的純化抗體,其中所述表位位于信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域或Ig結構域中。在還有另一方面,本發明的特征在于產生特異性結合AMIGO-2多肽表位的抗體的分離細胞,其中所述表位位于信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域或Ig結構域中。在另一方面,本發明的特征在于產生特異性結合AMIGO-2多肽表位的抗體的雜交瘤,其中所述表位位于信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域或Ig結構域中。在還有另一方面,本發明的特征在于產生特異性結合AMIGO-2多肽表位的抗體的非人轉基因動物,其中所述表位位于信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域或Ig結構域中。在另一方面,本發明的特征在于SEQIDNO:2所示多肽的攜帶表位的分離片段,其中所述片段包含選自SEQIDNO:3-6和25-62所構成組的一種或多種表位。在還有另一方面,本發明的特征在于編碼SEQIDNO:2所示多肽的攜帶表位的分離片段的多核苷酸,其中所述片段包含選自SEQIDNO:3-6和25-62所構成組的一種或多種表位。在還有另一方面,本發明的特征在于用SEQIDNO:2所示多肽的攜帶表位的片段免疫對象而獲得的純化AMIGO-2抗體,其中所述片段包含選自SEQIDNO:3-6和25-62所構成組的一種或多種表位。在另一方面,本發明的特征在于包含第一核苷酸鏈和第二核苷酸鏈的分離dsRNA分子,所述第一核苷酸鏈包含SEQIDNO:17-24所示某序列的至少19個連續核苷酸,所述第二核苷酸鏈包含與所述第一鏈基本上互補的序列,其中所述dsRNA分子長度短于3769個核苷酸。在還有另一方面,本發明的特征在于包含第一核苷酸鏈和第二核苷酸鏈的分離dsRNA分子,所述第一核苷酸鏈包含SEQIDNO:17-24所示某序列的至少19個連續核苷酸,所述第二核苷酸鏈包含與所述第一鏈完全互補的序列,其中所述dsRNA分子長度短于3769個核苷酸。在另一方面,本發明的特征在于包含SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離核酸。在另一方面,本發明的特征在于治療有此需要的患者的癌癥或癌癥癥狀的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2抑制劑給予患者,其中所述抑制劑是分離的雙鏈RNA(dsRNA);含有選自SEQIDNO:7-16所構成組的序列中至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;結合選自下組的AMIG02-結構域中表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;小分子;模擬物;可溶性受體;或引誘物。在還有另一方面,本發明的特征在于調節患者的AMIGO-2活性的方法,該方法包括將有效調節AMIGO-2活性用量的AMIGO-2抑制劑給予患者。在還有另一方面,本發明的特征在于鑒定對AMIGO-2治療敏感的患者的方法,包括(a)檢測樣品中是否存在AMIGO-2表達的證據,其中樣品中存在AMIGO-2表達的證據表明患者是AMOGI-2治療的候選者,而樣品中不存在AMIGO-2表達的證據表明患者不是AMOGI-2治療的候選者,(b)如果患者是AMOGI-2治療的候選者,則將治療有效量的包含AMIGO-2抑制劑的組合物給予患者,和(c)如果患者不是AMOGI-2治療的候選者,則將傳統癌癥治療劑給予患者。在另一方面,本發明的特征在于抑制癌細胞生長的方法,包括使癌細胞與有效抑制細胞生長相比于對照至少20%的用量的AMIGO-2抑制劑接觸。在另一方面,本發明的特征在于抑制有此需要的患者中癌細胞表型的方法,該方法包括將治療有效量的AMIGO-2抑制劑給予該患者。在另一方面,本發明的特征在于抑制癌細胞生長的方法,該方法包括將調節AMIGO-2的一種或多種下游標記物的化合物給予具有癌癥的患者,所述癌癥包含一種或多種表達AMIGO-2的細胞。AMIGO-2的一種或多種下游標記物可以是c-MYC、c-Jun、FosLl和胞外信號調節激酶(ERK)。在一些實施方式中,調節一種或多種下游標記物可以是抑制一種或多種下游標記物的表達,例如抑制蛋白質或mRNA表達。在一些實施方式中,調節還可包括抑制AMIGO-2的一種或多種下游標記物的活性。在一些實施方式中,調節ERK包括調節ERK的磷酸化。在一些實施方式中,調節ERK包括調節ERK激酶針對一種或多種ERK底物的活性。在還有另一方面,本發明的特征在于檢測患者的腫瘤的方法,包括將包含與顯像劑相連的AMIGO-2抑制劑的組合物給予該患者并檢測該顯像劑在患者中的定位。在另一方面,本發明的特征在于抑制患者中兩種或多種細胞相互作用的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2抑制劑給予該患者。在另一方面,本發明的特征在于在細胞中表達AMIGO-2抗體的方法,其中所述AMIGO-2抗體特異性結合包含選自SEQIDNO:3-6和25-62所構成組的序列的表位。該方法包括在細胞中表達編碼AMIGO-2抗體的核酸。在另一方面,本發明的特征在于鑒定癌癥抑制劑的方法,其中所述癌癥的特征在于AMIGO-2相比于對照過度表達。該方法包括使表達AMIGO-2的細胞與候選化合物接觸并測定AMIGO-2活性是否得到調節,其中所述AMIGO-2活性得到調節是癌癥抑制劑的標志。在另一方面,本發明的特征在于鑒定癌癥抑制劑的方法,其中所述癌癥的特征在于AMIGO-2相比于對照過度表達。該方法包括使表達AMIGO-2的細胞與候選化合物和AMIGO-2配體接觸并測定AMIGO-2下游標記物的活性是否得到調節,其中所述下游標記物得到調節是癌癥抑制劑的標志。在另一方面,本發明的特征在于測定患者對AMIGO-2抑制劑敏感性的方法,包括檢測患者的癌癥樣品中AMIGO-2差別表達的證據,其中AMIGO-2差別表達的證據是患者對AMIGO-2抑制劑敏感性的標志。在另一方面,本發明的特征在于從樣品中純化AMIGO-2蛋白的方法,包括(a)提供包含抗-AMIGO-2抗體的親和基質,所述抗體結合于固體支持物上,(b)使樣品與親和基質接觸以形成親和基質-AMIGO-2蛋白復合體,(c)將該親和基質AMIGO-2蛋白復合體與其余樣品分離,和(d)從該親和基質上釋放AMIGO-2蛋白。在另一方面,本發明的特征在于將細胞毒劑或診斷劑遞送至一種或多種表達AMIGO-2的細胞的方法。該方法包括(a)提供與抗-AMIGO-2抗體或其片段偶聯的細胞毒劑或診斷劑,和(b)使細胞與該抗體-試劑或片段-試劑偶聯物接觸。在另一方面,本發明的特征在于測定候選AMIGO-2抑制劑效力的方法,包括使表達AMIGO-2的細胞與候選AMIGO-2抑制劑接觸并測定下游AMIGO-2標記物的水平或活性是否降低,其中所述下游標記物的水平或活性降低表明候選AMIGO-2抑制劑是有效的抗癌癥藥物。在還有另一方面,本發明的特征在于測定候選AMIGO-2抑制劑效力的方法,包括使表達AMIGO-2的細胞與候選AMIGO-2抑制劑接觸并測定PARP1切割是否增加,其中PARP1增加表明候選AMIGO-2抑制劑是有效的抗癌癥藥物。在還有另一方面,本發明的特征在于測定某種癌癥是否為AMIGO-2相關癌癥的方法,包括比較癌癥和對照細胞中的AMIGO-2表達,其中與對照相比,癌細胞中AMIGO-2表達上調表明該癌癥是AMIGO-2相關癌癥。在還有另一方面,本發明的特征在于測定某種癌癥是否為AMIGO-2相關癌癥的方法,包括使癌癥樣品和對照樣品與AMIGO-2抑制劑接觸,并比較癌癥樣品和對照樣品中AMIGO-2下游標記物的水平或活性,其中與對照樣品相比,癌癥樣品中AMIGO-2下游標記物的水平或活性降低表明該癌癥是AMIGO-2相關癌癥。在另一方面,本發明的特征在于測定某種癌癥是否為AMIGO-2相關癌癥的方法,包括使癌癥樣品和對照樣品與AMIGO-2抑制劑接觸,并比較癌癥樣品和對照樣品中的PARPl切割情況,其中與對照樣品相比,癌癥樣品中PARPl切割增加表明該癌癥是AMIGO-2相關癌癥。在還有另一方面,本發明的特征在于治療癌癥患者的方法,包括測定某種癌癥是否為AMIGO-2相關癌癥,如果該患者具有AMIGO-2相關癌癥則將包含AMIGO-2抑制劑的組合物給予該患者,如果該患者不具有AMIGO-2相關癌癥則將傳統癌癥治療劑給予該患者。在另一方面,本發明的特征在于治療癌癥患者的方法,包括比較患者癌癥樣品中的AMIGO-2表達與對照樣品中的AMIGO-2表達,并(l)如果與對照樣品相比,該癌癥樣品中AMIGO-2表達上調則用包含AMIGO-2抑制劑的組合物治療該患者,和(2)如果與對照樣品相比,該癌癥樣品中AMIGO-2表達未變或下調則進行二級試驗。在另一方面,本發明的特征在于診斷患者中癌癥的方法,包括檢驗候選癌細胞中的AMIGO-2定位,其中當定位于細胞膜的AMIGO-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2之比至少為2:1時,該患者診斷為具有AMIGO-2相關癌癥。在另一方面,本發明的特征在于檢測包含表達AMIGO-2的細胞的樣品中AMIGO-2活性調節情況的方法。該方法包括(a)使樣品與AMIGO-2抑制劑接觸足以調節AMIGO-2活性的時間,(b)用抗-AMIGO-2抗體免疫沉淀AMIGO-2,和(c)利用磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體比較樣品與對照中AMIGO-2絲氨酸/蘇氨酸磷酸化情況。與對照相比,樣品中AMIGO-2的絲氨酸/蘇氨酸磷酸化情況改變表明AMIGO-2活性得到調節。在另一方面,本發明的特征在于檢測包含表達AMIGO-2的細胞的樣品中AMIGO-2活性調節情況的方法。該方法包括(a)使樣品中的AMIGO-2過度表達足以調節AMIGO-2活性的時間,(b)用抗-AMIGO-2抗體免疫沉淀AMIGO-2,和(c)利用磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體比較樣品與對照中AMIGO-2絲氨酸/蘇氨酸磷酸化情況。與對照相比,樣品中AMIGO-2的絲氨酸/蘇氨酸磷酸化情況改變表明AMIGO-2活性得到調節。在還有另一方面,本發明的特征在于檢測包含表達AMIGO-2的細胞的樣品中AMIGO-2活性調節情況的方法。該方法包括(a)使樣品與AMIGO-2抑制劑接觸足以調節AMIGO-2活性的時間,(b)用抗-磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體免疫沉淀AMIGO-2,和(c)利用抗AMIGO-2抗體比較樣品與對照中磷酸化AMIGO-2的水平。與對照相比,樣品中磷酸化AMIGO-2的水平改變表明AMIGO-2活性得到調節。在另一方面,本發明的特征在于檢測包含表達AMIGO-2的細胞的樣品中AMIGO-2活性調節情況的方法。該方法包括(a)使樣品中的AMIGO-2過度表達足以調節AMIGO-2活性的時間,(b)用抗-磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體免疫沉淀AMIGO-2,和(c)利用抗AMIGO-2抗體比較樣品與對照中磷酸化AMIGO-2的水平。與對照相比,樣品中磷酸化AMIGO-2的水平改變表明AMIGO-2活性得到調節。在另一方面,本發明的特征在于鑒定AMIGO-2調節劑的方法,包括比較有和沒有候選化合物存在下,包含表達AMIGO-2的一種或多種細胞的樣品中AMIGO-2的磷酸化,其中與沒有候選化合物存在下樣品中AMIGO-2的磷酸化相比,有候選化合物存在下樣品中AMIGO-2的磷酸化得到調節表明該候選化合物是AMIGO-2調節劑。發明詳述中將說明本發明的這些和其它方面。附圖簡述圖1A和1B描述了用AffymetrixGeneChip(人基因組U133+2.0陣列(HumanGenomeU133Plus2.0Array),艾飛麥特利克斯公司(Affymetrix,Inc.))寡核苷酸陣列(圖lA)和內部合成的cDNA微陣列(圖IB)產生的基因表達數據o圖2圖示了正常組織和結腸、乳腺和前列腺組織樣品中相對AMIGO-2mRNA水平。圖》圖示了從癌性和正常組織分離的AMIGO-2mRNA的寡核苷酸陣列數據(人基因組U133+2.0陣列,艾飛麥特利克斯公司)。正常和癌性組織類型沿x軸表示。縱軸上的各斑點表示一位患者的組織樣品,各斑點在縱軸上的高度(線性)表示探針組的相對表達水平。實心圓圈表示表達水平處于線性檢測范圍內的樣品。空心圓圈表示樣品中基因表達的上限,此處基因低于探針組的檢測界限。空心正方形表示樣品中基因表達的下限,此處探針組飽和。圖4描述了圖3所示的圖示,但y-軸為log2值。正常和癌性組織類型沿水平軸表示。癌組織的名稱前有"c",正常組織的名稱前為"n"。"ns"表示未指定的組織亞型。圖5描述了顯示從6種不同細胞系分離的AMIGO-2蛋白的蛋白質印跡分析。相對半-定量RT-PCRCt水平表示于毗鄰4種細胞系的名稱的括號中。圖6圖示了給予siRNA后SW620細胞中的AMIGO-2mRNA水平。y-軸是相對比例,數值是任意的。UT=未轉染的;Eg5=靶向Eg5沃關基因)的siRNA;陰性對照=與任何己知基因不同源的siRNA序列;C315-1.2到C315-4.3是一組AMIGO-2siRNA。圖7A圖示了給予siRNA后Colo320細胞中的AMIGO-2mRNA水平。y-軸是相對比例,數值是任意的。Eg5=靶向Eg5(無關基因)的siRNA;陰性對照=與任何已知基因不同源的siRNA序列;C315-1.2和C315-4.3是AMIGO-2特異性siRNA。圖7B圖示了給予siRNA后HCT116細胞中的AMIGO-2mRNA水平。y-軸是相對比例,數值是任意的。Eg5=靶向Eg5(無關基因)的siRNA;陰性對照=與任何已知基因不同源的siRNA序列;C315-1.2和C315-4.3是AMIGO-2特異性siRNA。圖8A圖示了AMGO-2特異性siRNA對SW620細胞死亡的作用。"Pos.對照"是耙向Eg5的Eg5siRNA。"陰性對照"是與任何已知基因不同源的siRNA序列。y-軸檢測與死細胞數目成比例的發光水平。圖8B圖示了AMIGO-2特異性siRNA對MRC9細胞死亡的作用。"Pos.對照"是靶向Eg5的Eg5siRNA。"陰性對照"是與任何已知基因不同源的siRNA序列。y-軸檢測與死細胞數目成比例的發光水平。圖9描述了顯示AMIGO-2特異性siRNA對AGS細胞中AMIGO-2、PARP、M30和微管蛋白表達和加工的作用的一組蛋白質印跡。"Pos.對照"表示用Eg5siRNA轉染的細胞的裂解液。"陰性對照"表示用與任何已知基因不同源的siRNA序列轉染的細胞的裂解液。圖10A描述了顯示AMIGO-2特異性siRNA對SW620細胞中AMIGO-2、ERK、c-Myc和微管蛋白表達和加工的作用的一組蛋白質印跡。pERK是磷酸化的ERK蛋白。"陰性對照"如圖9所示。圖10A圖示了AMIGO-2特異性siRNA對SW620細胞中c-MYCmRNA水平的作用。"Pos.對照"是靶向Eg5的Eg5siRNA。"陰性對照"是與任何已知基因不同源的siRNA序列。y-軸檢測通過qPCR測定的mRNA的相對表達水平。圖11描述了顯示AMIGO-2特異性siRNA對AGS細胞中AMIGO-2、ERK、c-Myc、細胞周期蛋白Dl和微管蛋白表達和加工的作用的一組蛋白質印跡。pERK是磷酸化的ERK蛋白。標有"抗-有絲分裂基因"的泳道表示用Eg5siRNA轉染的細胞的裂解液。"陰性對照"表示用與任何已知基因不同源的siRNA序列轉染的細胞的裂解液。圖12A-12C描述了調節AMIGO-2對cJun表達的作用。圖12A是顯示cJun在用AMIGO-2siRNA轉染的細胞中下調的一組蛋白質印跡。"UT"表示未轉染的對照樣品;"DharmNeg"是與任何己知基因不同源的陰性對照siRNA序列;C315-1.3si是AMIGO-2特異性siRNA。圖12B是顯示cJun表達在用AMIGO-2轉染的細胞中上調的一組蛋白質印跡。圖12C是顯示使AGS細胞與激動劑抗-AMIGO-2抗體MAB2080接觸后cJun上調的蛋白質印跡。"ISO"表示同種型對照。圖13描述了顯示AMIGO-2敲除對AGS和SW620細胞中細胞周期蛋白Bl和cFos表達的作用的一組蛋白質印跡。"UT"表示未轉染的對照樣品;"DharmNeg"是與任何已知基因不同源的陰性對照siRNA序列;C315-1.3si和C315-4.3si是AMIGO-2特異性siRNA。圖14A-C描述了調節AMIGO-2對cMyc表達的作用。圖14A和14B是顯示使SW620(圖14A)和AGS(圖14B)細胞與AMIGO-2siRNAC315-1.3si和C315-4.3si接觸后c-Myc下調的一組蛋白質印跡。"UT"是未轉染的細胞培養液。"Neg"表示用與任何己知基因不同源的siRNA序列轉染的樣品。"Eg5"表示用靶向Eg5的siRNA轉染的樣品。圖14C表示使SW620細胞和AGS細胞與抗-AMIG0-2抗體MAB2080接觸后cMyc在細胞中上調的蛋白質印跡。圖15A-15B描述了利用AMIGO-2調節劑一致下調(圖15A)和上調(圖15B)的基因。圖16描述了顯示AMIGO-2-特異性抗體MAB2080(A)對SW620細胞的全細胞裂解液中cJUN、cFosLl和微管蛋白表達的作用的一組蛋白質印跡(上兩幅圖)。下圖中一系列蛋白質印跡描述了與細胞中總ERK相比,MAB2080(A)對ERK磷酸化(pERK)的作用。T或"同種型對照"表示用非特異性小鼠IgG處理SW620細胞。詳述本申請的發明人發現AMIG0-2在包括肺癌和結腸癌在內的幾種癌癥中過度表達,而在正常組織中表達有限。令人意外地,抑制AMIGO-2抑制了癌細胞存活。此外,現已發現抑制AMIGO-2能調節包括,例如細胞周期蛋白D1、細胞周期蛋白B1、c-Myc、cJcun、FosLl、VEGF、尿激酶或ERK在內的下游標記物水平。因此,本發明提供治療、診斷和使癌癥成像的方法和組合物,特別是治療診斷和使AMIGO-2相關癌癥成像,以及治療AMIGO-2表達異常相關的其它疾病和病癥。本申請提供了本發明的這些和其它方面。定義本文件采用了各種定義。大多數詞語具有本領域技術人員所賦予那些詞語的意義。在下文或本文件它處專門定義的詞語總體上具有本發明范圍內提供的意義,與本領域技術人員通常理解的一樣。除非另有表述,實施本發明可采用本領域技術范圍內的常規化學、生物化學、分子生物學、免疫學和藥學方法。參考文獻中充分解釋了這些技術。參見,例如Remington'sPharmaceuticalSciences(雷明頓藥物科學),第18版(伊斯頓,賓夕法尼州,馬克出版公司(MackPublishingCompany),1990),MethodsInEnzymology(酶學方法)(S.Colowick禾BN.Kaplan編,學術出版社公司(AcademicPress,Inc))和HandbookofExperimentalImmunology(實驗免疫學手冊),第I-IV巻(D.M.Weir和C.C.Blackwell編,1986,布萊克威爾科學出版公司(BlackwellScientificPublications))禾BSambrook等,MolecularCloning:ALaboratoryManual(分子克隆實驗室手冊)(第2版,1989)。除非文中另有表述,本文所用的單數形式"一個"、"一種"和"該"包括復數形式。因此,例如"一個抗體"包括兩個或多個這種抗體的混合物。本文所用的術語"約"指某數值的+/-30%、+/-20%、+/-10%或+/-5%。本文所用的術語"AMIGO-2"(也稱為Alivinl(ALIl)禾卩DEGA)指具有Ig樣結構域2的黏著分子。AMIGO-2的核苷酸序列見SEQIDNO:l(GenBank登錄號NM—181847),AMIGO-2的氨基酸序列見SEQIDNO:2(GenBank登錄號NMj81847)。該術語"AMIGO-2"還包括核酸和氨基酸同源物。在一些實施方式中,這種AMIGO-2核酸和氨基酸保留了投入AMIGO-2核酸或氨基酸的一種或多種活性。術語"多肽"和"蛋白質"可互換使用,指任何長度的氨基酸聚合形式,其可包含編碼和非編碼的氨基酸,化學或生物化學修飾或衍生的氨基酸和具有修飾的肽主鏈的多肽。該術語包括融合蛋白,包括但不限于具有異源氨基酸序列的融合蛋白;具有異源和同源前導序列的融合蛋白,含或不含N-末端甲硫氨酸殘基;免疫學標記的蛋白質;等等。術語"個體"、"對象"、"宿主"和"患者"可互換使用,指需要診斷、治療或診治的任何對象,尤其是人。其它對象可包括牛、狗、貓、豚鼠、家兔、大鼠、小鼠、馬等。在一些實施方式中,所述對象是人。本文所用的"癌癥"指原發癌或轉移癌。術語"癌細胞"指轉化的細胞。可以從癌癥患者分離這些細胞,或者這些細胞可以是體外轉化成癌性的細胞。癌細胞可以衍生自許多類型的樣品,包括任何組織或細胞培養系。在一些實施方式中,癌細胞是過度增生性,腫瘤細胞或贅生物。在一些實施方式中,從肺組織、膀胱組織、腎組織、結腸組織、乳腺組織、子宮組織、卵巢組織或胰腺組織分離癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞取自公眾可得的已有細胞系。在一些實施方式中,從先前存在的患者樣品或含癌細胞的文庫分離癌細胞。在一些實施方式中,分離癌細胞,然后植入不同的宿主,例如異種移植。在一些實施方式中,移植癌細胞,用于SCID小鼠模型。在一些實施方式中,癌癥是肺癌或結腸癌。在一些實施方式中,癌癥是除胃癌以外的癌癥。本文所用的術語"轉化的"指其后代可穩定遺傳的細胞特性的任何改變。在一些實施方式中,"轉化的"指正常細胞向癌性細胞改變,例如能導致腫瘤的改變。在一些實施方式中,轉化細胞是無限增殖的。許多因素可導致轉化,包括某受體在缺乏受體磷酸化下的過度表達,病毒感染、癌基因和/或腫瘤抑制基因的突變,和/或改變細胞的生長和/或無限增殖特性的任何其它技術。"癌性表型"通常指作為癌細胞特征的各種生物學現象,這些現象可因癌癥類型而有所不同。通常由,例如細胞生長或增殖(例如,不受控的生長或增殖),細胞周期的調節,細胞運動性,細胞-細胞相互作用或轉移等等中的異常現象來鑒定癌性表型。本文所用的術語"轉移"指某癌癥從其起源,例如從原發癌癥擴展到遠端部位。轉移部位包括但不限于骨、淋巴結、肺、肝和腦。本文所用的術語"血管發生"指患者體內產生血管。本文所用的術語"臨床終末點"指表明癌癥的可檢測現象。臨床終末點包括但不限于首次轉移的時間、后繼轉移的時間、轉移的大小和/或數量、腫瘤的大小和/或數量、腫瘤的定位、腫瘤的侵襲性、生活質量、疼痛等等。本領域技術人員能確定并檢測臨床終末點。本領域技術人員己知檢測臨床終末點的方法。本文所用的術語"樣品"指患者的生物學材料。本發明檢驗的樣品不限于任何特定類型。樣品包括但不限于單細胞、多細胞、組織、腫瘤、生物學液體、生物學分子或任何前述的上清液或提取物。例子包括取出用于生物活檢的組織,切除期間取出的組織,血液,尿液,淋巴組織,腦脊液,粘液和糞便樣品。所用的樣品根據試驗形式、檢測方法和待檢驗的腫瘤、組織、細胞或提取物的性質而有所不同。本領域熟知制備樣品的方法,不難采用這些方法獲得與所用方法相容的樣品。本文所用的術語"生物學分子"包括但不限于多肽、核酸和糖。本文所用的術語"調節"指細胞內、外或其表面上的基因、蛋白質或任何分子的質量或數量的改變。所述改變可以是分子表達或水平的增加或降低。術語"調節"還包括改變生物學功能/活性的質量或數量,所述生物學功能/活性包括但不限于細胞信號傳導活性、細胞周期調節、激酶活性、絲氨酸/蘇氨酸激酶活性、細胞-細胞相互作用活性、影響多倍性的活性、染色體穩定性、致瘤性、細胞運動性、轉移性、癌細胞存活、癌細胞生長、增殖、通過細胞周期進展、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、細胞-細胞相互作用,包括在AMIGO-2與AMIGO-l(GenBank登錄號NM_020703,氨基酸序列見SEQIDNO:63)或AMIGO-3(GenBank登錄號NM—198722,氨基酸序列見SEQIDNO:64)中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、血管發生、神經元長出(neuronaloutgrowth)或細胞死亡。本文所用的術語"調節劑"指能調節一種或多種癌癥相關的生理學或生物化學事件的組合物。在一些實施方式中,所述調節劑抑制一種或多種癌癥相關的生物學活性。在一些實施方式中,所述調節劑是小分子、抗體、模擬物、引誘物或寡核苷酸。在一些實施方式中,所述調節劑通過阻斷配體結合或通過競爭配體結合位點而起作用。在一些實施方式中,所述調節劑不依賴于配體結合而起作用。在一些實施方式中,所述調節劑不競爭配體結合位點。在一些實施方式中,所述調節劑阻斷涉及癌癥的基因產物表達。在一些實施方式中,所述調節劑阻斷涉及癌癥的兩種或更多種生物分子的物理相互作用。在一些實施方式中,本發明調節劑抑制選自下組的一種或多種AMIGO-2活性細胞信號傳導活性、細胞周期調節、激酶活性、絲氨酸/蘇氨酸激酶活性、細胞-細胞相互作用活性、影響多倍性的活性、染色體穩定性、致瘤性、細胞運動性、轉移性、癌細胞存活、癌細胞生長、增殖、通過細胞周期進展、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、細胞-細胞相互作用(包括在AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用)、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、血管發生、神經元長出。在一些實施方式中,所述AMIGO-2調節劑抑制AMIGO-2表達。在一些實施方式中,所述調節劑抑制分裂細胞發展成細胞周期的G2/M期。"基因產物"是基因表達或產生的生物聚合產物。基因產物可以是,例如未剪接的RNA、mRNA、剪接變體mRNA、多肽、翻譯后修飾的多肽、剪接變體多肽等。該術語還包括利用RNA基因產物(即,RNA的cDNA)作為模板產生的生物聚合產物。基因產物可用酶方法、重組方法、化學方法或在該基因的天然細胞內產生。在一些實施方式中,如果基因產物是蛋白性的,其顯示生物學活性。在一些實施方式中,如果基因產物是核酸,可將其翻譯成顯示生物學活性的蛋白性基因產物。本文所用的"調節AMIGO-2活性"指,例如某物質與AMIGO-2多核苷酸序列或多肽相互作用,抑制AMIGO-2轉錄和/或翻譯(例如通過反義或siRNA與AMIGO-2基因或AMIGO-2基因表達產物相互作用,通過調節促進AMIGO-2表達的轉錄因子)等而導致AMIGO-2活性增加或降低。例如,調節AMIGO-2活性指生物學活性增加或生物學活性降低。調節AMIGO-2活性也指增加或降低一種或多種AMIGO-2表型。可通過(包括但不限于)評估AMIGO-2多肽水平,或通過評估AMIGO-2轉錄水平來評估AMIGO-2活性。