疾病標志物及其用途的制作方法

專利名稱：疾病標志物及其用途的制作方法
技術領域：
本發明涉及miRNA標志物和干擾素(IFN) α /I型IFN-誘導性藥效學(PD)標志物 以及采用其的方法。
背景技術：
本發明涵蓋miRNA標志物和IFN α /I型IFN-誘導性PD標志物。本發明還涵蓋在 例如治療患者和預測或監測疾病的方法中采用這些標志物的方法。發明_既述本發明的一個實施方式涵蓋治療患有I型IFN或IFNa介導的疾病或疾患的患者 的方法。將結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑施用給患者。該患者包含差異調節的 miRNA標志物譜。所述藥劑中和差異調節的miRNA標志物譜。本發明的另一實施方式是在需要其的患者中中和差異調節的miRNA標志物譜的 方法。將結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑施用給患者。該藥劑中和所述患者的差 異調節的miRNA標志物譜。本發明的另一個實施方式是監測或預測患者的自身免疫疾病或炎性疾病進展的 方法。在來自患者的第一樣品中獲得第一差異調節的miRNA標志物譜。本發明的又一實施方式是監測接受治療劑治療的患者的自身免疫疾病或炎性疾 病進展的方法。獲得來自患者的第一樣品中的第一 miRNA譜。施用治療劑。獲得來自患者 的第二樣品中的第二 miRNA譜。比較所述第一 miRNA譜和所述第二 miRNA譜。所述第一 miRNA譜與所述第二 miRNA譜之間的變化表明治療劑的效力水平。本發明的另一個實施方式是治療肌炎患者的方法。將結合并調控I型IFN或IFN a 活性的藥劑施用給患者。所述藥劑中和患者的I型IFN或IFNa -誘導性PD標志物表達譜。本發明的另一個實施方式涵蓋監測或預測患者的肌炎疾病進展的方法。獲得來自 患者的第一樣品中的第一 IFNa-誘導性PD標志物表達譜。本發明的又一實施方式是監測接受治療劑治療的患者的肌炎疾病進展的方法。獲 得來自患者的第一樣品中的第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜。將治療劑施用給患者。從 來自患者的第二樣品中獲得第二 IFN a -誘導性PD標志物表達譜。比較所述第一 IFN a -誘 導性PD標志物表達譜和所述第二 IFN a -誘導性PD標志物表達譜。附圖簡述圖Ia和Ib 在DM和PM患者的肌肉樣本中上調最明顯的基因的大多數是IFN-a / β誘導性的。(a)顯示在DM患者肌肉樣本中上調的基因的表；(b)在DM和PM患者肌肉中 的IFN-α/β誘導性基因標記(signature)評分。圖2a和2b 在DM和PM患者中的IFN- α/β誘導性基因標記評分隨著患者疾病 狀態的改善而降低。(a)提供DM活性患者(DMA)、DM改善患者(DMI)、PM活性患者(PMA) 和PM改善患者(PMI)的IFN-α/β誘導性基因標記評分。(b)顯示在DM患者中隨著他們 的活性疾病變得改善，IFN-α/β誘導性基因標記評分降低。圖3a_3c 如對于(a)-(c)三名患者所顯示的，DM患者全血樣品中的IFN-α / β誘
14導性基因標記評分與臨床改善相關，但是其他細胞因子(TNFa、ILl β、IL4、ILlO和IL13) 的基因標記評分與臨床改菩不相關。圖4:DM患者的IFN-α/β誘導性基因標記評分預示了臨床改善以及復發。圖5a_5d =PM患者中的IFN-α / β誘導性基因標記評分的改變與血清CK水平相 關。(a)顯示 PM 患者的 IFN- α / β -、TNF α -、ILl β -、IL4_、IL10-、IL13-誘導性基因標記 評分；(b)提供患者的血清CK活性，其符合IFN- α / β誘導性基因標記的曲線；(c)提供各 種細胞因子基因標記評分與血清CK水平之間的相關性；(d)是PM患者的IFN- α / β _誘導 性基因標記評分與健康供體(黑色圓)相比較的PCA圖。圖6 =DM患者中的IFN- α/β誘導性基因標記評分改變與血清CK水平相關。(a)顯 示醫師的四次隨訪內的患者的血清CK活性；(b)顯示在相同的四次隨訪中患者的IFN-a/ β -、TNF α -、ILl β -、IL4-、IL10-、IL13-誘導性基因標記評分；(c)提供各種細胞因子基 因標記評分和血清CK水平之間的相關性。如通過患者的全血中的前25種誘導性基因的 中和所監測的，I型IFN基因標記(顯示在(b)中)示蹤了臨床活性。隨訪1，治療前；隨 訪2，利妥昔單抗和類固醇治療之后(小的改善)；隨訪3，患者保持穩定；隨訪4，患者崩潰 (crashed)(血清CK水平驟增)。圖7a和7b 圖6中所討論的DM患者的IFN- α/β誘導性基因標記示蹤了疾病進 展/消退。(a)熱圖，它顯示在患者進展/消退時在IFN-α/β誘導性標記中的基因的中和 及去中和；(b)示蹤DM患者的IFN-α/β誘導性基因標記評分與健康供體(黑色圓)相比 較的PCA圖。圖8 顯示IBM患者的肌肉樣本展示了 IFN-α / β誘導性基因標記過表達的散點 圖。散點圖是使用下列兩種方法由14名患IBM的患者得到的肌肉樣本的IFN-α /β基因 標記評分的散點圖25種基因的動態列表和21種基因的靜態列表。每個點表示一名患者。圖9a和9b :IBM患者血清樣品顯示出不同的IFN-α / β基因標記過表達。(a)使 用下列兩種方法由9名IBM患者得到的全血的IFN-α / β基因標記評分25種基因的動態 列表和21種基因的靜態列表；(b)使用25種基因的動態列表由9名IBM患者的全血獲得 的IFN-α/β基因標記評分的散點圖。每個點表示一名患者。圖IOa和IOb Jol陰性DM患者比Jol陽性DM患者具有更高的IFN- α/β基因標 記評分。(a)DM Jol陽性和DM Jol陰性患者中19種IFN- α / β誘導性基因的過表達；(b) 使用19種基因得到的來自3名Jol陽性和7名Jol陰性的DM患者的肌肉的IFN- α / β基 因標記評分散點圖。每個點表示一名患者。

圖11-104 注釋IL4標記中的基因的探針列表。圖105-158 注釋ILlO標記中的基因的探針列表。圖159-234 注釋IL13標記中的基因的探針列表。圖235-381 注釋807種IFNa誘導性基因的探針列表。圖382-383 獨特的檢測物id、miRNA id、和序列的列表。圖384a和384b 在DM和PM患者中過表達最明顯的那些基因之中的1型IFN誘 導性基因的普遍性可用于鑒定1型IFN誘導性基因標記評分陽性患者。(a)熱圖，它表示 24名正常健康供體、20名PM患者和22名DM患者以及136種探針組，該探針組被鑒定為是 1型IFN誘導性的并且將42名DM和PM患者與24名正常健康供體相比較時顯著過表達(q值< 0. 05并且改變倍數> 2)。第一個黑色的水平線表示正常健康供體；第二個標記為低 的水平線表示具有弱的1型IFN誘導性基因標記評分(改變倍數< 4)的患者；第三個標記 為中等的水平線表示具有中等1型IFN誘導性基因標記評分(4彡改變倍數< 10)的患者 并且第四個標記為高的水平線表示具有高1型IFN誘導性基因標記評分(即，標記評分陽 性)的患者。(b)在(a)中被分級為正常健康供體、弱標記評分、中等標記評分和高標記評 分的相同受治療者的1型IFN誘導性基因標記評分的散點圖。IFN =干擾素；DM =皮肌炎； PM=多肌炎。圖385a-385c 患者特異性的縱向1型IFN誘導性轉錄物測量具有作為生物標志 物來測量DM和PM疾病活性的效用。(a)使用在隨訪1時的21名患者和36名正常健康供 體的13種基因復合評分和IFI27、IFI44、IFI44L和RSAD2的單個轉錄物測量所得的單個基 因復合評分和改變倍數值。通過相對較低或中等的臨床測量疾病活性(MITAXS6)和高疾 病活性(MITAX > 6)將患者分組。在多重檢驗調整后，4種基因的任一種或13種基因復合 評分在正常健康供體和MITAX ( 6的患者之間沒有顯著的差異。對于所有的基因和基因復 合評分，在正常健康供體與MITAX > 6的患者相比，以及MITAX彡6的患者與MITAX > 6的 患者相比時具有顯著差異(參見表8)。(b)MITAX測量的疾病活性具有一些變化的18名患 者的患者特異性分析以及(c)研究中MITAX沒有改變的3名患者。提供了 18名患者的每 一個在他們的具有研究過程中的最低至最高MITAX值的隨訪時的基因復合評分、改變倍數 值以及原始P值。具有MITAX變化的患者顯示在調整后除EFI44外的所有基因/基因復合 評分具有高度顯著的一致的基因表達改變；沒有MITAX變化的患者顯示基本沒有基因表達 改變，盡管樣品大小太小而無法得到統計顯著性。所有的基因復合評分和改變倍數值均相 對于36名正常健康供體的中值計算。圖386a和386b :DM和PM患者表現出外周血的MITAX評分與1型IFN 13種基因復 合評分之間的相關性。(a)具有至少4次總隨訪的6名患者(BGE15、BGE99、BGE10、BGE106、 BGE119和BGE147)的MITAX評分與13種基因復合評分之間的比較。黑色實線和最右側的y 軸表示MITAX評分，而黑色虛線和最左側的y軸表示13種基因復合評分。BGE15和BGE147 的圖示中的‘H’標號表示預告(herald)隨訪。(b)對于患者BEG92看到了在13種基因復 合評分與CK水平之間的另一種相關性。最左側的圖中黑色虛線和最右側的y軸表示此患 者的CK水平。DM =皮肌炎；PM =多肌炎；CK =肌酸激酶。圖387a和387b :WB中1型IFN誘導性基因表達的強升高預告在幾個患DM或PM 的患者中的疾病復發。出現了其中相信疾病是臨床上穩定的或在改善，但是在6-35天后 患者發展了臨床復發的三次隨訪。在“預告”復發會馬上出現的這3次隨訪的每一次中，顯 著的IFN誘導性基因表達增加。(a) 13種基因復合評分的表達改變的列表。列顯示了患 者樣品；預告(V-預告)隨訪與復發(V-復發)隨訪之間的天數；V-預告與V-復發之間的 MITAX評分改變；從前一次隨訪到V-預告的基因表達增加倍數。(b) 13種基因復合評分的 代表圖。每個中間隨訪(#3)是預告隨訪；MITAX評分是與之前一次隨訪(#2)相比穩定的 或改善的，但是13種基因復合評分則顯著增加，可能預告了復發，這由下一次隨訪(M)的 MITAX評分增加證實。IFN =干擾素；DM =皮肌炎；PM =多肌炎。圖388a-388c 其他細胞因子誘導性標記評分在中等的和嚴重的患DM和PM患者 之間沒有不同并且與疾病活性不相關。(a)隨訪1時的21名患者和36名正常健康供體的TNF-α、IL-I β、IL-10、IL-13和GM-CSF的細胞因子誘導性基因標記。通過相對較低或中 等的臨床測量疾病活性(MITAX ( 6)和高疾病活性(MITAX > 6)將患者分組。在多重檢驗 調整之后，對于所有的5種細胞因子誘導性基因標記，正常健康供體與MITAX ( 6的患者 之間存在顯著的差異。對于所有的5種細胞因子誘導性基因標記，正常健康供體與MITAX >6的患者之間也存在顯著的差異。然而對于5種細胞因子誘導性基因標記的任一種，在 MITAX ^ 6的患者與MITAX > 6的患者之間不存在顯著的差異(參見表8)。(b) MITAX測量 的疾病活性具有一些變化的18名患者的患者特異性分析以及(c)研究中MITAX活性沒有 改變的3名患者。提供了 18名患者的每一個在他們的具有研究過程中的最低至最高MITAX 值的隨訪時的細胞因子誘導性基因標記和原始P值。對于任何細胞因子誘導性基因標記， MITAX變化的患者均未顯示出顯著的一致的基因表達改變；沒有MITAX變化的患者基本也 不顯示基因表達改變，盡管樣品大小太小而無法計算出統計顯著性。所有的細胞因子誘導 性基因標記均相對于36名正常健康供體的中值計算。DM =皮肌炎；PM =多肌炎。圖389 24名DM或PM患者在具有最高(上排(panel))和最低(下排)MITAX評 分的隨訪時的不同細胞因子誘導性基因標記的比較。各行表示不同的細胞因子誘導性基因 標記的過表達。框中顯示的3名患者是1型IFN誘導性基因標記評分陰性的。每位患者的 升高的細胞因子誘導基因標記水平由近紅色的顏色表示，而近藍色的顏色表示低的細胞因 子誘導基因標記值。IFN =干擾素；DM =皮肌炎；PM =多肌炎。詳細說明本發明涵蓋鑒定、診斷、治療和監測患者的疾病進展的方法。患者包括具有I型 IFN或IFN α誘導性疾病、疾患或病癥的任何動物；或具有炎性或自身免疫疾病、疾患或病 癥的任何動物。患者可以由于實驗研究而患疾病、疾患或病癥，例如，其可以是開發的用于 疾病、疾患或病癥的實驗模型。可選擇地，患者可以在不存在實驗操作的情況下患有疾病、 疾患或病癥。患者包括人、小鼠、大鼠、馬、豬、貓、狗和用于研究的任何動物。I型IFN或IFN α誘導性疾病、疾患或病癥是表現出I型IFN或IFN α PD標志物表 達譜或基因標記的任何疾病、疾患或病癥。PD標志物表達譜和基因標記應被理解為是等同 的。這些疾病、疾患或病癥包括具有自身免疫組分的那些，如系統性紅斑狼瘡、胰島素依賴 性糖尿病、炎性腸病(包括克羅恩病、潰瘍性結腸炎、和乳糜瀉(Celiac's disease))、多發 性硬化、銀屑病、自身免疫性甲狀腺炎、類風濕性關節炎、腎小球腎炎、如包涵體肌炎或皮肌 炎或多肌炎或非特異性肌炎的特發性炎性肌炎、或壞死性肌病、舍格倫綜合征(Sjogren’ s syndrome)、血管炎和結節病。其他疾病、疾患或病癥包括移植物抗宿主疾病和移植排斥。如果患者是肌炎患者，則患者可以患有包涵體肌炎或皮肌炎或多肌炎。肌炎 患者可以具有高的或低的肌炎意向治療級別(MITAX)評分。本領域的技術人員將能 夠容易地確定肌炎患者的MITAX評分。參見，例如Walsh RJ, Pinkus幾，等人Type I interferon-inducible gene expression in blood is present and reflects disease activity in dermatomyositis and polymyositis.(在血液中存在 I 型干擾素誘導性 基因表達并且其反應了皮肌炎與多肌炎的疾病活性)Arthritis Rheum. 2007 ；56 (11) 3784-92，其通過引用并入。高MITAX評分可以為約大于6。低MITAX評分可以為約小于或 等于6。肌炎患者可以可選地或另外具有中等或強的I型IFN-或IFNa誘導性基因標記 評分。如果被分配的評分約小于4，則1型IFN-或IFNα誘導性基因標記評分可能是弱的，如果被分配的評分為4左右或約大于4但小于10則是中等的，并且如果被分配的評分 為約10或大于10則是高的。本領域的那些技術人員將容易理解并能夠確定I型IFN或 IFNa誘導性基因標記評分。參見，例如Yao，Y，Jallal J，等人Development of Potential Pharmacodynamic and Diagnostic Markers for Anti-IFN- α Monoclonal Antibody Trials in Systemic Lupus Erythematosus.(用于系統性紅斑狼瘡的抗IFNα單克隆抗 體試驗的潛在的藥效學和診斷標志物的開發)Human Genomics and Proteomics. 2008 ；第 2009 卷，文獻 ID 374312，doi 10. 4061/2009/374312，通過引用并入。自身免疫疾病、疾患或病癥可以是其中在沒有外來物質要抵抗時免疫系統觸發免 疫應答并且機體的正常保護性免疫系統通過錯誤地襲擊自身而損害其自身組織的任何疾 病、疾患或病癥。這些疾病、疾患或病癥包括多發性硬化、克羅恩病、類風濕性關節炎、斑禿 (alopecia greata)、強直性脊柱炎、抗磷脂綜合征、自身免疫性阿狄森氏病、腎上腺的自身 免疫疾病、變應性腦脊髓炎、自身免疫性溶血性貧血、自身免疫性肝炎、自身免疫性炎性眼 病、自身免疫性新生兒血小板減少癥、自身免疫性嗜中性白細胞減少癥、自身免疫性卵巢炎 和睪丸炎、自身免疫性血小板減少癥、自身免疫性甲狀腺炎、貝切特氏病、大皰性類天皰瘡、 心肌病、心切開術綜合征(cardiotomy syndrome)、口炎性腹瀉-皮炎、慢性活動性肝炎、慢 性疲勞性免疫功能障礙綜合征(CFIDS)、慢性炎性脫髓鞘性多神經病、丘-施二氏綜合征、 疤痕性類天皰瘡、CREST綜合征、冷凝集素疾病、克羅恩病、致密物沉積病(dense deposit disease)、盤狀狼瘡、特發性混合性冷球蛋白血癥、纖維肌痛-纖維肌炎、腎小球腎炎(例 如，IgA腎病(η印hrophathy))、谷蛋白敏感性腸病、古德帕斯徹綜合癥(Goodpasture' s syndrome)、格雷夫斯氏病、格林_巴利病、甲狀腺功能亢進癥(即，橋本氏甲狀腺炎)、特 發性肺纖維化、特發性阿狄森氏病、特發性血小板減少性紫癜(ITP)、IgA神經病、幼年型 關節炎、扁平苔蘚(lichen planus)、紅斑狼瘡(lupus erthematosus)、梅尼埃病、混合性 結締組織病、多發性硬化、重癥肌無力、心肌炎、1型或免疫介導的糖尿病、重癥肌無力、心 肌炎、神經炎、其他內分泌腺衰竭、尋常型天皰瘡、惡性貧血、結節性多動脈炎、多軟骨炎 (polychrondritis)、多種內分泌腺病、多腺性綜合征、風濕性多肌痛、多肌炎和皮肌炎、心 肌梗死后(post-MI)、原發性無丙種球蛋白血癥、原發性膽汁性肝硬化、銀屑病、銀屑病關 節炎、雷諾氏現象(Raynauld' s phenomenon)、復發性多軟骨炎、萊特爾氏綜合征、風濕性 心臟病、類風濕性關節炎、結節病、硬皮病、舍格倫綜合征、僵人綜合征、系統性紅斑狼瘡、 紅斑狼瘡、大動脈炎、顳動脈炎/巨細胞動脈炎、潰瘍性結腸炎、蕁麻疹、葡萄膜炎、葡萄膜 眼炎(Uveitis Opthalmia)、血管炎如皰疹樣皮炎性血管炎(dermatitis herpetiformis vasculitis)、白癜風和韋格納氏肉芽腫病。炎性疾患、疾病或病況可以包括哮喘、變應性疾患、特征為2型介導的炎癥的炎 性疾患、肺纖維化、慢性阻塞性肺病(COPD)、腦炎(encephalitis)、炎性腸病、感染性休克、 未分化脊椎關節病、未分化關節病、關節炎、炎性骨質溶解以及由慢性病毒或細菌感染所導 致的慢性炎癥。患者可以包含差異調節的miRNA譜。差異調節的miRNA譜可以是其中患者的組 織樣品相對于患者的對照組織樣品或相對于健康對照個體表現出一種或多種miRNA的表 達增加的miRNA譜。差異調節的miRNA譜可以是其中患者的組織樣品相對于患者的對照 樣品或相對于健康對照個體表現出一種或多種miRNA的表達降低的miRNA譜。差異調節的miRNA譜可以是其中患者的組織樣品相對于對照樣品表現出一種或多種miRNA的表達增 加和相對于對照樣品表現出一種或多種miRNA表達降低二者的miRNA譜。表現出表達增 加的miRNA的數目可以是1 ；至少1、2 ；至少2、3 ；至少3、4 ；至少4 ；4 ；至少5 ；至少6 ；至少 7 ；至少8 ；至少9 ；至少10 ；至少15 ；至少20 ；至少25 ；至少30或至少50。表現出表達降 低的miRNA的數目可以是1 ；至少1、2 ；至少2、3 ；至少3、4 ；至少4 ；4 ；至少5 ；至少6 ；至少 7 ；至少8 ；至少9 ；至少10 ；至少15 ；至少20 ；至少25 ；至少30或至少50。表達的差異增加 或降低可以是對照樣品的大約10% -500%、對照樣品的大約10% -400%、對照樣品的大約 10% -300%、對照樣品的大約10% -250%、對照樣品的大約10% -200%、對照樣品的大約 10% -150%、對照樣品的大約10% -100%、對照樣品的大約10% -50%、對照樣品的大約 100 % -500 %、對照樣品的大約200 % -500 %、對照樣品的大約300 % -500 %、對照樣品的大 約400 % -500 %、對照樣品的大約50 % -100 %、對照樣品的大約100 % -200 %、對照樣品的 大約100% -400%、對照樣品的大約200% -400%、對照樣品的大約10% -50%、對照樣品 的大約20% -100%、對照樣品的大約25% -75%或對照樣品的大約50% -100%。它可以 是對照樣品的 10%,20%,25%,30%,40%,50%,75% ,100% ,125% ,150% ,175%,200%, 250%,300%,400%^； 500% ο差異表達的任何1種；至少1、2種；至少2、3種；至少3、4種；至少4種；4種；至 少5種；至少6種；至少7種；至少8種；至少9種；至少10種；至少15種；至少20種；至 少25種；至少30或至少50種miRNA可以包括表2_5或圖382-383中所討論的任何miRNA。 miRNA 可以通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 或 hsa-miR-1-4373161 檢測。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑的施用可以是小分子或生物藥劑的施 用。如果治療劑是小分子，則它可以是合成的或由天然來源鑒定和分離的。如果治療劑是生物藥劑，則它可以是對I型IFN或IFN α的任何亞型特異性的抗 體。例如，抗體可以是對下列的任一種特異性的JFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、 IFNa 7、IFNa 8、IFNa 10、IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN^ 或 IFNco。可選擇地，抗體 可以是對任兩種、任三種、任四種、任五種、任六種、任七種、任八種、任九種、任十種、任i^一 種、任十二種I型IFN或IFNa亞型特異性的。如果抗體是對大于一種的I型IFN亞型特 異性的，貝U抗體可以是對 IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8、IFNa 10 禾Π IFNa 21 特 異性的；或它可以是對IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8和IFNa 10特異性的；或 它可以是對IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8禾口 IFNa 21特異性的；或它可以是對 IFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 10 禾口 IFNa 21 特異性的。對 I 型 IFN 或 IFNa 特異 性的抗體包括MEDI-545、除MEDI-545之外的任何生物劑或抗體、2004年12月10日提交的 美國專利申請11/009，410和2005年6月20日提交的11/157,494中所描述的抗體、在美 國專利第7，087，726號中描述的9F3和其他抗體(實施例1和實施例2，在表3和表4中公 開的那些和/或在名為“材料保藏”(D印osit of Material)的表的第56列，第25_54行中 所公開的那些)、NK-2 和 Y0K5/19 (W0 84/03105)、L0-22 (美國專利 4，902, 618)、144BS (美 國專利4，885，166)以及ΕΒΙ-1、ΕΒΙ-2和EBI-3(EP 119476)。調控IFNa活性的治療劑可 以中和IFNa活性。本領域的技術人員清楚地知道這種生物藥劑的制備和配制以及它們施 用的方法。抗體可以是合成抗體、單克隆抗體、多克隆抗體、重組制備的抗體、細胞內抗體、多特異性抗體(包括雙特異性抗體)、人抗體、人源化抗體、嵌合抗體、單鏈FV(SCFV)(包括雙 特異性scFv)、BiTE分子、單鏈抗體、Fab片段、F(ab，)片段、二硫鍵連接的Fv(SdFv)或上 述任何一種的表位結合片段。抗體可以是免疫球蛋白分子或免疫球蛋白分子的免疫活性部 分中的任何一種。此外，抗體可以為任何同種型。例如，它可以是同種型IgGl、IgG2、IgG3 或IgG4的任何一種。抗體可以是包含可變區與恒定區的全長抗體、或其抗原結合片段，如 單鏈抗體、或Fab或Fab’2片段。抗體還可以軛合或連接至治療劑上，如細胞毒素或放射性 同位素。可以將除結合以調控IFNa活性的藥劑之外的第二藥劑施用給患者。第二藥劑 包括但不限于非類固醇類抗炎藥物，如布洛芬、萘普生、舒林酸、雙氯芬酸、吡羅昔康、酮洛 芬、二氟尼柳、萘丁美酮、依托度酸和奧沙普秦、吲哚美辛；抗瘧疾藥物，如羥氯喹；皮質類 固醇激素，如潑尼松、氫化可的松、甲潑尼龍和地塞米松；甲氨蝶呤；免疫抑制劑，如硫唑嘌 呤和環磷酰胺；以及生物藥劑，例如，靶向T細胞的生物藥劑，如阿法賽特(Alefac印t)和依 法利珠單抗(Efalizumab)，或靶向TNFa的生物藥劑，如恩利(Enbrel)、類克(Remicade) 和修美樂(Humira)。藥劑的治療可以導致差異調節的miRNA譜的中和。藥劑的治療可以導致I型IFN 或IFNa介導的疾病或疾患的一種或多種癥狀的減輕。藥劑的治療可以導致I型IFN或 IFNa介導的疾病或疾患突發較少。藥劑的治療可以導致患有I型IFN或IFNa介導的疾 病或疾患的患者的預測改善。藥劑的治療可以導致患者較高的生活品質。藥劑的治療可以 減輕共施用第二藥劑的需要或可以減少施用給患者的第二藥劑的劑量。藥劑的治療可以降 低關于I型IFN或IFNa介導的疾病或疾患的患者住院次數。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑可以中和差異調節的miRNA譜。差異 調節的miRNA譜的中和可以是至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至少七種、至少 八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至少二十五種、至少三十種、至少 三十五種、至少四十種、至少四十五種或至少五十種上調的miRNA的降低。上調的miRNA可 以包括表2或表4中所檢測的或所包括的那些或如圖表382-383中所顯示的那些中的任何 一種。差異調節的miRNA譜的中和可以是在任何差異調節的miRNA譜中上調的至少一種、 至少兩種、至少三種、至少五種、至少七種、至少八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、 至少二十種、至少二十五種、至少三十種、至少三十五種、至少四十種、至少四十五種或至少 五十種基因中的任何基因的至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至 少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至 少60 %、至少70 %、至少75 %、至少80 %或至少90 %的降低。可選擇地，差異調節的miRNA 譜的中和是指上調的miRNA表達的如下降低在對照樣品中的那些miRNA的表達水平的最 多50%、最多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多 10%、最多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之內。如果結合并調控I型IFN或 IFNa活性的藥劑是生物藥劑如抗體則該藥劑可以在下列劑量中和I型IFN或IFNa譜 0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、l 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、 5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。差異調節的miRNA譜的中和可以是至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至 少七種、至少八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至少二十五種、至少三十種、至少三十五種、至少四十種、至少四十五種或至少五十種的miRNA的下調的表達的 增加。下調的miRNA可以包括表3或5中所檢測的或所包括的那些或如圖表382-383中 所顯示的那些的任何一種。差異調節的miRNA譜中下調的基因的中和是在任何miRNA譜 中表達下調的至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至少七種、至少八種、至少十種、至 少十二種、至少十五種、至少二十種、至少二十五種miRNA中的任何miRNA的至少2%、至少 3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至 少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、或 至少90%、或至少100%、或至少125%、或至少130%、或至少140%、或至少150%、或至 少175%、或至少200%、或至少250%、或至少300%、或至少500%的增加。可選擇地，差 異調節的miRNA譜的中和是指miRNA的表達增加至在對照樣品中那些miRNA表達水平的最 多50%、最多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多 10%、最多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之內。如果結合并調控I型IFN或 IFNa活性的藥劑是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下列劑量中和差異調節的miRNA譜 0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、l 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、 5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。患者還可以包含I型IFN或IFN α誘導性PD標志物表達譜。I型IFN或IFN α誘 導性PD標志物表達譜可以是強的譜、中等的譜或弱的譜。可以如下而容易地將I型IFN或 IFNa誘導性PD標志物表達譜指定為強的、中等的或弱的測定患者的I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物表達譜相對于對照樣品或對照患者的失調倍數(例如，患者中上調的I型 IFN或IFNa誘導性PD標志物表達的增加倍數)，并比較患者的失調倍數與具有I型IFN 或IFN α誘導性PD標志物表達譜的其他患者的失調倍數。I型IFN或IFN α誘導性PD標 志物表達譜可以是2007年12月6日提交的PCT/US2007/024947中所公開的任一種，通過 引用將其并入本文。患者的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜中可以包括的基因的組可以是 MX1、LY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RASD2 和 IFI44。通過探針 所檢測的基因可以包括IFI44、IFI27、IFI44L、DNAPTP6、LAMP3、LY6E、RSAD2、HERC5、IFI6、 ISG15、0AS3、SIGLEC1、0AS2、USP18、RTP4、IFITl、MXl、OASl、EPSTI1、PLSCRl 和 IFRG28。在 這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或 多種基因。基因可以包括LAMP3、DNAPTP6、FLJ31033、HERC6、SERPING1、EPSTl 1、RTP4、OASL, FBX06、IFIT2、IFI44、0AS3、BATF2、ISG15、IRF7、RSAD2、IFI35、OASU LAP3、IFITUIFIT5、 PLSCRl、IFI44L、MS4A4A、GALM、UBE2L6、T0R1B、SAMD9L、HERC5、TDRD7、TREXl、PARP12 和 AXUDl中的任何至少2種、任何至少3種、任何至少4種、任何至少5種、任何至少6種、任 何至少7種、任何至少8種、任何至少9種、任何至少10種、或任何至少11種、或任何至少 12種、或任何至少13種、或任何至少14種、或任何至少15種、或任何至少16種、或任何至 少17種、或任何至少18種、或任何至少19、或任何至少20種、或任何至少21種、或任何至 少22種、或任何至少23種、或任何至少24、或任何至少25種、或任何至少26種、或任何至 少27種、或任何至少28種、或任何至少29種、或任何至少30種。在這種表達譜中的IFN a 誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。
