篩選楊樹生長及材性性狀的PtUXS1 SNP位點、篩選方法、試劑盒及應用的制作方法
【專利摘要】本發明公開了一種篩選楊樹生長及材性性狀的PtUXS1 SNP位點、篩選方法、試劑盒及應用。其中,該SNP位點為毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位堿基。本發明采用連鎖-連鎖不平衡作圖策略獲得楊樹半纖維素合成相關基因PtUXS1內與木材品質性狀(α-纖維素含量)顯著關聯的功能SNP標記,即毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位堿基,為開展林木全基因組水平的關聯作圖研究提供了重要的理論基礎。本發明確定的功能SNP位點為早期篩選高纖維素含量的優異用材新種質,縮短林木育種選擇周期提供了新的育種策略,對發展楊樹速生豐產紙漿林、確保我國林業持續穩定地提供高得率工業紙漿原料具有重要的意義。
【專利說明】篩選楊樹生長及材性性狀的PtUXSI SNP位點、篩選方法、 試劑盒及應用
【技術領域】
[0001] 本發明涉及分子生物學【技術領域】,具體而言,涉及一種篩選楊樹生長及材性性狀 的PtUXSlSNP位點、篩選方法、試劑盒及應用。
【背景技術】
[0002] 木材作為地球能源中最重要的可再生資源,為人類生存提供了約80%的纖維質生 物量。木材細胞主要由纖維素、半纖維素和木質素組成,其對細胞壁的形成具有重要作用。 先前的研究主要集中于理解纖維素和木質素的合成機制,對半纖維素的生物合成過程特別 是木聚糖、木糖葡聚糖的合成機制以及它們對木材纖維品質的影響卻相當貧乏。
[0003] 近年來,隨著模式植物全基因組測序的完成,植物基因組學的研究已經呈現出由 簡單質量性狀向復雜的數量性狀轉移的趨勢,特別是大量SNP標記的開發以及生物信息學 的迅猛發展,應用關聯分析方法發掘植物數量性狀基因已成為目前國際植物基因組學研究 的熱點之一。尤其是在樹木育種中,由于樹木世代周期長及雜合度高,利用基于候選基因的 關聯分析方法可以縮短育種年限、提高關聯作圖的精確度。在一些桉樹和針葉樹種中,利用 基于候選基因的關聯分析方法已經鑒定了一些與木材生長和品質性狀相關的等位變異位 點及其功能基因。
[0004] 毛白楊是我國北方地區特有的優良用材樹種,具有分布廣泛、材質優良及速生豐 產等特性,在紙漿造紙、生物質能源、工業用材等方面具有較大的潛力及應用前景。因此,闡 明木材形成的分子遺傳表達機制,利用穩定高效的分子標記輔助育種手段改良木材品質, 積極選育單位面積高產量及質量的優良種質個體,用于構建速生能源豐產林,對確保我國 林業持續發展具有十分重要的戰略意義。目前,亟需開發有效的與楊樹生長及材性性狀相 關的分子標記。
【發明內容】
[0005] 本發明旨在提供一種篩選楊樹生長及材性性狀的PtUXSl SNP位點、篩選方法、試 劑盒及應用,以提供一種快速、準確篩選楊樹生長及材性性狀的方法和試劑盒。
[0006] 為了實現上述目的,根據本發明的一個方面,提供了一種篩選楊樹生長及材性性 狀的PtUXSl SNP位點。該SNP位點為毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位 喊基。
[0007] 進一步地,毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位為C/G。
[0008] 根據本發明的另一個方面,提供了一種篩選楊樹生長及材性性狀的方法。該方法 包括以下步驟:S1,提取毛白楊的基因組DNA ;S2,測定毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧 酶基因第463位的基因型;S3,根據毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因 型進行篩選。
[0009] 進一步地,毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因型為GG時,對 應的毛白楊個體α-纖維素含量最高。
[0010] 進一步地,毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因型為CC時,對 應的毛白楊個體α-纖維素含量最低。
[0011] 進一步地,步驟S2中在測定毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基 因型時用的引物為SEQIDN(λ2、SEQIDN(λ3、SEQIDN(λ4,且SEQIDN(λ3、SEQIDN0·4 的3'末端第一個脫氧核苷酸LNA修飾。
[0012] 根據本發明的再一個方面,提供一種篩選楊樹生長及材性性狀的試劑盒。該試劑 盒包括堿基序列為 SEQ ID NO. 2、SEQ ID NO. 3 及 SEQ ID NO. 4 的引物,且 SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4的3'末端第一個脫氧核苷酸LNA修飾。
[0013] 進一步地,該試劑盒還包括PCR擴增試劑,擴增試劑包括PCR擴增緩沖液, SSmmolL-1MgCl2, IOmmolL-1 dNTP,Taq DNA 聚合酶和雙蒸水。