還可通過檢測AMIGO-2下游標記物水平、檢測染色體穩定性、檢測激酶活性、檢測致瘤性、檢測轉移、檢測AMIGO-2信號傳導、檢測AMIGO-2介導的細胞黏著、檢測AMIGO-2介導的癌細胞凋亡、檢測ERK磷酸化、檢測癌細胞生長、檢測腫瘤形成、檢測細胞周期蛋白產生、檢測細胞增殖、檢測癌細胞生長、檢測不依賴與貼壁的生長、檢測細胞周期調節、檢測神經元指導(neuronalguidance)、檢測癌細胞運動性、檢測AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、檢測細胞-細胞相互作用(包括在AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用)、檢測細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、檢測血管發生和檢測細胞死亡等來比較AMIGO-2活性。在一些實施方式中,尤其感興趣的是抑制AMIGO-2活性。本文所用的術語"抑制"指活性或數量的減少、降低、失活或下調。例如,就本發明而言,AMIGO-2調節劑可抑制一種或多種致瘤性;癌細胞運動性;細胞黏附;轉移性;癌細胞存活;激酶活性;增殖;不依賴于貼壁的生長;癌細胞運動性;AMIGO-2蛋白定位于細胞膜;在AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用;神經元指導;細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平;磷酸化ERK的水平和血管發生。與對照相比,這些活性的抑制可以是至少25%、至少50%、至少75%、至少80%、至少卯%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或100°/。。本領域技術人員能檢測AMIGO-2調節情況;示范性試驗的非限制性例子見下文。因此,本文所用的術語"抑制AMIGO-2"指一種或多種AMIGO-2-介導的生物學活性的減少、降低、失活或下調。"AMIGO-2生物學活性"的抑制指,例如以下活性的減少、降低、失活或下調致瘤性;癌細胞運動性;細胞黏附;轉移性;癌細胞存活;激酶活性;增殖;不依賴于貼壁的生長;癌細胞運動性;AMIGO-2蛋白定位于細胞膜;在AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用;神經元指導;細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平;磷酸化ERK的水平;或血管發生。與對照相比,這些活性的抑制可以是至少25%、至少50%、至少75%、至少80%、至少卯%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或100%。在一些實施方式中,尤其感興趣的是調節AMIGO-2活性從而能活化或導致AMIGO活性增加。AMIGO-2調節劑可抑制一種或多種多倍性和細胞死亡(活性)。與對照相比,AMIGO-2活性的活化、上調或增加可以是至少125%、至少150%、至少200%、至少250%、至少300%、至少500%。例如,與對照相比,增加細胞死亡率200%的AMIGO-2調節劑將細胞死亡率提高兩倍。本文所用的術語"在癌細胞中有差別地表達"和"在癌細胞中有差別地表達的多核苷酸"可互換使用,指與細胞類型相同的非癌性細胞相比,代表或對應于在癌性細胞中有差別地表達的基因的多核苷酸,例如,發現mRNA水平差異有至少約25%、至少約50%-約75%、至少約90%、至少約1.5倍、至少約2倍、至少約5倍、至少約10倍或至少約50倍或更高(例如,較高或較低)。該比較可以在組織中進行,例如如果采用在組織的細胞類型之間有一定區分程度的原位雜交或另一試驗方法。還可以在從組織來源取出的細胞之間,或在原位細胞與從組織來源取出的第二細胞之間進行比較。在一些實施方式中,與正常細胞相比,所述基因在癌基因中上調。如果AMIGO-2相關癌癥的至少一種癥狀緩解、終止、減緩或阻止則該癌癥受到"抑制"。如本文所用,如果AMIGO-2相關癌癥的復發或轉移降低、減緩、延遲或阻止則也"抑制"了該癌癥。本文所用的短語"抑制AMIGO-2介導的細胞黏著"指有AMIGO-2調節劑存在下,細胞-細胞黏著的降低、減少或消除,其中至少一種細胞有差別地表達AMIGO-2。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在時AMIGO-2介導的細胞黏著相比,AMIGO-2調節劑可將AMIGO-2介導的細胞黏著降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%,最多達100%。可通過檢測,例如通過標記感興趣的細胞,將它們與黏著于基板的一群未標記細胞溫育,并作清洗以分開黏著和未黏著的細胞群來比較AMIGO-2介導的細胞黏著。以此方式可通過檢測保留于基板上的標記量來確定細胞黏著。試驗系統的例子包括但不限于用熒光標記物,例如鈣熒光素AM、CFMDA(5-氯甲基熒光素二乙酸酯)、5(6)-CFDA-SE[5-(和-6)-羧基熒光素二乙酸酯,琥珀酰亞胺酯]作標記并用熒光平板讀數計或通過流式細胞術檢測熒光。本文所用的短語"抑制癌細胞生長"指有AMIGO-2調節劑存在下降低、減少或消除癌細胞生長,其中所述細胞表達AMIGO-2。在一些實施方式中,與其它正常細胞相比和/或與其它癌細胞相比,這些細胞有差別地表達AMIGO-2。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的癌細胞生長相比,AMIGO-2調節劑可將細胞生長降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%,最多達100。/。。可采用,例如MTT試驗(例如,英杰公司(Invitrogen)的Vybrant②MTT細胞增殖檢驗試劑盒);BrdU摻入(例如,英杰公司的絕對-SSBIP試驗);檢測胞內ATP水平(例如,利用帕金埃爾默公司(PerkTnElmer)的ATPLiteTM-M,l,OOO檢驗試劑盒或生景公司(BioVision)的ATP細胞活力檢驗試劑盒);DiOcl8試驗,一種膜透過性染料(英杰公司);葡萄糖-6-磷酸脫氫酶活性試驗(例如,英杰公司的Vibrant細胞毒性試驗);或檢測細胞LDH活性來比較癌細胞生長。本文所用的短語"抑制腫瘤形成"指有AMIGO-2調節劑存在下降低、減少或消除腫瘤形成,其中所述腫瘤包含有差別地表達AMIGO-2的細胞。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的腫瘤形成相比,AMIGO-2調節劑可將腫瘤形成降低至少25%、至少50°/。、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%,最多達100%。可采用,例如細胞試驗(例如軟瓊脂中的菌落形成);通常依賴于將感興趣細胞注射入動物的腫瘤形成體內模型(例如,無胸腺小鼠或大鼠,受輻射的小鼠或大鼠,接種入免疫特惠區,如腦、頰囊或眼,接種同系動物)和在限定時間后監測(腫瘤)塊大小來比較腫瘤形成。本文所用的短語"抑制細胞周期蛋白Dl"指降低、減少或消除AMIGO-2介導的細胞周期蛋白產生。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的AMIGO-2介導細胞周期蛋白產生相比,抑制性物質可將AMIGO-2介導的細胞周期蛋白產生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%,最多達100%。可通過以下方式比較細胞周期蛋白產生通過RT-PCR或northern印跡檢測,例如細胞周期蛋白mRNA水平;通過免疫印跡、免疫沉淀或ELISA檢測細胞周期蛋白的多肽水平;或采用功能試驗,包括利用例如靶向CDK、p21WAFl、p27KIP-1的抗體進行免疫共沉淀試驗以檢測與細胞周期蛋白調節劑,如細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK)形成復合體的細胞周期蛋白水平;和通過放射性標記與免疫沉淀分析或FRET復發,例如分子裝置公司(MolecularDevices)的CDK2/細胞周期蛋白A檢驗試劑盒來檢測CDK導致的細胞周期蛋白的磷酸化情況。本文所用的短語"抑制細胞周期蛋白Bl"指降低、減少或消除AMIGO-2介導的細胞周期蛋白產生。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的AMIGO-2介導細胞周期蛋白產生相比,抑制性物質可將AMIGO-2介導的細胞周期蛋白產生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%,最多達100%。可按照所述細胞周期蛋白D1所述的方法比較細胞周期蛋白產生。本文所用的短語"抑制FosLl"指降低、減少或消除AMIGO-2介導的FosLl產生。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的AMIGO-2介導FosLl產生相比,抑制性物質可將AMIGO-2介導的FosLl產生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%,最多達100%。可通過RT-PCR或northern印跡檢測,例如FosLlmRNA水平;或通過免疫印跡、免疫沉淀、ELISA或免疫組織化學方法檢測FosLl多肽水平來比較FosLl產生。檢測FosLl表達(例如,mRNA或蛋白質表達)的合適方法的例子見本實施例,例如Matsuo等(2000)NatureGenet24:184-187和Sahin等(2005)Pancreas30(2):158-167中也有描述。本文所用的"抑制c-Myc"指降低、減少或消除AMIGO-2介導的c-Myc產生。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的AMIGO-2介導c-Myc產生相比,抑制性物質可將AMIGO-2介導的c-Myc產生降低至少25°/。、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%,最多達100%。可通過RT-PCR或northern印跡檢測,例如c-MycmRNA水平;或通過免疫印跡、免疫沉淀、ELISA或免疫組織化學方法檢測c-Myc多肽水平來比較c-Myc產生。或者,可"功能性地"檢測c-Myc,例如通過c-Myc轉錄因子促進靶基因轉錄的能力。所述靶基因可以是內源性基因或者可以是外源性轉基因(g卩,報道基因)。可采用本文所述的任何方法檢測靶基因mRNA或蛋白質的表達。在一些例子中,所述報道基因可以是具有可檢測活性的酶(例如,螢光素酶、氯霉素乙酰基轉移酶、堿性磷酸酶或辣根過氧化物酶)或可檢測的蛋白質(例如,綠色熒光蛋白或紅色熒光蛋白)。檢測c-Myc表達(例如,mRNA或蛋白質表達)的合適方法的例子是本領域已知的,詳見本實施例。監測報道基因表達,特別是上述酶或可檢測的報道基因的方法是本領域熟知的,描述于,例如Cziepluch等(1993)Oncogene8(10):2833-8。本文所用的"抑制c-Jun"指降低、減少或消除AMIGO-2介導的c-Jun產生。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的AMIGO-2介導c-Jun產生相比,抑制性物質可將AMIGO-2介導的c-Jun產生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%,最多達100%。可通過RT-PCR或northern印跡檢測,例如c-MycmRNA水平;或通過免疫印跡、免疫沉淀、ELISA或免疫組織化學方法檢測c-Jun多肽水平來比較c-Jun產生。或者,可"功能性地"檢測c-Jun,例如通過c-Jun轉錄因子促進靶基因轉錄的能力。所述靶基因可以是內源性基因或者可以是外源性轉基因(S卩,報道基因)。可采用本文所述的任何方法檢測靶基因mRNA或蛋白質的表達。檢測c-Jun表達(例如,mRNA或蛋白質表達)的合適方法的例子是本領域己知的,詳見本實施例,例如Kharbanda等(1991)Biochemistry30:7947-7952和Kayahara等(2005)MolCellBiol25(9):3784-3792中也有描述。監測報道基因表達,特別是上述酶或可檢測的報道基因的方法是本領域熟知的,上文有所描述。本文所用的短語"抑制ERK磷酸化"指降低、減少或消除AMIGO-2介導的ERK磷酸化。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的AMIGO-2介導ERK磷酸化相比,抑制性物質可將AMIGO-2介導的ERK磷酸化降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90°/。、至少95%,最多達100%。可采用本領域技術人員已知的磷酸化試驗評估ERK磷酸化的比較。盡管不局限于任何特定的理論或作用機制,因為ERK的磷酸化通常導致其活化,但在一些實施方式中,該短語"抑制ERK磷酸化"也可指減少、降低或消除AMIGO-2介導的磷酸化ERK所致的一種或多種ERK底物磷酸化。ERK底物包括但不限于IEX-1、ELK1、樁蛋白、Bcl-2、S0S或SP1。監測ERK對其底物的激酶活性的方法是本領域已知的,描述于,例如Mediant等(1999)BBRC254:454-461;Chemiack等(1994)JBiolChem269:4717-4720;Cano等(1995)JCellSci108:3599-3609;Garcia等(2004)EMBOJ21:5151-5163和Tamura等(2004)FEBSLett569:249-255。本文所用的短語"抑制癌細胞存活"指降低或減少表達AMIGO-2的癌細胞的存活率。在一些實施方式中,術語"抑制癌細胞存活率"指影響表達AMIGO-2的癌細胞的凋亡。在一些實施方式中,與其它正常細胞和/或癌細胞相比,這些癌細胞有差別地表達AMIGO-2。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下或正常細胞中的癌細胞存活率相比,抑制性物質可將表達AMIGO-2的癌細胞存活率降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%,最多達100%。本文所用的短語"抑制AMGO-2信號傳導"指降低、減少或消除AMIGO-2對包含AMIGO-2的細胞信號傳導級聯的下游成員的作用。包含AMIGO-2的細胞信號傳導級聯包括介導細胞生長和存活的途徑。在一些實施方式中,介導細胞生長和存活的這些途徑是活化的生長因子途徑,例如EGFR途徑或(3-聯蛋白途徑的下游。在一些實施方式中,所述途徑是導致p-聯蛋白穩定的突變p-聯蛋白途徑,等等。在一些實施方式中,抑制AMIGO-2信號傳導上調一種或多種下游標記物。在一些實施方式中,抑制AMIGO-2信號傳導下調一種或多種下游標記物。可通過檢測細胞信號傳導途徑的下游成員的多肽或多核苷酸水平來測定AMIG0-2信號傳導的抑制情況。本領域技術人員能檢測AMIGO-2多肽和/或多核苷酸水平。本領域技術人員還能檢測AMIGO-2下游標記物的水平。本文所用的短語"抑制細胞-細胞相互作用"指降低或消除表達AMIGO-2的兩個或多個細胞之間的相互作用。在一些實施方式中,細胞之間的相互作用導致細胞信號傳導。可通過本領域已知的許多方法檢測細胞-細胞相互作用,包括但不限于觀察共同培養、預先標記的細胞之間的膜交換,例如用不同的熒光膜染料,包括西格瑪公司(Sigma)的PKH26和PKH67作標記。本文所用的短語"抑制增殖"指降低或消除AMIGO-2介導的增殖,其可通過本領域技術人員已知的許多方法檢測。細胞增殖試驗包括但不限于MTT試驗(例如,英杰公司的Vybrant⑧MTT細胞增殖檢驗試劑盒);BrdU慘入試驗(例如,英杰公司的絕對-SSBIP試驗);檢測胞內ATP水平(試驗的商品化形式包括帕金埃爾默公司的ATPLiteTM-M,1,000檢驗試劑盒或生景公司的ATP細胞活力檢驗試劑盒);DiOcl8試驗,一種膜透過性染料(英杰公司);葡萄糖-6-磷酸脫氫酶活性試驗(例如,英杰公司的Vibrant細胞毒性試驗);檢測細胞LDH活性;3H-胸苷摻入和細胞滴度Glo試驗(普羅美加公司(Promega))。本文所用的短語"抑制血管發生"指降低或消除AMIGO-2介導的血管發生。可通過本領域技術人員已知的方法檢測血管發生,包括但不限于細胞增殖試驗、細胞遷移試驗、細胞分化試驗、器官培養(離體)試驗、雞絨毛膜尿囊膜(CAM)試驗、角膜血管發生試驗、基質膠活塞試驗(Matrigelplugassay)和在SCID小鼠、裸鼠或C57BL小鼠中進行的腫瘤體積試驗。細胞遷移試驗包括但不限于盲-孔趨化室(blind-wellchemotaxischamber),例如改進的博伊登室(modifiedBoydenCharmber)和吞噬動力學軌跡試驗(Phagokinetictrackassay)。細胞分化試驗包括但不限于在膠原、纖維蛋白凝塊或基質膠中形成管道,然后進行電子顯微術。器官培養(離體)試驗包括但不限于大鼠主動脈環試驗(rataorticringassay)和雞主動脈弓試斷chickaorticarchassay)。本文所用的短語"抑制通過細胞周期進展"指減緩或停止細胞分裂。可通過溴脫氧尿苷(BRDU)摻入來檢驗細胞周期進展。這些試驗通過將BRDU摻入新合成的DNA來鑒定經歷DNA合成的細胞群。然后可利用抗-BRDU抗體(Hoshino等,1986,JCancer38,369;Campana等,1988,JImmunolMeth107,79)或通過其它方式檢測新合成的DNA。還可通過磷酸-組蛋白H3染色檢驗細胞增殖,從而通過組蛋白H3的磷酸化鑒定經歷有絲分裂的細胞群。利用對組蛋白H3的絲氨酸IO殘基的磷酸化形式具有特異性的抗體檢測組蛋白H3在絲氨酸10處的磷酸化(Chadlee,DN1995,JBiolChem270:20098-105)。還可利用[3司-胸苷摻入檢測細胞增殖(Chen,J,1996,Oncogene13:1395-403;Jeoung,J,1995,JBiolChem270:18367-73)。該i式驗能定量表征S-期DNA合成。在該試驗中,合成DNA的細胞將[SH]-胸苷摻入新合成的DNA。然后可通過標準技術檢測慘入情況,例如用閃爍計數儀(例如,貝克曼LS3800液相閃爍計數儀)計數放射性同位素。另一增殖試驗利用購自生物源國際公司(BiosourceInternational)的染料阿爾瑪藍(AlamarBlue),該染料在紅細胞中還原時發出熒光,從而能間接檢測細胞數目(Voytik-HarbmSL等,1998,InVitroCellDevBiolAnim34:239-46)。還有另一種增殖試驗,即MTS試驗依據工業化學品的體外細胞毒性評估,其利用可溶性四唑鐺鹽,MTS。MTS試驗可以商品化購得,包括普羅美加細胞滴度96⑧水性非放射性細胞增殖試驗(目錄號G5421)。還可通過軟瓊脂中的菌落形成來檢驗細胞增殖(Sambrook等,MolecularCloning(分子克隆),冷泉港,(1989))。還可通過檢測ATP水平作為代謝活性細胞的指示劑來檢驗細胞增殖。這些試驗司商品化購得,包括普羅美加公司的細胞滴度-GloTM。還可通過流式細胞術檢驗細胞周期增殖(GrayJW等(1986)IntJRadiatBiolRelatStudPhysChemMed49:237-55)。可用碘化丙啶染色細胞,用流式細胞計評估從而檢測在細胞周期不同階段的細胞累積。本文所用的"AMIGO-2下游標記物"是與在正常或健康組織中的表達水平相比,顯示在癌組織或癌細胞中表達水平改變的基因或活性,或者是有AMIGO-2調節劑存在時改變的特性。在一些實施方式中,當用本發明AMIGO-2調節劑干擾AMIGO-2時,所述下游標記物顯示表達水平改變。AMIGO-2下游標記物包括但不限于細胞周期蛋白D1、細胞周期蛋白B1、c-Myc、VEGF、尿激酶、cJcun、FosLl或ERK。在一些實施方式中,切割PARP1是AMIGO-2活性的下游標記。本文所用的短語"增加癌細胞凋亡"指在有AMIGO-2調節劑存在下增加表達AMIGO-2的癌細胞凋亡。就此而言,與沒有AMIGO-2調節劑存在下的癌細胞凋亡相比,AMIGO-2調節劑能將癌細胞凋亡增加至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%,最多100°/。。在一些實施方式中,與其它正常細胞相比和/或與其它癌細胞相比,癌細胞有差別地表達AMIGO-2。可通過檢測,例如DNA斷裂、胱冬酶活性、線粒體膜電勢喪失、活性氧中間體(ROS)產量增加、胞內酸化、染色質凝聚、細胞表面的磷脂酰絲氨酸(PS)水平和細胞膜滲透性增加來比較癌細胞凋亡。例如,可采用TUNEL試驗(末端脫氧核苷酸轉移酶dUTP切口末端標記)檢測DNA斷裂。該試驗的商品化形式可廣泛獲得,例如英杰公司的APO-BrdUTUNEL檢驗試劑盒、BD生物科學法瑪金公司(BDBiosciencesPharmmgen)的APO-DIRECTTM試劑盒和ApoAlertDNA斷裂檢驗試劑盒(克隆技術公司(Clontech),Takara生物公司(TakaraBioCompany))。可通過特定胱冬酶的特異性發熒光、生色和發光底物監測胱冬酶活性。至少胱冬酶l、2、3、6、7、8和9有商品化的檢驗試劑盒可用(參見,例如英杰公司、凱米康公司(Chemicon)、卡爾生物化學公司(CalBiochem)、生物源公司公司、生景公司)。可用能有差別地累積在健康活性線粒體上的熒光染料檢測線粒體膜電勢的喪失。一種非限制性例子是英杰公司的米圖特拉克紅系統(MitoTrackerRedsystem)。可用熒光染料檢測活性氧中間體(ROS)的產量,包括,例如英杰公司的H2DCFDA。可用熒光或生色染料檢測胞內酸化情況。可用熒光染料檢測染色質凝聚,包括,例如Hoechst33342。可檢測細胞表面的磷脂酰絲氨酸(PS)水平。例如,膜聯蛋白V對PS具有高親和力。許多可商品化購得的試驗適于監測標記膜聯蛋白V與細胞表面的結合。可利用能進入凋亡細胞但不進入壞死細胞的染料,例如英杰公司的熒光染料YO-PRO-I檢測細胞膜滲透性。本文所用的術語"上調"指增加、活化或刺激某活性或數量。本文所用的術語"N-末端"指某蛋白質的前10個氨基酸。本文所用的術語"C-末端"指某蛋白質的后IO個氨基酸。本文所用的術語"結構域"指生物分子中對該生物分子的已知或猜測的功能作出貢獻的結構部分。結構域可與其區域或部分共生,除該區域的全部或部分外,還可摻入生物分子中不同于特定區域的一部分。本文所用的術語"胞外域"指分子中在細胞以外或外部的部分。就本發明而言,N-末端胞外域指存在于分子N-末端并恰好在第一跨膜區之前的胞外域。對于(1M)區之間,例如TM2禾tl3之間的胞外域,胞外域指在AMIGO-2的第二和第三跨膜區之間并在細胞膜外的AMIGO-2部分。本文所用的術語"配體結合域"指保留AMIGO-2的相應天然序列的至少一種定性結合活性的受體中任何部分或區域。術語"區域"指生物分子的一級結構中物理上連續的部分。就蛋白質而言,區域定義為該蛋白質的氨基酸序列的連續部分。在一些實施方式中,"區域"與生物分子的功能相關。本文所用的術語"片段"指生物分子的一級結構中物理上連續的部分。就蛋白質而言,部分定義為該蛋白質的氨基酸序列的連續部分,其指至少3-5個氨基酸、至少8-10個氨基酸、至少11-15個氨基酸、至少17-24個氨基酸、至少25-30個氨基酸和至少30-45個氨基酸。就寡核苷酸而言,部分定義為該寡核苷酸的核酸序列的連續部分,其指至少9-15個核苷酸、至少18-30個核苷酸、至少33-45個核苷酸、至少48-72個核苷酸、至少75-卯個核苷酸和至少90-130個核苷酸。在一些實施方式中,生物分子的片段具有生物學活性。就本發明而言,AMIGO-2多肽片段不包含SEQIDNO:2所示完整的AMIGO-2多肽序列。在一些實施方式中,AMIGO-2片段保留了AMIGO-2的一種或多種活性。本文所用的短語"AMIGO-2相關細胞/腫瘤/樣品"等指與非癌性和/或非轉移細胞、樣品、腫瘤或其它病狀相比,特征在于有差別地表達AMIGO-2的細胞、樣品、腫瘤或其它病狀。在一些實施方式中,與非轉移性細胞、樣品、腫瘤或其它病狀相比,AMIGO-2-相關細胞、樣品、腫瘤或其它病狀的特征在于AMIGO-2表達增加。本文所用的術語"抗體"指對于靶蛋白或其片段具有特異性的單克隆抗體和多克隆抗體、單鏈抗體、嵌合抗體、雙功能/雙特異性抗體、人源化抗體、人抗體和互補決定區(CDR)-嫁接抗體,還包括抗體片段,包括Fab、Fab,、F(ab)2、scFv、Fv、駱鴕體(camelbody)或微抗體(microantibody)。術語"抗體"還包括體內治療性抗體基因轉移。本文所用的術語"單克隆抗體"指來自于基本同源的抗體群的抗體,艮口,組成該群的各抗體是一樣的,除了少量存在天然突變外。單克隆抗體是高度特異的,直接針對單一抗原位點。另外,與包含針對不同決定子(表位)的不同抗體的多克隆抗體制品相反,各單克隆抗體只針對抗原上的單一決定子。除了其特異性外,單克隆抗體的優點還在于可以人工合成,從而不會被其它抗體污染。修飾語"單克隆"表示抗體的特征是來自于基本同源的抗體群,不應理解為需要通過任何特定的方法制備抗體。例如,本發明所用的單克隆抗體可通過Kohler等Nature,256:495(1975)首先描述的方法或通過重組DNA方法(參見美國專利號4,816,567)制備。例如,還可采用Clackson等,Nature,352:624-628(1991)和Marks等,J.Mol.Biol.,222:581-597(1991)描述的技術從噬菌體抗體庫中分離"單克隆抗體"。本文的單克隆抗體專門包括"嵌合"抗體,其中重鏈和/或輕鏈的一部分與衍生自特定物種或屬于另一抗體類型或亞類的抗體的相應序列一致或同源,而鏈的其余部分與衍生自另一物種或屬于另一抗體類型或亞類的抗體的相應序列一致或同源,以及這種抗體的片段,只要它們形式所需的生物學活性(美國專利號4,816,567;和Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855(1984))。本文的感興趣嵌合抗體包括含有衍生自非人靈長類(如,古猴(OldWorldMonkey)、猿等)的可變區抗原結合序列和人恒定區序列的"靈長類化"的抗體。"抗體片段"包含完整抗體的一部分,在一些實施方式中包含其抗原結合區或可變區。抗體片段的例子包括Fab、Fab'、F(ab')2和Fv片段;雙抗體(diabody);線性抗體(Zapata等,ProteinEng.8(10):1057-1062[1995]);單鏈抗體分子;和抗體片段形成的多特異性抗體。"完整"的抗體是包含抗原結合可變區以及輕鏈恒定區(QJ和重鏈恒定區Cm、Ch2和Ch3的抗體。恒定區可以是天然序列恒定區(如人天然序列恒定區)或其氨基酸序列變體。在一些實施方式中,完整抗體具有一種或多種效應功能。抗體"效應功能"是指抗體的Fc區(天然序列Fc區或氨基酸序列變體Fc區)所具有的那些生物學活性。