表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI27、SIGLEC1、 RSAD2、IFI6、IFI44L、IFI44、USP18、IFIT2、SAMD9L、BIRC4BP、DNAPTP6、0AS3、LY6E、IFITl、 LIPA、L0C129607、ISG15、PARP14, MX1、0AS2、OASL, CCL2、HERC5、OASl。在這種表達譜中的 IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFIT1、IFIT3、IRF7、 IFI6、IL6ST、IRF2、LY6E、MARCKS, MXl、MX2、OASl、EIF2AK2、ISG15、STAT2、0AS3、IFI44、 IFI44L、HERC5、RAB8B、LILRA5、RSAD2 和 FCH02。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標志 物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFl、RTP4、SIGLEC1和EPSTI1。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物 還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFU RTP4、SIGLEC1、EPSTIl 和 RSAD2。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因BCL2、BAK1、BAD、BAX 和BCL2L1。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列 的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因RTP4、RSAD2、HERC5、 SIGLEC1、USP18、LY6E、ETV7、SERPING1、IFIT3、0AS1、HSXIAPAF1、G1P3、MXU 0AS3、IFI27、 DNAPTP6、LAMP3、EPSTI1、IFI44、0AS2、IFIT2 和 ISG15。在這禾中表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因LAMP3、SIGLEC1、 DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、SERPING1、HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、 IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、LY6E、ISG15 和 IFI27。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標 志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因DNAPTP6、EPSTIU HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITU IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2、 0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SIGLEC1和USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物 還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、 IFIT2、ZC3HAV1、ETV6、DAPPl、IL1RN、CEACAMU OASU IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、 EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL, GBPl和MXl。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物 還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MXl、IFITl、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1 和 USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至 少一種或多種基因。
表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1、IFITl、HERC5、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTIl、IFIT3、0AS2、LY6E、 SIGLEC1和USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381 中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1和IFIT1。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖 表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、 IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL、GBPl 和 MXl0在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少 一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI27、RSAD2、 IFI44L、IFI44、0AS1、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、MXl、ESPTI1、IFIT3 和 IFI6。在這種表達 譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI44L、RSAD2、IFI27 和IFI44。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的 至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少基因IFI44L和RSAD2。在這種 表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少基因IFI44L。在這種表達譜中 的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少基因RSAD2。在這種表達譜中的 IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。包含差異調節的miRNA譜的患者還可以包含下調的I型IFN或IFNa PD標志物。 下調的PD標志物可以包括基因CYPlBl、TGSTl、RRAGD、IRS2、MGST1、TGFBR3和RGS2的任何 一種、任何兩種、任何三種、任何四種、任何五種、任何六種或任何七種。包含差異調節的miRNA譜的患者還可以包含任何數目的IFN α或I型IFN亞型的 表達上調。IFNa或I型IFN亞型可以包括任何大于一種、大于兩種、大于三種、大于四種、 大于五種、大于六種、大于七種、大于八種、大于九種或大于十種的IFNa或I型IFN亞型。 這些亞型可以包括IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 6、IFNa 7、IFNa 8、IFNa 10、 IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN3 或 IFNco。患者可以包含 IFN亞型 IFNa l、IFNa 2、IFNa 8 和IFNa 14的表達上調。包含差異調節的miRNA譜的患者還可以包含為IFNARl或IFNAR2或二者的IFN a 受體、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNY 受體(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和 IFNGR2 二者)的表 達上調。患者可以被簡單地鑒定為包含為IFNARl或IFNAR2或二者的IFNa受體、或TNFa 或IFN γ、或IFNy受體(IFNGR1、IFNGR2或IFNGRl和IFNGR2 二者)的表達上調的患者。患者的表達譜中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的上調或下調可以是與來 自對照的樣品(可以是來自患者的非疾病組織(例如銀屑病患者的未損害的皮膚)或來自未受疾病或疾患折磨的健康人的樣品)相比的任何程度。上調或下調程度可以是對照或對 照樣品的至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至 少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、 或至少200 %、或至少300 %、或至少400 %、或至少500 %。此外，患者可以過表達下列程度的I型IFN亞型或具有過表達下列程度的I型IFN 亞型的組織對照的至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少 50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少 150%,或至少200%、或至少300%、或至少400%、或至少500%。I型IFN亞型可以是下列 的任何一種 JFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、IFN a 7、IFN a 8、IFN a 10、IFN a 14、 IFNa 17、IFNa 21、IFN^ 或 IFNco。I 型 IFN 亞型可以包括 IFNa 1、IFNa 2、IFNa 8 禾口 IFNa 14的全部。患者還可以包含或可選擇地包含血清中蛋白水平的改變。患者可以具有血清水 平增加的蛋白，如脂連蛋白、甲胎蛋白、載脂蛋白CIII、β-2微球蛋白、癌抗原125、癌抗 原19-9、嗜酸細胞活化趨化因子、FABP、因子VII、鐵蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、IL-18、 IL-lra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌紅蛋白、SG0T、組織因子、TIMP-1、TNF RII、TNF_a、VCAM-1 或vWF。患者在血清中可以具有血清水平增加的任何1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8 種、9 種、10 種、11 種、12 種、1314 種、15 種、16 種、17 種、18 種、19 種、20 種、21 種、o22 種、23 種、24種、25種或26種的這些蛋白。增加的水平可以是對照如健康受治療者的至少10%、 至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至 少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至少200%、或至少 300%、或至少400%、或至少500%。變化可以是諸如以下的蛋白的血清水平降低BDNK、 補體3、CD40配體、EGF、ENA-78、EN-RAGE, IGF-I、MDC、髓過氧化物酶、RANTES或血小板生 成素。患者可以具有血清水平降低的任何1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、 10或11種的這些蛋白。降低的水平可以為對照如健康受治療者的至少10 %、至少15 %、至 少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少 80%、至少90%或至少100%。PD標志物譜可以包含這些血清水平增加或降低的蛋白的一 種或多種。患者還可以包含結合下列自身抗原的任何一種的自身抗體(a)抗黏液病毒 (流感病毒)1，干擾素誘導蛋白p78;(b)SUrfeit 5，轉錄物變體c;(c)蛋白酶體(前體 (posome)，巨蛋白因子(macropain))激活物亞基3 (PA28 γ ；Ki) transc ； (d)視黃酸受 體α ； (e) IOkDa熱休克蛋白1(伴侶蛋白10) ；f)原肌球蛋白3;(g)普列克底物蛋白同 源性樣結構域(pleckstrin homology-like domain)，家族A，成員1 ； (h)細胞骨架相關 蛋白1 ;(i)舍格倫綜合征抗原A2(60kDa，核糖核蛋白自身抗原SS-A/Ro) ； (j)NADH脫氫 酶(泛醌)1，α/β亞復合體(subcomplexU，8kDa;(k)NudE核分布基因E同系物1(構 巢曲霉(A.nidulans))；⑴MutL同系物1，2型非息肉性結腸癌(大腸桿菌(E. coli))； (m)富亮氨酸重復(FLII中)相互作用蛋白2 ； (η)原肌球蛋白1 (α ) ； (0)痙攣性截癱20， spartin (Troyer 綜合征)；(ρ)植入前蛋白(preimplantation protein),轉錄物變體 1 ； (r)線粒體核糖體蛋白L45 ;(s)Lin-28同系物(秀麗隱桿線蟲(C. elegans)) ； (t)90kDa熱 休克蛋白1，α ； (u)dom-3同系物Z (秀麗隱桿線蟲)；(ν)動力蛋白，胞質的，輕中間體多肽2 (light intermediate polypeptide 2) ； (w) Ras W C31 (rhoMM,
小GTP結合蛋白)；(χ)滑膜肉瘤，X斷點2，轉錄物變體2 ； (y)膜突蛋白；(z)homer同系物 (果蠅(Drosophila))轉錄物變體1 ； (aa)GCN5廣泛控制的氨基酸合成5樣(GCN5general control of amino-acid synthesis 5_like)2(酵母)；(bb)真核翻譯延伸因子 1 Y ； (cc) 真核翻譯延伸因子IS ； (dd)DNA損傷誘導轉錄物3 ;(ee)CCAAT/增強子結合蛋白(C/EBP) Y ；以及在下列臨時申請中所描述的任何其他自身抗原2007年5月3日提交的名稱為 "Auto-antibody markers of autoimmune disease (自白勺自”白勺 臨時申請或在2007年11月6日提交的名稱為‘‘Auto-antibody markers of autoimmune disease (自身免疫疾病的自身抗體標志物)”(例如但不限于在表2、4、5和9中所描述的 那些)。患者可以包含結合任何數目的這些自身抗原的自身抗體，例如任何至少2種、至少 3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少9至少10種、至少11種、至 少12種、至少13種、至少14種、至少15種、至少20種、至少25種。結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑的施用還可以在下列范圍內中和I型IFN 或IFN α誘導譜對照樣品的至少2 %、至少3 %、至少4 %、至少5 %、至少7 %、至少8 %、至 少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少75%、至少80%、或至少90%。在監測或預測患者的疾病進展的方法中，可以在藥劑施用之前和之后從患者獲得樣品。樣品包括任何生物流體或組織，如全血、血清、肌肉、唾液、尿、滑液、骨髓、腦脊液、 鼻分泌物、痰、羊水、支氣管肺泡灌洗液、外周血單核細胞、總白細胞、淋巴結細胞、脾細胞、 扁桃體細胞或皮膚。樣品可以通過本領域內的任何已知方法獲得。獲得樣品中的miRNA譜(藥劑施用之前和之后)。比較樣品中的miRNA譜。比較 可以是樣品中存在的miRNA數目的比較或者可以是樣品中存在的miRNA數量的比較，或它 們的任何組合。如果在治療劑施用之后所獲得的樣品中上調的miRNA的數目或水平(或它 們的任何組合)相對于治療劑施用之前所獲得的樣品降低，則可以指示表明治療劑效力的 變化。上調的miRNA的數目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、 至少8、至少9、或至少10。任何給定的上調的miRNA水平可以降低至少10%、至少20%、 至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至 少90%或至少95%。水平降低的上調的miRNA的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少 4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少 35。上調的miRNA的數目降低和水平降低的任何組合可以表明效力。如果在治療劑施用之 后所獲得的樣品中下調的miRNA的數目或水平(或它們的任何組合)相對于治療劑施用之 前所獲得的樣品降低，則可以指示表明治療劑效力的變化。下調的miRNA的數目可以降低 至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、或至少10。任何給定 的下調的miRNA水平可以增加至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %。水平增加的下調 的miRNA的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、 至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。下調的miRNA的數目降低和水平增 加的任何組合可以表明效力。
可以在第一次施用藥劑之前(即患者對藥劑是幼稚的)從患者獲得樣品。可選擇 地，從患者獲得樣品可以在治療過程中施用藥劑之后進行。例如，可在監測步驟開始之前已 經施用藥劑。在施用藥劑之后可以從患者獲得另外的樣品并比較樣品中的I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物。樣品可以為相同類型或不同類型的，例如，獲得的各樣品可以為血樣，或 獲得的各樣品可以為血清樣品。各樣品中所檢測的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物可 以是相同的、可以基本上重疊或可以相似。樣品可以在施用治療劑之前和之后的任何時間獲得。在施用治療劑之后獲得的樣 品可以在施用治療劑之后至少2天、至少3天、至少4天、至少5天、至少6天、至少7天、至 少8天、至少9天、至少10天、至少12天或至少14天獲得。在施用治療劑之后獲得的樣品 可以在施用治療劑之后至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少7周或至 少8周獲得。在施用治療劑之后獲得的樣品可以在施用治療劑之后至少2個月、至少3個 月、至少4個月、至少5個月或至少6個月獲得。可以在施用治療劑之后從患者獲得另外的樣品。可以從患者獲得至少2份、至少3 份、至少4份、至少5份、至少6份、至少7份、至少8份、至少9份、至少10份、至少12份、至 少15份、至少20份、至少25份樣品以監測疾病或疾患隨時間的進展或消退。可以在以下 的時間段內監測疾病進展至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、 至少7周、至少2個月、至少3個月、至少4個月、至少5個月、至少6個月、至少1年、至少 2年、至少3年、至少4年、至少5年、至少10年或患者的終生。另外的樣品可以定期從患 者獲得，如每月一次、每兩月一次、每季度一次、每年兩次或每年一次的間隔。可以在施用藥 劑之后定期從患者獲得樣品。例如，可以在下列時間從患者獲得樣品每次施用藥劑之后一 周、每次施用藥劑之后兩周、或每次施用藥劑之后三周或每次施用藥劑之后一個月、或每次 施用藥劑之后兩個月。可選擇地，可以在每次施用藥劑之后從患者獲得多份樣品。可以類似地在不存在藥劑施用時監測患者的疾病進展。可以定期從患有疾病或 疾患的患者獲得樣品。如果較晚獲得的樣品中的miRNA數目相對于較早獲得的樣品中的 miRNA數目增加，則可以確定疾病進展。miRNA的數目可以增加至少1、至少2、至少3、至少 4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、或至少10。如果任何給定的上調的miRNA的水平 增加了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%，則可以確定疾病進展。如果任何給定 的下調的miRNA的水平降低了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，則可以確定疾病 進展。水平增加的上調的miRNA的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、 至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平降低的 下調的miRNA的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至 少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。上調的miRNA的數目增加和水 平增加的任何組合可以表明疾病進展。可選擇地，或與之組合，下調類型的miRNA的數目降 低和水平降低的組合可以表明疾病進展。還可以在患有疾病或病患而未用藥劑治療的患者 中鑒定疾病消退。在這種情況下，如果較晚獲得的樣品中的miRNA數目相對于較早獲得的 樣品的miRNA數目降低，則可以鑒定疾病消退。miRNA的數目可以降低至少1、至少2、至少 3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、或至少10。如果任何給定的上調的miRNA的水平降低了至少10 %、至少20 %、至少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少50 %、 至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，則可以鑒定疾病消退。如果任何給 定的下調的miRNA的水平增加了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至 少40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，則可以確定疾 病消退。水平降低的上調的miRNA的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至 少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平增 加的下調的miRNA的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少 8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。可以通過在任何時間段以 任何間隔獲得樣品來監測疾病進展或疾病消退。可以通過在以下的時程內獲得樣品來監測 疾病進展或疾病消退至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少 7周、至少2月、至少3月、至少4月、至少5月、至少6月、至少1年、至少2年、至少3年、至 少4年、至少5年、至少10年或患者的終生。可以通過至少每月一次、每兩月一次、每季度 一次、每年兩次或每年一次獲得樣品來監測疾病進展或疾病消退。不需要以嚴格的間隔獲 得樣品。樣品中的變化可以指導疾病或疾患的治療策略。治療策略可以是具體治療劑的給 藥或可以是移除或添加施用給患者的特定治療劑。本發明還涵蓋采用IFN α誘導性PD標志物來治療、診斷、預測和監測肌炎的方法。 這些IFNa誘導性PD標志物還可以用于指導肌炎患者或肌炎疾病模型的給藥和治療。I型IFN或IFN α誘導性PD標志物表達譜可以包含相對于對照(如健康人、患者 或患者的非疾病組織的樣品)的任何I型IFN或IFN α誘導性PD標志物表達譜基因或基 因的組的上調或下調。所述基因或基因的組可以包括任何至少2種、任何至少3種、任何至 少4種、任何至少5種、任何至少6種、任何至少7種、任何至少8種、任何至少9種、任何至 少10種、任何至少11種、任何至少12種、任何至少13種、任何至少14種、任何至少15種、 任何至少16種、任何至少17種、任何至少18種、任何至少19種、任何至少20種、任何至少 21種、任何至少22種、任何至少23種、任何至少24種、任何至少25種、任何至少26種、任 何至少27種、任何至少28種、任何至少29種、任何至少30種、任何至少40種、任何至少50 種基因、任何至少75種基因、任何至少100種基因或任何至少150種基因。表達譜中的IFN α誘導性PD標志物可以包括至少下列基因EPSTI 1、HERC5、 IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITU IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2、0AS3、 RSAD2、RTP4、SIGLEC1、USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖 表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI27、SIGLEC1、 RSAD2、IFI6、IFI44L、IFI44、USP18、IFIT2、SAMD9L、BIRC4BP、DNAPTP6、0AS3、LY6E、IFITl、 LIPA、L0C129607、ISG15、PARP14, MX1、0AS2、OASL, CCL2、HERC5、OASl。在這種表達譜中的 IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFIT1、IFIT3、IRF7、 IFI6、IL6ST、IRF2、LY6E、MARCKS, MXl、MX2、OASl、EIF2AK2、ISG15、STAT2、0AS3、IFI44、 IFI44L、HERC5、RAB8B、LILRA5、RSAD2 和 FCH02。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標志 物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。
27
