專利名稱:一種靈芝脫氧核糖核酸酶及其提取純化方法
技術領域:
本發明涉及一種酶及其提取純化方法,特別是一 種靈芝脫氧核糖核酸酶及其提取純化方法,屬于生物化學領域。
背景技術:
脫氧核糖核酸酶在核酸代謝過程和基礎遺傳機制中參
與DNA復制、修復、重組及突變;控制基因表達,參與基因的置換、轉 座及重組;作為宿主系統中的重要組分,降解外源核酸分子,同時在免 疫方面也具有重要作用。脫氧核糖核酸酶主要有2種脫氧核糖核酸酶 I,簡稱DNaseI;脫氧核糖核酸酶II,簡稱DNaseII。 20世紀60年代末 首先在牛胰腺中發現DNaseI,隨后在牛脾和胸腺中發現DNaseII。其中 DNaseI是一種降解雙鏈或單鏈DNA的核酸內切酶,產生帶5'-磷酸末端 的單核苷酸及寡核苷酸。其活性依賴二價金屬陽離子,DNaseI的切割位 點是隨機分布。另外DNaseI也是一種重要的分子生物學工具酶,如可用 于切口平移反應,.體外轉錄模板DNA的分解去除等。
目前己經從多種生物中分離純化了 DNaseI。尤其是動物的脫 DNaseI研究較為廣泛和深入。根據報道已經分離純化的DNaseI的 分子量都在30-40KD,如入類DNaseI為38kD,牛DNaseI分子量 為31kD,豬DNaseI為34kD。老鼠DNaseI為36kD;蛇DNaseI 為40kD;魚DNaseI為33kD。
目前用于分離脫氧核糖核酸酶的方法有多種。主要通過離子 交換層析,疏水柱層析和親和層析。分離介質有DEAE-Sepharose, Phenyl Sepharose, Sephadex G-75, Con Aagarose resins。 其中較常 用的Phenyl Sepharose為疏水柱層析。近年來,發展了一些新的分 離介質用于脫氧核糖'核酸酶的分'離。例如采用.DEAE cellulose, Double-stranded DNA cellulose禾n AF扁Blue TOYOPEARL層析從C
"V7WM"'.中分離純化了一種斬的脫氧核糖核酸酶;采用.
DEAE-cellulose, phenyl-Sepbar6se, Source 15Q從海星中分離了 一禾中脫氧核豐唐核酸酶;采用concanavalin A禾卩wheatgerm agglutinin
兩種凝集素混合制備的親和層析柱一步法純化了兔子、鼠等的脫 氧核糖核酸酶I。發明內容本發明的目的是提供靈芝子實體中的一種脫氧核糖核 酸酶及其提取純化方法。該酶的提取純化方法也可用于分離提純其它食 用菌、藥用菌子實體中的脫氧核糖核酸酶。
本發明的一種靈芝脫氧核糖核酸酶的特征為
1) 采用美國ABI公司的MALDI-TOF, Voyager DE-STR測定,
其精確分子量為'13807Da。.
2) 將純化的靈芝脫氧核糖核酸酶經電轉印至PVDF膜上,采用 Edman降解法,在美國ABI公司的Procise491型蛋白測序儀上測定, 其N-端的氨基酸序列為PLDTGRYHIY。
3) 用胰蛋白酶酶解后,'采用美國ABI公司的4700串聯飛行時間 質譜儀質譜分析結果表明,具有QVETVVDRLDELPIR和 ESPGLQGVSSVPLR商個肽段。
一種靈芝脫氧核糖核酸酶的提取純化方法,以新鮮靈芝子實體為原 料,經干燥處理后粉碎,保存備用;具體提取方法經粗酶抽提、(NH4)2S04 鹽析后,再由以下步驟完成
1) Blue-SepHarose 6 Fast Flow.親和層析,以含有0 1moL.L"NaCl梯度 洗脫,流速為20-60mL/h;.
