基于DNABarcoding 的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生物制品鑒別試劑盒的制作方法
【專利摘要】本發明公開了一種基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品的一種鑒別方法。通過對編輯好的堿基序列長度進行比較來鑒別這3種魚類及其生肉制品,該方法是基于DNABarcoding建立的,不受被鑒定材料的形態限制,即便是個體的組織碎片,也能得出準確的結論,因此可廣泛用于魚類及其生肉制品的準確鑒定。
【專利說明】基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生物制 品鑒別試劑盒
【技術領域】
[0001] 本發明公開了一種魚類的鑒別方法,尤其涉及到一種基于DNA Barcoding的黃顙 魚、云斑鮰和鱸魚鑒別方法。
【背景技術】
[0002] 魚類作為水生環境的指標生物,不僅可做為水體凈化指標,還可以作為外來物種 入侵檢驗指標,同時魚類多樣性指標也可以反映其生境狀態。近年來,隨著我國經濟的高速 發展,生態問題日益突出,為外來物種的入侵提供了便利條件,給當地魚類開發和保護帶來 隱憂。如何快速有效的識別魚類成為迫切需要解決的問題。但是,由于傳統的形態分類學 目前得不到足夠的重視,形態分類的專業人員逐步減少,影響了魚類資源保護以及生境研 究等工作。
[0003] 近年來廣泛發展的一種由四川大學研發出的魚類分子生物學快速鑒別方法 CN200510022323. 1,是通過編碼魚類RNA的核DNA序列的保守性及其轉錄間隔子的種間差 異結合傳統的電泳技術鑒別魚類,這種方法耗時較長,成本較高,更關鍵的是這種方法無法 用于篩選和鑒定特定的魚類。
【發明內容】
[0004] 針對現有技術的缺陷,本發明公開了一種黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品的 鑒別方法,通過對編輯好的堿基序列長度進行比較來鑒別多種魚類中是否有這3種魚類中 的某種,該方法是基于DNA Barcoding建立的,不受被鑒定材料的形態限制,即便是個體的 組織碎片,也能得出準確的結論,因此可廣泛用于這3種常見魚類及其生肉制品的準確鑒 定。
[0005] 為實現上述目的,本發明采用如下技術方案: 1、根據已知魚類的DNA條形碼數據庫,設計和合成多組引物。
[0006] 2、從包含這3種魚的多種魚類中提取DNA,利用引物對每個待測對象的DNA進行擴 增,根據擴增的結果,選出最佳引物和反應條件。
[0007] 3、利用步驟(2)篩選出的引物對每個待測對象的DNA進行擴增,擴增后的序列進 行測序,然后進行數據分析,從而得到針對常見魚類DNA Barcoding數據庫。
[0008] 4、在建立DNA Barcoding數據庫后,對新的待測對象采用步驟(2)篩選出的引物 進行檢測,將其與步驟(3)的DNA Barcoding數據庫中的序列長度進行比對,從而確定其是 否為這3種魚類中的某種。
[0009] 通過上述方法,先建立對應特定引物的準確的含有常見魚類C0I序列長度的DNA Barcoding數據庫,在后續檢測新的待測樣品是否為該3種魚時只需進行序列長度比對即 可進行鑒定得到準確結果。
[0010] 其中,在上述方法中,采用酚氯仿抽提法提取DNA。
[0011] 具體的說,通過上述方法篩選得到了 一對具有良好PCR擴增性能的引物 (F-BaL1733/F-BaH2364 :GTGGGCCTAAAAGCAGCC/AAGCTCCAAAGGGTCTTCTCGT)。
[0012] 通過上述引物,得到的這3種魚類DNABarcoding數據庫如下表1所示 表 1:DNABarcoding數據庫
[0013] 【具體實施方式】
【權利要求】
1. 基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和S盧魚及其生肉制品鑒別試劑盒,其特征在 于它是通過對試驗所得的堿基序列長度進行比較從而準確鑒別這3種魚類及其生肉制品 的方法,簡便易行,操作容易;基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品 的鑒別方法,包括下述步驟:(1)根據已知魚類的DNA條形碼數據庫,設計和合成多組引 物;(2)從包含這3種魚的多種魚類中提取DNA,利用引物對每個待測對象的DNA進行擴增, 根據擴增的結果,選出最佳引物和反應條件;(3)利用步驟(2)篩選出的引物對每個待測對 象的DNA進行擴增,擴增后的序列進行測序,然后進行數據分析,從而得到針對這3種魚類 DNABarcoding數據庫;(4)在建立DNABarcoding數據庫后,對新的待測對象采用步驟 (2)篩選出的引物進行檢測,將其與步驟(3)的DNABarcoding數據庫中的序列長度進行 比對,從而確定其是否為這3種魚類中的某種。
2. 根據權利要求1的鑒定方法,其特征在于采用酚氯仿抽提法提取DNA。
3. 根據權利要求1的鑒定方法,其特征在于篩選出一組特異引物,該引物為: F-BaL1733/F-BaH2364 :GTGGGCCTAAAAGCAGCC/AAGCTCCAAAGGGTCTTCTCGT〇
4. 根據權利要求3的鑒定方法,其特征在于基于這一組引物建立的3種魚類DNA Barcoding數據庫如下所示:
一種黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品的鑒別試劑盒,其特征在于包含權利要求3 中的引物。
【文檔編號】C12Q1/68GK104450882SQ201410561559
【公開日】2015年3月25日 申請日期:2014年10月22日 優先權日:2014年10月22日
【發明者】趙生國, 邊琳鶴, 汪文強, 李永青, 郭永博, 鄭王山, 權金強, 車攏杰 申請人:甘肅農業大學