一種茶樹rna提取方法
【專利摘要】本發明公開了一種茶樹RNA提取方法,步驟包括:取茶樹組織,加入不溶性聚乙烯吡咯烷酮PVPP,液氮研磨成粉末,加入提取液,水浴并離心,獲得的上清液中加入無水乙醇,沉淀RNA,再用吸附柱進行吸附,洗滌吸附柱,最后用RNA-free水洗脫,獲得茶樹RNA。該方法是將現有技術的CTAB法與RNA提取試劑盒結合,在現有茶樹RNA提取方法上做了進一步優化,與現有技術相比,該方法提取茶樹RNA的時間短,獲得的茶樹RNA的提取率和純度高。
【專利說明】—種茶樹RNA提取方法
【技術領域】
[0001]本發明涉及RNA提取領域,具體地是一種茶樹RNA提取方法。
【背景技術】
[0002]茶樹原產于我國西南地區,是一種喜溫畏寒的多年生經濟作物,從分子水平上挖掘優良茶樹種質資源是一項很有意義的工作。隨著現代分子生物學的發展,構建茶樹cDNA文庫、茶樹基因克隆及表達分析、茶樹microRNA分析等已經成為茶樹生物技術研究的重點工作,而從茶樹中提取出高質量的RNA是進行這些研究的關鍵步驟。
[0003]茶樹是一種的多年生木本植物,富含多糖、多酚類物質,容易在核酸分離純化時,與RNA相互作用,使得RNA降解,因此,用這些常規方法提取時往往效果較差。現有技術中常用的RNA提取方法包括CTAB法、TriZ01法等,也有很多市售的RNA提取試劑盒,如史成穎等人利用傳統CTAB法,提取獲得了茶樹嫩葉RNA(史成穎等,提取高質量茶樹總RNA的方法研究,安徽農業大學學報,2007年,第34期第3版,360~363頁),該茶樹RNA的A260/280值為2.08~2.10,RNA濃度為845.5~901.2ng/μ L,提取過程消耗了 2天的時間。市售的植物RNA提取試劑盒種類較多,提取時間短,一般只需要2~4小時,但針對性不強,提取率和純度不能很好地滿足開展茶樹基因工程實驗需要。因此,需要尋找一種更加優化的方法,以達到進一步提高 總RNA提取率的基礎上縮短提取時間,同時保證RNA的高純度及完整性的目的。
【發明內容】
[0004]本發明的目的在于克服現有技術的不足,提供一種茶樹RNA提取方法,以提供一種更加優化的方法,進一步提高茶樹RNA提取率和純度,縮短提取時間。
[0005]本發明是通過以下技術方案實現的,本發明包括以下步驟:
[0006]一種茶樹RNA提取方法,包括以下步驟:
[0007](I)取茶樹組織,加入茶樹組織0.5~1.5倍重量的不溶性聚乙烯吡咯烷酮PVPP,液氮中研磨成粉末;
[0008](2)將步驟(1)的粉末中加入提取液,每Ig茶樹組織加入4.5mL的提取液,混勻,每Ig茶樹組織中再加入250μ L的β-巰基乙醇,水浴,得到粗樣品;
[0009](3)將步驟(2)的粗樣品在4°C下離心,取上清轉移至RNA提取試劑盒的過濾柱中,離心,獲得上清液;
[0010](4)將步驟(3)的上清液中加入0.5倍上清液體積的無水乙醇,混勻,獲得粗提液;
[0011](5)將步驟(4)的粗提液轉移至RNA提取試劑盒的吸附柱中進行吸附,然后用RNA提取試劑盒中的去蛋白液和漂洗液洗滌吸附柱,最后用不含核酸酶的RNA-free水洗脫吸附柱上的RNA,獲得茶樹RNA。
[0012]優選地,所述步驟(1)中,茶樹組織選自茶樹嫩葉、成熟葉、茶樹嫩根和茶樹花蕾中的一種。[0013]優選地,所述步驟(1)中,加入的PVPP重量與茶樹組織的重量相等。
[0014]優選地,所述步驟(2)中,水浴溫度為65°C,水浴時間為30min。
[0015]優選地,所述步驟(2)中,提取液的配方為:1.4mol/L的NaCl,重量百分比為2%的十六烷基三甲基溴化銨CTAB,IOOmmoI/L的三羥甲基氨基甲烷的鹽酸溶液Tris-HCl和20mmol/L的乙二胺四乙酸EDTA,溶劑為焦碳酸二乙酯DEPC水,pH8.0,配制后滅菌。