抗體效應功能的例子包括Clq結合;補體依賴的細胞毒性;Fc受體結合;抗體依賴的細胞介導的細胞毒性(ADCC);吞噬作用;細胞表面受體(如,B細胞受體;BCR)的下調等。"抗體依賴的細胞介導的細胞毒性"或"ADCC"指某種形式的細胞毒性,其中分泌的Ig結合到某種細胞毒性細胞(如,天然殺傷(NK)細胞、中性粒細胞和巨噬細胞)表面的Fc受體(FcR)上,使這些細胞毒性效應細胞與攜帶抗原的靶細胞特異性結合,隨后用細胞毒素殺傷靶細胞。抗體"武裝"細胞毒性細胞,這是發揮這種殺傷作用所必須的。介導ADCC的初級細胞,NK細胞只表達FcyRin,而單核細胞表達FcyRI、FcyRII和FcyRIII。Ravetch和Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457-92(1991)第464頁的表3中總結了造血細胞的FcR表達。為了評估感興趣分子的ADCC活性,可以進行體外ADCC試驗,如美國專利號5,500,362或5,821,337所描述的。可用于這種試驗的效應細胞包括外周血單個核細胞(PBMC)和天然殺傷(NK)細胞。另外,可以體內評估感興趣分子的ADCC活性,例如在動物模型中,如Clynes等,(USA)95:652-656(1998)所描述的。"人效應細胞"是表達一種或多種FcR并且執行效應功能的白細胞。在一些實施方式中,這些細胞至少表達FcyRni,并執行ADCC效應功能。能介導ADCC的人白細胞的例子包括外周血單個核細胞(PBMC)、天然殺傷(NK)細胞、單核細胞、細胞毒性T細胞和中性粒細胞。可從其天然資源,例如從本文所述的血液或PBMC中分離效應細胞。術語"Fc受體"或"FcR"用于描述可結合抗體Fc區的受體。在一些實施方式中,FcR是天然序列人FcR。另外,在一些實施方式中,FcR是能結合IgG抗體的受體(y受體),包括FcyRI、FcyRII和FqRin亞類的受體,其中包括這些受體的等位基因變體和其它剪接形式。FcYRII受體包括FcyRIIA("活化受體")和FqRIIB("抑制受體"),氨基酸序列相似,區別主要在其胞漿區。活化受體FcyRIIA在其胞槳區含有免疫受體酪氨酸活化基序(ITAM)。抑制受體FcYRIIB在其胞漿區含有免疫受體酪氨酸抑制基序(ITIM)。(參見綜述M,見Daron,Annu.Rev.Immunol.15:203-234(1997))。FcR的綜述見Ravetch和Kinet,Annu.Rev.Immunol9:457-92(1991);Capel等,Immunomethods4:25陽34(1994);以及deHaas等,J.Lab.Clin.Med.126:330-41(1995)。其它FcR,包括未來可能鑒定的那些,都屬于本文術語"FcR"。該術語還包括新生兒受體,FcRn,它負責母體IgG向胎兒轉運(Guyer等,J.Immunol.117:587(1976)和Kim等,J.Immunol.24:249(1994))。"補體依賴的細胞毒性"或"CDC"指有補體存在下分子溶解耙標的能力。通過補體系統的第一組分(Clq)與能與同源抗原形成復合物的分子(如抗體)結合啟動補體活化途徑。為評估補體活化,可進行CDC試驗,如Gazzano-Santoro等,J.Immunol.Methods202:163(1996)所述。本文所用的術語"表位"指多肽的抗原決定子。在一些實施方式中,表位可包含該表位獨特空間構象的3個或更多個氨基酸。在一些實施方式中,表位可以是線性或構象表位。表位通常包含至少4個、至少6個、至少8個、至少10個和至少12個這種氨基酸。更常見是包含至少8-10個這種氨基酸。本領域已知測定氨基酸空間構象的方法,包括,例如x-射線晶體學和2-維核磁共振。短語"互補決定區"指一起決定天然免疫球蛋白結合位點中天然Fv區的結合親和力和特異性的氨基酸序列。參見,例如Chothia等,JMolBiol196:901-917(1987),Kabat等,美國健康與人類服務部(USDeptofHealthandHumanServices)NIH出版號91-3242(1991)。短語"恒定區"指抗體分子中賦予效應功能的那部分。在本發明中,人恒定區取代了小鼠恒定區。目標人源化抗體的恒定區衍生自人免疫球蛋白。重鏈恒定區可選自5種同種型a、S、s、Y和n。使抗體人源化的一種方法包括比對非人重鏈和輕鏈序列與人重鏈和輕鏈序列,依據該比對結果選擇并用人框架區替換非人框架區,分子建模來預測人源化序列的構象以及與親代抗體的構象作比較。在該方法后對CDR區中干擾CDR結構的殘基進行反復回突變,直至人源化序列模型的預測構象近似親代非人抗體的非人CDR的構象。還可衍生這些人源化抗體以促進攝取和清除,例如通過Ashwell受體。參見,例如通過引用納入本文的美國專利號5,530,101和5,585,089。可利用各種抗體/免疫球蛋白框架或支架,只要得到的多肽包含至少一個靶蛋白特異性結合區。這些框架或支架包括人免疫球蛋白的5種主要同種型或它們的片段(例如本文它處公開的),包括其它動物的免疫球蛋白,優選具有人源化部分。在這點上,尤其感興趣的是單一重鏈抗體,例如在駱駝中鑒定的那些。本領域技術人員不斷發現和開發新型框架、支架和片段。利用可將本發明CDR嫁接于其上的非免疫球蛋白支架,可產生基于抗體的非免疫球蛋白。可利用已知或其它非免疫球蛋白框架和支架,只要它們包含靶標的特異性結合區。本文將這些化合物稱為"包含靶標特異性結合區的多肽"。已知的非免疫球蛋白框架或支架包括但不限于Adnectins(纖連蛋白)(化合物療劑公司(CompoundTherapeutics,Inc),沃爾瑟姆,馬薩諸塞州)、錨蛋白(分子伴侶公司(MolecularPartnersAG),蘇黎世,瑞士)、結構域抗體(domainantibody)(多門提斯有限公司(Domantis,Ltd),劍橋,馬薩諸塞州和阿比耐克斯公司(Ablynxnv)(茨維納德(Zwijnaarde),比利時))、脂籠蛋白(安提卡林(Anticalin))(拜恩斯蛋白實驗室公司(PiensProteolabAG),弗萊興(Freising),德國)、小模塊免疫藥物(smallmodularimmuno-pharmaceuticals)(特魯賓醫藥公司(TrubionPharmaceuticalsInc),西雅圖,華盛頓州)、麥克西體(maxybody)(阿維迪亞公司(Avidia,Inc)(芒廷維尤(MountainView),加利福尼亞州))、A蛋白(親和體公司(AffibodyAG),瑞典)和親和蛋白(affilin)(y-晶體蛋白或泛素)(希爾蛋白質股份有限公司(ScilProteinsGmbH),哈雷(Halle),德國)。(iii)麥克西體/高親合性聚合體(Avimer)-阿維迪亞公司高親合性聚合體衍生自含有天然A-結構域的蛋白,例如LRP-1。這些結構域在其本質上用于蛋白質-蛋白質相互作用,在人類中,250種以上的蛋白質在結構上基于A-結構域。高親合性聚合體由通過氨基酸接頭相連的許多不同"A-結構域"單體(2-10)構成。可采用,例如美國專利公布20040175756、20050053973、20050048512和20060008844所述的方法產生能結合靶抗原的高親合性聚合體。術語"拮抗劑"以廣義使用,包括部分或完全阻斷、抑制或中和本文所述腫瘤細胞抗原的生物學活性的任何分子。同樣,術語"激動劑"也以廣義使用,包括可模擬本文所述腫瘤細胞抗原的生物學活性的任何分子。合適的激動劑或拮抗劑分子尤其包括激動劑或拮抗劑抗體或抗體片段、腫瘤細胞抗原的片段或氨基酸序列變體、肽、反義寡核苷酸、小有機分子等。鑒定腫瘤細胞抗原的激動劑或拮抗劑的方法包括使表達感興趣抗原的腫瘤細胞與候選激動劑或拮抗劑分子接觸,檢測與腫瘤細胞抗原正常相關的一種或多種生物學活性的可檢測變化。拮抗劑還可以是通過合理設計或通過噬菌體展示產生的肽(參見,例如1998年8月13日公布的W098/35036)。在一個實施方式中,備選分子是根據抗體的CDR設計的"CDR模擬物"或抗體類似物。雖然這種肽本身是拮抗性的,但該肽任選與細胞毒劑融合以增加或增強該肽的拮抗特性。本文所用的術語"寡核苷酸"指一系列相連的核苷酸殘基。寡核苷酸包括但不限于反義和siRNA寡核苷酸。寡核苷酸包含DNA序列的一部分,其具有至少約io個核苷酸和最多約500個核苷酸。在一些實施方式中,寡核苷酸包含約10個核苷酸-約50個核苷酸,約15個核苷酸-約30個核苷酸,約20個核苷酸-約25個核苷酸。寡核苷酸可以是化學合成的,其還可用作探針。在一些實施方式中,寡核苷酸是單鏈的。在一些實施方式中,寡核苷酸包含的至少一部分是雙鏈。在一些實施方式中,寡核苷酸是反義寡核苷酸(ASO)。在一些實施方式中,寡核苷酸是RNA干擾寡核苷酸(RNAi寡核苷酸)。本文所用的術語"反義寡核苷酸"指具有AMIG0-2多核苷酸序列的互補核苷酸序列的未修飾或修飾核酸,所述AMIG0-2多核苷酸序列包含與AMIGO-2的轉錄或翻譯相關的多核苷酸序列(例如,AMIGO-2多核苷酸的啟動子),其中所述反義寡核苷酸能與AMIGO-2多核苷酸序列雜交。尤其感興趣的是能在體外或體內抑制AMIGO-2多肽的編碼多核苷酸轉錄和/或翻譯的反義寡核苷酸。本文所用的術語"siRNA寡核苷酸"、"RNAi寡核苷酸"、"短干擾RNA"或"siRNA"可互換使用,指通過轉錄后基因剪接而起作用的寡核苷酸,也稱為RNA干擾(RNAi)。這些術語指能實施RNA干擾"RNAi"的雙鏈核酸分子(參見Kreutzer等,WO00/44895;ZemickaGoetz等,WO01/36646;Fire,WO99/32619;Mello和Fire,WO01/29058)。siRNA分子通常是RNA分子,但也包括化學修飾的核苷酸和非核苷酸。通過將siRNA瞬時轉移入細胞進行siRNA基因靶向實驗(通過經典方法,例如脂質體-介導的轉染、電穿孔或微量注射進行)。siRNA分子是21-到23-核苷酸RNA,含有特征性的2-到3-核苷酸3'突出端類似于正常啟動RNAi的長雙鏈RNA(dsRNA)的RNA酶III加工產物。本文所用的術語"引誘受體"指包含能結合AMIGO-2配體的多肽、模擬物或其它大分子的至少一部分的受體。本文所用的術語"治療有效量"表示藥物的用量,當將治療有效量的藥物給予個體時,可產生醫學作用,即觀察到該個體中一種或多種臨床終末點、癌細胞的生長和/或存活或癌細胞的轉移發生降低或逆轉。與將不含活性成分的組合物給予類似情況的個體時觀察到的作用相比,治療有效量一般通過它們具有的療效確定。對于某對象的精確有效量取決于該對象的體形和健康狀況、病癥的性質和程度以及選擇給予的治療劑和治療劑組合。然而,常規實驗可確定給定狀況的有效量,臨床醫師也可作出判斷。本文所用的術語"組合"或"聯用"指聯合給予本發明的AMIGO-2調節劑和其它治療方案。本文所用的術語"敏感的"指AMIGO-2治療是可接受的治療方法的患者,即,可能起陽性反應的患者。在一些實施方式中,與對AMIGO-2治療不敏感的那些患者相比,對AMIGO-2治療敏感的癌癥患者表達高水平的AMIGO-2。在一些實施方式中,不是AMIGO-2治療的優良候選對象的癌癥患者包括腫瘤樣品的癌細胞中缺乏AMIGO-2或其水平較低的癌癥患者。在一些實施方式中,相比于AMIGO-2定位于癌細胞的其它區域,較高比例的AMIGO-2定位于細胞膜的患者表明相比于非細胞膜定位的AMIGO國2,這些患者對AMIGO-2治療的敏感性高于細胞膜定位的AMIGO-2比例較低的那些患者。在一些實施方式中,定位于細胞膜的AMIG0-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2之比至少為2:1表明該患者具有AMIGO-2相關癌癥,并對AMIGO-2治療敏感。在一些實施方式中,定位于細胞膜的AMIGO-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2之比至少為3:1表明該患者具有AMIGO-2相關癌癥,并對AMIGO-2治療敏感。本文所用的術語"檢測"表示建立、發現或確認某活性(例如基因表達)或生物分子(例如多肽)的證據。"天然序列"多肽是具有與衍生自自然界的多肽相同的氨基酸序列的多肽。這些天然序列多肽可以從自然界分離或可通過重組或合成方法產生。因此,天然序列多肽可具有天然人多肽、鼠科多肽或任何其它哺乳動物多肽的氨基酸序列。術語"氨基酸序列變體"指所具有的氨基酸序列在一定程度上不同于天然序列多肽的多肽。氨基酸序列變體通常與天然配體的至少一個受體結合區或與天然受體的至少一個配體結合區或其多個配體結合區有至少約70%、至少約80%同源性或至少約90%同源性。氨基酸序列變體在天然氨基酸序列的氨基酸序列內的某些位置具有取代、缺失和/或插入。本文所用的短語"同源核苷酸序列"或"同源氨基酸序列"或它們的改變形式指特征在于在核苷酸水平或氨基酸水平上具有至少一定百分比的同源性的序列,該短語可與"序列相同性"互換使用。同源核苷酸序列包括編碼蛋白質同種型的那些序列。這些同種型可因,例如RNA的另路剪接而在同一生物的不同組織中表達。或者,可由不同基因編碼同種型。同源核苷酸序列包括編碼除人以外的物種(包括但不限于哺乳動物)的蛋白質的核苷酸序列。同源核苷酸序列還包括但不限于本文所示核苷酸序列的天然等位基因改變和突變。同源氨基酸序列包括含有不超過50(例如,不超過1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、20、25、30、35、40或50)個保守性氨基酸取代的那些氨基酸序列,這些多肽保留天然多肽的至少25%(例如,至少25%、至少30°/。、至少35%、至少40%、至少50%、至少55%、至少60%、至少70%、至少80%、至少卯%、至少95%、至少98%、至少99%、至少99.5%或100%或更高)結合能力和/或活性。保守性取代通常包括下組內的取代甘氨酸和丙氨酸;纈氨酸、異亮氨酸和亮氨酸;天冬氨酸和谷氨酸;天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸和蘇氨酸;賴氨酸、組氨酸和精氨酸;以及苯丙氨酸和酪氨酸。同源氨基酸序列可包括缺乏1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個氨基酸區段(由兩個或更多個氨基酸構成)或不連續的單一氨基酸的氨基酸序列缺失變體。在一些實施方式中,同源氨基酸序列可含有一個或多個(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、20個以上)氨基酸插入。在一些實施方式中,同源氨基酸序列可含有保守性取代、插入和/或缺失。例如,可通過采用Smith和Waterman算法(AdvApplMath,1981,2,482-489)的Gap程序(威斯康星序列分析包(WisconsinS叫uenceAnalysisPackage),用于UNIX的8版,遺傳學計算機組(GeneticsComputerGroup),大學研究園區(UniversityResearchPark),麥迪遜,威斯康星州),利用默認設置測定同源性或相同性百分比。在一些實施方式中,探針和耙標之間的同源性在約50%-約60%之間。在一些實施方式中,核酸具有與SEQIDNO:l或其一部分約70%、約80%、約85°/。、約90%、約92%、約94°/。、約95%、約97%、約98%、約99%和約100%同源的核苷酸。在一些實施方式中,同源物具有與SEQIDNO:l相同的活性。在一些實施方式中,同源物與SEQIDNO:l共有相同的表達分布。同源性還可以是多肽水平上的。在一些實施方式中,多肽與SEQIDNO:2或其一部分約60%、約70%、約80%、約85%、約90%、約92%、約94°/。、約95%、約97%、約98°/。、約99%和約100°/。同源。在一些實施方式中,同源物具有與SEQIDNO:2相同的活性。在一些實施方式中,同源物與SEQIDNO:2共有相同的表達分布。本文所用的術語"探針"指長度不同的核酸序列。在一些實施方式中,探針包含至少約10個,最多約6,000個核苷酸。在一些實施方式中,探針包含至少12、至少14、至少16、至少18、至少20、至少25、至少50或至少75個連續核苷酸。探針可用于檢測相同、相似或互補的核酸序列。較長的探針通常小天然或重組來源獲得,其對靶序列高度特異且與靶標的雜交遠慢于寡聚物。探針可以是單鏈或雙鏈的,其設計成在PCR、基于膜的雜交、原位雜交(ISH)、熒光原位雜交(FISH)或ELISA-樣技術中具有特異性。本文所用的術語"混合"指將一種或多種化合物、細胞、分子等組合在同一區域中的過程。這可在,例如試管、培養皿或能混合一種或多種化合物、細胞或分子的任何容器中進行。本文所用的術語"分離的"指多核苷酸、多肽、抗體或宿主細胞所處環境不同于該多核苷酸、多肽或抗體天然所處的環境。本領域技術人員熟知分離細胞的方法。分離的多核苷酸、多肽或抗體通常基本上是純的。本文所用的術語"基本上純的"指從其天然環境中取出的化合物(例如,多核苷酸或多肽或抗體),其至少60%、至少75%和至少90%不含天然與其相連的其它組分。本文所用的術語"結合"表示兩個或多個生物分子或化合物之間的物理或化學相互作用。結合包括離子、非離子、氫鍵、范德華力、疏水相互作用等。結合可以是直接的,或者通過或因另一生物分子或化合物的作用而間接結合。直接結合指不通過或不因另一分子或化合物的作用,而是沒有其它實質性化學中間體即可發生的相互作用。本文所用的術語"接觸"表示直接或間接地將一個分子帶至第二分子的物理鄰近范圍內。所述分子可以是許多緩沖劑、氧、溶液等。"接觸"包括,例如將多核苷酸置于含有核酸分子的燒杯、微量滴定板、細胞培養燒瓶或微陣列等中。接觸還包括,例如將抗體置于含有多肽的燒杯、微量滴定板、細胞培養燒瓶或微陣列等中。接觸可在體內、離體或體外發生。本文所用的短語"嚴格雜交條件"或"嚴格條件"指探針、引物或寡核苷酸與其靶序列雜交但盡可能少地與其它序列雜交的條件。嚴格條件依賴于序列,并且在不同環境中有區別。較長的序列在較高溫度下特異性雜交其合適的互補序列。通常選擇的嚴格條件比確定離子強度和pH下特定序列的解鏈溫度(TJ約低5'C。Tm是50%與靶序列互補的探針與該靶序列雜交平衡時的溫度(確定的離子強度、pH和核酸濃度下)。由于靶序列通常過量存在,在Tm下,平衡時有50%的探針與它們的互補序列雜交。嚴格條件通常是鹽濃度低于約1.0M鈉離子,通常是約0.01-1.0M鈉離子(或其它鹽),pH7.0-8.3,對于短探針、引物或寡核苷酸(例如10-50個核苷酸),溫度至少約30'C,對于較長的探針、引物或寡核苷酸,溫度至少約60'C。還可加入去穩定劑,例如甲酰胺以獲得嚴格條件。本文所用的術語"中等嚴格條件"指探針、引物或寡核苷酸與其靶序列雜交但也與少量其它序列雜交的條件。中等嚴格條件依賴于序列,并且在不同環境中有區別。本領域技術人員熟知中等條件,其描述于Maniatis等(MolecularCloning:ALaboratoryManual(分子克隆實驗室手冊),冷泉港實驗室,第2版(1989年12月)),等等。本文所述的核酸組合物可用于,例如,制備多肽,用作檢測生物學樣品(例如,人細胞提取物)中的mRNA或從這種樣品產生的cDNA的探針,產生額外拷貝的多核苷酸序列,產生核酶或寡核苷酸(單鏈和雙鏈),用作單鏈DNA探針或形成三鏈的寡核苷酸(triple-strandformingoligonucleotide)。本文所述的探針可用于,例如測定樣品中是否存在本文提供的多核苷酸。這些多肽可用于產生癌癥相關多肽的特異性抗體,進而可用于本文詳細討論的診斷方法、預后方法等。多肽還可用作治療干預的靶標,如本文詳細討論的。本發明抗體還可用于,例如純化、檢測和靶向本發明多肽,包括在體外和體內診斷和治療方法中。例如,這些抗體可用于免疫測定來定性和定量檢測生物學樣品中本發明多肽的水平。參見,例如Harlow等,Antibodies:ALaboratoryManual(抗體實驗室手冊),(冷泉港實驗室出版社,第2版,1988)。下文詳細描述了這些和其它應用。本文所用的術語"顯像劑"指與本發明抗體、小分子或探針相連的組合物,其可用本領域技術人員已知的技術檢測。本文所用的術語"基因表達的證據"指基因表達的任何可檢測的標記。.術語"藥學上可接受的載體"指給予治療劑,例如抗體或多肽、基因和其它治療劑的載體。該術語指本身不誘導對接受組合物的個體有害的抗體產生并且可以給予而不產生過度毒性的任何藥物載體。合適的載體可以是大的、代謝緩慢的大分子,例如蛋白質、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、多聚氨基酸、氨基酸共聚物、脂質聚集物和滅活的病毒顆粒。本領域技術人員熟知這些載體。治療組合物中藥學上可接受的載體可包括液體,例如水、鹽水、甘油和乙醇。這些載體中也可存在輔助物質,例如潤濕劑或乳化劑、pH緩沖物質等。本發明方法和組合物可治療的癌癥的具體例子包括但不限于AMIGO-2相關癌癥。與非癌性細胞相比,本文所用的"AMIGO-2相關癌癥"指特征在于有差別地表達AMIGO-2的細胞的癌癥。本發明還適用于AMIGO-2在以下方面起作用的任何腫瘤細胞類型染色體穩定性、激酶活性、致瘤性、轉移性、信號傳導、細胞黏著、凋亡、底物磷酸化、細胞生長、腫瘤形成、細胞周期蛋白產生、細胞增殖、細胞周期調節、癌細胞生長、癌細胞存活、依賴于貼壁的生長和血管發生、細胞遷移、細胞-細胞相互作用等。在一些實施方式中,所述癌癥是肺癌、膀胱癌、腎癌、結腸癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌或胰腺癌,或癌癥轉移。在一些實施方式中,所述癌癥是肺癌或結腸癌。在一些實施方式中,所述癌癥是除胃癌以外的癌癥。在一些實施方式中,與對照相比,這些癌癥顯示AMIGO-2表達有至少約25%、至少約50%、至少約75%、至少約100%、至少約150%、至少約200%或至少約300%不同。本發明提供用于治療、抑制和控制AMIGO-2過度表達相關疾病和病癥以及治療、抑制和控制這些疾病和病癥的癥狀的方法和組合物。本發明的一些實施方式涉及方法和組合物,包括治療、抑制或控制癌癥的組合物,包括但不限于癌癥轉移、癌細胞存活、癌細胞增殖、癌細胞生長、細胞周期調節、血管發生和癌細胞侵襲性。本發明還提供包括將其它活性成分與本發明AMIGO-2調節劑組合的方法。在一些實施方式中,這些方法還包括將一種或多種常規癌癥療劑給予患者。在一些實施方式中,本發明方法還包括用化療、放療或外科手術中的一種或多種治療患者。本發明還提供治療、抑制和控制對目前的或標準癌癥治療,例如外科手術、化療、放療、激素療法和生物療法部分或完全難治的癌癥或其它過度增生性細胞病癥或疾病的方法和組合物。本發明還提供利用本發明AMIGO-2調節劑,特別是AMIGO-2抗體診斷癌癥和/或預測癌癥進展的診斷和/或顯像方法。在一些實施方式中,本發明方法提供顯像和定位腫瘤和/或轉移的方法和診斷及預后方法。在一些實施方式中,本發明方法提供評估AMIGO-2-相關治療的適當性和/或效力的方法。AMIGO-2調節劑本發明提供AMIGO-2調節劑來治療、診斷、檢測或顯像癌癥。AMIGO-2調節劑還可用于制備治療癌癥的藥物。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是AMIGO-2抑制劑。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是核苷酸、小分子、模擬物、引誘物或抗體。在一些實施方式中AMIGO-2調節劑是分離雙鏈RNA(dsRNA);含有選自SEQIDNO:7-16所構成組的序列中至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;結合選自下組的AMIGO-2結構域中表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;小分子;模擬物;可溶性受體;或引誘物。在一些實施方式中,結合AMIGO-2結構域中表位的抗體不與除AMIGO-2以外的多肽特異性結合。例如,在一些實施方式中,抗體片段不與AMIGO-l或AMIGO-3特異性結合。在一些實施方式中,與對照相比,AMIGO-2調節劑可將AMIGO-2活性抑制至少25%、50%、75%、80%、卯%、95%、97%、98%、99%或100%。在一些實施方式中,與對照相比,AMIGO-2調節劑將LIV-l表達抑制至少25%、50%、75%、80%、卯%、95%、97%、98%、99%或100%。抗體在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人抗體、人源化抗體、單鏈抗體或Fab片段。可以,例如酶放射性同位素或熒光團標記抗體或Fab片段。在一些實施方式中,抗體或Fab片段不與除AMIGO-2以外的多肽特異性結合。例如,在一些實施方式中,抗體或Fab片段不與AMIGO-l或AMIGO-3特異性結合。在一些實施方式中,抗體或Fab片段對AMIGO-2以外的多肽的結合親和力小于約1X105Ka。在,些實施方式中,AMIGO-2調節劑是以至少1Xl()SKa的結合親和力結合AMIGO-2多肽的單克隆抗體。本發明還提供競爭性抑制某抗體與本發明表位結合的抗體,所述競爭性抑制通過本領域已知的采用,例如免疫試驗來測定競爭性結合的任何方法測定。在一些實施方式中,該抗體將與表位的結合競爭性抑制至少95%、至少90°/。、至少85%、至少80°/。、至少75%、至少70%、至少60%或至少50%。在一些實施方式中,抗體是人源化抗體。可通過各種方法獲得人源化抗體,所述方法包括,例如(l)將非人互補決定區(CDR)嫁接到人框架區和恒定區上(本領域稱為"人源化"的方法),或者(2)移植完整的非人可變區,但通過替代表面殘基用人-樣表面"掩蓋"它們(本領域稱為"鑲面(veneering)"的方法)。在本發明中,人源化抗體包括"人源化"和"鑲面"的抗體。類似地,可將人免疫球蛋白基因座引入內源性免疫球蛋白基因被部分或完全滅活的轉基因動物,例如小鼠來制造人抗體。激發后,觀察到人抗體產生,在所有方面,包括基因重排、裝配和抗體譜均類似于在人中所見。該方法描述于,例如美國專利號5,545,807;5,545,806;5,569,825;5,625,126;5,633,425;5,661,016和以下科學出版物中Marks等,Bio/Technology10,779-783(1992);Lonberg等,Nature368856-859(1994);Morrison,Nature368,812-13(1994);Fishwild等,NatureBiotechnology14,845-51(1996);Neuberger,NatureBiotechnology14,826(1996);Lonberg禾口Huszar,Intern.Rev.Immunol.1365-93(1995);Jones等,Nature321:522-525(1986);Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci,U.S.A.,81:6851-6855(1984);Morrison禾卩Oi,Adv.Immunol.,44:65-92(1988);Verhoeyer等,Science239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169-217(1994);和Kettleborough,C.A.