表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFl、RTP4、SIGLEC1和EPSTI1。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物 還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFU RTP4、SIGLEC1、EPSTIl 和 RSAD2。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因RTP4、RSAD2、HERC5、 SIGLEC1、USP18、LY6E、ETV7、SERPING1、IFIT3、0AS1、HSXIAPAF1、G1P3、MXU 0AS3、IFI27、 DNAPTP6、LAMP3、EPSTI1、IFI44、0AS2、IFIT2 禾Π ISG15。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因LAMP3、SIGLEC1、 DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、SERPING1、HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、 IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、LY6E、ISG15 和 IFI27。在這種表達譜中的 IFNa 誘導性 PD 標 志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因DNAPTP6、EPSTIU HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITU IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2、 0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SIGLEC1和USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物 還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、 IFIT2、ZC3HAV1、ETV6、DAPPl、IL1RN、CEACAMU OASU IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、 EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL, GBPl和MXl。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物 還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MXl、IFITl、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1 和 USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至 少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1、IFITl、HERC5、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTIl、IFIT3、0AS2、LY6E、 SIGLEC1和USP18。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381 中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1和IFIT1。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖 表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L和IFI27。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381 中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL、GBPl 和 MXl0在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少 一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI27、RSAD2、 IFI44L、IFI44、0AS1、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、MXl、ESPTI1、IFIT3 和 IFI6。在這種表達 譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI44L、RSAD2、IFI27 和IFI44。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的 至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少基因IFI44L和RSAD2。在這種 表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少基因IFI44L。在這種表達譜中 的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少基因RSAD2。在這種表達譜中的 IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包括至少下列基因IFI27、IL-121Rβ 2、 IL-15Ra、IL-15、細胞因子信號傳導阻抑物 1 (SOCSl)、janus 激酶 2、CXCLll (T-TAC), TNFSF13B (BAFF)、TRAF 型結構域 1 (TRAFDl)、SERPING1、CD274 (PDl-L)、吲哚胺 2，3 雙加氧 酶(INDO)、淋巴細胞激活基因3 (LAG3)和胱天蛋白酶5。在這種表達譜中的IFNa誘導性 PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。IFNα誘導性PD標志物或PD標志物譜可以包含如下的任何至少5種基因，例如 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFI6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASl、IFI44L ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、ISG15 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、LAMP3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OAS 1、OASL ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 0ASUIFI44 ;或MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、0AS3 ；或 MXl、 LLY6E、IFI27、OASU USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 0ASUHERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、DNAPTP6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、L0C129607 ； 或 MX1、LLY6E、IFI27、OASl、EPSTIl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、BIRC4BP ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、OASU SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI44L ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU ISG15 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、LAMP3 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、OASL ；或 LLY6E、IFI27、 OASU IFITU RSAD2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI44 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、USP18 ；或 LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITl、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、HERC5 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITU DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、 EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、BIRC4BP ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、0ASl、IFITl、通過探針229450_at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 IFI27、 OASl、IFITl、IFI6、LAMP3 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、0ASL ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 RSAD2 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFIT2 ；或 IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、0AS3 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、USP18 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 SIGLEC1 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、HERC5 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、DNAPTP6 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、L0C129607 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、EPSTI1 ；或 IFI27、0AS1、 IFIT1、IFI6、BIRC4BP ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、SIGLEC1 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 通過探針229450_at檢測的基因；或IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、通過探針235276_at檢測的 基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、LAMP3 ；或 0AS1、 IFITU IFI6、IFI44L、OASL ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 0AS1、IFITU IFI6、 IFI44L、IFI44 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、0AS3 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、USP18 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、DNAPTP6 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 L0C129607 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L, EPSTIl ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、BIRC4BP ； 或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、通過探針 229450_ at檢測的基因；或0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、通過探針235276_at檢測的基因；或IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、0ASL ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、RSAD2 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、IFIT2 或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、0AS3 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、USP18 ；或 IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、HERC5 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、DNAPTP6 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 EPSTIl ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通過探 針229450_at檢測的基因；或IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針235276_at檢測的基 因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探針 229450_at 檢測 的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、SIGLEC1；或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、USP18；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFI44 ； 或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、RSAD2；或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL；或IFI44L、 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、IFI44 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, IFIT2 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, 0AS3 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, USP18 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、SIGLEC1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、HERC5 ；或 IFI44L、 ISG15、LAMP3、0ASL、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFIT2 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、0AS3 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、SIGLEC1 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、DNAPTP6 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、EPSTI1 ； 或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通過探針 229450_ at檢測的基因；或ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、通過探針235276_at檢測的基因；或LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、 IFI44、USP18 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、SIGLEC1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、HERC5 ； 或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、EPSTI1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、BIRC4BP ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、通過探針 229450_at 檢測的基因；或1^1^3、(^51^、1 402、正144、通過探針235276_3{ 檢測的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、USP18 ；或 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5 ；或 0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、EPSTIl ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通 過探針229450_at檢測的基因；或OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針235276_at檢測 的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ； 或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLEC1 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、L0C129607 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 229450_at 檢測的基 因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECUHERC5 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 L0C129607 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、EPSTIl ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 DNAPTP6 ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 EPSTIl ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過探 針229450_at檢測的基因；或0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過探針235276_at檢測的基 因；或 USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 EPST11 ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 通過探針 229450_at 檢測的基因；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1 ；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、BIRC4BP ；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 229450_at 檢測的 基因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 235276_at 檢 測的基因；或DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通過探針229450_at檢測的基因；或 DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、BIRC4BP、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針229450_at檢測的基因、通過探針235276_at檢測的基因。在這 種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少一種或多 種基因。 表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包含如下的任何至少6種基因，例如 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI44L ；或 MX1、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、ISG15 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、LAMP3 ；或 MXl、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、OASL ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、OASl、IFITl、IFI44 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFIT2 ；或 MXl、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU HERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASl、IFITl、DNAPTP6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、L0C129607 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITl、EPSTIl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、BIRC4BP ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU 通過探針 235276_at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、ISG15 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、LAMP3 ；或 LLY6E、 IFI27、OASl、IFITl、IFI6、0ASL;或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、RSAD2 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFIT2 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、USP18 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、HERC5 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、BIRC4BP ； 或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L, LAMP3 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 OASL ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 IFI44 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 0AS3 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、USP18 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 SIGLEC1 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 DNAPTP6 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、L0C129607 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、EPSTIl ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、BIRC4BP ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、通過 探針 235276_at 檢測的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、OASL ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、RSAD2 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFIT2 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、0AS3 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、USP18 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、HERC5 ；或 0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、DNAPTP6 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 0AS1、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、EPSTIl ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、RSAD2 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 IFI44；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFIT2；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、0AS3 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、USP18 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ；或 IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFI44 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, 0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, USP18 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, SIGLEC1 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探針 229450_at 檢測的基因；或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探針235276_at檢測的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFIT2 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、0AS3 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、USP18 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、SIGLEC1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、 HERC5 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、EPSTI1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通過探針 229450_at 檢測的 基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 ISG15、 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、SIGLEC1 ；或 ISG15、 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ；或 ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、通過探 針 229450_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通過探針 235276_at 檢測 的基因；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 USP18 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、HERC5 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、 IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、EPSTIl ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針 229450_ at檢測的基因；或LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針235276_at檢測的基因；或 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ；或 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTIl ； 或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通過
