一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑，該試劑通過對等溫環(huán)介導(dǎo)擴(kuò)增所使用的引物組中的前內(nèi)引物標(biāo)記一種抗原同時對后內(nèi)引物標(biāo)記另一種抗原，能夠在擴(kuò)增嗜肺軍團(tuán)菌特異性目的基因的同時對該基因進(jìn)行標(biāo)記。標(biāo)記后使用配套的膠體金試紙能夠快速檢測目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物，從而檢測嗜肺軍團(tuán)菌。本發(fā)明的檢測試劑操作簡單快速、特異性強(qiáng)、靈敏度高。
【專利說明】—種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種應(yīng)用于核酸檢測的試劑，具體講，涉及一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑。
【背景技術(shù)】
[0002]1976年美國費(fèi)城退伍軍人協(xié)會會員中曾爆發(fā)急性發(fā)熱性呼吸道疾病，參加者中超過200人發(fā)生肺炎，其中34人遇難。經(jīng)研究，發(fā)現(xiàn)一種細(xì)菌命名為嗜肺軍團(tuán)菌。隨后，許多有關(guān)細(xì)菌暫被列入這一屬，且追溯研究發(fā)現(xiàn)早在1943年即有軍團(tuán)人員病的病例?，F(xiàn)已提出了超過30種軍團(tuán)桿菌，至少19種是人類肺炎的病原。其中最常見病原體為嗜肺軍團(tuán)菌(占病例的85%~90%)，這次事件反映了嗜肺軍團(tuán)菌并非小面積的人與人的傳染。加強(qiáng)水資源管理及人工輸水管道和設(shè)施的消毒處理，防治軍團(tuán)菌造成空氣和水源污染，是預(yù)防軍團(tuán)菌病擴(kuò)散的重要措施，嗜肺軍團(tuán)菌的快速檢測對該疾病的防控具有重要的意義。
[0003]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediatedisothermal amplification)是一種新型的核酸檢測技術(shù)，其特點(diǎn)是針對靶基因的6個區(qū)域設(shè)計(jì)4種特異引物，在鏈置換DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)的作用下,在60°C~65°C恒溫?cái)U(kuò)增，60分鐘左右即可實(shí)現(xiàn)IO9~IOltl倍的核酸擴(kuò)增，具有操作簡單、特異性強(qiáng)等特點(diǎn)。該技術(shù)的優(yōu)勢除了高特異性、高靈敏度外，操作十分簡單，對儀器設(shè)備要求低，一臺水浴鍋或恒溫箱就能實(shí)現(xiàn)反應(yīng)。其擴(kuò)增結(jié)果可以通過凝膠電泳、肉眼觀察焦磷酸鎂沉淀或加入熒光物質(zhì)后的顏色改變來做初步的判斷。但該方法也有一定的缺陷，主要表現(xiàn)在擴(kuò)增結(jié)果檢測環(huán)節(jié)，凝膠電泳檢測容易造成污染，焦磷酸鎂沉淀檢測靈敏度較差，熒光物質(zhì)變色方法受到熒光物質(zhì)的成本或者需要使用檢測儀器的限制。因此，在產(chǎn)物檢測環(huán)節(jié)的限制，影響了該技術(shù)的推廣應(yīng)用。
[0004]本發(fā)明公開了一種新型的等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑。該方法具有本發(fā)明的相對傳統(tǒng)環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增技術(shù)具有靈敏度更高，結(jié)果判斷更準(zhǔn)確的優(yōu)勢。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005]本發(fā)明的首要發(fā)明目的在于提供一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑。
[0006]本發(fā)明的第二發(fā)明目的在于提供一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測方法。
[0007]本發(fā)明的第三發(fā)明目的在于提供這種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑盒的應(yīng)用。