[0014] 根據本發明的再一個方面,提供一種毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第 463位PtUXSl SNP位點在楊樹分子標記輔助選擇育種中的應用。
[0015] 本發明采用連鎖-連鎖不平衡作圖策略獲得楊樹半纖維素合成相關基因 PtUXSl 內與木材品質性狀(α -纖維素含量)顯著關聯的功能SNP標記(SNP10),即毛白楊尿苷二 磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位堿基,為開展林木全基因組水平的關聯作圖研究提供 了重要的理論基礎。本發明確定的功能SNP位點為早期篩選高纖維素含量的優異用材新種 質,縮短林木育種選擇周期提供了新的育種策略,對發展楊樹速生豐產紙漿林、確保我國林 業持續穩定地提供高得率工業紙漿原料具有重要的戰略意義。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0016] 構成本申請的一部分的說明書附圖用來提供對本發明的進一步理解,本發明的示 意性實施例及其說明用于解釋本發明,并不構成對本發明的不當限定。在附圖中:
[0017] 圖1示出了 SNPlO標記3種基因型組合的mRNA水平表達量;
[0018] 圖2示出了 SNP10標記在關聯作圖群體的α -纖維素含量上的基因型效應;以及
[0019] 圖3示出了 SNP10標記在連鎖作圖群體的α -纖維素含量上的基因型效應。
【具體實施方式】
[0020] 需要說明的是,在不沖突的情況下,本申請中的實施例及實施例中的特征可以相 互組合。下面將參考附圖并結合實施例來詳細說明本發明。
[0021] 利用傳統育種選擇生長快和木材品質好的樹木費時而且難度大、成本高,穩定性 差,為了解決這一技術問題,本發明開發出與楊樹生長及材性性狀關聯的功能SNP標記,可 以在早期就鑒定出具有良好纖維品質的單株,從而大大加速育種進程。
[0022] 半纖維素占木材干重的35%,含量僅次于纖維素。而木聚糖是半纖維素的重要結構 成分,也是木材細胞壁多聚糖的重要組分,影響著木材初生細胞壁和次生細胞壁的形成。尿 苷二磷酸-木糖(UDP-Xylose)是木聚糖、木葡聚糖等形成所必須的底物,主要通過尿苷二 磷酸葡萄糖脫氫酶催化葡萄糖(Glucose)形成尿苷二磷酸-葡糖醒酸(UDP-glucuronate), 進而由尿苷二磷酸葡萄糖醒酸脫羧酶(UDP-Glucuronate Decarboxylase, UXS)催化尿苷二 磷酸-葡萄糖醛酸而形成。因此,UXS作為一種不可逆酶,是實現己糖向戊糖轉化的關鍵酶, 影響半纖維素的合成。目前,在擬南芥、煙草、水稻和豌豆等多種植物中已經克隆出不同的 UXS等位酶家族,但在林木中關于該基因的研究尚無相關報道。
[0023] 本發明獲得了楊樹半纖維素合成相關基因 PtUXSl (SEQ ID NO. 1)內與木材材性 性狀(α -纖維素含量)顯著關聯的功能SNP標記(SNP10,毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫 羧酶基因第463位堿基),為楊樹分子標記輔助育種提供理論依據,并為楊樹早期優良種質 選育提供技術支持。本發明與楊樹生長及材性性狀關聯的功能SNP標記具體是通過如下步 驟而獲得的:
[0024] (1)選取全國毛白楊種質資源庫中426株個體構成關聯作圖群體;選取以銀腺楊 "ΥΧ01"為母本,毛白楊"LM50"為父本雜交獲取的Fl代中的1200株個體構成連鎖作圖群 體;并測定兩個群體的生長及材性性狀。
[0025] (2)從關聯作圖群體中隨機選取44株能夠最大程度反映毛白楊分布范圍的基因 型個體,利用直接測序方法得到PtUXSl的DNA序列,經Cluster W比對44株基因型個體的 基因序列,獲得PtUXSl內的常見SNP位點(頻率彡0. 10)。
[0026] (3)提取關聯作圖群體和連鎖作圖群體所有基因型個體的基因組DNA,以此為模 板,采用鎖核酸技術修飾的引物進行PCR擴增、基因型分型,建立SNP基因型數據庫。
[0027] (4)聯合利用連鎖-連鎖不平衡作圖原理進行SNP位點基因型與表型性狀的關聯 分析:在關聯作圖群體中采用TASSEL軟件中的混合線性模型(MLM),在連鎖作圖群體中采 用單因素方差分析法進行關聯分析。
[0028] (5)篩選出在兩個群體中重復出現的顯著關聯結果,并采用熒光定量PCR方法驗 證顯著關聯的SNP位點是否影響PtUXSl基因的RNA轉錄水平,通過檢測位點不同基因型組 的mRNA水平表達量,最終確定SNPlO (毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位 堿基)三種基因型(CC、CG、GG)的RNA轉錄水平差異顯著(GG基因型表達量最高,CC基因型 最低),表明該位點堿基的突變影響了該基因的轉錄表達水平,證明其為功能SNP位點。
[0029] (6)對功能SNP位點(SNPlO)在兩個群體中的基因型效應進行分析,結合RNA轉錄 水平分析的結果,確定三種基因型個體對應的表型性狀差異(GG基因型對應個體的α -纖 維素含量均值最高,CC基因型最低)。因此,在楊樹早期優良種質個體選育過程中,可直接 根據該位點基因型類型進行早期選擇。