33探針 229450_at 檢測的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通過探針 235276_at 檢 測的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、HERC5 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 229450_at 檢測的 基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、L0C129607 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 EPSTIl ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLEC1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通過 探針 235276_at 檢測的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6 ；或 IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、EPSTIl ； 或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過探針 235276_ at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 0AS3、USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5、DNAPTP6、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 USP18、SIGLECU HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、BIRC4BP ；或 USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 SIGLEC1、HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通 過探針 229450_at 檢測的基因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針229450_ at 檢測的基因；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針 235276_at 檢測 的基因；或DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針229450_at檢測的基因、通過探 針235276_at檢測的基因。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表 235-381中所列的至少一種或多種基因。 表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包含如下的任何至少7種基因，例如 MXU LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、 ISG15 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、LAMP3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、 IFI6、0ASL ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFIT1、IFI6、IFI44 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFIT2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU IFI6、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、USP18 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、HERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、DNAPTP6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、 L0C129607 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、EPSTIl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITU IFI6、BIRC4BP ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、通過探針 229450_at 檢 測的基因；或MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、通過探針235276_at檢測的基因；或LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L, LAMP3 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、IFI44L、0ASL ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、 IFIT1、IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、IFI44 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、0AS 1、IFITU IFI6、IFI44L、USP18 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、BIRC4BP ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、0ASL ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、RSAD2 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 IFIT2 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、0AS3 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、USP18 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、HERC5 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 DNAPTP6 ；或 IFI27、0AS 1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、EPSTIl ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、RSAD2 ；或 OASl、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFI44 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 IFIT2 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0AS3 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、USP18 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、SIGLEC1 ；或 0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ； 或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ；或 OASl、 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFI44 ；或 IFITl、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFIT2；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL,0AS3 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, USP18 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、HERC5 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, DNAPTP6 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, L0C129607 ；或 IFITUIFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, BIRC4BP ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探針 229450_at 檢測的 基因；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、USP18 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、SIGLEC1 ；或 IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、 DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、BIRC4BP ；或 IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、USP18 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 SIGLEC1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、HERC5 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、EPSTIl ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通過探針 229450_at 檢測 的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通過探針 235276_at 檢測的基因； 或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 LAMP3、OASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTI1 ； 或1^1^3、(^51^、1 六02、正144、正叮2、(^53、811^48卩；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通過探 針 235276_at 檢測的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1 ；或 0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、EPSTI1 ；或 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 OASL、 1 八02、正144、正叮2、(^53川5 18、通過探針229450_3{檢測的基因；或 0ASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、EPSTIl ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、BIRC4BP ；或正144、正叮2、(^53川5 18、5161^(1、!^1^5、通過探針229450_3{檢測的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ； 或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 229450_at 檢測的基因； 或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 235276_at 檢測的基因； 或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通過探針 229450_at 檢測的基 因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針 235276_at 檢測的 基因；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通過探針 229450_at 檢測的基因、 通過探針235276_at檢測的基因。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括 在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。 表達譜中的IFNci誘導性PD標志物可以包含如下的任何至少8種基因，例如； MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、LAMP3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OAS 1、IFITU IFI6、IFI44L、OASL ；或 MX1、 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、IFI44 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 MXU LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 DNAPTP6 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、L0C129607 ；或 MXl、LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、EPSTIl ；或 MXU LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、BIRC4BP ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、通過探針 229450_at 檢 測的基因；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通過探針 235276_at 檢測的 基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、OASL ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 RSAD2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、USP18 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 HERC5 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通過探針 235276_at 檢測的基因；orIFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、RSAD2 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFI44 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFIT2 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、0AS3 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、USP18 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、SIGLEC1 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探 針 229450_at 檢測的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ； 或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, IFI44 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFIT2 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、0AS3 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、0ASL、USP18 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、SIGLEC1 ；或 OASl、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, HERC5 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, DNAPTP6 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, L0C129607 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, BIRC4BP ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探 針 229450_at 檢測的基因；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFIT2 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、0AS3 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、USP18 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、HERC5 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、DNAPTP6 ； 或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、 BIRC4BP ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、通過探針 229450_at 檢測的基 因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通過探針 235276_at 檢測的基因； 或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、USP18 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、SIGLEC1 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ； 或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通過探針 229450_at 檢測 的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通過探針 235276_at 檢測 的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、USP18 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、SIGLEC1 ；或IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、EPSTIl ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 SIGLEC1 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 通過探針 235276_at 檢測的基因；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLEC1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 L0C129607 ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 LAMP3、0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 通過探針 235276_at 檢測的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU EPSTIl ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ； 或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 229450_at 檢測的基因； 或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過探針 229450_at 檢測 的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ； 或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通過探針 229450_at 檢測的基因； 或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通過探針 235276_at 檢測的基 因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、BIRC4BP、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針 235276_at 檢測的基因； 或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通過探針 229450_at 檢測的基 因、通過探針235276_at檢測的基因。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包 括在圖表235-381中所列的至少一種或多種基因。 表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包含如下的任何至少12種基因，例如 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44 ；或 MXl、 LLY6E、IFI27、OAS 1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFIT2 ；或 MX1、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、HERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、DNAPTP6 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、L0C129607 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、EPSTIl ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、BIRC4BP ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 MX1、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、通過探針 235276_ at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、USP18 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、HERC5 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、BIRC4BP ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 15615、1^1^3、(^51^、1 402、正144、通過探針 235276_3{檢測的基因；或 IFI27、0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、OAS ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、USP18 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、EPSTIl ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、EPSTIl ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 229450_at 檢測的基因； 或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、EPSTI1 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通過 探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU HERC5、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、BIRC4BP ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通過探針 229450_at 檢 測的基因；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、BIRC4BP ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通過探針 229450_at 檢測的 基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、 EPSTI1、通過探針 235276_at 檢測的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、LOCl29607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針 229450_at 檢測的基因；或 RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過 探針 229450_at 檢測的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通過探針229450at檢測的基因通過探針235276_at檢測的基 因。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至少 一種或多種基因。表達譜中的IFN α誘導性PD標志物可以包含下列蛋白的任何一種或多種的血清 蛋白水平的改變脂連蛋白、甲胎蛋白、載脂蛋白CIII、β-2微球蛋白、癌抗原125、癌抗 原19-9、嗜酸細胞活化趨化因子、FABP、因子VII、鐵蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、IL-18、 IL-1 ra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌紅蛋白、SGOT、組織因子、TIMP-1、TNF RII、TNF- α、VCAM-1、 vffF, BDNK、補體 3、CD40 配體、EGF, ENA-78、EN-RAGE、IGF-I、MDC、髓過氧化物酶、RANTES 或 血小板生成素。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中 所列的至少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包含下列蛋白的任何一種或多種的血 清蛋白水平的改變脂連蛋白、甲胎蛋白、載脂蛋白CHI、β _2微球蛋白、癌抗原125、癌抗 原19-9、嗜酸細胞活化趨化因子、FABP、因子VII、鐵蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、IL-18、 IL-lra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌紅蛋白、SGOT、組織因子、TIMP-1、TNF RII、TNF_a、VCAM-1 或vWF。在這種表達譜中的IFNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表235-381中所列的至 少一種或多種基因。表達譜中的IFNa誘導性PD標志物可以包含下列蛋白的任何一種或多種的血清 蛋白水平的改變BDNK、補體3、CD40配體、EGF、ENA-78、EN-RAGE, IGF-I、MDC、髓過氧化物 酶、RANTES或血小板生成素。在這種表達譜中的FNa誘導性PD標志物還可以包括在圖表 235-381中所列的至少一種或多種基因。IFNa-誘導性PD標志物表達譜還可以包含在暴露于非基線IFNa水平的細胞 中表達或活性下調的基因。所述基因可以包括下列的任何一種或多種SLC4A1、PRSS33、 FCER1A、BACH2、KLRB1、D4S234E、T 細胞受體 α 基因座/T 細胞受體 δ 基因座、FEZ1、AFF3、 CD160、ABCBl、PTCHl、0R2W3、IGHD, NOG、NR3C2、TNSl、PDZKlIPl、SH2D1B、STRBP、ZMYNDl 1、 TMODl、FCRLA、DKFZp761P0423、EPB42、NR6Al、L0C341333、MS4Al、IGHM、SIGLECP3、KIR2DS2、 PKIA、BLRl、C5orf4、MYLK、L0C283663、MADlLl、CXCL5、D4S234E、FCRLA、KRTl、cl6orf74、