[0008]發(fā)明的主要技術(shù)方案為:
1.等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑的組成為:
(O核酸恒溫標(biāo)記擴(kuò)增反應(yīng)試劑
核酸恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液中含有前外引物、后外引物、前促環(huán)引物、后促環(huán)引物、前內(nèi)引物、后內(nèi)引物、dNTPs溶液、具有鏈置換活性的DNA聚合酶(如'Bst DNA聚合酶等)、MgSO4、無菌雙蒸水以及環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增的緩沖液。
[0009]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增的緩沖液的最終工作濃度為20 mM Tris-HClUO mMKClUO mM(NH4)2SO4,2 mM MgSO4 以及質(zhì)量濃度為 0.1% Triton X-100，緩沖液的 pH 值為 8.8。
[0010]其中前外引物、后外引物、前促環(huán)引物、后促環(huán)引物、前內(nèi)引物、后內(nèi)引物均為人工合成的脫氧核糖核酸分子，其中前外引物的核苷酸序列為SEQ ID N0:1、后外引物的核苷酸序列為SEQ ID NO:2、前促環(huán)引物的核苷酸序列為SEQ ID NO:3、后促環(huán)引物的核苷酸序列為SEQ ID N0:4、前內(nèi)引物的核苷酸序列為SEQ ID NO:5、后內(nèi)引物的核苷酸序列為SEQ IDN0:6，上述引物分別與待測基因的相應(yīng)位置互為反義互補(bǔ)序列，上述引物能夠在等溫條件下以環(huán)介導(dǎo)的方式檢測待測基因。將前內(nèi)引物的5’端標(biāo)記上生物素基團(tuán)，將后內(nèi)引物的5’端標(biāo)記上異硫氰酸熒光素基團(tuán)。
[0011]各引物的具體核苷酸序列如下:
SEQ ID NO:1 5’ - AAGATGAAATTGGTGACTGCAGC -3’，
SEQ ID NO:2 5’ - AGCAGTACGTTTTGCCATCA -3’，
SEQ ID NO:3 5’ - CCGATGCCACATCATTAGCTACAGACA -3’，
SEQ ID NO:4 5’ - TTGGCTTTAACCGAACAGCA -3’，
SEQ ID NO:5 5’ - TCGGCACCAATGCTATAAGACAACTAATGTCAACAGCAATGGCTGC -3’，
SEQ ID NO:6 5’ - GGCTAAAGGCATGCAAGACGTTTCTGAAACTTGTTAAGAACG -3’。
[0012](2)標(biāo)記核酸膠體金檢測試紙條
該試紙條的組成包括樣品墊、金膠墊、醋酸纖維素膜(膜上由相應(yīng)的抗體組成的檢測線和質(zhì)控線)和吸水墊等，具體組成參見附圖1。該膠體金檢測試紙的金膠墊上含有標(biāo)記后抗生物素抗體的金顆粒，膠體金檢測試紙層析膜的檢測線上包被有抗異硫氰酸生物素抗體，膠體金檢測試紙層析膜的質(zhì)控線上包被有能和金顆粒上標(biāo)記的抗生物素抗體結(jié)合的二抗。
[0013]2.使用等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑的具體步驟為:
(I)將待檢測的DNA溶液，加入到裝有恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液的PCR管中；在對照PCR管中分別加入陽性對照試劑和陰性對照試劑，將上述PCR管在60~65°C下擴(kuò)增反應(yīng)30~60分鐘，優(yōu)選條件為62°C下擴(kuò)增反應(yīng)60分鐘。
[0014](2)利用標(biāo)記核酸膠體金檢測試紙條，檢測PCR管中反應(yīng)后的核酸擴(kuò)增產(chǎn)物。
[0015]下面對本發(fā)明的技術(shù)方案作進(jìn)一步的解釋和說明:· 等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑能夠在60~65°C下將嗜肺軍團(tuán)菌的DNA進(jìn)行擴(kuò)增，在擴(kuò)增的同時，由于前內(nèi)引物和后內(nèi)引物分別標(biāo)記有生物素基團(tuán)和異硫氰酸熒光素基團(tuán)，因此在DNA擴(kuò)增產(chǎn)物上同時含有生物素基團(tuán)和異硫氰酸熒光素基團(tuán)。