[0030] SEQ ID NO. 1:
[0031] I atggcggtcc tcctcttggc ttccccaaaa atagaagaaa ccactgatgc ttaaacccaa
[0032] 61 cacaactagt cctctcttct tcttcttccg tctccaaaac tttgaaaaaa agaaatccca
[0033] 121 attcccacga tgatgaaaca attacacaaa caaacaagcg taaatcaaag gagagacgaa
[0034] 181 gaaatcccat cttcccaatc ttactctcct aaaatgctaa aacaccccag atctctccct
[0035] 241 agatccgtta attatctctt caaagaacag cgccttcttt tcattcttgt tggcatttta
[0036] 301 attggttcta ctttcttcat tgttcagcct actctctccc gccttaaccc atctgatcca
[0037] 361 accacccatt cttctctccc ctcttcaatt taccatcgca accaagattc ctcctctggg
[0038] 421 tcctccggat ttttctctaa gagaacgttt ccaggccgcg tcccagctgg gatcggccgg
[0039] 481 aagagtttgc gtatcgtggt tactggcggg gctggatttg ttgggagtca tttggtggat
[0040] 541 aaattgattt cgcggggtga tgaggttatt gtgattgata atttttttac tggaaggaaa
[0041] 601 gagaatttgg ttcatttgtt cgggaatccg aggtttgaat taattagaca tgatgtcgtt
[0042] 661 gagcctattt tgttagaagt tgatcagatc tatcacttgg cttgtcctgc ttcgccagtt
[0043] 721 cattataaat ataacccagt caagactatt atatccttta tatgaagttg ttacgcttgc
[0044] 781 ttaattgtca ttaatgttaa ttatgtgtgt gtgattcgtg tgtatttttt ttggaattct
[0045] 841 tggatccttg actgtgaatt gtttgcttac aagactaatg tgatgggcac gctcaatatg
[0046] 901 ttgggtttgg cgaagagggt aggggcgagg tttttgctaa ccagtacgag tgaggtttat
[0047] 961 ggagatcccc ttgagcatcc gcagaaggag acatattggg gaaatgtgaa tccaataggt
[0048] 1021 cagatgctag ttagaaacat ccgtttgttt cattaatgca acaatgtact gttgttattg
[0049] 1081 atagggtgtg ctttggaatt ctttaggtga gaggagttgc tatgatgaag gaaaacggac
[0050] 1141 ggcagaaaca ctaaccatgg attatcaccg aggtgcagat gtcgaggtaa ttgtttttga
[0051] 1201 tatattacta gactgcaagg tgcaagctat aatgacacgc ttattttgtt attaggatct
[0052] 1261 ttgggtgtat aaaatttgca tgatgttgtt tgtatatcag tggttttact cggtgcttct
[0053] 1321 caatagatct gctcctttca gatgatgaat gcaattctac aggatcatgc actgtcaaaa
[0054] 1381 attactggtt gttgttgaaa tggcagtcat aaaatgttaa gcttttattt gtatattcaa
[0055] 1441 taagttgatg catgtgtgtt ctagacaatc aattctgtag acaataaatt gtgaactgag
[0056] 1501 ttggagctac ctttatatct ggtaaaatag agtttattat tgattagagc gtacagtatt
[0057] 1561 tgagaatggc ctgcaatcaa caagccaatt ccttgatttg ttgcatggct ttgacctctt
[0058] 1621 tgagggccta aataattcaa tttggcgcat tatgtttgat ggaagtgttt tcattcgaaa
