用于治療肺疾病和損傷的組合物和方法
【專利摘要】本文公開了用于治療哺乳動物的肺疾病、病癥和損傷的治療方法,其包括治療急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、肺氣腫、肺移植之后的閉塞性細支氣管炎以及肺移植誘發的急性移植物功能障礙,包括治療、預防原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、肺再移植反應、肺移植之后的閉塞性細支氣管炎和/或器官移植(特別在肺移植中)之后的原發性移植物功能障礙(PGD)的或阻止所述疾病發展,包括下調TLR2基因或TLR2基因與TLR4基因兩者。本文提供了用于治療肺疾病、病癥和損傷的組合物、方法以及試劑盒。
【專利說明】用于治療肺疾病和損傷的組合物和方法
[0001]相關申請
[0002]本申請要求2011年3月3日提交、名稱為“用于治療肺疾病和損傷的組合療法(Combination Therapy for Treating Lung Disease And Injury) ” 的美國臨時申請序列號61/448,723的權益,并且所述申請以引用的方式整體并入本文并用于所有的目的。
[0003]序列表
[0004]本申請包含名稱為228-PCTl_ST25.txt、在2012年2月6日創建且大小為2,280kb的序列表,并且所述序列表以引用的方式整體并入本文。
[0005]在本申請中引用了各種專利和出版物。這些文件的公開內容以引用的方式整體并入本申請以更充分地描述本發明所屬領域的狀態。
發明領域
[0006]本文提供了用于治療肺疾病和損傷的組合物、方法以及試劑盒。
[0007]發明概述
[0008]本文提供了用于治療肺疾病的組合物、方法以及試劑盒。在某些方面和實施方案中,提供了用于治療哺乳動物的肺病癥或損傷的療法的組合物和方法,其包括治療急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素(bleomycin)誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、肺氣腫、肺移植誘發的急性移植物功能障礙以及肺移植之后的閉塞性細支氣管炎。在某些方面和實施方案中,提供了用于治療或預防與 器官移植(特別是肺移植)相關的炎癥和/或移植物排斥的組合療法的組合物和方法,其包括治療、預防或減弱原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、肺再移植反應、肺移植之后的閉塞性細支氣管炎和/或器官移植之后(特別在肺移植中)的原發性移植物功能障礙(PGD)的發展。在某些方面和實施方案中,提供了用于治療哺乳動物的肺病癥或損傷的組合療法的組合物和方法。所述組合物和方法涉及抑制基因Toll樣受體2(TLR2)或基因Toll樣受體2 (TLR2)和 Toll 樣受體 4 (TLR4)。
[0009]在各種方面和實施方案中,本文提供的組合物、方法和試劑盒可以靶向、減少、下調或抑制基因Toll樣受體2 (TLR2)的表達/活性/功能。在各種方面和實施方案中,本文所提供的組合物、方法和試劑盒可以靶向、減少、下調或抑制以下基因的表達/活性/功能:(i)Toll 樣受體 2(TLR2)和(ii) Toll 樣受體 4 (TLR4)。
[0010]一方面,提供了一種用于治療有需要的哺乳動物的肺病癥、疾病或損傷的方法。所述方法可以包括以有效治療所述哺乳動物的量對所述哺乳動物施用選自TLR2抑制劑或其藥學上可接受鹽或前藥的至少一種治療劑。
[0011]另一方面,提供了一種用于治療有需要的哺乳動物的肺病癥、疾病或損傷的方法。所述方法可以包括以有效治療所述哺乳動物的量對所述哺乳動物施用選自以下的至少兩種治療劑:(i)TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及(ii)TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥。[0012]所述方法可以包括預防、治療、改善和/或減慢受試者的肺病癥或損傷的發展,所述肺病癥或損傷如但不限于ARDS、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、COPD以及與肺移植相關的疾病、病癥或損傷。所述方法可以涉及通過對所述受試者施用治療有效量的針對基因TLR2的治療劑來治療、改善和/或減慢上述疾病或病狀或其相關癥狀或并發癥的發展。所述方法可以涉及通過對所述受試者施用治療有效量的至少一種下調TLR2的治療劑和至少一種下調TLR4的治療劑來治療、改善和/或減慢上述疾病或病狀或其相關癥狀或并發癥的發展。所述方法可以涉及通過對所述受試者施用治療有效量的能夠下調基因TLR2和TLR4和/或基因TLR2和TLR4的基因產物的單一治療劑來治療、改善和/或減慢上述疾病或病狀或其相關癥狀或并發癥的發展。
[0013]在各種實施方案中,所提供的治療肺疾病、病癥或損傷的方法包括與選自由以下組成的組的一種或多種另外的治療方法組合來抑制基因Toll樣受體2(TLR2):手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗生素療法、抗病毒療法、抗真菌療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法以及營養補充劑。在各種實施方案中,在所提供的用于治療肺病癥、疾病或損傷的方法之前、之后或同時施用另外的治療。在各種實施方案中,所提供的治療肺疾病、病癥或損傷的方法包括與免疫抑制劑療法組合來抑制基因Toll樣受體2(TLR2)。在各種實施方案中,所提供的治療肺疾病、病癥或損傷的方法包括與選自由以下組成的組的一種或多種另外的治療方法組合來抑制基因Toll樣受體2 (TLR2)和Toll樣受體4(TLR4):手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗生素療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法以及營養補充劑。在各種實施方案中,所提供的治療肺疾病、病癥或損傷的方法包括與免疫抑制劑療法組合來下調基因Toll樣受體2(TLR2)和基因Toll樣受體4(TLR4)。
[0014]在某些實施方案中,所提供的方法可以包括以下一種或多種:
[0015]A.施用包含選自TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的治療劑;以及藥學上可接受的載劑的藥物組合物;或者
[0016]B.聯合施用(例如同時或按序`)治療有效量的至少兩種治療劑,其中至少一種治療劑是用于下調基因TLR2并且至少一種治療劑是用于下調基因TLR4 ;并且所述治療劑選自:(i)TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及(ii)TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;或者
[0017]C.施用包含至少兩種治療劑的組合的藥物組合物,其中至少一種治療劑是用于下調基因TLR2并且至少一種治療劑是用于下調基因TLR4 ;并且所述治療劑選自:(i)TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及(ii)TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑;或者
[0018]D.施用包含能夠下調基因TLR2和TLR4和/或基因TLR2和TLR4的基因產物的治療劑的藥物組合物。這些單一藥劑的非限制性實例是在PCT專利公布號W02007/091269中公開的串聯且多臂的RNAi分子。
[0019]一方面,提供了一種藥劑,其包括靶向、減少、下調或抑制基因TLR2的表達/活性/功能的治療劑或其藥學上可接受的鹽或前藥。適用于如本文所提供的組合中的治療劑包括但不限于小有機分子化合物;蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。
[0020]一方面,提供了一種藥劑,其包括靶向、減少、下調或抑制以下基因的表達/活性/功能的至少兩種治療劑:(i)TLR2和(ii)TLR4,其中至少一種治療劑下調基因TLR2并且至少一種治療劑下調基因TLR4 ;并且所述治療劑選自:(i)TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及(ii)TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥。適用于如本文提供的組合中的治療劑包括但不限于小有機分子;蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。
[0021]在一些實施方案中,所述治療劑包含核酸分子。在一些實施方案中,各核酸分子獨立地選自由以下組成的組:結合編碼選自TLR2和TLR4的靶基因的核苷酸序列(如mRNA序列)的反義分子、短干擾核酸(siNA)、短干擾RNA (siRNA)、雙鏈RNA (dsRNA)、微RNA (miRNA)或短發夾RNA(shRNA),例如:
[0022]?如 SEQ ID N0:l(gi|68160956|ref|NM_003264.3| 智人 Toll 樣受體 2(TLR2),mRNA)所例示的人TLR2的mRNA編碼序列,或者
[0023]?如 SEQ ID N0:2(gi |207028550|ref |NR_024169.1 智人 Toll 樣受體 4 (TLR4),轉錄變異體4,非編碼mRNA)所例示的人TLR4的mRNA編碼序列;或者
[0024]?如 SEQ ID NO: 3 (gi | 207028620 | ref | NM_138554.3 智人 Toll 樣受體 4 (TLR4),轉錄變異體1,mRNA)所例示的人TLR4的mRNA編碼序列;或者
[0025]?如 SEQ ID NO:4 (gi |207028451 |ref I NR_024168.1 智人 Toll 樣受體 4 (TLR4),轉錄變異體3,非編碼RNA)所例示的人TLR4的mRNA編碼序列。
[0026]在各種實施方案中,各核酸分子是或包括dsRNA分子或siRNA分子。在各種實施方案中,所述核酸分子(a)包括有義鏈和反義鏈;(b)所述核酸分子的各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;(c)反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼人TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)或TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2至4)的mRNA序列互補;并且(d)有義鏈的17至40個核苷酸序列與反義鏈的序列互補并且`包括編碼人TLR2(例如,SEQ ID NO:1)或TLR4 (例如,SEQ IDNO: 2至4)的mRNA的17至40個核苷酸序列。
[0027]如本文所提供的藥物產品可例如為包含處于藥學上可接受的載劑中的治療劑的藥物組合物。如本文所提供的藥物產品可以例如是包含處于藥學上可接受的載劑中的第一和第二治療劑的混合物的藥物組合物。或者,所述藥物產品可例如為包含第一治療劑的制劑和第二治療劑的制劑以及任選地用于對有需要的患者同時、連續或單獨地施用所述制劑的說明書的試劑盒。
[0028]在第一個方面,提供了一種預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法,其包括對所述受體施用治療有效量的至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及治療有效量的至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥,由此預防或減輕所述受體的PGD癥狀。在各種實施方案中,PGD癥狀包括炎癥、急性移植物排斥、移植物排斥、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、肺功能受損、閉塞性細支氣管炎、血氧合作用受損、炎癥性細胞因子的產生增加、移植物內和氣道內粒細胞積累、肺水腫以及血氧不足。
[0029]在一些實施方案中,肺移植受體是具有發展原發性移植物功能障礙(PGD)的風險或者正在治療原發性移植物功能障礙(PGD)的人。在一些實施方案中,如本文提供的所述方法可以例如用于預防或減輕冷缺血相關的PGD的癥狀。或者,所述方法可以例如用于預防或減輕熱缺血相關的PGD的癥狀。
[0030]在各種實施方案中,施用所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥引起以下一種或多種結果:肺水腫減輕、血氧合作用增加、血氧合作用得到保持、肺功能得到改善、肺移植受體的肺功能得到保持以及移植的肺的肺功能得到改善。
[0031]在各種實施方案中,在肺移植之前、期間或之后對肺移植受體施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
[0032]在一些實施方案中,在同一制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。或者,在不同制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
[0033]在一些實施方案中,通過相同途徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在其它實施方案中,通過不同途徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在各種實施方案中,所述方法包括同時施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在一些實施方案中,所述方法包括單獨施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在一些實施方案中,所述方法包括組合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在其它實施方案中,所述方法包括連續施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
[0034]在各種實施方案中,所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法進一步包括選自由以下組成的組的至少一種另外的治療:手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法、營養補充劑及其任意組合。在各種實施方案中,在施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑之前、之后或同時施用所述另外的治療。在一些實施方案中,所述另外的治療包括免疫抑制劑療法。
[0035]在各種實施方案中,施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑的途徑選自:全身性施用或局部施用。在各種實施方案中,對肺移植受體施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑的方法選自包括以下的組:靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、直接注射、氣管內滴注、吸入、鼻內、肺部以及經由泵施用到肺中。在一些實施方案中,通過吸入對肺移植受體施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑。在另外的實施方案中,通過氣管內滴注對肺移植受體施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑。
[0036]在所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法的各種實施方案中,所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑各自獨立地選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。在一些實施方案中,至少一種抑制劑包含核酸分子。在其它實施方案中,各抑制劑包含核酸分子。在一些實施方案中,各抑制劑包含核酸分子并且第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸一個接另一個地串聯地連接或形成RNAistar時退火。
[0037]在一些實施方案中,所述第一雙鏈寡核苷酸包含:
[0038](a)有義鏈和反義鏈;[0039](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0040](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且
[0041](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;
[0042]并且所述第二雙鏈寡核苷酸包含:
[0043](a)有義鏈和反義鏈;
[0044](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0045](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;以及
[0046](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。[0047]在各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出,并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2, SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0048]在一些實施方案中,在同一制劑中對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在其它實施方案中,在不同制劑中對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,通過相同途徑對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,通過不同途徑對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在各種實施方案中,對肺移植受體施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸的模式選自包括以下的組:單獨施用、組合施用、同時施用以及連續施用。