等,ProteinEng.4(7):773-83(1991),各篇文獻通過引用納入本文。'本發明抗體可通過不同機制起作用。在一些實施方式中,抗體觸發依賴抗體的細胞毒性(ADCC),一種對抗體所耙向的細胞的裂解攻擊。在一些實施方式中,抗體具有多種治療功能,包括例如,抗原結合,誘導凋亡和依賴補體的細胞毒性(CDC)。在一些實施方式中,抗體與毒素或放射性核素偶聯。在一些實施方式中,本發明抗體可用作AMIGO-2拮抗劑。例如,在一些實施方式中,本發明提供部分或完全干擾受體/配體與本發明多肽相互作用的抗體。在一些實施方式中,本發明抗體結合本文公開的表位或其一部分。在一些實施方式中,與沒有抗體存在下的活性相比,提供的抗體能將配體活性或受體活性調節至少95%、至少90%、至少85%、至少80%、至少75%、至少70%、至少60%或至少50%。在一些實施方式中,本發明提供中和抗體。中和抗體結合感染性物質,例如病毒或細菌,如癌癥相關病毒或細菌(如JC多瘤病毒、EB病毒或幽門螺桿菌(/fe/z'co6a"w/^/oW))。在一些實施方式中,中和抗體能有效用作受體拮抗劑,即,抑制配體介導受體活化的所有或部分生物學活性。在一些實施方式中,可將抗體指定為生物學活性(包括本文公開的本發明肽特定生物學活性)的激動劑、拮抗劑或反向激動劑。在一些實施方式中,抗體抑制選自下組的一種或多種AMIGO-2活性染色體穩定性、激酶活性、致瘤性、轉移性、信號傳導、細胞黏著、細胞凋亡、底物磷酸化、癌細胞生長、腫瘤形成、細胞周期蛋白產生、細胞增殖、通過細胞周期的進展(例如,進展至細胞周期的G2/M期)、依賴貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用和血管發生,等等。在一些實施方式中,AMIGO-2抗體抑制生長和存活途徑,例如活化EGFR和突變|3連環蛋白介導的那些途徑。在一些實施方式中,AMIGO-2抗體抑制(例如,抑制mRNA或蛋白質表達)細胞周期蛋白Dl、細胞周期蛋白Bl、c-Myc、c-Jun、FosLl、胞外信號調節激酶(ERK)、血管內皮生長因子(VEGF)、尿激酶和聚ADP核糖聚合酶1(PARP1)中的一種或多種。調節VEGF和尿激酶還表明Amigo-2在血管發生中的作用。在一些實施方式中,AMIGO-2抗體調節癌細胞運動性并影響癌癥轉移。在一些實施方式中,AMIGO-2抗體調節立即早期基因和包含立即早期基因的途徑。例如,AMIGO-2抗體調節cFosLl、E2Fl、ELKl、JNK、MEKK、SAPK1p38、細胞周期D、c-Jun、c-fos、c-myc、JE、KC、junB和BTG2中的一種或多種以及相關途徑。本發明抗體可單獨使用或可與其它組合物聯用。這些抗體還可與異源多肽在N-或C-末端重組融合或化學偶聯于(包括共價和非共價偶聯)多肽或其它組合物。例如,本發明抗體可重組融合或偶聯于可用作檢測試驗標記的分子和效應分子,例如異源多肽、藥物、放射性核素或毒素。參見,例如PCT公布WO92/08495;WO91/14438;WO89/12624;美國專利號5,314,995和EP396,387。除嵌合和人源化抗體外,完全人抗體可衍生自具有人免疫球蛋白基因的轉基因小鼠(參見,例如美國專利號6,075,181;6,091,001和6,114,598,所有均通過引用納入本文),或衍生自人免疫球蛋白基因的噬菌體展示文庫(參見,例如McCafferty等,Nature,348:552-554(19卯);Clackson等,Nature,352:624-628(1991);和Marks等,J.Mol.Biol.,222:581-597(1991))。在一些實施方式中,可通過scFv-噬菌體展示文庫產生和鑒定抗體。可從商業來源,例如魔弗希斯公司(Morphosys)獲得抗體噬菌體展示技術。可采用Kohler等((1975)Nature256495-496)的方法獲取改進方法制備單克隆抗體。通常用含有抗原的溶液免疫小鼠。可通過在鹽水,一些實施方式中在佐劑,例如完全弗氏佐劑中混合或乳化含抗原的溶液,然后胃腸外注射該混合物或乳液來進行免疫。可用本領域己知的任何免疫方法獲得本發明的單克隆抗體。免疫動物后,取出脾臟(任選取出幾個大的淋巴結),解離成單細胞。可將細胞懸液施加于包被了感興趣抗原的平板或孔上來篩選脾細胞。表達抗原特異性的膜結合免疫球蛋白的B細胞與平板結合而不會洗去。然后誘導得到的B細胞或所有解離的脾細胞與骨髓瘤細胞融合以形成雜交瘤,在選擇性培養基中培養。通過連續或有限稀釋接種得到的細胞,檢驗特異性結合感興趣抗原(不結合無關抗原)的抗體產生。然后體外(例如,在組織培養瓶或中空纖維反應器中)或體內(作為小鼠的腹水)培養選擇的分泌單克隆抗體(mAb)的雜交瘤。作為用雜交瘤表達的備選方法,可以用諸如CHO或骨髓瘤細胞系等細胞系產生抗體,如各自通過引用納入本文的美國專利號5,545,403;5,545,405和5,998,144所述。簡言之,用分別能表達輕鏈和重鏈的載體轉染細胞系。通過在不同的載體上轉染兩種蛋白質,可產生嵌合抗體。Immunol.147:8;Banchereau等,(1991)Clin.Immunol.Spectrum3:8;和Banchereau等,(1991)Science251:70;均通過引用納入本文。還可采用本領域己知的技術產生人抗體,包括噬菌體展示文庫(Hoogenboom和Winter,JMolBiol,227:381(1991);Marks等,JMolBiol,222:581(1991))。還可采用Cole等和Boerner等的技術制備人單克隆抗體(Cole等,MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy(單克隆抗體和癌癥治療),ARL公司(AlanR.Liss),第77頁(1985)和Boerner等,J.Immunol.,147(1):8695(1991))。可通過各種方法獲得人源化抗體,所述方法包括,例如(l)將非人互補決定區(CDR)嫁接到人框架區和恒定區上(本領域稱為"人源化"的方法),或者(2)移植完整的非人可變區,但通過替代表面殘基用人-樣表面"掩蓋"它們(本領域稱為"鑲面"的方法)。在本發明中,人源化抗體包括"人源化"和"鑲面"的抗體。類似地,可將人免疫球蛋白基因座引入內源性免疫球蛋白基因被部分或完全滅活的轉基因動物,例如小鼠來制造人抗體。激發后,觀察到人抗體產生,在所有方面,包括基因重排、裝配和抗體譜均類似于在人中所見。該方法描述于,例如美國專利號5,545,807;5,545,806;5,569,825;5,625,126;5,633,425;5,661,016和以下科學出版物中Marks等,Bio/Technology10,779-783(1992);Lonberg等,Nature368856-859(1994);Morrison,Nature368,812-13(1994);Fishwild等,NatureBiotechnology14,845-51(1996);Neuberger,NatureBiotechnology14,826(1996);Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.1365-93(1995);Jones等,Nature321:522-525(1986);Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci,U.S.A.,81:6851-6855(1984);Morrison禾BOi,Adv.Immunol.,44:65-92(1988);Verhoeyer等,Science239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169-217(1994);和Kettleborough,C.A.等,ProteinEng.4(7):773-83(1991),各篇文獻通過引用納入本文。可利用商業來源,例如魔弗希斯公司(Martinsned/Planegg,德國),在篩選試驗中鑒定完全人源化的抗體。可利用經工程改造而含有人免疫球蛋白基因座的轉基因動物產生人抗體。例如,WO98/24893公開了具有人IgG基因座的轉基因動物,其中所述動物因內源性重鏈和輕鏈基因座滅活而不產生內源性功能免疫球蛋白。WO91/10741還公開了能對免疫原產生免疫應答的轉基因非靈長類哺乳動物宿主,其中抗體具有靈長類恒定區和/或可變區,其中編碼內源性免疫球蛋白的基因座被取代或滅活。WO96/30498公開了利用Cre/Lox系統修飾哺乳動物的免疫球蛋白基因座,例如替代所有或部分恒定區或可變區以形成修飾的抗體分子。WO94/02602公開了具有滅活的內源性Ig基因座和功能性人Ig基因座的非人哺乳動物宿主。美國專利號5,939,598公開了制備轉基因小鼠的方法,該小鼠缺乏內源性重鏈,表達含一個或多個異基因恒定區的外源性免疫球蛋白基因座。還可采用通過引用納入本文的美國專利號5,766,886所述的人工程改造技術產生本發明抗體。利用上述轉基因動物可產生免疫應答,從而能在先額抗原性分子,可從動物中取出產生抗體的細胞并用于產生分泌人單克隆抗體的雜交瘤。本領域已知免疫方案、佐劑等,可用于免疫,例如WO96/33735所述的轉基因小鼠。可檢驗單克隆抗體抑制或中和相應蛋白質的生物學活性或生理學作用的能力。可通過Fang等(2005),NatBiotechnol23,584-590所述的體內治療性抗體基因轉移將本發明抗體給予對象。例如,可產生重組載體以遞送多順反子表達盒,所述重組載體在Mab重鏈和輕鏈編碼序列之間含有介導多肽的酶不依賴性共翻譯自身切割的肽。表達產生化學計量量的兩種Mab鏈。在一些實施方式中,介導酶不依賴性共翻譯自身切割的肽是口蹄疫衍生的2A肽。抗體片段適用于本發明方法,只要它們保留全長抗體的所需親和力。因此,抗-AMIGO-2抗體的片段保留結合AMIGO-2的能力。這些片段的特征在于類似于相應的全長抗-AMIGO-2抗體的特性。即這些片段特異性結合表達于人細胞表面的人AMIGO-2抗原。在一些實施方式中,這些抗體特異性結合AMIGO-2胞外域中的一種或多種表位。在一些實施方式中,這些抗體調節一種或多種AMIGO-2相關生物學活性。在一些實施方式中,這些抗體抑制激酶活性、致瘤性、轉移性、AMIGO-2信號傳導、AMIGO-2介導細胞黏著、癌細胞凋亡、ERK磷酸化、細胞生長、腫瘤形成、細胞周期蛋白產生、細胞增殖、通過細胞周期進展、不依賴貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種相互作用和血管發生,等等中的一種或多種。在一些實施方式中,這些抗體是特異性結合選自下組的AMIGO-2結構域中一種或多種AMIGO-2表位的單克隆抗體或Fab片段信號肽結構域、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域。信號肽結構域大致是SEQIDNO:2的氨基酸1-33;LRR-N-末端(LRR-NT)結構域大致是SEQIDNO:2的氨基酸41-60;LRR1結構域大致是SEQIDNO:2的氨基酸69-92;LRR2結構域大致是氨基酸94-116;LRR3結構域大致是氨基酸118-140;LRR4結構域大致是氨基酸142-164;LRR5結構域大致是167-191;LRR6結構域大致是氨基酸193-216;LRR-C-末端(LRR-CT)結構域大致是氨基酸222-282;IgV-組結構域大致是293-388;AMIGO-2的Ig結構域在V-組結構域,大致是氨基酸303-365。在一些實施方式中,這些抗體是特異性結合AMIGO-2的信號肽中一個或多個表位的單克隆抗體。在一個實施方式中,所述抗體不與非AMIGO-2表位的表位特異性結合。例如,在一個實施方式中,所述抗體不與AMIGO-2表位或AMIGO-3表位特異性結合。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRRNT結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRR1結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRR1表位選自SEQIDNO:30或SEQIDNO:57。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LKR2結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRR2表位選自SEQIDNO:32、SEQIDNO:39或SEQIDNO:61。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRR3結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRR3表位選自SEQIDNO:29、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:56或SEQIDNO:58。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRR4結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRR4表位選自SEQIDNO:26、SEQIDNO:35或SEQIDNO:45。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRR5結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRR5表位選自SEQIDNO:25、SEQIDNO:27、SEQIDNO:36或SEQIDNO:53。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRR6結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRR6表位選自SEQIDNO:31、SEQIDNO:33、SEQIDNO:41、SEQIDNO:46、SEQIDNO:47或SEQIDNO:62。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的LRRCT結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,所述LRRCT表位選自SEQIDNO:28、SEQIDNO:34、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:44、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60或SEQIDNO:62。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的IgV-組結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的Ig結構域的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合AMIGO-2的胞外域(ECD)的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合基本上由SEQIDNO:3所構成序列的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。本發明的合適抗體可識別線性或構象表位,或它們的組合。在一些實施方式中,本發明抗體結合選自SEQIDNO:3-6或SEQIDNO:25-62的AMIGO-2中抗原性區域的表位。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是特異性結合基本上由SEQIDNO:3所構成序列的一種或多種表位的單克隆抗體或Fab片段。在一些實施方式中,抗體對具有SEQIDNO:3所示序列的表位有特異性。應該知道這些肽不一定精確地表示一種表位的圖譜,而是還可包含不具有免疫原性的AMIGO-2序列。本領域技術人員熟知預測本發明抗體可結合的潛在表位的方法,包括但不限于Kyte-Doolittle分析(Kyte,J.和Dolittle,R.F.,J.Mol.Biol.(1982)157:105-132)、Hopp和Woods分析(Hopp,T.P.禾口Woods,K.R.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1981)78:3824-3828;Hopp,T丄和Woods,K.R.,Mol.Immunol.(1983)20:483-489;Hopp,T丄,J.Immunol.Methods(1986)88:1-18.)、Jameson-Wolf分析(Jameson,B.A.和Wolf,H.,Comput.Appl.Biosci.(1988)4:181-186.)和Emini分析(Emini,E.A.,Schlief,W.A.,Colonno,R丄和Wimmer,E.,Virology(1985)140:13-20)。在一些實施方式中,通過測定理論胞外域鑒定潛在的表位。可采用諸如TMpred(參見K.Hofmann禾口W.Stoffel(1993)TMbase-Adatabaseofmembranespanningproteinssegments(TM基礎-一種跨膜蛋白質區段的數據庫)Biol.Chem.Hoppe-Seyler374,166)或TMHMM(A.Krogh,B.Larsson,G.vonHeijne和E.L.L.Sonnhammer.,PredictingtransmembraneproteintopologywithahiddenMarkovmodel:Applicationtocompletegenomes(用隱馬爾禾斗夫模型預測跨膜蛋白質拓撲學完整基因組的應用).JournalofMolecularBiology,305(3):567-580,2001年1月)的分析算法作出這種預測。可采用其它算法,例如SignalP3.0(Bednsten等,(2004)JMolBiol.2004年7月16日;340(4):783-95)預測信號肽的存在并預測那些肽在何處從全長蛋白質上切下。蛋白質的胞外部分可用作抗體相互作用的靶標。如果1)抗體顯示閾值水平的結合活性,和/或2)它們不與已知的相關多肽分子明顯交叉反應,則將這些抗體定義為"特異性結合"。本領域技術人員不難測定抗體的結合親和力,例如可通過Scatchard分析(Scatchard,Ann.NYAcad.Sci.51:660-672,1949)。在一些實施方式中,對于靶癌癥相關多肽,本發明抗體結合它們的靶表位或模擬引誘物比結合AMIGO家族的其它已知成員(例如,AMIGO-1和AMIGO-3)高至少1.5-倍、2-倍、5-倍、10-倍、100-倍、103-倍、104-倍、105-倍、106-倍或更高。在一些實施方式中,這些抗體的結合親和力為1(^M或不到、10々M或不到、10-9M或不到或亞納摩爾(subnanomolar)的親和力(0.9、0.8、0.7、0.6、0.5、0.4、0.3、0.2、0.1nM或更低)。在一些實施方式中,這些抗體對AMIGO-2的結合親和力是至少1x1(^Ka。在一些實施方式中,這些抗體對AMIGO-2的結合親和力是至少5x106Ka、至少lxl()7Ka、至少2xl()7Ka、至少1x108Ka或更高。還可借鑒本發明多肽的結合親和力描述或說明本發明抗體。在一些實施方式中,結合親和力包括低于5x1(T2M、1(T2M、5xl(T3M、l(T3M、5x10-4M、10-4M、5x10-5M、10-5M、5x10-6M、l(T6M、5xl(T7M、10-7M、5xlO—8M、10-8M、5xl(T9M、10—9M、5xl(T10M、10-10M、5x10-11M、10-11M、5x10-12M、10-12M、5xl(T13M、10-13M、5x10-14M、1(T14M、5xlCT15M、or10—"M過更低的Kd。在一些實施方式中,采用標準蛋白質印跡分析(Ausubel等,CurrentProtocolsinMolecularBiology(最新分子生物學方法),1994),本發明抗體不結合巳知的相關多肽分子,例如如果它們結合AMIGO-2多肽則不結合已知的相關多肽。已知的相關多肽的例子包括但不限于'AMIGO家族的其它成員(例如,AMIGO-1和AMIGO-3)。在一些實施方式中,本發明抗體結合AMIGO-2的直向同源物、同源物、側向同源物或變體,或它們的組合和亞組合(subcombination)。在一些實施方式中,本發明抗體結合AMIGO-2的直向同源物。在一些實施方式中,本發明抗體結合AMIGO-2同源物。AMIGO-2的同源物指已知的AMIGO-2-相關蛋白質,包括AMIGO-1和AMIGO-3。在一些實施方式中,本發明抗體結合AMIGO-2的側向同源物。在一些實施方式中,本發明抗體結合AMIGO-2的變體。在一些實施方式中,本發明抗體不結合AMIGO-2的直向同源物、同源物、側向同源物或變體,或它們的組合和亞組合。在一些實施方式中,可用已知的相關多肽篩選抗體以分離特異性結合AMIGO-2多肽的抗體群。例如,在合適的緩沖條件下,使人AMIGO-2多肽的特異性抗體流過包含粘附在不可溶基質上的AMIGO蛋白質(除AMIGO-2外)的柱子。這種篩選能分離與緊密相關的多肽不具交叉反應性的多克隆和單克隆抗體(Antibodies:ALaboratoryManual(抗體實驗室手冊),Harlow和Lane(編),冷泉港實驗室出版社,1988;CurrentProtocolsinImmunology(最新免疫學方法),Cooligan等(編),國家衛生研究院,約翰威利父子公司(JohnWileyandSons,Inc.),1995)。本領域熟知如何篩選和分離特定抗體(參見,FundamentalImmunology(基礎免疫學),Paul(編),雷文出版社(RavenPress),1993;Getzoff等,Adv.inImmunol.43:1-98,1988;MonoclonalAntibodies:PrinciplesandPractice(單克隆抗體原理和實踐),Goding,J.W.(編),學術出版社有限公司(AcademicPressLtd.),1996;Benjamin等,Ann.Rev.Immunol.2:67-101,1984)。這些試驗的代表性例子包括并行免疫電泳(concurrentimmunoelectrophoresis)、放射免疫測定(RIA)、放射免疫沉淀、酶聯免疫吸附測定(ELISA)、斑點印跡或蛋白質印跡、抑制或競爭試驗和夾心試驗。在一些實施方式中,本發明抗體不與選自SEQIDNO:63(AMIGO-l)或SEQIDNO:64(AMIGO-3)的序列內的表位特異性結合。在一些實施方式中,這些抗體或Fab片段不與AMIGO-1或AMIGO-3交叉反應。本發明還提供靶蛋白特異性的SMIP或結合區免疫球蛋白融合蛋白。這些構建物是包含與實施抗體效應功能所需的免疫球蛋白結構域融合的抗原結合結構域的單鏈多肽。參見,例如WO03/041600;美國專利公布20030133939和美國專利公布20030118592。在一些實施方式中,本發明抗體是中和抗體。在一些實施方式中,這些抗體是尋靶抗體。在一些實施方式中,這些抗體在結合靶標后被內在化。在一些實施方式中,這些抗體在結合靶標后未被內在化,而是維持在表面。在一些實施方式中,這些中和抗體不具有任何效應功能。或者,中和抗體可具有效應功能。63可以篩選本發明抗體在結合所研究的腫瘤細胞抗原后被快速內在化的能力,或在結合后維持在表面的能力。在一些實施方式中,例如,在一些類型的免疫偶聯物構建中,如果內在化是釋放毒素部分所需,則抗體能被內在化可能是理想的。或者,如果將抗體用于促進ADCC或CDC,則該抗體最好維持在細胞表面。可采用篩選方法區分這些性能類型。例如,在冰上(含0.1%疊氮化鈉以阻斷內在化)或37。C(不含疊氮化鈉),將細胞與濃度約1pg/mL的人IgG(對照抗體)或本發明抗體之一溫育3小時的情形下,可利用攜帶腫瘤細胞抗原的細胞。然后用冷的染色緩沖液(PBS+1%BSA+0.1%疊氮化鈉)洗滌細胞,在冰上用山羊抗-人IgG-FITC染色30分鐘。用FACSCalibur記錄幾何平均熒光強度(MFI)。如果在冰上有疊氮化鈉存在下與本發明抗體溫育的細胞與37t沒有疊氮化鈉存在下的細胞之間未觀察到MFI有差異,則懷疑該抗體維持與細胞表面結合,而不是被內在化。然而,如果當細胞在37'C沒有疊氮化鈉存在下溫育時發現表面可染色抗體減少,則懷疑該抗體能內在化。抗體偶聯物在一些實施方式中,本發明抗體是偶聯的。在一些實施方式中,偶聯的抗體可用于癌癥治療、癌癥診斷或癌細胞顯像。對于診斷應用,通常用可檢測部分標記抗體。通常可將許多可用的標記物分成以下類別(a)放射性核素,例如下文所述那些。例如,可采用CurrentProtocolsinImmunology(最新免疫學方法),第1和2巻,Coligen等編,WI公司(Wiley-Interscience),紐約,紐約州,出版(1991)中所述的技術以放射性同位素標記抗體,可采用閃爍計數法檢測放射性。(b)可利用熒光標記物,例如稀土螯合劑(銪螯合劑)或熒光及其衍生物,羅丹明及其衍生物、丹酰、麗絲胺(Lissamine)、藻紅蛋白和德克薩斯紅(TexasRed)。例如,可采用"最新免疫學方法"(同上)中所述的技術將熒光標記物偶聯于抗體。可利用熒光計定量測定熒光。(c)可利用各種酶-底物標記物,美國專利號4,275,149總結了其中一些。酶通常催化生色底物的化學改變,從而可用各種技術檢測。例如,酶可催化底物的顏色改變,從而可透過分光光度法檢測。或者,酶可改變底物的熒光或化學發光。上文描述了定量測定熒光變化的技術。可通過化學反應電激發化學發光底物,然后可檢測(例如利用化學冷光測量計(chemiluminometer))發出的光或者將能量遞送至熒光接受體。酶標記物的例子包括螢光素酶(例如,螢火蟲螢光素酶和細菌螢光素酶;美國專利號4,737,456)、熒光素、2,3-二氫酞嗪二酮類(dihydr叩hthalazinediones)、蘋果酸脫氫酶、過氧化物酶,例如辣根過氧化物酶(HRPO)、堿性磷酸酶、(3-半乳糖苷酶、葡萄糖淀粉酶、溶菌酶、糖氧化酶(例如,葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶和葡萄糖-6-磷酸脫氫酶)、雜環氧化酶(例如,尿酸酶和黃嘌呤氧化酶)、乳酸過氧化物酶、微過氧化物酶,等等。O'Sullivan等,MethodsforthePreparationofEnzyme-AntibodyConjugatesforuseinEnzymeImmunoassay(制備用于酶免疫測定的酶-抗體偶聯物的方法),刊于MethodsinEnzym(酶學方法).(J.Langone和H.VanVunakis編),學術出版社,紐約,73:147-166(1981)中描述了將酶與抗體偶聯的技術。