[0059] 1681 gaaatcacgt aatgtacttg tgtagaaagc gatataatgg tctgctattt taatgttgga
[0060] 1741 aagcacatgg ttttcaggca tgattttatt cattgttctt ctggaaataa ctgcaaaggt
[0061] 1801 tcaacatgaa tctaatgtct ttacaaaatt atctgctata gttacttcaa aaatgcactc
[0062] 1861 aacattgctt agatcggtca cttgtcttca gacaaatatt ggaatacaat gtgaatgaat
[0063] 1921 aagagtaatt aatttttcat ggagttgtca ggcataatgc tatcctttct tctgacagtt
[0064] 1981 tcagcactct accagtccat ctgtgttact tcctttataa ttgttgattt gtttgggtag
[0065] 2041 gttgaaggga ttgggcaggg cagggcagat tttcttctta tccacttgaa tttgcctgtt
[0066] 2101 caaaatgtta tcaatttaat ttgacgtggt gtgcctgatg tccacatcct acaatgttta
[0067] 2161 aatggttgca tgaaactgga aactgacaac accacccttc cttctggcac tgttaaacta
[0068] 2221 ttggtccaag tttcacccat tcctatttat gcaaagtcct caaagcttga catttatctt
[0069] 2281 cacttcttca aagattagtt ggctagatca gctgctcctg ggctttgcca catgtagaaa
[0070] 2341 agggatgggt gatataagcc aggttttaag ttaatatcat taccgattga aataaatgaa
[0071] 2401 atttgcttat agaaatgcgt tgtttaactt gaagactagt aaacttgatg aactacccat
[0072] 2461 agcctttgtg tgggcagtaa agggtgggtt agattggccc aggtctttgg tgaaaatagc
[0073] 2521 tactattgaa ataaatgaat ttagtttata gaaaatgatg aatagttgca gcgatatata
[0074] 2581 gcattcattg tctactctgt tgcagcagct tgggttcaaa agaagcttgt acccattttt
[0075] 2641 ttctcataac tggtgaattt ctccaattat ttgatgctga gaatgcaaca ctttaagcct
[0076] 2701 tatgtcatct gtgctgatat gatatcagct gttttgtgtt gtctgtgttg cctatttttc
[0077] 2761 tatcctgcaa tggctgctct tgcatatatg tgcttagtta actggcggga aatgggctaa
[0078] 2821 taatggctct ttccatttgc aggtgcgtat tgctcgcata tttaatacat atgggcctcg
[0079] 2881 catgtgtttg gatgatggac gtgttgtcag taatttcgtt gctcaggtat tattctcctt
[0080] 2941 tttcaggctg tgatgttggc aatagactgc catttgaatt ttgggatatc taaataaaat
[0081] 3001 tctgctttct ataatttttt tttaactagt tgaacaatgt ttgcaggtca ttcgcaaaca
[0082] 3061 gccaatgact gtatatgggg atgggaaaca aactaggagc ttccaatatg tttctgacct
[0083] 3121 ggtatgttgc tattatccac atttccattt tactgccagc atttaaaatt tcatgaaagc
[0084] 3181 tgtatggcct ttgagatcct ttatttcaat gcaaactact caaaacacat ttgtagttgc
[0085] 3241 tattcatggc cagcaatcag ggaagtggtt gcataaggtt ttggaaaaga aggtgctaga
[0086] 3301 gttgatgaat tctatttttc taaagaacca aatagagaat aattgcaaat gcagagaata
[0087] 3361 tcttgaacat taaatatgtt ttgggattcc tgtttaggtt tttaaagtta acatgataaa