[0049]在一些實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用一次。在其它實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用至少一天一次。在其它實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用多次。
[0050]在所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al):
[0051](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0052]3’Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈)
[0053]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0054]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0055]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0056]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0057]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0058]在結構(Al)的各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出,并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3和SEQ ID NO:4中的任一個中列出。
[0059]在結構(Al)的一些優選實施方案中,x=y=19。
[0060]在結構(Al)的一些實施方案中,(N)X包含選自由具有SEQ ID NO:723-1440,2247-3052,7076-8312和8459-8604的寡核苷酸組成的組的反義寡核苷酸并且(N’)y包含選自由具有SEQ ID NO: 5-722,1441-2246,5839-7075以及8313-8458的寡核苷酸組成的組的互補有義鏈寡核苷酸。
[0061]在所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法的各種實施方案中,結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的所述至少一種雙鏈寡核苷酸和結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的所述至少一種雙鏈寡核苷酸的施用分別引起TLR2表達和TLR4表達的下調。
[0062]在所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法的一些實施方案中,至少一種雙鏈化合物獨立地包含結構(A2).[0063](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0064]3,Z,-N2_(N,)y - z” 5, (有義鏈)
[0065]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0066]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0067]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0068]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補并且其中(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補;
[0069]其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的所述mRNA錯配;
[0070]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳脫氧核糖核苷、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0071]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0072]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0073]在結構(A2)的各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出,并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3和SEQ ID NO:4中的任一個中列出。
[0074]在結構(A2)的一些優選實施方案中,x=y=18。
[0075]在結構(A2)的一些實施方案中,(N)X的序列包含選自由具有SEQ IDNO:4153-5252,5546-5838,10319-12032以及12085-12136的寡核苷酸組成的組的反義鏈寡核苷酸并且(N,)y的序列包含選自由具有SEQ ID NO: 3053-4152,5253-5545,8605-10318以及12033-12084的寡核苷酸組成的組的有義鏈寡核苷酸。
[0076]在第二方面,提供了一種用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法,所述方法包括對所述患者施用至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的治療有效組合,由此治療所述患者的肺病癥、疾病或損傷。在各種實施方案中,所述肺病癥、疾病或損傷選自急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、與肺移植相關的病癥以及肺氣腫。在一些實施方案中,所述肺病癥、疾病或損傷是與肺移植相關的病癥。在各種實施方案中,與肺移植相關的所述肺病癥選自由以下組成的組:炎癥、移植物排斥、原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、急性移植物功能障礙、肺再移植反應、閉塞性細支氣管炎以及原發性移植物功能障礙(PGD)。在一個實施方案中,與肺移植相關的所述肺病癥是PGD。
[0077]在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的一些實施方案中,在同一制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在其它實施方案中,在不同制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在各種實施方案中,通過相同途徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在其它實施方案中,通過不同途徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。在各種實施方案中,施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑的模式選自包括以下的組:單獨施用、組合施用、同時施用以及連續施用。
[0078] 在一些實施方案中,所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法進一步包括選自由以下組成的組的至少一種另外的治療:手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法、營養補充劑及其任意組合。在一些實施方案中,所述另外的治療包括免疫抑制劑療法。在各種實施方案中,在施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑之前、之后或同時施用所述另外的治療。
[0079]在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的一些實施方案中,所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑的對所述患者的施用包括全身性施用或局部施用。在各種實施方案中,施用方法選自包括以下的組:靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、直接注射、氣管內滴注、吸入、鼻內、肺部以及經由泵施用到肺中。在一些實施方案中,施用方法包括吸入。在一些實施方案中,施用方法包括氣管內滴注。
[0080]在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的一些實施方案中,所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑各自是獨立地選自由以下組成的組的抑制劑:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。在一些實施方案中,至少一種抑制劑包含核酸分子。在其它實施方案中,各抑制劑包含核酸分子。在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的各種實施方案中,第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸一個接另一個地串聯地連接或形成RNAistar時退火。
[0081]在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的一些實施方案中,所述第一雙鏈寡核苷酸包含:
[0082](a)有義鏈和反義鏈;
[0083](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0084](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且
[0085](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;[0086]并且所述第二雙鏈寡核苷酸包含:
[0087](a)有義鏈和反義鏈;
[0088](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0089](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且
[0090](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
[0091]在各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2, SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0092]在一些實施方案中,在同一制劑中對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在其它實施方案中,在不同制劑中對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,通過相同途徑對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,通過不同途徑對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在各種實施方案中,對肺移植受體施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸的模式選自包括以下的組:單獨施用、組合施用、同時施用以及連續施用。
[0093]在一些實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次。在其它實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用至少一天一次。在其它實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用多次。
[0094]在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸包`含結構(Al):
[0095](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0096]3’Z’-(N’)y_z” 5’ (有義鏈)
[0097]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0098]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0099]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0100]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0101]其中(N’)y的序列與(N) X的序列互補;并且其中(N) X包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0102]在結構(Al)的各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸`序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0103]在結構(Al)的一些優選實施方案中,x=y=19。
[0104]在結構(Al)的一些實施方案中,(N)X包含選自由具有SEQ ID NO:723-1440,2247-3052,7076-8312以及8459-8604的寡核苷酸組成的組的反義寡核苷酸并且(N’)y包含選自由具有SEQ ID NO: 5-722,1441-2246,5839-7075以及8313-8458的寡核苷酸組成的組的有義鏈寡核苷酸。[0105]在所提供的用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法的一些實施方案中,至少一種雙鏈化合物包含結構(A2):
[0106](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0107]3,Z,-N2_(N,)y - z” 5, (有義鏈)
[0108]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0109]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0110]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0111]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補并且其中(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補;
[0112]其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的所述mRNA錯配;
[0113]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳脫氧核糖核苷、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0114]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0115]其中Z和V各自獨立 地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0116]在結構(A2)的各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0117]在結構(A2)的一些優選實施方案中,x=y=18。
[0118]在結構(A2)的一些實施方案中,(N)X的序列包含選自由具有SEQ IDNO:4153-5252,5546-5838,10319-12032以及12085-12136的寡核苷酸組成的組的反義寡核苷酸并且(N,)y的序列包含選自由具有SEQ ID NO:3053-4152、5253-5545、8605_10318以及12033-12084的寡核苷酸組成的組的有義寡核苷酸。
[0119]另一方面,提供了一種組合物,其包含:至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑。在各種實施方案中,各抑制劑獨立地選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。在一些實施方案中,各抑制劑獨立地選自由以下組成的組:小有機分子;蛋白質;抗體或其片段;以及核酸分子。
[0120]在所提供的組合物的一些實施方案中,各抑制劑包含核酸分子。在一些實施方案中,第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。在所述組合物的一些實施方案中,所述核酸分子串聯地連接或形成RNAistar時退火。
[0121]在所提供的組合物的一些實施方案中,第一雙鏈寡核苷酸包含:
[0122](a)有義鏈和反義鏈;
[0123](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;[0124](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且
[0125](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;
[0126]并且第二雙鏈寡核苷酸包含:
[0127](a)有義鏈和反義鏈;
[0128](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0129](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且
[0130](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
[0131]在各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2, SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0132]在一些實施方案中,組合物中各雙鏈寡核苷酸的量的范圍獨立地為約0.05mg至約 10.0mg0
[0133]在所提供的組合物的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al):