2) SP Sephorose Fast Flow柱層析,.以0 0.3MNaCl梯度洗脫,流速為 20-40mL/h;
該靈芝脫氧核糖核酸酶是一種非限制性內切酶,.可作用于超螺旋 DNA,線狀DNA, ssDNA利dsDNA,是一種非限制性內切酶。其酶活 性依賴于二價金屬陽離子Mg、 lOmmoL丄.1 EDTA可完全抑制其酶活 性。最適pH值范圍為pH,7.5 pH9.0,在15'C條件下,就具有酶活性, 可以將超螺旋DNA切割成環狀DNA,并進一步切割成線狀DNA形式。 其活性隨溫度增高,酶活性增加,4CTC時相對活性最高。在75'C條件下 加熱15min后完全喪失活性。靈芝脫氧核糖核酸酶水解DNA的產物末 端的基團為3' -OH, 5'-磷酸。
本發明的優點與'積極效果
,1)首次從靈芝中分離純化出一種新的脫氧核糖核酸酶,該方 法具有快速提純脫氧核糖核酸酶的特點,純度高,能保持較高的 酶活性。2)通過本發明方法所提取'的具有酶活性的脫氧核糖核酸酶, 有良好的應用前景,其一,依據此氨基酸序列進行人工合成和進
一步開發利用。其二',依據氨基酸序列設計引物,克隆其cDNA,
進一步在原核細胞或真核細胞中表達該酶。其三,用于分子生物 學研究。
圖1為靈芝脫氧核糖核酸酶經SP Sephorose Fast Flow柱層析后 的電泳檢測圖。
其中,l為靈芝脫氧核糖核酸酶;2為蛋白標準分子量。
具體實施例 為充分公開本發明的一種靈芝脫氧核糖核酸酶及 其提取純化方法,現結合具體實施例加以說明。
實施例"種靈芝脫氧核糖核酸酶的提取純化方法,包括以下歩驟:
(1) 樣品前處理鮮靈芝經冷凍干燥后粉碎,'取凍干粉加入15倍
體積的0.02moL'L"pH6.2的磷酸緩沖液,4。C浸提16h,然后離心12000 Xg, 20min,獲得上清液A;
(2) 硫酸銨鹽析在上清液A中加入(NH4)2S04粉末,0。C條件下 邊加邊攪拌至80%飽和度,,待全部溶解后,4"C靜置6h, 12000Xg, 4 °C離心20 min,收集沉淀,并用蒸熘水透析除鹽后再用0.02moL丄" pH7.5的Tris-HCl進行充分透析平衡,12000Xg, 4"C離心5min,得到溶
液B;
(3) Blue-SepHarose 6FastFlow層析將所述的溶液B,通過蠕動 泵使流速為0.2mL/min;上到預先用0.02moL'L-1 pH7.5的Tris-HC1 緩沖液平衡好的親和層析介質中;洗脫至A達0.002,用含0 1 moL'U'NaCl的O.OSmoL'L-1 pH7.5的Tris-HCl梯度洗脫,,洗脫體積為 10倍的柱體積,流速為20-60mL/h,測定OD,,收集洗脫峰;經PEG20000 濃縮至l/5體積,然后再用0.02moLL"pH5.8的磷酸緩沖液平衡,得 到溶液C;
(4) SP Sephorose Fast Flow層析將所述的溶液C加入用 0.02moL丄"pH5.8的磷酸緩沖液平衡好的SP Sephorose Fast Flow中,洗 脫至A280<0.02;然后,以含0 0.3 moL'L"NaCl的0.02moL丄"pH5.8的
磷酸緩沖液梯度洗脫,j先脫體積為10倍的柱體積,流速40mL/h;測定OD28。,收集有酶活性的洗脫液,即洗脫液D;
(5) 超濾濃縮所述洗脫液D至所需的酶活性,即可獲得靈芝脫氧核
糖核酸純酶。
(6) 活性檢測其酶反應體系如下表
試劑名稱_上樣量
^物DNA (ljig卞i;1)
脫氧核糖核酸酶 '10)LiL
10XTris-HCl(0.2M ,pH8.0) 2pL
Mg2+(0.2mM) 12. 5|iL
蒸餾水_____71. 5|iL
H雨 f^j57—
37卩水浴30min。加入等體積的10%的三氯乙酸終止反應,冰上10min,12 OOOrpm, 20min。測定上清液體在260nm的吸收值。
酶活單位是在上述條件下,以小牛胸腺DNA為底物,在37。C、pH8.0 的條件下,1分鐘內使反應液的260nm吸光度增加0.001所需要的酶量 定義為1個活性單位。