[0088] 3421 gaatgctaaa agccttttcc attgacaggt tgatgggctg gtggctctaa tggaaggcga
[0089] 3481 gcatgtggga cctttcaacc ttggcaaccc aggagagttc actatgctcg agcttgcaga
[0090] 3541 ggtttgtctt ccaacaaatt ttttagtctt cttattttta aagagacacg gattcctttt
[0091] 3601 ccgagtgccc ccaatcacct tatcttggtg agattcaaaa caaggctcta ttagtttaga
[0092] 3661 attgcttgct cccaagtgtg tgtgcatggg gagatagaga tagagatagt gaaagatgga
[0093] 3721 aactcctagt tgatgttggc acttaatttt tccgccgtat tatgaaggtt gtcaaggaga
[0094] 3781 ccattgattc aagtgcaaca atagaattca aacccaacac tgctgatgat ccacataaga
[0095] 3841 ggaaacctga tataagtaaa gcgaaggagc tgctgaattg ggagccaaga atttctttga
[0096] 3901 gagaaggatt gcctctcatg gtgaatgatt tccggagtcg cattttgaat ggagatgaag
[0097] 3961 ggaaagggct ttaaataaaa tgatcgacag aactacgatg tatagtgtca agaccttgt
[0098] 根據本發明一種典型的實施方式,提供一種篩選楊樹生長及材性性狀的PtUXSl SNP位點。該SNP位點為毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位堿基。
[0099] 本發明采用連鎖-連鎖不平衡作圖策略獲得楊樹半纖維素合成相關基因 PtUXSl 內與木材品質性狀(α -纖維素含量)顯著關聯的功能SNP標記(SNP10),即毛白楊尿苷二 磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位堿基,為開展林木全基因組水平的關聯作圖研究提供 了重要的理論基礎。本發明確定的功能SNP位點為早期篩選高纖維素含量的優異用材新種 質,縮短林木育種選擇周期提供了新的育種策略,對發展楊樹速生豐產紙漿林、確保我國林 業持續穩定地提供高得率工業紙漿原料具有重要的戰略意義。
[0100] 毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位為C/G。
[0101] 根據本發明一種典型的實施方式,提供一種篩選楊樹生長及材性性狀的方法。該 方法包括以下步驟:S1,提取毛白楊的基因組DNA ;S2,測定毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸 脫羧酶基因第463位的基因型;S3,根據毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位 基因型進行篩選。
[0102] 本發明的發明人發現,毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因型 為GG時,對應的毛白楊個體α-纖維素含量最高。毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基 因第463位基因型為CC時,對應的毛白楊個體α -纖維素含量最低。
[0103] 優選地,步驟S2中在測定毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因 型時用的引物為 SEQ ID NO. 2、SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4,且 SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4 的3'末端第一個脫氧核苷酸LNA修飾。采用上述引物,能夠高效、準確地鑒定出SNP位點 的喊基。
[0104] SEQ ID NO. 2 :PtUXSl-SNP10F:5'-TGCTAAAACACCCCAGATCTCT-3'。
[0105] SEQ ID NO. 3 :PtUXSl-SNP10GR:5'-GCCGATCCCAGCTGGGACC-3'。
[0106] SEQ ID NO. 4 :PtUXSl-SNP10CR:5,-GCCGATCCCAGCTGGGACG-3,。