[0134](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0135]3’Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈)
[0136]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0137]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0138]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0139]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0140]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0141]其中(N’)y的序列與(N) X的序列互補;并且其中(N) X包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0142]在所述組合物的各種實施方案中,在結構(Al)中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3和SEQID N0:4中的任一個中列出。
[0143]在所述組合物的一些優選實施方案中,在結構(Al)中,x=y=19。
[0144]在所述組合物的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸化合物獨立地包含結構(A2):
[0145](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0146]3’Z’ -N2_(N’)y_z”5’(有義鏈)
[0147]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0148]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0149]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0150]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補并且(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補;[0151]其中NI共價結合于(N)X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配;
[0152]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0153]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0154]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0155]在所提供的組合物的各種實施方案中,在結構(A2)中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0156]在所提供的組合物的一些優選實施方案中,在結構(A2)中,x=y=18。
[0157]在一些實施方案中,配制所提供的組合物以用于對所述受體施用一次。在其它實施方案中,配制所提供的組合物以用于對所述受體施用至少一天一次。在其它實施方案中,配制所提供的組合物以用于對所述受體施用多次。
[0158]另一方面,提供了一種試劑盒,其包含至少兩種治療劑,其中至少一種藥劑包含TLR2抑制劑并且第二藥劑包含TLR4抑制劑;以及任選地使用說明書。
[0159]在所提供的試劑盒的一些實施方案中,各治療劑獨立地選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。在所述試劑盒的一些實施方案中,至少一種治療劑包含核酸分子。`在所提供的試劑盒的其它實施方案中,各治療劑包含核酸分子。
[0160]在所提供的試劑盒的一些實施方案中,第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。在所述的一些實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸一個接另一個地串聯地連接或形成RNAistar時退火。
[0161]在所提供的試劑盒的一些實施方案中,第一雙鏈寡核苷酸包含:
[0162](a)有義鏈和反義鏈;
[0163](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0164](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR24的mRNA的序列互補;并且
[0165](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;
[0166]并且所述第二雙鏈寡核苷酸包含:
[0167](a)有義鏈和反義鏈;
[0168](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0169](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且
[0170](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
[0171]在所提供的試劑盒的各種實施方案中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。[0172]在所述試劑盒的一些實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于在同一制劑中對受體聯合施用。在其它實施方案中,在不同制劑中對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,通過相同途徑對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在一些實施方案中,通過不同途徑對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。在各種實施方案中,對肺移植受體施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸的模式選自包括以下的組:單獨施用、組合施用、同時施用以及連續施用。
[0173]在所提供的試劑盒的一些實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次。在其它實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用至少一天一次。在其它實施方案中,配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用多次。
[0174]在所提供的試劑盒的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al):
[0175](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0176]3’Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈)
[0177]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0178]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0179]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0180]其中z”可以是存 在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0181]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0182]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補;并且其中(N) x包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0183]在所提供的試劑盒的各種實施方案中,在結構(Al)中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0184]在所提供的試劑盒的一些優選實施方案中,在結構(Al)中,x=y=19。
[0185]在所提供的試劑盒的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(A2):
[0186](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0187]3’Z’ -N2_(N’)y_z” 5’ (有義鏈)
[0188]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0189]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0190]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0191]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補并且(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補;[0192]其中NI共價結合于(N)X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配;
[0193]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0194]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0195]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0196]在所提供的試劑盒的各種實施方案中,在結構(A2)中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出并且TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID N0:3和SEQ ID N0:4中的任一個中列出。
[0197]在所提供的試劑盒的一些優選實施方案中,在結構(A2)中,x=y=18。
[0198]另一方面,提供了一種包裝,其包含:A)至少兩個選自以下的單獨劑量單位:(i)包含TLR2抑制劑的至少一個劑量單位和(ii)包含TLR4抑制劑的至少一個劑量單位;以及任選地B)包含用于使用劑量單位的說明書的包裝插頁。
[0199]在所提供的包裝的各種實施方案中,所述TLR2抑制劑是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸并且所述TLR4抑制劑是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈
寡核苷酸。
[0200]在所提供的包裝的一些實施方案中,所述TLR2抑制劑是包含以下的雙鏈寡核苷酸:
[0201](a)有義鏈和反義鏈;
[0202](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0203](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且
[0204](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;
[0205]并且所述TLR4抑制劑是包含以下的雙鏈寡核苷酸:
[0206](a)有義鏈和反義鏈;
[0207](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0208](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且
[0209](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
[0210]在所提供的包裝的一些實施方案中,通過相同途徑對患者聯合施用所述劑量單位。在所述包裝的其它實施方案中,通過不同途徑對患者聯合施用所述劑量單位。在各種實施方案中,施用所述劑量單位的模式選自包括以下的組:單獨施用、組合施用、同時施用以及連續施用。
[0211]在所提供的包裝的一些實施方案中,所述劑量單位被設計為對所述患者施用一次。在其它實施方案中,所述劑量單位是用于對所述患者施用至少一天一次。在其它實施方案中,所述劑量單位是用于對所述患者施用多次。
[0212]在所提供的包裝的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al):[0213](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0214]3,Z,-(N,)y_z” 5, (有義鏈)
[0215]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0216]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0217]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0218]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0219]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0220]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0221]在所提供的包裝的一些實施方案中,至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(A2):
[0222](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0223]3’Z’ -N2_(N’)y_z” 5’ (有義鏈)
[0224]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0225]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0226]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0227]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補并且(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補;
[0228]其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配;
[0229]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0230]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0231]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0232]在所提供的試劑盒或所提供的包裝的各種實施方案中,所述說明書或包裝插頁指示所述治療劑或劑量單位適合用于治療罹患選自由以下組成的組的肺疾病、損傷或病癥的患者:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、與肺移植相關的病癥以及肺氣腫。在所提供的試劑盒或所提供的包裝的一些實施方案中,所述說明書或包裝插頁指示所述治療劑或劑量單位適合用于治療罹患與肺移植相關的病癥的患者。
[0233]在所提供的試劑盒或所提供的包裝的一些實施方案中,與肺移植相關的肺病癥選自由以下組成的組:炎癥、移植物排斥、原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷 、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、急性移植物功能障礙、肺再移植反應、閉塞性細支氣管炎以及原發性移植物功能障礙(PGD)。
[0234]另一方面,提供了一種預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法,所述方法包括對所述受體施用治療有效量的至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥,由此預防或減輕受體的PGD的癥狀。
[0235]在所提供的方法的一些實施方案中,肺移植受體是正在治療原發性移植物功能障礙(PGD)的人。在一些實施方案中,所述方法是用于預防或減輕冷缺血相關的PGD的癥狀。在其它實施方案中,所述方法是用于預防或減輕熱缺血相關的PGD的癥狀。在所提供的方法的各種實施方案中,所述癥狀選自由以下組成的組:炎癥、急性移植物排斥、移植物排斥、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、肺功能受損、閉塞性細支氣管炎、血氧合作用受損、炎癥性細胞因子的產生增加、移植物內和氣道內粒細胞積累、肺水腫以及血氧不足。
[0236]在所提供的方法的一些實施方案中,施用治療有效量的至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥引起以下一種或多種:肺水腫減輕、血氧合作用增加、血氧合作用得到保持、肺功能改善、肺移植受體的肺功能得到保持以及移植肺的肺功能得到改善。
[0237]在所提供的方法的各種實施方案中,在肺移植之前、期間或之后對肺移植受體施用所述至少一種TLR2抑制劑。
[0238]在各種實施方案中,所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法進一步包括選自由以下組成的組的至少一種另外的治療:手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法、營養補充劑及其任意組合。在各種實施方案中,在施用至少一種TLR2抑制劑之前、之后或同時施用所述另外的治療。在一些實施方案中,所述另外的治療包括免疫抑制劑療法。
[0239]在所提供的方法的各種實施方案中,施用至少一種TLR2抑制劑的途徑選自:全身性施用或局部施用。