這些抗體還可用于體內診斷試驗。在一些實施方式中,可用放射性核素標記這些抗體,從而可采用免疫閃爍照相術(immunoscintiography)定位腫瘤。為方便起見,可利用試劑盒,即預定量試劑與實施診斷試驗的使用說明書的包裝組合來提供本發明抗體。如果用酶標記抗體,該試劑盒可裝有底物和酶所需的輔因子(例如,提供可檢測生色團或熒光團的底物前體)。此外,可裝有其它添加劑,例如穩定劑、緩沖劑(例如,封閉緩沖劑或裂解緩沖劑)等。可大幅度地改變各種試劑的相對量,從而提供的試劑溶液濃度能實質性優化試驗靈敏度。特別是,諸試劑可作為干粉提供,通常是凍干的并包含賦形劑,從而在溶解后能提供濃度合適的試劑溶液。在一些實施方式中,抗體與一種或多種美登素(maytansine)分子偶聯(例如,每個抗體分子約1-約IO個美登素分子)。可以將美登素,例如轉化為May-SS-Me,其可還原為May-SH3并與修飾的抗體反應(Chari等,CancerResearch52:127-131(1992))以產生美登素-抗體免疫偶聯物。在一些實施方式中,所述偶聯物可以是高度強效的美登素衍生物DMl(N2'-脫乙基^2,-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素)(參見,例如2002年12月12日公布的WO02/098883),其IC50約為10-11M(綜述可參見Payne(2003)CancerCell3:207-212),或DM4(N2'-脫乙酰基-N2'(4-甲基-4-巰基-l-氧代戊基)-美登素)(參見,例如2004年12月2日公布的WO2004/103272)。在一些實施方式中,所述抗體偶聯物包含與一個或多個刺孢霉素(calicheamicin)分子偶聯的抗腫瘤細胞抗原抗體。亞-皮摩爾濃度的抗體刺孢霉素家族能導致雙鏈DNA斷裂。可用的刺孢霉素結構類似物包括但不限于yll、a21、a31、N-乙酰基-ylI、PSAG和011(Hinman等,CancerResearch53:3336-3342(1993)和Lode等,CancerResearch58:2925-2928(1998))。還可參見美國專利號5,714,586;5,712,374;5,264,586禾n5,773,001,這些專利通過引用專門納入本文。在一些實施方式中,所述抗體偶聯于前藥,所述前藥能通過許多癌癥中過度產生的酶而釋放其活性形式。例如,可用阿霉素的前藥形式制備抗體偶聯物,其中纖溶酶將活性組分從該偶聯物中釋放。纖溶酶已知在許多癌性組織中過度產生(參見Decy等,(2004)FASEBJournal18(3):565-567)。在一些實施方式中,這些抗體偶聯于酶促活性毒素及其片段。在一些實施方式中,所述毒素包括但不限于白喉A鏈、白喉毒素的非結合活性片段、外毒素A鏈(來自銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa))、假單胞菌內毒素、蓖麻毒蛋白A鏈、相思豆毒蛋白A鏈、蒴蓮根毒素A鏈、a-抑酶、油桐蛋白、石竹素蛋白、美洲商陸蛋白(Phytolacaamericanaprotein)(PAPI、PAPII和PAP-S)、核糖核酸酶(RNA酶)、脫氧核糖核酸酶(DNA酶)、商陸抗病毒蛋白、苦瓜素抑制齊lj(momordicacharantiainhibitor)、瀉果素、巴豆毒蛋白、肥皂草抑制劑(sapaonariaofficinalisinhibitor),白樹毒素、米托潔林、局限曲菌素、酚霉素、新霉素和單端孢菌毒素(tricothecene)。參見,例如1993年10月28日公布的WO93/21232。在一些實施方式中,毒素固有的免疫原性低,其作用機制(例如,細胞毒性機制與細胞抑制機制)能降低癌細胞對該毒素耐受的機會。在一些實施方式中,可在本發明抗體與免疫調節劑之間形成偶聯物。例如,在一些實施方式中,可用免疫刺激性寡核苷酸。這些分子能激發抗原特異性抗體應答的高效免疫原(參見Datta等,(2003)AnnN.Y.Acad.Sci1002:105-lll)。其它免疫刺激性化合物包括干細胞生長因子,如"Sl因子",淋巴毒素,如腫瘤壞死因子(TNF),造血因子,如白介素,集落刺激因子(CSF),如粒細胞集落刺激因子(G-CSF)或粒細胞巨噬細胞集落刺激因子(GM-CSF),干擾素(IFN),如干擾素a或Y,紅細胞生成素和血小板生成素。一些實施方式提供放射性偶聯的抗體。在一些實施方式中,可利用32P、33P、47Sc、59Fe、64Cu、67Cu、75Se、77As、89Sr、90Y、"Mo、105Rh、109Pd、125I、131I、142Pr、143Pr、149Pm、153Sm、161Th、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、189Re、194Ir、198Au、199Au、211Pb、212Pb、213Bi、58Co、67Ga、80mBr、99mTc、103mRh、109Pt、161Ho、189mOs、192Ir、152Dy、211At、212Bi、223Ra、219Rn、215Po、211Bi、225Ac、221Fr、217At、213Bi、255Fm及其組合和亞組合來制備這些抗體。在一些實施方式中,硼、釓或鈾原子與這些抗體偶聯。在一些實施方式中,硼原子是"B,釓原子是^Gd,鈾原子是23511。在一些實施方式中,放射性核素偶聯物包含能量在20到10,000keV之間的放放射性核素。放射性核素可以是能量低于1000keV的Auger發射體、能量在20到5000keV之間的P發射體或者能量在2000到10,000keV之間的a或"a"發射體。在一些實施方式中,提供的診斷性放射偶聯物所含的放射性核素是"、P-或正電子發射同位素。在一些實施方式中,放射性核素的能量在20到10,000keV之間。在一些實施方式中,放射性核素選自18F、51Mn、52mMn、52Fe、55Co、62Cu、64Cu、68Ga、72As、75Br、76Br、82mRb、83Sr、89Zr、94mTc、51Cr、"Co、58Co、59Fe、67Ga、75Se、97Ru、99mTc、114mIn、123I、125I、13Li和197Hg。、在一些實施方式中,本發明抗體偶聯于作為光活化劑或造影劑。光活化化合物包括如發色團或染料等化合物。造影劑可以是,例如,順磁性離子,其中所述離子包括選自下組的金屬鉻(ni)、鎂(n)、鐵(m)、鐵(n)、鈷(n)、鎳(n)、銅(n)、釹(in)、釤(ni)、鐿(in)、釓(ni)、釩(n)、鋱(in)、鏑(III)、鈥(III)和鉺(III)。造影劑還可以是用于x射線技術或計算機斷層掃描術的不透射線的化合物,如碘、銥、鋇、鎵和鉈化合物。不透射線的化合物可選自鋇、泛影酸、乙碘油、枸櫞酸鎵、碘卡明酸、碘卡酸、碘達酸、膽影酸、碘撒酸、碘磺拉胺(iogulamide)、碘海索、碘帕醇、碘番酸、碘普西酸、碘西法酸、碘絲酸、碘砜葡胺、碘琥酸(iosemeticadd)、碘酞硫、碘得酸(iotetricacid)、碘拉酸、碘托酸、碘克沙酸、羥泛影酸、碘泊酸鹽、葡甲胺、甲泛葡胺、甲泛影鈉、丙碘酮和氯化亞鉈。在一些實施方式中,診斷性免疫偶聯物可含有超聲增強劑,如與本發明抗體偶聯的充氣脂質體。診斷性免疫偶聯物可用于各種方法,包括但不限于腫瘤或癌診斷和檢測的手術中、內窺鏡或血管內方法。在一些實施方式中,抗體偶聯物可利用各種雙功能蛋白偶聯劑來制備,例如N-琥珀酰亞胺基-3-(2-吡啶二巰基)丙酸酯(SPDP)、琥珀酰亞胺基-4-(>1-馬來酰亞胺芐甲基)環己烷-l-羰化物、亞氨基硫垸(iminothiolane)(IT)、亞氨酸酯的雙功能衍生物(如己二亞氨鹽酸二甲酯(dimethyladipimidateHCL))、活性酯類(如辛二酸二琥珀酰亞胺)、醛(如戊二醛)、雙-疊氮化合物(如雙(對-疊氮基苯甲酰)己二胺(bis(p-azidobenzoyl)hexanediamine))、二重氮鹽(bis-diazonium)衍生物(如雙-(對-二重氮苯甲酰)-乙二胺(bis-(p-diazoniumbenzoy1)-ethylenediamine))、二異氰酸酯(如亞芐基2,6-二異氰酸酯)以及雙活性氟化合物1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。例如,蓖麻毒蛋白免疫毒素可按照Vitetta等,Science238:1098(1987)描述的方法制備。碳-14標記的1-異硫氰酸根合芐基-3-甲基二亞乙基三胺戊酸(isothiocyanatobenzyl-3-methyldiethylenetriaminepentaaceticacid)(MX-DTPA)是將放射性核苷酸偶聯于抗體的示范性螯合劑。參見W094/11026。接頭可以是促使細胞毒性藥物在細胞中釋放的"可切割接頭"。例如,可用酸不穩定的接頭、肽酶敏感性接頭、二甲基接頭或含二硫鍵的接頭(Chari等,CancerResearch52:127-131(1992))。試劑還可以通過碳水化合物部分連接于本發明抗體。在一些實施方式中,可通過,例如重組技術或肽合成制備包含本發明抗體和細胞毒性劑的融合蛋白。在一些實施方式中,將包含偶聯于細胞毒性劑的抗腫瘤抗原抗體的這種免疫偶聯物給予患者。在一些實施方式中,免疫偶聯物和/或其所結合的腫瘤細胞抗原蛋白被細胞內在化,從而增加了免疫偶聯物殺傷與之結合的癌細胞的療效。在一些實施方式中,細胞毒性劑靶向或干擾癌細胞的核酸。這種細胞毒性劑的例子包括美登醇68(maytansinoid)、刺孢霉素、核糖核酸酶和DNA核酸內切酶。在一些實施方式中,這些抗體可以偶聯于"受體"(如鏈霉親和素),從而可用于腫瘤預靶向(tumorpretargeting),其中先將抗體-受體偶聯物給予患者,然后利用清除劑從循環中去除未結合的偶聯物,再給予偶聯于細胞毒性劑(如放射核苷酸)的配體(例如,親和素)。在一些實施方式中,這些抗體可偶聯于在靶細胞溶酶體內釋放的細胞毒性分子。例如,藥物單甲基奧瑞斯他汀E(monomethylauristatinE)(MMAE)可經纈氨酸-瓜氨酸連接鍵偶聯,該連接鍵在抗體偶聯物內在化后可被蛋白水解性溶酶體酶,組織蛋白酶B切割(參見,例如2003年4月13日公布的WO03/026577)。在一些實施方式中,可以利用含有腙官能團作為可切割部分的酸不穩定接頭將MMAE連接于抗體(參見,例如2002年11月11日公布的WO02/088172)。抗體依賴的酶介導前藥治療(ADEPT)在一些實施方式中,本發明抗體還可以通過將抗體偶聯于前藥活化酶而用于ADEPT,所述酶可將前藥(例如,肽酰基化療劑,參見WO81/01145)轉化成活性抗癌藥物。參見,例如WO88/07378和美國專利號4975278。在一些實施方式中,ADEPT可用的免疫偶聯物中的酶組分包括能以將前藥轉化成具有更高活性的細胞毒性形式的方式作用于前藥的任何酶。可用于ADEPT中的酶包括但不限于用于將含磷酸(基團)的前藥轉化成游離藥物的堿性磷酸酶;用于將含硫酸(基團)的前藥轉化成游離藥物的芳基硫酸酯酶;用于將非毒性的5-氟半胱氨酸轉化成抗癌藥物5-氟尿嘧啶的半胱氨酸脫氨酶;用于將含肽的前藥轉化成游離藥物的蛋白酶,如沙雷氏菌蛋白酶、嗜熱菌蛋白酶、枯草桿菌蛋白酶、羧肽酶和組織蛋白酶(如組織蛋白酶B和L);用于轉化含D氨基酸取代基的前藥的D-丙氨酰羧肽酶;用于將糖基化前藥轉化成游離藥物的碳水化合物鏈切割酶如p-半乳糖苷酶和神經酰胺酶;用于將P-內酰胺衍生的藥物轉化成游離藥物的p-內酰胺酶;和用于將在氨基氮處分別用苯氧乙酰基或苯乙酰基衍生的藥物轉化成游離藥物的青霉素酰胺酶,如青霉素V酰胺酶或青霉素G酰胺酶。在一些實施方式中,本領域中也稱為"抗體酶"的具有酶活性的抗體可用于將本發明前藥轉化成游離的活性藥物(參見,例如Massey,Nature328:457-458(1987))。抗體-抗體酶偶聯物可按照本文所述方法制備,從而能將抗體酶轉移給腫瘤細胞群。_在一些實施方式中,ADEPT酶可通過本領域熟知的技術,例如利用上述異雙功能交聯劑共價結合于抗體。在一些實施方式中,可采用本領域熟知的重組DNA技術構建融合蛋白,其中融合蛋白至少包含連接于本發明酶的至少功能活性部分的本發明抗體的抗原結合區(參見,例如Neuberger等,Nature,312:604-608(1984)。在一些實施方式中,可通過檢測與未處理對照培養物相比,經處理靶細胞培養物的活力來鑒定以細胞抑制方式而非細胞毒性方式起作用的抗體。可采用本領域已知的方法檢測活力,如CellTiter-Blue⑧細胞活力試驗或Ceimter-Glo⑧發光細胞活力試驗(普羅美加公司(Promega),編號分別為G8080和G5750)。在一些實施方式中,與對照培養物相比,如果通過上述方式檢測到處理導致細胞數下降而沒有細胞死亡的證據,則抗體可認為是細胞抑制性的。在一些實施方式中,可采用本領域已知的試驗來進行體外篩選試驗以鑒定可促進ADCC的抗體。一種示范性試驗是體外ADCC試驗。為制備51-Cr標記的靶細胞,在組織培養板上培養腫瘤細胞系,用PBS配制的10mM無菌EDTA收獲細胞。用細胞培養基洗滌解離的細胞兩次。37。C用200pCi的Cr-51(新英格蘭核制品公司(NewEnglandNuclear)/杜邦公司(DuPont))標記細胞(5xl06)1小時,期間偶爾攪拌。用細胞培養基洗滌標記的細胞三次,然后重懸至濃度為lxl()S細胞/mL。不調理或調理細胞,然后在PBMC試驗中將細胞與100ng/ml和125ng/ml的測試抗體共孵育,在NK試驗中將細胞與20ng/mL和1ng/mL的測試抗體共孵育。利用肝素從正常健康供者采集血液,用等體積的磷酸緩沖鹽水(PBS)稀釋來制備外周血單核的細胞。然后按照生產商的使用說明書,將血液疊加到淋巴細胞分離液(LYMPHOCYTESEPARATIONMEDIUM(LSM:OrganonTeknika))上并離心。從LSM-血漿界面收集單核的細胞,PBS洗滌三次。將效應細胞懸浮在細胞培養基中,終濃度為lxl(^細胞/mL。經LSM純化后,按照廠家的使用說明書,利用NK細胞分離試劑盒和磁柱(米爾特尼耶生物技術公司(MiltenyiBiotech))通過負篩選從PBMC中分離天然殺傷細胞(NK)。收集分離的NK細胞,洗滌并重懸到細胞培養基內,濃度為2xl()S細胞/mL。通過流式細胞術分析確定NK細胞的身份。沿微量滴定板的各行用細胞培養基兩倍連續稀釋效應細胞(PBMC或NK)以制備不同效應細胞:靶細胞之比(終體積為100pL)。效應細胞的濃度范圍為PBMC是1.0xl07/mL到2.0x104/mL,NK是2.0xl0VmL到3.9xl0VmL。效應細胞滴定后,向滴定板的各孔中加入lOOpL濃度為lxl()S細胞/ml的Cr51-標記的靶細胞(調理或未調理)。從而對于PBMC,初始效應細胞:靶細胞之比為100:1,對于NK,初始效應細胞:靶細胞之比為20:1。所有試驗一式兩份進行,各滴定板都包含自發裂解(無效應細胞)和完全裂解(靶細胞加100pL1%十二烷基硫酸鈉,1N氫氧化鈉)對照。37'c溫育滴定板18小時,然后利用上清液收獲系統(斯卡特隆儀器公司(SkatronInstrument,Inc.))收獲細胞培養上清液,用Minaxi自動y5000系列y計數儀(帕卡德公司(Packard))計數1分鐘。然后利用以下公式將結果表示為細胞毒性百分比%細胞毒性(樣品cpm-自發裂解)/(完全裂解-自發裂解)xlOO。為鑒定能促進CDC的抗體,技術人員可以實施本領域已知的試驗。一種示范性試驗是體外CDC試驗。在體外,在沒有或有不同濃度的測試抗體存在下,通過共同溫育表達腫瘤細胞抗原的細胞與人(或其它來源的)的含補體血清來檢測CDC活性。然后利用ALAMARBLUE⑧定量測定活細胞來檢測細胞毒性(Gazzano-Santoro等,J.Immunol.Methods202163-171(1997))。所進行的對照試驗不用抗體,和使用抗體但用的是熱滅活血清和/或使用不表達所研究腫瘤細胞抗原的細胞。另外,可用腫瘤抗原或衍生自腫瘤抗原的肽包被紅細胞,然后通過觀察紅細胞裂解檢驗CDC(參見,例如Karjalainen禾卩Mantyjarvi,ActaPatholMicrobiolScand[C].1981/10;89(5):315-9)。為選擇能誘導細胞死亡的抗體,可以評估與對照相比,膜完整性的喪失,如PI、臺盼藍或7AAD攝取試驗所示。一種示范性試驗是用表達腫瘤抗原的細胞進行的PI攝取試驗。按照該試驗,用添加10%熱滅活FBS(Hyclone)和2mML-谷氨酰胺的Dulbecco改進的Eagle培養基(D-DMEM):HamF-12(50:50)培養表達腫瘤細胞抗原的細胞。(因此,該試驗可在沒有補體和免疫效應細胞存在下進行)。以3X10"皿的接種密度將腫瘤細胞接種到100x20mm培養皿中,使細胞貼壁培養過夜。然后除去培養基,或者更換單獨的新鮮培養基,或者更換含10昭/mL合適單克隆抗體的培養基。每次處理后,用PBS洗滌細胞單層,然后通過胰蛋白酶消化分離細胞。4'C以1200rpm離心細胞5分鐘,細胞團重懸到3mL冰冷卻的Ca"+結合緩沖液(10mMHepes,pH7.4,140mMNaCl,2.5mMCaCb)中,然后分裝入35mm帶過濾蓋子的12X75管內(每管lmL,每個處理組3管),從而去除細胞團±央。然后在管內加入PI(IOpg/mL)。用FACSCANTM流式細胞儀和FACSCONVERTCellQuest軟件(BD公司(BectonDickinson))分析樣品。通過PI攝取測定到能誘導統計學顯著水平的細胞死亡的的抗體可選為細胞死亡誘導抗體。還可利用"F-膜聯蛋白為PET造影劑在體內篩選這些抗體的凋亡活性。在該方法中,用"F放射性標記膜聯蛋白V,在所研究的抗體給予測試動物后給予。凋亡過程中最早發生的事件之一是磷脂酰絲氨酸從細胞膜的內側外翻到細胞外表面,在此處磷脂酰絲氨酸可接近膜聯蛋白。然后對動物進行PET造影(參見Yagle等,JNuclMed.2005年4月;46(4):658-66)。還可以處死動物,取出各器官或腫瘤并按標準方法分析凋亡標記。雖然在一些實施方式中,癌癥的特征在于基因表達產物的過度表達,但本申請還提供一種治療不視作過度表達腫瘤抗原的癌癥的方法。為測定癌癥中的腫瘤抗原表達,可進行各種診斷/預后試驗。在一些實施方式中,可通過IHC分析基因表達產物過度表達。對腫瘤生物活檢的石蠟包埋組織切片進行IHC試驗,參照以下腫瘤抗原蛋白染色強度標準0分未見染色或者在不到10%的腫瘤細胞中觀察到膜染色。l+分在10%以上的腫瘤細胞中檢測到微弱的/幾乎不可覺察的膜染色。染色只發生在細胞膜的一部分上。2+分在10%以上的腫瘤細胞中觀察到弱到中度的完整膜染色。3+分在10%以上的腫瘤細胞中觀察到中度到強的完整膜染色。在一些實施方式中,腫瘤抗原過度表達評估中為0或1+分的那些腫瘤可表征為沒有過度表達腫瘤抗原,而那些2+或3+的腫瘤則表征為過度表達腫瘤抗原。在一些實施方式中,與正常細胞相比,癌細胞中AMIGO-2未顯著上調,而且癌細胞和正常細胞對AMIGO-2表達的依賴性不同。在一些實施方式中,調節AMIGO-2可影響腫瘤-基質相互作用。在一些實施方式中,抑制AMIGO-2可調節腫瘤-基質相互作用。或者,可用甲醛固定、石蠟包埋的腫瘤組織進行FISH分析,如INFORM(由亞利桑那州維塔納公司(Ventana)銷售)或PATHVISION(瓦西斯公司(Vysis),伊利諾伊州)以測定腫瘤中腫瘤抗原過度表達的程度(如果存在)。此外,例如可將抗體共價偶聯于聚合物來進行化學修飾以增加它們的循環半衰期。各抗體分子可連接于一個或多個(S卩,1、2、3、4、5或更多個)聚合物分子。在一些實施方式中,聚合物分子通過接頭分子連接于抗體。聚合物通常可以是合成或天然聚合物,例如任選取代的直鏈或支鏈聚亞垸基、聚鏈烯或聚氧化烯聚合物或支鏈或無支鏈的多糖,例如同-或雜多糖。在一些實施方式中,聚合物是聚氧乙烯多元醇和聚乙二醇(PEG)。PEG在室溫下可溶于水,其通式為R(0-CH2-CH2)nO-R,其中R可以是氫或保護基團,例如烷基或烷醇基團。在一些實施方式中,所述保護基團具有1-8個碳。在一些實施方式中,所述保護基團是甲基。符號n是1-1,000或2-500之間的正整數。在一些實施方式中,PEG的平均分子量在1000-40,000之間、2000-20,000之間或3,000-12,000之間。在一些實施方式中,PEG具有至少一個羥基。在一些實施方式中,所述羥基是末端羥基。在一些實施方式中,該羥基經活化與抑制劑上的游離氨基反應。然而,應該知道可改變反應基團的類型和數量以獲得共價偶聯的PEG/本發明抗體。美國專利號4,766,106;4,179,337;4,495,285和4,609,546公開了聚合物以及將它們連接于肽的方法,各專利通過引用納入本文。安全性研究可檢驗本發明抗體的安全性和毒理學特征。這類研究的指南可見通過引用納入本文的USDACBER部門,"PointstoConsiderintheManufacture1X/LJk量llg丄T丄V11V^iHillJL1V/WWV<lU丄V/11JLU。W、^h"i—^/94D-0259,1997年2月28日)。一般而言,應在臨床前研究中用大量人組織樣品和/或分離的人細胞類型篩選候選抗體以評估非靶組織結合和交叉反應。從這些人組織研究中獲得滿意結果后,再篩選各種動物來源的一組組織樣品或分離細胞以鑒定適用于一般毒理學研究的物種。如果未鑒定出有交叉反應性的動物種類,其它模型類型也可視為合適的。這些其它模型包括諸如異種移植模型等研究,其中人腫麼細胞植入嚙齒類宿主,或者使用能識別毒理學研究所選用的動物物種內相應的腫瘤細胞抗原的代用單克隆抗體。應當知道,這些類型的其它模型的數據是一級近似,轉化成高級物種時應謹慎。對于候選裸抗體,可進行測定簡單耐受性的研究。在這些研究中,可通過觀察任何劑量依賴性藥效學效應來測定候選分子的治療指數。應使用較寬的劑量范圍(例如,0.1mg/kg到100mg/kg)。在估計治療指數時應考慮腫瘤細胞抗原數之間的差異、候選抗體對交叉反應性動物耙位的親和力以及抗體結合后細胞應答的差異。還應當用合適的動物模型進行藥效學和藥動學研究以幫助確定在人中測試候選抗體時的初始劑量。對于候選免疫偶聯物,必須在體內進行偶聯物的穩定性研究。任選對免疫偶聯物的各組分進行藥效學和藥動學研究以確定候選免疫偶聯物的任何分解產物的后果。如上所述,也應用合適的動物模型進行藥效學和藥動學研究以幫助確定初始劑量。如果藥物與用裸抗體預處理聯用,那么安全性研究的設計還必須考慮其它因素。必須單用裸抗體進行安全性研究,在設計免疫偶聯物的安全性研究時必須要記得,在這類治療方案中免疫偶聯物的最終給藥劑量要適當降低。對于放射性免疫偶聯物,應進行動物組織分布研究以測定生物分布數據。另外,應采取早和晚時間點計算所給予的放射性總劑量的代謝降解。利用血清或血漿可測試放射性免疫偶聯物的體外穩定性,應開發方法以檢測游離放射性核素、放射性免疫偶聯物和標記的非抗體化合物的百分比。寡核苷酸在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是寡核苷酸。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是包含選自SEQIDNO:7-24的某序列的寡核苷酸。在一些實施方式中,寡核苷酸是反義或RNAi寡核苷酸。在一些實施方式中,所述寡核苷酸與AMIGO-2基因或基因表達產物的區域、結構域、部分或區段互補。在一些實施方式中,所述寡核苷酸包含約5-約100個核苷酸、約10-約50個核苷酸、約12-約35和約18-約25個核苷酸。在一些實施方式中,所述寡核苷酸與AMIGO-2基因或基因表達產物的區域、結構域、部分或區段有至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95°/。、至少96%、至少97%、至少98%、至少99°/。或100%同源性。在一些實施方式中,在AMIGO-2基因或基因表達產物的至少15、20、25、30、35、40、50或100個連續核苷酸上有實質性的序列同源性。在一些實施方式中,在全長AMIGO-2基因或基因表達產物上有實質性的序列同源性。在一些實施方式中,在AMIGO-2基因或基因表達產物的至少15、20、25、30、35、40、50或100個連續核苷酸上有完全的序列相同性。在一些實施方式中,在全長AMIGO-2基因或其基因表達產物上有完全的序列相同性。在一些實施方式中,所述寡核苷酸在中等或嚴格雜交條件下結合具有SEQIDNO:l所示核苷酸序列的核酸分子。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是雙鏈RNA(dsRNA)分子,其通過RNAi(RNA干擾)起作用。在一些實施方式中,所述dsRNA的一條鏈與AMIGO-2基因的區域、部分、結構域或區段有至少50%、至少70%、至少80%、至少卯%、至少95°/。、至少96%、至少97%、至少98°/。、至少99%或100%同源性。在一些實施方式中,在AMIGO-2基因的至少15、20、25、30、35、40、50、100、200、300、400、500或1000個連續核苷酸上有實質性的序列同源性。在一些實施方式中,在全長AMIGO-2基因上有實質性的序列同源性。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是雙鏈RNA(dsRNA)分子(其通過RNAi(RNA干擾)起作用),其中該dsRNA的一條或兩條鏈與AMIGO-2基因的區域、部分、結構域或區段部分互補(例如,至少50%、至少70%、至少80%、至少卯°/。、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%)。在一些實施方式中,所述dsRNA的一條或兩條鏈與AMIGO-2基因的區域、部分、結構域或區段完全互補。序列"互補性"指特定含氮堿基之間因它們成氫鍵的特性而具有的化學親和力(即,具有堿基序列的兩條核酸鏈能形成反平行的雙鏈體的特性,其中腺嘌呤和尿嘧啶(或在DNA或修飾的RNA的情形下是胸腺嘧啶)彼此相對,而鳥嘌呤和胞嘧啶彼此相對)。因此,核苷酸序列形成反平行雙鏈體時,完全互補的序列應是堿基序列具有完全的一對一對應性(即,腺嘌呤對尿嘧啶,鳥嘌呤對胞嘧啶)的兩條序列。在一些實施方式中,本發明寡核苷酸用于聚合酶鏈式反應(PCR)。該序列可依據(從中設計)基因組序列或cDNA序列,還可用于擴增、證實或檢測特定細胞或組織中相同、相似或互補的DNA或RNA是否存在。小分子在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是小分子。本文所用的術語"小分子"指有機或無機非聚合化合物,其分子量小于約10kd。小分子的例子包括肽、寡核苷酸、有機化合物、無機化合物等。在一些實施方式中,所述小分子的分子量小于約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、約2或約1kd。模擬物在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是模擬物。本文所用的術語"模擬物"指能模擬某肽活性的化合物。模擬物是非肽,但可包含通過非肽鍵相連的氨基酸。1997年6月10日授權的美國專利號5,637,677及其專利申請(均通過引用納入本文)記載了制備模擬物的詳細指導。簡言之,不是肽的分子復制了與AMIGO-2的三維結構特異性相互作用的肽的三維結構。在一些實施方式中,AMIGO-2模擬物是AMIGO-2的模擬物或AMIGO-2配體的模擬物。引誘物受體在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是包含AMIGO-2受體的至少一部分的引誘物受體。在一些實施方式中,所述引誘物受體與天然AMIGO-2受體競爭AMIGO-2配體。在一些實施方式中,標記所述引誘物受體以促進定量測定、定性測定和/或目測觀察。在其它實施方式中,所述引誘物受體還包含有助于分離引誘物受體和/或引誘物受體-AMIGO-2復合體的部分。在一些實施方式中,所述引誘物受體結合AMIGO-2受體配體后可增強要影響的信號(與天然AMIGO-2受體相比)。在一些實施方式中,所述引誘物受體是通過捕捉AMIGO-2配體并防止其與信號傳導AMIGO-2受體相互作用而起作用的非信號傳導分子。在一些實施方式中,所述引誘物受體包含與抗體或抗體片段融合的AMIGO-2受體的至少一部分。治療/預防癌癥的方法