[0016]優選地,所述步驟(3)中,離心的轉速為12000rpm,離心的時間為5min,將粗樣品離心可以去除粗樣品中的固體物質,避免后續將樣品轉入過濾柱時,固體物質堵塞過濾柱。
[0017]本發明相比現有技術具有以下優點:本發明提供了一種茶樹RNA提取方法,該方法是將現有技術的CTAB法與RNA提取試劑盒結合,在現有茶樹RNA提取方法上做了進一步優化,用該方法提取茶樹RNA的用時只需2小時,大大縮短了提取時間,同時,用該方法提取茶樹RNA與現有技術相比,茶樹RNA的提取率和純度都有大幅度提高。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0018]圖1為茶樹嫩葉RNA的甲醛變性膠電泳圖,其中泳道I~3為3個重復;
[0019]圖2為茶樹成熟葉片RNA的甲醛變性膠電泳圖,其中泳道I~2為2個重復;
[0020]圖3為茶樹嫩根中RNA的甲醛變性膠電泳圖,其中泳道I~3為3個重復;
[0021 ] 圖4為茶樹花蕾RNA的甲醛變性膠電泳圖,其中泳道I~3為3個重復;
[0022]圖5為用試劑盒提取的茶樹嫩葉RNA的甲醛變性膠電泳圖,其中I~2為2個重復。
【具體實施方式】
[0023]下面對本發明的實施例作詳細說明,本實施例在以本發明技術方案為前提下進行實施,給出了詳細的實施方式和具體的操作過程,但本發明的保護范圍不限于下述的實施例。
[0024]實施例1
[0025]本實施例為茶樹嫩葉RNA提取方法,包括以下步驟:
[0026](I)取茶樹嫩葉0.2g,加入0.2g的不溶性聚乙烯吡咯烷酮,液氮中迅速研磨成粉末;
[0027](2)配制提取液并滅菌,將步驟(1)的粉末中加入900 μ L的提取液,混勻,再加入50 μ L的β -巰基乙醇,65°C下水浴30min,得到粗樣品,所述提取液的配方為:1.4mol/L的NaCl,重量百分比為2%的十六烷基三甲基溴化銨,IOOmmoI/L的Tris-HCl,20mmol/L的EDTA,溶劑為水;
[0028](3)將步驟(2)的粗樣品在4°C下離心5min,離心轉速為12000rpm,取上清轉移至天根RNA提取試劑盒(購于天根生化科技有限公司)的過濾柱CS中,12000rpm離心2min,獲
得上清液;
[0029](4)將步驟(3)的上清液中加入0.5倍上清液體積的無水乙醇,混勻,獲得粗提液;
[0030](5)將步驟(4)的粗提液用天根RNA提取試劑盒提取,所述提取步驟包括:
[0031]I)將粗提液轉移至試劑盒的帶有收集管的吸附柱CR3中進行吸附,12000rpm離心lmin,棄廢液,將吸附柱CR3重新放回收集管中;[0032]2)向上述步驟I)的吸附柱CR3中加入350 μ L去蛋白液RWl溶液,12000rpm離心lmin,棄廢液,將吸附柱CR3重新放回收集管中;
[0033]3)配制DNase I溶液:取10 μ L的DNase I的存儲液,加入70 μ L的RDD溶液混勻;
[0034]4)向上述步驟2)的吸附柱CR3中加入80 μ L的DNase I溶液,室溫放置15min,然后加入350 μ L的去蛋白液RWl溶液,12000rpm下離心lmin,棄廢液,將CR3重新放回收
集管中;
[0035]5)向上述步驟4)的吸附柱CR3中加入500 μ L的漂洗液RW (使用前已按試劑盒說明書中的提示加入無水乙醇),室溫靜置2min,12000rpm下離心lmin,棄廢液,將CR3重新放回收集管中;
[0036]6)重復上述步驟5),在12000rpm下離心2min,棄廢液,將吸附柱CR3于室溫下靜置10分鐘以徹底晾干吸附柱中殘留的漂洗液