42ABCB4 或 GPRASP1。PD標志物可以為相對于那些健康的受治療者或未受折磨的患者組織上調的或下 調的。患者的表達譜中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的上調或下調可以是與來自 對照的樣品(可以是來自患者的非疾病組織(例如銀屑病患者的未損害的皮膚)或來自未 受疾病或疾患折磨的健康人的樣品)相比的任何程度。上調或下調程度可以是對照或對照 樣品的至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至 少200 %、或至少300 %、或至少400 %、或至少500 %。包含I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜的患者還可以包含任何數目的 IFNa或I型IFN亞型的表達上調。IFNa或I型IFN亞型可以包括任何大于一種、大于 兩種、大于三種、大于四種、大于五種、大于六種、大于七種、大于八種、大于九種或大于十種 的 IFNa 或 I 型 IFN 亞型。這些亞型可以包括IFN a 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、 IFNa 7、IFN a 8、IFN a 10、IFN a 14、IFN a 17、IFN a 21、IFN β 或 IFNco。患者可以包含 IFN 亞型IFNa 1、IFNa 2、IFNa 8和IFNa 14的表達上調。表達上調可以是對照的至少10%、 至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至 少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至少200%、或至少 300 %、或至少400 %、或至少500 %。包含I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜的患者還可以包含為IFNARl或 IFNAR2 或二者的 IFNa 受體、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNy 受體(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和IFNGR2 二者)的表達上調。患者可以被簡單地鑒定為包含為IFNARl或IFNAR2或二者 的 IFNa 受體、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNY 受體(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和 IFNGR2 二 者)的表達上調的患者。患者還可以包括或可選擇地包括血清中蛋白水平的改變。患者可以具有諸如以下 的蛋白的血清水平增加脂連蛋白、甲胎蛋白、載脂蛋白CIII、β-2微球蛋白、癌抗原125、 癌抗原19-9、嗜酸細胞活化趨化因子、FABP、因子VII、鐵蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、 IL-18、IL-lra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌紅蛋白、SG0T、組織因子、TIMP-1、TNF RII、TNF-a、 VCAM-I或vWF。患者在血清中可以具有血清水平增加的任何1種、2種、3種、4種、5種、6 種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、1314種、15種、16種、17種、18種、19種、20種、21種、 o22種、23種、24種、25種或26種的這些蛋白。增加的水平可以是對照如健康受治療者的至 少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少 70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至少200%、 或至少300%、或至少400%、或至少500%。變化可以是諸如以下的蛋白的血清水平降低 BDNK、補體 3、CD40 配體、EGF、ENA-78、EN-RAGE, IGF-I、MDC、髓過氧化物酶、RANTES 或血小 板生成素。患者可以具有血清水平降低的任何1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9 種、10或11種的這些蛋白。降低的水平可以為對照如健康受治療者的至少10%、至少15%、 至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至 少80%、至少90%或至少100%。PD標志物譜可以包含這些血清水平增加或降低的蛋白的 一種或多種。患者還可以包含結合下列自身抗原的任一種的自身抗體(a)抗黏液病毒(流感病毒)1，干擾素誘導蛋白p78;(b)SUrfeit 5，轉錄物變體c;(c)蛋白酶體(前體，巨蛋白 因子)激活物亞基3 (PA28 γ ；Ki) transc ； (d)視黃酸受體α ； (e) IOkDa熱休克蛋白1 (伴 侶蛋白10) ；f)原肌球蛋白3 ;(g)普列克底物蛋白同源性樣結構域，家族A，成員1 ;(h)細 胞骨架相關蛋白1 ;(i)舍格倫綜合征抗原A2(60kDa，核糖核蛋白自身抗原SS-A/Ro) ； (j) NADH脫氫酶(泛醌)1，α/β亞復合體l，8kDa ； (k)NudE核分布基因E同系物1 (構巢曲 霉)；⑴MutL同系物1，2型非息肉性結腸癌(大腸桿菌)；(m)富亮氨酸重復(FLII中)相 互作用蛋白2; (η)原肌球蛋白1(a) ； (ο)痙攣性截癱20，spartin (Troyer綜合征)；(ρ)植 入前蛋白，轉錄物變體1 ;(r)線粒體核糖體蛋白L45 ;(s)Lin-28同系物(秀麗隱桿線蟲)； (t)90kDa熱休克蛋白1，α ； (u) dom-3同系物Z (秀麗隱桿線蟲)；(ν)動力蛋白，胞質的，輕 中間體多肽2 ； (w) Ras相關的C3肉毒桿菌毒素底物1 (rho家族，小GTP結合蛋白)；(χ)滑膜 肉瘤，X斷點2，轉錄物變體2 ;(y)膜突蛋白；(Z)homer同系物(果蠅)轉錄物變體1 ； (aa) GCN5廣泛控制的氨基酸合成5樣2 (酵母)；(bb)真核翻譯延伸因子1 Y ； (cc)真核翻譯延 伸因子IS ； (dd)DNA損傷誘導轉錄物3; (ee) CCAAT/增強子結合蛋白(C/EBP) γ ；以及在下 列臨時申請中所描述的任何其他自身抗原2007年5月3日提交的名稱為“Auto-antibody markers of autoimmune disease (自身免疫疾病的自身抗體標志物)”的臨時申請或在 2007 ip 11^6 Hil^W^^^J "Auto-antibody markers of autoimmune disease (自胃 免疫疾病的自身抗體標志物)”(例如但不限于在表2、4、5和9中所描述的那些)。患者可 以包含結合任何數目的這些自身抗原的自身抗體，例如任何至少2種、至少3種、至少4種、 至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少9至少10種、至少11種、至少12種、至少13 種、至少14種、至少15種、至少20種、至少25種。可以將治療劑施用給肌炎患者。治療劑可以為結合并調控I型IFN或IFNa活性 的任何分子。治療劑可以為小分子或生物藥劑。如果治療劑是小分子，則它可以是合成的 或由天然來源鑒定和分離的。
如果治療劑是生物藥劑，則它可以是對I型IFN或IFN α的任何亞型特異性的抗 體。例如，抗體可以是對下列的任一種特異性的JFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、 IFNa 7、IFNa 8、IFNa 10、IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN^ 或 IFNco。可選擇地，抗體 可以是對任兩種、任三種、任四種、任五種、任六種、任七種、任八種、任九種、任十種、任i^一 種、任十二種I型IFN或IFNa亞型特異性的。如果抗體是對大于一種的I型IFN亞型特 異性的，貝U抗體可以是對 IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8、IFNa 10 禾Π IFNa 21 特 異性的；或它可以是對IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8和IFNa 10特異性的；或 它可以是對IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8禾口 IFNa 21特異性的；或它可以是對 IFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 10 禾口 IFNa 21 特異性的。對 I 型 IFN 或 IFNa 特異 性的抗體包括MEDI-545、除MEDI-545之外的任何生物劑或抗體、2004年12月10日提交的 美國專利申請11/009，410和2005年6月20日提交的11/157,494中所描述的抗體、在美 國專利第7，087，726號中描述的9F3和其他抗體(實施例1和實施例2，在表3和表4中公 開的那些和/或在名為“材料保藏”(D印osit of Material)的表中第56列，第25_54行所 公開的那些)、NK-2 和 Y0K5/19 (W0 84/03105)、L0_22 (美國專利 4，902，618)、144 BS (美國 專利4，885，166)以及rai-UBI-2和mi-3(EP 119476)。調控IFNa活性的治療劑可以 中和IFNa活性。本領域的技術人員清楚地知道這種生物藥劑的制備和配制以及它們施用的方法。抗體可以是合成抗體、單克隆抗體、多克隆抗體、重組制備的抗體、細胞內抗體、多 特異性抗體(包括雙特異性抗體)、人抗體、人源化抗體、嵌合抗體、單鏈FV(SCFV)(包括雙 特異性scFv)、BiTE分子、單鏈抗體、Fab片段、F(ab，)片段、二硫鍵連接的Fv(SdFv)或上 述任何一種的表位結合片段。抗體可以是免疫球蛋白分子或免疫球蛋白分子的免疫活性部 分的任何一種。此外，抗體可以為任何同種型。例如，它可以是同種型IgGl、IgG2、IgG3或 IgG4的任何一種。抗體可以是包含可變區與恒定區的全長抗體或其抗原結合片段，如單鏈 抗體、或Fab或Fab’2片段。抗體還可以軛合或連接至治療劑上，如細胞毒素或放射性同位素 可以將除結合以調控IFNa活性的藥劑之外的第二藥劑施用給肌炎患者。第二藥 劑包括但不限于非類固醇類抗炎藥物，如布洛芬、萘普生、舒林酸、雙氯芬酸、吡羅昔康、酮 洛芬、二氟尼柳、萘丁美酮、依托度酸和奧沙普秦、吲哚美辛；抗瘧疾藥物，如羥氯喹；皮質 類固醇激素，如潑尼松、氫化可的松、甲潑尼龍和地塞米松；甲氨蝶呤；免疫抑制劑，如硫唑 嘌呤和環磷酰胺；以及生物藥劑，例如，靶向T細胞的生物藥劑，如阿法賽特和依法利珠單 抗，或靶向TNFa的生物藥劑，如恩利、類克和修美樂。藥劑的治療可以導致I型IFN或IFNa誘導譜的中和。藥劑的治療可以導致肌炎 的一種或多種癥狀或疾病的突發減少。癥狀可以包括肌無力、吞咽困難、呼吸困難、發熱、體 重減少、疼痛、肌肉壓痛、關節炎和疹。藥劑的治療可能導致改善的預測。藥劑的治療可以 導致患者較高的生活品質。藥劑的治療可以減輕共施用第二藥劑的需要或可以減少施用給 患者的第二藥劑的劑量。藥劑的治療可以減少患者的住院次數。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑可以中和I型IFN或IFNa活性譜。I 型IFN或IFNa誘導譜的中和可以是至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至少七種、 至少八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至少二十五種、至少三十種、至 少三十五種、至少四十種、至少四十五種或至少五十種被I型IFN或IFNa上調的基因的降 低。I型IFN或IFNa上調的基因可以是圖235-381中或如上所討論的任何基因的組。I型 IFN或IFNa誘導譜的中和是在任何I型IFN或IFNα誘導譜中至少一種、至少兩種、至少 三種、至少五種、至少七種、至少八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至 少二十五種、至少三十種、至少三十五種、至少四十種、至少四十五種或至少五十種上調的 基因的至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至 少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少45 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少 75%、至少80%或至少90%的降低。可選擇地，I型IFN或IFN α譜的中和可以指上調的I 型IFN或IFNa誘導基因表達的如下降低在對照樣品中的那些I型IFN或IFNa誘導基 因表達水平的最多50%、最多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、 最多15%、最多10%、最多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之內。如果結合并 調控I型IFN或IFNa活性的藥劑是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下列劑量中和I型 IFN 或 IFN α 譜0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、1 至 30mg/ kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。I型IFN或IFNa誘導譜的中和可以是至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、 至少七種、至少八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至少二十五種、至少三十種、至少三十五種、至少四十種、至少四十五種或至少五十種表達被I型IFN或IFNa 降低的基因的表達增加。表達被I型IFN或IFNa降低的基因可以是圖235-381中或如上 所討論的任何基因的組。I型IFN或IFNa誘導譜中下調的基因的中和可以是在任何I型 IFN或IFNa誘導譜譜中表達下調的至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至少七種、 至少八種、至少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至少二十五種基因中的任何基 因的至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至 少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少45 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少 75%、至少80%、或至少90%、或至少100%、或至少125%、或至少130%、或至少140%、 或至少150 %、或至少175 %、或至少200 %、或至少250 %、或至少300 %、或至少500 %的增 加。可選擇地，I型IFN或IFNα誘導譜的中和是指I型IFN或IFNα誘導基因表達的如下 增加在對照樣品中的那些I型IFN或IFNa誘導(下調的)基因表達水平的最多50%、最 多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多10%、最多 5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之內。如果結合并調控I型IFN或IFN α活性 的藥劑是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下列劑量中和I型IFN或IFN α譜0. 3至30mg/ kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、1 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、 10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑還可以或可選擇地中和一種或多種I 型IFN或IFNa亞型的表達。IFNa或I型IFN亞型可以包括任何大于一種、大于兩種、大 于三種、大于四種、大于五種、大于六種、大于七種、大于八種、大于九種或大于十種的IFNa 或 I 型 IFN 亞型。這些亞型可以包括 JFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 6、IFNa 7、 IFNa 8、IFNa 10、IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN3 或 IFNco。這些亞型可以包括 IFNa 1、 IFNa 2、IFNa 8禾口 IFNa 14的全部。可選擇地，這些亞型可以包括JFNa l、IFNa 2、IFNa 4、 IFNa 5、IFNa 8、IFNa 10、IFNa 21。IFNa或I型IFN亞型的中和可以是所述亞型的至少 一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至少七種、至少八種、至少十種的至少2%、至少3%、 至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少 35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%或至少 90%的降低。IFNa或I型IFN亞型的中和可以是下列范圍內的IFNa或I型IFN亞型基 因表達的降低對照樣品中的那些IFNa或I型IFN亞型表達水平的最多50%、最多45%、 最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多10%、最多5%、最 多4%、最多3%、最多2%或最多之內。如果結合并調控IFNa或I型IFN活性的藥劑 是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下列劑量中和IFNa或I型IFN亞型0. 3至30mg/kg、 0.3 M 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、1 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑還可以或可選擇地中和為IFNARl或 IFNAR2 或二者的 IFNa 受體、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNy 受體(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和IFNGR2 二者)的表達。為IFNARl或IFNAR2或二者的IFN α受體、或TNF α或IFN γ、或 IFNy受體(IFNGR1、IFNGR2或IFNGRl和IFNGR2 二者)的表達的中和可以是這些基因的 任何至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種或至少六種的至少2%、至少3%、至少4%、 至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少
4640%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%或至少90%的降 低。為 IFNARl 或 IFNAR2 的 IFNa 受體、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNy 受體(IFNGR1、IFNGR2 或IFNGRl和IFNGR2 二者)的表達的中和是對照樣品中這些基因表達水平的最多50%、最 多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多10%、最 多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多的表達降低。如果結合并調控I型IFN或 IFNa活性的藥劑是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下列劑量中和IFNa受體IFNARl或 IFNAR2、或 TNF α 或 IFN γ、或 IFN Y 受體 IFNGRl 或 IFNGR2 的表達0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kgU 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑還可以或可選擇地中和血清中蛋白水平 的改變，例如將血清水平下調的那些蛋白的水平增加至或將血清水平上調的那些蛋白的水 平降低至更接近對照受治療者的那些水平的水平。血清中諸如脂連蛋白、甲胎蛋白、載脂蛋 白CIII、i3-2微球蛋白、癌抗原125、癌抗原19-9、嗜酸細胞活化趨化因子、FABP、因子VII、 鐵蛋白、IL-10、IL-12p70、IL-16、IL-18、IL-lra、IL_3、MCP-1、MMP_3、肌紅蛋白、SG0T、組織 因子、TIMP-1、TNF RII、TNF- α、VCAM-1、vWF、BDNK、補體3、CD40 配體、EGF、ENA-78、EN-RAGE、 IGF-I、MDC、髓過氧化物酶、RANTES或血小板生成素的蛋白表達的中和可以通過使這些蛋白 的至少一種、至少兩種、至少三種、至少五種、至少六種、至少七種、至少八種、至少九種、至 少十種、至少十二種、至少十五種、至少二十種、至少25種的水平達到健康受治療者的血清 中所述蛋白水平的至少2 %、至少3 %、至少4%、至少5 %、至少7 %、至少8 %、至少10 %、至 少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少 70%、至少75%、至少80%或至少90%之內進行。如果結合并調控I型IFN或IFNa活性 的藥劑是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下列劑量中和如脂連蛋白、甲胎蛋白、載脂蛋白 CIII、β _2微球蛋白、癌抗原125、癌抗原19-9、嗜酸細胞活化趨化因子、FABP、因子VII、鐵 蛋白、IL-10、IL-12p70、IL-16, IL-18, IL-lra, IL_3、MCP-1、MMP_3、肌紅蛋白、SGOT、組織因 子、TIMP-1、TNF RII、TNF-a、VCAM-1、vWF、BDNK、補體 3、CD40 配體、EGF、ENA_78、EN-RAGE、 IGF-I、MDC、髓過氧化物酶、RANTES或血小板生成素的血清蛋白的水平0. 3至30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kgU 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑還可以或可選擇地降低結合下列自身 抗原的任何一種、任何至少2種、任何至少3種、任何至少4種、任何至少5種、任何至少6 種、任何至少7種、任何至少8種、任何至少9種、任何至少10種、任何至少15或任何至少 20種的自身抗體的數目和水平(a)抗黏液病毒(流感病毒)1，干擾素誘導蛋白p78;(b) surfeit 5，轉錄物變體c; (c)蛋白酶體(前體，巨蛋白因子)激活物亞基3(ΡΑ28γ ；Ki) transc ； (d)視黃酸受體α ； (e) IOkDa熱休克蛋白1(伴侶蛋白10) ；f)原肌球蛋白3 ； (g) 普列克底物蛋白同源性樣結構域，家族A，成員1 ;(h)細胞骨架相關蛋白1 ;(i)舍格倫綜 合征抗原A2(60kDa，核糖核蛋白自身抗原SS-A/Ro) ； (j) NADH脫氫酶(泛醌)1，α/β亞 復合體l，8kDa ； (k)NudE核分布基因E同系物1 (構巢曲霉)；(I)MutL同系物1，2型非息 肉性結腸癌(大腸桿菌)；(m)富亮氨酸重復(FLII中)相互作用蛋白2 ;(n)原肌球蛋白 1 ( α ) ； (ο)痙攣性截癱20，spartin (Troyer綜合征)；(ρ)植入前蛋白，轉錄物變體1 ； (r)線粒體核糖體蛋白L45 ;(s)Lin-28同系物(秀麗隱桿線蟲)；(t)90kDa熱休克蛋白1，α ； (u)dom-3同系物Z(秀麗隱桿線蟲)；(ν)動力蛋白，胞質的，輕中間體多肽2; (w)Ras相關 的C3肉毒桿菌毒素底物1 (rho家族，小GTP結合蛋白)；(χ)滑膜肉瘤，X斷點2，轉錄物變 體2 ； (y)膜突蛋白；(z)homer同系物(果蠅)轉錄物變體1 ； (aa)GCN5廣泛控制的氨基酸 合成5樣2(酵母)；(bb)真核翻譯延伸因子IY ； (cc)真核翻譯延伸因子1 δ ； (dd)DNA損 傷誘導轉錄物3; (ee) CCAAT/增強子結合蛋白(C/EBP) γ ；以及在2007年5月3日提交的 名稱為“Auto-antibody markers of autoimmune disease (自身免疫疾病的自身抗體標志 物)”的臨時申請申請中所描述的任何其他自身抗原；以及在2007年11月6日提交的名稱 ^j"Auto-antibody markers of autoimmune disease (自白勺自” 的臨時申請申請中所描述的任何其他自身抗原(例如但不限于在表2、4、5和9中所描述的 那些)。自身抗體水平的降低可以是存在的任何所述自身抗體的至少2%、至少3%、至少 4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至 少40 %、至少45 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少75 %、至少80 %或至少90 %的降 低。如果結合并調控I型IFN或IFNα活性的藥劑是生物藥劑如抗體，則該藥劑可以在下 列劑量降低自身抗體的數目或水平0. 3至30mg/kg、0. 3至10mg/kg、0. 3至3mg/kg、0. 3至 lmg/kgU 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 IOmg/ kg 或 1 至 5mg/kg。結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑可以不中和不包括在干擾素誘導性標記 或PD標志物譜中的基因的表達。監測疾病進展可以通過在施用如下的藥劑之前和之后獲得患者樣品來進行例 如，結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑、結合但不調控I型IFN或IFNa活性的藥劑 或可以包括或可以不包括結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑的組合。樣品包括任何 生物流體或組織，如全血、唾液、尿、滑液、骨髓、腦脊液、鼻分泌物、痰、羊水、支氣管肺泡灌 洗液、外周血單核細胞、總白細胞、淋巴結細胞、脾細胞、扁桃體細胞或皮膚。樣品可以通過 本領域內已知的任何方法獲得。獲得(在藥劑施用之前和之后)樣品中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達 譜。比較樣品中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜。比較可以是樣品中存在的 I型IFN或IFN α誘導性PD標志物的數目的比較或可以是樣品中存在的I型IFN或IFN α 誘導性PD標志物的數量的比較、或它們的任何組合。如果在治療劑施用之后所獲得的樣品 中上調的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目或水平(或它們的任何組合)相對于治 療劑施用之前所獲得的樣品降低，則可以指示表明治療劑效力的變化。上調的I型IFN或 IFNa誘導性PD標志物的數目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少 7、至少8、至少9或至少10。任何給定的上調的I型IFN或IFN α誘導性PD標志物的水平 可以降低至少10 %、至少20 %、至少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少50 %、至少 60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %。水平降低的上調的I型IFN或IFN α誘 導性PD標志物的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、 至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。上調的I型IFN或IFNa誘 導性PD標志物的數目降低和水平降低的任何組合可以表明效力。如果在治療劑施用之后 所獲得的樣品中下調的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目或水平(或它們的任何組合)相對于治療劑施用之前所獲得的樣品降低，則可以指示表明治療劑效力的變化。下 調的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至 少5、至少6、至少7、至少8、至少9或至少10。任何給定的下調的I型IFN或IFNa誘導 性PD標志物的水平可以增加至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %。水平增加的下調 的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、 至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。下調 的I型IFN或IFN α誘導性PD標志物的數目降低和水平增加的任何組合可以表明效力。可以在第一次施用藥劑之前(即患者對藥劑是幼稚的)從患者獲得樣品。可選擇 地，從患者獲得樣品可以在治療過程中施用藥劑之后進行。例如，可在監測步驟開始之前已 經施用藥劑。在施用藥劑之后可以從患者獲得另外的樣品并比較樣品中的I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物。樣品可以為相同類型或不同類型的，例如，獲得的各樣品可以為血樣，或 獲得的各樣品可以為血清樣品。各樣品中所檢測的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物可 以是相同的、可以基本上重疊或可以相似。樣品可以在施用治療劑之前和之后的任何時間獲得。在施用治療劑之后獲得的樣 品可以在施用治療劑之后至少2天、至少3天、至少4天、至少5天、至少6天、至少7天、至 少8天、至少9天、至少10天、至少12天或至少14天獲得。在施用治療劑之后獲得的樣品 可以在施用治療劑之后至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少7周、至少 8周獲得。在施用治療劑之后獲得的樣品可以在施用治療劑之后至少2個月、至少3個月、 至少4個月、至少5個月或至少6個月獲得。可以在施用治療劑之后從患者獲得另外的樣品。可以從患者獲得至少2份、至少3 份、至少4份、至少5份、至少6份、至少7份、至少8份、至少9份、至少10份、至少12份、至 少15份、至少20份、至少25份樣品以監測疾病或疾患隨時間的進展或消退。可以在以下 的時間段內監測疾病進展至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、 至少7周、至少2個月、至少3個月、至少4個月、至少5個月、至少6個月、至少1年、至少 2年、至少3年、至少4年、至少5年、至少10年或患者的終生。另外的樣品可以定期從患 者獲得，如每月一次、每兩月一次、每季度一次、每年兩次或每年一次的間隔。可以在施用藥 劑之后定期從患者獲得樣品。例如，可以在下列時間從患者獲得樣品每次施用藥劑之后一 周、每次施用藥劑之后兩周、或每次施用藥劑之后三周或每次施用藥劑之后一個月、或每次 施用藥劑之后兩個月。可選擇地，可以在施用治療劑之后或每次施用藥劑之后從患者獲得 多份樣品。可以類似地在不存在藥劑施用下監測患者的疾病進展。可以定期從患有疾病或疾 患的患者獲得樣品。如果較晚獲得的樣品中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物數目相 對于較早獲得的樣品中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物數目增加，則可以確定疾病進 展。I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目可以增加至少1、至少2、至少3、至少4、至 少5、至少6、至少7、至少8、至少9或至少10。如果任何給定的上調的I型IFN或IFNa誘 導性PD標志物的水平增加了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，則可以確定疾病 進展。如果任何給定的下調的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的水平降低了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至 少80 %、至少90 %或至少95 %，則可以確定疾病進展。水平增加的上調的I型IFN或IFN α 誘導性PD標志物的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、 至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平降低的下調的I型IFN 或IFNa誘導性PD標志物的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少