[0240]在各種實施方案中,對肺移植受體施用至少一種TLR2抑制劑的方法選自包括以下的組:靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、直接注射、氣管內滴注、吸入、鼻內、肺部以及經由泵施用到肺中。在一些實施方案中,通過吸入對肺移植受體施用至少一種TLR2抑制劑。在另外的實施方案中,通過氣管內滴注對肺移植受體施用至少一種TLR2抑制劑。
[0241]在所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法的各種實施方案中,所述至少一種TLR2抑制劑選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。在一些實施方案中,至少一種抑制劑包含核酸分子。在一些實施方案中,所述核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
[0242]在所提供的預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法的各種實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸包含:
[0243](a)有義鏈和反義鏈;
[0244](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0245](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且[0246](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
[0247]在所提供的方法的各種實施方案中,配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用一次。在所提供的方法的一些實施方案中,配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用至少一天一次。在其它實施方案中,配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用多次。[0248]在所提供的方法的各種實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸包含結構(Al):
[0249](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0250]3,Z,-(N,)y-z,,5, (有義鏈)
[0251]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0252]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0253]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0254]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0255]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含編碼TLR2的mRNA的反義序列。
[0256]在所提供的方法的各種實施方案中,在結構(Al)中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出。
[0257]在所提供的方法的一些優選實施方案中,在結構(Al)中,x=y=19。
[0258]在所提供的方法的各種實施方案中,在結構(Al)中,(N)X包含存在于SEQ IDNO:723-1440和2247-3052中的反義寡核苷酸并且(N,)y包含存在于SEQ ID N0:5_722和1441-2246中的有義鏈寡核苷酸。
[0259]在所提供的方法的各種實施方案中,所述雙鏈化合物包含結構(A2):
[0260](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0261]3’Z’ -N2_(N’)y_z” 5’ (有義鏈)
[0262]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0263]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0264]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0265]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補并且其中(N)X與編碼TLR2的mRNA中的連續序列互補;
[0266]其中NI共價結合于(N) X并且與編碼TLR2的mRNA錯配;
[0267]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0268]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0269]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。[0270]在所提供的方法的各種實施方案中,在結構(A2)中,TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:1中列出。
[0271]在所提供的方法的一些優選實施方案中,在結構(A2)中,x=y=18。
[0272]在所提供的方法的各種實施方案中,在結構(A2)中,(N)X的序列選自SEQ IDNO:4153-5252 和 5546-5838 中的任一個并且(N,)y 的序列選自 SEQ ID NO:3053-4152 和5253-5545中的任一個。
[0273]在所提供的方法的各種實施方案中,施用結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的至少一種雙鏈寡核苷酸引起TLR2表達的下調。
[0274]另一方面,提供了一種試劑盒或包裝,其包含:含有TLR2抑制劑的至少一個劑量單位;以及任選地使用說明書,其中所述說明書指示所述劑量單位適合用于治療罹患選自由以下組成的組的肺疾病、損傷或病癥的患者:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、與肺移植相關的病癥以及肺氣腫。
[0275] 在一些實施方案中,所提供的試劑盒或包裝用于在治療罹患與肺移植相關的病癥的患者中使用。
[0276]在所提供的試劑盒或包裝的各種實施方案中,所述TLR2抑制劑選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。在所述試劑盒或包裝的一些實施方案中,所述TLR2抑制劑選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質;抗體或其片段;以及核酸分子。在所述試劑盒或包裝的其它實施方案中,所述TLR2抑制劑包含核酸分子。
[0277]在所提供的試劑盒或包裝的一些實施方案中,所述核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。在所述試劑盒或包裝的一些實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸包含:
[0278](a)有義鏈和反義鏈;
[0279](b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0280](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且
[0281](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
[0282]在所提供的試劑盒或包裝的一些實施方案中,配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次。在一些實施方案中,配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用至少一天一次。在所提供的試劑盒或包裝的一些實施方案中,配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用多次。
[0283]在所提供的試劑盒或包裝的一些實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸包含結構(Al):
[0284](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0285]3,Z,-(N,)y-z” 5, (有義鏈)
[0286]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0287]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0288]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。[0289]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0290]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0291]其中(N’) y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含編碼TLR2的mRNA的反義序列。
[0292]在所提供的試劑盒或包裝的一些實施方案中,所述雙鏈寡核苷酸包含結構(A2):
[0293](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0294]3,Z,-N2_(N,)y_z” 5, (有義鏈)
[0295]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0296]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0297]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0298]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補并且(N)X與編碼TLR2的mRNA中的連續序列互補;
[0299]其中NI共價結合于(N) X并且與編碼TLR2的mRNA錯配;
[0300]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核`糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0301]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0302]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0303]在一些實施方案中,所提供的試劑盒或包裝用于在治療罹患與肺移植相關的病癥的患者中使用。在各種實施方案中,與肺移植相關的所述病癥選自由以下組成的組:炎癥、移植物排斥、原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、急性移植物功能障礙、肺再移植反應、閉塞性細支氣管炎以及原發性移植物功能障礙(Pffl))。
[0304]另一方面,提供了包含以下的組合物的用途:至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑,所述用途為用于制備用于治療或預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的藥劑。
[0305]另一方面,提供了包含以下的組合物的用途:至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑,所述用途為用于治療或預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀。
[0306]在所提供的用途的各種實施方案中,肺移植受體是正在治療原發性移植物功能障礙(PGD)的人。在一些實施方案中,所述用途為用于預防或減輕冷缺血相關的PGD的癥狀。在其它實施方案中,所述用途為用于預防或減輕熱缺血相關的PGD的癥狀。
[0307]在所述用途的各種實施方案中,所述癥狀選自由以下組成的組:炎癥、急性移植物排斥、移植物排斥、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、肺功能受損、閉塞性細支氣管炎、血氧合作用受損、炎癥性細胞因子的產生增加、移植物內和氣道內粒細胞積累、肺水腫以及血氧不足。
[0308]另一方面,提供了包含以下的組合物的用途:至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑,所述用途為用于制備用于治療或預防選自以下的肺疾病、病癥或損傷的藥劑:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎以及肺氣腫。
[0309]另一方面,提供了包含以下的組合物的用途:至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑,所述用途為用于治療或預防選自以下的肺疾病、病癥或損傷:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎以及肺氣腫。
[0310]附圖簡述
[0311]圖1示出組合施用25ii g/小鼠的劑量的對TLR2具有特異性的雙鏈RNA(dsRNA)和25 u g/小鼠的劑量的對TLR4具有特異性的雙鏈RNA(dsRNA),有效減輕了移植的小鼠肺中的移植后肺水腫和出血。正位肺移植后24小時時獲得受體的肺的照片。左圖:在肺移植手術結束時(吻合開口后立即)通過氣管內滴注而對所述受體施用dsRNA組合(對TLR2具有特異性的dsRNA和對TLR4具有特異性的dsRNA的組合,各dsRNA為25 y g/小鼠(在圖中標識為“siRNA混合液,25iig”))。右圖:媒介物。箭頭:顯著出血。
[0312]圖2示出靶向TLR2和TLR4基因的雙靶dsRNA組合(第3列和第4列)恢復了所述受體肺的肺功能。肺移植和dsRNA施用后24h時測量小鼠的動脈血的氧合作用。施用靶向TLR2的單一 dsRNA(第5列 和第6列)也顯著有效保留肺功能。然而施用靶向TLR4的單一dsRNA(第8列和第9列)對于保留肺功能無效。對照組由以下組成:(i)施用媒介物的小鼠(一般陰性對照,第2列)和(ii)冷保存僅I小時(I小時冷缺血時間(CIT))后經受肺移植(Tx)的小鼠(再灌注對照,第I列)。
[0313]圖3示出靶向TLR2和TLR4基因的雙靶dsRNA組合(第4至6列)恢復了所述受體肺的肺功能。肺移植和dsRNA施用后24h時測量小鼠的動脈血的氧合作用。陰性對照組由以下組成:正常(完整)小鼠(一般陰性對照,第I列)、以及冷保存僅I小時(I小時冷缺血時間(CIT))后經受肺移植(Tx)的小鼠(再灌注對照,第2列)和用媒介物處理的小鼠(18小時冷缺血時間(CIT),第3列)。
[0314]圖4示出對TLR2具有特異性的dsRNA和對TLR4具有特異性的dsRNA的組合(TLR2_4_S73 和 TLR4_4_S500)(第 3 列)、以及包含對 TLR2 具有特異性的 dsRNA (TLR2_4_S73)的個別處理(第4至6列)減少了從移植的肺中獲得的BAL中的氣道內粒細胞積累。肺移植后24h時,從所有小鼠收集BAL。通過FACS測量細胞總量和不同細胞群(嗜中性粒細胞、淋巴細胞、單核細胞、嗜酸性粒細胞、嗜堿性粒細胞)的量。將不同的細胞計數作為總細胞計數的分數呈示。
[0315]圖5示出在同種異基因移植后第7天,用對TLR2具有特異性的dsRNA和對TLR4具有特異性的dsRNA的組合(TLR2_4_S73和TLR4_4_S500 (在圖中標識為“siRNA混合液”))進行處理減小了移植物內IFN y +CD8+T細胞的豐度。(A).顯示移植物內IFN y +CD8+T細胞的代表性豐度百分比的FACS (N>6) ;(B)移植物內IFN Y+CD8+T細胞的豐度百分比的圖。
[0316]圖6示出在第0天和第I天用對TLR2具有特異性的dsRNA和對TLR4具有特異性的dsRNA的組合(TLR2_4_S73和TLR4_4_S500)進行處理,顯著減弱了在協同刺激阻滯中的急性移植物排斥的組織病理學信號一處理的Ih CIT或18H CIT Balb/c->B6移植物、用對照dsRNA (EGFP_5_S763)或對TLR2具有特異性的dsRNA和對TLR4具有特異性的dsRNA的組合(TLR2_4_S73和TLR4_4_S500)進行氣管內處理(標識為“siRNA混合液”)。(A.)在同種異基因肺移植后第7天受體肺的代表性組織病理學圖像(HE)。(B).由通過職業資格認證的肺移植病理醫師以單盲方式評價的排斥分數。通常在臨床中使用如下的評分系統:級別AO (無)、級別Al (最低)、級別A2 (輕度)、級別A3 (中等)以及級別A4 (嚴重)。
[0317]發明詳述
[0318]本公開內容部分涉及用于治療有需要的哺乳動物的肺病癥、疾病或損傷的方法。所述方法可包括:以有效治療所述哺乳動物的量對所述哺乳動物施用選自TLR2抑制劑或其藥學上可接受鹽或前藥的至少一種治療劑。所述方法可包括對所述哺乳動物施用至少兩種治療劑,其中至少一種治療劑靶向TLR2基因或基因產物并且至少一種治療劑靶向TLR4基因或基因產物。在一些實施方案中,所述治療劑包括:(i)TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及(ii)TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;量為有效治療所述哺乳動物的肺病癥、疾病或損傷的量。本公開內容還涉及包括所述治療劑的組合、組合物、試劑盒以及包裝。
[0319]在一些實施方案中,方法可包括以足夠減少TLR2基因的表達和/或抑制其功能的量對所述哺乳動物施用至少一種治療劑。在一些實施方案中,方法可包括以足夠減少TLR2基因和TLR4基因兩者的表達和/或抑制兩者的功能的量對所述哺乳動物施用至少兩種治療劑的組合或組合的治療劑。在某些實施方案中,所述肺疾病或損傷選自由以下組成的組:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、 急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、肺氣腫、肺移植誘發的急性移植物功能障礙以及肺移植之后的閉塞性細支氣管炎。在某些實施方案中,提供了用于治療或預防與器官移植(特別是肺移植)相關的炎癥和/或移植物排斥的組合療法的組合物和方法,包括治療、預防或減弱原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、肺再移植反應、肺移植之后的閉塞性細支氣管炎和/或器官移植(特別在肺移植中)之后的原發性移植物功能障礙(PGD)的發展。