[0107] 根據本發明一種典型的實施方式,提供一種篩選楊樹生長及材性性狀的試劑盒。 該試劑盒包括堿基序列為SEQ ID NO. 2、SEQ ID NO. 3及SEQ ID NO. 4的引物,且SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4的3'末端第一個脫氧核苷酸LNA修飾。采用上述引物,能夠高效、準確 地鑒定出毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位的基因型,可以在楊樹生長的 早期就能夠高效、準確地鑒定出具有優良纖維品質的單株,從而大大加速育種進程,縮短選 育周期。
[0108] 優選地,該試劑盒進一步包括PCR擴增試劑,擴增試劑包括PCR擴增緩沖液, SSmmolL-1MgCl2, IOmmolL-1 dNTP,Taq DNA 聚合酶和雙蒸水。
[0109] 根據本發明一種典型的實施方式,提供一種毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶 基因第463位PtUXSl SNP位點在楊樹分子標記輔助選擇育種中的應用。
[0110] 本發明中提及的分子生物學技術,本領域技術人員均可按照常規操作進行,以下 對本發明優選的實驗步驟做詳細的描述:
[0111] (1)群體構建
[0112] 關聯作圖群體:由426株取自山東冠縣毛白楊種質資源基因庫的基因型個體組 成,基本覆蓋了毛白楊天然分布范圍。
[0113] 連鎖作圖群體:以銀腺楊"YX01"為母本,毛白楊"LM50"為父本進行雜交,在獲得 的5000株Fl代中隨機選取1200株個體,構成連鎖作圖群體。
[0114] 利用 Near Infrared Ref lectance Spectroscopy (NIRS)儀器(MPA 傅立葉型)測 定木材化學成分如木質素含量、綜纖維素含量及α -纖維素含量;采用纖維測定儀測定木 材物理性質如纖維長和纖維寬,利用X-衍射儀測定微纖絲角;并測定樹高、胸徑、樹高/胸 徑和材積等生長性狀。
[0115] (2)單核苷酸多態性位點檢測
[0116] 從關聯作圖群體中選取能夠最大程度反映毛白楊分布范圍的44株基因型個體, 通過直接測序方法得到DNA序列,經分析發現該基因包含6個內含子,利用MEGA4. 0軟件中 的Cluster W程序比對44株基因型個體的序列后獲得PtUXSl基因內82個常見SNP位點 (頻率彡0· 10)。
[0117] (3)基因型分型
【權利要求】
1. 一種篩選楊樹生長及材性性狀的PtUXSl SNP位點,其特征在于,所述SNP位點為毛 白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位堿基。
2. 根據權利要求1所述的PtUXSl SNP位點,其特征在于,所述毛白楊尿苷二磷酸葡萄 糖醛酸脫羧酶基因第463位為C/G。
3. -種篩選楊樹生長及材性性狀的方法,其特征在于,包括以下步驟: S1,提取毛白楊的基因組DNA ; 52, 測定毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位的基因型; 53, 根據所述毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因型進行篩選。
4. 根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧 酶基因第463位基因型為GG時,對應的毛白楊個體α -纖維素含量最高。
5. 根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧 酶基因第463位基因型為CC時,對應的毛白楊個體α -纖維素含量最低。
6. 根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述步驟S2中在測定毛白楊尿苷二磷酸 葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位基因型時用的引物為SEQ ID NO. 2、SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4,且SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4的3'末端第一個脫氧核苷酸LNA修飾。
7. -種篩選楊樹生長及材性性狀的試劑盒,其特征在于,包括堿基序列為SEQ ID NO. 2、SEQ ID NO. 3 及 SEQ ID NO. 4 的引物,且 SEQ ID NO. 3、SEQ ID NO. 4 的 3' 末端第一 個脫氧核苷酸LNA修飾。
8. 根據權利要求7所述的試劑盒,其特征在于,進一步包括PCR擴增試劑,所述擴增試 劑包括PCR擴增緩沖液,ΙΟι?ι?οΙΓΜΝΤΡ,Taq DNA聚合酶和雙蒸水。
9. 毛白楊尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脫羧酶基因第463位PtUXSISNP位點在楊樹分子標記 輔助選擇育種中的應用。
【文檔編號】C12Q1/68GK104293891SQ201310298649
【公開日】2015年1月21日 申請日期:2013年7月16日 優先權日:2013年7月16日
【發明者】張德強, 潘煒, 杜慶章 申請人:北京林業大學