7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。上調的I型IFN 或IFNa誘導性PD標志物的數目增加和水平增加的任何組合可以表明疾病進展。可選擇 地，或與之組合，下調的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目降低和水平降低的組合 可以表明疾病進展。還可以在患有疾病或病患而未用藥劑治療的患者中鑒定疾病消退。在 這種情況下，如果較晚獲得的樣品中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物數目相對于較早 獲得的樣品中的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物數目降低，則可以鑒定疾病消退。I型 IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少 6、至少7、至少8、至少9或至少10。如果任何給定的上調的I型IFN或IFNa誘導性PD標 志物的水平降低了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少 50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，則可以鑒定疾病消退。如果 任何給定的下調的I型IFN或IFN α誘導性PD標志物的水平增加了至少10%、至少20%、 至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至 少90%或至少95%，則可以鑒定疾病消退。水平降低的上調的I型IFN或IFNa誘導性PD 標志物的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至 少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平增加的下調的I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物的數目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少
8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。可以通過在任何時間段以 任何間隔獲得樣品來監測疾病進展或疾病消退。可以通過在以下的時程內獲得樣品來監測 疾病進展或疾病消退至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少 7周、至少2月、至少3月、至少4月、至少5月、至少6月、至少1年、至少2年、至少3年、至 少4年、至少5年、至少10年或患者的終生。疾病進展或疾病消退可以通過至少每月一次、 每兩月一次、每季度一次、每年兩次或每年一次獲得樣品來監測。不需要以嚴格的間隔獲得 樣品。本發明還涵蓋試劑盒和探針。探針可以是檢測可被包括在IFNa -誘導性PD標志 物表達譜中的任何基因的任何表達或活性的任何分子。申請人:提供了 一組非限制性實施方式來描述本發明的一些方面。實施方式1. 一種治療患有I型IFN或IFN α介導的疾病或疾患的患者的方法，所述方法包 括施用結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑；其中所述患者包含差異調節的miRNA標志物譜；并且其中所述藥劑中和所述患者的所述差異調節的miRNA標志物譜。2.如實施方式1所述的方法，所述方法還包括檢測所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜的中和。
50
3.如實施方式1所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2 或4中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。4.如實施方式3所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2 或4中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。5.如實施方式4所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2 或4中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。6.如實施方式5所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2 或4中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。7.如實施方式6所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2 或4中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。8.如實施方式3所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。9.如實施方式1所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3 或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。10.如實施方式9所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3 或5中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。11.如實施方式10所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。12.如實施方式11所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。13.如實施方式12所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。14.如實施方式9所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。15.如實施方式3所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜還包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。16.如實施方式15所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。17.如實施方式16所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。18.如實施方式17所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。19.如實施方式18所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。20.如實施方式15所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述 至少一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。21.如實施方式1所述的方法，其中所述藥劑為生物藥劑。22.如實施方式21所述的方法，其中所述藥劑為抗體。23.如實施方式22所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。
24.如實施方式22所述的方法，其中所述抗體是對一種或多種I型IFN或IFNa 亞型特異性的但不是MEDI-545。25.如實施方式1所述的方法，其中所述藥劑的施用減輕所述疾病或疾患的一種 或多種癥狀。26.如實施方式22所述的方法其中所述抗體以大約0. 03和30mg/kg之間的劑量 施用。27.如實施方式26所述的方法，其中所述抗體以0. 3和3mg/kg之間的劑量施用。28.如實施方式27所述的方法，其中所述抗體以0.03和lmg/kg之間的劑量施用。29.如實施方式21中任一項所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調 節的miRNA標志物譜中和至少10%。30.如實施方式29所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少20%。31.如實施方式30所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少30%。32.如實施方式31所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少40%。33.如實施方式32所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少50%。34.如實施方式1所述的方法，其中所述疾病或疾患是狼瘡、銀屑病、血管炎、結節 病、舍格倫綜合征或肌炎之一。35.如實施方式34所述的方法，其中所述疾病或疾患是肌炎。36.如實施方式1所述的方法，其中所述患者還包含至少IFNa亞型1、2、8和14 的表達或活性上調。37.如實施方式2所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者的 全血中檢測。38.如實施方式2所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者的 肌肉組織中檢測。39.如實施方式1所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜是強的或中等 的。40. 一種在需要其的患者中中和差異調節的miRNA標志物譜的方法，所述方法包 括給所述患者施用結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑；其中所述藥劑中和所述患者的所述差異調節的miRNA標志物譜。41.如實施方式40所述的方法，所述方法還包括檢測所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜的中和。42.如實施方式40所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。43.如實施方式42所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。
44.如實施方式43所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。45.如實施方式44所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。46.如實施方式45所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。47.如實施方式42所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。48.如實施方式40所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。49.如實施方式48所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。50.如實施方式49所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。51.如實施方式50所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。52.如實施方式51所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。53.如實施方式48所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。54.如實施方式42所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜還包含通過 表3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。55.如實施方式54所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。56.如實施方式55所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。57.如實施方式56所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。58.如實施方式57所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。59.如實施方式54所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述 至少一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。60.如實施方式40所述的方法，其中所述藥劑為生物藥劑。61.如實施方式60所述的方法，其中所述藥劑為抗體。62.如實施方式61所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。63.如實施方式61所述的方法，其中所述抗體是對一種或多種I型IFN或IFN α 亞型特異性的但不是MEDI-545。64.如實施方式40所述的方法，其中所述藥劑的施用減輕疾病或疾患的一種或多 種癥狀。
53
65.如實施方式61所述的方法其中所述抗體以大約0. 03和30mg/kg之間的劑量 施用。66.如實施方式65所述的方法，其中所述抗體以0. 3和3mg/kg之間的劑量施用。67.如實施方式66所述的方法，其中所述抗體以0.03和lmg/kg之間的劑量施用。68.如實施方式40所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少10%。69.如實施方式68所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少20%。70.如實施方式69所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少30%。71.如實施方式70所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少40%。72.如實施方式71所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少50%。73.如實施方式40所述的方法，其中所述患者已被診斷為患有狼瘡、銀屑病、血管 炎、結節病、舍格倫綜合征或肌炎之一。74.如實施方式73所述的方法，其中所述患者已被診斷為患有肌炎。75.如實施方式40所述的方法，其中所述患者還包含至少IFNa亞型1、2、8和14 的表達或活性上調。76.如實施方式41所示的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者 的全血中檢測。77.如實施方式41所示的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者 的肌肉組織中檢測。78.如實施方式40所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜是強的或中等的。79. 一種監測或預測患者的炎性疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自患者的第一樣品中的第一差異調節的miRNA標志物譜。80.如實施方式79所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表2或4中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。81.如實施方式80所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表2或4中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。82.如實施方式81所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表2或4中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。83.如實施方式82所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表2或4中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。84.如實施方式83所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表2或4中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。85.如實施方式80所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。
86.如實施方式79所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。87.如實施方式86所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。88.如實施方式87所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。89.如實施方式88所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。90.如實施方式89所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通 過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。91.如實施方式86所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。92.如實施方式80所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜還包含 通過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。93.如實施方式92所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。94.如實施方式93所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。95.如實施方式94所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。96.如實施方式95所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。97.如實施方式92所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述 至少一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。98.如實施方式79所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜是強譜 并且所述患者預測為疾病進展。99.如實施方式98所述的方法，其中所述強譜包含健康個體的至少10倍的miRNA
差異表達。100.如實施方式98所述的方法，其中所述自身免疫疾病是肌炎。101.如實施方式79所述的方法，其中第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜是弱譜 并且所述患者預測為疾病消退。102.如實施方式101所述的方法，其中所述弱譜包含不超過健康個體的2倍的 miRNA差異表達。103.如實施方式98所述的方法，其中所述強譜指示醫師改變疾病治療。104.如實施方式79所述的方法，所述方法還包括獲得來自患者的第二樣品中的第二差異調節的miRNA標志物譜。其中第二譜相對于第一譜的miRNA標志物的數目或水平增加預測疾病進展；或其中第二譜相對于第一譜的miRNA標志物的數目或水平降低預測疾病消退。105. 一種監測接受治療劑治療的患者的自身免疫疾病或炎性疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自所述患者的第一樣品中的第一 miRNA譜。施用治療劑；獲得來自所述患者的第二樣品中的第二 miRNA譜；以及比較所述第一 miRNA譜和所述第二 miRNA譜，其中所述第一 miRNA譜與所述第二 miRNA譜之間的變化表明治療劑的效力水平。106.如實施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表2或4中所 標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。107.如實施方式106所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表2或4中所 標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。108.如實施方式107所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表2或4中所 標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。109.如實施方式108所述的方法，其中所述第一 miRNA標志物譜包含通過表2或 4中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。110.如實施方式109所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表2或4中所 標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。111.如實施方式106所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。112.如實施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。113.如實施方式112所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。114.如實施方式113所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。115.如實施方式114所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。116.如實施方式115所述的方法，其中所述第一 miRNA譜包含通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。117.如實施方式112所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。118.如實施方式106所述的方法，其中所述第一 miRNA譜還包含通過表3或5中 所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。119.如實施方式118所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。120.如實施方式119所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。121.如實施方式120所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所 標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。122.如實施方式121所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所
56標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。123.如實施方式118所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所 述至少一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。124.如實施方式105所述的方法，其中所述自身免疫疾病或炎性疾病是狼瘡、特 發性炎性肌炎、舍格倫綜合征、血管炎、結節病或銀屑病。125.如實施方式124所述的方法，其中所述自身免疫疾病是特發性炎性肌炎。126.如實施方式105所述的方法，其中所述治療劑為小分子或生物藥劑。127.如實施方式126所述的方法，其中所述生物藥劑為抗體。128.如實施方式127所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。129.如實施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA譜在施用所述治療劑之前 獲得。130.如實施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA譜在施用所述治療劑之時獲得。131.如實施方式105所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品是全血、肌 肉或血清。132.如實施方式105所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第三樣品 中的第三miRNA譜。133.如實施方式132所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第四樣品 中的第四miRNA譜。134.如實施方式133所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第五樣品 中的第五miRNA譜。135.如實施方式134所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第六樣品 中的第六miRNA譜。136.如實施方式105所述的方法，其中所述第二樣品在施用所述治療劑之后至少 一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。137.如實施方式132所述的方法，其中所述第三樣品在獲得所述第二樣品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。138.如實施方式133所述的方法，其中所述第四樣品在獲得所述第三樣品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。139.如實施方式134所述的方法，其中所述第五樣品在獲得所述第四樣品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。140.如實施方式105所述的方法，其中變化是所述患者的差異miRNA水平相對于 健康水平的降低。141.如實施方式105所述的方法，其中變化是所述患者的差異miRNA水平相對于 健康水平的增加。142.如實施方式141所述的方法，其中所述差異miRNA水平的增加指示疾病預后 不良(poor disease prognosis)或疾病將復發。143.如實施方式141所述的方法，其中所述患者的差異miRNA水平的增加指示所 述患者的治療的改變。