技術領域:
:本發明提供治療和/或預防對象中癌癥或癌癥癥狀的方法,包括將治療有效量的一種或多種本發明AMIGO-2調節劑給予該對象。在一些實施方式中,所述癌癥是AMIGO-2過度表達相關的癌癥。在一些實施方式中,所述癌癥是肺癌、膀胱癌、腎癌、結腸癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌或胰腺癌。在一些實施方式中,所述癌癥是肺癌或結腸癌。在一些實施方式中,所述對象己診斷患有癌癥或傾向于患癌癥。在一些實施方式中,所述對象是已診斷患有癌癥或傾向于患除胃癌以外的癌癥。本領域技術人員熟知癌癥的癥狀,包括但不限于乳腺腫塊、乳頭變化、乳腺囊腫、乳腺疼痛、死亡、體重減輕、虛弱、過度疲勞、進食困難、食欲不振、久咳、氣喘惡化、咳血、尿中帶血、血便、惡心、嘔吐、肝轉移、肺轉移、骨轉移、腹痛下墮、胃氣脹、腹膜腔中有液體、陰道出血、便秘、腹脹、結腸穿孔、急性腹膜炎(感染、發熱、疼痛)、疼痛、吐血、大量出汗、發熱、高血壓、貧血、腹瀉、黃疸、頭暈、寒顫、肌肉痙攣、結腸轉移、肺轉移、膀胱轉移、肝轉移、骨轉移、腎轉移和胰腺轉移、吞咽困難,等等。可按照醫學藥劑師熟知的方法,憑經驗決定調節性化合物的治療有效量,其取決于患者的年齡、病癥的嚴重程度和所需的最終藥物制劑,等等。可通過,例如吸入或栓劑或諸如灌洗陰道、直腸、尿道、含服和舌下組織等給予至粘膜組織,口服、局部、鼻內、腹膜內、胃腸外、靜脈內、淋巴管內、腫瘤內、肌肉內、間質地、動脈內、皮下、眼內、滑膜內、經上皮地和經皮地給予本發明調節劑。在一些實施方式中,通過灌洗、口服或動脈內給予這些抑制劑。其它合適的引入方法還包括可充電的或可生物可降解的裝置以及慢釋放或緩釋多聚裝置。如上所述,本發明的治療組合物還可作為組合治療的一部分與其它已知的抗癌藥或其它已知的抗-骨疾病治療方案一起給予。本發明還提供調節患者中AMIG0-2-相關生物學活性的方法。這些方法包括有效調節一種或多種AMIGO-2生物學活性用量的AMIGO-2調節劑給予患者。檢測AMIGO-2生物學活性的合適試驗見上文和下文。本發明還提供抑制有此需要的患者中癌細胞生長的方法,包括將治療有效量的一種或多種AMIGO-2調節劑給予該患者。本領域技術人員已知檢測AMIGO-2相關細胞生長的合適試驗,見于上文和下文中。本發明還提供抑制癌細胞生長(例如,在需要這種方法的患者中)的方法,該方法將能調節AMIGO-2的一種或多種下游標記的化合物給予具有包含一種或多種表達AMIGO-2的細胞的癌癥的患者。所述一種或多種AMIGO-2下游標記可選自c-MYC、c-Jun、FosLl或胞外信號調節激酶(ERK)。調節ERK可以是調節ERK的磷酸化或ERK對其一種或多種底物的磷酸化(參見上文)。該方法任選包括鑒定具有癌癥的患者的步驟,所述癌癥包含一種或多種表達AMIGO-2(例如,AMIGO-2mRNA或AMIGO-2蛋白)的細胞。本發明還包括提供抑制有此需要的患者的癌癥的方法。這些方法包括測定該患者是否是本文所述AMIGO-2治療的候選者,如果該患者是AMIGO-2治療的候選者,則將治療有效量的一種或多種AMIGO-2調節劑給予該患者。如果該患者不是AMIGO-2治療的候選者,則用常規癌癥療法治療該患者。本發明還提供抑制患者的癌癥的方法,該患者被診斷到或懷疑患有癌癥。該方法包括將治療有效量的一種或多種AMIGO-2調節劑給予該患者。本發明還提供抑制患者中兩種或更多種細胞相互作用的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予所述患者。本領域技術人員已知檢測AMIGO-2相關細胞相互作用的合適試驗,見于上文和下文中。本發明還提供調節患者中癌癥的一種或多種癥狀的方法,包括將治療有效量的一種或多種AMIGO-2調節劑給予所述患者。本發明還提供抑制有此需要的患者中細胞生長的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予所述患者。本領域技術人員已知檢測細胞生長的合適試驗,見于上文和下文中。本發明還提供抑制有此需要的患者中癌細胞遷移的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予該患者。本領域技術人員已知檢測AMIGO-2相關細胞遷移的合適試驗,見于上文和下文中。本發明還提供抑制有此需要的患者中癌細胞黏著的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予該患者。本領域技術人員已知檢測AMIGO-2相關細胞黏著的合適試驗,見于上文和下文中。本發明還提供抑制有此需要的患者中血管發生的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予該患者。本領域技術人員已知檢測血管發生的合適試驗,見于上文和下文中。本發明還提供預防性治療患者的方法,所述患者有患癌癥、癌癥轉移的傾向,或已具有轉移因此易復發。這些方法尤其可用于高危險個體,例如具有癌癥或轉移性腫瘤家族史,或顯示癌癥轉移遺傳傾向性的個體。在一些實施方式中,這些腫瘤是AMIGO-2相關腫瘤。此外,這些方法可用于防止己通過外科手術切除了AMIGO-2相關腫瘤,或用常規癌癥療法治療過的患者發生AMIGO-2相關腫瘤的復發。本發明還提供抑制癌癥進展和/或導致癌癥消退的復發,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予該患者。在一些實施方式中,聯用本發明AMIGO-2調節劑與化療和/或放療治療需要抗癌癥治療的患者。例如,給予AMIGO-2調節劑后,還可用治療有效量的抗癌癥輻射治療患者。在一些實施方式中,聯用化療與AMIGO-2調節劑。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑與化療和放療聯合給予。治療方法包括將單劑量或多劑量的一種或多種AMIGO-2調節劑給予患者。在一些實施方式中,將AMIGO-2調節劑作為可注射的藥物組合物給予,所述藥物組合物無菌、無熱原并包含AMIGO-2調節劑與藥學上可接受的載體或稀釋劑。在一些實施方式中,聯用本發明治療方案與常規癌癥治療方案,包括但不限于外科手術、放療、激素消融(hormoneablation)和/或化療。可以在常規癌癥治療前、其同時或之后給予本發明AMIGO-2調節劑。在一些實施方式中,將兩種或更多種不同的AMIGO-2調節劑給予患者。在一些實施方式中,給予患者的AMIGO-2調節劑用量足以抑制染色體不穩定性、激酶活性、致瘤性、轉移性、AMIGO-2細胞信號傳導、細胞黏著、癌細胞存活、ERK磷酸化、癌細胞生長、腫瘤形成、細胞周期蛋白產生、細胞增殖、通過細胞周期進展、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平和血管發生,等等中的一種或多種。在一些實施方式中,給予患者的AMIGO-2調節劑用量足以通過凋亡而增加癌細胞死亡。治療神經系統相關疾病和病癥的方法
技術領域:
:本發明還提供治療有此需要的患者中神經系統疾病和病癥的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2調節劑給予該患者。在一些實施方式中,本發明提供治療阿爾茨海默病、帕金森病、癲癇、多發性硬化癥、亨廷頓病、脊髓損傷、中風、面神經損傷、糖尿病相關神經損傷和視網膜變性中一種或多種的方法。干擾下游基因表達的方法在一些實施方式中,本發明提供干擾一種或多種基因的方法。在一些實施方式中,該方法包括使過度表達AMIGO-2的細胞與AMIGO-2調節劑接觸的方法。在一些實施方式中,給予患者治療有效量的AMIGO-2調節劑后,體內一種或多種基因的表達受到干擾。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑抑制選自下組的一種或多種基因表達BNIP3L、FAM46C、LOC339988、SATB1、Cllorf21、FAM3B、UCP2、FNDC3A、DRE1、PPIC、ASS、KIAA1718、ALDH6A1、LR8、ADAMTSL2、LIPC、FZDIO、COL4A2、TPP1、SERP腳1、ADCY9、AZGP1、USH1C、RAB40B、SMOC2、RRAGD、NUDT21、C14orfl、TPP1、RPS6KB1、KIAA0657、QPRT、RFK、KCNH2、PAQR8、SEPT6、LOC285758、EFNA1、LGALS8、ATP10D、ERBB3、CHST13、FLJ25476、MCF2L、FLJ10159、RAB13、ZNF261、USH1C、OSTM1、BMPR2、80IP09、ZNF226、HRASLS3、ERBB3、PR0S1、ALDH6A1、PPT2、TFF3、C21orf86、LRRC8B、BAZ2B、HIP1、RNASE4、FAM46C、STARDIO、KLF13、BACE1、FCGRT、QPCT、KCTD14、FRAS1、FAM63B、SPON2、IQWD1、BMPR2、TXNIP、ZBTB4、DDAH2、ZNF420、LGALS8、NEU1、FUCA1、GRN、C20orfl94、SEPT6、ASPSCR1、KLHDC5、GRN、STARDIO、MGC12981、C14orfl、EPB41、ALDH2、ARHGEF10L、FNDC3A、CYP2R1、PAQR8、RNF38、KIAA1327、ALS2CR3、EPS8L3、BACE1、SEPT6、IL27RA、DTX3L、CBPIN、ZNF627、Clorf85、AZGP1、GRN、SUOX、PSMB8、ARHGAP1、DACH1、COL4A2、PLEKHB1、SEC14L1、C2orf7、TPD52L1、PGM2、C14orf4、ZNF286、CAMK2D、PSME1、ZNF268、TRAF5、SEPT6、MGC45474、WIPI-2、CAMK2D、ZBED1、SEC24A、GGTL3、TRIM4、PPM1H、廳D1A、DOK4、RPS6KB1、PSAP、EXOC7、C6orf80、RERE、ZNF641、MXRA7、RAC1、NDST1、JAG2、ZNF329、SEPT6、KLHDC5、STXBP1和UBE2L3以及它們的組合和亞組合。組合治療在一些實施方式中,本發明提供包含兩種或更多種AMIGO-2調節劑的組合物以提供更加改善的抵御癌癥效力。在一些實施方式中,所述AMIGO-2調節劑是單克隆抗體。可將包含兩種或更多種AMIGO-2抗體的組合物給予患有或易患癌癥的人或哺乳動物。還可聯合給予一種或多種抗體與另一種治療劑,例如細胞毒性劑或癌癥化療劑。共同給予兩種或更多種治療劑不要求同時或以同一途徑給予這些藥劑,只要這些藥劑施加其療效的時期重疊即可。考慮了同時或依次給藥,例如在不同日子或星期給藥。在一些實施方式中,考慮了給予不同抗體的組合或"混合物"。這種抗體混合物具有一定優點,因為它們所含的抗體利用不同的效應機制或直接組合了細胞毒性抗體與依賴免疫效應功能的抗體。這種組合抗體可顯示協同療效。細胞毒性劑指抑制或防止細胞功能和/或導致細胞破壞的物質。該術語應包括放射性同位素(例如,1311、1251、9(^和186Re)、化療劑和毒素,例如細菌、真菌、植物或動物來源的酶活性毒素或合成毒素,或它們的片段。非細胞毒性劑指不抑制或防止細胞功能和/或不導致細胞破壞的物質。非細胞毒性劑可包括可活化成細胞毒性的藥劑。非細胞毒性劑可包括珠、脂質體、基質或顆粒(參見,例如通過引用納入本文的美國專利公布2003/0028071和2003/0032995)。這種藥劑可以綴合、偶聯、連接或結合于本發明抗體。在一些實施方式中,將常規癌癥藥物與本發明組合物共同給予。常規癌癥藥物包括a)癌癥化療劑;b)其它藥劑;c)前藥。癌癥化療劑包括但不限于烷化劑,例如碳鉑和順鉑;氮芥烷化劑;亞硝基脲烷化劑,如卡莫司汀(BCNU);抗代謝物,如甲氨蝶呤;亞葉酸;嘌呤類似抗代謝物,巰基嘌呤;密度類似抗代謝物,如氟尿嘧啶(5-FU)和吉西他濱(Gemzar);激素抗腫瘤劑,如戈舍瑞林、醋酸亮丙瑞林和他莫昔芬;天然抗腫瘤劑,如阿地白介素、白介素-2、多西他賽、依托泊苷(VP-16)、干擾素a、紫杉醇(Taxol⑧)和維甲酸(ATRA);抗生素天然抗腫瘤劑,如博來霉素、放線菌素D、柔紅霉素、阿霉素、柔紅霉素和絲裂霉素,包括絲裂霉素C;和長春花生物堿天然抗腫瘤劑,例如長春堿、長春新堿、長春地辛;羥基脲;醋葡醛內酯、阿霉素、異環磷酰胺、依諾他濱、環硫雄醇、阿柔比星、安西他濱、尼莫司汀、鹽酸丙卡巴肼、卡波醌、卡鉑、卡莫氟、色霉素A3、抗腫瘤多糖、抗腫瘤血小板因子、環磷酰胺(Cytoxin)、裂殖菌多糖、阿糖胞苷(阿糖胞苷)、達卡巴嗪、硫嘌呤苷、塞替派、替加氟、多拉司他汀、多拉司他汀類似物,如奧瑞斯他汀、CPT-ll(依立替康)、米托蒽醌、長春瑞濱、替尼泊苷、氨基蝶呤、去甲柔紅霉素、埃斯培拉霉素(esperamicin)(參見,例如美國專利號4,675,187)、新制癌菌素、OK-432、博來霉素、氟鐵龍、溴尿苷、白消安、二磷酸己烯雌酚四鈉、培洛霉素、抑氨肽酶素b(Ubenimex⑧)、干擾素-p、美雄垸、二溴甘露醇、美法侖、層粘連蛋白肽、香菇多糖、采絨革蓋菌提取物、替加氟/尿嘧啶、雌莫司汀(雌激素/氮芥)。可用作癌癥患者療劑的其它藥劑包括EPO、G-CSF、更昔洛韋;抗生82素、醋酸亮丙瑞林;哌替啶;齊多夫定(AZT);白介素1-18,包括突變體和類似物;干擾素或細胞因子,例如干擾素a、P和y激素,例如促黃體激素釋放激素(LHRH)和類似物及促性腺激素釋放激素(GnRH);生長因子,例如轉化生長因子-p(TGF-P)、成纖維細胞生長因子(FGF)、神經生長因子(NGF)、生長激素釋放因子(GHRF)、表皮生長因子(EGF)、成纖維細胞生長因子同源因子(FGFHF)、肝細胞生長因子(HGF)和胰島素生長因子(IGF);腫瘤壞死因子-a和p(TNF-a和p);侵襲抑制因子-2(IIF-2);骨形態發生蛋白l-7(BMPl-7);生長激素抑制素;胸腺素-a-l;Y-球蛋白;超氧化物歧化酶(SOD);補體因子;血管生成抑制因子;抗原性物質;和前藥。在一些實施方式中,可聯合給予一種或多種AMIGO-2調節劑與一種或多種用于癌癥的常規免疫治療劑。免疫治療劑可包括目標為剌激免疫系統(例如,刺激天然殺傷細胞、巨噬細胞和嗜中性白細胞的產生或活性)的藥劑,例如干擾素a、粒細胞-單核細胞集落刺激因子(GM-CSF)、白介素-12或白介素-2。免疫治療劑還可包括一種或多種用于治療癌癥的疫苗藥劑。例如,可組合給予(例如,同時,大致同時或作為患者的整體治療方案的一部分)一種或多種AMIGO-2調節劑與用于給定癌癥或癌癥抗原(例如,MAGE抗原)的肽、多肽或病毒載體疫苗。還可組合給予一種或多種AMIGO-2調節劑與一種或多種靶向特定癌癥或癌癥抗原的單克隆抗體治療劑(例如藥劑)。例如,利妥昔單抗(IDEC-C2B8)-—種靶向存在于某些B細胞惡性腫瘤中CD20抗原的嵌合抗體-結合免疫效應細胞(例如,單核細胞、巨噬細胞或天然殺傷細胞)上的Fc受體并促進這些免疫效應細胞破壞腫瘤細胞(也稱為抗體依賴性細胞介導的毒性,見上文)。結合特異性腫瘤細胞或腫瘤細胞抗原的抗體還可用于觸發補體依賴性細胞毒性反應,如本文所述。在一些實施方式中,可組合給予一種或多種AMIGO-2調節劑與一種或多種用于癌癥的細胞周期靶向劑。細胞周期靶向劑可包括靶向細胞周期的特定蛋白質介體(例如,細胞周期蛋白依賴性激酶)的那些藥劑,例如羅卡維亭(roscovitine)或黃酮吡醇。細胞周期靶向劑(例如,化合物)還可包括導致分裂細胞(例如,癌細胞)停滯在細胞周期特定時期的藥劑,例如但不限于紫杉醇、斯他菌素(staurosporin)、UCN-Ol、羅卡維亭或長春堿。在一些實施方式中,可以同時給予一種或多種AMIGO-2調節劑和一種或多種其它藥劑。在其它實施方式中,首先給予一種或多種AMIGO-2調節劑,再給予一種或多種其它藥劑。在一些實施方式中,首先一種或多種其它藥劑,再給予一種或多種AMIGO-2調節劑。一種或多種AMIGO-2調節劑可替代或補充以前或目前給予的治療劑。例如,用一種或多種AMIGO-2調節劑治療后,可停止或減少給予一種或多種其它藥劑,例如以較低水平給予。在其它實施方式中,可維持給予以前的療劑。在一些實施方式中,可維持以前的療劑直至一種或多種AMIGO-2調節劑水平達到足以提供療效的水平(例如,在測定給定患者的最佳劑量時)。可組合給予兩種療劑。在一些實施方式中,可將一種或多種AMIGO-2調節劑給予對象(例如,人患者)以彌補同時給予的一種或多種藥劑的水平或劑量。例如,當第一療劑(例如,一種或多種其它藥劑,如紫杉醇)有毒性或患者的耐受不佳時,給予一種或多種AMIGO-2調節劑時可降低劑量。所述給予一種或多種AMIGO-2調節劑可提供與第一療劑等效或更高的療效,而沒有毒性或耐受不佳的副作用。前藥指藥學活性物質的前體或衍生物形式,與母體藥物相比,前藥對腫瘤細胞的毒性較低或無毒性并能被酶促活化或轉化成活性或更具活性的母體形式。參見,例如Wilman,"ProdrugsinCancerChemotherapy"(癌癥化療的前藥),BiochemicalSocietyTransactions(生物化學協會學報),14,第375-382頁,第615屆貝爾法斯特大會(MeetingBelfast)(1986)和Stella等,"Prodrugs:AChemicalApproachtoTargetedDrugDelivery"(前藥革巴向藥物遞送的化學方法),DirectedDrugDelivery(定向藥物遞送),Borchardt等(編),第247-267頁,休瑪娜出版社(HumanaPress)(1985)。前藥包括但不限于能轉化成更具活性的游離藥物的含磷酸(根)的前藥、含硫代磷酸(根)的前藥、含硫酸(根)的前藥、含肽的前藥、D-氨基酸-修飾的前藥、糖基化的前藥、含b-內酰胺的前藥、含任選取代的苯氧基乙酰胺的前藥或含任選取代的苯基乙酰胺的前藥、5-氟胞嘧啶和前體5-氟尿嘧啶前藥。可以衍生為本文所用前藥形式的細胞毒性藥物的例子包括但不限于上述那些化療劑。臨床方面在一些實施方式中,本發明方法和組合物尤其可用于肺癌、膀胱癌、腎癌、結腸癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌或胰腺癌和癌癥轉移。在一些實施方式中,所述癌癥是肺癌或結腸癌。藥物組合物本發明還提供包含一種或多種AMIGO-2調節劑和藥學上可接受的載體的藥物組合物。在一些實施方式中,將藥物組合物制備成可注射劑,例如液體溶液或懸液;還可制備成適用于先溶解或懸浮在液體載體中再注射的固體形式。藥學上可接受的載體包括脂質體。藥物組合物中還可存在藥學上可接受的鹽,例如礦物酸鹽,如鹽酸鹽、氫溴酸鹽、磷酸鹽、硫酸鹽等;和有機酸鹽,如乙酸鹽、丙酸鹽、丙二酸鹽、苯甲酸鹽等。藥學上可接受的賦形劑的詳細討論見Remington:TheScienceandPracticeofPharmacy(雷明頓藥學科學和實踐)(1995)AlfonsoGennaro,Lippincott,Williams禾口Wilkins。檢測AMIGO-2的方法
技術領域:
:本發明還提供檢測AMIGO-2的方法。在一些實施方式中,患者或患者樣品中存在AMIGO-2。在一些實施方式中,該方法包括將含一種或多種AMIGO-2調節劑的組合物給予患者并檢測顯像劑在患者體內的定位。在一些實施方式中,患者樣品包含癌細胞。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑與顯像劑相連或作可檢測標記。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是偶聯于顯像劑的AMIGO-2抗體,將其給予患者以檢測一種或多種腫瘤或測定患者對AMIGO-2治療的敏感性。標記的抗體結合細胞上高密度的受體,從而累積在腫瘤細胞上。利用標準顯像技術,可檢測腫瘤的部位。本發明還提供顯像/檢測表達或過度表達AMIGO-2的細胞或腫瘤的方法,包括使包含AMIGO-2調節劑的組合物與樣品接觸并檢測樣品中是否存在AMIGO-2調節劑。在一些實施方式中,所述樣品是患者樣品。在一些實施方式中,患者樣品包含癌細胞。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑與顯像劑相連或作可檢測標記。本發明還提供定量測定患者、細胞或樣品中AMIGO-2的存在量的方法。這些方法包括將抗體、探針或小分子的一種或多種給予患者或樣品并檢測樣品中AMIGO-2的存在量。在一些實施方式中,抗體、探針或小分子連接于顯像劑或作可檢測標記。這種信息表明,例如腫瘤是否與AMIGO-2相關以及由此85的是否應使用或避免具體治療方法。在一些實施方式中,采用本領域技術人員熟知的標準技術獲得據信包含腫瘤細胞的樣品,使之與標記的抗體、探針、寡核苷酸和小分子接觸。除去任何未結合的、標記的抗體、探針、寡核苷酸或小分子后,可測定與細胞結合的標記抗體、肽、寡核苷酸或模擬物的數量或因未結合而除去的抗體、肽、寡核苷酸或模擬物的數量。該信息與AMIGO-2的存在量直接相關。可采用本領域普通技術人員熟知的方法進行顯像。例如,可通過放射性閃爍照相術、核磁共振成像(MRI)或計算機斷層掃描(CT掃描)進行顯像。顯像劑最常用的放射性標記包括放射性碘和銦。CT掃描顯像可利用重金屬,例如鐵螯合劑。MRI掃描可利用釓或錳的螯合劑。此外,利用氧、氮、鐵、碳或鎵的正電子發射體可能進行正電子發射斷層攝影術(PET)。在一些實施方式中,AMIGO-2調節劑是AMIGO-2抗體。在一些實施方式中,所述調節劑連接于顯像劑或作可檢測標記。在一些實施方式中,所述顯像劑是18F、43K、52Fe、"Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、"MTc、mIn、123I、125I、127Cs、129Cs、131I、132I、197Hg、2。3pb或2。6Bi。本領域技術人員熟知檢測方法。例如,檢測多核苷酸的方法包括但不限于PCR、Northern印跡、Southern印跡、RNA保護和DNA雜交(包括原位雜交)。檢測多肽的方法包括但不限于蛋白質印跡、ELISA、酶活性試驗、狹線印跡、肽質量指紋法(peptidemassfingerprinting)、電泳、免疫化學和免疫組織化學。檢測方法的其它例子包括但不限于放射免疫測定(RIA)、化學發光免疫測定、熒光免疫測定、時間分辨熒光免疫測定(TR-FIA)、雙色熒光顯微術或免疫色譜試驗(ICA),所有這些是本領域技術人員熟知的。在本發明的一些實施方式中,采用PCR方法檢測多核苷酸表達,采用ELISA技術檢測多肽產生。將細胞毒性劑或診斷劑遞送給細胞的方法
技術領域:
:本發明還提供將細胞毒性劑或診斷劑遞送給一個或多個表達AMIGO-2的細胞的方法。在一些實施方式中,這些方法包括使偶聯于細胞毒性劑或診斷劑的本發明AMIGO-2調節劑與細胞接觸。領!l定癌癥患者預后的方法本發明還提供測定AMIGO-2相關癌癥患者的預后的方法。在一些實施方式中,這些方法包括測定定位于細胞膜的AMIGO-2水平與定位于癌細胞其它區域的AMIGO-2水平之比。在一些實施方式中,患者中定位于細胞膜的AMIGO-2水平高于定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2水平表明該患者具有AMIGO-2-相關癌癥并對AMIGO-2治療敏感。在一些實施方式中,定位于細胞膜的AMIGO-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2之比至少為2:1表明該患者具有AMIGO-2-相關癌癥并對AMIGO-2治療敏感。在一些實施方式中,定位于細胞膜的AMIGO-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的皿100-2之比至少為3:1表明該患者具有皿100-2-相關癌癥并對AMIGO-2治療敏感。測定對AMIGO-2治療敏感性的方法
技術領域:
:本發明還提供測定患者對AMIGO-2治療的敏感性的方法。這些方法包括檢測患者或患者樣品中是否存在AMIGO-2差別表達的證據。在一些實施方式中,患者或樣品中存在AMIGO-2差別表達的證據表明患者對AMIGO-2治療敏感。在一些實施方式中,患者或樣品中不存在AMIGO-2差別表達的證據表明患者不是AMIGO-2治療的候選者。在一些實施方式中,與正常細胞相比,癌細胞中AMIGO-2未顯著上調,但癌細胞與正常細胞對AMIGO-2表達的依賴性不同。在一些實施方式中,調節AMIGO-2影響腫瘤-基質相互作用。在一些實施方式中,調節AMIGO-2抑制腫瘤和基質組織之間的相互作用。在一些實施方式中,治療方法包括首先鑒定對AMIGO-2治療敏感的患者,包括將包含連接于顯像劑的AMIGO-2調節劑的組合物高于對AMIGO-2治療敏感的患者,并檢測患者中是否存在基因后基因產物的證據。在一些實施方式中,這些治療方法還包括如果患者是AMIGO-2治療的候選者,則將一種或多種AMIGO-2調節劑給予該患者,如果患者不是AMIGO-2治療的候選者,則用常規癌癥治療方法治療該患者。在一些治療方法中,在患者被鑒定為具有癌癥或易患癌癥時,將一種或多種AMIGO-2調節劑單獨或與其它抗癌癥藥物組合給予該患者。評估癌癥進展的方法
技術領域:
:本發明還提供評估患者中癌癥進展的方法,包括比較生物學樣品中AMIG0-2表達產物在第一時間點的水平與同一表達產物在第二時間點的水平。與第一時間點相比,表達產物在第二時間點的水平變化表明癌癥的進展。篩選方法
技術領域:
:本發明還提供篩選抗癌癥藥劑的方法。這些方法包括使表達AMIGO-2的細胞與候選化合物接觸并測定AMIGO-2-相關生物學活性是否得到調節。在一些實施方式中,以下一種或多種情況的抑制表明是抗癌癥藥劑染色體不穩定性、激酶活性、致瘤性、癌細胞生長、癌細胞存活、腫瘤形成、癌細胞增殖、轉移性、細胞遷移、底物磷酸化、細胞周期蛋白產生、血管發生、細胞增殖、細胞周期調節、信號傳導、細胞-細胞黏著、細胞-細胞膜相互作用、細胞-胞外基質相互作用、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用和AMIGO-2表達。在一些實施方式中,在治療和/或診斷方法中將通過本發明方法鑒定的抗癌癥藥劑給予有此需要的患者。在一些實施方式中,本發明提供通過,例如篩選假定調節劑調節下游標記物的活性或水平的能力來篩選抗癌癥藥劑,特別是抗轉移癌癥藥劑的方法。在一些實施方式中,能降低細胞周期蛋白Dl、細胞周期蛋白Bl、c-Myc、c-J皿、胞外信號調節激酶(ERK)、血管內皮生長因子(VEGF)、尿激酶和聚ADP核糖聚合酶1(PARP1)水平的候選藥劑鑒定為抗癌癥藥劑。在一些實施方式中,本發明提供鑒定AMIGO-2調節劑的方法。在一些實施方式中,該方法包括比較有和沒有候選化合物存在下包含一種或多種表達AMIGO-2的細胞的樣品中AMIGO-2的磷酸化。在一些實施方式中,與沒有候選化合物存在下樣品中AMIGO-2的磷酸化相比,有候選化合物存在下樣品中AMIGO-2的磷酸化得到調節表明該候選化合物是AMIGO-2調節劑。在一些實施方式中,利用免疫沉淀抗體從樣品中分離AMIGO-2。在一些實施方式中,免疫沉淀抗體是本發明的抗-AMIGO-2抗體。在一些實施方式中,AMIGO-2磷酸化是絲氨酸/蘇氨酸磷酸化。在一些實施方式中,利用磷酸絲氨酸/蘇氨酸抗體檢測和/或定量測定AMIGO-2磷酸化。在一些實施方式中,免疫沉淀抗體是磷酸絲氨酸/蘇氨酸抗體。檢測AMIGO-2調節的方法在一些實施方式中,本發明提供檢測細胞中AMIGO-2活性調節的方法。在一些實施方式中,這些方法包括使包含表達AMIGO-2的細胞的樣品與AMIGO-2抑制劑接觸足夠時間以調節AMIGO-2活性;用本發明的AMIGO-2抗體免疫沉淀AMIGO-2;和利用磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體比較樣品與對照中的AMIGO-2絲氨酸/蘇氨酸磷酸化。在一些實施方式中,與對照相比,樣品的細胞中AMIGO-2的絲氨酸/蘇氨酸磷酸化改變表明AMIGO-2活性得到調節。在一些實施方式中,AMIGO-2磷酸化是絲氨酸/蘇氨酸磷酸化。在一些實施方式中,利用磷酸絲氨酸/蘇氨酸抗體檢測和/或定量測定AMIGO-2磷酸化。在一些實施方式中,免疫沉淀抗體是磷酸絲氨酸/蘇氨酸抗體。在一些實施方式中,本發明提供檢測包含過度表達AMIGO-2的細胞的樣品中AMIGO-2活性調節的方法。在一些實施方式中,這些方法包括使細胞過度表達AMIGO-2足夠的時間以調節AMIGO-2活性,用本發明的AMIGO-2抗體免疫沉淀AMIGO-2,和利用磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體比較樣品與對照中的AMIGO-2絲氨酸/蘇氨酸磷酸化。在一些實施方式中,與對照相比,樣品中AMIGO-2的絲氨酸/蘇氨酸磷酸化改變表明AMIGO-2活性得到調節。在一些實施方式中,這些方法包括使樣品與AMIGO-2抑制劑接觸足夠的時間以調節AMIGO-2活性,用抗-磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體免疫沉淀AMIGO-2,和利用本發明抗體比較樣品與對照中的磷酸化AMIGO-2水平。在一些實施方式中,與對照相比,樣品中磷酸化AMIGO-2水平的改變表明AMIGO-2活性得到調節。在一些實施方式中,該方法包括在樣品中過度表達AMIGO-2足夠的時間以調節AMIGO-2活性,用抗-磷酸-絲氨酸/蘇氨酸抗體免疫沉淀AMIGO-2,和利用本發明的AMIGO-2抗體比較樣品與對照中磷酸化AMIGO-2的水平。在一些實施方式中,與對照相比,樣品中磷酸化AMIGO-2的水平改變表明AMIGO-2活性得到調節。純化AMIGO-2的方法在一些實施方式中,本發明提供從含有AMIGO-2的樣品中純化AMIGO-2蛋白的方法。這些方法包括提供包含與固體支持物結合的本發明AMIGO-2抗體的親和基質,使樣品與該親和基質接觸以形成親和基質-AMIGO-2蛋白復合體,將親和基質-AMIGO-2蛋白復合體與剩余樣品分開,和從該親和基質中釋放AMIGO-2蛋白。試劑盒在一些實施方式中,本發明提供顯像和/或檢測與AMIGO-2差別表達相關的基因或基因產物的試劑盒。本發明的試劑盒裝有實施本發明方法的可檢測抗體、小分子、寡核苷酸、引誘物、模擬物或探針以及使用說明書。試劑盒任選還裝有以下一種或多種對照(陽性對照和/或陰性對照)、對照的容器、正和/或負結果的代表性例子的照片或圖片。本文所述的專利、專利申請、登錄號和出版物各自通過引用全文納入本文。除了本文所述那些,本領域技術人員借鑒上文可明白本發明的各種改進形式。這些改進形式也屬于所附實施方式的范圍。以下實施例進一步說明的本發明,其目的是說明而不是要限制本發明的范圍。實施例實施例1:一些癌組織中AMIGO-2表達上調從激光捕捉顯微切割的(LCM)結腸癌、乳腺癌和前列腺癌組織分離mRNA,將該mRNA與各自的正常組織庫(圖1A;RSM=參比標準混合物)或各組織樣品中癌細胞附近的正常細胞(圖1B)作比較。利用AffymetrixGeneChips⑧(艾飛麥特利克斯公司,圣克拉拉,加利福尼亞州)(圖1A)或利用從癌性組織制得的cDNA文庫內部制備的陣列(圖1B),通過寡核苷酸陣列分析經驗樣品。對于圖1A和1B中的各表,顯示了患者數量,然后是癌癥和正常樣品之間的相對表達。("%GE2X"禾卩">=2X"表示上調2-倍;"%LE.5X"和"<=2x"表示下調2-倍)。兩組芯片證明結腸癌中AMIGO-2上調。用內部芯片進行的實驗表明AMIGO-2在乳腺癌和前列腺癌中也上調。用艾飛麥特利克斯實驗未觀察到在這些組織中上調。還采用反轉錄偶聯的聚合酶鏈式反應(RT-PCR)檢測正常和癌組織樣品中的相對AMIGO-2mRNA水平(圖2)。通過半定量RT-PCR(GeneAmp,應用生物系統公司(AppliedBiosystems),福斯特城,加利福尼亞州)比較一組正常組織與結腸、乳腺和前列腺LCM(激光捕捉切割)切割樣品組(每組8位患90者)。測試的兩組引物得到相似的結果(名為"ABTP508/509"的引物組的數據見圖2)。在測試的正常組織中,乳腺和肺顯示相對表達最高。與正常結腸相比,結腸癌顯示上調5-倍以上,與正常乳腺相比,上調數倍。利用人基因組U133+2.0陣列(艾飛麥特利克斯公司)對癌性和正常組織中AMIG0-2mRNA表達的寡核苷酸陣列分析的圖示見圖3和4。正常和癌性組織類型沿水平軸顯示。在圖4中,用"c"標記癌性組織(例如,"c一乳腺—導管(cj)reast—duct)"代表乳腺癌組織樣品),用"n"標記正常組織。組織類型還標記有相關的組織類型和亞型,如果已知的話。例如,"c—乳腺_導管"是定位于乳腺導管的乳腺癌的癌組織。如果在手術切除時不清楚亞型或者亞型未知,那么標記"ns"代表"非特異性的"。圖3和4的垂直軸上各點代表一位患者的一個組織樣品,各點在垂直軸上的高度(線性)表示探針組的相對表達水平。圖3表示線性分析,而圖4的數據以log2比例表示。實心圈代表表達水平在線性檢測范圍內的樣品。空心圈代表樣品中基因表達的上限,即基因低于探針組的檢測限以下之處。空心方塊代表樣品中基因表達的下限,即探針組飽和之處。進行分析前,通過在大量不同樣品組中分析其組成型探針的特性來校正各探針組。這種校正檢測了各探針的相對靈敏度和探針之間的探針組反應是線性的強度范圍。該范圍以下的強度稱為"未檢出",而該范圍以上的強度稱為"飽和的"。由于樣品間的雜交和標記效率存在差異,因此各陣列在校正后還要進行標準化。就基因表達而言,這導致該范圍的上下限隨樣品而有所不同。實施例2:免疫組織化學方法揭示AMIGO-2在結腸癌和肺癌中表達使組織切片脫石蠟,用亞利桑那州圖森市維塔納醫學系統公司(VentanaMedicalSystems,Inc.,Tucson,AZ)的維塔納發現儀器(VentanaDiscoveryinstrument)進行抗原回收。進行標準細胞條件化,然后將細胞與第一抗體溫育60分鐘。利用10pg/ml的加利福尼亞州艾莫利維爾市希龍公司(Chiron,Emeryville,CA)的家兔抗-人AMIGO-2抗體和加利福尼亞州艾莫利維爾市希龍公司的家兔IgG預采血對照(Prebleedcontrol)。依次利用維塔納醫學系統公司的維塔納通用第二試劑和維塔納醫學系統公司的維塔納DABMap試劑盒檢測。利用維塔納醫學系統公司的維塔納蘇木精和靛青試劑復染,切片在分等級酒精中脫水,在二甲苯中清潔,用合成的固定介質蓋上蓋玻片。染色表明腫瘤細胞和腫瘤基質中表達AMIGO-2。觀察到圍繞腫瘤的基質組織中表達的AMIGO-2與腫瘤自身中的表達相當或更高,從而表明AMIGO-2對于支持腫瘤生長所需的血管形成可能至關重要。實施例3:不同細胞系中AMIGO-2蛋白水平不同從不同細胞系的細胞團制備蛋白質裂解液,用市售可得的AMIGO-2抗體(明尼蘇達州明尼阿波利斯RD系統公司(R&DSystems,Inc.)的MAB2080,)免疫沉淀該裂解液,該抗體特異性識別AMIGO-2,而不識別AMIGO-l或AMIGO-3蛋白。細胞系包括人胃癌細胞系(AGS)、兩種結腸癌細胞系(SW620和HT29)、兩種結腸直腸細胞系(Colo320和HCT116)和胚胎細胞系(293-CMVII)(圖5)。通過丙烯酰胺凝膠電泳分開免疫沉淀捕捉的蛋白質,然后利用內部制備的抗-AMIGO-2抗體進行蛋白質印跡分析(圖5)。在結腸和胃細胞系中觀察到兩個條帶(約63kD和約卯kD)。分子量較高的產物可能是糖基化、磷酸化或多聚形式的AMIGO-2。測定相對半定量RT-PCRCt水平,將其標注在圖5中4種細胞系名稱旁的括號內。Ct值表明經一定輪次PCR后的檢測閾值。Ct值較高表明要檢測cDNA需要較多輪PCR,因此表明mRNA水平較低。測試的所有細胞系對AMIGO-2mRNA呈陽性,但檢測蛋白質的能力隨mRNA數量減少而降低。圖5表明結腸癌細胞系中表達的AMIGO-2水平顯著。實施例4:功能試驗測試了一組siRNA在SW620細胞(表達AMIGO-2的結腸癌細胞系)中敲減AMIGO-2mRNA的能力(圖6)。圖6中測試的siRNA序列見表3。圖6所示AMIGO-2siRNA均將AMIGO-2mRNA水平降低一定程度,但siRNAC315-1.3和C315-4.3看來降低mRNA水平最有效。雖然蛋白質印跡分析在Colo320和HCT116細胞中未能檢測到AMIGO-2蛋白水平(見圖5),但AMIGO-2特異性siRNAC315-1.3和C315-4.3降低了這些細胞系中的AMIGO-2mRNA水平,這與Colo320和HCT116細胞中的陽性mRNA表達一致。通過幾種方法測試AMIGO-2敲減的功能后果。利用市售可得的試劑盒(ToxiLight,康布萊科斯公司(CambrexCorporation),東盧瑟福,新澤西州)評估在結腸癌細胞系SW620中進行AMIGO-2敲減后的細胞死亡程度。雖然在未感染和陰性對照樣品中觀察到極少的細胞死亡,但敲減陽性對照基因和AMIGO-2(通過兩種不同的siRNA試劑)顯示明顯的毒性(圖8A)。也檢測了AMIGO-2敲減在MRC9細胞中的功能后果。雖然在用陰性對照siRNA處理的細胞中檢測到的細胞死亡量較低,但在用CHIR314-1.5SIsiRNA處理的MRC9細胞中觀察到顯著且可重現的細胞死亡量(圖8B)。還通過檢測siRNACHIR315-1.3SI和CHIR315-4.3SI在胃癌細胞系AGS中對PARP切割和M30表達的作用而測試了AMIGO-2敲減的功能后果。PARP切割和M30產生表明作為凋亡介體的胱冬酶活化。用siRNA溫育細胞48小時,然后通過蛋白質印跡分析細胞裂解液的AMIGO-2、PRAP、M30和微管蛋白的表達。陽性對照和siRNA處理樣品中PARP切割和M30表達均增加,從而表明這些細胞系中凋亡增加(圖9)。與預計的一樣,與各siRNA接觸后,AMIGO-2蛋白水平降低(圖9,上圖)。還檢測了結腸癌細胞系SW620中siRNACHIR315-1.3SI和CHIR315-4.3SI對PARP切割禾口M30表達的作用。將SW620細胞與AMIGO-2特異性siRNA(或對照RNA)溫育72小時,通過上述蛋白質印跡分析細胞裂解液。檢測用CHIR315-1.3SI處理的SW620細胞中的PARP切割,表明siRNA處理導致這些這些細胞中發生凋亡。還采用其它試驗檢驗AMIGO-2敲減在各種細胞系中的功能后果,所述細胞系包括AGS、SW620、HT29、A549和Colo320癌細胞系;184B5和HMEC非致瘤性乳腺上皮細胞系;和MRC9正常人肺成纖維細胞系。利用兩種不同的AMIGO-2siRNA,即C315-1.3si和C315-4.3si進行實驗。也在所有實驗中證實了AMIGO-2敲減。這些實驗的結果如下所示。采用亞-GlDNA試驗(Sub-GlDNAassay),用流式細胞術檢測細胞死亡。用AMIGO-2siRNA轉染后,檢測到在AGS、SW620、A549和Colo320癌細胞系中細胞死亡增加,在HT29中有一定程度(增加),但在184E5或HMEC細胞中未增加。MRC9細胞沒有數據報道。還采用凋亡試驗,通過檢測PARP切割和/或M30產生檢測細胞死亡。用AMIGO-2siRNAC315-lsi和C315-4si轉染后,檢測到在AGS和SW620癌細胞系中細胞死亡增加,但在A549細胞中未增加。HT29、Colo320、184B5、HMEC或MRC9細胞系沒有數據報道。按照生產商的使用說明書,還采用1\)^1^8111@試驗(康布萊科斯公司,東盧瑟福,新澤西州)檢測細胞死亡。將細胞接種在96-孔碟中,其密度在1天后可達到約80-95%匯合。用OptiMEMTM將寡核苷酸稀釋至2^M。然后將寡核苷酸-OptiMEMTM加入遞送載體,選擇以優化用于該試驗中的特定細胞類型。然后用含血漿的細胞培養基進一步稀釋寡聚/遞送載體混合物。siRNA寡核苷酸終濃度是50nM。如上所述制備寡核苷酸。37'C轉染細胞約4小時至過夜,用新鮮培養基替換轉染混合物。胰蛋白酶處理轉染的細胞,在48或72小時計數維持與平板結合的總細胞。用AMIGO-2siRNA轉染后,檢測到在SW620和A549癌細胞系中細胞死亡增加,但在MRC9細胞中未增加。AGS、HT29、Colo320、184B5或HMEC細胞系沒有數據報道。采用細胞滴度發光(ATP檢測;普羅美加公司)試驗檢測依賴貼壁的細胞生長。24小時時,將細胞以3000-5000個細胞/孔接種在96-孔板上。按照生產商的使用說明書,在各時間點(轉染后24小時、48小時、72小時、96小時、120小時)裂解細胞并采用細胞滴度發光試驗檢驗。細胞滴度發光試驗的結果提供與相對細胞數成比例的熒光。在AGS、SW620、HT29、Colo320、A549和MRC9細胞中觀察到依賴貼壁的細胞生長降低,但在184B5或HMEC細胞中未觀察到。采用軟瓊脂試驗檢測不依賴貼壁的細胞生長。軟瓊脂試驗的實施首先用多聚-HEMA包被非組織培養處理的平板以防細胞與平板相連。利用胰蛋白酶收集未轉染的細胞,用培養基洗滌兩次。用血球計數器計數細胞,將細胞重懸在培養基中達10"個細胞/ml。將50pl試樣置于多聚HEMA包被的96-孔板中并轉染。轉染一天后,胰蛋白酶處理細胞,重懸并計數。將細胞稀釋至約500個細胞/100pl/孔,轉移至深孔區(deepwellblock)(最大體積=1ml/孔,一式三份,按照標準布局)。將細胞接種在兩塊平板中用于試驗的康寧7007號超低粘附U-平板(Corning#7007UltraLowAdherentU-plate)和用于接種效率檢測的康寧3799號平板。用微波爐加熱約1分鐘來融化SeaplaqueGTG瓊脂糖3%。完全融化時,將約10ml倒入預熱的50ml聚丙烯試管中(Falcon#35-2070),在60。C加熱塊中溫育至少10分鐘。將約18.6ml完全培養基加入50ml聚丙烯試管,在水浴中以約37"C溫育。用MultimekTM移液器將瓊脂糖分散于96孔板中的細胞。將約18.6ml熱培養基倒入10ml瓊脂糖中,小心翻轉以充分混合。約4'C溫育平板20-30分鐘以使瓊脂糖快速固化。瓊脂糖固化后,將100pl完全培養基加在細胞上。為檢測第0天接種效率,加入約25nl/孔阿爾瑪藍,37'C溫育過夜。18-24小時后,用TECAN平板讀數計在530ex/590em閱讀平板。37°C,溫育試驗平板7天,然后用阿爾瑪藍(25nl/孔)顯色。在SW620、A549和MRC9細胞中觀察到不依賴貼壁的細胞生長降低。AGS、HT29或Colo320細胞沒有數據報道。該試驗不適于測試MRC9、184B5和HMEC細胞,因為該類型的正常細胞通常不以不依賴于貼壁的方式生長。利用AMIGO-2調節劑能抑制癌細胞系中菌落形成表明AMIGO-2在轉移表型的產生和/或維持中至關重要。在SW620和AGS細胞中測試了通過C315-1.3si禾BC315-4.3sisiRNA敲減AMIGO-2對功能相關下游標記的影響。將這些細胞與siRNA溫育48小時,然后通過蛋白質印跡分析細胞裂解液。利用抗-AMIGO-2抗體RBAd70(希龍公司,艾莫利維爾,加利福尼亞州)檢測AMIGO-2蛋白。利用微管蛋白作為加樣對照。兩種siRNA均在SW620和AGS細胞中導致AMIGO-2蛋白水平降低(圖10A和11)。在SW620細胞中,C314-1.3si看來比C315-4.3si更有效地降低AMIGO-2蛋白水平(圖10A)。還利用C315-1.3si和C315-4.3sisiRNA檢測了SW620細胞中AMIGO-2敲減對c-mycmRNA95水平的作用。將細胞與siRNA溫育72小時,然后分離并制備mRNA用于分析。陽性對照siRNA和兩種AMIGO-2特異性siRNA均降低cMycmRNA,表明AMIGO-2影響c-myc在轉錄水平的表達(圖IOB)。兩種siRNA還降低了兩種細胞系中的磷酸化ERK,但在SW620細胞中,C315-1.3si看來比C315-4.3si更能降低磷酸化(分別見圖10和11)。兩種siRNA還降低了兩種細胞系中的C-myc、cFosLl和cJun(見圖11、12A、14A和14B)。用兩種AMIGO-2-特異性siRNA轉染的AGS細胞中細胞周期蛋白Dl表達也降低(圖11)。用C315-1.3si轉染的SW620和AGS細胞中細胞周期蛋白Bl和cFosll水平也降低(圖13)。蛋白質印跡(圖16)檢測到接觸抗AMIGO-2抗體MAB2080(用作AMIGO-2激動劑)的SW620細胞顯示cMyc(圖14C)、cJun(圖2C)、FosLl和磷酸-ERK上調。接觸MAB2080的AGS細胞還顯示cMyc(圖14C)和cJun(圖12C)上調。此夕卜,用AMIGO-2穩定轉染的Rati細胞顯示cJun表達上調(圖12B)。AMIGO-2對c-Myc、細胞周期蛋白B1、cFosll和cJun表達的表觀作用提示AMIGO-2參與調節立即早期基因。這些觀察結果和AMIGO-2下調對細胞周期蛋白基因表達的作用(見上文)支持了AMIGO-2在細胞周期調節中起作用。進行艾飛麥特利克斯實驗以檢測AMIGO-2siRNA對基因表達的作用(圖15A和15B)。這些結果證實cFosLl和細胞周期蛋白Bl的下調與AMIGO-2下調相關,這與AMIGO-2在細胞生長和存活中的作用一致。實施例5:AMIGO-2抑制血管生成AMIGO-2敲減抑制參與血管生成的尿激酶和VEGF表達。現已在正常血管中觀察到AMIGO-2表達,從而支持了該基因在血管生成中起作用(參見上文實施例2)。參與神經元指導和運動性的許多基因,例如AMIGO-2也參與血管生成。實施例6:AMIGO-2抗體表1:靶向AMIGO-2多肽的抗體<table>tableseeoriginaldocumentpage97</column></row><table>實施例7:AMIGO-2反義寡核苷酸表2:耙向AMIGO-2的反義RNA<table>tableseeoriginaldocumentpage97</column></row><table>實施例9:AMIGO-2表位<table>tableseeoriginaldocumentpage98</column></row><table>實施例10:正常組織中的AMIGO-2表達制備正常組織切片,用上述家兔抗-AMIGO-2或對照、預采血抗體染色。染色表明AMIGO-2在各種正常人組織中表達,包括腎上腺、乳腺、子宮頸、肺、腎臟、肝臟、卵巢、胰腺、前列腺、骨骼肌、皮膚、脾臟、睪丸、結腸和子宮,特別是在肺、子宮頸、心臟和肝臟的基質細胞亞組(例如,血管和巨噬細胞)中。艾飛麥特利克斯實驗(見上文)測定到這些組織中的AMIGO-2蛋白表達水平與相應的mRNA表達水平相關,表明AMIGO-2在正常組織,特別是增殖性組織(例如,睪丸、皮膚、卵巢、脾臟和結腸)中廣泛表達。雖然參考具體實施方式描述了本發明,但本領域技術人員應該知道可作出各種改變并可取代各種等價形式而不脫離本發明的真實構思和范圍。此外,可對本發明的目的、構思和范圍作出許多改進以適應特定的情形、材料、物質、方法、方法步驟或步驟的組成。所有這樣的改進應屬于本發明的范圍。權利要求1.一種治療有此需要的患者的癌癥或癌癥癥狀的方法,包括將治療有效量的AMIGO-2抑制劑給予該患者,所述AMIGO-2抑制劑選自下組(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物。2.如權利要求l所述的方法,其特征在于,與對照相比,所述AMIGO-2抑制劑將AMIGO-2表達抑制至少20%。3.如權利要求l所述的方法,其特征在于,與對照相比,所述AMIGO-2抑制劑導致至少20%癌細胞死亡。4.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人抗體、人源化抗體、單鏈抗體或Fab片段。5.如權利要求87所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段結合AMIGO-2的ECD中一個或多個表位。6.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合基本上由SEQIDNO:2或SEQIDNO:3構成的序列中的一個或多個表位。7.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRRNT結構域中一個或多個表位。8.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRRl結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:30和SEQIDNO:57構成的組。9.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR2結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:32、SEQIDNO:39和SEQIDNO:61構成的組。10.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR3結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:29、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:56和SEQIDNO:58構成的組。11.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR4結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:26、SEQIDNO:35禾口SEQIDNO:45構成的組。12.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR5結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:25、SEQIDNO:27、SEQIDNO:36和SEQIDNO:53構成的組。13.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR6結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:31、SEQIDNO:33、SEQIDNO:41、SEQIDNO:46、SEQIDNO:47和SEQIDNO:62構成的組。14.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRRCT結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:28、SEQIDNO:34、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:44、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60和SEQIDNO:62構成的組。15.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的IgV-組結構域中一個或多個表位。16.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的Ig結構域中一個或多個表位。17.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的ECD中一個或多個表位。18.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合選自由SEQIDNO:3-6和25-62構成的組的一個或多個表位。19.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述患者具有或易患肺癌、膀胱癌、腎癌、結腸癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌或胰腺癌。20.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述癌癥是肺癌或結腸癌。21.如權利要求4所述的方法,其特征在于,所述抗體或Fab片段抑制選自以下的AMIGO-2活性染色體穩定性、致瘤性、細胞增殖、細胞周期調節、癌細胞運動性、細胞黏著、腫瘤形成、轉移性、AMIGO-2信號傳導、癌細胞存活、細胞周期蛋白產生、激酶活性、底物磷酸化、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、腫瘤和基質組織之間的相互作用和血管發生。22.如權利要求4所述的方法,其特征在于,所述抗體作了標記。23.如權利要求22所述的方法,其特征在于,所述標記是酶、放射性同位素、毒素或熒光團。24.如權利要求4所述的方法,其特征在于,所述抗體對除AMIGO-2以外的多肽的結合親和力小于約lxl05Ka。25.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是包含第一核苷酸鏈和第二核苷酸鏈的dsRNA分子,所述第一核苷酸鏈包含SEQIDNO:17-24所示某序列的至少19個連續核苷酸,所述第二核苷酸鏈包含與所述第一鏈基本上互補的序列,其中所述dsRNA分子長度短于3769個核苷酸。26.