[0320]在一些實施方案中,所述至少一種治療劑是TLR2抑制劑。在一些實施方案中,所述至少兩種治療劑是TLR2抑制劑和TLR4抑制劑。在一些實施方案中,所述至少兩種治療劑是聯合施用的,例如同時或按序施用。在其它實施方案中,所述至少兩種治療劑以包含其組合的藥物組合物來施用。在一些實施方案中,所述治療劑是組合抑制劑,其意指能夠下調基因TLR2和基因TLR4兩者和/或其基因產物的表達和/或活性的單一藥劑。這些單一藥劑的非限制性實例是在PCT專利公布號W02007/091269中公開的串聯且多臂的RNAi分子。
[0321]在一個實施方案中,所述方法包括施用治療有效量的靶向TLR2的治療劑。
[0322]在一些實施方案中,所述方法包括施用(a)治療有效量的靶向TLR2的第一治療劑和(b)治療有效量的靶向TLR4的第二治療劑。[0323]在一個實施方案中,所述方法包括施用治療有效量的靶向TLR2和TLR4兩者的組合抑制劑。
[0324]在一些實施方案中,所述治療劑是TLR2抑制劑。在一些實施方案中,所述治療劑選自由以下組成的組:小有機分子化合物;蛋白質;抗體或其片段;肽;肽模擬物以及核酸分子。在一些實施方案中,至少一種治療劑是核酸分子。在一些實施方案中,所述治療劑包含核酸分子。在一些實施方案中,所述核酸分子獨立地選自由以下組成的組:結合編碼基因TLR2的核苷酸序列(如mRNA序列)的反義分子、短干擾核酸(siNA)、短干擾RNA (siRNA)、雙鏈RNA(dsRNA)、微RNA(miRNA)或短發夾RNA(shRNA),所述核苷酸序列例如為由SEQ ID N0:1 (gi I 68160956 | ref | NM_003264.3 |)所例示的人 TLR2 的 mRNA 編碼序列。
[0325]在一些實施方案中,所述至少兩種治療劑是TLR2抑制劑和TLR4抑制劑。在一些實施方案中,各治療劑獨立地選自由以下組成的組:小有機分子;蛋白質;抗體或其片段;肽;肽模擬物以及核酸分子。在一些實施方案中,至少一種治療劑是核酸分子。在一些實施方案中,各治療劑包含核酸分子。
[0326]在一些實施方案中,各核酸分子獨立地選自由以下組成的組:結合編碼選自TLR2和TLR4的靶基因的核苷酸序列(如mRNA序列)的反義分子、短干擾核酸(siNA)、短干擾RNA (siRNA)、雙鏈 RNA (dsRNA)、微 RNA (miRNA)或短發夾 RNA (shRNA),例如:由 SEQ ID NO:1所例示的人TLR2的mRNA編碼序列或者由SEQ ID NO: 2至4所例示的人TLR4的mRNA編碼序列。在各種實施方案中,各核酸分子是dsRNA分子或siRNA分子。
[0327]在各種實施方案中,各治療劑包含核酸分子,其中:
[0328](a)所述核酸分子包括有義鏈和反義鏈;
[0329](b)所述核酸分子的各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
`[0330](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與選自編碼TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)的mRNA或編碼TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2-4)的mRNA的mRNA的序列互補;并且
[0331](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補,并且包括選自編碼TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)的 mRNA 和編碼 TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2-4)的 mRNA 的 mRNA 的17至40個核苷酸序列。
[0332]在各種實施方案中,各治療劑包含具有結構(Al)的核酸分子:
[0333](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0334]3,Z,-(N,)y-z” 5, (有義鏈)
[0335]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0336]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0337]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0338]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0339]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0340]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。[0341]在一些實施方案中,TLR2mRNA的序列在SEQ ID NO:1中列出。在各種實施方案中,TLR2siRNA寡核苷酸的有義鏈和反義鏈選自在SEQ ID NO:5-722 ; 1441-2246 ;3053-4152 ;以及 5253-5545 中列出的有義鏈序列和在 SEQ ID NO:723-1440 ;2247_3052 ;4153_5252 以及5546-5838中列出的反義鏈序列。在一些實施方案中,TLR4mRNA的序列在SEQ ID NO:2 ;SEQ ID N0:3或SEQ ID N0:4中列出。在各種實施方案中,TLR4siRNA寡核苷酸的有義鏈和反義鏈選自在 SEQ ID NO:5839-7075、8313-8458、8605-10318、12033-12084 中列出的有義鏈序列和在SEQ ID NO: 7076-8312,8459-8604,10319-12032、12085-12136 中列出的反義鏈序列。
[0342] 在一些實施方案中,雙鏈寡核苷酸化合物的(N)X包含存在于SEQ IDNO:723-1440,2247-3052,4153-5252,5546-5838,7076-8312,8459-8604,10319-12032,12085-12136中的反義寡核苷酸。在一些實施方案中,(N’)y的序列與(N)X的序列部分互補。在一些實施方案中,(N’)y的序列與(N)X的序列實質上互補。在一些實施方案中,(N’ )y的序列與(N)X的序列完全互補。在一些實施方案中,雙鏈寡核苷酸化合物的(N)X包含存在于標識為TLR2_4、TLR2_7或TLR4_4的雙鏈RNA化合物中的反義寡核苷酸。
[0343]在所述雙鏈寡核苷酸化合物的一些實施方案中,x=y=19。在各種實施方案中,Z和V兩者都存在于雙鏈寡核苷酸化合物中。在各種實施方案中,Z和V兩者都不存在于雙鏈寡核苷酸化合物中;即所述雙鏈化合物的兩端都是平端。在一些實施方案中,Z或Z’中至少一個存在于所述雙鏈寡核苷酸化合物中。
[0344]在一些實施方案中,Z或Z’獨立地是選自以下的非常規部分:脫堿基脫氧核糖部分、脫堿基核糖部分反向脫堿基脫氧核糖部分、反向脫堿基核糖部分;C3部分、C4部分、C5部分、氨基-6部分。在一些優選實施方案中,Z或V獨立地選自C3部分和氨基-C6部分。
[0345]在一些實施方案中,雙鏈寡核苷酸化合物中的N或N’中的至少一個包含2’糖修飾的核糖核苷酸。在一些實施方案中,所述2’糖修飾包含存在氨基、氟代基、烷氧基或烷基部分。在一些優選實施方案,2’糖修飾包含存在烷氧基部分,優選地,所述烷氧基部分包含2’ -0-甲基部分。
[0346]在雙鏈寡核苷酸化合物的一些實施方案中,(N)X包含交替的2’-0_甲基糖修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸。在某些實施方案中,(N) X包含至少5個交替的2’-0-甲基糖修飾或未修飾的核糖核苷酸。在一些實施方案中,(N)X在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19處包含2’ -0-甲基糖修飾的核糖核苷酸。在一些實施方案中,(N)X在位置1、3、5、7、9、11、13、15、17和19處包含2’-0_甲基糖修飾的核糖核苷酸。在一些實施方案中,(N)X包含2’-0_甲基糖修飾的嘧啶核糖核苷酸。在一些實施方案中,在(N)X中的所有嘧啶核糖核苷酸都包含2’ -0-甲基糖修飾的嘧啶核糖核苷酸。
[0347]在一些實施方案中,(N) X包含選自以下的至少一個非常規部分:鏡像核苷酸以及通過2’ -5’核苷酸間磷酸酯鍵連接于相鄰核苷酸的核苷酸。在一些實施方案中,(N)x中的非常規部分是鏡像核苷酸。在一些實施方案中,(N)X中的鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸(L-DNA)。在各種實施方案中,(N)X在位置6或7處包含L-DNA部分(5’ >3’)。
[0348]在一些實施方案中,(N’)y包含選自以下的至少一個非常規部分:鏡像核苷酸以及通過2’ -5’核苷酸間磷酸酯鍵連接于相鄰核苷酸的核苷酸。在一些實施方案中,(N’)y中的非常規部分是鏡像核苷酸。在一些實施方案中,(N’)y中的鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸(L-DNA)。在一些實施方案中,(N’ )y由位置I至17和19處的未修飾核糖核苷酸以及3’倒數第二位置(位置18)處的一個L-DNA組成。在一些實施方案中,(N’)y由位置I至16和19處的未修飾核糖核苷酸以及3’倒數第二位置(位置17和18)處的兩個連續L-DNA組成。在一些實施方案中,(N’)y中的非常規部分是通過2’-5’核苷酸間磷酸酯鍵連接于相鄰核苷酸的核苷酸。在一些實施方案中,(N’ )y中通過2’ -5’核苷酸間磷酸酯鍵連接于相鄰核苷酸的核苷酸進一步包含3’ -O-甲基(3’ O-Me)糖修飾。
[0349]在各種實施方案中,所述治療劑是具有如下所示的結構(A2)的雙鏈寡核苷酸化合物:
[0350](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0351]3,Z,-N2_(N,)y_z” 5, (有義鏈)[0352]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0353]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0354]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0355]其中(N’ )y的序列與(N)X的序列互補,并且(N)X與在選自編碼TLR2(例如,SEQID NO:1)的mRNA和編碼TLR4(例如,SEQ ID NO: 2-4)的mRNA的mRNA中的連續序列互補;
[0356]其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)的mRNA和編碼 TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2-4)的 mRNA 的 mRNA 錯配;
[0357]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0358]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0359]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0360]在根據結構(A) 2的雙鏈寡核苷酸化合物的一些實施方案中,x=y=18。
[0361]在一些實施方案中,(N)X與SEQ ID NO:1 (人TLR2mRNA)中的連續序列互補。在一些實施方案中,(N) X包括選自SEQ ID NO:4153-5252和5546-5838中的任一個的反義寡核苷酸。在一些實施方案中,x=y=18并且N1-(N)X包括選自SEQ ID NO:723-1440和2247-3052中的任一個的反義寡核苷酸。在一些實施方案中,x=y=19或者x=y=20。在某些優選實施方案中,x=y=18。
[0362]在一些實施方案中,(N) X與SEQ ID NO: 2 (人TLR4,轉錄變異體4,非編碼RNA)或SEQ ID N0:3(人TLR4,轉錄變異體1,mRNA)或SEQ ID NO:4(人TLR4,轉錄變異體3,非編碼RNA)中的連續序列互補。在一些實施方案中,(N)X包括選自SEQ ID NO: 10319-12032和12085-12136中的任一個的反義寡核苷酸。在一些實施方案中,x=y=18并且Nl-(N)X包括選自SEQ ID NO:7076-8312和8459-8604中的任一個的反義寡核苷酸。在一些實施方案中,x=y=19或者x=y=20。在某些優選實施方案中,x=y=18。
[0363]在一些實施方案中,NI和N2形成Watson-Crick堿基對。在其它實施方案中,NI和N2形成非Watson-Crick堿基對。在一些實施方案中,NI是修飾的腺嘌呤核糖核苷或修飾的尿嘧啶核糖核苷。
[0364]在某些實施方案中,NI選自由腺嘌呤核糖核苷、修飾的腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷、修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷組成的組。在其它實施方案中,NI選自由尿嘧啶核糖核苷、尿嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的尿嘧啶核糖核苷以及修飾的尿嘧啶脫氧核糖核苷組成的組。
[0365]在某些實施方案中,NI選自由腺嘌呤核糖核苷、修飾的腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷、修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷組成的組,并且N2選自由尿嘧啶核糖核苷、尿嘧唳脫氧核糖核苷、修飾的尿喃唳核糖核苷以及修飾的尿喃唳脫氧核糖核苷組成的組。在某些實施方案中,NI選自由腺嘌呤核糖核苷和修飾的腺嘌呤核糖核苷組成的組,并且N2選自由尿嘧啶核糖核苷和修飾的尿嘧啶核糖核苷組成的組。
[0366]在某些實施方案中,N2選自由腺嘌呤核糖核苷、修飾的腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷、修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷組成的組,并且NI選自由尿嘧啶核糖核苷、尿嘧唳脫氧核糖核苷、修飾的尿喃唳核糖核苷以及修飾的尿喃唳脫氧核糖核苷組成的組。在某些實施方案中,NI選自由尿嘧啶核糖核苷和修飾的尿嘧啶核糖核苷組成的組,并且N2選自由腺嘌呤核糖核苷和修飾的腺嘌呤核糖核苷組成的組。在某些實施方案中,NI是尿嘧啶核糖核苷并且N2是腺嘌呤核糖核苷。
[0367]在(A2)的一些實施方案中,(N)X選自SEQ ID NO:4153-5252和5546-5838中的任一個并且(N,)y與選自SEQ ID NO:3053-4152和5253-5545的序列實質上互補。在(A2)的一些實施方案中,(N)x選自SEQ ID NO: 10319-12032和12085-12136中的任一個并且(N’)y與選自SEQ ID NO:8605-10318和12033-12084的序列實質上互補。在一些實施方案中,(N’)y的序列與(N)X的序列部分互補。在一些實施方案中,(N’)y的序列與(N)X的序列完全互補。在一些實施方案中,雙鏈寡核苷酸化合物的(沁1包含存在于標識為!1^2_4、TLR2_7或TLR4_4的雙鏈RNA化合物中的反義寡核苷酸。
[0368]在一些實施方案中 ,施用方法是全身性施用。在一些實施方案中,施用方法是局部施用。在各種實施方案中,施用方法是氣管內、吸入、靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、皮內、局部、通過注射或經由泵直接施用到靶肺組織中。
[0369]一方面,提供了一種藥物組合物,其包括:選自TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的至少一種治療劑;以及藥學上可接受的載劑。
[0370]另一方面,提供了一種組合,其包括:選自以下的至少兩種治療劑:(i)TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥和(ii)TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑。
[0371]另一方面,提供了一種藥物組合物,其包括:選自以下的至少兩種治療劑的組合:(i) TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥和(iii) TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑。
[0372]在一些實施方案中,所述組合物包含由TLR2抑制劑組成的治療劑。在一些實施方案中,所述組合或組合物包含至少兩種治療劑,其中所述治療劑中的至少一種是TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥并且所述治療劑中的至少一種是TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥。在一些實施方案中,所述組合或組合物包含TLR2抑制劑和TLR4抑制劑。[0373]在一些實施方案中,所述TLR2抑制劑選自由以下組成的組:小分子化合物;蛋白質;抗體或其片段;以及核酸分子。在一些實施方案中,所述TLR2抑制劑包含核酸分子。在一些實施方案中,所述核酸分子選自結合編碼靶基因TLR2的核苷酸序列(如mRNA序列)的短干擾核酸(siNA)、短干擾RNA(siRNA)、雙鏈RNA(dsRNA)、微RNA(miRNA)或短發夾RNA(shRNA)。在一些實施方案中,所述核酸分子是靶向TLR2的雙鏈RNA (dsRNA)或短干擾RNA(siRNA)。[0374]在一些實施方案中,各治療劑獨立地選自由以下組成的組:小分子化合物;蛋白質;抗體或其片段;以及核酸分子。在一些實施方案中,各治療劑包含核酸分子。在一些實施方案中,各核酸分子獨立地選自結合編碼選自TLR2和TLR4的靶基因的核苷酸序列(如mRNA 序列)的短干擾核酸(siNA)、短干擾 RNA (siRNA)、雙鏈 RNA (dsRNA)、微 RNA (miRNA)或短發夾RNA(shRNA)。在一些實施方案中,各核酸分子是雙鏈RNA(dsRNA)或短干擾RNA(siRNA)。在一些實施方案中,至少兩種dsRNA或siRNA是靶向TLR2的dsRNA或siRNA和靶向TLR4的dsRNA或siRNA。