144. 一種治療肌炎患者的方法，所述方法包括施用結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑；其中所述患者包含I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表達譜；并且其中所述藥劑中和所述患者的所述I型IFN或IFNa -誘導性PD標志物表達譜。145.如實施方式144所述的方法，所述方法還包括檢測所述患者的所述I型IFN 或IFNa誘導性PD標志物表達譜的中和。146.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含下列基因的表達或活性上調MX1、LY6E、IFI27、0AS1 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2 和 IFI44。147.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物 表達譜包含下列基因的表達或活性上調LAMP3、SIGLEC1、DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、 SERPING1、HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、 LY6E、ISG15 和 IFI27。148.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含下列基因的表達或活性上調EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、 IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。149.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物 表達譜包含下列基因的表達或活性上調DNAPTP6、EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、 IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、 SIGLEC1和 USP18。150.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物 表達譜包含下列基因的表達或活性上調SAMD9L、IFI6、IFI44、IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、 IFI44L、HERC5、IFIT1、EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL、GBP1 和 MX1。151.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物 表達譜包含下列基因的表達或活性上調IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、 ISG15、LAMP3、0AS3、0AS1、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1和 USP18。152.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含下列基因的表達或活性上調IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L和IFI27。153.如實施方式144所述的方法，其中所述藥劑為生物藥劑。154.如實施方式153所述的方法，其中所述藥劑為抗體。155.如實施方式154所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。156.如實施方式154所述的方法，其中所述抗體是對一種或多種I型IFN或IFNa 亞型特異性的但不是MEDI-545。157.如實施方式144所述的方法，其中所述藥劑的施用減輕一種或多種肌炎癥 狀。158.如實施方式154所述的方法，其中所述抗體以大約0.03和30mg/kg之間的劑
量施用。159.如實施方式158所述的方法，其中所述抗體以0.3和3mg/kg之間的劑量施用。160.如實施方式159所述的方法，其中所述抗體以0. 03和lmg/kg之間的劑量施用。161.如實施方式153-155中任一項所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述 I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表達譜中和至少10%。162.如實施方式144所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或 IFN a誘導性PD標志物表達譜中和至少20%。163.如實施方式162所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或 IFN a誘導性PD標志物表達譜中和至少30%。164.如實施方式163所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或 IFN a誘導性PD標志物表達譜中和至少40 %。165.如實施方式164所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或 IFN a誘導性PD標志物表達譜中和至少50%。166.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含至少IFNa亞型1、2、8和14的表達或活性上調。167.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含PD標志物基因的轉錄物。168.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含由PD標志物基因所表達的多肽。169. 一種監測或預測患者的肌炎疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自患者的第一樣品中的第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜。170.如實施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a誘導性PD標志物表達譜是 強譜并且所述患者預測為肌炎疾病進展。171.如實施方式170所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的過量表達或活性(overexpression or activity) :EPSTI1、HERC5、IFI27、 IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、RSAD2、RTP4、 SIGLEC1和 USP18。172.如實施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a誘導性PD標志物表達譜是 弱譜并且所述患者預測為肌炎疾病消退。173.如實施方式169所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第二樣品中的第二 IFNa-誘導性PD標志物表達譜。其中第二表達譜相對于第一表達譜的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目 或水平增加預測肌炎疾病進展；或其中第二表達譜相對于第一表達譜的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目 或水平降低預測肌炎疾病消退。174. 一種監測接受治療劑治療的患者的肌炎疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自所述患者的第一樣品中的第一 IFNa-誘導性PD標志物表達譜；施用治療劑；獲得來自所述患者的第二樣品中的第二 IFNa-誘導性PD標志物表達譜；以及
比較所述第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜和所述第二 IFN a -誘導性PD標志 物表達譜。其中所述第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜與所述第二 IFN a -誘導性PD標志 物表達譜之間的變化表明治療劑的效力水平。175.如實施方式174所述的方法，其中包含表達或活性上調的基因譜的所述第一 I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜包含下列基因的過量表達或活性EPSTI1、HERC5、 IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、 RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。176.如實施方式174所述的方法，其中所述變化是基因的表達或活性上調水平的 降低。177.如實施方式174所述的方法，其中所述治療劑為小分子或生物藥劑。178.如實施方式177所述的方法，其中所述治療劑為結合并調控IFNa活性的生 物藥劑。179.如實施方式178所述的方法，其中所述生物藥劑為抗體。180.如實施方式179所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。181.如實施方式179所述的方法，其中所述抗體結合至少一種IFNa亞型但不是 MEDI-545。182.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜在 施用所述治療劑之前獲得。183.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜在 施用所述治療劑之時獲得。184.如實施方式174所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品是全血、肌 肉或血清。185.如實施方式174所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第三樣品 中的第三IFNa -誘導性PD標志物表達譜。186.如實施方式185所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第四樣品 中的第四IFNa -誘導性PD標志物表達譜。187.如實施方式186所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第五樣品 中的第五IFNa -誘導性PD標志物表達譜。188.如實施方式187所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第六樣品 中的第六IFNa -誘導性PD標志物表達譜。189.如實施方式174所述的方法，其中所述第二樣品在施用所述治療劑之后至少 一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。190.如實施方式185所述的方法，其中所述第三樣品在獲得所述第二樣品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。191.如186所述的方法，其中所述第四樣品在獲得所述第三樣品之后至少2天、至 少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。192.如實施方式187所述的方法，其中所述第五樣品在獲得所述第四樣品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
193.如實施方式174所述的方法，其中變化是基因的表達或活性上調的降低。194.如實施方式193所述的方法，其中所述降低為至少10%、至少20%、至少 25%、至少30%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少 80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%。195.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含下列基因的表達或活性上調IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、 0AS3、HERC5、MX1、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。196.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含下列基因的表達或活性上調IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。197.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表 達譜包含基因IFI44L和RSAD2的表達或活性上調。198.如實施方式169所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、0AS3、 HERC5、MX1、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。199.如實施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a誘導性PD標志物表達譜包 含下列基因的表達或活性上調IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。200.如實施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a誘導性PD標志物表達譜包 含基因IFI44L和RSAD2的表達或活性上調。201.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、0AS3、 HERC5、MX1、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。202.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜包 含下列基因的表達或活性上調IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。203.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa誘導性PD標志物表達譜包 含基因IFI44L和RSAD2的表達或活性上調。204.如實施方式1所述的方法，其中所述患者具有強的I型IFN或IFNa誘導性 基因標記評分。205.如實施方式1所述的方法，其中所述患者具有中等的I型IFN或IFN a誘導 性基因標記評分。206.如實施方式204所述的方法，其中強的評分大于或等于10。207.如實施方式205所述的方法，其中中等的評分大于或等于4但小于10。208.如實施方式35或74所述的方法，其中所述肌炎為DM或PM。209.如實施方式144所述的方法，其中所述肌炎患者為DM或PM患者。210.如實施方式144所述的方法，其中所述肌炎患者包含大于6的MITAX評分。211.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性基因標記評 分是強的。212.如實施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a誘導性基因標記評 分是中等的。213.如實施方式211所述的方法，其中所述評分大于或等于10。
61
214.如實施方式212所述的方法，其中所述評分大于或等于4但小于10。215.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜 包含強的I型IFN或IFNa誘導性基因標記評分。216.如實施方式215所述的方法，其中強的評分為大于或等于10的評分。217.如實施方式174所述的方法，其中所述第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜 包含中等的I型IFN或IFNa誘導性基因標記評分。218.如實施方式217所述的方法，其中中等的評分為大于或等于4但小于10的評 分。本說明書中所提到的所有的出版物、專利和專利申請均通過引用并入本說明書， 并入程度如同特定且單獨地指出各單獨的出版物、專利或專利申請通過引用并入本文。此申請為了所有的目的通過引用并入了 2006年12月6日提交的美國臨時申請 系列第60/873，008號、2007年4月16日提交的美國臨時申請系列第60/907，762號、2007 年5月3日提交的美國臨時申請系列第60/924，219號、2007年5月21日提交的美國臨時 申請系列第60/924，584號、2007年9月19日提交的美國臨時申請系列第60/960, 187號、 2007年11月5日提交的美國臨時申請系列第60/996，176號和2007年12月6日提交的 PCT申請第PCT/US2007/024947號。此申請還為了所有的目的通過引用并入了 2008年6月 20日提交的美國臨時申請系列第61/129，366號和2008年5月5日提交的PCT申請第PCT/ US2008/062646號。此申請還為了所有的目的通過引用并入了 2007年5月3日提交的美國 臨時申請系列第60/924，220號、2007年11月6日提交的名稱為“Auto-Antibody Markers of Autoimmune Disease (自身免疫疾病的自身抗體標志物)”的美國臨時申請(系列號 60/996，219)、2007 年 12 月 6 日提交的名稱為 “Auto-Antibody Markers of Autoimmune Disease (自身免疫疾病的自身抗體標志物)”的美國臨時申請(系列號60/996，820)以及 2008年5月5日提交的PCT申請第PCT/US2008/062639號。此外，此申請要求2008年2月8日提交的美國臨時申請系列第61/006，963號的 優先權，為了所有的目的通過引用將其并入本文。提供的下列實施例組僅為了示例的目的，并且本發明絕不能被理解為只限于這些 實施例。
實施例實施例la 在DM患者肌肉樣品中上調最明顯的基因大部分是IFNa /g誘導性的檢測了 DM肌肉樣品以測定在DM患者中上調最明顯的基因。總RNA 提取和微陣列處理使用 Qiagen RNeasy Fibrous Tissue Mini(Hilden, Germany)從PAXgene肌肉活組織檢查提取總RNA。以分光光度法測定RNA純度和濃度 (260/280 > 1. 9) o 使用 RNA 6000 Nano LabChip 在 Agilent 2100 生物分析儀上估計 RNA 的質量。使用Affymetrix GeneChip -輪式(One-Cycle) cDNA 合成試劑盒(One-Cycle cDNA Synthesis kit)和 Affymetrix GeneChip IVT 標記試劑盒完成由 2 ii g 總 RNA 產生 生物素標記的擴增的cRNA。以分光光度法測定cRNA產物的濃度和純度。將20微克的每種 生物素標記的cRNA片段化以便在Affymetrix人基因組U1332. 0+GeneChip 陣列上雜交。按照Affymetrix GeneChip 手冊中的概述制備用于雜交的片段化cRNA。在設置為45 口 的320型旋轉雜交爐中進行雜交過夜。所有的GeneChip 洗滌和染色步驟均在Affymetrix 450 型射流工作站(Fluidics station)上進行。在 Affymetrix GeneChip 掃描儀 3000 上 掃描陣列。用GeneChip操作軟件(GeneChip Operating Software (GCOS))工具進行數據 捕獲和初始陣列的質量估計。結果在DM患者的肌肉樣本中上調最明顯的基因大部分是IFNa/0誘導性的。 參見圖la，它提供了在DM患者肌肉樣品中上調最明顯的基因的列表，以及在DM患者肌肉樣 品中的那些基因相對于健康對照肌肉樣品的上調倍數。還參見圖lb，它提供了在DM和PM 患者的肌肉中IFNa/3誘導性基因標記評分的散點圖。實施例lb 在大多數DM或PM患者血樣中I型IFN誘導件基因的過表汰評定了 DM和PM患者的血液中I型IFM誘導性基因過表達的流行率(Prevalence) 和量值。患者和患者樣品在此研究中使用兩組患者。第一組包括來自單個醫院中心的24 名肌炎患者(15名患DM，9名患PM)，他們預期將被募集到外周WB樣品中的全基因組基因表 達與包括疾病活性的臨床特征之間的關聯的縱向調查研究中。在多達6年的期間內(此研 究的平均參與時間為1. 9年)收集共150次患者隨訪的臨床數據和80次患者隨訪的基因 表達數據。那些患者的臨床特征總結在下表6中。表6. 24名DM和PM患者的臨床特征
權利要求
1.一種治療患有I型IFN或IFNα介導的疾病或疾患的患者的方法，所述方法包括施用結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑；其中所述患者包含差異調節的miRNA標志物譜；并且其中所述藥劑中和所述患者的所述差異調節的miRNA標志物譜。
2.如權利要求1所述的方法，所述方法還包括檢測所述患者的所述差異調節的miRNA 標志物譜的中和。
3.如權利要求1所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或4 中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。
4.如權利要求3所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或4 中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。
5.如權利要求4所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或4 中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。
6.如權利要求5所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或4 中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。
7.如權利要求6所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或4 中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。
8.如權利要求3所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。
9.如權利要求1所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或5 中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
10.如權利要求9所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或5 中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
11.如權利要求10所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
12.如權利要求11所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
13.如權利要求12所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
14.如權利要求9所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。
15.如權利要求3所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜還包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
16.如權利要求15所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
17.如權利要求16所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
18.如權利要求17所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
19.如權利要求18所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
20.如權利要求15所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述至少 一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。
21.如權利要求1所述的方法，其中所述藥劑為生物藥劑。
22.如權利要求21所述的方法，其中所述藥劑為抗體。
23.如權利要求22所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。
24.如權利要求22所述的方法，其中所述抗體是對一種或多種I型IFN或IFNa亞型 特異性的但不是MEDI-545。
25.如權利要求1所述的方法，其中所述藥劑的施用減輕所述疾病或疾患的一種或多 種癥狀。
26.如權利要求22所述的方法其中所述抗體以大約0.03和30mg/kg之間的劑量施用。
27.如權利要求26所述的方法，其中所述抗體以0.3和3mg/kg之間的劑量施用。
28.如權利要求27所述的方法，其中所述抗體以0.03和lmg/kg之間的劑量施用。
29.如權利要求21中任一項所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜中和至少10%。
30.如權利要求29所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少20%。
31.如權利要求30所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少30%。
32.如權利要求31所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少40%。
33.如權利要求32所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少50%。
34.如權利要求1所述的方法，其中所述疾病或疾患是狼瘡、銀屑病、血管炎、結節病、 舍格倫綜合征或肌炎之一。
35.如權利要求34所述的方法，其中所述疾病或疾患是肌炎。
36.如權利要求1所述的方法，其中所述患者還包含至少IFNα亞型1、2、8和14的表 達或活性上調。
37.如權利要求2所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者的全血 中檢測。
38.如權利要求2所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者的肌肉 組織中檢測。
39.如權利要求1所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜是強的或中等的。
40.一種在需要其的患者中中和差異調節的miRNA標志物譜的方法，所述方法包括給所述患者施用結合并調控I型IFN或IFN α活性的藥劑；其中所述藥劑中和所述患者的所述差異調節的miRNA標志物譜。
41.如權利要求40所述的方法，所述方法還包括檢測所述患者的所述差異調節的 miRNA標志物譜的中和。
42.如權利要求40所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或4中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。
43.如權利要求42所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或 4中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。
44.如權利要求43所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或 4中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。
45.如權利要求44所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或 4中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。
46.如權利要求45所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表2或 4中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。
47.如權利要求42所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。
48.如權利要求40所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
49.如權利要求48所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
50.如權利要求49所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
51.如權利要求50所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
52.如權利要求51所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜包含通過表3或 5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
53.如權利要求48所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。
54.如權利要求42所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜還包含通過表3 或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
55.如權利要求54所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
