專利名稱:一株空間金黃色葡萄球菌lct-sa67菌株的制作方法
技術領域:
本發明屬于生物技術領域;更具體地,本發明涉及太空環境下金黃色葡萄球菌的生物學特性、全基因組測序信息、轉錄組測序以及差異蛋白組學分析。
背景技術:
空間環境是指大氣層以外的宇宙空間,其顯著特點是高真空、極端溫度、微磁場、微重力和高能核粒子輻射。在空間環境中很多微生物的致病性會受到影響,同時飛行中航天員的免疫功能下降,如何保障進入太空的生命體預防感染性疾病,如何利用空間環境造福人類都是就是其中要解決的關鍵問題。金黃色葡萄球菌是感染機體的一種重要病原菌,隸屬于葡萄球菌屬(Staphylococcus),是一種典型的革蘭氏陽性菌,可引起許多嚴重感染,常見于皮膚表面及上呼吸道黏膜,也可引起肺炎、偽膜性腸炎、心包炎等,甚至敗血癥、膿毒癥等全身感染。其在自然界中無處不在,空氣、水、灰塵及人和動物的排泄物中都可找到,很容易污染食品,是常見的引起食物中毒的致病菌,人體中常存在少量金黃色葡萄球菌。因此,在航天活動中,該菌常可隨人體或其他航天設備進入太空。隨著人類的生物醫學研究進入微觀水平,人們認識到,DNA遺傳信息決定了生物體的生命特征,而生物體的基因組正是這些遺傳信息的攜帶者。因此闡明生物體基因組攜帶的遺傳信息、以及這些遺傳信息是如何轉錄成RNA和翻譯成蛋白質執行功能將有助于揭示生物體的遺傳規律。目前,測序技術和質譜繼續不斷更新,這些技術的成本也不斷降低,同時細菌的基因組較小,從細菌基因組、轉錄組和蛋白質組入手研究其對機體的分子作用機制是研究細菌致病的很好切入點。通過這些組學的研究分析太空誘變金黃色葡萄球菌的變化特征,有利于保障航天活動的安全,同時研究結果可服務于地面
發明內容
本發明的一個目的提供空間環境誘變的金黃色葡萄球菌LCT-SA67菌株本發明提供的該菌株,其保藏號為CGMCC N0.6517。一株金黃色葡萄球菌,其特征包括:革蘭氏染色陽性,呈球狀、聚團排列;同地面對照株的抗生素耐受性相比,無差異;無生長速度的差異;不能利用丙酮酸甲酯為碳源,而地面對照能使用該碳源。所述的金黃色葡萄球菌,利用全基因組測序和比較基因組學分析獲得基因突變,見表1,空間環境導致LCT-SA67基因組上SNP的變化,包括SNP在基因組上的位置,突變位點及編碼蛋白以及注釋出的基因。表1:空間環境導致LCT-SA67菌株基因組上SNP的變化
權利要求
1.一種金黃色葡萄球菌LCT-SA67,其保藏號為:CGMCC N0.6517。
2.根據權利要求1所述的一株金黃色葡萄球菌,其特征在于:革蘭氏染色陽性,呈球狀、聚團排列;同地面對照株的抗生素耐受性相比,無差異;無生長速度的差異;不能利用丙酮酸甲酯為碳源,而地面對照能使用該碳源。
3.根據權利要求1所述的金黃色葡萄球菌LCT-SA67菌株,進行全基因組測序和比較基因組學分析得出突變基因。
4.根據權利要求1所述的金黃色葡萄球菌LCT-SA67菌株,進行轉錄組測序得出差異表達基因。
5.根據權利要求1所述的金黃色 葡萄球菌LCT-SA67菌株,進行差異蛋白組學分析得出差異表達蛋白分子。
全文摘要
本發明涉及一株太空環境下金黃色葡萄球菌LCT-SA67菌株的生物學特性、基因組DNA序列、轉錄組和差異蛋白組學,特別是同地面金黃色葡萄球菌比較分析鑒定出的功能序列和分子在闡明空間環境對微生物的作用及用途,可獲得全面、準確的空間誘變金黃色葡萄球菌菌株突變的基因、差異表達基因和蛋白質。
文檔編號C12N1/20GK103087943SQ20121038006
公開日2013年5月8日 申請日期2012年9月26日 優先權日2012年9月26日
發明者劉長庭, 王俊峰, 方向群, 李天志, 郭英華, 常德, 蘇龍翔, 王雅娟, 陳振鴻, 姜學革 申請人:中國人民解放軍總醫院