[0375]在一個實施方案中,所述方法包括治療有效量的下調TLR2的治療劑。
[0376]在一個實施方案中,所述方法包括(a)治療有效量的下調TLR2的第一治療劑和(b)治療有效量的下調TLR4的第二治療劑。
[0377]一方面,提供了一種試劑盒,其包含由TLR2抑制劑組成的治療劑;以及任選地使用說明書。
[0378]另一方面,提供了一種試劑盒,其包含至少兩種治療劑,其中所述兩種藥劑選自由TLR2抑制劑和TLR4抑制劑組成的組;以及任選地使用說明書。
[0379]在所述試劑盒的一些實施方案中,各治療劑獨立地選自由以下組成的組:小分子化合物;蛋白質;抗體或其片段;以及核酸分子。在一些實施方案中,各治療劑包含核酸分子。在一些實施方案中,各核酸分子獨立地選自結合編碼選自TLR2和TLR4的靶基因的核苷酸序列(如mRNA序列)的短干擾核酸(siNA)、短干擾RNA(siRNA)、雙鏈RNA(dsRNA)、微RNA(miRNA)或短發夾RNA(shRNA)。在一些實施方案中,各核酸分子是雙鏈RNA(dsRNA)或短干擾RNA(SiRNA)。在一些實施方案中,各核酸分子選自由以下組成的組:靶向TLR2的dsRNA或靶向TLR2的siRNA ;以及靶向TLR4的dsRNA或靶向TLR4的siRNA。在一些實施方案中,至少兩種siRNA由以下組成:靶向TLR2的dsRNA或siRNA ;以及靶向TLR4的dsRNA或 siRNA。
[0380]在一些實施方案中,本文提供的試劑盒包含:組合抑制劑,其意指能夠下調選自由TLR2和TLR4兩者組成的組的至少兩種基因和/或基因產物的單一藥劑;以及任選地使用說明書。
[0381]在一些實施方案中,所述試劑盒的各治療劑包含核酸分子,其中:
[0382](a)所述核酸分子包含有義鏈和反義鏈;
[0383](b)所述核酸分子的各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0384](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與選自編碼TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)的mRNA和編碼TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2-4)的mRNA的mRNA的序列互補;并且
[0385](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補,并且包括選自編碼TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)的 mRNA 和編碼 TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2-4)的 mRNA 的 mRNA 的17至40個核苷酸序列。
[0386]在一些實施方案中,所述試劑盒的各治療劑包含具有結構(Al)的核酸分子:
[0387](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0388]3,Z,-(N,)y_z” 5, (有義鏈)
[0389]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0390]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0391]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0392]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0393]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0394]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0395]在各種實施方案中,所述雙鏈分子在引導鏈(反義鏈)的5’端核苷酸處包含與革巴mRNA的錯配。因此,在一些實施方案中,所述試劑盒的各治療劑包含具有如下所示的結構(A2)的雙鏈寡核苷酸化合物
`[0396](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0397]3,Z,-N2_(N,)y_z” 5, (有義鏈)
[0398]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0399]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0400]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0401]其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補,并且(N) x與在選自編碼TLR2的mRNA(例如,SEQ ID NO:1)和編碼TLR4的mRNA (例如,SEQ ID NO: 2-4)的mRNA中的連續序列互補;
[0402]其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2 (例如,SEQ ID NO:1)的mRNA和編碼 TLR4 (例如,SEQ ID NO: 2-4)的 mRNA 的 mRNA 錯配;
[0403]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0404]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0405]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0406]另一方面,提供了一種包裝,其包含:A)至少兩種單獨的選自以下的劑量單位:(i)包含TLR2抑制劑的劑量單位和(ii)包含TLR4抑制劑的劑量單位;以及任選地B)包含用于使用劑量單位的說明書的包裝插頁。
[0407]在所述包裝的另一個實施方案中,各抑制劑包含核酸分子,其中:
[0408](a)所述核酸分子包含有義鏈和反義鏈;[0409](b)所述核酸分子的各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸;
[0410](c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的序列互補;并且
[0411](d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補,并且包括選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的17至40個核苷酸序列。
[0412]在所述包裝的一些實施方案中,各抑制劑包含具有結構(Al)的核酸分子:
[0413](Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
[0414]3’Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈)
[0415]其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0416]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸;
[0417]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0418]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;
[0419]其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數;
[0420]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補;并且其中(N) x包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
[0421]在各種實施方案中,所述雙鏈分子在引導鏈(反義鏈)的5’端核苷酸處包含與靶mRNA的錯配。因此,在所述包裝的一些實施方案中,各抑制劑包含具有如下所示的結構(A2)的雙鏈寡核苷酸化合物:
[0422](A2) 5’Nl-(N)X-Z 3’ (反義鏈)
[0423]3’Z’ -N2_(N’)y_z” 5’ (有義鏈)
[0424]其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分;
[0425]其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸;
[0426]其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;
[0427]其中(N’)y的序列與(N) x的序列互補并且(N) x與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補;
[0428]其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配;
[0429]其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧唳核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖核苷、胸腺喃唳脫氧核糖核苷、修飾的胸腺喃唳核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,
[0430]其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2_(N’ )y的5’端的封端部分;并且
[0431]其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
[0432]在所述試劑盒或包裝的各種實施方案中,所述說明書或包裝插頁指示所述治療劑或劑量單位或所述多種治療劑或劑量單位適合用于治療罹患選自由以下組成的組的疾病或病狀的患者:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、肺氣腫、肺移植誘發的急性移植物功能障礙以及肺移植之后的閉塞性細支氣管炎。在所述試劑盒或包裝的各種實施方案中,所述說明書或包裝插頁指示所述治療劑或劑量單位適合用于治療罹患與器官移植(特別是肺移植)相關的炎癥和/或移植物排斥或者具有罹患所述炎癥和/或移植物排斥的風險的患者,所述炎癥和/或移植物排斥包括但不限于原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、肺再移植反應、肺移植之后的閉塞性細支氣管炎和/或器官移植(特別在肺移植中)之后的原發性移植物功能障礙(PGD)。
[0433]在各種實施方案中,所述組合物包含下調或抑制包括DNA和mRNA在內的TLR2基因和/或TLR2基因產物的表達/活性/功能的一種或多種雙鏈核酸(dsNA)藥劑。
[0434]在各種實施方案中,所述組合包含下調或抑制選自以下的包括DNA和mRNA在內的至少兩種基因和/或基因產物的表達/活性/功能的一種或多種雙鏈核酸(dsNA)藥劑:(i)TLR2 和(ii)TLR4。
[0435]人TLR2的mRNA編碼序列由SEQ ID NO:1所例示,并且人TLR4的mRNA編碼序列由 SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3 和 SEQ ID NO:4 所例示。
[0436]在一個實施方案中,所述組合物包含下調TLR2的至少一種dsNA分子。
[0437]在另一個實施方案中,所述組合包含下調TLR2和TLR4的一種或多種dsNA藥劑。在一個實施方案中,所述組合包含下調TLR2的至少一種dsNA分子和下調TLR4的至少一種dsNA分子。
`[0438]在一些實施方案中,提供了一種包含靶向至少TLR2和TLR4兩者的dsRNA的串聯dsRNA。
[0439]在一些實施方案中,提供了一種三臂結構,所述結構也被稱為RNAistar。所述三鏈
寡核糖核苷酸包含具有以下通用結構的寡核糖核苷酸:
[0440]y 寡丨(有義>接頭A寡2(有義)3'
3,寡丨(反義>接頭B暮3(有義>5,
35寡3(反義>接頭C寒2(反義>5’
或者
S5凍1(有義}懸A寡2(反又}35
35寡丨(反義)接頭B寡3(有義>5’
y 寡3(反義)接頭C寡2(有義}5’
或者
S5 寡1(有又}接頭A寡3(反義)V
y.寡1(反叉)接頭B.寡2(有義)5’
5’寡3(有義)接頭C寡2(反義)3,
[0441]其中接頭A、接頭B或接頭C中的一個或多個是存在的;兩種或更多種寡核苷酸與接頭A至C中的一種或多種的任意組合是可能的,只要所述鏈的極性和所述分子的通用結構保留即可。此外,如果接頭A至C中的兩種或更多種是存在的,則它們可以是相同或不同的。在一些實施方案中,優選“有間隙的” RNAistar化合物,其中所述化合物包含三個RNA雙鏈體。
[0442]由形成三個RNA雙鏈體的四條核糖核苷酸鏈組成的化合物具有以下通用結構:
[0443]
【權利要求】
1.一種預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法,其包括對所述受體施用治療有效量的至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥以及治療有效量的至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥,由此預防或減輕所述受體的PGD的所述癥狀。
2.如權利要求1所述的方法,其中所述肺移植的所述受體為具有發展原發性移植物功能障礙(PGD)的風險或者正在治療原發性移植物功能障礙的人。
3.如權利要求1所述的方法,其用于預防或減輕冷缺血相關的PGD的所述癥狀。
4.如權利要求1所述的方法,其用于預防或減輕熱缺血相關的PGD的所述癥狀。
5.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述癥狀選自由以下組成的組:炎癥、急性移植物排斥、移植物排斥、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、肺功能受損、閉塞性細支氣管炎、血氧合作用受損、炎癥性細胞因子的產生增加、移植物內和氣道內粒細胞積累、肺水腫以及血氧不足。
6.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用使得所述受體的肺水腫減輕。
7.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用使得所述受體的血氧合作用增加。
8.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用使得所述受體的血氧合作 用得到保持。
9.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用使得所述受體的肺功能改善。
10.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用使得所述受體的肺功能得到保持。
11.如權利要求1至4中任一項所述的方法,其中所述至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥、以及所述至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用使得所述移植的肺的肺功能改善。
12.如權利要求1所述的方法,其中在肺移植之前、期間或之后對肺移植的所述受體施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
13.如權利要求12所述的方法,其中在肺移植之前對肺移植的所述受體施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
14.如權利要求12所述的方法,其中在肺移植期間對肺移植的所述受體施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
15.如權利要求12所述的方法,其中在肺移植之后對肺移植的所述受體施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
16.如權利要求1所述的方法,其中在同一制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
17.如權利要求1所述的方法,其中在不同制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
18.如權利要求1所述的方法,其中通過相同途徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
19.如權利要求1所述的方法,其中通過不同途徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
20.如權利要求1所述的方法,其中對所述受體的所述施用是同時的。
21.如權利要求1所述的方法,其中對所述受體的所述施用是連續的。
22.如權利要求1至21中任一項所述的方法,其進一步包括選自由以下組成的組的至少一種另外的治療:手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法、營養補充劑及其任意組合。
23.如權利要求22所述的方法,其中在施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑之前、之后或同時施用所述另外的治療。
24.如權利要求22所述的方法,其中所述另外的治療包括免疫抑制劑療法。
25.如權利要求1所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括全身性施用或局部施用。
26.如權利要求25所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括全身性施用。
27.如權利要求25所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括局部施用。
28.如權利要求25所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括選自以下的方法:靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、直接注射、氣管內滴注、吸入、鼻內、肺部以及經由泵施用到肺中。
29.如權利要求28所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括吸入。