[0016]上述擴(kuò)增產(chǎn)物滴加在核酸膠體金檢測試紙條的樣品墊上，在層析作用下，擴(kuò)增產(chǎn)物在經(jīng)過金膠墊時雙標(biāo)記的核酸擴(kuò)增產(chǎn)物由于攜帶有生物素基團(tuán)和異硫氰酸熒光素基團(tuán)，因此能夠和標(biāo)記有金顆粒的抗生物素抗體結(jié)合形成核酸抗體復(fù)合物；核酸抗體復(fù)合物在醋酸纖維素膜上層析，經(jīng)過檢測線時該復(fù)合物由于帶有異硫氰酸熒光素基團(tuán)，因此能夠和檢測線上的抗異硫氰酸熒光素抗體結(jié)合，形成復(fù)合物，該復(fù)合物由于攜帶有有色的標(biāo)記物(納米金顆粒呈紅色)，此時檢測線呈現(xiàn)紅色；當(dāng)核酸抗體復(fù)合物或者單獨(dú)的標(biāo)記抗生物素抗體經(jīng)過質(zhì)控線時，由于質(zhì)控線上含有能夠結(jié)合抗生物素抗體的二抗，所以只要有標(biāo)記的抗生物素抗體層析至質(zhì)控線，無論該抗體是否結(jié)合有標(biāo)記的核酸，均能夠形成二抗和標(biāo)記抗體的復(fù)合物，該復(fù)合物由于攜帶有有色的標(biāo)記物(納米金顆粒呈紅色)，此時質(zhì)控線呈現(xiàn)紅色。
[0017]本發(fā)明的相對傳統(tǒng)環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增技術(shù)具有靈敏度更高，結(jié)果判斷更準(zhǔn)確的優(yōu)勢。首先，本發(fā)明的新型恒溫環(huán)介導(dǎo)核酸標(biāo)記檢測試劑，使用標(biāo)記的引物，使得環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增后，擴(kuò)增產(chǎn)物攜帶了兩種抗原標(biāo)記物。這樣的雙標(biāo)記核酸擴(kuò)增產(chǎn)物，能夠被制備好的膠體金試紙條檢測出來。當(dāng)含有雙標(biāo)記擴(kuò)增產(chǎn)物的樣本在膠體金試紙上層析時，雙標(biāo)記產(chǎn)物能夠結(jié)合攜帶有有色顆粒標(biāo)記的抗體，在檢測線上呈現(xiàn)紅色，這樣目的擴(kuò)增產(chǎn)物可以通過試紙上檢測線的顏色改變顯示出來。即使有很少的擴(kuò)增產(chǎn)物也能夠進(jìn)行準(zhǔn)確的檢測，因此有效地提高了檢測靈敏度。其次，檢測反應(yīng)的結(jié)果通過膠體金檢測試紙的檢測線得到，相對于濁度觀察法和熒光燃料變色法讀取結(jié)果更加準(zhǔn)確，避免了由于檢驗(yàn)人員主觀判斷帶來的結(jié)果偏差。上述檢測方法擴(kuò)大了該檢測試劑的應(yīng)用范圍，使之可以廣泛應(yīng)用于野外現(xiàn)場等特殊環(huán)境。此方法操作簡單、時間短，同時也降低了檢測成本，使得檢測結(jié)果更加快速、可靠，具有免疫與核酸診斷試劑各自的優(yōu)點(diǎn)。該技術(shù)由于操作簡單、快速、低廉的成本和防止核酸擴(kuò)增物對實(shí)驗(yàn)室的污染，對于病原體的檢測具有重大意義。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0018]附圖1膠體金試紙條的組成。
[0019]該試紙條的組成包括樣品墊(I)、金膠墊(2 )、醋酸纖維素膜(3 )、質(zhì)控線(4 )、檢測線(5)和吸水墊(6)。該膠體金檢測試紙的金膠墊上含有標(biāo)記后抗生物素抗體的金顆粒，膠體金檢測試紙層析膜的檢測線上包被有抗異硫氰酸生物素抗體，膠體金檢測試紙層析膜的質(zhì)控線上包被有能和金顆粒上標(biāo)記的抗生物素抗體結(jié)合的二抗。
[0020]附圖2嗜肺軍團(tuán)菌標(biāo)記擴(kuò)增檢測結(jié)果
加入的擴(kuò)增DNA模板如下，I號條為嗜肺軍團(tuán)菌DNA模板標(biāo)準(zhǔn)品其中含目的基因約IO5拷貝；2號條為嗜肺軍團(tuán)菌DNA模板標(biāo)準(zhǔn)品其中含目的基因約10°拷貝；3號條為待測樣品；4號條為肺炎鏈球菌DNA模板標(biāo)準(zhǔn)品；5號條為加入的雙蒸水進(jìn)行陰性對照。
[0021]下面結(jié)合具體實(shí)施例，進(jìn)`一步詳細(xì)地闡述本發(fā)明。
【具體實(shí)施方式】
[0022]本發(fā)明的【具體實(shí)施方式】僅對本發(fā)明做進(jìn)一步的解釋和說明，并不對本發(fā)明的內(nèi)容進(jìn)行限制。
[0023]實(shí)施例1:嗜肺軍團(tuán)菌DNA基因組梯度稀釋標(biāo)記擴(kuò)增檢測