(7)電泳檢測電泳檢測結果如附圖l所示,所提取的靈芝脫氧核 糖核酸為單一 的蛋白質條帶。說明經SP Sephorose Fast Flow層析后分 離得到的靈芝脫氧核糖核酸酶中已沒有其他雜蛋白組分存在。
該靈芝脫氧核糖核酸酶可作用,于超螺旋DNA,線狀DNA, ssDNA 和dsDNA,對ssDNA的活性略高于dsDNA,是一種非限制性內切酶。 其酶活性依賴于二價金屬陽離子Mg2+, 10mmoL丄"EDTA可完全抑制其 酶活性。最適pH值范圍為pH7.5 pH9.0,最適pH值為8.4。在15'C條 件下,就具有酶活性,4(TC時相對活性最高。在75。C條件下加熱15min 后完全喪失活性。該酶水解DNA的產物末端的基團為,3' -OH, 5'-磷 酸。
本發明的一種靈芝脫氧核糖核酸酶具有DNaseI的性質,屬于 DNaseI家族的一個成員。從靈芝中提取脫氧核糖核酸酶方法,具有 方法簡單、成本低等優點,還可以從其他藥用菌或食用菌中獲得高純度 的脫氧核糖核酸酶。從靈芝中提取脫氧核糖核酸酶可用于分子生物學 研究。
權利要求
1、一種靈芝脫氧核糖核酸酶,其特征在于(1)分子量為13807Da;(2)N-端的氨基酸序列為PLDTGRYHIY;(3)具有QVETVVDRLDELPIR和ESPGLQGVSSVPLR兩個肽段。
2、 一種靈芝脫氧核糖核酸酶的提取純化方法,其特征在于包括以下步驟(1) 樣品前處理鮮靈芝經冷凍干燥后粉碎,'取凍干粉加入15倍體積的0.02moL丄"pH6.2的磷酸緩沖液,4'C浸提16h,然后離心12000 Xg, 20min,獲得上清液A;(2) 硫酸銨鹽析在上清液A中加入(NH4)2S04粉末,OX:條件下 邊加邊攪拌至80%飽和度,'待全部溶解后,4"C靜置6h, 12000Xg, 4 °C離心20 min,收集沉淀,并用蒸餾水透析除鹽后再用0.02moL-L—
pH7.5的Tris-HCl進行充分透析平衡,12000Xg, 4。C離心5min,得到溶液B;(3) Blue-SepHarose6FastFlow層析將所述的溶液B,通過蠕動 泵使流速為0.2mL/min;上到預先用O.OZmoL.L-1 pH7.5的Tris-HCl緩 沖液平衡好的親和層析介質中;洗脫至A,0.002,用含0 1 moL丄"NaCl的0.02moL丄"pH7.5的Tris-HCl梯度洗脫,洗脫體積為 10倍的柱體積,流速為20-60mL/h,測定OD28Q,收集洗脫峰;經PEG20000 濃縮至l/5體積,然后再用0.02moL丄"pH5.8的磷酸緩沖液平衡,得 到溶液C;(4) SP Sephorose Fast Flow層析將所述的溶液C加入用 0.02moL'U1 pH5.8的磷酸緩沖液平衡好的SP Sephorose Fast Flow中,洗 脫至A280<0.02;然后,以含0 0.3 moL丄"NaCl的0.02moL丄"pH5.8的磷酸緩沖液梯度洗脫,洗脫體積為IO倍的柱體積,流速40mL/h;測定 OD28Q,收集有酶活性的洗脫液,,即洗脫液D;(5) 超濾濃縮所述洗脫液D至所需的酶活性。
全文摘要
靈芝脫氧核糖核酸酶的分子量為13807Da、N-端氨基酸序列為PLDTGRYHIY、具有QVETVVDRLDELPIR和ESPGLQGVSSVPLR兩個肽段。該酶可作用于超螺旋DNA,線狀DNA,ssDNA和dsDNA,是一種依賴于二價金屬陽離子Mg<sup>2+</sup>的非限制性內切酶,水解DNA的產物末端的基團為3′-OH,5′-磷酸。該酶的提取純化方法,以新鮮靈芝子實體為原料,經干燥處理后粉碎、粗酶抽提、硫酸銨鹽析、親和層析,梯度洗脫,再用SP Sephorose Fast Flow柱層析,以0~0.3M NaCl梯度洗脫,即可獲得靈芝脫氧核糖核酸酶。
文檔編號C12N9/22GK101294150SQ20071000891
公開日2008年10月29日 申請日期2007年4月28日 優先權日2007年4月28日
發明者吳祖建, 林奇英, 雯 祝, 謝東揚, 謝聯輝 申請人:福建農林大學