30.如權利要求28所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括氣管內滴注。
31.如權利要求1至30中任一項所述的方法,其中各抑制劑獨立地選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。
32.如權利要求31所述的方法,其中至少一種抑制劑包括核酸分子。
33.如權利要求32所述的方法,其中各抑制劑包括核酸分子。
34.如權利要求33所述的方法,其中第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
35.如權利要求34所述的方法,其中所述雙鏈寡核苷酸一個接另一個地串聯地連接或形成RNAistar時退火。
36.如權利要求34所述的方法,其中所述第一雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;并且 其中所述第二雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈;(b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
37.如權利要求36所述的方法,其中在同一制劑中對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
38.如權利要求36所述的方法,其中在不同制劑中對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
39.如權利要求36所述的方法,其中通過相同途徑對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
40.如權利要求36所述的方法,其中通過不同途徑對所述受體聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
41.如權利要求36所述的方法,其中對所述受體的所述施用是同時的。
42.如權利要求36所述的方法,其中對所述受體的所述施用是連續的。
43.如權利要求36所述的方法,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用一次。
44.如權利要求36所述的方法,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用至少一天一次。
45.如權利要求36所述的方法 ,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體施用多次。
46.如權利要求34所述的方法,其中至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al): (Al)5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸; 其中Z和Z’各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則各自獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數; 其中(N’) y的序列與(N) X的序列互補;并且其中(N) X包含選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
47.如權利要求34或46所述的方法,其中TLR2的mRNA多核苷酸序列在SEQID NO:1中列出并且其中TLR4的mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4中的任一個中列出。
48.如權利要求46所述的方法,其中(N)X包含選自由具有SEQID NO:723-1440,2247-3052,7076-8312和8459-8604的寡核苷酸組成的組的反義寡核苷酸并且其中(N,)y包含選自由具有SEQ ID NO: 5-722,1441-2246,5839-7075以及8313-8458的寡核苷酸組成的組的互補有義鏈寡核苷酸。
49.如權利要求34或46所述的方法,其中施用結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的所述至少一種雙鏈寡核苷酸和結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的所述至少一種雙鏈寡核苷酸分別引起TLR2表達和TLR4表達的下調。
50.如權利要求46至48中任一項所述的方法,其中x=y=19。
51.如權利要求34所述的方法,其中至少一種雙鏈化合物獨立地包含結構(A2): (A2) 5’Nl-(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’Z’ -N2-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸; 其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補并且其中(N)X與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補; 其中NI共價結合于(N)X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的所述mRNA錯配; 其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧啶核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖核苷、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2-(N’)y的5’端的封端部分;并且其中Z和V各自獨立地是存在或不 存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
52.如權利要求51所述的方法,其中x=y=18。
53.如權利要求51或52所述的方法,其中(N)X的所述序列包含選自由具有SEQIDNO:4153-5252,5546-5838,10319-12032和12085-12136的寡核苷酸組成的組的反義鏈寡核苷酸。
54.如權利要求53所述的方法,其中(N’)y的所述序列包含選自由具有SEQIDNO:3053-4152,5253-5545,8605-10318和12033-12084的寡核苷酸組成的組的有義鏈寡核苷酸。
55.一種用于治療有需要的患者的肺病癥、疾病或損傷的方法,其包括對所述患者施用至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥和至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的治療有效組合,由此治療所述患者的所述肺病癥、疾病或損傷。
56.如權利要求55所述的方法,其中所述肺病癥、疾病或損傷選自急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、與肺移植相關的病癥以及肺氣腫。
57.如權利要求56所述的方法,其中所述肺病癥、疾病或損傷是與肺移植相關的病癥。
58.如權利要求57所述的方法,其中與肺移植相關的所述肺病癥選自由以下組成的組:炎癥、移植物排斥、原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、急性移植物功能障礙、肺再移植反應、閉塞性細支氣管炎以及原發性移植物功能障礙(PGD)。
59.如權利要求58所述的方法,其中與肺移植相關的所述肺病癥為PGD。
60.如權利要求55至59中任一項所述的方法,其中在同一制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
61.如權利要求55至59中任一項所述的方法,其中在不同制劑中對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
62.如權利要求55至59中任一項所述的方法,其中通過相同路徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
63.如權利要求55至59中任一項所述的方法,其中通過不同路徑對所述受體聯合施用所述至少一種TLR2抑制劑和所述至少一種TLR4抑制劑。
64.如權利要求55至59中任一項所述的方法,其中對所述受體的所述施用是同時的。
65.如權利要求55至59中任一項所述的方法,其中對所述受體的所述施用是連續的。
66.如權利要求55至65中任一項所述的方法,其進一步包括選自由以下組成的組的至少一種另外的治療:手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法、營養補充劑及其任意組合。
67.如權利要求66所述的方法,其中在施用至少一種TLR2抑制劑和至少一種TLR4抑制劑之前、之后或同時施用所述另外的治療。
68.如權利要求67所述的方法,其中所述另外的治療包括免疫抑制劑療法。
69.如權利要求55至65中任一項所述的方法,其中對所述患者的所述施用包括全身性施用或局部施用。
70.如權利要求69所述的方法,其中對所述患者的所述施用包括全身性施用。
71.如權利要求69所述的方法,其中對所述患者的所述施用包括局部施用。
72.如權利要求69所述的方法,其中對所述患者的所述施用包括選自以下的方法:靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、直接注射、氣管內滴注、吸入、鼻內、肺部以及經由泵施用到肺中。
73.如權利要求72所述的方法,其中對所述患者的所述施用包括吸入。
74.如權利要求72所述的方法,其中對所述患者的所述施用包括氣管內滴注。
75.如權利要求55所述的方法,其中各抑制劑獨立選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。
76.如權利要求75所述的方法,其中至少一種抑制劑包含核酸分子。
77.如權利要求76所述的方法,其中各抑制劑包含核酸分子。
78.如權利要求77所述的方法,其中第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
79.如權利要求77所述的方法,其中所述雙鏈寡核苷酸一個接另一個地串聯地連接或形成RNAistar時退火。
80.如權利要求78所述的方法,其中所述第一雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;并且 其中所述第二雙鏈寡核苷酸包含:(a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
81.如權利要求80所述的方法,其中在同一制劑中對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
82.如權利要求80所述的方法,其中在不同制劑中對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
83. 如權利要求80所述的方法,其中通過相同途徑對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
84.如權利要求80所述的方法,其中通過不同途徑對所述患者聯合施用所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸。
85.如權利要求80所述的方法,其中對所述患者的所述施用是同時的。
86.如權利要求80所述的方法,其中對所述患者的所述施用是連續的。
87.如權利要求80所述的方法,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次。
88.如權利要求80所述的方法,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用至少一天一次。
89.如權利要求80所述的方法,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用多次。
90.如權利要求78所述的方法,其中至少一種雙鏈寡核苷酸包含結構(Al): (Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸; 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補;并且其中(沁1包含選自編碼!1^2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
91.如權利要求78或90所述的方法,其中TLR2的所述mRNA多核苷酸序列在SEQIDNO:1中列出,并且其中TLR4的所述mRNA多核苷酸序列在SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3和SEQID N0:4中的任一個中列出。
92.如權利要求90所述的方法,其中(N)X包含選自由具有SEQID NO:723-1440,2247-3052,7076-8312和8459-8604的寡核苷酸組成的組的反義寡核苷酸并且其中(N,)y包含選自由具有SEQ ID NO: 5-722,1441-2246,5839-7075以及8313-8458的寡核苷酸組成的組的有義鏈寡核苷酸。
93.如權利要求90至92中任一項所述的方法,其中x=y=19。
94.如權利要求78所述的方法,其中至少一種雙鏈化合物包含結構(A2): (A2) 5’Nl-(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’ -N2-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸; 其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補并且其中(沁1與選自編碼!1^2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補; 其中NI共價結合于(N)X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的所述mRNA錯配; 其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧啶核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖核苷、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2-(N’ )y的5’端的封端部分;并且 其中Z和Z’各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
95.如權利要求94所述的方法,其中x=y=18。
96.如權利要求94或95所述的方法,其中(N)X的所述序列包含選自由具有SEQIDNO:4153-5252,5546-5838,10319-12032以及12085-12136的寡核苷酸組成的組的反義寡核苷酸并且其中(N,)y的所述序列包含選自由具有SEQ ID NO:3053_4152、5253_5545、8605-10318以及12033-12084的寡核苷酸組成的組的有義寡核苷酸。
97.一種組合物,其包含至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥和至少一種TLR4抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥;以及藥學上可接受的載劑。
98.如權利要求97所述的組合物,其中各抑制劑獨立選自由以下組成的組:小有機分子;蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。
99.如權利要求98所述的組合物,其中各抑制劑獨立選自由以下組成的組:小有機分子;蛋白質;抗體或其片段;以及核酸分子。
100.如權利要求99所述的組合物,其中各抑制劑包含核酸分子。
101.如權利要求100所述的組合物,其中第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
102.如權利要求101所述的組合物,其中所述核酸分子串聯地連接或形成RNAistar時退火。
103.如權利要求101所述的組合物,其中第一雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且(d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;并且 其中第二雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
104.如權利要求103所述的組合物,其中在所述組合物中各雙鏈寡核苷酸的量的范圍獨立地為約0.05mg至約10.0mg0
105.如權利要求101所述的組合物,其中至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al): (Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸; 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分; 其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補;并且其中(沁1包含選自編碼!1^2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
106.如權利要求101所述的組合物,其中至少一種雙鏈寡核苷酸化合物獨立地包含結構(A2): (A2) 5’Nl-(N)x-Z3’(反義鏈)
3’ Z’-N2-(N’)y-z” 5’(有義鏈) 其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸; 其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補并且(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補; 其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配;其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧啶核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖核苷、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2-(N’ )y的5’端的封端部分;并且其中Z和Z’各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