取濃度已知的嗜肺軍團(tuán)菌DNA基因組對其進(jìn)行10倍梯度稀釋，稀釋至嗜肺軍團(tuán)菌DNA中的目的基因終濃度為10°拷貝/ μ L，取嗜肺軍團(tuán)菌DNA模板標(biāo)準(zhǔn)品制備的陽性參照物，陰性參照物，以及嗜肺軍團(tuán)菌DNA梯度稀釋液(在PCR管中嗜肺軍團(tuán)菌特異性目的基因的終濃度分別為IO3拷貝、IO2拷貝、IO1拷貝和10°拷貝)，做為模板進(jìn)行標(biāo)記擴(kuò)增檢測。
[0024]等溫?cái)U(kuò)增中的各組分構(gòu)成比例如下:
【權(quán)利要求】
1.一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑，其特征在于，所述的檢測試劑包括嗜肺軍團(tuán)菌等溫環(huán)介導(dǎo)核酸標(biāo)記擴(kuò)增反應(yīng)液，該反應(yīng)液中含有前外引物、后外引物、前促環(huán)引物、后促環(huán)引物、5’端標(biāo)記生物素基團(tuán)的前內(nèi)引物、5’端標(biāo)記異硫氰酸熒光素基團(tuán)的后內(nèi)引物、dNTPs溶液、具有鏈置換活性的DNA聚合酶(如M DNA聚合酶)、MgSO4、無菌雙蒸水以及環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增的緩沖液。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑，其特征在于，使用的前外引物、后外引物、前促環(huán)引物、后促環(huán)引物、前內(nèi)引物和后內(nèi)引物的序列如下:
SEQ ID NO:1 5’ - AAGATGAAATTGGTGACTGCAGC -3’，
SEQ ID NO:2 5’ - AGCAGTACGTTTTGCCATCA -3’，
SEQ ID NO:3 5’ - CCGATGCCACATCATTAGCTACAGACA -3’，
SEQ ID NO:4 5’ - TTGGCTTTAACCGAACAGCA -3’，
SEQ ID NO:55 - TCGGCACCAATGCTATAAGACAACTAATGTCAACAGCAATGGCTGC -3’ ，
SEQ ID NO:6 5’ - GGCTAAAGGCATGCAAGACGTTTCTGAAACTTGTTAAGAACG -3’。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑，其特征在于，使用該試劑，能夠在擴(kuò)增目的基因的同時將擴(kuò)增產(chǎn)物DNA上標(biāo)記生物素基團(tuán)和異硫氰酸熒光素基團(tuán)。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑，其特征在于，將提取得到的待測D`NA溶液作為擴(kuò)增模板加入到裝有核酸恒溫標(biāo)記擴(kuò)增反應(yīng)液的PCR管中，在60~65°C下擴(kuò)增反應(yīng)30~60分鐘，優(yōu)選62°C下擴(kuò)增反應(yīng)60分鐘。
5.一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑所使用的膠體金檢測試紙，其特征在于，膠體金檢測試紙的金膠墊上含有標(biāo)記后抗生物素抗體的金顆粒，膠體金檢測試紙層析膜的檢測線上包被有抗異硫氰酸生物素抗體，膠體金檢測試紙層析膜的質(zhì)控線上包被有能和金顆粒上標(biāo)記的抗生物素抗體結(jié)合的二抗。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種新型等溫環(huán)介導(dǎo)嗜肺軍團(tuán)菌核酸標(biāo)記檢測試劑所使用的膠體金檢測試紙，其特征在于，將待測標(biāo)記擴(kuò)增產(chǎn)物滴加在檢測試紙的樣品墊上，當(dāng)檢測線和質(zhì)控線都呈現(xiàn)紅色時表明DNA樣品中含有嗜肺軍團(tuán)菌的待測基因，當(dāng)檢測線無色而質(zhì)控線呈現(xiàn)紅色表明DNA樣品中不含有嗜肺軍團(tuán)菌的待測基因。
【文檔編號】C12Q1/68GK103667501SQ201310736719
【公開日】2014年3月26日 申請日期:2013年12月27日 優(yōu)先權(quán)日:2013年12月27日
【發(fā)明者】關(guān)淳, 王馨, 祁軍, 左鋒, 劉寅, 韓靜娜, 姜智賢, 葉正 申請人:天津國際旅行衛(wèi)生保健中心