[0037]7)將上述步驟6)的吸附柱CR3放入一個新的離心管中,向吸附膜中懸空滴加50 μ L不含核酸酶的RNA-free水,室溫放置2min,12000rpm下離心2min,得到得溶液即為RNA。得到的所述總RNA。
[0038]以上提取方法中所用到的試劑和實驗器材均不含核酸酶,重復3次,提取獲得的RNA甲醛變性膠電泳結果如圖1所示。
[0039]實施例2
[0040]本實施例為茶樹成熟葉的RNA提取方法,取茶樹成熟葉0.2g,剪碎,加入0.2g的PVPP,其它步驟同實施例1,重復2次,提取獲得的RNA甲醛變性膠電泳結果如圖2所示。
[0041]實施例3
[0042]本實施例為茶樹嫩根的RNA提取方法,取茶樹嫩根0.2g,剪碎,加入0.2g的PVPP,其它步驟同實施例1,重復3次,提取獲得的RNA甲醛變性膠電泳結果如圖3所示。
[0043]實施例4
[0044]本實施例為茶樹花蕾的RNA提取方法,取茶樹花蕾0.2g,加入0.2g的PVPP,其它步驟同實施例1,重復3次,提取獲得的RNA甲醛變性膠電泳結果如圖4所示。
[0045]取實施例1~4提取的茶樹RNA,用甲醛變性膠進行電泳檢測,獲得如圖1~4所示的電泳圖,另取茶樹嫩葉,用天根RNA提取試劑盒提取RNA作為對照組,重復2次,得到如圖5所示的甲醛變性膠電泳圖。
[0046]通過核酸定量儀檢測實施例1~4提取的茶樹RNA和對照組的RNA的A260/280值和RNA濃度,計算RNA平均濃度,結果如下表1所示:
[0047]表1:茶樹RNA的A260/280值和提取率的測定結果
【權利要求】
1.一種茶樹RNA提取方法,其特征在于,包括以下步驟: (1)取茶樹組織,加入茶樹組織0.5~1.5倍重量的不溶性聚乙烯吡咯烷酮PVPP,液氮中研磨成粉末; (2)將步驟(1)的粉末中加入提取液,每Ig茶樹組織加入4.5mL的提取液,混勻,每Ig茶樹組織中再加入250yL的β-巰基乙醇,水浴,得到粗樣品; (3)將步驟(2)的粗樣品在4°C下離心,取上清轉移至RNA提取試劑盒的過濾柱中,離心,獲得上清液; (4)將步驟(3)的上清液中加入0.5倍上清液體積的無水乙醇,混勻,獲得粗提液; (5)將步驟(4)的粗提液轉移至RNA提取試劑盒的吸附柱中進行吸附,然后用RNA提取試劑盒中的去蛋白液和漂洗液洗滌吸附柱,最后用不含核酸酶的RNA-free水洗脫吸附柱上的RNA,獲得茶樹RNA。
2.如權利要求1所述的一種茶樹RNA提取方法,其特征在于,所述步驟(1)中,茶樹組織選自茶樹嫩葉、成熟葉、茶樹嫩根和茶樹花蕾中的一種。
3.如權利要求1所述的一種茶樹RNA提取方法,其特征在于,所述步驟(1)中,加入的PVPP重量與茶樹組織的重量相等。
4.如權利要求1所述的一種茶樹RNA提取方法,其特征在于,所述步驟(2)中,水浴溫度為65°C,水浴時間為30min。
5.如權利要求1所述的一種茶樹RNA提取方法,其特征在于,所述步驟(2)中,提取液的配方為:1.4mol/L的NaCl,重量百分比為2%的十六烷基三甲基溴化銨CTAB,IOOmmoI/L的三羥甲基氨基甲烷的鹽酸溶液Tris-HCl和20mmol/L的乙二胺四乙酸EDTA,溶劑為焦碳酸二乙酯DEPC水,pH8.0,配制后滅菌。
6.如權利要求1所述的一種茶樹RNA提取方法,其特征在于,所述步驟(3)中,離心的轉速為12000rpm,離心的時間為5min。
【文檔編號】C12N15/10GK103667259SQ201310654955
【公開日】2014年3月26日 申請日期:2013年12月5日 優先權日:2013年12月5日
【發明者】李葉云, 添先鳳, 周月琴, 江昌俊 申請人:安徽農業大學