107.如權利要求102至106中任一項所述的組合物,其中配制所述雙鏈寡核苷酸以用于施用一次、至少一天一次或用于施用多次。
108.—種試劑盒,其包含至少兩種治療劑,其中至少一種藥劑包含TLR2抑制劑并且第二藥劑包含TLR4抑制劑;和任選地使用說明書。
109.如權利要求108所述的試劑盒,其中各治療劑獨立選自由以下組成的組:小有機分子、蛋白質、抗體或其片段、肽、肽模擬物以及核酸分子。
110.如權利要求109所述的試劑盒,其中至少一種治療劑包含核酸分子。
111.如權利要求110所述的試劑盒,其中各治療劑包含核酸分子。
112.如權利要求111所述的試劑盒,其中第一核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸,并且第二核酸分子是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
113.如權利要求112所述的試劑盒,其中所述雙鏈寡核苷酸一個接另一個地串聯地連接或形成RNAistar時退火。
114.如權利要求113所述的試劑盒,其中所述第一雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR24的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補;并且 其中所述第二雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
115.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于在同一制劑中對受體聯合施用。
116.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于在不同制劑中對所述受體聯合施用。
117.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于通過相同路徑對所述受體聯合施用。
118.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于通過不同路徑對所述受體聯合施用。
119.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體同時施用。
120.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述受體連續施用。
121.如權利要求114所述的試劑盒,其中配制所述第一雙鏈寡核苷酸和所述第二雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次、至少一天一次或者以用于對所述受體施用多次。
122.如權利要求114所述的試劑盒,其中至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al): (Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸; 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分; 其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補;并且其中(沁1包含選自編碼!1^2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
123.如權利要求114所述的試劑盒,其中至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(A2): (A2) 5’Nl-(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’Z’ -N2-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸; 其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補并且(N)X與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補; 其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配; 其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧啶核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖核苷、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷, 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2-(N’ )y的5’端的封端部分;并且 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
124.—種包裝,其包含:A)至少兩種單獨的選自以下的劑量單位:⑴包含TLR2抑制劑的至少一個劑量單位和(ii)包含TLR4抑制劑的至少一個劑量單位;以及任選地B)包含劑量單位的使用說明書的包裝插頁。
125.如權利要求124所述的 包裝,其中所述TLR2抑制劑是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸并且所述TLR4抑制劑是結合編碼TLR4基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
126.如權利要求125所述的包裝,其中所述TLR2抑制劑是包含以下的雙鏈寡核苷酸:(a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補,并且; 其中所述TLR4抑制劑是包含以下的雙鏈寡核苷酸: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR4的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
127.如權利要求124所述的包裝,其中通過相同途徑對患者聯合施用所述劑量單位。
128.如權利要求124所述的包裝,其中通過不同途徑對患者聯合施用所述劑量單位。
129.如權利要求124所述的包裝,其中對患者同時或連續地施用所述劑量單位。
130.如權利要求132所述的包裝,其中劑量單位用于對患者施用至少一天一次。
131.如權利要求124所述的包裝,其中所述劑量單位用于對患者施用多次。
132.如權利要求124所述的包裝,其中至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(Al): (Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸; 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分; 其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補;并且其中(沁1包含選自編碼!1^2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA的反義序列。
133.如權利要求124所述的包裝,其中至少一種雙鏈寡核苷酸獨立地包含結構(A2): (A2) 5’Nl-(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’ Z’ -N2-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸; 其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數; 其中(N’)y的所述序列與(N)X的所述序列互補并且(N)x與在選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA中的連續序列互補; 其中NI共價結合于(N) X并且與選自編碼TLR2的mRNA和編碼TLR4的mRNA的mRNA錯配; 其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧啶核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖核苷、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷, 其中Z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2-(N’)y的5’端的封端部分;并且 其中Z和Z ’各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
134.如權利要求108至142中任一項所述的試劑盒或包裝,其中所述說明書或包裝插頁指示所述治療劑或劑量單位適合用于治療罹患選自由以下組成的組的肺疾病、損傷或病癥的患者:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、與肺移植相關的病癥以及肺氣腫。
135.如權利要求134所述的試劑盒或包裝,其中所述說明書或包裝插頁指示所述治療劑或劑量單位適合用于治療罹患與肺移植相關的病癥的患者。
136.如權利要求135所述的試劑盒或包裝,其中與肺移植相關的肺病癥選自由以下組成的組:炎癥、移植物排斥、原發性移植物衰竭、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、再灌注水腫、同種異體移植物功能障礙、急性移植物功能障礙、肺再移植反應、閉塞性細支氣管炎以及原發性移植物功能障礙(PGD)。
137.一種預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀的方法,其包括對所述受體施用治療有效量的至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥,由此預防或減輕所述受體的PGD癥狀。
138.如權利要求137所述的方法,其中肺移植的所述受體是正在治療原發性移植物功能障礙(PGD)的人。
139.如權利要求138所述的方法,其用于預防或減輕冷缺血相關的PGD或熱缺血相關的PGD的所述癥狀。
140.如權利要求137至139中任一項所述的方法,其中所述癥狀選自由以下組成的組:炎癥、急性移植物排斥、移植物排斥、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、肺功能受損、閉塞性細支氣管炎、血氧合作用受損、炎癥性細胞因子的產生增加、移植物內和氣道內粒細胞積累、肺水腫以及血氧不足。
141.如權利要求137至139所述的方法,其中治療有效量的至少一種TLR2抑制劑或其藥學上可接受的鹽或前藥的所述施用引起以下之一:所述受體的肺水腫減輕;所述受體的血氧合作用增加、所述受體的血氧合作得到保持、所述受體的肺功能得到改善、所述受體的肺功能得到保持、移植的肺的肺功能得到改善。
142.如權利要求141所述的方法,其中在肺移植之前、期間或之后對肺移植的所述受體施用所述至少一種TLR2抑制劑。
143.如權利要求137至142中任一項所述的方法,其進一步包括選自由以下組成的組的至少一種另外的治療:手術、類固醇療法、非類固醇療法、抗病毒療法、抗真菌療法、抗微生物療法、免疫抑制劑療法、抗感染療法、抗高血壓療法、營養補充劑及其任意組合。
144.如權利要求143所述的方法,其中在施用至少一種TLR2抑制劑之前、之后或同時施用所述另外的治療。
145.如權利要求143所述的方法,其中所述另外的治療包括免疫抑制劑療法。
146.如權利要求143所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括全身性施用或局部施用。
147.如權利要求146所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括選自以下的方法:靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、門脈內、皮下、直接注射、氣管內滴注、吸入、鼻內、肺部以及經由泵施用到肺中。
148.如權利要求147所述的方法,其中對所述受體的所述施用包括吸入或氣管內滴注。
149.如權利要求137所述的方法,其中所述抑制劑包含核酸分子。
150.如權利要求149所述的方法,其中所述雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
151.如權利要求150所述的方法,其中配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次、至少一天一次或者以用于對所述受體施用多次。
152.如權利要求151所`述的方法,其中所述雙鏈寡核苷酸包含結構(Al): (Al) 5’(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’Z’-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N和N’各自是可能未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接至下一個N或N’的寡核苷酸; 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。 其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在(N’)y的5’端的封端部分;其中X和y各自獨立地是17與40之間的整數; 其中(N’)y的序列與(N)X的序列互補;并且其中(N)X包含編碼具有SEQ ID NO:1中所列出的序列的TLR2的mRNA的反義序列。
153.如權利要求152所述的方法,其中(N)X包含存在于SEQID NO:723-1440和2247-3052中的反義寡核苷酸并且其中(N,)y包含存在于SEQ ID NO:5_722和1441-2246中的有義鏈寡核苷酸。
154.如權利要求152至153中任一項所述的方法,其中x=y=19。
155.如權利要求151所述的方法,其中所述雙鏈化合物包含結構(A2): (A2) 5’Nl-(N)x-Z 3’ (反義鏈)
3’Z’ -N2-(N’)y-z” 5’ (有義鏈) 其中N2、N和N’各自獨立地是未修飾或修飾的核糖核苷酸或非常規部分; 其中(N)X和(N’)y各自是其中各連續的N或N’通過共價鍵連接于相鄰的N或N’的寡核苷酸; 其中X和y各自獨立地是17與39之間的整數;其中(N’)y的所述序列與(N)x的所述序列互補并且其中(N)X與編碼TLR2的mRNA中的連續序列互補; 其中NI共價結合于(N) X并且與編碼TLR2的mRNA錯配; 其中NI是選自由以下組成的組的部分:尿嘧啶核苷、修飾的尿嘧啶核苷、胸腺嘧啶核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖核苷、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷、修飾的胸腺嘧啶核糖脫氧核糖、腺嘌呤核糖核苷、腺嘌呤脫氧核糖核苷以及修飾的腺嘌呤脫氧核糖核苷,其中z”可以是存在或不存在的,但是如果存在,則是共價連接在N2-(N’ )y的5’端的封端部分;并且 其中Z和V各自獨立地是存在或不存在的,但是如果存在,則獨立地是共價連接在其所存在于其中的鏈的3’端的I至5個連續核苷酸或非常規部分或其組合。
156.如權利要求155所述的方法,其中x=y=18。
157.如權利要求155所述的方法,其中(N)X的所述序列選自SEQID NO:4153-5252和5546-5838中的任一個并且其中(N,)y的所述序列選自SEQ ID NO: 3053-4152和5253-5545中的任一個。
158.如權利要求155所述的方法,其中施用結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的所述至少一種雙鏈寡核苷酸引起TLR2表達的下調。
159.—種試劑盒或包裝,其包含:含有TLR2抑制劑的至少一個劑量單位;以及任選地使用說明書,其中所述說明書指示所述劑量單位適合用于治療罹患選自由以下組成的組的肺疾病、損傷或病癥的患者:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎、與肺移植相關的病癥以及肺氣腫。
160.如權利要求159所述的試劑盒或包裝,其中所述TLR2抑制劑包含核酸分子。
161.如權利要求160所述的試劑盒或包裝,其中所述核酸分子是結合編碼TLR2基因的核苷酸序列的雙鏈寡核苷酸。
162.如權利要求161所述的試劑盒或包裝,其中所述雙鏈寡核苷酸包含: (a)有義鏈和反義鏈; (b)各鏈的長度獨立地是17至40個核苷酸; (c)所述反義鏈的17至40個核苷酸序列與編碼TLR2的mRNA的序列互補;并且 (d)所述有義鏈的17至40個核苷酸序列與所述反義鏈互補。
163.如權利要求162所述的試劑盒或包裝,其中配制所述雙鏈寡核苷酸以用于對所述患者施用一次、至少一天一次或者以用于對所述患者施用多次。
164.如權利要求162所述的試劑盒或包裝,其中所述雙鏈寡核苷酸包含如本說明書所公開的結構(Al)或(A2)。
165.如權利要求97至107中任一項所述的組合物,其用于在療法中使用。
166.如權利要求165所述的組合物,其中所述療法包括治療或預防或減輕肺移植受體的原發性移植物功能障礙(PGD)的癥狀,以用于預防或減輕冷缺血相關的PGD的癥狀、用于預防或減輕熱缺血相關的PGD的癥狀。
167.如權利要求166所述的組合物,其中所述癥狀選自由以下組成的組:炎癥、急性移植物排斥、移植物排斥、缺血再灌注損傷、再灌注損傷、肺功能受損、閉塞性細支氣管炎、血氧合作用受損、炎癥性細胞因子的產生增加、移植物內和氣道內粒細胞積累、肺水腫以及血氧不足。
168.如權利要求97至107中任一項所述的組合物用于制備治療或預防選自以下的肺疾病、病癥或損傷的藥劑的用途:急性呼吸窘迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎以及肺氣腫。
169.如權利要求97至107中任一項所述的組合物用于治療或預防選自以下的肺疾病、病癥或損傷的用途:急性呼吸窘 迫綜合癥(ARDS)、急性肺損傷、肺纖維化(特發性)、博來霉素誘發的肺纖維化、機械呼吸機誘發的肺損傷、慢性阻塞性肺病(COPD)、慢性支氣管炎以及肺氣腫。
【文檔編號】C12N15/113GK103492572SQ201280020499
【公開日】2014年1月1日 申請日期:2012年3月1日 優先權日:2011年3月3日
【發明者】安德魯·E·格爾曼, 埃琳娜·費因斯坦, 斯維特拉娜·亞當斯基, 伊戈·邁特, 夏甲·卡林斯基, 莎倫·阿夫金-納祖姆 申請人:夸克醫藥公司, 華盛頓大學