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是包含SEQIDNO:7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離核酸。27.如權利要求1所述的方法,其特征在于,還包括用化療、放療或外科手術中的一種或多種治療患者。28.如權利要求l所述的方法,其特征在于,所述癌癥癥狀選自下組久咳、氣喘惡化、體重減輕、過度疲勞、疼痛、咳血、尿中帶血、食欲不振、大量出汗、發熱、高血壓、貧血、腹瀉、便秘、血便、黃疸、頭暈、虛弱、寒顫、肌肉痙攣、深靜脈血栓、腹脹、胃氣脹、月經不調、結腸轉移、肺轉移、膀胱轉移、腎轉移、乳腺轉移、子宮轉移、卵巢轉移和胰腺轉移。29.—種調節患者AMIGO-2活性的方法,該方法包括將足以調節AMIGO-2活性用量的AMIGO-2抑制劑給予該患者,所述AMIGO-2抑制劑選自下組(a)特異性結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物。30.如權利要求29所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2活性選自下組染色體穩定性、致瘤性、細胞增殖、細胞周期調節、癌細胞運動性、細胞黏著、腫瘤形成、轉移性、AMIGO-2信號傳導、AMIGO-2下游標記的調節、癌細胞存活、細胞周期蛋白產生、激酶活性、底物磷酸化、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、腫瘤和基質組織之間的相互作用和血管發生。31.如權利要求29所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人抗體、人源化抗體、單鏈抗體或Fab片段。32.—種鑒定對AMIGO-2治療敏感的患者的方法,包括(a)檢測所述樣品中是否存在AMIGO-2表達的證據,其中所述樣品中存在AMIGO-2表達的證據表明患者是AMOGI-2治療的候選者,而所述樣品中不存在AMIGO-2表達的證據表明患者不是AMOGI-2治療的候選者;(b)如果患者是AMOGI-2治療的候選者,則將治療有效量選自下組的抑制劑給予該患者(1)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體:信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(2)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(3)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(4)小分子;(5)模擬物;(6)可溶性受體;和(7)引誘物;和(c)如果該患者不是AMOGI-2治療的候選者,則將傳統癌癥治療劑給予該患者。33.如權利要求32所述的方法,其特征在于,與對照相比,AMIGO-2表達至少增加20%。34.如權利要求32所述的方法,其特征在于,通過檢測AMIGO-2RNA水平來檢測AMIGO-2表達的證據。35.如權利要求32所述的方法,其特征在于,通過檢測AMIGO-2多肽水平來檢測AMIGO-2表達的證據。36.如權利要求32所述的方法,其特征在于,所述患者具有或易患肺癌、膀胱癌、腎癌、結腸癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌或胰腺癌中的一種或多種。37.—種抑制癌細胞生長的方法,包括使癌細胞與相比對照以至少20%抑制細胞生長用量的AMIGO-2抑制劑接觸,所述AMIGO-2抑制劑選自下組(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物。38.如權利要求37所述的方法,其特征在于,所述癌細胞在癌癥患者體內或衍生自癌癥患者。39.如權利要求37所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人抗體、人源化抗體、單鏈抗體或Fab片段。40.—種抑制有此需要的患者中癌細胞表型的方法,所述方法包括將治療有效量的AMIGO-2抑制劑給予所述患者,所述AMIGO-2抑制劑選自下組(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;①可溶性受體;和(g)引誘物。41.如權利要求40所述的方法,其特征在于,所述癌細胞表型是膠原中的細胞運動性、致瘤性、以不依賴于貼壁的方式生長的能力、細胞存活能力或細胞黏著能力中的一種或多種。42.如權利要求40所述的方法,其特征在于,所述癌細胞選自肺癌、膀胱癌、腎癌、結腸癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌或胰腺癌細胞。43.—種抑制癌細胞生長的方法,該方法包括將調節一種或多種AMIGO-2下游標記的化合物給予具有包含一種或多種表達AMIGO-2的細胞的癌癥的患44.如權利要求43所述的方法,其特征在于,所述一種或多種AMIGO-2的下游標記選自c-MYC、c-Jun、FosLl和胞外信號調節激酶(ERK)。45.如權利要求44所述的方法,其特征在于,所述ERK是磷酸化ERK。46.—種檢測患者的腫瘤的方法,包括將包含連接于顯像劑的AMIGO-2抑制劑的組合物給予患者并檢測該顯像劑在患者中的定位,其中所述抑制劑選自(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物。47.如權利要求46所述的方法。其特征在于,所述組合物包含偶聯于顯像劑的AMIGO-2抗體。48.如權利要求47所述的方法,其特征在于所述顯像劑是18F、43K、52Fe、57Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、"MTc、mIn、123I、125I、127Cs、129Cs、131I、132I、197Hg、2。3pb或2。6Bi。49.一種鑒定癌癥抑制劑的方法,其中所述癌癥的特征在于AMIGO-2相比于對照過度表達,所述方法包括使表達AMIGO-2的細胞與候選化合物接觸并測定AMIGO-2活性是否得到調節,其中所述AMIGO-2活性得到調節是癌癥抑制劑的標志。50.如權利要求49所述的方法,其特征在于,所述候選化合物調節癌細胞中而不是非癌細胞中的AMIGO-2活性。51.—種鑒定癌癥抑制劑的方法,其中所述癌癥的特征在于AMIGO-2相比于對照過度表達,所述方法包括使表達AMIGO-2的細胞與候選化合物和AMIGO-2配體接觸并測定AMIGO-2下游標記物的活性是否得到調節,其中所述下游標記物得到調節是癌癥抑制劑的標志。52.如權利要求51所述的方法,其特征在于,所述下游標記物選自細胞周期蛋白D1、細胞周期蛋白B1、c-Myc、c-Jun、FosLl、胞外信號調節激酶(ERK)、血管內皮生長因子(VEGF)、尿激酶和聚ADP核糖聚合酶1(PARP1)。53.如權利要求51所述的方法,其特征在于,所述下游標記物的活性是ERK磷酸化降低或ERK表達降低。54.如權利要求51所述的方法,其特征在于,所述下游標記物的活性是PARP1切割增加。55.如權利要求51所述的方法,其特征在于,所述候選化合物和AMIGO-2配體誘導調節癌細胞而不是非癌細胞中AMIGO-2的下游標記物。56.—種將細胞毒性劑或診斷劑遞送至一種或多種表達AMIGO-2的細胞的方法,所述方法包括(a)提供與純化抗體偶聯的細胞毒劑或診斷劑,所述抗體特異性結合AMIGO-2多肽的表位,其中所述表位位于選自下組的結構域中信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;和(b)使該細胞與該抗體-試劑或片段-試劑偶聯物接觸。57.—種治療癌癥患者的方法,包括將患者癌癥樣品的AMIGO-2表達與對照樣品的AMIGO-2表達進行比較,和(1)如果與對照樣品相比,該癌癥樣品的AMIGO-2表達上調則用包含選自下組的抑制劑的組合物治療該患者(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體:信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物;和(2)如果與對照樣品相比,該癌癥樣品中AMIGO-2表達未變或下調則進行二級試驗。58.如權利要求57所述的方法,其特征在于,所述二級試驗包括比較有和沒有抑制劑存在下,癌癥樣品中AMIGO-2下游標記物的水平或活性,其中(1)如果與沒有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的AMIGO-2下游標記物的水平或活性相比,有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的AMIGO-2下游標記物的水平或活性降低,則用包含選自下組的抑制劑的組合物治療該患者(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體:信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;①可溶性受體;和(g)引誘物;或(2)如果與沒有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的AMIGO-2下游標記物的水平或活性相比,有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的AMIGO-2下游標記物的水平或活性不變或降低,則用常規癌癥治療劑治療該患者。59.如權利要求57所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2下游標記物選自細胞周期蛋白Dl、細胞周期蛋白Bl、c-Myc、c-Jun、FosLl、VEGF、尿激酶和ERK。60.如權利要求57所述的方法,其特征在于,所述下游標記物的活性是ERK磷酸化或ERK表達。61.如權利要求57所述的方法,其特征在于,所述下游AMIGO-2標記物的活性降低。62.如權利要求57所述的方法,其特征在于,所述二級試驗包括比較有和沒有抑制劑存在下,癌癥樣品中的PARP1切割,其中(a)如果與沒有AMIG0-2抑制劑存在下癌癥樣品中的PARP1切割相比,有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的PARP1切割增加,則用包含選自下組的抑制劑的組合物治療該患者(1)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體:信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(2)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少10個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(3)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(4)小分子;(5)模擬物;(6)可溶性受體;和(7)引誘物;或(b)如果與沒有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的PARP1切割相比,有AMIGO-2抑制劑存在下癌癥樣品中的PARP1切割增加或不變,則用常規癌癥治療劑治療該患者。63.—種診斷患者中癌癥的方法,包括檢驗候選癌細胞中的AMIGO-2定位,其中當定位于細胞膜的AMIGO-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2之比至少為2:1時,該患者診斷為具有AMIGO-2相關癌癥。64.如權利要求63所述的方法,其特征在于,定位于細胞膜的AMIGO-2與定位于不包括細胞膜的癌細胞其它區域的AMIGO-2之比至少為3:1。65.如權利要求63所述的方法,其特征在于,還包括當患者診斷為具有AMIGO-2相關癌癥時,將含有選自下組的抑制劑的組合物給予該患者(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物。66.—種鑒定AMIGO-2調節劑的方法,包括比較有和沒有候選化合物存在下,包含表達AMIGO-2的一種或多種細胞的樣品中AMIGO-2的磷酸化,其中與沒有候選化合物存在下樣品中AMIGO-2的磷酸化相比,有候選化合物存在下樣品中AMIGO-2的磷酸化得到調節表明該候選化合物是AMIGO-2調節劑。67.如權利要求66所述的方法,其特征在于,利用免疫沉淀抗體從樣品中分離AMIGO-2。68.如權利要求67所述的方法,其特征在于,所述免疫沉淀抗體是特異性結合AMIGO-2多肽表位的抗體,其中所述表位位于選自下組的結構域中信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域。69.如權利要求66所述的方法,其特征在于,所述AMIGO-2磷酸化是絲氨酸/蘇氨酸磷酸化。70.如權利要求66所述的方法,其特征在于,利用磷酸絲氨酸/蘇氨酸抗體測定所述AMIGO-2磷酸化。71.如權利要求67所述的方法,其特征在于,所述免疫沉淀抗體是磷酸絲氨酸/蘇氨酸抗體。72.—種包含AMIGO-2抑制劑的一種或多種藥學上可接受的載體的組合物,其中所述AMIGO-2抑制劑選自下組(a)結合選自下組的AMIGO-2結構域中的表位的抗體信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域;(b)包含選自SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離寡核苷酸;(c)分離的雙鏈RNA(dsRNA);(d)小分子;(e)模擬物;(f)可溶性受體;和(g)引誘物。73.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述組合物抑制至少一種選自以下的AMIGO-2活性染色體穩定性、致瘤性、細胞增殖、細胞周期調節、癌細胞運動性、細胞黏著、腫瘤形成、轉移性、AMIGO-2信號傳導、癌細胞存活、細胞周期蛋白產生、激酶活性、底物磷酸化、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、腫瘤和基質組織之間的相互作用和血管發生。74.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述組合物在癌細胞而不在非癌細胞中誘導至少一種細胞表型。75.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述組合物抑制癌細胞存活,抑制AMIGO-2的細胞質磷酸化,抑制血管發生或細胞增殖、絲氨酸/蘇氨酸激酶活性,抑制Erk磷酸化,抑制cJun、cMyc或FosLl表達,或抑制分裂細胞進展至細胞周期的G2/M期。76.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述組合物是無菌可注射劑。77.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑抑制AMIGO-2翻譯或誘導AMIGO-2mRNA降解。78.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人抗體、人源化抗體、單鏈抗體或Fab片段。79.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRRNT結構域中一個或多個表位。80.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR1結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:30和SEQIDNO:57構成的組。81.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR2結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:32、SEQIDNO:39和SEQIDNO:61構成的組。82.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR3結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:29、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:56和SEQIDNO:58構成的組。83.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR4結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:26、SEQIDNO:35和SEQIDNO:45構成的組。84.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR5結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:25、SEQIDNO:27、SEQIDNO:36和SEQIDNO:53構成的組。85.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRR6結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:31、SEQIDNO:33、SEQIDNO:41、SEQIDNO:46、SEQIDNO:47和SEQIDNO:62構成的組。86.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的LRRCT結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:28、SEQIDNO:34、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:44、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60和SEQIDNO:62構成的組。87.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的IgV-組結構域中一個或多個表位。88.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的Ig結構域中一個或多個表位。89.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合AMIGO-2的胞外域(ECD)中一個或多個表位。90.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合基本上由選自SEQIDNO:3-6和25-62的序列構成的序列中的一個或多個表位。91.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段特異性結合基本上由SEQIDNO:2或SEQIDNO:3構成的序列中的一個或多個表位。92.如權利要求78所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段結合AMIGO-2的親和力至少為lxl08Ka。93.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述AMGO-2活性選自染色體穩定性、致瘤性、細胞增殖、細胞周期調節、癌細胞運動性、細胞黏著、腫瘤形成、轉移性、AMIGO-2信號傳導、癌細胞存活、細胞周期蛋白產生、激酶活性、底物磷酸化、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、腫瘤和基質組織之間的相互作用和血管發生。94.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述抗體或Fab片段抑制癌細胞存活、AMIGO-2的細胞質磷酸化或ERK磷酸化。95.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述組合物抑制cJun、cMyc或FosLl表達。96.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述組合物抑制分裂細胞進展至細胞周期的G2/M期。97.如權利要求72所述的組合物,其特征在于,所述AMIGO-2抑制劑是包含第一核苷酸鏈和第二核苷酸鏈的dsRNA分子,所述第一核苷酸鏈包含SEQIDNO:17-24所示某序列的至少19個連續核苷酸,所述第二核苷酸鏈包含與所述第一鏈基本上互補的序列,其中所述dsRNA分子長度短于3769個核苷酸。98.如權利要求97所述的組合物,其特征在于,與對照相比,所述dsRNA將AMIGO-2翻譯抑制至少20%。99.一種特異性結合AMIGO-2多肽的表位的純化抗體,其特征在于,所述表位位于選自下組的結構域中信號肽、LRRNT結構域、LRR1結構域、LRR2結構域、LRR3結構域、LRR4結構域、LRR5結構域、LRR6結構域、LRRCT結構域、IgV-組結構域和Ig結構域。100.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRR1結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:30和SEQIDNO:57構成的組。101.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRR2結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:32、SEQIDNO:39和SEQIDNO:61構成的組。102.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRR3結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:29、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:56和SEQIDNO:58構成的組。103.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRR4結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:26、SEQIDNO:35和SEQIDNO:45構成的組。104.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRR5結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:25、SEQIDNO:27、SEQIDNO:36和SEQIDNO:53構成的組。105.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRR6結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:31、SEQIDNO:33、SEQIDNO:41、SEQIDN0:46、SEQIDNO:47和SEQIDNO:62構成的組。106.如權利要求99所述的組合物,其特征在于,所述抗體特異性結合AMIGO-2的LRRCT結構域中一個或多個表位,所述表位選自SEQIDNO:28、SEQIDNO:34、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:44、SEQIDNO:49、SEQIDNO:50、SEQIDNO:51、SEQIDNO:52、SEQIDNO:54、SEQIDNO:59、SEQIDNO:60和SEQIDNO:62構成的組。107.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合選自SEQIDNO:25-62的一個或多個表位。108.如權利要求119所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體特異性結合基本上由SEQIDNO:2或SEQIDNO:3構成的序列中的一個或多個表位。109.如權利要求99所述的純化抗體,其特征在于,所述抗體抑制選自下組的AMIGO-2活性染色體穩定性、致瘤性、細胞增殖、細胞周期調節、癌細胞運動性、細胞黏著、腫瘤形成、轉移性、AMIGO-2信號傳導、癌細胞存活、細胞周期蛋白產生、激酶活性、底物磷酸化、不依賴于貼壁的生長、AMIGO-2蛋白定位于細胞膜、AMIGO-2與AMIGO-l或AMIGO-3中一種或兩種之間的相互作用、細胞質磷酸化AMIGO-2蛋白的水平、腫瘤和基質組織之間的相互作用和血管發生。110.—種特異性結合AMGO-2多肽的一個或多個表位的純化抗體,其中所述表位包含選自SEQIDNO:3-6和25-62構成的組的序列。111.一種產生權利要求99所述抗體的分離細胞。112.—種產生權利要求99所述抗體的雜交瘤。113.—種產生權利要求99所述抗體的非人轉基因動物。114.一種SEQIDNO:2所示多肽的攜帶表位的分離片段,所述片段包含選自SEQIDNO:3-6和25-62構成的組的一個或多個表位。115.如權利要求114所述攜帶表位的片段,其特征在于,所述片段包含SEQIDNO:2的約6-20個毗連氨基酸。116.如權利要求114所述攜帶表位的片段,其特征在于,所述片段包含SEQIDNO:2的至少21個毗連氨基酸和SEQIDNO:2的少于522個毗連氨基酸。117.—種編碼如權利要求114所述攜帶表位的分離片段的多核苷酸。118.—種純化的AMIGO-2抗體,其通過用權利要求114所述攜帶表位的片段免疫對象獲得。119.一種分離的dsRNA分子,其包含第一核苷酸鏈和第二核苷酸鏈,所述第一核苷酸鏈包含SEQIDNO:17-24所示某序列的至少19個連續核苷酸,所述第二核苷酸鏈包含與所述第一鏈基本上互補的序列,其中所述dsRNA分子長度短于3769個核苷酸。120.如權利要求119所述的分離的dsRNA分子,其特征在于,所述第二核苷酸鏈包含與所述第一核苷酸鏈完全互補的序列,其中所述dsRNA分子長度短于3769個核苷酸。121.—種包含SEQIDNO:7-16所示某序列的至少IO個連續核苷酸的分離核酸。全文摘要本發明提供治療癌癥的方法,治療癌癥的組合物及診斷和/或檢測癌癥的方法和組合物,等等。具體地說,本發明提供治療、診斷和檢測AMIGO-2過度表達相關癌癥的組合物和方法。文檔編號C07K14/435GK101583621SQ200780027447公開日2009年11月18日申請日期2007年7月19日優先權日2006年7月20日發明者A·法尼迪,G·余,M·J·加納塔普,V·占申請人:諾華有限公司