56.如權利要求55所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
57.如權利要求56所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
58.如權利要求57所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
59.如權利要求54所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述至少 一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。
60.如權利要求40所述的方法，其中所述藥劑為生物藥劑。
61.如權利要求60所述的方法，其中所述藥劑為抗體。
62.如權利要求61所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。
63.如權利要求61所述的方法，其中所述抗體是對一種或多種I型IFN或IFNa亞型特異性的但不是MEDI-545。
64.如權利要求40所述的方法，其中所述藥劑的施用減輕疾病或疾患的一種或多種癥狀。
65.如權利要求61所述的方法其中所述抗體以大約0.03和30mg/kg之間的劑量施用。
66.如權利要求65所述的方法，其中所述抗體以0.3和3mg/kg之間的劑量施用。
67.如權利要求66所述的方法，其中所述抗體以0.03和lmg/kg之間的劑量施用。
68.如權利要求40所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少10%。
69.如權利要求68所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少20%。
70.如權利要求69所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少30%。
71.如權利要求70所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少40%。
72.如權利要求71所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述差異調節的miRNA標 志物譜中和至少50%。
73.如權利要求40所述的方法，其中所述患者已被診斷為患有狼瘡、銀屑病、血管炎、 結節病、舍格倫綜合征或肌炎之一。
74.如權利要求73所述的方法，其中所述患者已被診斷為患有肌炎。
75.如權利要求40所述的方法，其中所述患者還包含至少IFNα亞型1、2、8和14的表 達或活性上調。
76.如權利要求41所示的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者的全 血中檢測。
77.如權利要求41所示的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜在所述患者的肌 肉組織中檢測。
78.如權利要求40所述的方法，其中所述差異調節的miRNA標志物譜是強的或中等的。
79.—種監測或預測患者的炎性疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自患者的第一樣品中的第一差異調節的miRNA標志物譜。
80.如權利要求79所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。
81.如權利要求80所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。
82.如權利要求81所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。
83.如權利要求82所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。
84.如權利要求83所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 2或4中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。
85.如權利要求80所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物hsa-miR-34b-4373037 檢測。
86.如權利要求79所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
87.如權利要求86所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
88.如權利要求87所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
89.如權利要求88所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
90.如權利要求89所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜包含通過表 3或5中所標示的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
91.如權利要求86所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。
92.如權利要求80所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜還包含通過 表3或5中所標示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
93.如權利要求92所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
94.如權利要求93所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
95.如權利要求94所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
96.如權利要求95所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示的 檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
97.如權利要求92所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述至少 一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。
98.如權利要求79所述的方法，其中所述第一差異調節的miRNA標志物譜是強譜并且 所述患者預測為疾病進展。
99.如權利要求98所述的方法，其中所述強譜包含健康個體的至少10倍的miRNA差異 表達。
100.如權利要求98所述的方法，其中所述自身免疫疾病是肌炎。
101.如權利要求79所述的方法，其中第一IFN a誘導性PD標志物表達譜是弱譜并且 所述患者預測為疾病消退。
102.如權利要求101所述的方法，其中所述弱譜包含不超過健康個體的2倍的miRNA差異表達。
103.如權利要求98所述的方法，其中所述強譜指示醫師改變疾病治療。
104.如權利要求79所述的方法，所述方法還包括獲得來自患者的第二樣品中的第二差異調節的miRNA標志物譜。其中第二譜相對于第一譜的miRNA標志物的數目或水平增加預測疾病進展；或其中第二譜相對于第一譜的miRNA標志物的數目或水平降低預測疾病消退。
105.一種監測接受治療劑治療的患者的自身免疫疾病或炎性疾病進展的方法，所述方 法包括獲得來自所述患者的第一樣品中的第一 miRNA譜。施用治療劑；獲得來自所述患者的第二樣品中的第二 miRNA譜；以及比較所述第一 miRNA譜和所述第二 miRNA譜，其中所述第一 miRNA譜與所述第二 miRNA譜之間的變化表明治療劑的效力水平。
106.如權利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表2或4中所標示 的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性上調。
107.如權利要求106所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表2或4中所標示 的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性上調。
108.如權利要求107所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表2或4中所標示 的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性上調。
109.如權利要求108所述的方法，其中所述第一miRNA標志物譜包含通過表2或4中 所標示的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性上調。
110.如權利要求109所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表2或4中所標示 的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性上調。
111.如權利要求106所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-34b-4373037 檢測。
112.如權利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
113.如權利要求112所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
114.如權利要求113所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
115.如權利要求114所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
116.如權利要求115所述的方法，其中所述第一miRNA譜包含通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
117.如權利要求112所述的方法，其中所述至少一種miRNA通過檢測物 hsa-miR-1-4373161 檢測。
118.如權利要求106所述的方法，其中所述第一miRNA譜還包含通過表3或5中所標 示的檢測物檢測的至少一種miRNA的表達或活性下調。
119.如權利要求118所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少兩種miRNA的表達或活性下調。
120.如權利要求119所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少五種miRNA的表達或活性下調。
121.如權利要求120所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少十種miRNA的表達或活性下調。
122.如權利要求121所述的方法，其中所述表達或活性下調是通過表3或5中所標示 的檢測物檢測的至少十五種miRNA的表達或活性下調。
123.如權利要求118所述的方法，其中通過表3或5中所標示的檢測物檢測的所述至 少一種 miRNA 為 hsa-miR-1-4373161。
124.如權利要求105所述的方法，其中所述自身免疫疾病或炎性疾病是狼瘡、特發性 炎性肌炎、舍格倫綜合征、血管炎、結節病或銀屑病。
125.如權利要求124所述的方法，其中所述自身免疫疾病是特發性炎性肌炎。
126.如權利要求105所述的方法，其中所述治療劑為小分子或生物藥劑。
127.如權利要求126所述的方法，其中所述生物藥劑為抗體。
128.如權利要求127所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。
129.如權利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA譜在施用所述治療劑之前獲得。
130.如權利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA譜在施用所述治療劑之時獲得。
131.如權利要求105所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品是全血、肌肉或 血清。
132.如權利要求105所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第三樣品中的 第三miRNA譜。
133.如權利要求132所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第四樣品中的 第四miRNA譜。
134.如權利要求133所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第五樣品中的 第五miRNA譜。
135.如權利要求134所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第六樣品中的 第六miRNA譜。
136.如權利要求105所述的方法，其中所述第二樣品在施用所述治療劑之后至少一 周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
137.如權利要求132所述的方法，其中所述第三樣品在獲得所述第二樣品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
138.如權利要求133所述的方法，其中所述第四樣品在獲得所述第三樣品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
139.如權利要求134所述的方法，其中所述第五樣品在獲得所述第四樣品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
140.如權利要求105所述的方法，其中變化是所述患者的差異miRNA水平相對于健康 水平的降低。
141.如權利要求105所述的方法，其中變化是所述患者的差異miRNA水平相對于健康 水平的增加。
142.如權利要求141所述的方法，其中所述差異miRNA水平的增加指示疾病預后不良 或疾病將復發。
143.如權利要求141所述的方法，其中所述患者的差異miRNA水平的增加指示所述患 者的治療的改變。
144.一種治療肌炎患者的方法，所述方法包括施用結合并調控I型IFN或IFNa活性的藥劑；其中所述患者包含I型IFN或IFN a誘導性PD標志物表達譜；并且其中所述藥劑中和所述患者的所述I型IFN或IFN a -誘導性PD標志物表達譜。
145.如權利要求144所述的方法，所述方法還包括檢測所述患者的所述I型IFN或 IFNa誘導性PD標志物表達譜的中和。
146.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達 譜包含下列基因的表達或活性上調MX1、LY6E、IFI27、0AS1IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2 和 IFI44。
147.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調LAMP3、SIGLEC1、DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、SERPING1、 HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、LY6E、ISG15 和 IFI27。
148.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達 譜包含下列基因的表達或活性上調EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、 IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。
149.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達 譜包含下列基因的表達或活性上調DNAPTP6、EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、 IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。
150.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調SAMD9L、IFI6、IFI44、IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、IFI44L、 HERC5、IFIT1、EPST11、ISG15、SERPING1、0ASL、GBP 1 和 MX 1。
151.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、ISG15、 LAMP3、0AS3、0AS1、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1 禾口 USP18。
152.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L和IFI27。
153.如權利要求144所述的方法，其中所述藥劑為生物藥劑。
154.如權利要求153所述的方法，其中所述藥劑為抗體。
155.如權利要求154所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。
156.如權利要求154所述的方法，其中所述抗體是對一種或多種I型IFN或IFNa亞 型特異性的但不是MEDI-545。
157.如權利要求144所述的方法，其中所述藥劑的施用減輕一種或多種肌炎癥狀。
158.如權利要求154所述的方法，其中所述抗體以大約0.03和30mg/kg之間的劑量施用。
159.如權利要求158所述的方法，其中所述抗體以0.3和3mg/kg之間的劑量施用。
160.如權利要求159所述的方法，其中所述抗體以0.03和1mg/kg之間的劑量施用。
161.如權利要求153-155中任一項所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型 IFN或IFN a誘導性PD標志物表達譜中和至少10%。
162.如權利要求144所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物表達譜中和至少20%。
163.如權利要求162所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物表達譜中和至少30%。
164.如權利要求163所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物表達譜中和至少40%。
165.如權利要求164所述的方法，其中所述藥劑將所述患者的所述I型IFN或IFNa 誘導性PD標志物表達譜中和至少50%。
166.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性PD標志物表達譜 包含至少IFNa亞型1、2、8和14的表達或活性上調。
167.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性PD標志物表達譜 包含PD標志物基因的轉錄物。
168.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性PD標志物表達譜 包含由PD標志物基因所表達的多肽。
169.—種監測或預測患者的肌炎疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自患者的第一樣品中的第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜。
170.如權利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜是強譜 并且所述患者預測為肌炎疾病進展。
171.如權利要求170所述的方法，其中所述第一IFNa誘導性PD標志物表達譜包含 下列基因的過量表達或活性:EPSTIU HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITl、IFIT3、 ISGl5、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2, 0AS3, RSAD2、RTP4、SIGLECl 和 USP18。
172.如權利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜是弱譜 并且所述患者預測為肌炎疾病消退。
173.如權利要求169所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第二樣品中的第二 IFN α-誘導性PD標志物表達譜。其中第二表達譜相對于第一表達譜的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目或水 平增加預測肌炎疾病進展；或其中第二表達譜相對于第一表達譜的I型IFN或IFNa誘導性PD標志物的數目或水 平降低預測肌炎疾病消退。
174.—種監測接受治療劑治療的患者的肌炎疾病進展的方法，所述方法包括獲得來自所述患者的第一樣品中的第一 IFN α-誘導性PD標志物表達譜；施用治療劑；獲得來自所述患者的第二樣品中的第二 IFN a -誘導性PD標志物表達譜；以及比較所述第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜和所述第二 IFN a -誘導性PD標志物表達譜。其中所述第一 IFN a -誘導性PD標志物表達譜與所述第二 IFN a -誘導性PD標志物表 達譜之間的變化表明治療劑的效力水平。
175.如權利要求174所述的方法，其中包含表達或活性上調的基因譜的所述第一1型IFN或IFN α誘導性PD標志物表達譜包含下列基因的過量表達或活性EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、 RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。
176.如權利要求174所述的方法，其中所述變化是基因的表達或活性上調水平的降低。
177.如權利要求174所述的方法，其中所述治療劑為小分子或生物藥劑。
178.如權利要求177所述的方法，其中所述治療劑為結合并調控IFNa活性的生物藥劑。
179.如權利要求178所述的方法，其中所述生物藥劑為抗體。
180.如權利要求179所述的方法，其中所述抗體為MEDI-545。
181.如權利要求179所述的方法，其中所述抗體結合至少一種IFNa亞型但不是 MEDI-545。
182.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFN a誘導性PD標志物表達譜在施用 所述治療劑之前獲得。
183.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFN a誘導性PD標志物表達譜在施用 所述治療劑之時獲得。
184.如權利要求174所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品是全血、肌肉或 血清。
185.如權利要求174所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第三樣品中的 第三IFN a -誘導性PD標志物表達譜。
186.如權利要求185所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第四樣品中的 第四IFN a -誘導性PD標志物表達譜。
187.如權利要求186所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第五樣品中的 第五IFN a -誘導性PD標志物表達譜。
188.如權利要求187所述的方法，所述方法還包括獲得來自所述患者的第六樣品中的 第六IFN a -誘導性PD標志物表達譜。
189.如權利要求174所述的方法，其中所述第二樣品在施用所述治療劑之后至少一 周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
190.如權利要求185所述的方法，其中所述第三樣品在獲得所述第二樣品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
191.如186所述的方法，其中所述第四樣品在獲得所述第三樣品之后至少2天、至少5 天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
192.如權利要求187所述的方法，其中所述第五樣品在獲得所述第四樣品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一個月或至少兩個月獲得。
193.如權利要求174所述的方法，其中變化是基因的表達或活性上調的降低。
194.如權利要求193所述的方法，其中所述降低為至少10%、至少20%、至少25%、至 少30%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少 85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%。
195.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、0AS3、HERC5、MXl、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。
196.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性PD標志物表達譜 包含下列基因的表達或活性上調IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。
197.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性PD標志物表達譜 包含基因IFI44L和RSAD2的表達或活性上調。
198.如權利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜包含下 列基因的表達或活性上調IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、OASl、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、 MXU ESPTIU IFIT3 和 IFI6。
199.如權利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜包含下 列基因的表達或活性上調IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。
200.如權利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜包含基 因IFI44L和RSAD2的表達或活性上調。
201.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜包含下 列基因的表達或活性上調IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、OASl、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、 MXU ESPTIU IFIT3 和 IFI6。
202.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜包含下 列基因的表達或活性上調IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。
203.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFN α誘導性PD標志物表達譜包含基 因IFI44L和RSAD2的表達或活性上調。
204.如權利要求1所述的方法，其中所述患者具有強的I型IFN或IFNa誘導性基因 標記評分。
205.如權利要求1所述的方法，其中所述患者具有中等的I型FN或IFNα誘導性基因 標記評分。
206.如權利要求204所述的方法，其中強的評分大于或等于10。
207.如權利要求205所述的方法，其中中等的評分大于或等于4但小于10。
208.如權利要求35或74所述的方法，其中所述肌炎為DM或ΡΜ。
209.如權利要求144所述的方法，其中所述肌炎患者為DM或PM患者。
210.如權利要求144所述的方法，其中所述肌炎患者包含大于6的MITAX評分。
211.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性基因標記評分是 強的。
212.如權利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα誘導性基因標記評分是 中等的。
213.如權利要求211所述的方法，其中所述評分大于或等于10。
214.如權利要求212所述的方法，其中所述評分大于或等于4但小于10。
215.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFNa-誘導性PD標志物表達譜包含 強的I型IFN或IFN α誘導性基因標記評分。
216.如權利要求215所述的方法，其中強的評分為大于或等于10的評分。
217.如權利要求174所述的方法，其中所述第一IFNa-誘導性PD標志物表達譜包含 中等的I型IFN或IFN α誘導性基因標記評分。
218.如權利要求217所述的方法，其中中等的評分為大于或等于4但小于10的評分。
全文摘要
本發明涵蓋炎性疾患或自身免疫疾患如肌炎中的miRNA譜和I型IFN/IFNα誘導的PD標志物譜。所述譜還可用于例如治療患者的方法、監測患者的疾病進展的方法以及用于診斷或提供對患有炎性疾患或自身免疫疾患的患者的預測。
文檔編號A61K31/70GK101999001SQ200980112393
公開日2011年3月30日 申請日期2009年2月6日 優先權日2008年2月8日
發明者B·加萊, B·希格斯, C·莫爾豪斯, S·A·格林柏格, Y·姚 申請人:米迪繆尼有限公司;布里格姆及婦女醫院股份有限公司